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Transcriptoma comparativo e redes de co-expressão gênica associados a características de carcaça de bovinos Nelore / Comparative transcriptome and gene co-expression networks associated with carcass traits of Nellore cattle

Vignato, Bárbara Silva 31 March 2017 (has links)
O objetivo deste trabalho foi estudar o transcriptoma do músculo Longissimus dorsi (LD) de bovinos da raça Nelore associado as características de área de olho de lombo (AOL) e espessura de gordura subcutânea (EGS), a fim de encontrar genes diferencialmente expressos (GDE), conjuntos de genes co-expressos, vias metabólicas e processos biológicos que regulam essas características. Foram utilizados dados de 385 bovinos Nelore castrados para obtenção das medidas fenotípicas de AOL e EGS, mensuradas entre a 12ª e 13ª costelas do músculo LD. Estes animais foram separados em dois grupos extremos, alto e baixo, contendo seis animais cada, baseados nos valores genômicos estimados (GEBV), para AOL e para EGS. Estes conjuntos de 12 animais foram submetidos à análise de expressão diferencial afim de encontrar GDE entre os grupos. Em seguida, a análise de enriquecimento funcional a partir da lista de GDE foi executada por meio do DAVID (Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery) e da combinação do BiNGO (Biological Networks Gene Ontology) e REVIGO (Reduce + Visualise Gene Ontology). Para AOL, foram identificados 101 GDE entre os grupos de alto e baixo GEBV. Desses, 72 genes apresentaram-se down-regulated e 29 up-regulated no grupo baixo. Para EGS, foram encontrados 18 GDE, dos quais treze apresentaram-se up-regulated e cinco down-regulated no grupo baixo. Dentre as vias metabólicas e processos biológicos encontrados para essas características, destacam-se a via de sinalização MAPK (bta04010) e a via da endocitose (bta04144) - AOL - e, os processos de biossíntese de andrógenos (GO:0006702) e via de sinalização canônica Wnt (GO:0060070) - EGS. Para encontrar conjuntos de genes co-expressos associados aos tratamentos (AOL e EGS), foi utilizado o pacote WGCNA (Weighted Correlation Network Analysis) do R, com dados de contagens de transcritos de 43 animais. Foram identificados 37 módulos, dentre eles, os módulos Azul, Verde-escuro e Salmon apresentaram correlação significativa de 0,3 com a EGS (P<0,10). Os genes destes módulos foram selecionados para análise de enriquecimento funcional quando seus valores de filiação ao módulo foram superiores a 0,7. O módulo azul apresentou o maior número de genes co-expressos, com 953 genes submetidos à análise de enriquecimento funcional. Foram encontradas seis vias metabólicas e 101 termos do Gene Ontology para este módulo, conforme análise do DAVID, além de 108 processos biológicos identificados pelo BiNGO/REVIGO. Os resultados do presente estudo enfatizam a complexidade da regulação gênica do músculo LD de bovinos Nelore associado às características de AOL e EGS. Estes resultados nos auxiliam a compreender melhor os diversos processos moleculares envolvidos na deposição muscular e de gordura de cobertura, características de carcaça economicamente importantes para a produção da carne bovina. / The aim of this work was to study the Longissimus dorsi (LD) muscle transcriptome of Nellore cattle associated with ribeye area (REA) and backfat thickness (BFT) to find differentially expressed genes (DEG), coexpressed gene modules, metabolic pathways, and biological processes that regulate these traits. Data from 385 Nellore steers were used to obtain the phenotypic measures of REA and BFT, measured between the 12th and 13th ribs of the LD muscle. These animals were divided into two extreme groups, high and low, with six animals each, based on the estimated genomic breeding values (GEBV) for REA and for BFT. These sets of 12 animals were submitted to differentially expressed gene analysis to find DEG between the groups. Then, the functional enrichment analysis from the list of DEG was performed by DAVID (Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery) and the combination of BiNGO (Biological Networks Gene Ontology) and REVIGO (Reduce + Visualize Gene Ontology). For REA, 101 DEG were identified between the high and low GEBV groups. Of those, 72 genes were down-regulated and 29 up-regulated in the low group. For BFT, 18 DEG were found, of which thirteen were up-regulated and five were down-regulated in the low group. Among the metabolic pathways and biological processes found for these traits, the MAPK signaling pathway (bta04010) and the endocytosis pathway (bta04144) - for REA -, the androgen biosynthetic processes (GO: 0006702) and the canonical Wnt signaling pathway (GO: 0060070) - for EGS - can be highlighted. To find coexpressed gene modules associated with the traits (REA and BFT), we used the WGCNA (Weighted Correlation Network Analysis) package from R, with data from transcript counts of 43 animals. A total of 37 modules were founded. Among them, the Blue, Dark Green and Salmon modules had a significant correlation of 0.3 with BFT (P<0.10). The genes of these modules were selected for functional enrichment analysis when their module membership values were higher than 0.7. The blue module had the highest number of co-expressed genes, with 953 genes submitted to functional enrichment analysis. Six metabolic pathways and 101 Gene Oontology terms were founded for this module by DAVID analysis, in addition, 108 biological processes were identified by BiNGO/REVIGO. The results of the present study emphasize the complexity of gene regulation in the LD muscle of Nellore cattle associated with REA and BFT. These results can help us to better understand the different molecular processes involved in muscle and fat deposition, which are economically important carcass traits for beef production.
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Efeito da dieta contendo caroço de algodão no desempenho, características quantitativas da carcaça e qualitativas da carne de novilhos Nelore confinados / Effects of whole cottonseed-enriched diet on performance, quantitative characteristics of the carcass and qualitative characteristics of the meat of feedlot Nelore cattle

Pesce, Domingos Marcelo Cenachi 17 March 2008 (has links)
O presente trabalho teve como objetivo avaliar o desempenho e as características quantitativas de carcaça e qualitativas da carne de novilhos Nelore confinados. Os animais foram confinados com quatro dietas contendo 80% de concentrado, em porcentagem da matéria seca: uma controle, sem adição de caroço de algodão (CA0), outra contendo 10% (CA10) ou 20% (CA20) de caroço de algodão e outra contendo 20% (CA20H) de caroço de algodão aquecido em câmara climática. Ao final do período experimental, não foram encontradas diferenças entre os tratamentos para a ingestão de matéria seca. Entretanto, o ganho diário de peso, o peso vivo e a eficiência alimentar foram maiores para os animais alimentados com dietas contendo caroço de algodão, que não diferiram entre si. Os valores encontrados para N-uréico no sangue foram significativamente maiores para os tratamentos contendo caroço de algodão, enquanto que os valores de glicose e de proteína total sérica não diferiram entre os tratamentos. O rendimento de carcaça, a área de olho de lombo, a espessura de gordura subcutânea, as gorduras renal e pélvica, o peso da carcaça quente e fria, o peso do fígado e os valores de pH da carcaça não foram significativamente diferentes. Houve diferença apenas para a temperatura da carcaça 1 hora e 24 horas após o abate, que foram menores para o tratamento CA0. Não houve diferença significativa para os teores de matéria seca e extrato etéreo da carne. Também não foi encontrada diferença entre os tratamentos para perdas totais no cozimento e maciez da carne aos 7 e 14 dias de maturação, verificada pela força de cisalhamento. Foi encontrado apenas efeito de tempo, onde a carne maturada por 14 dias apresentou-se mais macia e com menores perdas totais no cozimento. A análise sensorial do músculo Longissimus dorsi não demonstrou diferença entre os tratamentos para aroma característico, suculência, sabor característico e estranho. Também não foi encontrada diferença para o total de ácidos graxos saturados, ômega-3, nem para as relações entre ácidos graxos insaturados, monoinsaturados e ácidos graxos saturados. Entretanto, os animais dos tratamentos CA10, CA20 e CA20H apresentaram carne com maiores e menores concentrações de, respectivamente, ácidos graxos polinsaturados e monoinsaturados em relação ao tratamento CA0. O caroço de algodão integral pode ser empregado em dietas de bovinos de corte confinados, constituindo até 20% da matéria seca, sem causar alterações indesejáveis na qualidade da carne e nas características de carcaça, proporcionando inclusive melhores resultados de desempenho, desde que observada a qualidade das sementes fornecidas aos animais. / The purpose of this work was to evaluate performance, quantitative characteristics of the carcass and qualitative characteristics of the meat of confined castrated Nelore males. Animals were confined with four diets containing 80% concentrate (dry matter): a control diet devoid of whole cottonseed (CA0), a diet containing 10% (CA10) or 20% of whole cottonseed (CA20) and a diet containing 20% of whole cottonseed heated in a climate chamber (CA20H). At the end of the experimental period, there were no differences between treatments for dry matter intake. However, the average daily gain, live weight and feed efficiency were greater for animals fed the whole cottonseed-enriched diets, whit no difference among diets when compared to control. Values documented for blood urea-N were significantly higher for treatments containing whole cottonseed, while glucose and total serum protein did not differ. Carcass yield, loin eye area, subcutaneous fat thickness, renal and pelvic fat, warm carcass weight and cold carcass weight, weight of the liver and values of carcass pH were not significantly different. Differences were noted only for carcass temperature 1 hour and 24 hours after slaughter, lower for CA0 treatment. There were no significant differences for dry matter content and ethereal meat extract. No differences were found between total cooking losses and meat tenderness between 7 and 14 days of maturing, as verified by shearing forces. Only time effect was noted, with meat matured for 14 days presenting with increased tenderness and less total cooking losses. Sensorial analysis of the Longissimus dorsi did not show differences among treatments for typical odor, juicyness and typical or off-flavour. No statistical difference was found for total saturated fatty acids and omega-3, or the relations between total unsaturated or monounsaturated and saturated fatty acids. However, animals fed whole cottonseed-enriched diets had higher concentrations of polyunsaturated fatty acids and omega-6 and lower concentrations of monounsaturated fatty acids in the Longissimus dorsi. Whole cottonseed can be used in feedlot beef cattle diets up to 20% of the dry matter content, without causing undesirable changes in meat quality and carcass characteristics and giving better performance results, as long as good quality seed is employed.
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Aspectos reprodutivos e produtivos de carneiros da raÃa Morada Nova submetidos a nÃveis crescentes de suplementaÃÃo concentrada / Reproductive and productive aspects of the breed sheep Morada Nova subjected to increasing levels of concentrate supplementation

Taciane Alves da Silva 09 February 2015 (has links)
CoordenaÃÃo de AperfeÃoamento de Pessoal de NÃvel Superior / O estudo foi conduzido com o objetivo de avaliar os efeitos de diferentes nÃveis de suplementaÃÃo concentrada sobre o peso corporal, parÃmetros seminais, medidas de biometria testicular, perfil proteico do plasma seminal e perfil proteico do mÃsculo Longissimus dorsi de carneiros da raÃa Morada Nova. Foram utilizados 22 carneiros com sete meses de idade. Os tratamentos consistiam em diferentes nÃveis de concentrado (0%, 0,6%, 1,2% e 1,8% do peso corporal do animal com base na matÃria seca). Os animais foram mantidos em sistema de pastejo rotacionado em pasto de capim Aruana (Panicum maximum). As amostras de sÃmen foram coletadas por eletroejaculaÃÃo ao final do experimento, quando os animais obtiveram 10 meses de idade. ApÃs o abate, os testÃculos e o mÃsculo Longissimus dorsi foram coletados. Os testÃculos foram mensurados e as proteÃnas seminais e musculares foram analisadas por meio de eletroforese bidimensional em gel de poliacrilamida. Os mapas proteicos foram analisados por meio do aplicativo PDQuest, version 8.0; Bio Rad, USA. Houve diferenÃa significativa no peso corporal e na expressÃo dos spots proteicos do mÃsculo Longissimus dorsi (P < 0,05), porÃm nÃo houve diferenÃa significativa para os parÃmetros seminais, biometria testicular e para a expressÃo de proteÃnas do plasma seminal. Os spots diferencialmente expressos (P < 0,05) foram digeridos com tripsina e submetidos à identificaÃÃo por espectrometria de massa (ESI-Q-TOF). Conclui-se, portanto, que os nÃveis de concentrado fornecido aos animais alteram o peso corporal e a expressÃo de proteÃnas do mÃsculo Longissimus dorsi, porÃm nÃo influenciam as medidas de biometria testicular, os parÃmetros seminais e a expressÃo de proteÃnas do plasma seminal. / The study was conducted in order to evaluate the effects of different levels of concentrated supplementation on body weight, seminal parameters, testicular biometry measurements, protein profile of seminal plasma and protein profile of the Longissimus dorsi muscle of the breed of sheep Morada Nova. 22 seven months old sheep were used. The treatments consisted in different levels of concentrated (0%, 0.6%, 1.2% and 1.8% of the animalsâ body weight based on dry matter). The animals were kept under a rotational grazing system, on Aruana grass (Panicum maximum). The semen samples were collected through electroejaculation at the end of the experiment, when the animals reached the age of 10 months. After slaughtering, the testicles and the muscle Longissimus dorsi were collected. The testicles were measured and the seminal and muscle proteins were analyzed through two-dimensional electrophoresis in polyacrylamide gel. The proteic maps were analyzed using the PDQuest application, version 8.0; Bio Rad, USA. There were significant differences over body weight and over the expression of the proteic spots of the muscle (P <0.05), but there was no significant difference for the seminal parameters, testicular biometry and the expression of seminal plasma proteins. The spots differentially expressed (P <0.05) were digested with trypsin and subjected to identification through mass spectrometry (ESI-Q-TOF). It is concluded, therefore, that the levels of concentrated provided to the animals change the body weight and influence the expression of the Longissimus dorsi muscle proteins, but do not modify the testicular biometry, the seminal parameters and the expression of seminal plasma proteins.
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Transcriptoma comparativo e redes de co-expressão gênica associados a características de carcaça de bovinos Nelore / Comparative transcriptome and gene co-expression networks associated with carcass traits of Nellore cattle

Bárbara Silva Vignato 31 March 2017 (has links)
O objetivo deste trabalho foi estudar o transcriptoma do músculo Longissimus dorsi (LD) de bovinos da raça Nelore associado as características de área de olho de lombo (AOL) e espessura de gordura subcutânea (EGS), a fim de encontrar genes diferencialmente expressos (GDE), conjuntos de genes co-expressos, vias metabólicas e processos biológicos que regulam essas características. Foram utilizados dados de 385 bovinos Nelore castrados para obtenção das medidas fenotípicas de AOL e EGS, mensuradas entre a 12ª e 13ª costelas do músculo LD. Estes animais foram separados em dois grupos extremos, alto e baixo, contendo seis animais cada, baseados nos valores genômicos estimados (GEBV), para AOL e para EGS. Estes conjuntos de 12 animais foram submetidos à análise de expressão diferencial afim de encontrar GDE entre os grupos. Em seguida, a análise de enriquecimento funcional a partir da lista de GDE foi executada por meio do DAVID (Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery) e da combinação do BiNGO (Biological Networks Gene Ontology) e REVIGO (Reduce + Visualise Gene Ontology). Para AOL, foram identificados 101 GDE entre os grupos de alto e baixo GEBV. Desses, 72 genes apresentaram-se down-regulated e 29 up-regulated no grupo baixo. Para EGS, foram encontrados 18 GDE, dos quais treze apresentaram-se up-regulated e cinco down-regulated no grupo baixo. Dentre as vias metabólicas e processos biológicos encontrados para essas características, destacam-se a via de sinalização MAPK (bta04010) e a via da endocitose (bta04144) - AOL - e, os processos de biossíntese de andrógenos (GO:0006702) e via de sinalização canônica Wnt (GO:0060070) - EGS. Para encontrar conjuntos de genes co-expressos associados aos tratamentos (AOL e EGS), foi utilizado o pacote WGCNA (Weighted Correlation Network Analysis) do R, com dados de contagens de transcritos de 43 animais. Foram identificados 37 módulos, dentre eles, os módulos Azul, Verde-escuro e Salmon apresentaram correlação significativa de 0,3 com a EGS (P&lt;0,10). Os genes destes módulos foram selecionados para análise de enriquecimento funcional quando seus valores de filiação ao módulo foram superiores a 0,7. O módulo azul apresentou o maior número de genes co-expressos, com 953 genes submetidos à análise de enriquecimento funcional. Foram encontradas seis vias metabólicas e 101 termos do Gene Ontology para este módulo, conforme análise do DAVID, além de 108 processos biológicos identificados pelo BiNGO/REVIGO. Os resultados do presente estudo enfatizam a complexidade da regulação gênica do músculo LD de bovinos Nelore associado às características de AOL e EGS. Estes resultados nos auxiliam a compreender melhor os diversos processos moleculares envolvidos na deposição muscular e de gordura de cobertura, características de carcaça economicamente importantes para a produção da carne bovina. / The aim of this work was to study the Longissimus dorsi (LD) muscle transcriptome of Nellore cattle associated with ribeye area (REA) and backfat thickness (BFT) to find differentially expressed genes (DEG), coexpressed gene modules, metabolic pathways, and biological processes that regulate these traits. Data from 385 Nellore steers were used to obtain the phenotypic measures of REA and BFT, measured between the 12th and 13th ribs of the LD muscle. These animals were divided into two extreme groups, high and low, with six animals each, based on the estimated genomic breeding values (GEBV) for REA and for BFT. These sets of 12 animals were submitted to differentially expressed gene analysis to find DEG between the groups. Then, the functional enrichment analysis from the list of DEG was performed by DAVID (Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery) and the combination of BiNGO (Biological Networks Gene Ontology) and REVIGO (Reduce + Visualize Gene Ontology). For REA, 101 DEG were identified between the high and low GEBV groups. Of those, 72 genes were down-regulated and 29 up-regulated in the low group. For BFT, 18 DEG were found, of which thirteen were up-regulated and five were down-regulated in the low group. Among the metabolic pathways and biological processes found for these traits, the MAPK signaling pathway (bta04010) and the endocytosis pathway (bta04144) - for REA -, the androgen biosynthetic processes (GO: 0006702) and the canonical Wnt signaling pathway (GO: 0060070) - for EGS - can be highlighted. To find coexpressed gene modules associated with the traits (REA and BFT), we used the WGCNA (Weighted Correlation Network Analysis) package from R, with data from transcript counts of 43 animals. A total of 37 modules were founded. Among them, the Blue, Dark Green and Salmon modules had a significant correlation of 0.3 with BFT (P&lt;0.10). The genes of these modules were selected for functional enrichment analysis when their module membership values were higher than 0.7. The blue module had the highest number of co-expressed genes, with 953 genes submitted to functional enrichment analysis. Six metabolic pathways and 101 Gene Oontology terms were founded for this module by DAVID analysis, in addition, 108 biological processes were identified by BiNGO/REVIGO. The results of the present study emphasize the complexity of gene regulation in the LD muscle of Nellore cattle associated with REA and BFT. These results can help us to better understand the different molecular processes involved in muscle and fat deposition, which are economically important carcass traits for beef production.
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Efeito da dieta contendo caroço de algodão no desempenho, características quantitativas da carcaça e qualitativas da carne de novilhos Nelore confinados / Effects of whole cottonseed-enriched diet on performance, quantitative characteristics of the carcass and qualitative characteristics of the meat of feedlot Nelore cattle

Domingos Marcelo Cenachi Pesce 17 March 2008 (has links)
O presente trabalho teve como objetivo avaliar o desempenho e as características quantitativas de carcaça e qualitativas da carne de novilhos Nelore confinados. Os animais foram confinados com quatro dietas contendo 80% de concentrado, em porcentagem da matéria seca: uma controle, sem adição de caroço de algodão (CA0), outra contendo 10% (CA10) ou 20% (CA20) de caroço de algodão e outra contendo 20% (CA20H) de caroço de algodão aquecido em câmara climática. Ao final do período experimental, não foram encontradas diferenças entre os tratamentos para a ingestão de matéria seca. Entretanto, o ganho diário de peso, o peso vivo e a eficiência alimentar foram maiores para os animais alimentados com dietas contendo caroço de algodão, que não diferiram entre si. Os valores encontrados para N-uréico no sangue foram significativamente maiores para os tratamentos contendo caroço de algodão, enquanto que os valores de glicose e de proteína total sérica não diferiram entre os tratamentos. O rendimento de carcaça, a área de olho de lombo, a espessura de gordura subcutânea, as gorduras renal e pélvica, o peso da carcaça quente e fria, o peso do fígado e os valores de pH da carcaça não foram significativamente diferentes. Houve diferença apenas para a temperatura da carcaça 1 hora e 24 horas após o abate, que foram menores para o tratamento CA0. Não houve diferença significativa para os teores de matéria seca e extrato etéreo da carne. Também não foi encontrada diferença entre os tratamentos para perdas totais no cozimento e maciez da carne aos 7 e 14 dias de maturação, verificada pela força de cisalhamento. Foi encontrado apenas efeito de tempo, onde a carne maturada por 14 dias apresentou-se mais macia e com menores perdas totais no cozimento. A análise sensorial do músculo Longissimus dorsi não demonstrou diferença entre os tratamentos para aroma característico, suculência, sabor característico e estranho. Também não foi encontrada diferença para o total de ácidos graxos saturados, ômega-3, nem para as relações entre ácidos graxos insaturados, monoinsaturados e ácidos graxos saturados. Entretanto, os animais dos tratamentos CA10, CA20 e CA20H apresentaram carne com maiores e menores concentrações de, respectivamente, ácidos graxos polinsaturados e monoinsaturados em relação ao tratamento CA0. O caroço de algodão integral pode ser empregado em dietas de bovinos de corte confinados, constituindo até 20% da matéria seca, sem causar alterações indesejáveis na qualidade da carne e nas características de carcaça, proporcionando inclusive melhores resultados de desempenho, desde que observada a qualidade das sementes fornecidas aos animais. / The purpose of this work was to evaluate performance, quantitative characteristics of the carcass and qualitative characteristics of the meat of confined castrated Nelore males. Animals were confined with four diets containing 80% concentrate (dry matter): a control diet devoid of whole cottonseed (CA0), a diet containing 10% (CA10) or 20% of whole cottonseed (CA20) and a diet containing 20% of whole cottonseed heated in a climate chamber (CA20H). At the end of the experimental period, there were no differences between treatments for dry matter intake. However, the average daily gain, live weight and feed efficiency were greater for animals fed the whole cottonseed-enriched diets, whit no difference among diets when compared to control. Values documented for blood urea-N were significantly higher for treatments containing whole cottonseed, while glucose and total serum protein did not differ. Carcass yield, loin eye area, subcutaneous fat thickness, renal and pelvic fat, warm carcass weight and cold carcass weight, weight of the liver and values of carcass pH were not significantly different. Differences were noted only for carcass temperature 1 hour and 24 hours after slaughter, lower for CA0 treatment. There were no significant differences for dry matter content and ethereal meat extract. No differences were found between total cooking losses and meat tenderness between 7 and 14 days of maturing, as verified by shearing forces. Only time effect was noted, with meat matured for 14 days presenting with increased tenderness and less total cooking losses. Sensorial analysis of the Longissimus dorsi did not show differences among treatments for typical odor, juicyness and typical or off-flavour. No statistical difference was found for total saturated fatty acids and omega-3, or the relations between total unsaturated or monounsaturated and saturated fatty acids. However, animals fed whole cottonseed-enriched diets had higher concentrations of polyunsaturated fatty acids and omega-6 and lower concentrations of monounsaturated fatty acids in the Longissimus dorsi. Whole cottonseed can be used in feedlot beef cattle diets up to 20% of the dry matter content, without causing undesirable changes in meat quality and carcass characteristics and giving better performance results, as long as good quality seed is employed.
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Desempenho na terminação e qualidade da carcaça e da carne de bovinos criados em sistema agrossilvipastoril

Luz, Patricia Aparecida Cardoso da. January 2017 (has links)
Orientador: André Mendes Jorge / Resumo: Os sistemas integrados de produção agropecuária (SIPAs), surgem como estratégia para aumentar a produtividade e renda para o produtor ao mesmo tempo que alcançam a sustentabilidade. No entanto, seus efeitos na qualidade da carcaça e carne dos animais nele produzidos carecem de elucidação. Assim, objetivou-se com este estudo avaliar o desempenho e as características da carcaça e carne de bovinos da raça Nelore terminados em SIPAs, sem disponibilidade de sombra (integração lavoura-pecuária: ILP) e com duas densidades de árvores (integração lavoura-pecuária-floresta: ILPF, com 196 árvores/ha e 448 árvores/ha). O delineamento experimental foi em blocos completos, com três tratamentos (ILP, ILPF-1L e ILPF-3L) e quatro repetições por tratamento, totalizando 12 parcelas experimentais. Foram utilizados 60 animais da raça Nelore castrados de aproximadamente 28±2,81 meses de idade e peso médio inicial de 385,71±27,17 kg para a avaliação do desempenho. Após o abate dos animais, foram coletadas 48 amostras do músculo longissimus thoracis para as análises de qualidade da carcaça e carne. Não foram encontradas diferenças (P>0,05) entre os tratamentos para o ganho médio diário e peso vivo final, contribuindo para ausência de diferença no peso e rendimento da carcaça quente, dianteiro, traseiro especial e ponta de agulha (P>0,05). Do mesmo modo, não foi encontrada diferença (P>0,05) entre os tratamentos para área de olho de lombo inicial e final, espessura de gordura subcutânea inicial e fin... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Doutor
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Aspectos reprodutivos e produtivos de carneiros da raça Morada Nova submetidos a níveis crescentes de suplementação concentrada / Reproductive and productive aspects of the breed sheep Morada Nova subjected to increasing levels of concentrate supplementation

Silva, Taciane Alves da January 2015 (has links)
SILVA, Taciane Alves da. Aspectos reprodutivos e produtivos de carneiros da raça Morada Nova submetidos a níveis crescentes de suplementação concentrada. 2015. 74 f. : Dissertação (Mestrado) - Universidade Federal do Ceará, Centro de Ciências, Departamento de Zootecnia, Programa de Pós-Graduação em Zootecnia. Fortaleza-CE, 2015. / Submitted by Eric Santiago (erichhcl@gmail.com) on 2016-08-09T15:42:56Z No. of bitstreams: 1 2015_dis_tasilva.pdf: 1372727 bytes, checksum: c5aed07999861a6537d53a0a85389f2e (MD5) / Approved for entry into archive by Nádja Goes (nmoraissoares@gmail.com) on 2016-08-09T15:45:42Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_dis_tasilva.pdf: 1372727 bytes, checksum: c5aed07999861a6537d53a0a85389f2e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-09T15:45:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_dis_tasilva.pdf: 1372727 bytes, checksum: c5aed07999861a6537d53a0a85389f2e (MD5) Previous issue date: 2015 / The study was conducted in order to evaluate the effects of different levels of concentrated supplementation on body weight, seminal parameters, testicular biometry measurements, protein profile of seminal plasma and protein profile of the Longissimus dorsi muscle of the breed of sheep Morada Nova. 22 seven months old sheep were used. The treatments consisted in different levels of concentrated (0%, 0.6%, 1.2% and 1.8% of the animals’ body weight based on dry matter). The animals were kept under a rotational grazing system, on Aruana grass (Panicum maximum). The semen samples were collected through electroejaculation at the end of the experiment, when the animals reached the age of 10 months. After slaughtering, the testicles and the muscle Longissimus dorsi were collected. The testicles were measured and the seminal and muscle proteins were analyzed through two-dimensional electrophoresis in polyacrylamide gel. The proteic maps were analyzed using the PDQuest application, version 8.0; Bio Rad, USA. There were significant differences over body weight and over the expression of the proteic spots of the muscle (P <0.05), but there was no significant difference for the seminal parameters, testicular biometry and the expression of seminal plasma proteins. The spots differentially expressed (P <0.05) were digested with trypsin and subjected to identification through mass spectrometry (ESI-Q-TOF). It is concluded, therefore, that the levels of concentrated provided to the animals change the body weight and influence the expression of the Longissimus dorsi muscle proteins, but do not modify the testicular biometry, the seminal parameters and the expression of seminal plasma proteins. / O estudo foi conduzido com o objetivo de avaliar os efeitos de diferentes níveis de suplementação concentrada sobre o peso corporal, parâmetros seminais, medidas de biometria testicular, perfil proteico do plasma seminal e perfil proteico do músculo Longissimus dorsi de carneiros da raça Morada Nova. Foram utilizados 22 carneiros com sete meses de idade. Os tratamentos consistiam em diferentes níveis de concentrado (0%, 0,6%, 1,2% e 1,8% do peso corporal do animal com base na matéria seca). Os animais foram mantidos em sistema de pastejo rotacionado em pasto de capim Aruana (Panicum maximum). As amostras de sêmen foram coletadas por eletroejaculação ao final do experimento, quando os animais obtiveram 10 meses de idade. Após o abate, os testículos e o músculo Longissimus dorsi foram coletados. Os testículos foram mensurados e as proteínas seminais e musculares foram analisadas por meio de eletroforese bidimensional em gel de poliacrilamida. Os mapas proteicos foram analisados por meio do aplicativo PDQuest, version 8.0; Bio Rad, USA. Houve diferença significativa no peso corporal e na expressão dos spots proteicos do músculo Longissimus dorsi (P < 0,05), porém não houve diferença significativa para os parâmetros seminais, biometria testicular e para a expressão de proteínas do plasma seminal. Os spots diferencialmente expressos (P < 0,05) foram digeridos com tripsina e submetidos à identificação por espectrometria de massa (ESI-Q-TOF). Conclui-se, portanto, que os níveis de concentrado fornecido aos animais alteram o peso corporal e a expressão de proteínas do músculo Longissimus dorsi, porém não influenciam as medidas de biometria testicular, os parâmetros seminais e a expressão de proteínas do plasma seminal.
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SUPLEMENTAÇÃO DE BEZERROS DESMAMADOS EM PASTAGEM DE TIFTON 85 / WEANED CALVES SUPPLEMENTATION ON TIFTON 85 PASTURE

Pizzuti, Luiz Angelo Damian 17 December 2014 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / This study aimed to evaluate the effects of concentrated supplementation on weaned calves in Tifton 85 bermudagrass pasture regarding the forage production and the development and animal behavior. Forty-four Braford castrated calves, with initial average age of 4.5 months and initial average body weight (BW) of 128.3+26.7 kg were used. The experimental period lasted 140 days, divided into five periods of 28 days, and the treatments consisted in four levels of supplementation: 0,29; 0,5; 1.0 and 1.5% of BW based on dry matter (DM). The grazing method used was the continuous stocking system with a variable number of regulator calves. The bromatological quality of the pasture suffered variation along the periods. The forage and the leaves blades mass did not differ among the treatments, presenting an average of 6316.16 and 934.88 kg DM ha-1 as well as the canopy height and the forage density 25.47cm and 252.20 kg cm-1respectively. The increase in the level of supplementation decreased linearly the offer of forage and the offer of leaves blades. Independently of the analyzed period it was observed a greater participation of leaves in the layer of 10-20cm. The participation of total leaves did not suffered influence of the supplementation levels, however, it increased linearly in the layer of 20-30cm. The final weights of the treatments 1.0 and 1.5% of BW, 248.27 and 254.27 kg were superior to the treatments 0.29 and 0.5% of BW, 203.86 and 210.82 kg respectively. It was observed a high capacity of support of Tifton 85 with variation from 2336.48 to 3127.97 kg BW ha-1 when it was used 0.29% of BW, until values varying from 2747.51 to 7365.75 kg BW ha-1, when it was used 1.5% of BW. The chest perimeter, hip height, longissimus dorsi area and subcutaneous fat thickness suffered influence, responding linearly and positively to the increase of the level of supplementation. The average grazing time of the calves corresponded to 9h53min; 9h03min; 7h20min and 5h48min and the average time for other activities corresponded to 7h39min; 7h53min; 8h42min and 11h02min, respectively for the treatments 0.29; 0.5; 1.0 and 1.5% of BW. The number of bites per station presented an interaction between treatment and period as well as the bites rate. The Tifton 85 associated with supplementation presents a high capacity of stoking rate with high weight gain per hectare. Higher levels of supplementation allow a better structural development of the calves, being this followed by a higher daily average weight gain, longissimus dorsi area and subcutaneous fat thickness, with greater expressiveness when the supplementation level is increased from 0.5 to 1.0% of BW. The reduction in rumination and grazing time promotes the increase in the time of other activities, however, the decrease in grazing time does not determine a lower rumination time. The processes of displacement of the animals and apprehension of forage are changed by the supplementation and by the variation of the pasture cycle of Tifton 85. / Objetivou-se avaliar os efeitos da suplementação concentrada para bezerros desmamados em pastagem de capim bermuda Tifton 85 sobre a produção forrageira e o desenvolvimento e comportamento animal. Foram utilizados 44 bezerros Braford castrados, com idade média inicial de 4,5 meses e peso corporal (PC) médio inicial de 128,3 + 26,7 kg. O período experimental durou 140 dias, divididos em cinco períodos de 28 dias, e os tratamentos consistiram em quatro níveis de suplementação: 0,29; 0,5; 1,0 e 1,5% do PC com base em matéria seca (MS). O método de pastejo adotado foi o sistema de lotação contínuo com número variável de bezerros reguladores. A qualidade bromatológica da pastagem sofreu alteração ao longo dos períodos. A massa de forragem e a massa de lâminas foliares não diferiram entre os tratamentos, apresentando média de 6316,16 e 934,88 kg MS ha-1, assim como a altura do dossel e a densidade da forragem, 25,47cm e 252,20 kg cm-1, respectivamente. O aumento do nível de suplementação diminuiu linearmente a oferta de forragem e oferta de lâminas foliares. Independente do período analisado foi observada maior participação de folhas no estrato de 10-20cm. A participação de folhas total não sofreu influência dos níveis de suplementação, porém, aumentou linearmente no estrato de 20-30cm. Os pesos finais dos tratamentos 1,0 e 1,5% do PC, 248,27 e 254,27 kg, foram superiores aos tratamentos 0,29 e 0,5% do PC, 203,86 e 210,82 kg, respectivamente. Foi observada capacidade de alta taxa de lotação do Tifton 85, com variação de 2336,48 a 3127,97 kg PC ha-1, quando utilizou-se 0,29% do PC, até valores variando de 2747,51 a 7365,75 kg PC ha-1, quando utilizou-se 1,5% do PC. O perímetro de tórax, altura de garupa, área de longissimus dorsi e espessura de gordura subcutânea sofreram influência, respondendo linear e positivamente ao aumento do nível de suplementação. O tempo médio de pastejo dos bezerros correspondeu à 9h53min; 9h03min; 7h20min e 5h48min, e o tempo médio de outras atividades à 7h39min; 7h53min; 8h42min e 11h02min, respectivamente para os tratamentos 0,29; 0,5; 1,0 e 1,5% do PC. O número de bocados por estação apresentou interação entre tratamente e período assim como a taxa de bocados. O Tifton 85 associado à suplementação apresenta alta taxa de lotação com elevados ganhos de peso por hectare. Níveis de suplementação mais elevados possibilitam um melhor desenvolvimento estrutural dos bezerros, sendo este, acompanhado por um maior ganho médio diário de peso, área de longissimus dorsi e espessura de gordura subcutânea, com maior expressividade quando aumenta-se o nível de suplementação de 0,5 para 1,0% do PC. A redução no tempo de ruminação e pastejo promove aumento no tempo de outras atividades, porém, a diminuição no tempo de pastejo não condiciona a menor tempo de ruminação. Os processos de deslocamento dos animais e apreensão da forragem são alterados pela suplementação e pela variação do ciclo da pastagem de Tifton 85.
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Características qualitativas da carne de cordeiros 1/2 Dorper +1/2 Santa Inês abatidos com diferentes espessuras de gordura subcutânea / Qualitative characteristics of the lamb meat 1/2 dorper + 1/2 santa inês slaughtered with different subcutaneous fat thickness

Santos, Camilo Azevedo 04 July 2018 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The study evaluated the allometric growth of commercial cuts, tissue composition, leg muscle index and physical-chemical characteristics of lambs ½ Dorper + ½ Santa Inês slaughtered at 2.0; 3.0 and 4.0 mm subcutaneous fat thickness (SFT). The experiment was carried out in partnership with Fazenda Canafístula, located in the state of Sergipe, county of Nossa Senhora das Dores. Weaned at the same breeding season, 24 male, uncastrated, ½ Dorper + ½ Santa Inês lambs were randomly assigned and confined to three collective bays. In periods of 15 days, the animals were weighed and their SFT measured. The lambs were slaughtered with stipulated SFT. The carcasses, after skinning and evisceration, were stored in a cold room for 24 hours at a temperature of 4 ° C. The carcasses were sectioned longitudinally to the vertebrae. The left half carcass was weighed and separated into five commercial cuts: neck, shoulder, rib, loin and leg. After dissection of the cuts, muscle, subcutaneous fat, intermuscular fat and bone were weighed, in addition to the muscle index of the leg. Allometric growth was determined as a function of the commercial cuts in relation to the halfcarcass, and then according to the tissue components in relation to the respective commercial cut. For the physicochemical characteristics of the meat the parameters of pHinitial and pHfinal were collected, respectively. In addition, the SFT were measured by ultrasound, pachymeter and through photographs of the Longissimus dorsi muscle between the 12th and 13th vertebrae. Meat and subcutaneous fat measurements were also performed for the parameters of brightness, red intensity, yellow intensity (L *, a * and b *), respectively, and then calculated tonality and chroma. Images were analyzed using the ImageJ® software in the Longissimus dorsi muscle between the 12th and 13th ribs, obtaining data such as the loin eye area (AOL), depth, length and marbling degree of this muscle. For the chemical characteristics, moisture, protein, ashes and total lipids were submitted to analysis of variance and submitted to the Student test with significance (P <0.05). For neck cuts, lambs with 2.0 and 4.0 mm SFT showed early growth, different from lambs slaughtered with 3.0 mm SFT. For the shoulder cut, animals with 2.0 and 4.0 mm showed to have an early growth. However, the palette of animals with 3.0 mm SFT had late growth. The rib showed isogonic growth for lambs with 2.0 and 3.0 mm EGS. Differently from the animals that were slaughtered with 4.0 mm of SFT, which had an early growth. In the cut loin, lambs with 2.0 and 3.0 mm had negative heterogenic growth. This did not occur with lambs with 4.0 mm, which showed a growth proportional to half-carcass. The leg was the cut that presented early growth for the animals slaughtered with different SFT and was the cut that best correlated with the half-carcass. However, SFT at slaughter, measured with a caliper, showed differences for 2.0 mm, 3.0 mm and 4.0 mm SFT. Regarding the measurement of SFT by photograph, difference was observed only for the treatment with 2.0 mm of SFT. The other characteristics did not present differences between slaughtered lambs with different SFT. Due to the allometric growth, it is recommended the slaughter of ½ Dorper + ½ Santa Inês lambs, with 4.0 mm of EGS, for presenting better yields of cuts of palette and leg, at the same time that the quality of the meat did not present alterations physico-chemical characteristics. / O estudo avaliou o crescimento alométrico dos cortes comerciais, composição tecidual, índice de musculosidade da perna e características físico-químicas da carne de cordeiros ½ Dorper + ½ Santa Inês abatidos com 2,0; 3,0 e 4,0 mm de espessura de gordura subcutânea (EGS). O experimento foi realizado em parceria com a Fazenda Canafístula, localizada no estado de Sergipe, município de Nossa Senhora das Dores. Desmamados na mesma estação de monta, 24 cordeiros machos, não castrados, ½ Dorper + ½ Santa Inês, foram distribuídos e confinados ao acaso em três baias coletivas. Em períodos de 15 dias, os animais eram pesados e mensurada sua EGS. Os cordeiros foram abatidos com EGS estipulada. As carcaças, após esfola e evisceração, foram armazenadas em câmara fria durante 24 horas, sob temperatura de 4 ºC. As carcaças foram seccionadas longitudinalmente às vértebras. A meia-carcaça esquerda foi pesada e separada em cinco cortes comerciais: pescoço, paleta, costela, lombo e perna. Após dissecação dos cortes, foram pesados músculo, gordura subcutânea, gordura intermuscular e osso, além de calculado o índice de musculosidade da perna. O crescimento alométrico foi determinado em função dos cortes comerciais em relação a meia-carcaça e, em seguida em função dos componentes teciduais em relação ao respectivo corte comercial. Para as características físico-químicas da carne foram colhidos os parâmetros de pHinicial e pHfinal, respectivamente. Além disso, as EGS foram mensuradas ultrassom, paquímetro e através de fotografias do músculo Longissimus dorsi entre a 12ª e 13ª vértebras. Ainda foram realizadas medidas da cor da carne e gordura subcutânea para os parâmetros de luminosidade, intensidade de vermelho, intensidade de amarelo, (L*, a* e b*), respectivamente e, posteriormente calculados tonalidade e croma. Realizaram-se análises por imagem, com auxílio do software ImageJ® no músculo Longissimus dorsi entre a 12ª e 13ª costelas obtendo-se dados como a área de olho de lombo (AOL), profundidade, comprimento e grau de marmoreio desse músculo. Para as características químicas, foram avaliados umidade, proteína, cinzas e lipídios totais e submetidos a análise de variância e submetidos ao teste Student com significância (P < 0,05). Para os cortes do pescoço, os cordeiros com 2,0 e 4,0 mm de EGS apresentaram crescimento precoce, diferente dos cordeiros abatidos com 3,0 mm de EGS. Para o corte paleta, os animais com 2,0 e 4,0 mm mostraram ter um crescimento precoce. No entanto, a paleta dos animais com 3,0 mm de EGS tiveram crescimento tardio. A costela apresentou crescimento isogônico para cordeiros com 2,0 e 3,0 mm de EGS. Diferentemente dos animais que foram abatidos com 4,0 mm de EGS, que tiveram um crescimento precoce. No corte lombo, os cordeiros com 2,0 e 3,0 mm tiveram crescimento heterogônico negativo. O que não ocorreu com os cordeiros com 4,0 mm que mostraram ter um crescimento proporcional a meia-carcaça. A perna foi o corte que apresentou crescimento precoce para os animais abatidos com diferentes EGS e foi o corte que melhor correlacionou-se com a meia-carcaça. Porém, as EGS ao abate, medidas com paquímetro, mostraram diferenças para 2,0 mm, 3,0 mm e 4,0 mm de EGS. Com relação à mensuração da EGS por fotografia, observou-se diferença apenas para o tratamento com 2,0 mm de EGS. As demais características não apresentaram diferenças entre cordeiros abatidos com diferentes EGS. Em função do crescimento alométrico, recomenda-se o abate de cordeiros ½ Dorper + ½ Santa Inês, com 4,0 mm de EGS, por apresentarem melhores rendimentos de cortes de paleta e perna, ao mesmo tempo que a qualidade da carne não apresentou alterações quanto a características físicoquímicas. / São Cristóvão, SE
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PROTEOME ET TRANSCRIPTOME DU MUSCLE LONGISSIMUS LUMBORUM DE PORC : INFLUENCE DU MODE D'ELEVAGE, DE L'ORIGINE GENETIQUE ET DU SEXE. RELATIONS AVEC LES QUALITES DES VIANDES ANTHONY KWASIBORSKI

Kwasiborski, Anthony 13 March 2008 (has links) (PDF)
Avec une consommation de 19600 milliers de tonnes équivalent carcasses en 2005, la viande de porc est la plus consommée en Europe. Elle montre, toutefois, une forte variabilité, en partie due à des variations dans le métabolisme énergétique musculaire post-mortem. Celui-ci est défini comme l'ensemble des réactions biochimiques et leurs interactions survenant dans le muscle au cours de la période allant de la mort de l'animal jusqu'à la préparation de la viande avant consommation. De nombreux facteurs, dépendant de l'animal (génétique, mode d'élevage, alimentation, réactivité au stress d'abattage...) ou de la technologie (mode d'étourdissement...), peuvent influencer le métabolisme post-mortem et par conséquent, les qualités de viande. Un plan expérimental 2x2x2 comparait le protéome et l'expression de certains gènes d'intérêt chez des porcs femelles ou mâles castrés, de 2 origines génétiques différentes (pères Large White ou Duroc, mères Large White x Landrace), élevés dans 2 conditions différentes (conventionnelle en intérieur ou alternative en extérieur). Les résultats obtenus mettent en évidence l'important effet des facteurs de variation sur les quantités de protéines ainsi que sur les voies biochimiques impliquées dans le déterminisme des qualités des viandes. Ils ont également permis l'identification des marqueurs protéiques caractéristiques de l'origine génétique ou environnementale de l'animal. Les facteurs de variations n'influence pas l'expression des gènes étudiés. Le déterminisme des qualités des viandes n'est probablement pas une conséquence des modifications dans le niveau d'expression des gènes, mais plutôt dans la régulation des processus traductionnels.

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