O presente estudo tem como objetivo descrever a dinâmica recente de três trechos de Floresta Estacional Semidecidual estudados entre 1994/1995, em função das mudanças estruturais e dos mosaicos de manchas em diferentes fases do ciclo de crescimento florestal. Esse estudo foi desenvolvido em três áreas situadas na Reserva Municipal de Santa Genebra, localizada no distrito de Barão Geraldo, município de Campinas-SP. Foram remedidas todas as plantas anteriormente marcadas em 35 parcelas permanentes de 100m² presentes em cada uma das áreas, nos anos 2000 (área A) e 2010 (áreas A, B e C). Todos os indivíduos ingressantes, com perímetro a altura do peito (PAP) maior ou igual a 15 cm (DAP aproximadamente 5 cm) e maiores de 1,3 m de altura, foram marcados e plaqueados. As espécies amostradas foram classificadas quanto ao grupo sucessional, síndrome de dispersão e deciduidade. As clareiras foram novamente medidas e demarcadas. De acordo com os resultados obtidos, foi possível observar a influência dos distúrbios, de forma diferenciada, na mudança estrutural e da dinâmica dos trechos florestais estudados. O dossel, sub-bosque e as clareiras analisados apresentaram modificações no número de indivíduos, composição de espécies e grupos sucessionais. As avaliações feitas nas manchas do mosaico mostraram que na área A as modificações ocorridas seguiram o que é descrito pela dinâmica de clareiras para Floresta Tropical Úmida, porém para as demais áreas (B e C), esse modelo de dinâmica não se aplicou, não seguindo, portanto, um padrão de substituição de manchas, grupos ecológicos e espécies nestes trechos de Floresta Estacional Semidecidual. As espécies pertencentes aos diferentes grupos sucessionais foram registrados em todos os regimes de luz, mas as espécies clímaces predominaram, principalmente, nas áreas de clareira. O ingresso dos indivíduos de todos os grupos sucessionais ocorreu preponderantemente através das clareiras, o que indica que novos indivíduos, bem como novas espécies, são incorporados por esse local. / This study aims to describe the recent dynamics of three plots of Semideciduous Forest studied between 1994/1995, in function of their structural changes and their mosaics of patches at different stages of growth. This study was conducted in three areas located in Santa Geneva Municipal Reserve, located in the district of Barão Geraldo, Campinas-SP. All previously marked plants in 35 permanent plots of 100m ² present in each of the areas in the 2000s (area A) and 2010 (areas A, B and C) were remeasured. All entering individuals, with perimeter at breast height (PAP) heighter than 15 cm (dbh nearly 5 cm) and height greater than 1.3 m, were marked and plated. The sampled species were classified according to their successional group, dispersal syndrome and deciduousness. The gaps were again measured and marked. According to the results obtained, it was possible to observe the influence of disturbances, differently in each area, the structural change and the dynamics of the studied forest areas. The analyzed canopy, understory and gaps showed changes in the number of individuals, species composition and successional groups. The evaluations made in mosaic patches in the area A showed that the changes occurred followed what is described by the dynamics of gaps for Tropical Moist Forest, but for the other areas (B and C), this dynamic model cannot applied, not following therefore, a standard replacement patches, ecological groups and species in these stretches from Semideciduous Forest. The species belonging to different successional groups were observed in all levels of light, but the climaxes occurred mainly in the gaps.

Tese de Doutoramento. Engenharia Informática. Faculdade de Engenharia. Universidade do Porto. 2011

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:43Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-08-21Bitstream added on 2014-06-13T20:26:43Z : No. of bitstreams: 1 gabriel_va_dr_rcla.pdf: 1465049 bytes, checksum: adbeba8c57d4586a7bcc4aae32986e9c (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A expansão de plantações florestais tem sido intensificada nos últimos anos, ultrapassando 70.000.000 ha nos trópicos. Eucalyptus é o principal gênero plantado, ocupando 50% das áreas silviculturais. Monoculturas arbóreas e fragmentos de vegetação secundária figurarão entre os principais elementos das paisagens tropicais futuras. Logo, compreender como diversas espécies se comportam diante dessa situação é fundamental quando se objetiva a conservação da biodiversidade. Este trabalho estudou a avifauna em um mosaico composto por talhões de Eucalyptus spp. e alguns de vegetação nativa na Floresta Estadual Edmundo Navarro de Andrade (Rio Claro, SP). Esses talhões possuíam diferentes idades (plantados de 1934 a 1990), extensões (~1-51 ha) e graus de regeneração de vegetação nativa. Os principais objetivos foram caracterizar a avifauna encontrada nesses talhões quanto à riqueza, abundância e composição e compará-las, verificando possíveis associações com a estrutura da vegetação (riqueza, altura, área basal, densidade de plantas, densidade de plantas mortas, cobertura do dossel e densidade vertical nos estratos de 0,0 a 1,0, de 1,1 a 2,0 e de 2,1 a 5,0 m). Para a amostragem de aves foi empregado o método de pontos. No primeiro capítulo, foram amostrados 14 talhões de E. citriodora. Foram registradas 103 espécies de aves, variando de 23 a 55 por talhão. Myiodynastes maculatus, Cyclarhis gujanensis, Amazilia lactea e Megarynchus pitangua mostraram maior plasticidade ambiental, não revelando fortes associações com as variáveis da vegetação. A abundância total foi maior em talhões que apresentavam vegetação mais desenvolvida. Talhões com maior complexidade da vegetação apresentaram maior riqueza e abundância de espécies insetívoras e de dependentes de florestas. A distância entre os talhões de E. citriodora e de vegetação nativa... / The expansion of planted forests is surprisingly fast in the last years, exceeding 70.000.000 ha in the tropics, 50% of which are composed of Eucalyptus spp.. Planted and secondary forests are likely to be dominant features of tropical forest landscapes in the future. Therefore, to understand the use of different species in this situation in basic to the biological conservation. This work investigated the avifauna at a mosaic of Eucalyptus spp. patches in the State Forest Edmundo Navarro de Andrade (Rio Claro, Sâo Paulo, Brazil). These patches (~1-51 ha) were created in different years (1994-1990), presenting different levels of regeneration of the native vegetation. The principal aims were to evaluate the richness, abundance and composition of the bird community associating these parameters to the structure of the vegetation (richness, height, basal area, plant density, dead plant density, canopy cover and vertical density from 0,0 to 1,0, from 1,1 to 2,0 and form 2,1 to 5,0 m). The avifauna was sampled with point counts. In the first chapter, 14 patches of E. citrioddora were studied. It was recorded 103 species, from 23 to 55 per patch. Myiodynastes maculatus, Cyclarhis gujanensis, Amazilia lactea and Megarynchus pitangua were the most habitat generalist species. These species were not associated to any vegetation parameter. The abundance was greater in patches with more developed vegetation. Patches with high vegetation complexity had greater richness and abundance of insectivorous and forest dependent species. The distance between E. citriodora and native vegetation patches influenced negatively the richness and abundance of forest dependent species. In chapter 2, in addition to the 14 E. citriodora patches, four E. microcorys and three native vegetation patches were included in the analyses. It was recorded 115 species. On average, there were 47, 35 and 24 species in the patches... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:37Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2001-12Bitstream added on 2014-06-13T19:37:31Z : No. of bitstreams: 1 frangioni_dss_me_botfca.pdf: 542597 bytes, checksum: 287866285220c5f30edfb16af2d32683 (MD5) / No período de 1998 à 2001, 17 amostras de pimentão ‘Magali-R’ (Capsicum annuum L.) com sintomas de mosaico sistêmico, nanismo, deformação foliar e dos frutos, causando severos danos e perdas econômicas, foram coletadas nas regiões produtoras de Paulínia, Lins, Jacareí, Guaiçara e Lucianópolis, municípios do Estado de São Paulo. Essas amostras foram caracterizadas através de círculo de hospedeiras, DAS-ELISA com o emprego de anticorpo monoclonal contra o CMV-I e CMV-II. Um isolado de cada região foi caracterizado molecularmente, quanto ao subgrupo através da RT-PCR e RFLP com a endonuclease de restrição MspI. As amostras foram inoculadas em plantas indicadoras que reagiram com sintomas típicos do Cucumber mosaic virus (CMV), entre estas, Nicotiana glutinosa demonstrando mosaico sistêmico e ausência de necrose, indicou que os isolados do CMV, em estudo, pertenciam ao subgrupo I. N. glutinosa foi utilizada para manter os isolados, para os testes de ELISA, extração de RNA total e como multiplicadora do vírus para a purificação. Todos os isolados testados no DAS-ELISA reagiram positivamente ao anticorpo monoclonal específico para o CMV-I e negativamente para o CMV-II. Os isolados 1, 3, 4, 15 e 17 foram amplificados com sucesso através da RT-PCR, e produziram um fragmento de 486 pb, tamanho esperado para o subgrupo I. Fragmento que ao ser digerido pela MspI, resultou em duas bandas de 150 e 336 pb, padrão esperado para o CMV-I. O método utilizado na purificação foi eficiente, resultando em uma preparação do CMV purificado, cujo rendimento foi de 40 mg/kg de tecido infectado, permitindo a imunização de galinhas e a produção de um antissoro policlonal específico à partir das gemas dos ovos. O antissoro apresentou alto título em ELISA indireto. A triagem de genótipos de pimentão para a resistência ao CMV... . / During the years 1998 to 2001, 17 samples of sweet peppers ‘Magali- R’ (Capsicum annuum L.) showing systemic mosaic, stunt, leaf and fruit distortion, causing severe damage and economic losses, were collected from Paulínia, Lins, Jacareí, Guaiçara and Lucianópolis, regions of São Paulo State. These samples were characterized by host range and DAS-ELISA with monoclonal antibodies against CMV I and CMV II. One isolate from each region was also characterized by RT-PCR and RFLP with restriction enzyme MspI. The plants host range revelead the presence of the Cucumber mosaic virus (CMV) in all samples. The symptom reaction in Nicotiana glutinosa was sistemic mosaic without necrosis, indicating that all CMV isolates belongs to subgroup I. The CMV isolates were also propagated and mantained in this host for the ELISA test and total RNA extration. All isolates tested by DAS-ELISA reacted positively with CMV I specific monoclonal antibodies and negatively with CMV II. The isolates 1, 3, 4, 15 e 17 were successfully amplified by the RTPCR and produced a fragment of 486 pb, the expected size for CMV subgroup I. These fragments when digested by MspI produced two bands of 150 and 336 pb, restriction pattern expected for the CMV subgroup I. Purified CMV yielding was 40mg/kg of infected leaves. The method used was efficient to produce a good purified preparation utilized to immunize chickens that produced specific antiserum with high titer. Screening of sweet peppers resistance to CMV showed immunity of AF-97A and tolerance of AF-188, AF-1178, AF-98 A, AF-99 A and AF-136 A. The hybrid progenies Lamuyo, Reinger, Mayata, Mônica, Magali, Mikalor, Esterel, Melody and “All Big” cultivar showed immune plants. These results are promising to sweet pepper breeding for resistance to CMV.

Orientador: José Osmar Gaspar / Banca: Júlio César Borges / Banca: Jorge Alberto Marques Rezende / Banca: Marinônio Lopez Cornelio / Banca: Roberto da Silva / Resumo: A expressão de proteínas recombinantes em Escherichia coli produz proteínas que se acumulam como agregados insolúveis conhecidos como corpos de inclusão (CI). As proteínas na forma de CI são biologicamente ativas e com estrutura semelhante à proteína nativa quando a expressão é induzida a baixa temperatura. Estas características e a facilidade em purificar os CIs podem representar uma possibilidade de utilização dos CIs como antígenos para a produção de anticorpos policlonais. O gene da proteína capsidial (CP) do Southern bean mosaic virus (SBMV), um Sobemovirus, foi clonado no vetor pET 28a e a proteína expressa em E. coli a 25 º C. Uma análise comparativa entre a CP recombinante presente na forma de corpos de inclusão e a proteína nativa presente nas partículas virais purificadas foi realizada utilizando a técnica de espectroscopia de infravermelho (FT-IR). Os conteúdos de estruturas secundárias identificados diferiram nos percentuais de folha-β enquanto os percentuais hélices-α foram preservados. Uma estrutura tridimensional foi gerada por modelagem molecular por homologia e comparada com os dados obtidos nas análises de FT-IR. Os percentuais obtidos por FT-IR da CP nativa foram condizentes com os dados gerados por modelagem molecular por homologia. Mesmo com algumas diferenças nos conteúdos de folha- β da CP recombinante foi possível verificar um estado conformacional semelhante à proteína nativa. Os corpos de inclusão contendo a proteína recombinante expressa foram utilizados como antígenos para a imunização de coelhos. O antissoro obtido mostrou ser específico e compatível a um antissoro previamente preparado com partículas virais purificadas do SBMV na detecção do vírus em extratos de feijoeiros infectados utilizando imunoensaios por Western blot, PTA-ELISA, Dot Blot e Tissue Printing... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The production of recombinant proteins in Escherichia coli yields proteins that accumulate as insoluble aggregates known as inclusion bodies (IBs). Biologically active with native-like structure is trapped inside IBs when the expression is induced at low temperature. These features, and the facility to purify the IBs, can represent a possibility to use the IBs as an antigen for the production of polyclonal antibodies. The coat protein gene of Southern bean mosaic virus, a Sobemovirus, was cloned in the vector pET 28a and expressed in Escherichia coli at 25 ºC. The inclusion bodies containing the recombinant protein were isolated and purified. A comparative analysis between recombinant protein present in the form of inclusion bodies and native coat protein present in the purified virus particles was performed using Fourier transform infrared spectroscopy (FT-IR). The secondary structure contents identified differences in the percentage of β-sheets while α-helices content was much preserved. The three-dimensional structure was generated using molecular modeling and was compared to the data obtained from FT-IR analysis. The percentages obtained from FT-IR analyses of the native CP were consistent with the structure generated through homology molecular modeling. Nevertheless, some differences were present on the content of β-sheets structure of the recombinant CP indicating that the protein conformational state is found in a native like condition. The IBs containing the expressed protein were used as an antigen to immunize rabbits. The antiserum obtained showed to be specific and comparable to one previously prepared with purified SBMV particles, in the virus detection in leaf extracts of infected bean plants using Western blot, PTA-ELISA, Dot Blot and Tissue Printing assays. So, the use of IBs containing recombinant viral proteins to immunize rabbits is a new, easy and very... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Submitted by Mendes Eduardo (dasilva@ufba.br) on 2013-08-05T18:42:18Z No. of bitstreams: 1 Dissertação de Elaine Cristina Cambuí Barbosa.pdf: 660054 bytes, checksum: e5cdb9d1b7310b2eb8aa9546bf7f1240 (MD5) / Approved for entry into archive by Rodrigo Meirelles (rodrigomei@ufba.br) on 2013-11-26T15:23:25Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação de Elaine Cristina Cambuí Barbosa.pdf: 660054 bytes, checksum: e5cdb9d1b7310b2eb8aa9546bf7f1240 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-11-26T15:23:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação de Elaine Cristina Cambuí Barbosa.pdf: 660054 bytes, checksum: e5cdb9d1b7310b2eb8aa9546bf7f1240 (MD5) / As paisagens podem ser caracterizadas como um conjunto de unidades heterogêneas que interagem entre si sob uma determinada escala e sob o ponto de vista de um observador (Turner 1989). As fontes de heterogeneidade nas paisagens, derivam principalmente de variações físicas do ambiente (solo, topografia, umidade), perturbações naturais (fogo, tornado, tempestades, inundações) e antrópicas (perda de habitat e fragmentação) (Sousa 1984; Turner, 1989; Metzger 1999). A fragmentação de habitats tem sido apontada como uma das principais ameaças a manutenção da biodiversidade, especialmente nas Florestas Tropicais (Laurance e Bierregarrd 1997; Myers et al. 2000). Este processo atua no aumento da redução da cobertura de hábitat, no grau de isolamento entre áreas, no número de manchas e no efeito de borda (Franklin et al. 2002; Fahrig 2003). Os efeitos resultam no declínio das populações naturais, a partir do aumento das taxas de extinções de espécies (Gustafson e Gardner 1996) e alterações nos serviços ecossistêmicos (Kremen et al. 2004; Tscharntke et al. 2005). As primeiras investigações sobre a fragmentação estiveram voltadas para o entendimento de como os efeitos do grau de isolamento e do tamanho das manchas de habitat sobre as taxas de colonização e extinção das populações locais (MacArthur e Wilson 1967). Nessa abordagem, os fragmentos florestais eram considerados unidades da paisagem responsáveis pela manutenção de populações viáveis, enquanto que a matriz era caracterizada como uma unidade espacialmente dominante e inóspita no ponto de vista de manter ou propiciar o fluxo de indivíduos (Haila 2002). No entanto quando consideramos a paisagem como o mosaico heterogêneo de diferentes tipos de uso da terra, outras unidades, além das manchas de habitats são importantes para a persistência de determinadas populações pelo aumento da conectividade da paisagem e dispersão dos organismos (Taylor et al. 1993). A conectividade pode ser classificada em estrutural e funcional. A conectividade estrutural está relacionada as unidades da paisagem que possuem similaridades estruturais com as manchas de habitat como corredores ecológicos (Perault e Lomolino 2000; Hannon e Schmiegelow 2002) e pontos de ligação (Boscolo et al. 2008; Uezu et al. 2008). Já a conectividade funcional refere-se a capacidade de movimentação dos organismos em diferentes tipos de unidades da paisagem e sob diferentes escalas de observação (Taylor et al. 1993; Awade e Metzger 2008). Dentre as diferentes unidades que compõem as paisagens heterogêneas, a matriz vem atualmente recebendo atenção nas investigações ecológicas como unidade facilitadora na promoção da conectividade estrutural e funcional (Gascon et al. 1999; Ricketts 2001; Vandermeer e Carvajal 2001; Perfecto e Vandermeer 2002; Verbeylen et al. 2003; Revilla et al. 2004; Umetsu e Pardini 2007). Atualmente a matriz é caracterizada como uma unidade heterogênea espacial e funcionalmente dominante pois pode regular os efeitos de borda, intensificar o papel dos corredores e dos pontos de ligação (Baum et al. 2004), determinar e/ou selecionar os fluxos biológicos (Malcolm 1991), além de servir como expansão de hábitats para espécies mais tolerantes (Gascon et al. 1999; Antongiovanni e Metzger 2005; Ewers e Didham 2006). Dentre os diferentes tipos de matrizes que compõem as paisagens fragmentadas, os sistemas de agricultura são considerados como importantes componentes das paisagens em decorrência do predomínio e ampla distribuição nas regiões tropicais (Power 1996; Mcneely e Schroth 2006). A funcionalidade destes sistemas está relacionado a aspectos estruturais da paisagem como a configuração espacial (Giulio et al. 2001) e da porcentagem de floresta nativa (Faria et al. 2006). Certas características próprias desses sistemas de agricultura, como regimes de manejo, baseados no enriquecimento com espécies nativas para fornecer maior sombreamento, promovem maior complexidade estrutural e conseqüentemente maior facilidade dos organismos colonizarem estes ambientes (Perfecto et al. 1996; Perfecto e Vandermeer 2002; Pineda et al. 2005; Faria et al. 2007). Além disso, a similaridade estrutural de alguns sistemas de agricultura, como por exemplo as plantações florestadas, com os fragmentos florestais podem minimizar os efeitos da fragmentação (Lindenmayer et al. 2006) através da redução do efeito de borda (Malcolm 1991; Pardini et al. 2009) e aumento da conectividade estrutural e funcional (Taylor et al. 1993). Essa similaridade estrutural pode tornar as plantações florestadas habitats sustentáveis para determinadas espécies nativas (Gascon et al. 1999; Antogiovanni e Metzger 2005). Por essas razões, as monoculturas florestadas vem sendo apontadas como possíveis conectores de paisagens fragmentadas, o que tem favorecido, nas últimas décadas, a expansão destes ambientes (Fearnside 1998), especialmente em regiões tropicais, perfazendo mais de 140 milhões de hectares de áreas plantadas, grande parte voltada a produção de madeira e fibra (FAO 2005). O Brasil possui cerca de seis milhões de hectares de plantações, sendo 62% somente de eucaliptais, considerada hoje a monocultura silvícola dominante no país (ABRAF 2008). As plantações de seringueira (Hevea brasiliensis Muell. Arg.), outro exemplo desses sistemas agrícolas, encontram-se atualmente em franco processo de crescimento mundial e ocupam o quarto lugar no Brasil em número de áreas plantadas com cerca de 81 mil hectares (ABRAF 2008). No século XIX o Brasil detinha a hegemonia na produção mundial de borracha, dado o grande número de seringueiras nativas da região amazônica (Cortez et al. 2002). Esse processo foi alterado após a Segunda Guerra Mundial, quando o Brasil passou a ser importador, em decorrência da grande expansão dessas plantações no Sudeste da Ásia, que atualmente contém 72% dos 9.7 milhões de hectares plantados no mundo (FAO 2001). A produção brasileira adquiriu um novo crescimento a partir da década de 70 com o plantio de Hevea brasiliensis Muell. Arg. em muitas regiões fora da Amazônia. Atualmente, o estado de São Paulo possui a maior produção de borracha natural, seguido por Mato Grosso e Bahia (Pino et al. 2000). Os argumentos favoráveis à expansão das áreas de plantações de seringueira no Brasil refere-se ao fato do país não ser auto-sustentável na produção de borracha (SBS 2007). Além disso essa monocultura desempenha um papel sócio econômico, atribuído a grande utilização de mão de obra familiar assalariada no plantio, extração e beneficiamento, o que propicia a geração de renda para as populações locais (Pino et al. 2000). Como conseqüência, há fortes perspectivas de crescimento da produção de borracha natural, objetivando suprir as necessidades da indústria nacional e sua exportação, especialmente na faixa leste, dominada pela Floresta Atlântica, (SBS 2007). A Floresta Atlântica representa um dos mais ameaçados Hotspots do mundo pelas elevadas taxas de endemismos e alto grau de ameaça do bioma (Myers et al. 2000). Nas últimas décadas o intenso processo de conversão de suas florestas nativas provocou a redução de mais 88% de sua cobertura original (Ribeiro et al. 2009), constituindo atualmente o bioma em muitos fragmentos florestais menores de 100 ha e poucos blocos contínuos de floresta, circundados por centros urbanos e diferentes sistemas de agricultura (Dean 1995; Di Bitetti et al. 2003), como as plantações florestadas (Pardini et al. 2009). Estudos realizados na Floresta Atlântica com plantações florestadas foram concentrados em plantações de eucaliptais (Mardsen et al. 2001; Vasconcelos 2008), Pinus, Araucaria (Zurita et al. 2006), e sistemas agroflorestais como cabrucas (Faria et al. 2007; Pardini et al. 2009). Em se tratando de plantações de seringueiras, apesar de estabelecida há décadas neste bioma, foram alvo de investigação apenas nos estudos de Accacio (2002) com borboletas frugivoras e Flesher (2006) como pequenos mamíferos, que compararam estes ambientes com diferentes com diferentes sistemas agrícolas. Entretanto, fora do Brasil, mas ainda na região tropical, destacamos os estudos de Beukema et al. (2007) com aves e plantas na Indonésia. Na paisagem onde foi realizado o nosso estudo, situada na região do baixo sul da Bahia, as plantações de seringueira estão sob dois principais regimes de manejo: o primeiro consiste na retirada total da vegetação de sub-bosque e o outro na sua manutenção, o que favorece o estabelecimento de uma capoeira jovem. Este diferencial de manejo pode promover diferentes respostas do papel das plantações de seringueiras, o que não foi considerado nos estudos acima mencionados. A escassez de informações sobre o papel dessas plantações na manutenção das assembléias de espécies e o potencial de expansão dessas plantações nas regiões tropicais, especialmente em áreas dominadas por Floresta Atlântica, requer estudos bem delineados, que avaliem o papel das mesmas na manutenção da diversidade biológica regional. Assim, o presente estudo é o primeiro no Brasil delineado para investigar as respostas das comunidades de borboletas frugívoras, em uma paisagem em mosaico composta por floresta madura, floresta secundária e plantações de seringueiras (Hevea brasiliensis) sob dois regimes de manejo na Floresta Atlântica do sul da Bahia. Dentre os diferentes grupos faunísticos que vem sendo estudos em paisagens fragmentadas, as borboletas (LEPIDOPTERA: INSECTA) têm recebido atenção especial (Brown Jr e Brown 1992; Kremen 1992; Brown Jr e Freitas 2000a, b; Brown Jr e Freitas 2002; Hill e Hamer 2004; Barlow et al. 2007 b, c, d; Uehara et al. 2007), sendo consideradas como um dos grupos mais estudados, visando a identificação de padrões de diversidade da biota terrestre (Robbins e Opler 1996; DeVries e Walla 2001). Participantes dos principais processos ecológicos (competição, mutualismo, predação, herbívoria, dentre outros), possuem alta diversidade de espécies, sensibilidade as variações físicas do ambiente, baixa resiliência, e especificidade as suas plantas hospedeiras (Robbins e Opler 1996; Brown Jr 1997; Brown Jr e Freitas 2000a; DeVries e Walla 2001). / Salvador, Bahia

The common bean (Phaseolus vulgaris L.) is a very consumed leguminous in Brazil it have essentials nutrients for the human health. The disease occurrence and inadequate management make difficult its Cultivation and affected the quality of that culture. Among the diseases most important, are the viruses caused by Begomovirus, show off Bean golden mosaic virus (BGMV). The high severity of disease caused by geminivirus, is mainly due to the absence of varieties resistant to the pathogen and also to the increased population of the insect vector, commonly called "whitefly" (Bemisia tabaci). This project had as main objective to evaluate the influence of three different irrigation systems in the incidence and the losses occasioned by Bean golden mosaic virus (BGMV) in the bean (Phaseolus vulgaris). The experiment consisted of three irrigation systems (drip, sprinkler and micro sprinkler) on bean plants grown in an area in the centro de ciências agrárias and was assessed for two consecutive years (October 2006 to January 2007 and October 2007 to January , 2008). The viruses incidence was determined based on number of symptomatic plants in relation to the total of plants present in parcel of 1 m2 randomly distributed in the experimental area. The golden mosaic effect in production was studied in two ways: relating production (grains weight) with the plot to incidence of the disease in this plot and comparing healthy and infected plants production. It was found that irrigation system influenced the viruses incidence, drip result in highest incidence (62.13%), and sprinkling shortest (16.74%), but did not differ statistically from the micro sprinkling. There was no correlation between incidence to golden mosaic and production in the plots, but when it was compared to production of healthy plants and disease plants found a higher three times production in healthy plants about plants disease. / Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Alagoas / O feijão comum (Phaseolus vulgaris L.) é uma leguminosa bastante consumida no Brasil por possuir nutrientes essenciais a saúde humana. A ocorrência de doenças e o manejo inadequado tem dificultado seu cultivo e afetado a qualidade desta cultura. Entre as doenças mais importantes, estão as viroses, ocasionadas por Begomovirus, destancando-se o Bean golden masaic virus (BGMV). A alta severidade das doenças causadas por Begomovirus, deve-se principalmente à ausência de variedades resistentes ao patógeno e também ao aumento populacional do inseto vetor, vulgarmente denominado, mosca-branca (Bemisia tabaci). O presente projeto teve como objetivo principal avaliar a influência de diferentes sistemas de irrigação na incidência e nas perdas ocasionadas pelo Bean golden mosaic virus (BGMV) em feijoeiro. O experimento consistiu de três sistemas de irrigação (gotejamento, micro aspersão e aspersão) sobre plantas de feijão cultivadas em uma área no centro de ciências agrárias e foi avaliado durante dois anos consecutivos (outubro de 2006 a janeiro de 2007 e outubro de 2007 a janeiro de 2008). A incidência da virose foi determinada com base no número de plantas sintomáticas em relação ao total de plantas presentes em parcelas de 1 m2 distribuídas aleatoriamente na área experimental. O efeito do mosaico dourado na produção foi estudado de duas maneiras: relacionando-se a produção (peso de grãos) da parcela com o a incidência da doença na respectiva parcela e comparando-se a produção de plantas sadias e infectadas. Verificou-se que o sistema de irrigação influenciou a incidência da virose, sendo o gotejamento aquele que resultou na maior incidência (62,13 %), e a aspersão na menor (16,74 %), porém não diferindo estatisticamente da microaspersão. Não houve correlação entre o a incidência do mosaico dourado e a produção nas parcelas, contudo quando foi comparada a produção de plantas sadias com a de plantas doentes constatou-se que as plantas sadias produziram cerca de três vezes mais que plantas doentes.

Nesta pesquisa buscou-se identificar os processos de elaboração e de reelaboração de conceitos relativos a polígonos, a partir de uma intervenção, de curta duração, com adolescentes, mediada por tecnologias digitais. A base teórica alicerça-se em Piaget, Vergnaud, o casal Van Hiele e Ausubel. Nesta investigação, analisaram-se processos e relações estabelecidas em oito encontros de intervenção, apoiados por um mosaico tecnológico, composto de algumas tecnologias recentes e outras pioneiras no estudo da geometria. Para o estabelecimento de relações geométricas, utilizou-se o Slogo-3.0, o Cabri-Géomètre II e o MatGeo, este desenvolvido no contexto da pesquisa. Para o incentivo às trocas entre os participantes da intervenção, utilizamos o Moodle. E, por fim, para observar a evolução dos conceitos representados por mapas conceituais, recorreu-se ao Cmap Tools. Entre os instrumentos de coleta de dados estão: os testes, para suporte aos estudos comparativos; os mapas, efetivados em três diferentes momentos e outros registros escritos, orais e digitais, para revelar mais sobre o processo. Os dados foram obtidos através das gravações das sessões interventivas em vídeos, da troca de arquivos on-line, do caderno de campo da pesquisadora e do acesso aos registros escritos dos alunos. Os resultados dos testes revelam que houve avanços significativos advindos do processo interventivo, relacionados ao reconhecimento de figuras, indicando que um mosaico tecnológico pode favorecer o desenvolvimento da aprendizagem, desde que permita aproximações sucessivas e distintas ao objeto de estudo. Os dados mostram, também, que há elaboração e reelaboração de conceitos por parte dos alunos, quando eles têm a oportunidade de agir sobre um mesmo conteúdo de diferentes formas, o que ocorreu na intervenção, apoiada pelo mosaico tecnológico. O processo interventivo permitiu aos alunos realizarem operações ligadas a uma dedução informal, assim como avanços nos processos lógicos. A metodologia utilizada na intervenção, embora em um processo de curta duração, permitiu a todos os alunos um alcance de resultados expressivos no processo de reconhecimento de figuras. Os mapas conceituais foram eficientes, pois evidenciaram os avanços concebidos e, também, as melhorias no processo de elaboração de conceitos relativos a polígonos. / This research has sought to identify the processes of elaboration and re-elaboration of concepts related to polygons, based on a short intervention involving teenagers, mediated by digital technologies. The theoretical basis is founded on Piaget, Vergnaud, the couple Van Hiele and Ausubel. This study aimed to analyze the processes and relationships established in eight intervention sessions. The intervention used a technological mosaic, composed of both recent and pioneering technologies for the study of geometry. To establish geometric relationships, we used the 3.0-Slogo, Cabri-II and Géomètre MatGeo, which was developed in the research context. To encourage interaction among the individuals participating in the intervention, we used Moodle. And finally, to observe the evolution of the concepts represented by concept maps, we used Cmap Tools. The data collection instruments were: tests to support comparative studies, conceptual maps produced at different times and written, oral and digital records. Data were obtained through recording sessions in interventional videos, exchanging files online, the researcher’s field notebook, and access to students’ written records. Test results show that significant advances, related to the recognition of figures, were achieved using the intervention process. Thus, suggesting the use of that a technological mosaic may favor learning, since it allows successive approximations. The data show that there is elaboration and re-elaboration of concepts by students when they have the opportunity to act on the same content in different ways, as occurred in the intervention. The intervention process allowed students to perform operations related to informal deduction and achieve advances in logical processes. The method involved the use of a short intervention which allowed all the participants to achieve significant results in the figure recognition process. Concept maps were shown to be efficient in assessing improvements in the process of elaborating concepts related to polygons.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:15Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-02-24Bitstream added on 2014-06-13T18:43:21Z : No. of bitstreams: 1 ozatojunior_t_dr_sjrp.pdf: 1586824 bytes, checksum: dea85cc33a334b628fea61b143707b14 (MD5) / A expressão de proteínas recombinantes em Escherichia coli produz proteínas que se acumulam como agregados insolúveis conhecidos como corpos de inclusão (CI). As proteínas na forma de CI são biologicamente ativas e com estrutura semelhante à proteína nativa quando a expressão é induzida a baixa temperatura. Estas características e a facilidade em purificar os CIs podem representar uma possibilidade de utilização dos CIs como antígenos para a produção de anticorpos policlonais. O gene da proteína capsidial (CP) do Southern bean mosaic virus (SBMV), um Sobemovirus, foi clonado no vetor pET 28a e a proteína expressa em E. coli a 25 º C. Uma análise comparativa entre a CP recombinante presente na forma de corpos de inclusão e a proteína nativa presente nas partículas virais purificadas foi realizada utilizando a técnica de espectroscopia de infravermelho (FT-IR). Os conteúdos de estruturas secundárias identificados diferiram nos percentuais de folha-β enquanto os percentuais hélices-α foram preservados. Uma estrutura tridimensional foi gerada por modelagem molecular por homologia e comparada com os dados obtidos nas análises de FT-IR. Os percentuais obtidos por FT-IR da CP nativa foram condizentes com os dados gerados por modelagem molecular por homologia. Mesmo com algumas diferenças nos conteúdos de folha- β da CP recombinante foi possível verificar um estado conformacional semelhante à proteína nativa. Os corpos de inclusão contendo a proteína recombinante expressa foram utilizados como antígenos para a imunização de coelhos. O antissoro obtido mostrou ser específico e compatível a um antissoro previamente preparado com partículas virais purificadas do SBMV na detecção do vírus em extratos de feijoeiros infectados utilizando imunoensaios por Western blot, PTA-ELISA, Dot Blot e Tissue Printing... / The production of recombinant proteins in Escherichia coli yields proteins that accumulate as insoluble aggregates known as inclusion bodies (IBs). Biologically active with native-like structure is trapped inside IBs when the expression is induced at low temperature. These features, and the facility to purify the IBs, can represent a possibility to use the IBs as an antigen for the production of polyclonal antibodies. The coat protein gene of Southern bean mosaic virus, a Sobemovirus, was cloned in the vector pET 28a and expressed in Escherichia coli at 25 ºC. The inclusion bodies containing the recombinant protein were isolated and purified. A comparative analysis between recombinant protein present in the form of inclusion bodies and native coat protein present in the purified virus particles was performed using Fourier transform infrared spectroscopy (FT-IR). The secondary structure contents identified differences in the percentage of β-sheets while α-helices content was much preserved. The three-dimensional structure was generated using molecular modeling and was compared to the data obtained from FT-IR analysis. The percentages obtained from FT-IR analyses of the native CP were consistent with the structure generated through homology molecular modeling. Nevertheless, some differences were present on the content of β-sheets structure of the recombinant CP indicating that the protein conformational state is found in a native like condition. The IBs containing the expressed protein were used as an antigen to immunize rabbits. The antiserum obtained showed to be specific and comparable to one previously prepared with purified SBMV particles, in the virus detection in leaf extracts of infected bean plants using Western blot, PTA-ELISA, Dot Blot and Tissue Printing assays. So, the use of IBs containing recombinant viral proteins to immunize rabbits is a new, easy and very... (Complete abstract click electronic access below)

Resumo: No período de 1998 à 2001, 17 amostras de pimentão 'Magali-R' (Capsicum annuum L.) com sintomas de mosaico sistêmico, nanismo, deformação foliar e dos frutos, causando severos danos e perdas econômicas, foram coletadas nas regiões produtoras de Paulínia, Lins, Jacareí, Guaiçara e Lucianópolis, municípios do Estado de São Paulo. Essas amostras foram caracterizadas através de círculo de hospedeiras, DAS-ELISA com o emprego de anticorpo monoclonal contra o CMV-I e CMV-II. Um isolado de cada região foi caracterizado molecularmente, quanto ao subgrupo através da RT-PCR e RFLP com a endonuclease de restrição MspI. As amostras foram inoculadas em plantas indicadoras que reagiram com sintomas típicos do Cucumber mosaic virus (CMV), entre estas, Nicotiana glutinosa demonstrando mosaico sistêmico e ausência de necrose, indicou que os isolados do CMV, em estudo, pertenciam ao subgrupo I. N. glutinosa foi utilizada para manter os isolados, para os testes de ELISA, extração de RNA total e como multiplicadora do vírus para a purificação. Todos os isolados testados no DAS-ELISA reagiram positivamente ao anticorpo monoclonal específico para o CMV-I e negativamente para o CMV-II. Os isolados 1, 3, 4, 15 e 17 foram amplificados com sucesso através da RT-PCR, e produziram um fragmento de 486 pb, tamanho esperado para o subgrupo I. Fragmento que ao ser digerido pela MspI, resultou em duas bandas de 150 e 336 pb, padrão esperado para o CMV-I. O método utilizado na purificação foi eficiente, resultando em uma preparação do CMV purificado, cujo rendimento foi de 40 mg/kg de tecido infectado, permitindo a imunização de galinhas e a produção de um antissoro policlonal específico à partir das gemas dos ovos. O antissoro apresentou alto título em ELISA indireto. A triagem de genótipos de pimentão para a resistência ao CMV... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo). / Abstract: During the years 1998 to 2001, 17 samples of sweet peppers 'Magali- R' (Capsicum annuum L.) showing systemic mosaic, stunt, leaf and fruit distortion, causing severe damage and economic losses, were collected from Paulínia, Lins, Jacareí, Guaiçara and Lucianópolis, regions of São Paulo State. These samples were characterized by host range and DAS-ELISA with monoclonal antibodies against CMV I and CMV II. One isolate from each region was also characterized by RT-PCR and RFLP with restriction enzyme MspI. The plants host range revelead the presence of the Cucumber mosaic virus (CMV) in all samples. The symptom reaction in Nicotiana glutinosa was sistemic mosaic without necrosis, indicating that all CMV isolates belongs to subgroup I. The CMV isolates were also propagated and mantained in this host for the ELISA test and total RNA extration. All isolates tested by DAS-ELISA reacted positively with CMV I specific monoclonal antibodies and negatively with CMV II. The isolates 1, 3, 4, 15 e 17 were successfully amplified by the RTPCR and produced a fragment of 486 pb, the expected size for CMV subgroup I. These fragments when digested by MspI produced two bands of 150 and 336 pb, restriction pattern expected for the CMV subgroup I. Purified CMV yielding was 40mg/kg of infected leaves. The method used was efficient to produce a good purified preparation utilized to immunize chickens that produced specific antiserum with high titer. Screening of sweet peppers resistance to CMV showed immunity of AF-97A and tolerance of AF-188, AF-1178, AF-98 A, AF-99 A and AF-136 A. The hybrid progenies Lamuyo, Reinger, Mayata, Mônica, Magali, Mikalor, Esterel, Melody and "All Big" cultivar showed immune plants. These results are promising to sweet pepper breeding for resistance to CMV. / Orientador: Marcelo Agenor Pavan / Coorientador: Addolarata Colariccio / Mestre