A estruturação em comunidades biológicas sugere que há fatores que determinam quais espécies poderão ocorrer juntas. Os pequenos mamíferos sul-americanos (marsupiais e roedores cricetídeos) apresentam um padrão de dispersão no continente sul-americano bastante distinto. Os marsupiais chegaram ao continente há cerca de 100 milhões de anos e os roedores cricetídeos o colonizaram apenas na formação do Istmo do Panamá em aproximadamente 2,5 milhões de anos. Atualmente esses dois grupos ocupam nichos bastante diversos e também específicos. O objetivo geral desta dissertação é explorar padrões funcionais entre pequenos mamíferos sul-americanos, apresentando uma nova métrica de análise e discriminando os principais mecanismos que estruturam esses padrões. Assim, ela está dividida em dois capítulos: o primeiro apresenta uma nova abordagem analítica para o cálculo de divergência funcional entre clados coocorrentes na mesma comunidade; o segundo trata de avaliar os principais determinantes da divergência funcional entre marsupiais e roedores cricetídeos sul-americanos. A métrica desenvolvida no primeiro capítulo foi adaptada da abordagem de diversidade beta funcional, entretanto, ao invés de compararmos pares de comunidades, comparamos pares de clados que coocorrem na mesma comunidade, distinguindo o quanto similiar ou diferente funcionalmente esses clados são. No segundo capítulo, verificamos que fatores ambientais, funcionais, históricos e evolutivos influenciam a divergência funcional entre os dois clados aqui estudados. Além disso, nós encontramos uma tendência de aumento da diferenciação de nicho entre marsupiais e roedores cricetídeos em direção ao norte do continente sul-americano. Nós podemos inferir que a porta de entrada da colonização dos roedores cricetídeos no continente determina, ainda hoje, padrões de funcionalidade dos ambientes, além de outros fatores importantes como o clima. / The existence of structure in biological communities suggests that there are factors that determine which species may occur together. Small mammals of South America (marsupials and cricetid rodents) show a pattern of dispersal in this continent quite different and interesting. Marsupials arrived on South American continent about 100 million years and cricetid rodents only colonized it in the formation of the Isthmus of Panama, approximately 2.5 million years. Currently, these two groups occupy several and specific niches. The major goal of this thesis is to explore functional patterns among small mammals in South America, presenting an analytical novelty and discriminating mechanisms that driving these patterns. Thus it is divided into two chapters: the first presents a new functional approach for the calculation of functional divergence among clades co-occurring in the same community; the second evaluates the main drivers of functional divergence between marsupials and cricetid rodents in South America. The metric developed in the first chapter was adapted from the approach of functional beta diversity, however, instead of comparing pairs of communities, we compared pairs of clades co-occurring in the same community, discriminating how functionally similar or different these clades are. In the second chapter, we found that environmental, functional, evolutionary and historical factors determine the functional divergence among two clades studied here. Furthermore, we found a trend of increased niche differentiation between marsupials and cricetid rodents northward South American continent. We may infer that the gateway of cricetid rodents already determines patterns of functionality in environments nowadays, beyond other important factors, like climate.

Fácies marinhas e costeiras associadas a eventos transgressivos-regressivos quaternários ocorrem na Planície Costeira do Rio Grande do Sul e na plataforma continental adjacente. Enquanto as fácies expostas na planície costeira apresentam uma composição essencialmente siliciclástica, as fácies submersas, hoje aflorantes na antepraia e plataforma interna, apresentam, muitas vezes, uma composição carbonática. Formada por coquinas e arenitos de praia fortemente cimentados, estas fácies destacam-se do fundo oceânico como altos topográficos submersos. Os altos topográficos da antepraia têm atuado como fonte de boa parte dos sedimentos e bioclastos de origem marinha encontrados nas praias da área de estudo. Os bioclastos carbonáticos que ocorrem nestes locais caracterizam uma Associação Heterozoa, ou seja, são formados por carbonatos de águas frias, característicos de médias latitudes, e são representados principalmente por moluscos, equinodermos irregulares, anelídeos, crustáceos decápodos, restos esqueletais de peixes ósseos e cartilaginosos, cetáceos, tartarugas e aves semelhantes à fauna atual. Além destes bioclastos de origem marinha, as praias estudadas apresentam a ocorrência de fragmentos orgânicos provenientes de afloramentos continentais fossilíferos, contendo abundantes restos esqueletais de mamíferos terrestres gigantes extintos, das ordens Edentada, Notoungulada, Litopterna, Proboscidea, Artiodactila, Perissodactila, Carnívora e Rodentia. A concentração dos bioclastos na praia resultada da ação direta dos processos hidrodinâmicos que atuam na região de estudo (ondas de tempestade, deriva litorânea, correntes, etc). A variação no tamanho médio dos bioclastos encontrados ao longo da linha de costa está relacionada ao limite da ação das ondas de tempestades sobre o fundo oceânico, o qual é controlado principalmente pela profundidade. Os afloramentos-fonte submersos podem ser divididos em holocênicos e pleistocênicos. A tafonomia dos bioclastos pleistocênicos permite argumentar que após o penúltimo máximo transgressivo que resultou na formação do sistema deposicional Laguna-Barreira III (aproximadamente 120 ka) parte dos depósitos lagunares permaneceram emersos e não estiveram sob a ação marinha (barrancas do arroio Chuí, com a megafauna preservada in situ), enquanto que parte dos depósitos lagunares esteve sob ação direta do ambiente praial. Em diversas feições submersas observam-se coquinas contendo fósseis de mamíferos terrestres, indicando o retrabalhamento dos sedimentos lagunares em ambiente praial. As coquinas que apresentam moluscos pouco arredondados e de maior granulometria são aqui definidas, informalmente, como Coquinas do Tipo 1. Como conseqüência da última regressão pleistocênica (iniciada após o máximo transgressivo de 120 ka) estas coquinas ficaram submetidas a uma exposição subaérea. Este fato possibilitou a dissolução diferenciada dos componentes carbonáticos existentes nos depósitos (coquinas e arenitos) e sua recristalização (calcita espática) em ambientes saturados em água doce. A Transgressão Pós-Glacial (iniciada em torno de 18 ka) foi responsável pelo retrabalhamento dos arenitos e coquinas, recristalizando mais uma vez os elementos carbonáticos. Devido ao seu grau de consolidação estes depósitos resistiram à erosão associada à elaboração da superfície de ravinamento e encontram-se atualmente expostos na antepraia e, mesmo, na linha de praia atual. Pelo menos há 8 ka houve novamente um período favorável à precipitação de carbonato de cálcio, ocorrendo a litificação de rochas sedimentares em uma linha de praia numa cota batimétrica inferior a atual. Neste intervalo de tempo formaram-se as coquinas e arenitos não recristalizados, apresentando fragmentos de moluscos muito fragmentados e arredondados e de menor granulometria, aqui definidas, informalmente, como Coquinas do Tipo 2. A interpretação da tafonomia dos bioclastos de idade holocênica sugere pelo menos duas fácies deposicionais: (a) Fósseis articulados numa matriz areno-síltica, preenchidos por silte e argila, interpretados como originalmente depositados em regime transgressivo no ambiente Mesolitoral (foreshore) para Infralitoral superior (upper shoreface), com baixa ação de ondas. (b) Fragmentos de carapaças e quelas isoladas encontradas numa coquina fortemente cimentada por calcita espática, por vezes recristalizada, interpretados como concentrados na Zona de Arrebentação por ondas de tempestades. A dinâmica costeira atual retrabalha novamente os sedimentos inconsolidados enquanto as rochas sedimentares consolidadas (formadas pelas Coquinas Tipo 1 e 2) resistem parcialmente à erosão e constituem os altos topográficos submersos (parcéis) descritos neste trabalho.

O MHC (Major Histocompatibility Complex) é um sistema genético importante para a manutenção de espécies ameaçadas, uma vez que baixa variabilidade para locos MHC tem sido associada a uma menor capacidade de resposta a doenças e diminuição do sucesso reprodutivo. Deste modo, pesquisas sobre a variabilidade genética do MHC têm demonstrado ser bastante informativas em estudos populacionais voltados para aspectos referentes à conservação. No presente trabalho foi investigada a variabilidade genética do MHC para três espécies de mamíferos marinhos (toninha, baleia franca austral e lobo marinho sul-americano) do sul do Brasil, com intensa mortalidade provocada por atividades humanas atuais ou passadas. As amostras foram coletadas de animais mortos encalhados na costa, de animais capturados acidentalmente por barcos pesqueiros, e também através de um sistema de biópsia. A região variável do exon 2 do gene DQB do MHC foi amplificada por PCR (Polymerase Chain Reaction) em 109 amostras de toninhas (Rio de Janeiro n=32, Rio Grande do Sul n=52, Argentina n=25), 35 amostras de lobo marinho sul-americano e 30 amostras de baleia franca austral, utilizando-se um par de primers heterólogos. O fragmento resultante de 172 pares de bases foi analisado quanto ao polimorfismo de seqüência através da técnica de SSCP (Polimorfismo de Conformação de Fita Simples) em todas as amostras de toninha e de lobo marinho sul-americano e 14 amostras de baleia franca austral. Dificuldades associadas à amplificação resultaram em padrões de SSCP pouco informativos para as amostras de lobo marinho sul-americano e baleia franca austral Todas as amostras de toninha apresentaram um padrão de pelo menos 4 bandas por indivíduo. As 4 bandas de um único indivíduo do Rio Grande do Sul foram seqüenciadas, tendo sido possível verificar que 2 seqüências relacionadas ao genes DQB estão sendo amplificadas com estes primers. Pelas análises de SSCP foi possível detectar ausência de variabilidade para as amostras de toninha provenientes do Rio de Janeiro e diferenciá-las da população da Argentina, que é polimórfica. A população do Rio Grande do Sul parece apresentar níveis intermediários de variação em relação aos extremos da distribuição da espécie. Analisando as três populações amostradas, conclui-se que a espécie apresenta baixos níveis de variabilidade para o loco DQB, a exemplo do que é reportado para os genes de MHC de outros mamíferos marinhos.

Tese apresentada ao Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde da Universidade do Extremo Sul Catarinense - UNESC, como requisito parcial para a obtenção do título de Doutor em Ciências da Saúde. / Estudos recentes indicam que a via de sinalização da proteína alvo da rapamicina em mamíferos (mTOR) está relacionada com a fisiopatologia do transtorno depressivo maior (TDM). A cetamina, um antagonista do receptor N-metil-D-asparto (NMDA), foi identificada como uma nova terapia para o TDM, no entanto, o seu mecanismo de ação como antidepressivo não é ainda totalmente compreendido. Evidências indicam que a ativação da via mTOR no cortéx frontal (CF) é requerida para os efeitos antidepressivos da cetamina. Assim, o presente estudo teve como objetivo avaliar os efeitos comportamentais e neuroquímicos em diferentes regiões cerebrais após a administração de cetamina e a inibição da via de sinalização mTOR no CF de ratos. Para este fim, ratos Wistar machos adultos foram divididos em 4 grupos experimentais: 1) veículo + sal; 2) veículo + rapamicina; 3) veículo + cetamina 15 mg/kg; 4) rapamicina + cetamina 15 mg/kg. O inibidor farmacológico da via mTOR, a rapamicina na dose de 0,2 nmol ou veículo (grupo controle), foram administrados diretamente no CF 1 hora antes do teste do nado forçado (TNF) e 30 minutos antes da administração intraperitoneal de cetamina ou salina. Após o TNF as estruturas cerebrais: CF, amígdala, hipocampo e núcleo acumbens (NAc) e soro foram retirados para as análises bioquímicas (parâmetros de estresse oxidativo e nitrosativo, níveis de citocinas e níveis de proteínas relacionadas com a via mTOR e estresse de retículo (ER)). Os resultados mostraram que a rapamicina foi capaz de bloquear os efeitos antidepressivos da cetamina no tempo de imobilidade no TNF. A cetamina aumentou os níveis das espécies reativas ao ácido tiobarbitúrico (TBARS), carbonilação de proteínas, níveis de nitrito/nitrato e atividade da mieloperoxidase (MPO) e diminuiu a atividade das enzimas antioxidantes superóxido dismutase (SOD) e catalase (CAT) em algumas áreas cerebrais analisadas. No entanto, a inibição da via de sinalização mTOR pela rapamicina no CF, foi capaz de proteger contra o estresse oxidativo através da diminuição do dano a proteínas e lipídeos e o aumento das enzimas antioxidantes. Os níveis do fator de necrose tumoral alfa (TNF-α) aumentaram no soro após a administração de cetamina. Os níveis da proteína mTOR foram reduzidos no grupo rapamicina tratado com salina e cetamina no CF. Houve uma redução nos níveis de p4EBP1 no grupo rapamicina tratado com cetamina no CF e NAc e ainda, os níveis da peEF2K foram aumentados no CF no grupo veículo tratado com cetamina e diminuídos no grupo rapamicina tratado com cetamina. Os níveis de PERK e IRE1- alfa foram diminuídos no CF no grupo rapamicina tratado com cetamina. Os achados do presente estudo sugerem que a inibição da via de sinalização mTOR pode estar envolvida, pelo menos em parte, com o mecanismo de ação da cetamina; e que o efeito antidepressivo da cetamina sobre os níveis das proteínas do ER podem ser mediados pela via de sinalização mTOR em áreas cerebrais envolvidas com a regulação do humor. Sugere-se também que a inibição da via mTOR pode proteger o cérebro contra o estresse oxidativo e nitrosativo induzidos pela cetamina.

Resumo: A bacia do Rio Capivara, composta por um mosaico de ambientes com diferentes formações de vegetação natural (floresta estacional semidecidual, cerrado e matas ciliares), encontra-se bastante fragmentada em função das perturbações provocadas pelo homem, com a predominância de pastagens, plantações de cana-de-açúcar e laranja, além de reflorestamentos de eucalipto. Inserida nesta bacia está a Fazenda Experimental Edgardia, pertencente à Universidade Estadual Paulista, Campus de Botucatu. Esta área apresenta como principais classes de uso e ocupação do solo pastagem, plantio de arroz em área de várzea e fragmentos de vegetação natural (floresta estacional semidecidual e cerradão). O presente estudo teve como objetivos determinar a riqueza, ocorrência, freqüência de ocorrência e abundância relativa de espécies de mamíferos de médio e grande porte e sua relação com o mosaico vegetacional. Foi realizado levantamento buscando-se registros indiretos como vestígios (pegadas e fezes) em trilhas, ao longo de um ano. Foram também utilizadas duas armadilhas fotográficas (câmaras com infravermelho) a fim de complementar a identificação das espécies. Os dados da ocorrência de carnívoros foram georreferenciados e inseridos em um sistema de informação geográfica de modo a cruzar a distribuição espacial das espécies com a cobertura vegetal. De março de 2004 a março de 2005 foram percorridos 242,01 km e registradas por meio dos dois métodos de amostragem 20 espécies de mamíferos silvestres de médio e grande porte. No ambiente de floresta/cultura de arroz (Estrada da bica) foram registradas 11 espécies, na cultura de arroz (Estrada da várzea) nove, na floresta/várzea (Monte redondo) nove, na várzea/pastagem com regeneração de vegetação natural (Capivara) oito, na transição de floresta/cerradão (Trilha barra longa) oito, na floresta (Castanheira)... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The Capivara River basin, formed by a habitat mosaic with different natural vegetation formation (seasonal semideciduous forest remnants and riparian forests) is very fragmented due to disturbances caused by humans, mainly pastures, sugarcane and orange plantations and eucalyptus forests. Along this basin is the "Edgardia" Experimental Farm, which belongs to the Sao Paulo State University (UNESP), Campus of Botucatu. The area uses are mainly pastures, rice plantations in varzea areas and natural vegetation fragments (native semi deciduous forest remant and tropical Brazilian savannah). This study aimed at to determine the richness, occurrence frequency and relative abundance of medium- and large-sized mammalian species and their relation to the vegetation mosaic. Data were collected from indirect records (footprints and feces) in trails during one year long. Two photographic traps (with infrared cameras) were also used to complement species identification. Data from occurrence of carnivores were georeferrenced and input in a geographical information system in order to cross species spatial distribution to vegetation covering. From March 2004 to March 2005, 242.01 km were tracked and recorded through two sampling methods for 20 native medium and large-sized mammalian species. 11 species were recorded in the forest/rice plantation environment (Estrada da Bica), 9 species in the rice plantation (Estrada da varzea), 9 in the forest/varzea (Monte Redondo), 8 in the varzea/pasture with natural vegetation regeneration (Capivara), 8 in the transition area of forest/savanna (Trilha Barra Longa), 7 in the forest (Castanheira), 5 in the transition area of forest/savanna (Carmelucho), 5 in forest/pasture (Fundo da Bica), and 4 in the forest/pasture (Trilha do IB). Expected total richness values by Mao Tau were close... (Complete abstract click electronic access below) / Orientador: Vera Lex Engel / Coorientador: Renata Cristina Batista Fonseca / Banca: Kléber Pereira Lanças / Banca: Jorge Jim / Banca: Laura Cullen Júnior / Mestre

T. cruzi compreende populações heterogêneas classificadas nas linhagens TCI e TCIIa-e. Neste estudo, foi caracterizado um grande número de isolados de mamíferos e vetores silvestres de diversas origens geográficas, além de isolados humanos da Amazônia. Análises filogenéticas baseadas em SSU rDNA e Cyb foram utilizadas para inferir relações entre linhagens e padrões biogeográficos. Além de análises ITS1 rDNA e RAPD para detectar polimorfismo intraespecífico. TCIIa circula em primatas e é transmitida por Rhodnius, no ecótopo arbóreo da Amazônia brasileira ocasionalmente infectando o homem. TCI é mais prevalente em macacos e no homem na Amazônia onde pode causar doença severa, como demonstramos no Nordeste. No Brasil, morcegos são infectados por três espécies de tripanossomas, incluindo uma nova linhagem de T. cruzi (TCbat). Foram caracterizados T. rangeli de macacos e morcegos. A linhagem TCIIc possui ampla distribuição no Brasil, associada com mamíferos e triatomíneos terrestres. Isolados TCIIa dos USA pertencem a uma linhagem, aparentemente ausente no Brasil. / T. cruzi comprises highly heterogeneous populations classified as TCI and TCIIa-e lineages. This study characterized large wild mammal and vector strains of various geographical origins, and human isolates from Amazonia. Phylogenetic analysis using SSU rDNA and Cyb genes inferred relationships among lineages and their biogeographic patterns. ITS1 rDNA and RAPD detected intraspecific polymorphism. TCIIa circulates in primates in the Brazilian Amazon, transmitted by Rhodnius in arboreal ecotopes sporadically infecting humans. TCI is the most prevalent in the Amazonian primates and humans, and can induce severe Chagas disease as demonstrated in a patient from Northeast Brazil. Bats of several biomes were found infected by three trypanosome species, including a new lineage of T. cruzi denominated TCbat. Isolates from monkeys and bats were also molecularly characterized. The lineage TCIIc showed to be widespread in Brazil, and was associated to terrestrial mammals and triatomines. TCIIa from the USA corresponds to an independent lineage, probably absent in Brazil.

Submitted by Alberto Vieira (martins_vieira@ibest.com.br) on 2017-09-15T23:58:16Z No. of bitstreams: 1 200795.pdf: 11906807 bytes, checksum: 4431620b426de68cc14cac3e642f6f7d (MD5) / Made available in DSpace on 2017-09-15T23:58:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 200795.pdf: 11906807 bytes, checksum: 4431620b426de68cc14cac3e642f6f7d (MD5) Previous issue date: 1981 / CAPES / Indisponível.

Submitted by Alberto Vieira (martins_vieira@ibest.com.br) on 2018-01-12T15:51:33Z No. of bitstreams: 1 617462.pdf: 9301397 bytes, checksum: 507a0d494160adf0b5d975c1297dee3e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-12T15:51:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 617462.pdf: 9301397 bytes, checksum: 507a0d494160adf0b5d975c1297dee3e (MD5) Previous issue date: 2003-10 / FUJB / CAPES / A heterogeneidade espacial e a variação temporal das características bióticas e abióticas do ambiente influenciam a distribuição de diversas espécies animais. Portanto, as interações entre as condições climáticas e a estrutura do ambiente são importantes em qualquer estudo que busque avaliar a dinâmica e os processos ecológicos de uma região. O objetivo desse estudo é avaliar as variações espacial e temporal do microclima, seus efeitos sobre o microhabitat e consequentemente sobre a dinâmica das populações de pequenos mamíferos, numa área de Mata Atlântica. Foi também proposto um método de avaliação da heterogeneidade microclimática nesse tipo de floresta tropical. Para medir as variáveis de microclima (temperatura, umidade e luminosidade), foram usados registradores automáticos, ou seja, aparelhos de leitura programada de parâmetros climáticos. Para caracterizar o microhabitat foram medidas oito variáveis propostas em Freitas et al. (2002). O método desenvolvido e testado é eficiente no estudo do ambiente de pequenos mamíferos que vivem nessa camada de ar junto ao solo. Os resultados mostram diferenças espaciais e temporais das variáveis estudadas, onde a variação espacial do microclima pôde ser atribuída às diferenças de altitude e estruturais locais, e, sua variação temporal afeta a dinâmica do microhabitat. Foram encontrados modelos de preferência de microhabitat para os marsupiais Didelphis aurita (generalista com boa capacidade de manutenção local) e Metachirus nudicaudatus (sub-bosque desenvolvido e menor capacidade de manutenção local), enquanto Marmosops incanus apresentou correlação com o microclima, ocorrendo com populações maiores nos locais mais altos da área de estudo, com temperaturas mais amenas e maior umidade relativa. / The spacial heterogeneity and the temporal variation of the biotics and abiotics characteristics of the environment influence the distribution of animal species. Therefore, the interactions between the climatic conditions and the structure of the environment are important in any study that evaluate the dynamics and the ecological processes of a region. The aim of this study is to evaluate the space and time variations of the microclimate, its effect on the microhabitat and consequentely on the dynamics of the populations of small mammals, in an area of Atlantic Forest. Also a method of evaluation of the microclimate variables (temperature, humidity and luminosity) was developed, where were used data loggers, a programmed reading equipment of climatic parameters. To characterize the microhabitat were measured eight variables proposed in Freitas et al. (2002). The developed and tested method is efficcient in the study of environment of small mammals that live in this layer of air near the ground. The results show spacial and temporal differences of the studied variables, where the spacial variatuon of the microclimate could be attributed to the differences of altitude and in the local structural, and, its temporal variation affects the dynamics of the microhabitat. Models of habitat preference were found for the marsupials Didelphis aurita (generalist with good capacity of local maintenance) and Metachirus nudicaudatus (developed understory and lesser capacity of local maintenance), while Marmosops incanus presented correlation with the microclimate, occurring with bigger populations in the highest places of the study area, with lower temperatures and higher relative humidity.

Submitted by Alberto Vieira (martins_vieira@ibest.com.br) on 2018-02-07T23:57:31Z No. of bitstreams: 1 273311.pdf: 21196694 bytes, checksum: f90712cfc89a45376315013c3c9b1279 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-07T23:57:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 273311.pdf: 21196694 bytes, checksum: f90712cfc89a45376315013c3c9b1279 (MD5) Previous issue date: 1998-10-20 / FAPERJ / FUJB / CAPES / Atualmente os estudos de preferência de habitat vem se preocupando com o problema da escala, tanto espacial quanto temporal. Este trabalho foi desenvolvido em Guapimirim (22°29'S e 43°00'W), Estado do Rio de Janeiro de Fevereiro de 1997 a Fevereiro de 1998. A área de estudo situa-se nos arredores do Parque Nacional de Serra dos Órgãos na Mata Atlântica e é ocupada por casas de veraneio que podem influenciar de alguma forma as comunidades animal e vegetal. Este trabalho se divide em quatro abordagens principais: definição de conceitos, descrição de um novo método, o efeito das escalas espacial e temporal sobre a estrutura do habitat, e a preferência de microhabitat por pequenos mamíferos. Primeiramente, os diferentes usos do conceito de habitat foram discutidos através de um breve histórico, e então uma nova definição deste conceito distingüindo-o dos de nicho e biótopo foi apresentada. Em seguida, o uso de um novo método para medir a estrutura de microhabitat foi proposto... / Nowadays studies on habitat choice have been worried with scale problems, as spatial as temporal scale. This work was carried out in Guapimirim (22°29'S e 43°00'W), Rio de Janeiro State from February'97 to February'98. The study area is a vicinity of Serra dos Órgãos National Park at Atlantic Forest and is occupied by several houses that can influence somehow animal and plant communities. This work is divided in four main topics: concepts definition, new method description, effects of spatial and temporal scales on habitat structure, and microhabitat choice by small mammals. First different concepts of habitat used were discussed through a brief historie, then a new definition of habitat distinguishing it from niche and biotipe concepts is presented. Therefore a new method to measure microhabitat structure was proposed...

Orientador: Mauro Galetti / Coorientador: Silvio Frosini de Barros Ferraz / Banca: Marco Aurelio Pizo Ferreira / Banca: Maria Luisa da Silva Pinto Jorge / Banca: Adriano Garcia Chiarello / Banca: Rafael Dias Loyola / Somente a introdução está em português / Resumo: Existe uma necessidade urgente de se desenvolver conhecimento ecológico de apoio à conservação e gestão da rede protegida da Mata Atlântica dentro da região biogeográfica Serra do Mar. Resultados de pesquisas anteriores mostraram variações elevadas nas abundâncias dos grandes mamíferos dentro destas grandes áreas protegidas, que são comparáveis, se não maiores, do que as encontradas nos ecossistemas fragmentados da Mata Atlântica. Neste trabalho demonstrou-se como variáveis ambientais e antrópicas influenciam grandes mamíferos em remanescentes contínuos da Mata Atlântica Brasileira na região biogeográfica da Serra do Mar. Remanescentes contínuos da Mata Atlântica apresentam um ambiente altamente heterogêneo, resultado de fatores ambientais e impactos antrópicos. Os resultados apresentados nos 4 capítulos dessa tese destacam que, embora a Mata Atlântica seja o bioma mais intensamente estudado para mamíferos no Brasil, ainda não se atingiu o conhecimento necessário para a conservação e gestão eficaz desta classe na Mata Atlântica. Estudos adicionais são necessários para permitir a definição de zonas dentro das áreas protegidas, como definido pela legislação brasileira (Lei: 9.985/2000 (SNUC)). Este zoneamento é necessário para a realização dos objetivos múltiplos das áreas protegidas (incluindo a manutenção da biodiversidade e o fornecimento dos serviços dos ecossistemas) dentro do contexto sócio-econômico em um escala regional e nacional / Abstract: There is an urgent need to develop ecological knowledge to support conservation and management of the protected area network within the Serra do Mar biogeographical region. Results of previous research showed a high variation in the abundance of large mammals within large protected areas of Atlantic Forest within this region that is comparable if not greater than that found in fragmented Atlantic Forest ecosystems. This thesis shows how environmental variables and anthropogenic impacts influence large mammals within the remaining continuous Atlantic Forest remnants of the Serra do Mar. Continuous Atlantic Forest remnants are highly heterogeneous and this heterogeneity results from environmental factors and human impacts. The results presented in the four chapters of this thesis highlight that, although the Atlantic Forest is the most intensely studied biome for mammals in Brazil, the knowledge necessary for the conservation and effective management of this class in the Atlantic Forest is still lacking. Additional studies are needed to allow the establishment of zones within protected areas as defined by Brazilian legislation (Law: 9.985/2000 (SNUC)). This zoning is necessary to achieve the multiple objectives of protected areas (including the maintenance of biodiversity and the provision of ecosystem services) within the socioeconomic development in a regional and national scale / Doutor