Thesis (M.S.)--Oregon State University, 2007. / Printout. Includes bibliographical references (leaves 81-83). Also available on the World Wide Web.

Thesis (M.S.)--Duquesne University, 2006. / Title from document title page. Abstract included in electronic submission form. Includes bibliographical references (p. v-xi) and index.

Στόχος της εργασίας αυτής είναι η καταγραφή και αξιολόγηση της ποιότητας δέκα παραλιών του νομού Αχαΐας, καθώς και η σύγκριση των μικροβιολογικών και γεωλογικών στοιχείων που διεξάγονται μέσω μηνιαίων επαναλαμβανόμενων δειγματοληψιών και αναλύσεων. Εβδομήντα δείγματα άμμου συλλέχθηκαν μηνιαία, σε χρονικό διάστημα επτά μηνών και ακολούθησαν αναλύσεις όσον αφορά τα εξής βακτήρια: ολικά κολοβακτηριοειδή, e.coli και εντερόκοκκους. Παράλληλα πραγματοποιήθηκαν γεωλογικές αναλύσεις των δειγμάτων, όσον αφορά το μέγεθος των κόκκων, την σφαιρικότητα, την στρογγύλωση καθώς και τον υπολογισμό των στατιστικών τους παραμέτρων. / The aim of this paper is to record and evaluate the quality of ten beaches of Achaia, and to compare the microbiological and geological data held by recurring monthly sampling and analysis. Seventy samples of sand were collected monthly, over a period of seven months, followed by analyzes of the following bacteria: total coliforms, e.coli and enterococci. Furthermore, a geological analysis of the samples for grain size, the sphericity and the calculation of statistical parameters.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:32Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-12-15Bitstream added on 2014-06-13T19:09:24Z : No. of bitstreams: 1 scuracchio_pa_me_arafcf.pdf: 218891 bytes, checksum: c8aae0d323ca8f97bd9a60baa02de3d6 (MD5) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / Sabe-se da importância de se tratar a água destinada ao consumo humano, pois, é capaz de veicular grande quantidade de contaminantes físico-químicos e/ou biológicos, cujo consumo tem sido associado a diversos problemas de saúde. Assim, é necessário saber se a qualidade da água destinada ao consumo humano, responde as exigências da legislação. O objetivo desta pesquisa foi avaliar a qualidade da água que abastece as escolas e creches municipais da cidade de São Carlos – SP. Foram coletadas 186 amostras de água, em três pontos distintos: rede, reservatório e filtro. Para análise de coliformes totais e coliformes fecais/E. coli utilizou-se a técnica de substratos cromogênicos/Colilert; para contagem de bactérias heterotróficas foi utilizada a técnica de cultivo em profundidade; para determinação do pH adotou-se leitura direta no pHâmetro; para determinação de flúor foi utilizado o método SPANDS; para determinação de cloro utilizou-se o método DPD; para determinação de turbidez foi utilizado o método nefelométrico e para determinação da cor o método colorimétrico. Para coliformes fecais/E.coli apenas uma amostra do filtro apresentou positividade. Para coliformes totais, sete amostras (22,5%) da rede, seis (19,3%) do reservatório e seis (19,3%) do filtro apresentaram contaminação na primeira colheita e sete (22,5%) amostras da rede, três (9,6%) do reservatório e sete (22,5%) do filtro na segunda coleta. Para bactérias heterotróficas uma amostra da rede, uma do reservatório e 13 (41,9%) do filtro apresentaram contagens acima de 500UFC/ml na primeira coleta e três (9,6%) amostras da rede e do reservatório e 14 (45,1%) do filtro na segunda coleta. Para pH, cinco amostras (16,1%) da rede e uma do filtro não atenderam ao padrão exigido pela legislação na primeira coleta e sete amostras (22,6%) da rede na segunda coleta... / Today, we know the importance of treating water for human consumption, therefore, is capable of conveying large amounts of physical and chemical contaminants and / or biological agents, whose consumption has been associated with several health problems. Thus, it is necessary to know if the quality of water intended for human consumption, answers the requirements of the law. The aim of this study was to evaluate the quality of water supply schools and day care centers of São Carlos - SP. We collected 186 samples of water, on three points: network, tank and filter. For analysis of total coliform and fecal coliform / E. coli we used the technique of chromogenic substrates / Colilert; for heterotrophic bacterial count technique was used to grow in depth, to determine pH reading was adopted in direct pHâmetro; for determination of fluoride, the method SPANDS; to determine chlorine used the DPD method, for determination of turbidity nephelometric method was used to determine the color and colorimetric method. For fecal coliform / E.coli only one sample was positive filter. For total coliforms, seven samples (22.5%) of the network, six (19.3%) of the tank and six (19.3%) of the filter was contaminated in the first harvest and seven (22.5%) samples of the network three (9.6%) of the reservoir and seven (22.5%) of the filter in the second collection. Heterotrophic bacteria from a sample network, a tank and 13 (41.9%) of the filter had counts above 500UFC/ml the first harvest and three (9.6%) samples of the network and the reservoir and 14 (45, 1%) of the filter in the second harvest. For pH, five samples (16.1%) of the network and a filter did not meet the standard required by legislation in the first harvest and seven samples (22.6%) of the net in the second harvest. For fluoride 27 (87.0%) of the network, 24 (77.4%) of the reservoir and 25 (80.6%) were outside of the filter pattern in the first... (Complete abstract click electronic access below)

CAPES / A autenticidade adequada de um produto cárneo conforme seu padrão de identidade (rotulagem) é imprescindível, por questões econômicas, de saúde éticas e religiosas, além de ser uma exigência dos órgãos vigentes de alimentos. Contudo, a identificação dos constituintes cárneos em um produto ainda é um desafio considerável para as autoridades, visto que nem sempre é possível detectá-los através dos métodos convencionais, principalmente após o processamento do produto. Este fator limitante torna a fraude por substituição de uma espécie animal por outra de menor valor econômico um ato muito comum. O presente trabalho tem como objetivo determinar a presença de carne suína e de frango em produtos processados a partir do diagnóstico molecular por Reação em Cadeia da Polimerase (PCR). Para tanto, realizou-se o diagnóstico molecular da espécie suína e de frango, primeiramente extraindo-se o DNA alvo, seguido da amplificação do mesmo. Em seguida, os oligonucleotídeos iniciadores das espécies suína e aviária foram avaliados quanto a sua especificidade e sensibilidade, mostrando-se eficazes, com limite de detecção a partir de 0,1%. Ao analisar 27 amostras de produtos cárneos comerciais, a metodologia PCR se mostrou satisfatória e robusta, uma vez que detectou adulteração em três amostras, além de não demostrar variação nos resultados em função do tratamento térmico utilizado no produto. / Proper authenticity of a meat product as your identity standard (labeling) is essential by economic issues, health and religious as well as being a requirement in existing organs of food. However, the identification of constituents in a meat product is still a considerable challenge for the authorities, as it is not always possible to detect them by conventional methods, especially after processing the product. This limiting factor makes the fraud by replacement of one animal species by another of lower economic value a very common act. This study aims to determine the presence of pork and chicken in processed products from the molecular diagnostic by Polymerase Chain Reaction (PCR). For this, we carried out the molecular diagnosis of swine and chicken species, first extracting the target DNA, followed by amplification of the same. Thus, the primers of chicken and pork species were evaluated for specificity and sensitivity, showing effective, with a detection limit from 0.1%. By analyzing 27 samples of commercial meat products, the PCR method has proved satisfactory and robust, once adulteration as been detected in three samples. Besides not demonstrate variation us results regarding to heat treatment used in the product.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:52Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-06-07Bitstream added on 2014-06-13T19:03:31Z : No. of bitstreams: 1 alves_lmc_dr_jabo.pdf: 5616819 bytes, checksum: 4a53256d90bbcf403f575125bc5a14c7 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A água é um recurso natural indispensável à vida, é essencial à promoção social, à produção de alimentos e ao desenvolvimento econômico. Com o objetivo de se avaliar a qualidade microbiológica e físico-química de águas subterrâneas e superficiais na microrregião de Itapecuru-Mirim-MA foram colhidas 172 amostras de água, sendo 86 no período chuvoso (março a maio) e 86 amostras no período de estiagem (agosto a outubro). Destas, 39 amostras eram águas consumidas em residências rurais procedentes de poços artesianos, poços rasos, fontes naturais e Rede Publica de Abastecimento, 05 eram de uso doméstico, 08 de lavagem dos tetos das vacas; 02 de uso em laticínios, 01 de uso em matadouro, 01 de fábrica de polpas de frutas, 18 de bebedouros dos animais, 09 águas de uso em piscicultura e 03 de irrigação de hortaliças. Foram analisados parâmetros microbiológicos e físico-químicos e aplicado um questionário fechado contendo perguntas objetivas para se avaliar o nível de conhecimento das pessoas quanto à qualidade da água usada ou consumida e mapeado geograficamente os pontos de colheitas. Os resultados das análises microbiológicas e físico-químicas identificaram 52 (66,66 %) amostras de água de consumo humano em desacordo com os padrões microbiológicos e 23 (29,48%) em desacordo com os parâmetros físico-químicos, nove (90%) amostras de água de uso doméstico não atenderam aos padrões microbiológicos, enquanto seis (60%) não o foram para os padrões físico-químicos, para água de lavagem dos tetos evidenciaramse 13 (81,25%) e 10 (62,50%) amostras, respectivamente, fora dos padrões microbiológicos e físico-químicos vigentes. Não foi constatada contaminação microbiológica nem físico-química para água de uso em laticínio e em fábrica de polpa de frutas. Referente à água de uso em matadouro, uma (50%) amostra não atendeu aos padrões... / Water is a natural resource essential for life, it is essential to social promotion, food production and economic development. In order to evaluate the microbiological and physical chemistry quality of groundwater and surface water in the municipality of Itapecuru-Mirim-MA were collected 172 water samples, including 86 in the rainy season (March-May) and 86 samples in the dry weather period (August- October). From these total, 39 samples were water consumed in rural residences coming from shallow water wells, artesian water wells, natural sources and public water supply, 05 were domestic water, 08 from teat washings of cows; 02 for use in dairy products, 01 from the slaughterhouse, 01 from a factory fruit pulps, 18 from animal drinking fountains, 09 water samples used for pisciculture and 03 from vegetables irrigation. They were all analyzed for the microbiological and physical-chemical parameters. A close questionnaire with objective questions was also applied to evaluate the awareness level of people about the water quality used or consumed and the crops points were geographically mapped. The microbiological and physical-chemical results identified 52 (66,66%) water samples for human consumption in discordance with the microbiological standards and 23 (29,48%) in discord to the physical-chemical parameters, nine (90%) water samples for domestic use did not attend to the microbiological standards, while six (60%) were not for the physical-chemical parameters. The teat washing water results showed that 13 (81,25%) and 10 (62,50%) samples, respectively, were out of the microbiological and physical-chemical actual patterns. It was not detected microbiological contamination of water used in the dairy and in the fruit pulp factory. Referring to the water used in the slaughterhouse, one (50%) sample did not attend to the microbiological patterns, but all samples attended to the physical-chemical...(Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:53Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-07-01Bitstream added on 2014-06-13T20:24:18Z : No. of bitstreams: 1 suhet_mi_dr_jabo.pdf: 911264 bytes, checksum: 71199b02b3ed48730d7b117d1868bb6d (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Fundação para o Desenvolvimento da UNESP (FUNDUNESP) / A criação intensiva de peixes tem se tornado popular, mas a dependência de arraçoamento pode enriquecer o ambiente com nutrientes, comprometendo a qualidade da água e predispondo os peixes a doenças. Streptococcus e Aeromonas são bactérias que acometem peixe em criações intensivas, podendo ocasionar mortalidade. Nesse sentido, o presente trabalho objetivou avaliar a influência de uma criação de tilápias do nilo em tanques-rede nos parâmetros de qualidade da água e na ocorrência de Streptococcus spp. e Aeromonas spp. na água e nos peixes em uma lagoa na região Sudeste do Brasil. Foram definidos para as amostragens dois locais, a lagoa, para coleta de água e os tanques-rede, para coleta de água e peixes e dois períodos, seco e chuvoso. Os dados obtidos da qualidade da água foram avaliados por indicadores estabelecidos na Resolução Conama nº 357, para corpos de água doce de classe 2. A presença de Streptococcus spp. e Aeromonas spp. foi avaliada por identificação fenotípica e a identificação das espécies, por provas bioquímicas. Isolados foram avaliados para produção de hemolisina utilizando ágar sangue e teste de resistência a antimicrobianos conforme o método de difusão de discos. A atividade de criação intensiva de peixes aumentou a concentração de fósforo total da água no período seco, ocorrência de Streptococcus spp. no ambiente e a população de Aeromonas spp. na superfície dos peixes. No período chuvoso, houve maior isolamento das espécies potencialmente patogênicas, Aeromonas hydrophila na superfície e no rim dos peixes, A. caviae, A. sobria, A veronii, A. jandaei e Streptococcus agalactiae na superfície dos peixes, quando também ocorreu aumento da concentração de N-amoniacal e depleção acentuada da concentração de oxigênio dissolvido na água, e isso pode ter sido a causa da mortalidade de peixes nos tanquesrede... / Intensive fish farming is becoming more and more popular, but dependency on ration feeding increases nutrient load of the water, affects its quality and predisposes fish to diseases. Streptococcus and Aeromonas are bacteria that can affect fish in intensive farms and cause mortality. This study aims at evaluating the impact of a nile tilapia net-cage farm on the water quality parameters and the occurrence of Streptococcus spp. and Aeromonas spp. in the water and on the fish, in a pond in Southeastern Brazil. Two sampling sites were defined, one in the pond and another in the net cages to collect water, and water and fish, respectively. Sampling took place during two periods, dry and rainy. Water quality data were analyzed according to standards set by Conama resolution nº 357, for freshwater bodies class 2. Streptococcus spp. and Aeromonas spp. were determined by phenotypic and species identification using biochemical tests. Isolates were evaluated for hemolysin production using blood agar and antimicrobial resistance test according to disk diffusion method. Intensive fish farming increased the amount of phosphorus in water, Streptococcus spp. occurrence in the environment and Aeromonas spp. population on fish surface as well, during dry periods. During the rainy season, more potentially pathogenic bacteria were isolated such as, Aeromonas hydrophila on fish surface and kidneys, A. caviae, A. sobria, A veronii, A. jandaei and Streptococcus agalactiae on fish surface. An increase of N-ammoniacal was also observed together with severe depletion of dissolved oxygen, which may have caused fish mortality in the net-cages. Production of b-hemolysis was greater for aeromonas species isolated from the water and fish kidneys, while for streptococci it was higher in isolates from fish surface. The species Aeromonas veronii, A. hydrophila, A. jandaei, A. sobria A. caviae and Streptococcus agalactiae... (Complete abstract click electronic access below)

Orientador: Helio Langoni / Resumo: Mycoplasma spp., tem distribuição mundial e é um patógeno relevante em medicina veterinária. As mastites causadas por Mycoplasma spp. mais frequentes em grandes rebanhos leiteiros, porém este patógeno é subestimado no Brasil, onde se têm poucos relatos como agente causador de mastite, o que se deve possivelmente a quantidade reduzida de laboratórios que inclui a análise de M. bovis em sua rotina. Devido a necessidade de meios seletivos e de condições especiais para o seu isolamento. Diante disso um dos objetivos do presente estudo foi pesquisar a participação de Mycoplasma bovis na etiologia das mastites clínicas em amostras de leite de vacas de propriedades leiteiras de sete estados do Brasil, totalizando 561 amostras de leite, que foram cultivas em meio Hayflick adicionado de acetato de tálio a 0,01%, incubadas em ambiente de microaerofilia com 5% de CO2. Foram também submetidas a reação em cadeia da polimerase (PCR) para detecção de Mycoplasma spp. e Mycoplasma bovis. Pesquisouse também a microbiota aeróbica envolvida nas mastites, cultivando-se as mesmas amostras de leite em meios de ágar sangue bovino 5% e ágar MacConkey resultando 225 amostras positivas. Obtiveram-se 11 (1,96%) amostras positivas para Mycoplasma spp., no exame microbiológico, enquanto na detecção molecular obteve-se um total de 17 (3,03%) amostras positivas para Mycoplasma bovis. Pode-se concluir com os resultados obtidos pela presença e dispersão do Mycoplasma bovis nos rebanhos leiteiros avaliados, ap... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Mestre

Os resíduos do processo de curtumes e a crescente importância da geração de energia a partir de fontes renováveis fazem com que seja necessário estudar formas de biodegradação dos resíduos produzidos pela indústria coureira e gerar energia a partir disso. Os resíduos sólidos produzidos pelos curtumes contêm cromo e costumam ser dispostos em aterros industriais perigosos. O biogás com alto teor de metano é o produto dessa decomposição, através de digestão anaeróbia. A partir desses conceitos, esse trabalho propõe realizar ensaios de biodegradação com lodo, proveniente de uma estação de tratamento de efluentes de curtumes, e com farelo de couro wet-blue (couro curtido ao cromo) em biorreatores de bancada. O objetivo principal foi isolar, quantificar e identificar os microrganismos que apresentam potencial de produzir biogás com alto teor de metano. Ainda, a forma de armazenamento prévio do lodo adicionado também foi analisada. Primeiramente, incubou-se o lodo com farelo de couro wet-blue em biorreatores de bancada (dez ensaios de biodegradação divididos em duas montagens) e análises de quantificação e de qualificação do biogás gerado foram feitas. Depois, realizou-se a coleta de alíquotas da biomassa gerada nos biorreatores em diferentes fases do crescimento. O isolamento da biomassa coletada foi conduzido em frascos tipo penicilina com meio de cultura propício para o crescimento de arqueas metanogênicas, onde era possível a incubação em atmosfera anaeróbia. A partir dos crescimentos dos microrganismos, realizaram-se testes de contagem, isolamento, coloração de Gram, além de novos testes de coleta de biomassa dos próprios frascos. Como resultado, a influência do armazenamento prévio do lodo na biodegradação deste com farelo de couro wet-blue ainda não foi totalmente elucidada. Os microrganismos isolados não eram arqueas metanogênicas. Realizou-se a contagem de microrganismos, em dois ensaios de biodegradação que tiveram sua biomassa coletada. O primeiro biorreator analisado (biorreator 4) apresentou 1,90 x 109 e 4,45 x 106 UFC/mL para o sólido precipitado e para o líquido sobrenadante, respectivamente. O segundo biorreator analisado (biorreator 7) apresentou 1,35 x 109 e 1,09 x 109 UFC/mL para o sólido precipitado sem e com adição de lodo ao meio de cultivo antes da autoclavagem, respectivamente, e 9,10 x 106 e 8,30 x 106 UFC/mL para o líquido sobrenadante sem e com adição de lodo ao meio de cultivo antes da autoclavagem, respectivamente. Foi detectado metano apenas nos frascos que continham alíquotas de biomassa provenientes dos biorreatores que estavam pouco diluídos, provenientes da coleta em fase final de produção de biogás, com quantidades elevadas de microrganismos. O percentual de metano encontrado nesses frascos variou entre 25,75 e 53,66% e foi detectado após a terceira semana de incubação. A homogeneização do lodo se mostrou um fator de grande influência na biodegradação. A técnica de isolamento com a utilização de frascos de penicilina mostrou-se adequada para a quantificação de microrganismos metanogênicos presentes nos ensaios de biodegradação, mas ainda não adequada para o isolamento das arqueas metanogênicas. / The tanning process waste and the increasing importance of energy generation from renewable sources make the study of alternative biodegradation ways of the waste produced by leather industry and the generation of power from it a necessity. The solid residues produced by tanneries contain chromium and are usually disposed in hazardous industrial landfills. Biogas with high methane content is the product of this decomposition by anaerobic digestion. Based on these concepts, this study proposes to perform biodegradation tests with sludge, from a tannery effluent treatment plant, and with wet-blue (leather tanned with chromium) shavings in bench bioreactors. The main objective was to isolate, quantify and identify microorganisms with potential to produce biogas with high methane content. Further, the prior storage form of the added sludge was also analyzed. First, the sludge and the wet-blue shavings were incubated in bench bioreactors (ten biodegradation tests divided into two assemblies) and quantification and qualification analysis of the generated biogas were made. Later, biomass aliquots generated in the bioreactors were collected at different growth stages. The collected biomass isolation was conducted in penicillin type injectable vial filled with culture medium propitious for methanogenic archaea growth, where it was possible to incubate in anaerobic atmosphere. From microorganisms’ growth, test of counting, depletion, Gram stain and other biomass collection of the vials themselves were carried out. As a result, the prior sludge storage influence on biodegradation tests of sludge with wet-blue shavings was not yet fully elucidated. Isolated microorganisms were not methanogenic archaea. The microorganism counting was held in two biodegradation tests with collected biomass. The first bioreactor analyzed (bioreactor 4) showed 1,90 x 109 and 4,45 x 106 CFU/mL for the precipitated solid and the supernatant liquid, respectively. The second bioreactor analyzed (bioreactor 7) showed 1,35 x 109 and 1,09 x 109 for the precipitated solid without and with added sludge in the culture medium before autoclaving, respectively, and 9,10 x 106 and 8,30 x 106 CFU/mL for the supernatant liquid without and with added sludge in the culture medium before autoclaving, respectively. Methane was only detected in vials containing collected biomass aliquots from final stages of biogas production bioreactors that were bit diluted and had high amounts of microorganisms. The percentage of methane found in these vials ranged between 25,75 and 53,66% and was detected after three weeks of incubation. The sludge homogenization proved to be a great influence factor on biodegradation. The isolation technique with penicillin type injectable vial proved to be appropriate for methanogenic microorganisms’ quantification in biodegradation tests, although it is not fully understood for the methanogenic archaea isolation.

Orientador: Antônio Celso Pezzato / Resumo: Objetivou-se avaliar o efeito de probiótico administrado in ovo ou spray sobre a histomorfometria, contagem de células caliciformes (CC), avaliação ultraestrutural da mucosa entérica e quanto à capacidade de redução de Salmonella Heidelberg (SH) em órgãos e no conteúdo cecal de frangos de corte desafiados experimentalmente com SH. Para histomorfometria, CC, avaliação ultraestrutural da mucosa entérica foram utilizados 297 frangos de corte Cobb®, distribuídos em delineamento inteiramente casualizado em esquema fatorial (2x2)+2, com 9 repetições. Para as análises microbiológicas, foram utilizados 162 frangos de corte Cobb®, distribuídos em DIC com 3 tratamentos (T3, T4 e T5), com 9 repetições de 6 aves cada. T1: aves tratadas in ovo com probiótico; T2: aves tratadas por spray com probiótico; T3: aves tratadas in ovo com probiótico e desafiadas com SH; T4: aves tratadas por spray com probiótico e desafiadas com SH; T5: aves não tratadas com probiótico e desafiadas com SH; T6: aves não tratadas com probiótico e não desafiadas com SH. No 2º dia de vida, as aves infectadas foram anilhadas e alojadas junto às aves dos tratamentos T3, T4 e T5. Para contagem de SH em órgãos e no conteúdo cecal aos 3, 5, 7, 14 e 21 dias pós-desafio e para análise histomorfométrica, CC e avaliação ultraestrutural nos 5, 9, 16 e 23 dias de vida das aves, 5 aves de cada tratamento mais 1 ave anilhada, dos tratamentos T3, T4 e T5 foram eutanasiadas. Os dados microbiológicos foram submetidos ao teste de Kru... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Doutor