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Gaining insights into mitochondrial membrane fusion through a structural and dynamic atomistic model of the mitofusin Fzo1p / Etude de la fusion membranaire mitochondriale à l'aide d'un modèle atomistique structural et dynamique de la mitofusine Fzo1pDe Vecchis, Dario 26 January 2017 (has links)
Les mitochondries sont des organites dynamiques dont la morphologie dépend de l’équilibre fusion/fission de leurs membranes. Ce processus essentiel à la survie cellulaire est nommé dynamique mitochondriale et sa dérégulation est associée à des troubles neurologiques. Cependant les mécanismes précis régissant la dynamique mitochondriale ne sont pas élucidés. Cette thèse porte sur la protéine Fzo1p, une grande GTPase de la superfamille des Dynamin-related-Protein. C’est un élément clé impliqué dans la fusion mitochondriale de la membrane externe de la levure. Sa structure et sa dynamique ont été étudiées par modélisation et simulations de dynamiques moléculaires tout-atome dans une bicouche lipidique solvatée. Le modèle structural obtenu tient compte de données expérimentales, de template structuraux, et de modèles ab initio du domaine transmembranaire de Fzo1p. Ce modèle a été validé expérimentalement par mutagenèse dirigée. Des permutations de charges ont confirmé des ponts salins à longue distance prédits dans le modèle. En outre, des mutations ont montré que les domaines coiled-coil de Fzo1p, contrairement à sa partie N-terminale, sont indispensables à sa fonction. L’ensemble des résultats expérimentaux et in silico met en évidence l’implication des domaines charnières dans le changement conformationnel de Fzo1p, ainsi que des résidus critiques affectant sa stabilité. Les précisions atomiques obtenues sur l’interaction de Fzo1p avec le GDP permet de formuler des hypothèses sur le mécanisme moléculaire de la catalyse du GTP pour la fusion membranaire; voire à la compréhension de la dynamique mitochondriale. / Mitochondria are dynamic organelles whose morphology is determined by fusion and fission of their membranes. This essential process is known as mitochondrial dynamics. Defects in mitochondrial dynamics are associated with neurological disorders making the investigation of physiological relevance. However, the precise sequence of events that lead mitochondrial dynamics are still not well characterised. Fzo1p, a large GTPase of the Dynamin-Related Proteins superfamily, is a key component in mitochondrial outer membrane fusion in yeast. During this PhD project I built a model of the protein Fzo1p. The structure and dynamics of the model was investigated through molecular modelling and all-atom molecular dynamics simulation in a fully hydrated lipid bilayer environment. The Fzo1p structural model integrates information from several template structures, experimental knowledge, as well as ab initio models of the transmembrane segments. The model is validated experimentally through directed mutagenesis, for instance charge-swap mutations confirm predicted long-distance salt bridges. A series of mutants indicate that coiled-coil domains are required for protein function at variance with its N-terminal region. Overall, the experimental and in silico approaches pinpoint the hinge domains involved in the putative conformational change and identifies critical residues affecting protein stability. Finally, key Fzo1p-GDP interactions provide insights about the molecular mechanism of membrane fusion catalysis. The model provides insight on atomic level and proposes a structure that will be instructional to understanding mitochondrial membrane fusion.
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Role mitochondriálního komplexu II v biologii nádorové buňky / The role of mitochondrial complex II in cancer cell biologyKraus, Michal January 2021 (has links)
Mitochondria are essential organelles for most eukaryotic cells, containing intricate networks of numerous proteins. These include, among others, complexes I-IV of the electron transport chain. Being at the crossroads of the tricarboxylic acid cycle and the respiratory chain, mitochondrial complex II plays a key role in cellular metabolism. The protein complex, also known as succinate dehydrogenase, is capable of not only succinate oxidation and electron transfer but also contributes to the production of reactive oxygen species. Mitochondrial complex II consists of four subunits, SDHA-D, and four dedicated protein assembly factors SDHAF1-4 that participate in complex II biogenesis. Mutations and epigenetic modulations of genes coding for succinate dehydrogenase subunits or assembly factors are associated with pathological conditions such as neurodegenerative diseases, or may result in tumor formation. However, inborn complex-II-linked mitochondrial pathologies are rather understudied, compared to diseases with causative errors of other mitochondrial complexes, presumably due to the fact that none of complex II subunits is encoded in the mitochondrial genome. Recent studies have shown that impairment of mitochondrial complex II function or assembly leads to accumulation of alternative assembly forms...
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Rôle de la signalisation par ERK et de la sénescence cellulaire dans la progression du cancer pancréatiqueRowell, Marie-Camille 07 1900 (has links)
Le cancer du pancréas est la quatrième cause de décès par cancer au Canada. Avec des mutations activatrices de KRas présentes dans près de 90% des lésions bénignes et tumeurs, ce cancer arbore une activation de la voie MAPK très tôt dans son développement. Or, peu de littérature existe sur les étapes clés de la progression et sur le rôle précis de cette signalisation dans le passage des lésions bénignes (PanIN) au stade avancé (PDAC). Depuis plusieurs années, notre laboratoire s’intéresse aux kinases ERK1/2, actives en aval de Ras, des acteurs centraux du programme de sénescence cellulaire, soit un programme antitumoral intrinsèque aux cellules. L’hypothèse centrale des présents travaux est donc que les mutations de KRas acquises dès le stade PanIN induisent une sénescence qui agit comme barrière à la progression tumorale, et que l’atténuation du signal de ERK est impliquée dans le contournement de ce mécanisme.
La première partie de cette thèse montrera donc les avancées que nous avons faites sur la caractérisation de la progression entre le stade bénin et le stade avancé, de laquelle l’acquisition d’un caractère souche, la transition épithélio-mésenchymateuse et le développement d’une dépendance mitochondriale semblent être des déterminants. Ensuite, nous présenterons nos découvertes sur le rôle des kinases ERK1/2, de la sénescence cellulaire et du stress nucléolaire dans une nouvelle approche visant à restaurer un mécanisme de suppression tumorale inspiré des lésions bénignes et impliquant une altération de la biogenèse ribosomique. Finalement, pour bonifier cette nouvelle stratégie, nous présenterons les résultats d’un criblage CRISPR-Cas9 génome-entier nous ayant permis d’identifier les composantes d’une stratégie « one-two punch » basée sur l’induction de sénescence dans les cellules PDAC combinée à l’inhibition de la Glutathion peroxydase 4 (GPX4), de façon à promouvoir une sénolyse efficace dans ce contexte.
Dans leur ensemble, les travaux présentés dans cette thèse montrent un avancement significatif dans la compréhension de la biologie des cancers pancréatiques en identifiant à la fois des vulnérabilités intrinsèques et inductibles afin de générer de nouvelles idées thérapeutiques pour ce cancer hautement fatal. / Pancreatic cancer is the fourth leading cause of death by cancer in Canada. With frequent activating mutations in KRas in up to 90% of benign lesions and tumors, this cancer possesses an early activation of the MAPK pathway. However, key events of its progression from the PanIN stage to the PDAC stage and the precise role of MAPK signaling in it are still poorly understood.
For many years, our laboratory has taken interest in the ERK1/2 signaling pathway, activated downstream of oncogenic Ras and a key mediator of cellular senescence. Cellular senescence is considered an intrinsic antitumor mechanism due to its ability to stably halt the cell cycle. The central hypothesis of this work is then that KRas mutations that are acquired at the PanIN stage induce cellular senescence which acts as a barrier against tumor development. Still, this powerful mechanism can be circumvented as cells tend to attenuate the ERK1/2 signaling to promote progression and acquisition of more aggressive features.
Thus, the first part of this thesis will present our most recent advances in characterizing the progression events between PanIN and PDAC stages, during which stem cell features acquisition, epithelial-mesenchymal transition and mitochondrial dependency seem to occur. Next, we will present our discoveries regarding the implication of ERK1/2 kinases, cellular senescence and nucleolar stress in a new approach to restore a tumor suppression mechanism inspired by the PanIN stage and based on ribosome biogenesis alteration. Finally, to potentiate this strategy, we will show the results of a genome-wide CRISPR-Cas9 screen that identified the components of a “one-two punch” approach to induce cellular senescence in PDAC cells and to efficiently eliminate them by GPX4 inhibitors-mediated senolysis.
Globally, the work presented in this thesis show significant progress in the field of pancreatic cancer, identifying previously unknown vulnerabilities of those cancer cells and paving the way for the development of new therapeutic combinations.
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Role tyrosinkinázové aktivity mitochondriálního ERBB2/HER2 v rakovině prsu / The Role of Tyrosine Kinase Activity of Mitochondrial ERBB2/HER2 in Breast CancerNovotná, Eliška January 2019 (has links)
Breast cancer is a common malignant disease affecting millions of women worldwide. Amplification of HER2 oncogene, a tyrosine kinase receptor, in breast cancer allows application of targeted therapy, but approximately one third of patients develop resistance to treatment. Relocalization of HER2 from the plasma membrane into the mitochondria was found and suggested as one of the potential causes of such resistance. Here we document that the function of mitochondrial HER2 is distinct from that of HER2 in the plasma membrane. Mitochondrial HER2 enhances cancer cell energetic metabolism, proliferation and migration in vitro, and tumour formation in vivo in mice correlating with elevated level of ROS signalling. The kinase activity of mitochondrial HER2 is unaffected, therefore I investigated its role in mitochondrial HER2 function. Moderate, endogenous levels of the kinase activity of mitochondrial HER2 drive pro-tumorigenic properties of breast cancer cells, while constitutive kinase activity sensitizes these cells to cell death and attenuates tumour formation in animal models. On the other hand, impairment of kinase activity due to mutation in the ATP binding site of mitochondrial HER2 supports adherence-independent growth in vitro and tumor growth in vivo. We propose that HER2 function in...
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Étude du rôle de PGC-1β dans l’inflammation, l’immunosuppression et la réponse au stress cellulaire; implication dans le traitement du mélanomeCoutu-Beaudry, Katherine 03 1900 (has links)
Le mélanome est caractérisé par un remodelage métabolique important, participant à la métastase et à la résistance aux traitements. Les coactivateurs 1 du récepteur activé par le proliférateur du peroxisome (PPARγ), ou PGC-1s, constituent une famille de coactivateurs qui potentialisent la transcription de gènes du métabolisme et de la biogenèse mitochondriale, participant ainsi à la reprogrammation métabolique des cellules cancéreuses. Les différents cancers de la peau expriment des niveaux variables de PGC-1s et les tumeurs qui expriment fortement les PGC-1s présentent un profil pro-inflammatoire et immunosuppresseur favorisant l’évasion immunitaire. Ceci suggère un rôle des PGC-1s dans la réponse à l’immunothérapie. Nous montrons d’abord que la déplétion en PGC-1β diminue la prolifération de lignées cellulaires de mélanome en plus d’induire l’expression de cytokines pro-inflammatoires et de transcrits immunosuppresseurs. À ce jour, les mécanismes permettant de réguler l’expression et l’activité des PGC-1s demeurent inconnus. Nous montrons que différents stress cellulaires affectant des procédés métaboliques, épigénétiques ou la traduction diminuent l’expression des PGC-1s et la viabilité de lignées cellulaires de mélanome. Nous montrons également un mécanisme de régulation de PGC-1β par une protéine de liaison à l’ARN soutenant le rôle de PGC-1β dans la réponse à différents stress et la survie des cellules de mélanome. Cette régulation serait importante pour l’immunosuppression du mélanome et dicterait la réponse à l’immunothérapie. En conclusion, ces travaux illustrent bien le rôle de PGC-1β dans la reprogrammation métabolique et la réponse au stress du mélanome, ces processus pouvant influencer l’inflammation et l’immunosuppression du microenvironnement afin d’assurer la progression tumorale. / Melanoma is characterized by a significant metabolic remodeling, which contributes to metastasis and treatment resistance. Peroxisome proliferator-activated receptor gamma (PPARγ) coactivators 1, or PGC-1s, are a family of coactivators that potentiate the transcription of genes involved metabolism and mitochondrial biogenesis, thus participating in the metabolic reprogramming of cancer cells. Different skin cancers express varying levels of PGC-1s and tumors that strongly express PGC-1s exhibit a proinflammatory and immunosuppressive profile that favors immune evasion. This suggests that PGC-1s play a role in melanoma response to immunotherapy. We first show that PGC-1β knockdown decreases the proliferation of melanoma cell lines. Moreover, it induces the expression of proinflammatory cytokines and immunosuppressive transcripts. To date, the mechanisms that regulate the expression and activity of PGC-1s remain unknown. We show that different cellular stresses affecting metabolic and epigenetic processes or translation decrease PGC-1s expression and the viability of melanoma cell lines. We also show a mechanism of regulation of PGC-1β by an RNA-binding protein enhencing the role of PGC-1β in the response to different stresses and the survival of melanoma cells. This regulation could contribute to melanoma immunosuppression and determine the tumor’s response to immunotherapy. In conclusion, this work illustrates well the role of PGC-1β in melanoma metabolic reprogramming and stress response, processes that regulate inflammation and create an immunosuppressive tumor microenvironment in order to ensure tumor progression.
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Caractérisation fonctionnelle du nouveau gène mitochondrial mtaltnd4 chez l’humainChoquette, Thierry 12 1900 (has links)
Chez les cellules eucaryotes, la mitochondrie est une organelle impliquée dans plusieurs fonctions cellulaires (production d’énergie, apoptose, production de ROS, prolifération, signalisation cellulaire, vieillissement, immunité et plus encore) et possédant son propre génome, soit l’ADN mitochondrial (ADNmt). Chez l’humain, on croyait que l’ADNmt ne codait que pour 37 gènes impliqués dans la production d’énergie et la traduction mitochondriale. Cependant, le potentiel codant du génome mitochondrial aurait été sous-estimé. Il a récemment été démontré qu’à l’intérieur de ces principaux gènes connus pouvaient se cacher plusieurs petits gènes alternatifs. Ceux-ci se retrouvent au sein de régions non codantes ou possèdent des séquences d’initiation ou de terminaison de la traduction distinctes de celles du gène de référence dans lequel ils se retrouvent. Ils codent pour des micropeptides dérivés des mitochondries qui possèdent un large éventail de fonctions, s’ajoutant à la longue liste de fonctions dans lesquelles la mitochondrie est déjà impliquée. Parmi ces peptides, on retrouve l’Humanine, MOTS-c, SHLP1-6, Gau et SHMOOSE. Nous avons précédemment découvert un nouveau gène alternatif situé dans le gène nd4, nommé mtaltnd4. Dans cette étude, nous visions à clarifier les fonctions du peptide alternatif correspondant MTALTND4 en étudiant son patron d’expression dans les tissus humains, l’impact de plusieurs stress sur son expression, l’impact du peptide sur la transcription des gènes, et ses partenaires d’interaction. Nous avons découvert que MTALTND4 pourrait être une molécule de signalisation sécrétée par les cellules en réponse au stress et affectant la physiologie pour induire un état de dépression bioénergétique en réduisant les processus de production et de demande en ATP. Plusieurs autres indices révélés par nos expériences suggèrent que MTALTND4 pourrait être une protéine multifonctionnelle impliquée dans de nombreuses voies de régulation. / In eukaryotic cells, mitochondria are organelles involved in many cellular functions (energy production, apoptosis, ROS production, proliferation, cell signaling aging, immunity and more) and that possess their own genome, namely mitochondrial DNA (mtDNA). In humans, mtDNA was believed to encode only 37 genes involved in energy production and mitochondrial translation. However, the coding potential of the mitochondrial genome has been underestimated. It has recently been shown that within these main genes could hide several small alternative genes (i.e., genes withing non-coding regions or with translation initiation/termination sequences that are distinct from the reference gene sequences in which they are found). They code for mitochondrial-derived micropeptides (MDPs) that have a broad spectrum of functions, adding to the extensive list of functions in which mitochondria are already involved. These peptides include Humanine, MOTS-c, SHLP1-6, Gau and SHMOOSE. We have previously discovered a new alternative gene located in the nd4 gene, termed mtaltnd4. In this study, we aim to clarify the functions of the corresponding alternative peptide MTALTND4 by studying its expression pattern in human tissues, the impact of several stresses on its expression, the impact of the peptide on gene transcription, and its interaction partners. We have found that MTALTND4 could be a signaling molecule secreted by cells in response to stress and would affect physiology to induce a state of bioenergetic depression by reducing ATP-producing and ATP-demanding processes. Several other clues revealed by our experiments suggest that MTALTND4 could be a multifunctional protein involved in numerous regulatory pathways.
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Analyse structure-fonction du transporteur ABC mitochondrial Atm1 chez la levure Saccharomyces cerevisiaePelletier, Laurence 10 1900 (has links)
Mémoire numérisé par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal. / Le transport des molécules à travers les membranes est un processus cellulaire
fondamental. Les transporteurs ABC (pour ATP-binding cassette) sont des protéines
transmembranaires médiant le transport actif de substrats variés (peptides, ions, acides
aminés, antibiotiques, etc). Le gène ATMI de Saccharomyces cerevisiae code pour un
transporteur ABC de 690 acides aminés localisé dans la membrane interne de la
mitochondrie. La protéine Atml est une proche homologue de la P-glycoprotéine
impliquée dans la résistance aux agents anticancéreux. Il a été démontré qu'Atml est
essentielle pour la croissance des cellules, procurant ainsi un phénotype idéal pour l'analyse
fonctionnelle de ce transporteur. Nous utilisons une technique, appelée plasmid shuffling',
basée sur l'échange de plasmides par contre-sélection d'un plasmide portant le marqueur de
sélection URA3 en présence d'acide 5-fluoroorotique (5-F0A) pour étudier Atml. Nous
avons construit une souche haploïde de S. cerevisiae dans laquelle la copie chromosomique
du gène ATMI est excisée mais qui est viable grâce à la présence d'un plasmide URA3
portant une copie fonctionnelle du gène ATMI. Cette souche a été transformée avec une
banque d'allèles mutés d'ATM1 portés par un plasmide LEU2 et criblée pour des mutants
thermosensibles (ts) d'Atml après contre-sélection du plasmide URA3 sur 5-F0A. Trois
mutants ts d'Atml ont été isolés et les mutations causant le phénotype ts ont été identifiées
par séquençage de l'ADN. Des courbes de croissance de ces mutants ont été tracées,
démontrant une croissance normale à température permissive mais un arrêt de croissance
après quelques divisions à température restrictive. Nous avons produit des anticorps
polyclonaux anti-Atml qui nous ont permis d'étudier la protéine de type sauvage et celle
des trois mutants ts. Ces études ont révélé l'absence d'Atml seulement dans les
mitochondries des mutants ts à température restrictive. D'autre part, des expériences de coimmunoprécipitation ont démontré qu'Atml forme des homodimères et que cette
interaction est médiée par la partie C-terminale d'Atml, qui contient le domaine de liaison à
l'ATP. Nos expériences ont donc permis d'identifier des acides aminés importants pour la
fonction d'Atml ainsi qu'un domaine impliqué dans la structure quaternaire de ce
transporteur.
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Impact d'une mitochondrie exogène sur le protéome du cybride Chrosomus eosSchwartz, Logan 08 1900 (has links)
On retrouve dans le complexe Chrosomus eos-neogaeus une forme cybride ayant le génome nucléaire de C. eos et le génome mitochondrial de C. neogaeus. Ce modèle particulier fournit une occasion unique d’étudier l’influence d’une mitochondrie exogène sur le métabolisme et la physiologie d'organismes vivant en milieu naturel, et s'étant donc adaptés à cette situation cellulaire atypique. La mitochondrie jouant un rôle fondamental vital, nous nous attendons à ce que la présence d’une mitochondrie exogène chez la forme cybride ait un impact sur l’expression de son génome et du protéome qui en découle.
L’objectif de ce projet est d’étudier les différences au niveau protéomique entre des individus C. eos purs (forme sauvage) et des cybrides provenant d'habitats similaires afin de faire ressortir au maximum les différences dues à la présence de mitochondries C. neogaeus chez la forme cybride. Pour ce faire, nous avons comparé les protéomes des formes cybride et sauvage en utilisant l'électrophorèse en deux dimensions. Un sous-groupe de protéines produisant un signal spécifique révélé par l’analyse comparative a été identifié et analysé par spectrométrie de masse (LC/MS).
Les résultats indiquent que la présence de mitochondries C. neogaeus chez le cybride influence fortement la régulation génique chez ce dernier. De plus, les protéines identifiées apportent des pistes intéressantes supportant l'hypothèse que la présence de mitochondries C. neogaeus chez le cybride rendrait ce biotype plus résistant au froid que la forme sauvage. / The Chrosomus eos-neogaeus genetic complex regroups different forms of hybrids of these two species, among which a cybrid form, that harbours the nuclear genome of C. eos and the mitochondria of C. neogaeus. This peculiar model is thus a unique opportunity to study the influence of an exogenous mitochondria on the metabolism and cellular physiology in a living animal in the wild, and thus perfectly adapted to this atypical cellular environment. Mitochondria being at the core of fundamental biological processes, we expect that the presence of foreign mitochondria will modify gene expression and the resulting proteome of these fishes.
The overall goal of this master thesis is thus to compare the proteome of pure (wild type) C. eos with the cybrid form sampled in similar lakes from the same geographical area so that most differences could be attributed to the different mitochondrial genomes. To achieve this goal, we used two dimensional electrophoresis. We selected a sub-group of proteins that showed the most extreme expression differences and identified these spots by mass spectrometric analyses (LC/MS).
Results demonstrate that C. neogaeus mitochondria has a strong influence on gene expression in cybrid. Proteins identified bring new clues supporting the hypothesis that cybrid are more cold tolerant than the wild type biotype.
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L'application de la métabolomique à la découverte de nouveaux biomarqueurs chez les patients atteints d'acidose lactiqueThompson Legault, Julie 04 1900 (has links)
L’acidose lactique du Saguenay-Lac-St-Jean, ou syndrome de Leigh de forme canadienne-française (LSFC), est une maladie mitochondriale neurodégénérative causée par des mutations du gène LRPPRC et caractérisée par des crises d’acidose menant au décès en bas âge. On ne comprend pas encore les causes exactes de ces crises, et aucun traitement n’est actuellement disponible. L’objectif de cette étude a été de comparer le profil des métabolites sanguins et urinaires chez des sujets LSFC et des témoins, avant et après un repas, par une approche métabolomique ciblée. Le projet s’inscrit dans une démarche à long terme visant l’identification de biomarqueurs prédictifs des crises, permettant d'intervenir plus rapidement afin d’éviter le décès. Les échantillons biologiques ont été prélevés chez 9 sujets atteints du LSFC et 9 témoins appariés, à jeun et 90 minutes après un repas standardisé. Les analyses incluent un bilan biochimique et hormonal, un profil des acides aminés, des acides gras, des acides organiques et des acylcarnitines. Les métabolites significativement modifiés chez les patients peuvent être classés en deux catégories : (i) le reflet d’une dysfonction mitochondriale, et plus particulièrement de l’accumulation d’équivalents réduits en amont de la chaîne respiratoire, et (ii) des indices de risque cardiométabolique, qui s’observent davantage chez les patients adultes malgré leur jeune âge. Ainsi, il serait intéressant d’inclure au traitement des stratégies visant la diminution des facteurs de risque cardiométabolique, notamment par une modification des habitudes de vie. Notre étude démontre la pertinence d’avoir recours à la métabolomique dans l’étude des désordres de la phosphorylation oxydative. / L’acidose lactique du Saguenay-Lac-St-Jean, ou syndrome de Leigh de forme canadienne-française (LSFC), est une maladie mitochondriale neurodégénérative causée par des mutations du gène LRPPRC et caractérisée par des crises d’acidose menant au décès en bas âge. On ne comprend pas encore les causes exactes de ces crises, et aucun traitement n’est actuellement disponible. L’objectif de cette étude a été de comparer le profil des métabolites sanguins et urinaires chez des sujets LSFC et des témoins, avant et après un repas, par une approche métabolomique ciblée. Le projet s’inscrit dans une démarche à long terme visant l’identification de biomarqueurs prédictifs des crises, permettant d'intervenir plus rapidement afin d’éviter le décès. Les échantillons biologiques ont été prélevés chez 9 sujets atteints du LSFC et 9 témoins appariés, à jeun et 90 minutes après un repas standardisé. Les analyses incluent un bilan biochimique et hormonal, un profil des acides aminés, des acides gras, des acides organiques et des acylcarnitines. Les métabolites significativement modifiés chez les patients peuvent être classés en deux catégories : (i) le reflet d’une dysfonction mitochondriale, et plus particulièrement de l’accumulation d’équivalents réduits en amont de la chaîne respiratoire, et (ii) des indices de risque cardiométabolique, qui s’observent davantage chez les patients adultes malgré leur jeune âge. Ainsi, il serait intéressant d’inclure au traitement des stratégies visant la diminution des facteurs de risque cardiométabolique, notamment par une modification des habitudes de vie. Notre étude démontre la pertinence d’avoir recours à la métabolomique dans l’étude des désordres de la phosphorylation oxydative.
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Étude de la distribution taxonomique du système de double hérédité uniparentale des mitochondriesGusman, Arthur 08 1900 (has links)
La mitochondrie est un organite intracellulaire permettant la production d’énergie
nécessaire à la survie de la cellule. Sa singularité passe par le fait qu’elle possède son propre
génome (ADN mitochondrial ou ADNmt) distinct du génome nucléaire (ADNnu). Aussi,
contrairement à l’ADNnu qui est transmis par les deux parents, l’ADNmt est lui hérité
seulement par la mère chez les animaux. Exceptionnellement, un seul système connu va à
l’encontre de cette « loi » d’hérédité. Il s’agit du système de double hérédité uniparentale
(Doubly Uniparental Inheritance ou DUI) retrouvé chez plusieurs espèces de bivalves. Les
espèces concernées possèdent ainsi 2 lignées d’ADNmt distinctes : une d’origine paternelle
(ADNmt M) transmise seulement de pères en fils, et une d’origine maternelle (ADNmt F)
transmise par la mère à la fois aux filles et fils. L’hypothèse privilégiée pour expliquer le
maintien du système DUI au cours de l’évolution l’engage dans la détermination sexuelle
chez les bivalves mais la vérification de cette hypothèse repose entre-autre sur une étude
plus élargie de différents systèmes DUI. Jusqu’à maintenant, le DUI a été trouvée chez 46
espèces de bivalves, mais sa distribution chez ce groupe est certainement plus vaste étant
donné le nombre d’espèces vivantes estimé à >20000. L’objectif de ce projet est d’étudier
(et d’élargir) la distribution taxonomique du système DUI au sein du groupe des mollusques
afin d’obtenir les prérequis indispensables à une meilleure compréhension de sa fonction
mais également pour en retracer l’origine. Les résultats suggèrent l’absence du système
DUI chez cinq espèces de gastéropodes et confirment sa découverte chez deux nouvelles
espèces et familles de bivalves [i.e. Scrobicularia plana (Semelidae) et Yoldia hyperborea
(Yoldiidae)]. En s’appuyant sur les résultats phylogénétiques, nous favorisons l’hypothèse
d’une origine unique pour ce système. Finalement, la nouvelle distribution taxonomique
proposée ici confirme la présence du système DUI chez 103 espèces de bivalves
appartenant à 12 familles. / Mitochondria are semi-independent organelles, mostly known for their role in energy
production necessary for cell survival. Several characteristics make them unique: they have
their own genome, the mitochondrial DNA (mtDNA), and contrary to the nuclear genome
(nuDNA), they are inherited uniparentally by Strict Maternal Inheritance (SMI) in animal
species. Exceptionally, one model of mitochondrial inheritance found in some Bivalvia goes
against the rule of SMI. It is called the Doubly Uniparental Inheritance (DUI) system. The
species concerned possess two distinct mitochondrial lineages: one transmitted by the male
(M mtDNA) to his sons only, and the other by the female to both sons and daughters. The
most likely hypothesis to explain the retention of the DUI system in evolution involves him in
sexual determination in bivalves but a widened study on different DUI systems is needed to
verify this hypothesis. Until now, the DUI system has been described in 46 bivalve species
but its distribution in this group might be broader given the total number of living species
estimated to >20000. This project aimed to study (and broaden) taxonomic distribution of
DUI within mollusks as a necessary prerequisite to a better understanding of its function and
its origin. The results suggest the absence of DUI in five gastropods species and confirm its
discovery in two new bivalves species and families [i.e. Scrobicularia plana (Semelidae) and
Yoldia hyperborea (Yoldiidae)]. Based on phylogenetic data, we favor the hypothesis of a
single origin of DUI. Finally, the new taxonomy proposed here confirms the presence of the
DUI system in 103 bivalves species belonging to 12 families.
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