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Associação de enterococcus faecalis, candida albicans e escherichia coli em canais radiculares e avaliação dos efeitos de extratos naturais sobre os microrganismos e endotoxinas

Molina, Flavio Pires [UNESP] 19 May 2008 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:04Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-05-19Bitstream added on 2014-06-13T20:29:45Z : No. of bitstreams: 1 molina_fp_me_sjc.pdf: 450221 bytes, checksum: 2c9670b296379f2aad2f168f87d11c94 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A proposta desta pesquisa foi padronizar a associação de três microrganismos (E. faecalis, C. albicans e E. coli) em canais radiculares e avaliar a efetividade de extratos naturais como agentes irrigantes e medicação intracanal sobre os microrganismos e endotoxinas. Foram utilizados 60 dentes humanos, unirradiculados, com tamanho padronizado em 16 mm, os quais foram esterilizados e fixados em placas de cultura celular. Na 1ª parte, em 12 espécimes, foi padronizada a associação dos três microrganismos utilizando quatro modelos experimentais diferentes. Após padronização, 48 espécimes foram contaminados com suspensões de E. coli, E. faecalis e C.albicans, sendo o período total de contaminação de 28 dias. Após, os canais radiculares foram preparados biomecanicamente, sendo divididos em 4 grupos experimentais (n=12) de acordo com o agente irrigante utilizado: G1) extrato glicólico de própolis; G2) extrato glicólico de sálvia; G3) solução de clorexidina 2% e G4) solução fisiológica (controle). Todos os espécimes receberam como medicação intracanal (MIC) pasta de bardana + hidróxido de cálcio por 14 dias. Foram realizadas quatro coletas do conteúdo do canal radicular. Para todas as coletas foram realizadas análise microbiológica (semeadura em meio de cultura seletivo e contagem de UFC/mL) e quantificação de endotoxinas (lisado de Limulus). Os resultados foram analisados estatisticamente (ANOVA e teste de Tukey, 5% / Kruskall Wallis e Dunn, 5%). Nos grupos G1 (própolis) e G3 (clorexidina) houve eliminação total dos microrganismos após instrumentação, sendo estatisticamente diferente dos grupos G2 e G4 (p<0,05). A sálvia (G2) apresentou melhores resultados que o controle (G4) na 1ª coleta após instrumentação, entretanto, na 2ª coleta foram semelhantes. Após medicação intracanal, em todos os grupos houve eliminação dos três microrganismos (p>0,05)... / The proposal of this research was to standardize the association of three microorganisms (E. faecalis, C. albicans and E. coli) in endodontic root canal and evaluate the effectiveness of natural extracts as irrigating agents and intracanal medication on the microrganisms and endotoxin. There have been used sitty humans teeth, unirradiculados sized 16 mm, wich were sterilized and fixed to celular cultured plaques. In the first part, in 12 specimen, the association of three microrganisms was standardized using 4 different experimental samples. After standardizing, 48 specimen were contamined with suspensions of E. faecalis, C. albicans and E. coli, and 28 days was the period of contamination. After that, the root canal were biomedically prepared, being divided into 4 experimental groups (n=12) according to the irrigating agent used: G1) propolis extract in glicolic solution; G2) salvia extract in glicolic solution; G3)Chlorhexidine solution 2%; G4)fisiologic solution (control). All the specimen have been treated with intracanal medication of Arctium lappa + calcium hydroxide paste for 14 days. There have been collected 4 samples of the root canal content. For all the collections, microbiological analysis (sowing of selective culture media and UFC/mL countable) and endotoxin (Limulus Amebocyte Lysate) were done. The results were statistically (ANOVA and Tukey test, 5%/ Kruskall Wallis and Dunn test). In the groups G1, G3 there was total elimination of the microrganisms after intrumentations being statistically different from the G2 and G4 groups (p<0,05). In G2 groups, presented better results than the control (G4) in the first collection after instrumentation, however, in the second colecction they were similar after intracanal medication, there was the elimination of the three microorganisms in all the groups (p>0,05)... (Complete abstract, click electronic access below)
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Estudos da utilização de sangue de abatedouros como substrato fermentativo para produção de Bacillus thuringiensis por fermentação submersa

Ernandes, Samara [UNESP] January 1998 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:06Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 1998Bitstream added on 2014-06-13T20:50:02Z : No. of bitstreams: 1 ernandes_s_me_araiq.pdf: 3011608 bytes, checksum: 7296c8f780cd8e98400ae8e9f3ecfc09 (MD5) / Not available
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Plantas daninhas, atributos biológicos e elementos-traço em latossolo tratado com lodo de esgoto por treze anos consecutivos

Silva, Elzane Freitas Leite [UNESP] 09 February 2012 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:11Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-02-09Bitstream added on 2014-06-13T18:50:27Z : No. of bitstreams: 1 silva_efl_me_jabo.pdf: 383641 bytes, checksum: 59b012609413039433f00a07564e3f1e (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Este estudo teve como objetivo avaliar o efeito de doses crescentes de lodo de esgoto (LE), aplicadas por treze anos em Latossolo Vermelho eutroférrico, nos atributos biológicos e bioquímicos, nos teores de elementos-traço do solo e no acúmulo destes pelas plantas daninhas. O experimento foi conduzido em condições de campo, em Jaboticabal-SP, utilizando-se delineamento em blocos casualizados com quatro doses de LE (0, 5, 10 e 20 Mg ha-1, base seca) e cinco repetições. As amostras de solo (0 a 10 cm), plantas daninhas e resíduos culturais foram coletadas em outubro de 2010, 130 dias após a colheita do milho. Os valores do carbono da biomassa microbiana não variaram em função das doses de LE, porém os valores de respiração basal e quociente metabólico foram maiores nas doses 10 e 20 Mg ha-1. Para o quociente microbiano, o menor valor foi observado na dose 0 Mg ha-1 de LE. Os teores totais de Cd e Cr no solo não variaram em função das doses de LE. De forma contrária, os teores totais de Ni e Pb no solo aumentaram proporcionalmente até a dose 10 Mg ha-1. A atividade das enzimas desidrogenase, arilsulfatase, celulase e urease não variou. Porém a atividade hidrolítica do diacetato de fluoresceína (FDA) e da fosfatase ácida foram maiores na dose 20 Mg ha-1. Em relação às plantas daninhas e a palha do milho a adição de LE por longo período causou efeitos semelhantes nos valores da produção de matéria seca e nos teores totais de Cd, Cr, Ni e Pb. Entretanto, os teores acumulados de Cd, Ni e Pb na parte aérea dos grupos de planta daninha aumentaram até a dose 10 Mg ha-1 diferindo da testemunha. O LE causou atividade biológica negativa no solo nas doses 10 e 20 Mg ha-1. A atividade foi indicada pelos aumentos na respiração basal, na atividade hidrolítica do FDA e na atividade da fosfatase ácida. Entretanto, o aumento do quociente metabólico e a diminuição do quociente microbiano indicaram estar havendo estresse / This study aimed to evaluate the effect of increasing doses of sewage sludge (SS), applied for thirteen years in Oxisol in biological and biochemical attributes, the levels of trace elements in soil and accumulation of weed. The experiment was conducted under field conditions in Jaboticabal, using a randomized block design with four doses of SS (0, 5, 10 and 20 Mg ha-1, dry basis) and five replicates. Soil samples (0-10 cm), weeds and crop residues were collected in October 2010, 130 days after the corn harvest. The values of microbial biomass carbon did not vary with the doses of SS, but the values of basal respiration and metabolic quotient were higher in doses 10 and 20 Mg ha-1. For the microbial quotient, the lowest value was observed at the dose 0 Mg ha-1 SS. Total concentrations of Cd and Cr in the soil did not vary with the doses of LE. Conversely, the total concentration of Ni and Pb in soil increased proportionally to the dose of 10 Mg ha-1. The activity of enzymes dehydrogenase, arylsulfatase, cellulase and urease did not change. However, the hydrolytic activity of the fluorescein diacetate (FDA) and acid phosphatase were higher in the dose 20 Mg ha-1. In relation to weeds and straw corn, adding SS for a long period caused similar effects on the values of dry matter production and total contents of Cd, Cr, Ni and Pb. However, the accumulated contents of Cd, Ni and Pb in the aerial part of the weed groups increased until the dose of 10 Mg ha-1 differed from the control. The SS has caused negative biological activity in soil at doses 10 and 20 Mg ha-1. The activity was indicated by increases in respiration, FDA hydrolytic activity and acid phosphatase activity. However, the increase metabolic quotient and decrease of the ratio having indicated that microbial stress
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Flutuação populacional do oligochaetaedafico Amynyhas spp. (Kinberg, 1867) emquatro ecossistemas, atraves de dois metodos de extração

Tanck, Benedito Carlos Borges 21 August 2012 (has links)
Resumo: Neste trabalho procurou-se avaliar a influência dos sistemas plantio direto e convencional e dos ecossistemas naturais mata nativa e campo nativo, na região dos campos gerais no Paraná, sobre a densidade populacional do Oligochaeta edá:icc Amynthas spp. (KINBERG, 1867). As áreas situam-se no 2° planalto paranaense entre as cidades de Ponta Grossa e Castro. O es~udo foi conduzido no período de fevereiro de 1993 a janeiro de 1994, sendo que as avaliações foram feitas mensalmente. Nos agroecossistemas foram desenvolvidas as cul turas de milho (P- 3069), triticale (Arapoti) e soja (EMBRAPA-4) simultaneamente, com aplicações de fertilizantes e agrotóxicos. Já nos ecossistemas naturais ocorrem vegetação carac~erística de estepes de gramíneas baixas para o campo nativo e de matas de galerias subtropícais para a mata nativa. Para a determinação da densidade e biomassa dos Oligochaeta, utilizou-se o método ativo, através do uso de substâncias químicas repelentes: formol 1% e permanganato de potássio 0,2 %. As amostragens foram realizadas usando-se um quadrado de madeira com área de 0,25 m2 , onde as soluções extratoras eram adicionadas independentes. Os organismos, após a coleta, foram conduzidos ao laboratório de Biologia do Solo do Departamento de fi totecnica e fí tossaní tarísmo do SCA/UFPR, para serem identificados, quantificados numericamente e pesados. A densidade e biomassa populacional do Oligochaeta Amynthas spp. foram mais acentuadas no agroecossistema plantio direto e no ecossistema natural mata nativa, enquanto que no agroecossistema plantio convencional foram baixas, devido provavelmente a movimentação mecânica do solo e baixo conteúdo de resíduos orgânicos. Já no ecossistema natural campo nativo não ocorreu presença do gênero estudado, devido as características peculiares que envolvem a área. Em relação aos extratores, o formol 1% mostrou-se com melhor rendimento no sistema de plantio direto, enquanto que o permanganato de potássio 0,2% obteve resultados significativos relacionados com a biomassa no ecossistema mata nativa. A caracteri zação física e química do solo foi realizada a partir de coletas sazonais, para ser observado alterações. Para a análise estatística utilizou-se o programa SANEST, onde avaliou-se diferenças entre os ecossistemas plantio direto e mata nativa e os extratores, através da aplicação de ANOVA e Teste de TUKEY ao nível de 5% de probabilidade, enquanto que para os ecossistemas plantio convencional e campo nativo não foi possível realizar análise estatística, devido a inexistência de comparação entre os intervalos.
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Caracterização polifásica de micro-organismos isolados de superfícies metálicas na Usina Hidrelétrica de Tucuruí, Pará, Brasil

Poitevin, Carolina Gracia January 2014 (has links)
Orientadora : Profª Drª Patricia do Rocio Dalzoto / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Microbiologia, Parasitologia e Patologia Básica. Defesa: Curitiba, 28/03/2014 / Inclui referências / Área de concentração: Microbiologia / Resumo: A corrosão influenciada por micro-organismos (CIM) é a mudança do potencial eletroquímico na interface metal/solução, causado pela produção de metabólitos de bactérias e fungos que crescem aderidos a superfícies metálicas na forma de biofilmes. O conhecimento da microbiota dos biofilmes permite a escolha do melhor antimicrobiano a ser utilizado para reduzir os efeitos da CIM. A abordagem polifásica, que consiste na associação de técnicas morfológicas, químicas e genéticas, é interessante para uma correta caracterização de micro-organismos. A espectroscopia no infravermelho aparece como uma opção para a identificação de fungos e bactérias devido à rapidez na execução e ao menor custo, quando comparado com as demais técnicas. O objetivo deste trabalho foi o isolamento e a identificação polifásica de micro-organismos presentes em corpos de prova metálicos instalados na Usina Hidrelétrica de Tucuruí (PA), e a avaliação do melhor biocida a ser utilizado para o controle da formação de biofilmes. As coletas foram feitas a cada dois meses entre 2011 e 2012, e os micro-organismos identificados por macro e micromorfologia, bioquimismo e biologia molecular. Os antimicrobianos Orobor, MXD-100 (MaxClean®), hidróxido de sódio, extrato de aroeira (Schinus terebinthifolius) e extrato de erva-mate (Ilex paraguariensis) foram testados quanto a sua eficiência. Os dados foram analisados por ANOVA (p<0,01) seguido por teste de Scott-Knott para comparação das médias (p<0,05). Foram isoladas 358 bactérias aeróbias ou anaeróbias facultativas, pertencentes em sua maioria aos gêneros Bacillus, Citrobacter, Shigella, Pseudomonas, Enterobacter e Acinetobacter. Foi verificada a presença de bactérias redutoras de sulfato e bactérias oxidantes de ferro, além do isolamento de 94 fungos, com predomínio dos gêneros Penicillium e Aspergillus. Os antimicrobianos MXD-100 1 ppm e 3 ppm, Orobor 10 mL/L e NaOH pH 14 foram os mais eficientes no controle, reduzindo em aproximadamente 35% o crescimento bacteriano e fúngico. A espectroscopia no infravermelho foi testada para classificação microbiana, e se mostrou eficiente na identificação de fungos filamentosos, mas novas metodologias devem ser testadas para a identificação bacteriana. A caracterização de micro-organismos encontrados nos corpos de prova metálicos mostra a biodiversidade da região e está relacionada ao processo de biocorrosão, possibilitando o desenvolvimento de novas estratégias de controle. Palavras chave: Biofilme, biocorrosão, biocida e NIRS. / Abstract: Microbially Influenced Corrosion (MIC) is the change of electrochemical potential at the interface metal/solution, caused by metabolites produced by bacteria and fungi growing in metallic surfaces as biofilms. The knowledge of biofilms’ microbiota allow us to choose the best biocide to reduce the effects of MIC. Polyphasic approach, consisting in associate morphological, chemical and genetical techniques, is interesting for the correct characterization of micro-organisms. Infrared spectroscopy shows up as an option to identify fungi and bacteria because of faster response and lower costs, when compared with other techniques. The aim of this work were the isolation and the polyphasic identification of micro-organisms present in metallic coupons installed in Tucuruí’s Power Plant (PA), and the evaluation of the best biocide to be used for the control of biofilm formation. Samples were collected every two months during 2011 and 2012, and micro-organisms were identified by macro and micromorphology, biochemical assays and molecular tools. The efficiency of biocides Orobor, MXD-100 (MaxClean®), sodium hydroxide, Schinus terebinthifolius extract and Ilex paraguariensis extract were tested. Data were analyzed by ANOVA (p<0.01) followed by Scott-Knott test for comparison of means (p<0.05). It was isolated 358 aerobic or facultative anaerobic bacteria, belonging mostly to the genera Bacillus, Citrobacter, Shigella, Pseudomonas, Enterobacter and Acinetobacter. Sulfate-reducing and iron-oxidizing bacteria were also found, in addition of isolation of 94 fungi, with prevalence of the genera Penicillium and Aspergillus. MXD-100 1 ppm and 3 ppm, Orobor 10 mL/L and NaOH pH 14 were the most efficient biocides, reducing approximately 35% of bacteria and fungi. Infrared spectroscopy was tested for micro-organisms classification, and it was efficient to identify filamentous fungi, but new methodologies need to be tested to bacterial identification. The characterization of micro-organisms found on metal surfaces highlights the biodiversity of the region and can be related to the process of biocorrosion, enabling the development of new strategies for its control. Key words: Biofilm, biocorrosion, biocide and NIRS.
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Plantas daninhas, atributos biológicos e elementos-traço em latossolo tratado com lodo de esgoto por treze anos consecutivos /

Silva, Elzane Freitas Leite. January 2012 (has links)
Orientador: Wanderley Jose de Melo / Coorientador: Gabriel Maurício Peruca de Melo / Banca: Ademir Sérgio Ferreira de Araújo / Banca: Ely Nahas / Resumo: Este estudo teve como objetivo avaliar o efeito de doses crescentes de lodo de esgoto (LE), aplicadas por treze anos em Latossolo Vermelho eutroférrico, nos atributos biológicos e bioquímicos, nos teores de elementos-traço do solo e no acúmulo destes pelas plantas daninhas. O experimento foi conduzido em condições de campo, em Jaboticabal-SP, utilizando-se delineamento em blocos casualizados com quatro doses de LE (0, 5, 10 e 20 Mg ha-1, base seca) e cinco repetições. As amostras de solo (0 a 10 cm), plantas daninhas e resíduos culturais foram coletadas em outubro de 2010, 130 dias após a colheita do milho. Os valores do carbono da biomassa microbiana não variaram em função das doses de LE, porém os valores de respiração basal e quociente metabólico foram maiores nas doses 10 e 20 Mg ha-1. Para o quociente microbiano, o menor valor foi observado na dose 0 Mg ha-1 de LE. Os teores totais de Cd e Cr no solo não variaram em função das doses de LE. De forma contrária, os teores totais de Ni e Pb no solo aumentaram proporcionalmente até a dose 10 Mg ha-1. A atividade das enzimas desidrogenase, arilsulfatase, celulase e urease não variou. Porém a atividade hidrolítica do diacetato de fluoresceína (FDA) e da fosfatase ácida foram maiores na dose 20 Mg ha-1. Em relação às plantas daninhas e a palha do milho a adição de LE por longo período causou efeitos semelhantes nos valores da produção de matéria seca e nos teores totais de Cd, Cr, Ni e Pb. Entretanto, os teores acumulados de Cd, Ni e Pb na parte aérea dos grupos de planta daninha aumentaram até a dose 10 Mg ha-1 diferindo da testemunha. O LE causou atividade biológica negativa no solo nas doses 10 e 20 Mg ha-1. A atividade foi indicada pelos aumentos na respiração basal, na atividade hidrolítica do FDA e na atividade da fosfatase ácida. Entretanto, o aumento do quociente metabólico e a diminuição do quociente microbiano indicaram estar havendo estresse / Abstract: This study aimed to evaluate the effect of increasing doses of sewage sludge (SS), applied for thirteen years in Oxisol in biological and biochemical attributes, the levels of trace elements in soil and accumulation of weed. The experiment was conducted under field conditions in Jaboticabal, using a randomized block design with four doses of SS (0, 5, 10 and 20 Mg ha-1, dry basis) and five replicates. Soil samples (0-10 cm), weeds and crop residues were collected in October 2010, 130 days after the corn harvest. The values of microbial biomass carbon did not vary with the doses of SS, but the values of basal respiration and metabolic quotient were higher in doses 10 and 20 Mg ha-1. For the microbial quotient, the lowest value was observed at the dose 0 Mg ha-1 SS. Total concentrations of Cd and Cr in the soil did not vary with the doses of LE. Conversely, the total concentration of Ni and Pb in soil increased proportionally to the dose of 10 Mg ha-1. The activity of enzymes dehydrogenase, arylsulfatase, cellulase and urease did not change. However, the hydrolytic activity of the fluorescein diacetate (FDA) and acid phosphatase were higher in the dose 20 Mg ha-1. In relation to weeds and straw corn, adding SS for a long period caused similar effects on the values of dry matter production and total contents of Cd, Cr, Ni and Pb. However, the accumulated contents of Cd, Ni and Pb in the aerial part of the weed groups increased until the dose of 10 Mg ha-1 differed from the control. The SS has caused negative biological activity in soil at doses 10 and 20 Mg ha-1. The activity was indicated by increases in respiration, FDA hydrolytic activity and acid phosphatase activity. However, the increase metabolic quotient and decrease of the ratio having indicated that microbial stress / Mestre
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Proteômica de Paracoccidioides brasiliensis : uma análise quantitativa das fases miceliana e leveduriforme e da transição dimórfica

Rezende, Tereza Cristina Vieira de 11 October 2011 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular, 2011. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2012-02-08T13:54:16Z No. of bitstreams: 1 2011_TerezaCristinaVieiraRezende.pdf: 7799530 bytes, checksum: ac6b8b811bee8d8f780e0d60ae6f7bc8 (MD5) / Approved for entry into archive by Marília Freitas(marilia@bce.unb.br) on 2012-02-15T11:45:56Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_TerezaCristinaVieiraRezende.pdf: 7799530 bytes, checksum: ac6b8b811bee8d8f780e0d60ae6f7bc8 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-02-15T11:45:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_TerezaCristinaVieiraRezende.pdf: 7799530 bytes, checksum: ac6b8b811bee8d8f780e0d60ae6f7bc8 (MD5) / Dimorfismo é uma característica importante para sobrevivência fúngica em diferentes ambientes e tem sido relacionado com a virulência. O fungo ascomiceto, Paracoccidioides brasiliensis, agente causador da paracoccidioidomicose, pode crescer nas fases de micélio ou de levedura. A patogenicidade do P. brasiliensis é frequentemente associada com a transição dimórfica, de saprófita a patogênico, mas os mecanismos que regulam esse processo permanecem obscuros. Uma das maneiras de estudar esse fenômeno seria isolar e caracterizar proteínas que são especificamente expressas em um dos estágios do ciclo de vida e/ou durante a diferenciação. Eletroforese bidimensional (2-DE) foi utilizada para comparar o proteoma de micélio e de levedura do isolado Pb01 e após 22 h de transição de micélio para levedura. Os géis corados pela prata de três replicatas biológicas independentes foram digitalizados e as imagens foram analisadas utilizando-se o software Image Master 2D Platinum 6.0 software (GE Healthcare). A detecção dos spots e o pareamento foram realizados. A intensidade dos spots foi normalizada e as análises estatísticas avaliada por one-way ANOVA. Os spots de interesse obtidos dos géis 2-D foram retirados, digeridos com tripsina e os peptídeos foram então analisados por MS e/ou MS/MS. Um total de 100 proteínas/isoformas foi identificado; 81 foram diferencialmente expressas nas três fases do fungo, enquanto que 19 proteínas/isoformas foram constitutivamente expressas. A expressão de proteínas como superóxido dismutase e peroxiredoxina mitocondrial foi mais abundante na fase miceliana. Nos estágios iniciais da transição (22 h) algumas enzimas envolvidas na glicólise, como enolase e fosfoglicomutase, estão aumentadas. Proteínas de choque térmico e ATP sintase também estão significantemente aumentadas durante o evento de transição. Proteínas preferencialmente expressas na fase leveduriforme foram identificadas. Muitas das enzimas da via glicolítica e algumas enzimas do ciclo do glioxalato e metabolismo de lipídeos foram mais abundantes em levedura. Para validar os resultados dos géis 2-D foi realizado western blotting de seis proteínas diferentes, e os resultados foram confirmados. Os resultados foram validados por RT-PCR em tempo real nas três condições estudadas, incluindo conídio e transição de conídio para levedura. Os resultados demonstram uma mudança no metabolismo durante a transição de micélio para levedura; o mesmo padrão foi evidenciado na transição de conídio para levedura. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / Fungal dimorphism is important for survival in different environments and has been related to virulence. The ascomycete Paracoccidioides brasiliensis, the causative agent of paracoccidioidomycosis, can grow as mycelia or yeast. The pathogenicity of P. brasiliensis is frequently associated with the dimorphic shift, from a saprobe to a pathogenic lifestyle, but the mechanisms that regulate the process is still poorly understood. One way to study this phenomenon is to isolate and characterize proteins that are specifically expressed in one of the stages of the life cycle and/or during differentiation. Two-dimensional gel electrophoresis we used to investigate the proteins expressed differentially during transition from mycelia to yeast forms of isolate Pb01 after 22 h of temperature shift. Silver-stained gels of three independent biological replicates were digitalized and the images were analyzed using the ImageMaster 2D Platinum 6.0 software (GE Healthcare). Spot detection and matching was performed. Spot intensities were normalized and the statistics analyses were estimated by one-way ANOVA. The spots of interest were excised, in-gel digested with trypsin, and the peptides were then analyzed by MS and/or MS/MS. A total of 100 proteins/isoforms were identified; 81 were differentially expressed in the three phases of the fungus, whereas 19 proteins/isoforms were constitutively expressed. Enzymes such as superoxide dismutase and mitochondrial peroxiredoxin have been detected as abundant in the mycelium phase. After the early stage of transition (22 h) some enzymes involved in glycolysis, such as enolase and phosphoglutomutase, were increased. Heat shock proteins and ATP synthase were also significantly increased in the transition event. Proteins preferentially expressed in the yeast phase were identified. Most of the enzymes of glycolysis, and some of the glyoxylate cycle and lipid metabolism were more abundant in yeast cells. To validate the 2-D gels results we performed western blotting of six different proteins, and the results were confirmed. The results were also validated by real-time RT-PCR in the three studied conditions, including conidia and conidia-yeast transition. The results demonstrated a shift in the metabolism during transition from mycelia to yeast cell; the same patterns were evidenced in the conidia to yeast transition.
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Investigação laboratorial de injeção de microrganismos em meio poroso / Laboratorial investigation of microorganisms injection in porous media

Abram, Marba Bastos 12 November 1996 (has links)
Orientadores: Osvair Vidal Trevisan, Glaucia Maria Pastore / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Mecanica / Made available in DSpace on 2018-07-26T15:47:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Abram_MarbaBastos_M.pdf: 21093628 bytes, checksum: d099e99a9fb2853971b4603f08e8efc5 (MD5) Previous issue date: 1996 / Resumo: Experimentos em laboratório, simulando as condições de reservatório, foram conduzidos com objetivo de avaliar a viabilidade técnica da utilização de microrganismos na recuperação adicional de petróleo. A linhagem de microrganismos utilizada foi uma espécie do Bacillus subtilis selecionada por produzir bio-surfactante, que reduz a tensão superficial. Os microrganismos foram transportados em amostras de arenito Botucatu. Os ensaios consistiram basicamente em colocar estes testemunhos na condição de saturação residual a injeção de água (salmoura), simulando a fase final de uma recuperação secundária em reservatório, para então submetê-los ao tratamento com a injeção de microrganismos, verificando a existência ou não de recuperação adicional de petróleo. Inicialmente os microrganismos foram injetados dispersos em meio composto de nutrientes, fontes de carbono e de nitrogênio, necessários ao seu crescimento em meio poroso. Devido a baixa concentração ou inexistência de microrganismos nos efluentes, foi constatada a alta retenção da células no meio poroso, fato que poderia acarretar a baixa eficiência na recuperação adicional de petróleo. Outros procedimentos visando a melhoria do transporte das células no meio poroso foram avaliados: (a) lavagem prévia das células e dissolução em meio nutriente estéril para injeção em meio poroso; e (b) lavagem prévia das células com dispersão em solução salina para injeção no testemunho, seguido da injeção do meio nutriente estéril. Em ambos os casos não houve recuperação adicional de petróleo. Uma possível influência do tempo de incubação ao qual o testemunho foi submetido também foi avaliado / Abstract: Experimental laboratory studies simulating reservoir conditions were conducted to evaluate the technical feasibility of using microorganisms in enhance petroleum recovery. The microorganism used was the Bacillus subtilis species, a bio-surfactant producer. The microorganisms were transported in cores of the Botucatu sandstone (from Paraná Basin). Basically, the test consisted in first waterflooding the core plugs up to the residual oil saturation, thus simulating the last stage ofreservoir secondary recovery. The plugs were then submitted to microorganism injection in order to verify the possibility of additional oil recovery, after an incubation period allowed microorganism growth and bio-product metabolization. Microorganisms were first injected as dispersed in the nutrient media composed by carbon and nitrogen sources. Analyses of the effluents showed absence or low concetration of cells during the fluid injection period, indicating that retention of microorganisms could be occuring. In this case, poor cell distribuition in the sandstone core would result in low recovery efficiency. Attempts to solve the problem included: (i) previous cell wash and dissolution in sterile nutrient media before inoculating the plug; (ii) previous cell wash and dispersion in sterile brine before inoculation followed by nutrient injection; (iii) inoculation followed by repeated cycles of static incubation. A better cell distribuition in sandstone core was obtained, but the experiments didn't get an enhance oi! recovery / Mestrado / Recuperação Especial de Petroleo / Mestre em Engenharia Mecânica
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Resistencia a antimicrobianos de microrganismos colhidos em artigos e equipamentos odontologicos

Motta, Rogério Heládio Lopes 05 February 2002 (has links)
Orientador: Thales Rocha de Mattos Filho / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba / Made available in DSpace on 2018-08-01T10:31:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Motta_RogerioHeladioLopes_M.pdf: 3737116 bytes, checksum: 4b2776a6fb8058f1adbf5dcebf1c2408 (MD5) Previous issue date: 2002 / Resumo: O correto uso de materiais esterilizados e barreiras de proteção são essenciais para o tratamento odontológico seguro, tanto para o paciente como para o cirurgião-dentista, diminuindo os riscos de contaminação cruzada. o objetivo deste trabalho foi quantificar a prevalênciade bactérias no ambiente da Clínica Odontológica da Faculdade de Odontologia de Piracicaba - UNICAMP. Foram realizadas colheitas de bactérias em diferentes locaisda Clínica utilizando-se swabs esterilizados, sendo colhidas amostras dos botões das cadeiras odontológicas, canhões de raio-X, luvas de procedimentos, maçanetas da porta de entrada da clínica, alças dos refletores, seringas tríplices e teclas "enter" dos computadores. As amostras foram colocadas em Placas de Petri contendo BHI e encubadas a 37° C, por 24 horas, assim como a 37°C, com 10% CO2, por 24 horas Os períodos de colheitas foram: antes, durante e após o término dos atendimentos da clínica. Foram contadas as unidades formadoras de colônias (ufc), sendo que a identificação presuntiva foi realizada utilizando-se o método de coloração de GRAM. A identificação das espécies foi feita através de testes bioquímicos. As bactérias colhidas foram submetidas ao teste de suscetibilidade antimicrobiana em agar, utilizando-se doze discos de antibióticos: ampicilina/10µg (amp), amoxicilina/10µg (amox), azitromicina/15µg (azi), claritromicina/15µg (cla), eritromicina/15µg (eri), cefadroxil/10µg (cef), clindamicina/2µg (clin), penicilina G/10u (pen), amoxicilina/20µg + ácido clavulânico/10µg (amox+cla), cloranfenico/30µg (cio), oxacilina 1µg (oxa) e vancomicina 30µg (van) . As porcentagens de resistência aos antimicrobianostestados foram: amp (62%), amox (68%), azi (35%), clari (58%), eri (42%), cef (56%), clin (51%), pen (71%), amox+ cla (47%), cio (31%), oxa (11%) e van (0%). Os resultados mostraram que as bactérias mais prevalentes foram os Streptococcus do grupo viridans, seguidas por Staphy/ococcus epidermidis. O botão de acionamento de cadeira foi o local com maior contaminação.O maior número de bactérias foi encontrado durante as atividades clínicas, independente da situação clínica analisada. Com os resultados do trabalho, podemos concluir que: 1) A atividade clínica aumenta a contaminação dos artigos e equipamentos odontológicos; 2) As bactérias encontradas mostraram alta porcentagem de resistência aos antibióticos testados; 3) Streptococcus do grupo viridans e Staphy/ococcus epidermidis foram os microrganismos mais encontrados / Abstract: Nowadays patients' infectious diseases mean serious risks to dentistry professionals. Thus, correct use of sterilized materiais, and self-protection equipment is essential. Bioaerosolsare an important considerationfor infection control and occupational health, since infectious agents could be transmitted via aerosols to patients or staff in the confines of the dental unit. The aim of this study was to identify microorganisms on dental equipment in the undergraduate clinic of Piracicaba Dentistry School. Also, antibiotic susceptibility tests were carried out against ali collected microorganisms. Microorganisms were collected from push buttons of dental chairs, air-water syringes, X ray device, gloves, computer keys, doorknobs, reflector handle, and lobby chairs by using sterilized swabs. They were inoculated on BHI agar, and incubated at 37°Cj24h. Ali microorganisms were collected in three different periods, before, during, and after clinical procedures. After counting, microorganisms were classified using Gram staining. Antibiotic susceptibility tests were assayed using commercial paper discs on Mueller-Hinton agar with 5% sheep-blood. Microorganisms were Gram+ cocci (67%), Gram+ bacilli(26%), Gram- cocci (5%), and others (2%). Rate of resistant strains was ampicillin/l0µg (62%), amoxicillin/l0µg (68%), azithromycin/15µg (35%), clarithromycin/15µg (58%), erythromycin/15µg (42%), cefadroxil/l0µg (56%), clindamycin/2µg (51%), penicillin/l0µ (71%), amoxicillin/20µg+clavulanic acid/10µg (47%), chloramphenicol/ 30µg (31%), oxacillin (11%)and vancomycin (0%). Push buttons of dental chairs were the most contaminated (p<0,05),and S.viridans were the most prevalent microorganisms. The highest number of microorganisms (p<0,05) was found during clinical procedures. We concluded that: increases environmental contamination;2) environmental microorganisms show high resistance rate against common antibiotics;3) S. viridans and S. epidermidis are the most common environmental microorganism / Mestrado / Farmacologia, Anestesiologia e Terapeutica / Mestre em Odontologia
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Efeito antimicrobiano in vitro da Mikania laevigata e da Mikania glomerata sobre estreptococos do grupo mutans

Yatsuda, Regiane 03 August 2018 (has links)
Orientadores: Pedro Luiz Rosalen, Hyun Koo / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba / Made available in DSpace on 2018-08-03T20:21:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Yatsuda_Regiane_M.pdf: 430240 bytes, checksum: 873a44bd03acd2e13ff4f548d9400ad0 (MD5) Previous issue date: 2004 / Mestrado

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