Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 431772.pdf: 662662 bytes, checksum: 03d09987b626e32b1598af236814d904 (MD5) Previous issue date: 2011-03-25 / O lobo-marinho sul-americano, Arctocephalus australis, est? distribu?do ao longo da costa do hemisf?rio sul com col?nias reprodutivas localizadas desde o Peru at? o Uruguai. Este trabalho foca na UES do Atl?ntico e cobre a maioria de suas col?nias. No passado recente, v?rias col?nias sofreram dr?sticas redu??es populacionais com a ca?a e os eventos de El Ni?o. Muitos estudos focaram na an?lise da UES do Pac?fico, no entanto, pouco se sabe sobre a UES do Atl?ntico. Neste estudo a estrutura populacional e a variabilidade gen?tica destas popula??es foram avaliadas atrav?s da regi?o controle do DNA mitocondrial e 11 loci de microssat?lites. Os resultados encontraram alto n?vel de diversidade gen?tica nesta regi?o, sem sinal de gargalo gen?tico recente, mas com sinais de uma expans?o populacional iniciada entre 200.000 e 100.000 anos atr?s. Um sinal de estrutura??o foi encontrado entre as col?nias do Uruguai e Chubut quando avaliado a partir do DNA mitocondrial, provavelmente causado pela forte filopatria das f?meas. No entanto, a an?lise de microssat?lite n?o revelou a exist?ncia de estrutura??o, mesmo entre as diversas subpopula??es mais distantes, sugerindo que o fluxo g?nico seja mediado pelos machos. Para fins de conserva??o, estes resultados mostram que o lobo-marinho sul-americano da UES do Atl?ntico ? uma ?nica popula??o, e por causa disso, medidas de seguran?a devem ser alinhadas entre os pa?ses de sua distribui??o

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 438169.pdf: 1180129 bytes, checksum: c9e8b906135a8be6e942f0b79033b2bc (MD5) Previous issue date: 2012-03-26 / Even though the Neotropical region has a vast biodiversity, it is also one of the least studied regions in the world, and harbors many species that still remain poorly known. An example is the wild cat jaguarundi (Puma yagouaroundi), which is up to now one the least known Neotropical felids. Of the few studies including this species, most address ecological aspects, and therefore little is known regarding its genetic diversity, evolutionary history and population structure. We have investigated these evolutionary aspects and inferred phylogeographic patterns of the jaguarundi by analyzing 1191 bp of the mitochondrial DNA and eight microsatellite loci. The results from both markers supported the recognition of at least two major phylogeographic groups (Northern and Southern), which do not corroborate the eight subspecies classically recognized for the jaguarundi. Physical barriers such as the Amazon river appear to have influenced the genetic differentiation between these two groups by restricting the gene flow between these broad geographic areas, in a pattern reminiscent of that observed in other felids. The results presented here contribute to increase the knowledge about the evolutionary history of this felid, and may be useful in the development of management strategies fostering its conservation in the wild. / Apesar da alta biodiversidade existente na regi?o Neotropical, esta ? tamb?m uma das regi?es menos estudadas no mundo e onde muitas esp?cies ainda continuam sendo pouco conhecidas. Um exemplo ? o gato selvagem jaguarundi (Puma yagouaroundi), que ? um dos felinos Neotropicais menos conhecidos. Dos poucos estudos realizados com esta esp?cie, a maioria aborda aspectos ecol?gicos e desse modo, pouco ou quase nada se conhece em termos de sua diversidade gen?tica, hist?ria evolutiva e estrutura populacional. N?s investigamos estes aspectos evolutivos e inferimos padr?es filogeogr?ficos do jaguarundi atrav?s da an?lise de 1191 pb do DNA mitocondrial e oito locos de microssat?lites. Os resultados de ambos os marcadores suportaram o reconhecimento de pelo menos dois grandes grupos filogeogr?ficos (Norte e Sul), e n?o corroboraram a validade das oito subesp?cies classicamente reconhecidas. Barreiras f?sicas como o rio Amazonas parecem ter influenciado a diferencia??o gen?tica destes dois grandes grupos, restringindo o fluxo g?nico hist?rico entre essas duas regi?es geogr?ficas, em um padr?o semelhante ao observado em outras esp?cies de felinos. Os resultados apresentados aqui contribuem para aumentar o conhecimento da hist?ria desta esp?cie e podem ser ?teis no desenvolvimento de propostas de manejo visando a sua conserva??o em longo prazo.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 438122.pdf: 3145728 bytes, checksum: b418ed52b6536be2e9efb41f6b7dc59b (MD5) Previous issue date: 2012-03-23 / Taxonomy forms the basis for all biological sciences, since it is through this discipline that natural units are recognized and described. Without the correct delimitation, researches from other disciplines would be unable to report their results because they would not be sure about the identity of their study units. The current estimate that millions of species are still to be described reinforces the centrality of taxonomy, because is through its use that species are found, delimited and described. Carnivores are usually thought to be well-known mammals, but some of these taxa have not been described yet, while others have received little biogeographic and taxonomic attention, preventing a correct assessment of their richness and conservation status. The genus Galictis (Carnivora, Mustelidae) is an example of a little-studied mustelid from the Neotropics, one of the richest and most endangered regions of the world. Basic information, such as number of species, delimitation between them, diagnosis and geographic distribution, have never been thoroughly tested before, leading to uncertainties regarding the taxonomy of this genus. In order to perform a comprehensive revision of Galictis, morphological and molecular approaches were applied on the basis of records encompassing all the distribution of the genus. For the former approach, we analyzed skulls and skins from 22 zoological collections and the statistical tests showed the presence of two clusters of Galictis specimens, representing G. cuja and G. vittata. Phylogenetic analyses of mitochondrial and nuclear segments supported morphological results showing two monophyletic groups, corresponding again to G. cuja and G. vittata. No other morphological grouping or evidence of a third clade was recognized with our data. All these results corroborate the existence of only two species and indicate morphological characters that effectively diagnose them. These are very useful to identify museum specimens and should also help field-based work in some situations. The correct delimitation between these units allowed the investigation of some long-standing issues about the geographic distribution of Galictis species. For example, we demonstrate the exclusive presence of G. cuja in the northeastern region of Brazil, and established the southernmost limits of G. vittata in the Amazon basin. Finally, as species were well identified and characterized, it was possible to conduct phylogeographic inferences as well as analyses of intra-specific morphological variation in G. cuja. This species contains moderate to high levels of variability and some interesting geographic patterns. These included the morphological distinction of southern Chile and Argentina, the significant genetic structuring among three broad geographic domains, and the evidence of recent demographic expansion in the Brazilian southeast. The results presented here contribute to substantially enhance our knowledge on the genus Galictis, and should help enable further studies focusing on the evolutionary history of these carnivores in the Neotropics. / A taxonomia forma a base para todas as demais ci?ncias da Biologia, uma vez que ? atrav?s dessa disciplina que as unidades de vida na natureza s?o reconhecidas e descritas. Sem a correta delimita??o das esp?cies, pesquisas de outras ?reas n?o poderiam reportar seus resultados, pois n?o teriam a certeza da identifica??o das unidades de estudo. A estimativa de que existem milh?es de esp?cies ainda para serem descritas refor?a a import?ncia da taxonomia, pois ? utilizando as ferramentas dessa disciplina que as esp?cies s?o descobertas, delineadas e descritas. Mam?feros carn?voros s?o animais tidos como bem conhecidos; contudo, alguns t?xons desse grupo ainda n?o foram descritos e tantos outros receberam pouca aten??o biogeogr?fica e taxon?mica, impedindo estimativas corretas de riqueza, abund?ncia e status de conserva??o. O g?nero Galictis (Mustelidae, Carnivora) ? um exemplo de t?xon ainda pouco estudado na regi?o Neotropical, justamente uma das mais ricas e mais amea?adas regi?es do mundo. Informa??es b?sicas sobre esses mustel?deos, tais como n?mero exato de esp?cies, delimita??o entre elas, diagnose e distribui??o geogr?fica das mesmas, n?o foram ainda investigadas com rigor, o que acarreta incertezas sobre alguns t?picos e compromete a sua taxonomia. Para realizar uma revis?o taxon?mica ampla de Galictis, foram realizadas an?lises morfol?gicas e moleculares com base em registros provenientes de toda a distribui??o geogr?fica do g?nero. Para a primeira t?cnica, foram analisados cr?nios e peles tombados em 22 institui??es cient?ficas, e os testes morfol?gicos assim como a visualiza??o das peles evidenciaram a presen?a de dois conjuntos de esp?cimes de Galictis, representando as duas esp?cies usualmente reconhecidas, G. cuja e G. vittata. An?lises filogen?ticas com base em segmentos mitocondriais e nucleares corroboraram os resultados morfol?gicos, com a presen?a de dois clados bem apoiados que correspondem tamb?m a G. cuja e G. vittata. Nenhum outro agrupamento morfol?gico ou mesmo ind?cios de um terceiro clado no g?nero foi identificado. Esses resultados confirmam a exist?ncia de duas esp?cies e possibilitam o reconhecimento de caracteres morfol?gicos diagn?sticos para elas. Esses caracteres s?o de utilidade para a identifica??o de esp?cimes de museu e podem tamb?m auxiliar a identifica??o de indiv?duos na natureza. Com o correto delineamento das esp?cies, foi poss?vel definir a distribui??o geogr?fica das mesmas e resolver algumas quest?es atualmente controversas, como a defini??o da ocorr?ncia exclusiva de G. cuja na regi?o Nordeste do Brasil e o limite austral de G. vittata para a Bacia Amaz?nia. Por fim, a partir da defini??o confi?vel e robusta das esp?cies, obtida na primeira etapa desta tese, foi poss?vel realizar um estudo intra-espec?fico mais detalhado com foco em G. cuja, englobando an?lises filogeogr?ficas de marcadores moleculares, bem como varia??o morfol?gica ao longo de sua distribui??o. Essa esp?cie se caracteriza de forma geral por consider?vel variabilidade gen?tica e morfol?gica, em que se observam alguns padr?es geogr?ficos interessantes. Entre estes, pode-se destacar a diferencia??o morfol?gica de popula??es do Sul do Chile e Argentina, bem como, uma estrutura??o gen?tica significativa entre tr?s grandes dom?nios geogr?ficos, e evid?ncia de uma expans?o demogr?fica relativamente recente no sudeste brasileiro. Todos esses resultados embasam o conhecimento sobre o g?nero e propiciam ferramentas para estudos futuros que visem a entender a hist?ria evolutiva de Galictis na regi?o Neotropical.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 440889.pdf: 6684459 bytes, checksum: 0d535b06e60282baab1694958fc93066 (MD5) Previous issue date: 2011-08-26 / Experimental studies allow to control and test the use of different kinds of ecological and social information during foraging decisions, thereby improving our understanding of the evolution of cognitive abilities. In this study I evaluated the ability of captive marmosets (Callithrix penicillata, C. jacchus and C. penicillata vs. C. kuhlii hybrids) to use spatial, visual, olfactory, quantitative and associative cues during foraging decision-making and how the adoption of different individual foraging strategies and rules influence the access to food rewards. Thirteen groups (eight C. penicillata, three C. jacchus and two hybrids) composed of two to five individuals were studied at the Criadouro Conservacionista Arca de No?, Morro Reuter, RS. An experimental apparatus composed of five plexiglass feeding boxes was established in each enclosure. Eight 25-days long experiments were conducted from March to November 2009. A single feeding box was baited with a food reward (two banana slices) during most experiments, whereas the remaining boxes contained the same amount of food unavailable within wire mesh cages. In the experiment testing the ability of marmosets to discriminate feeding boxes based on differences in the amount of food there were two reward feeding boxes (one with one slice and the other with three slices). Data were recorded by the all occurrences sampling method. Four study groups used spatial information (location of food rewards predictable throughout the experiment) to locate the rewarded boxes, three of which applied a win-return strategy. No group selected the rewarded box based only on the presence of an associative cue (a green block), two groups used differences in the coloration between the blocks signalizing the presence (yellow block) or absence (red block) of a food reward inside the box, whereas seven groups appear to have associated the absence of a block to the presence of available banana slices inside the box. Ten groups efficiently located the box with banana slices when they were visually accessible. On the other hand, a single group appeared to have located the rewarded box based on the smell of banana. Finally, there is evidence that the marmosets were capable of selecting feeding sites based on the amount of food available. Searching investment varied among individuals. However, it was not possible to identify any consistent pattern of adoption of the producer and scrounger strategies related to sex, age, or social rank. The order of arrival to the rewarded box(es) influenced the amount of food ingested at the individual level, reflecting the finder s advantage and the benefits of playing producer. Some adult females enjoyed priority of access to the food rewards. This study allowed to confirm the saliency of some cognitive abilities during marmoset foraging and to indicate the importance of the experimental design in this kind of research and its potential as an environmental enrichment tool for captive animals / Estudos experimentais permitem controlar e testar os diferentes tipos de informa??o ecol?gica e social utilizados na tomada de decis?es de forrageio fornecendo um melhor entendimento sobre a evolu??o das habilidades cognitivas. Esta pesquisa avaliou a habilidade de saguis (Callithrix penicillata, C. jacchus e h?bridos de C. penicillata vs. C. kuhlii) cativos de utilizar a informa??o espacial, visual, olfativa, quantitativa e dicas associativas durante as decis?es de forrageio e como a ado??o de estrat?gias e regras individuais de forrageio influencia o acesso ao alimento. Treze grupos (oito de C. penicillata, tr?s de C. jacchus e dois h?bridos de C. penicillata vs. C. kuhlii) compostos por dois a cinco indiv?duos, foram estudados no Criadouro Conservacionista Arca de No?, Morro Reuter, RS. Em cada recinto foi fixado um aparato experimental composto por uma plataforma com cinco caixas de acr?lico. Oito experimentos, com dura??o de 25 dias cada, foram conduzidos de mar?o a novembro de 2009. Na maioria dos experimentos apenas uma caixa de alimenta??o continha recompensa alimentar dispon?vel (duas rodelas de banana), enquanto as demais continham a mesma quantidade de alimento, por?m indispon?vel. Apenas o experimento testando o uso de diferen?as na quantidade de alimento continha duas caixas com recompensa alimentar dispon?vel (uma com uma rodela de banana e a outra com tr?s rodelas de banana). A coleta de dados foi realizada pelo m?todo de amostragem de todas as ocorr?ncias. Quatro grupos utilizaram a informa??o espacial para localizar as recompensas alimentares, dos quais tr?s aplicaram uma regra win-return para retornar ?s caixas com alimento dispon?vel. Nenhum grupo selecionou a caixa com recompensa com base na presen?a de uma dica associativa (bloco verde). Apenas dois grupos utilizaram diferen?as na colora??o de blocos sinalizando a presen?a (bloco amarelo) ou aus?ncia (bloco vermelho) de recompensa para identificar o local com alimento, enquanto sete grupos parecem ter associado a aus?ncia do bloco ? caixa com alimento. Dez grupos localizaram o alimento visualmente. Por outro lado, apenas um grupo parece ter utilizado o olfato durante o forrageio. Por fim, h? evid?ncia de que os saguis foram capazes de selecionar os locais de alimenta??o com base na quantidade de alimento dispon?vel. O investimento na procura por alimento variou entre os indiv?duos. Contudo, n?o foi poss?vel identificar um padr?o consistente de ado??o das estrat?gias de produtor e usurpador em rela??o ao sexo, ? idade ou ? posi??o hier?rquica. A ordem de chegada dos indiv?duos ?s caixas com recompensa influenciou a quantidade de alimento ingerida, salientando a vantagem do descobridor e o benef?cio da ado??o da estrat?gia de produtor. A f?mea adulta de alguns grupos obteve prioridade de acesso ao alimento. Este estudo permitiu confirmar a sali?ncia de algumas habilidades cognitivas dos saguis durante o forrageio e indicar a import?ncia do desenho experimental neste tipo de pesquisa e seu potencial como ferramenta de enriquecimento ambiental para animais cativos.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 451414.pdf: 10722032 bytes, checksum: b8263340ed1091c069ea4b99a9f81848 (MD5) Previous issue date: 2013-09-09 / Conepatus (Mammalia: Carnivora) comprises one of the least known groups of Neotropical mammals. Despite its broad distribution, ranging from southern North America to southernmost South America, few studies have been conducted on this genus. The lack of knowledge regarding the ecology, morphology and distribution of different populations hampers comparative studies, resulting in much of the group's diversity remaining unknown. The most basic problem, however, seems to be the lack of studies regarding the evolutionary history and phylogenetic relationships among its populations, which are the main grounds for modern taxonomic classifications. A solid taxonomic arrangement is critical, since it is the principie that guides the description of ali other aspects of a given population. Finaily, understanding the evolutionary history of a taxon is important not only due to taxonomic concerns, but also because it is the cumulative knowledge on the diversification of different groups that allows the description of major biogeographic patterns. Attempting to shed light on several of these aspects, this study investigated phyiogenetic patterns, evolutionary history, population structure, morphological variation and general distribution of Conepatus, which altogether led to a taxonomic revision. To accomplish this, molecular analyses were performed, based on 1,902 base pairs of the mitochondrial DNA and eight microsatellite loci. We also conducted two types of morphological surveys. The first one was based on a panel of 29 craniodental measurements, while the second one investigated the differentiation of external body features among previousiy identified populations. Finally, we performed an extensive search for geographic records in original publications and scientific collection databases. Overall, the results indicated that Conepatus is a highly structured genus, encompassing at least 10 distinct geographic groups. In addition, at least some of these groups presented a noticeabie levei of morphological differentiation in terms of general body aspects, which reinforces the identified population structure. With respect to distributional aspects, Conepatus seems to inhabit almost exclusively open habitats and dry forests, rarely being found in moist dense forests. Some distributional discontinuities could be identified, which may be directly linked to the complete or partial isolation between groups. The evolution of the genus is complex, and appears to be linked to broad biogeographic patterns. The coalescence of Central and South American groups was estimated in ca. 3.2 million years ago (MYA), supporting the hypothesis that this genus colonized South America right after the complete closure of the Panama Isthmus, ca. 2.8 MYA, during the Great American Biotic Interchange. The coalescence of the South American populations, however, is far more recent (ca. 0.85 MYA), suggesting a complex evolutionary history, possibiy linked to the peculiar vegetation dynamics that took place in South America during the cycles of Pleistocene ice ages. Finally, a new taxonomic arrangement is proposed, suggesting that ali 10 identified groups could be elevated to the rank of species, due to the observed pattern of differentiation among these lineages. / Conepatus (Mammalia: Carn?vora) compreende um dos grupos de mam?feros neotropicais menos conhecidos. Apesar de apresentar uma extensa ?rea de distribui??o, indo sul da Am?rica do Norte ao extremo sul da Am?rica do Sul, poucos estudos foram conduzidos at? o momento sobre o g?nero. A falta de conhecimento envolvendo ecologia, morfologia e distribui??o das diferentes popula??es dificulta estudos comparativos, fazendo com que grande parte da diversidade do grupo permane?a desconhecida. O problema mais b?sico, contudo, parece ser a falta de estudos envolvendo sua hist?ria evolutiva e rela??es filogen?ticas, disciplinas balizadoras da taxonomia moderna. Uma classifica??o taxon?mica s?lida ? primordial para o estudo de qualquer grupo, j? que ? o princ?pio que norteia a descri??o dos demais aspectos de uma determinada popula??o. Al?m das contribui??es taxon?micas, conhecer a hist?ria evolutiva de um t?xon ? importante tamb?m por que ? a partir do entendimento cumulativo da estrutura da diversidade de v?rios grupos que se pode entender grandes padr?es hist?ricos. Assim, para contribuir com o conhecimento relativo a essas quest?es fundamentais, este estudo procurou revisar v?rios aspectos deste g?nero. Entre eles est?o padr?es filogen?ticos, evolutivos, morfol?gicos, de distribui??o e de estrutura populacional, culminando assim em uma revis?o taxon?mica. Para tanto, foram realizadas an?lises moleculares baseadas em 1.902 pares de base pertencentes a tr?s fragmentos do DNA mitocondrial, al?m de oito tocos de microssat?lites nucleares. Tamb?m foram conduzidos dois tipos de an?lise morfol?gica. A primeira baseou-se em um painel de 29 medidas de cr?nio e dentes para identificar padr?es de estrutura populacional, enquanto a segunda procurou por diferen?as no padr?o corporal geral entre algumas das popula??es identificadas. Finalmente, realizou-se uma extensa busca por registros de ocorr?ncia geogr?fica do g?nero em publica??es originais e bases de dados de cole??es cient?ficas. Os resultados obtidos indicam que Conepatus ? um g?nero bastante estruturado geograficamente, apresentando, no m?nimo, 10 grupos distintos. Tamb?m ? poss?vel afirmar que ao menos alguns dos grupos identificados apresentam um n?vel percept?vel de diferencia??o morfol?gica em termos de aspectos corporais gerais, o que refor?a a id?ia de estrutura??o neste grupo. A respeito dos padr?es de distribui??o, fica claro que o g?nero habita quase que exclusivamente ?reas de campo e florestas secas, sendo raramente encontrado em florestas densas. Algumas descontinuidades de distribui??o podem ser percebidas, podendo estar diretamente ligadas ao isolamento total ou parcial dos grupos. A hist?ria evolutiva do g?nero ? complexa, e parece estar ligada a padr?es biogeogr?ficos amplos. A coalesc?ncia dos grupos da Am?rica do Sul e Central ? de cerca de 3,2 milh?es de anos atr?s (MAA), apoiando a hip?tese de que o g?nero invadiu o continente sul-americano logo ap?s o fechamento do Istmo do Panam?, h? 2.8 MAA. A coalesc?ncia das amostras sul-americanas, contudo, ? bem mais recente (cerca de 0.85 MAA), sugerindo uma evolu??o complexa, possivelmente ligada ? din?mica vegetacional intrincada da Am?rica do Sul ao longo das eras glaciais do Pleistoceno. Finalmente, a revis?o taxon?mica proposta sugere que os 10 grupos identificados sejam elevados ? categoria de esp?cie, devido ao padr?o observado de diferencia??o entre estas linhagens.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 454365.pdf: 3007905 bytes, checksum: b56832ba15c565900ea3873756783426 (MD5) Previous issue date: 2013-08-21 / Commercial whaling mainly during the 20th century reduced most populations of humpback whale (Megaptera novaeangliae). Seven breeding stocks (A-G) are recognized by the International Whaling Commission (IWC) in the Southern Hemisphere. Humpback whales from Breeding stock A (BSA) are distributed along the Brazilian coast (mainly between 5? and 23? S), in the Southwestern Atlantic, while the humpbacks from breeding stock G (BSG) occur from Peru (6? S) to Costa Rica (12? N) coast, in the eastern Pacific Ocean. Despite previous studies have provided important information about both South America breeding grounds, the degree of connectivity and differentiation between these populations needs to be better investigated. Therefore, the manuscript 2 of this thesis represents the first analysis of the genetic differentiation and level of gene flow between these populations, using mitochondrial DNA sequences and 16 microsatellite loci. Our results showed a significant differentiation between Breeding Stocks A and G, at both molecular markers (mtDNA and microsatellites), in specially through the Bayesian clustering analysis that identified two populations even without sampling location information. However, the assignment tests have indicated an exchange of individuals between these populations, but with a gene flow low enough to allowing the demographic independence of these two stocks. Our data segregated by gender showed a significant differentiation between females from Brazil and Colombia, and between males from Brazil and Antarctic Peninsula, suggesting higher fidelity of females to the breeding areas and of males to the feeding areas. Nevertheless, recent studies have shown females undertaking long movements between breeding grounds. Thus, a sampling effort mainly on arrival and departure of the whales migrating for these areas is needed for a better understanding of the migratory pattern of the humpbacks of these populations. Although the Brazilian humpback whale population has shown signs of recovery after suffering a reduction estimated to 2% of its historical size in the late 1950s, no genetic study has provided estimates of effective and census size, contemporary and historical, for this population. For a better understanding of the whaling impact on this population, its demographic history was investigated using different molecular markers and methods (manuscripts 1 and 3). In the first manuscript ten microsatellite loci were used to estimate for the first time its contemporary population size. In the manuscript 3 was used for the first time the high throughput sequencing technology to sequence multiple nuclear loci at 24 Brazilian humpback samples. Despite the approximate Bayesian computation analysis has supported a scenario of constant Ne over size changes scenarios during the whaling period; our estimates of contemporary size at different time frames have detected a fluctuation of the population size during this period (~ 2 to 4 generations ago). Moreover, multiple sequence loci data have indicated a most recent bottleneck caused by anthropogenic population depletion over past 200 years. Our estimate of historical abundance (~ 148,000 individuals) indicates that BSA humpback population was much larger than that estimated (24,700 individuals) by whaling catch records. Finally, an extended Bayesian skyline plot of the nuclear loci indicated that the population was declining ever since a size peak around 30,000 years ago, which may be associated with the climate changes caused by glacial/interglacial cycles. These results suggest that Southwestern Atlantic humpback population was higher before the onset of the whaling period, which may explain the discrepancy found between previous genetic and catch record population size estimates at this period. / A ca?a comercial baleeira durante o s?culo XX reduziu significativamente a maioria das popula??es de baleias jubarte (Megaptera novaeangliae). Sete estoques reprodutivos (A-G) s?o reconhecidos pela Comiss?o Internacional Baleeira (CIB) no Hemisf?rio Sul. As baleias jubarte do estoque reprodutivo A s?o distribu?das ao longo da costa brasileira (principalmente entre 5? e 23? S), no Oceano Atl?ntico Sul Ocidental, enquanto as jubartes do estoque G ocorrem da costa do Peru (6? S) at? a Costa Rica (12? N), no Oceano Pac?fico Oriental. Apesar de estudos anteriores terem fornecido importantes informa??es sobre ambos estoques reprodutivos Sul Americanos, o grau de conectividade e de diferencia??o entre essas popula??es precisa ser melhor investigado. Deste modo, o manuscrito 2 desta tese representa a primeira an?lise de diferencia??o gen?tica e n?vel de fluxo g?nico entre essas popula??es, usando sequ?ncias de DNA mitocondrial e 16 locos de microssat?lites. Nossos resultados revelaram uma significante diferencia??o entre os estoques A e G em ambos marcadores moleculares (DNAmt e microssat?lites), especialmente atrav?s da an?lise bayesiana que identificou duas popula??es mesmo sem informa??o dos locais de amostragem. No entanto, os testes de assignment indicaram um interc?mbio de indiv?duos entre essas popula??es, mas com um fluxo g?nico baixo o suficiente permitindo a independ?ncia demogr?fica desses dois estoques. Nossos dados separados por sexo apresentaram uma diferencia??o gen?tica significativa entre as f?meas do Brasil e da Col?mbia, e entre os machos do Brasil e da Pen?nsula Ant?rtica, sugerindo maior fidelidade das f?meas ?s ?reas de reprodu??o e dos machos ?s ?reas de alimenta??o. Apesar disso, estudos recentes t?m demonstrado f?meas realizando longos movimentos entre ?reas de reprodu??o. Portanto, um esfor?o de amostragem principalmente na chegada e na sa?da das baleias migrando para essas ?reas de reprodu??o ? necess?rio para melhor compreender o padr?o migrat?rio das jubartes dessas popula??es. Embora a popula??o de baleias jubarte do Brasil tem demonstrado sinais de recupera??o ap?s sofrer uma redu??o estimada a 2% de seu tamanho hist?rico at? meados de 1950, nenhum estudo gen?tico tem fornecido estimativas de tamanho efetivo e de censo, atual e hist?rico, para essa popula??o. Para uma melhor compreens?o do impacto da ca?a nessa popula??o, sua hist?ria demogr?fica foi investigada utilizando diferentes marcadores moleculares e diferentes m?todos (manuscritos 1 e 3). No primeiro manuscrito dez locos de microssat?lites foram usados para estimar pela primeira vez o tamanho atual dessa popula??o. No manuscrito 3 foi usado pela primeira vez a tecnologia de sequenciamento em larga escala para sequenciar m?ltiplos locos nucleares em 24 amostras de jubartes brasileiras. Apesar da an?lise de computa??o Bayesiana aproximada suportar um cen?rio de popula??o constante sobre os cen?rios de mudan?a do tamanho da popula??o durante a ca?a comercial, nossas estimativas de tamanho atual em diferentes per?odos de tempo demonstraram uma flutua??o do tamanho da popula??o durante esse per?odo (~ 2 a 4 gera??es atr?s). Al?m disso, os dados de m?ltiplos locos indicaram um decl?nio de popula??o mais recente causado pela explora??o antropog?nica nos ?ltimos 200 anos. Nossa estimativa de abund?ncia hist?rica (~ 148.000 indiv?duos) indica que a popula??o de jubartes do estoque A foi muito maior do que aquele estimado (~ 24.700 indiv?duos) pelos registros da ca?a. Finalmente, os dados dos locos nucleares tamb?m indicaram que a popula??o estava declinando desde seu tamanho m?ximo atingido a cerca de 30 mil anos atr?s, possivelmente relacionada com as mudan?as clim?ticas causadas pelos ciclos de glacia??o/interglacia??o. Esses resultados sugerem que a popula??o do Oceano Atl?ntico Sul Ocidental era maior antes do in?cio da ca?a, o que deve explicar a discrep?ncia encontrada entre as estimativas de tamanho da popula??o, gen?ticas e baseadas em dados da ca?a.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:34:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 410178.pdf: 10609249 bytes, checksum: 193923c7d5b9630df9b36f33d2b43424 (MD5) Previous issue date: 2009-02-16 / Objetivo geral: O objetivo geral do presente estudo ? avaliar a acur?cia da Mamografia e da Ultra-Sonografia (BIRADS) no diagn?stico de c?ncer de mama e os objetivos espec?ficos foram descrever a freq??ncia de apresenta??o dos diferentes achados mamogr?ficos e ultra-sonogr?ficos e avalia??o da concord?ncia entre observadores. Materiais e M?todos: os exames mamogr?ficos de 115 pacientes e os exames ultrasonogr?ficos de 110 pacientes encaminhadas para core biopsy, com diagn?stico pr?vio ultra-sonogr?fico, de n?dulos mam?rios, foram re-analisados independentemente por dois (2) m?dicos especialistas, cegados, utilizando a nomenclatura, avalia??o e recomenda??o do BI-RADS? e o ?ltimo l?xico para Mamografia e Ecografia. Os achados histol?gicos foram utilizados como padr?o-ouro. A acur?cia dos achados foi determinada atrav?s dos c?lculos de sensibilidade, especificidade e dos valores preditivos (positivo e negativo). As diferen?as nos grupos de compara??o foram analisadas com teste Qui-quadrado para vari?veis categ?ricas e a concord?ncia entre os m?dicos foi calculada atrav?s da estat?stica Kappa de Cohen. Resultados: A sensibilidade da Mamografia variou entre 68% e 87%, com um VPN de 76% e 83%, das caracter?sticas descritas no BI-RADS. Apresentou uma especificidade, que variou entre 76% e 44% e o VPP variou de 51% e 53%. A acur?cia mamogr?fica oscilou de 75% e 62%, na diferencia??o entre les?es benignas de malignas com o uso do BI-RADS. Houve uma concord?ncia global moderada entre os radiologistas. Na Ultra-Sonografia foi obtida uma sensibilidade que variou entre 70,5% e 82,3%, o VPN entre 81,1% e 87,5% e o VPP entre 42,1% e 45,1%. A especificidade variou entre 56,58% e 55,2% e a acur?cia entre 60,9% e 63,6%. Na avalia??o entre os observadores foi obtida uma concord?ncia global considerada moderada (k: 0,50) para a avalia??o dos contornos (formas), margens, tecidos circunvizinhos, caracter?stica ac?stica posterior, modelos dos ecos internos e eixo da les?o em rela??o ? pele e considerada baixa (k: 0,29) na avalia??o das bordas dos n?dulos.Conclus?o: BI-RADS? 4? edi??o foi moderadamente acurado em padronizar a linguagem para os m?dicos descreverem les?es morfol?gicas na Mamografia e Ultrasonografia, mas existe consider?vel variabilidade. Esfor?os para reavalia??es de termos espec?ficos e para a avalia??o da signific?ncia diagn?stica das calcifica??es podem melhorar a qualidade da avalia??o entre leitores e a sua acur?cia, sendo desta forma, referencial para m?dicos e pacientes que poder?o definir a tomada de decis?o a partir dessas informa??es (quais pacientes referenciar para a bi?psia).

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:36:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 390396.pdf: 742166 bytes, checksum: ff6f453c7552409274aceb3384b4bfd9 (MD5) Previous issue date: 2007-03-08 / Base te?rica: Atualmente, a avalia??o progn?stica do c?ncer de mama inicial ? principalmente baseada nas caracter?sticas cl?nicas das pacientes e histol?gicas dos tumores. Recentemente, subtipos moleculares de carcinoma invasor da mama foram reconhecidos atrav?s dos estudos de perfilamento gen?tico por DNA microarray. Essa nova classifica??o pode melhorar a avalia??o progn?stica, mas essa nova tecnologia ainda n?o ? amplamente dispon?vel. Assim, a possibilidade de identificar os subtipos moleculares atrav?s de m?todos mais simples e baratos ? promissora. A identifica??o do subtipo basal-like de c?ncer de mama particularmente importante porque tem uma evolu??o desfavor?vel e menos op??es de tratamento dispon?veis. Adicionalmente, a express?o de Receptor para o Fator de Crescimento Epid?rmico (EGFR) parece ser mais freq?ente nesse subtipo. M?todos: Uma coorte retrospectiva de 112 pacientes consecutivas com carcinoma prim?rio de mama de est?gio patol?gico I ou II, diagnosticadas e tratadas na mesma institui??o entre 1995 e 2000, foi estudada. As caracter?sticas histol?gicas e cl?nicas, bem como dados de evolu??o cl?nica e sobrevida, foram revisados. An?lise imunohistoqu?mica foi realizada em blocos representativos dos tumores com anticorpos contra Receptor de Estr?geno (RE), Receptor para o Fator de Crescimento Epid?rmico Humano-tipo 2 (HER2), CK 5/6 e EGFR. O objetivo prim?rio foi identificar a preval?ncia do subtipo basal-like de c?ncer de mama (RE HER2-negativo e CK 5/6 e/ou EGFR positivo) nessa popula??o. Resultados: 13 dos 112 (11,6%) tumores avaliados foram do subtipo basal-like. Sua idade m?dia foi 49 anos; 77 % eram est?gio patol?gico II e 100 % eram carcinomas ductais invasores. N?o houve diferen?a progn?stica entre o subtipo basal-like e os subtipos luminal (RE positivo e HER2 negativo); com superexpress?o de HER2 (HER2 positivo) e indeterminado (quatro marcadores negativos) com rela??o ? sobrevida livre de doen?a e sobrevida geral. Esse resultado provavelmente se deve ao n?mero limitado de pacientes neste estudo e ao bom progn?stico de pacientes com c?ncer de mama em est?gio inicial. 11 dos 112 (10%) casos foram positivos para EGFR. Tumores positivos para EGFR foram mais freq?entemente negativos para RE (23 x 5%;p=0,01). Conclus?es: Nossos resultados sugerem que ? poss?vel identificar o subtipo basal-like de c?ncer de mama atrav?s da an?lise imunohistoqu?mica do RE, HER2, CK 5/6 e EGFR. Al?m disso, a express?o de EGFR parece ser mais freq?ente em tumores Re-negativos, o que sugere que drogas direcionadas contra o EGFR poderiam beneficiar esse subgrupo de pacientes

Submitted by Setor de Tratamento da Informa??o - BC/PUCRS (tede2@pucrs.br) on 2016-08-23T16:17:32Z No. of bitstreams: 1 DIS_MARCELO_RECONDO_CHEFFE_COMPLETO.pdf: 3315226 bytes, checksum: 0fdee62535103c67bd1e877995e8c9f9 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-23T16:17:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DIS_MARCELO_RECONDO_CHEFFE_COMPLETO.pdf: 3315226 bytes, checksum: 0fdee62535103c67bd1e877995e8c9f9 (MD5) Previous issue date: 2016-05-25 / Background: Dynamic breast is a known entity characterized by visible distortion and deformity of the breast as a result of the contraction of the pectoralis major muscle after a subpectoral implant, fortunate occurring in small fraction of the patients. The purpose of this study is to present an original method for objectively measuring the breast distortion on patients submitted to dual plane augmentation. Methods: We studied 32 female patients, aged 18 ? 50 years, who underwent primary dual plane breast augmentation with at least one year of follow-up. Anthropometric landmarks in the breast region were marked as parameters in order to originate linear segments. Through the study of photographs of the breast region, taken under no contraction and under maximum contraction of the pectoralis muscle (MCP), measurements of the linear segments were made through the use of a software, and comparisons between the measured groups were evaluated. Results: We found differences in all the segments analyzed when comparing the measurements of the breasts under no contraction of the pectoralis muscle and under MPC (p<0,001). Conclusion: Our study proposes a new and original method for measuring the dynamic breast distortion after dual plane augmentation through photogrammetry, allowing us not only to quantify the deformity but also to reproduce this methodology in any patient, contributing to objective enlightenment, for surgeons as well as patients, regarding this entity, not unusual after subpectoral implant. / Introdu??o: Deformidade mam?ria din?mica ? uma entidade bem conhecida caracterizada por distor??o e deformidade mam?ria vis?vel resultante da contra??o do m?sculo peitoral maior ap?s implante subpeitoral, felizmente acometendo apenas parte dos pacientes. O objetivo de nosso estudo ? apresentar um m?todo original para mensurar de maneira objetiva a distor??o mam?ria em pacientes submetidos a aumento mam?rio em duplo plano. M?todos: Foram avaliadas 32 pacientes, com idade entre 18 e 50 anos, submetidas a implante mam?rio em duplo plano, com no m?nimo 1 ano de p?s-operat?rio. Pontos antropom?tricos na regi?o mam?ria foram demarcados com o prop?sito de originar segmentos lineares. Atrav?s do estudo fotogr?fico da regi?o mam?ria das pacientes, em repouso e sob contra??o m?xima do m?sculo peitoral, medidas dos segmentos lineares foram realizadas atrav?s do uso de software, e compara??es entre os grupos medidos (em repouso e sob contra??o do m?sculo peitoral) foram feitas. Resultados: Houve diferen?a significativa em todos os segmentos analizados quando comparadas as medidas dos segmentos lineares das mamas em repouso e sob contra??o m?xima do m?sculo peitoral (p<0,001). Conclus?o: Nosso estudo prop?e um novo e original m?todo que permite, atrav?s de fotogrametria, mensurar de maneira objetiva a deformidade din?mica mam?ria ap?s implante mam?rio em duplo plano, possibilitando a remo??o da subjetividade na avalia??o dos pacientes acometidos desta deformidade ap?s implante mam?rio subpeitoral.

Made available in DSpace on 2015-04-14T14:51:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 395749.pdf: 1423043 bytes, checksum: ca56d3788b6dc3481d9aed7040fc6130 (MD5) Previous issue date: 2007-08-10 / O melanismo em mam?feros decorre principalmente da atividade de dois genes: MC1R (Melanocortin-1 Receptor), cujo produto induz a produ??o de eumelanina (pretomarrom); e ASIP (Agouti Signaling Protein), que codifica um pept?deo antagonista que promove a produ??o de feomelanina (pigmento claro). A combina??o do efeito destes dois locos faz com que o p?lo cres?a escuro com bandas subapicais amarelas. No presente estudo investigamos a diversidade nucleot?dica e os padr?es de variabilidade presentes no gene ASIP, principalmente nas regi?es codificadoras dos ?xons 2 e 3 e em regi?es n?o codificadoras dos ?ntrons 2 e 3 em alguns mam?feros, com ?nfase em fel?deos (Mammalia, Carnivora, Felidae). Atrav?s do alinhamento entre as esp?cies analisadas nesse estudo foi poss?vel construir tr?s bases de dados que foram divididas em diferentes blocos conforme as regi?es de alinhamento. A an?lise comparativa de seq??ncias permitiu a caracteriza??o de diferentes blocos de seq??ncia conservada, assim como a identifica??o de uma inser??o SINE presente apenas no gato dom?stico, de uma regi?o repetitiva hipervari?vel em todos os fel?deos analisados, e tamb?m de variantes moleculares (SNPs) em Felis catus e Leopardus geoffroyi. Nenhum dos polimorfismos identificados nesta esp?cie estava localizado em regi?es ex?nicas ou apresentou associa??o a fen?tipos de colora??o, indicando que as regi?es analisadas n?o est?o envolvidas na indu??o do melanismo nesta esp?cie.