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Estimativas de parâmetros genéticos de características de carcaças feitas por ultra-sonografia em bovinos da raça Nelore / Genetic parameters for carcass traits measured trough ultrasound in Nelore cattle

Luís Gustavo Girardi Figueiredo 24 May 2001 (has links)
O presente trabalho teve como objetivo estimar parâmetros genéticos de características de carcaças feitas por ultra-sonografia em bovinos da raça Nelore bem como as suas correlações genéticas com características de desenvolvimento ponderal e com escores visuais. Os dados coletados pertencem a três fazendas, duas pertencentes a Agropecuária CFM (Rebanho 1) que foram analisadas em conjunto com 1696 animais e uma pertencente a Manah Agropastoril Ltda. com 951 animais (rebanho 2). As características analisadas foram: área de olho de lombo (AOL), espessura de gordura subcutânea (EGS), peso a desmama (PESDES), ganho de peso da esmama ao sobreano (GP345), peso ao sobreano (PESSOB) e altura (ALT). E os escores visuais analisados foram: musculosidade (MUSC), conformação (CONF) e precocidade (PREC). Os componentes de (co)variância foram estimados por verossimilhança restrita, utilizando-se o software MTDFREML. Foram realizadas análises uni-características em que foram estimadas as herdabilidades das características AOL e EGS e análises bi-características em que foram estimadas as correlações genéticas das características de AOL e EGS com as características de desempenho ponderal e escores visuais. As estimativas herdabilidades para AOL foram de 0,19 (rebanho 1) e de 0,41 (rebanho 2), para a EGS foram de 0,04 (rebanho 1) e de 0,19 (rebanho 2). Estas herdabilidades sugerem que as características são passíveis de seleção. São sugeridos estudos adicionais de estimativas de componentes de (co)variância para medidas de ultra-sonografia para bovinos da raça Nelore. / This research was conducted to estimate variance components and genetic parameters of carcass traits of Nelore cattle, measured through ultrasound equipment, and also the genetic relationship of those traits with growth traits and visual scores. Data came from three different herds. 1,696 animals were measured in two farms owned by Agro-Pecuaria CFM Ltda. (herd 1) and 951 animals were measured at Fazenda Mundo Novo, owned by Manah Agropastoril Ltda. (herd 2). The traits analyzed were: loin-eye are (AOL, cm2), subcutaneous fat thickness (EGS, mm), weaning weight (PESDES, kg), weight gain from weaning to yearling (GP345, kg), yearling weight (PESSOB, kg), and height (ALT, cm). Visual scores were muscle score (MUSC), body conformation (CONF) e precocity (PREC). (Co)variance components were estimated by REML methods, using the software MTDFREML, under single traits (to estimate components for AOL and EGS) and twotraits analysis to estimate genetic correlations among AOL and EGS and the other traits. Heritability estimates for AOL were 0.19 (herd 1) and 0.41 (herd 2). While for EGS the values estimated were 0.04 (herd 1) and 0.19 (herd 2). The heritability coefficients estimated suggest that the traits can be selected. Further studies are suggested as related to (co)variance components estimation for ultrasound measurements in Nelore cattle.
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Estimativas de parâmetros genéticos de características de carcaças medidas por ultra-sonografia e de desenvolvimento ponderal em bovinos da raça Santa Gertrudis. / Estimative of genetic parameters for carcass traits measured by ultrasound and traits of ponderal development in Santa Gertrudis beef cattle.

José Henrique Hippolito Karsburg 19 September 2003 (has links)
O presente trabalho teve por objetivo estimar parâmetros genéticos de características de carcaça medidas por ultra-sonografia e de desenvolvimento ponderal em bovinos da raça Santa Gertrudis. O conjunto de dados é proveniente de 12 fazendas participantes do Programa de Melhoramento Animal da ABSG. As características analisadas foram, área de olho de lombo, espessura de gordura subcutânea, peso ao nascimento, peso aos 120 dias de idade, peso a desmama, peso aos 12 meses de idade, peso aos 18 meses de idade, peso aos 24 meses de idade e perímetro escrotal aos 18 meses de idade. Os dados foram pré-ajustados para o efeito de idade pela metodologia de polinômios segmentados. Os componentes de (co)variância foram estimados por máxima verossimilhança restrita utilizando-se o software MTDFREML. As estimativas de herdabilidade foram obtidas em análises uni-característica, e em análises bi-características, as quais geraram estimativas de correlações genéticas das características de AOL, EGS com as características de desempenho ponderal. As estimativas de herdabilidade para AOL e EGS foram de 0,23±0,10 e 0,05±0,04, respectivamente. Os parâmetros encontrados neste trabalho são estimativas para uma amostra da população da raça Santa Gertrudis e sugerem-se estudos adicionais, para confirmar as estimativas de parâmetros genéticos para estimativas de carcaça obtidas por ultra-sonografia, para esta raça. / The present study has as objectives to estimate genetic parameters of carcass traits measured by ultrasound and traits of ponderal development in Santa Gertrudis beef cattle. All data set evaluated was originated from 12 farms participating of the Animal Breeding Program conduced by Grupo de Melhoramento Animal of the Universidade de Sao Paulo. The traits analyzed were rib eye area (REA), fat thickness (FAT), birth weight, weight at 120 days, weaning weight, weight at 12, 18 and 24 months and scrotal circumference at 18 months of age. The data were pre-adjusted for age effect by segmented polynomials methodology. The co-variance components were estimated by Restricted Maximum Likelihood using the MTDFREML software. The estimates of heritability were obtained from univariate analysis, while the genetic correlations between REA and FAT with traits of ponderal development were calculated from bivariate analysis. The heritability estimated for REA and FAT were of 0.23±0.10 and 0.05±0.04, respectively. All genetic parameters reported in this present study are estimated from a population sampling of Santa Gertrudis animals, being suggested additional research for genetic parameters evaluation of carcass traits measured by ultrasound. In the breed.
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Estudo genético-quantitativo de número e diâmetro de fibras musculares em linhagem macho de frangos / Quantitative-genetic study of muscle fibers of number and diameter in a male broiler line

Andrezza Maria Felício 16 May 2008 (has links)
O presente estudo teve como objetivo estimar parâmetros genéticos e fenotípicos de número diâmetro e área de fibras musculares, bem como de características de desempenho, carcaça e qualidade de carne em uma linhagem de frangos pertencentes a um programa de seleção do tipo sib test, onde foram coletadas informações de carcaça dos irmãos completos dos indivíduos a serem selecionados, oriundos de um rebanho de pedigree, fornecidos pela Agroceres Ross Melhoramento de Aves S.A. Também foram fornecidos pela empresa 73.142 e 34.949 dados de peso à seleção juvenil e medidas de ultra-sonografia do músculo peitoral, respectivamente. As características analisadas foram: peso à seleção (PS), medidas de ultra-sonografia (US), peso de peito (PPEI), medida de pH inicial (pHi), medida de pH final (Phf), teor de luminosidade (L*), teor de vermelho (a*), teor de amarelo (b*), perdas de água por exsudação (EXSU), perdas de água por descongelamento (CONG), perdas de água por cozimento (COZ), força de cisalhamento (FC), número de fibras musculares (NCel), diâmetro de fibras musculares (DIAM) e área de fibras musculares (AREA). Os componentes de (co) variância foram estimados através do método de máxima verossimilhança restrita, utilizando-se o programa MTDFREML. A matriz de parentesco foi composta por 77.474 animais. As estimativas dos coeficientes de herdabilidade foram moderadas a altas para as características número de fibras musculares, peso à seleção juvenil, medida de ultra-sonografia, peso de peito, perda de água por exsudação, teor de luminosidade e teor de vermelho. As estimativas de correlações genéticas do número e diâmetro de fibras musculares com as características de perda de água da carne e força de cisalhamento indicaram a existência de uma importante associação genética entre as características, capazes de apresentar satisfatório potencial de resposta à seleção. / This research was conducted to estimate genetic and phenotypic parameters of muscle fibers of number, diameter and area, as well as of performace, carcass and meat quality traits in a male broiler line belonging to a program of selection of the type sib test, in which data from complete brothers of the individuals were selected, bred in a pedigree flock provided by Agroceres Ross Melhoramento de Aves S. A. Also were provided by the company 73,142 and 34,949 data concerning body weight at juvenile selection and ultrasound records of pectoral muscle, respectively. The traits analyzed were: body weight at juvenile selection (PS), ultrasound records of pectoral muscle (US), meat breast weight (PPEI), initial pH measure (pHi), final pH measure (pHf), lightness (L*), redness (a*), yellowness (b*), weep losses (EXSU), drip losses (CONG), shrik losses (COZ), shear force (FC), muscle fibers of number (NCel), muscle fibers of diameter and muscle fibers area (AREA). (Co) variance components were estimated by restricted maximum likelihood method, using the software MTDFREML. The numerator relationship matrix was composed by 77,474 individuals. Heritability coefficients estimates were from moderate to high for muscle fibers number, ultrasound records, meat breast weight, weep losses, lightness and redness traits. Genetic correlation estimates of muscle fibers number and diameter with the measures of meat water losses and shear force traits indicated the existence of an important genetic association between the traits, capable to present potential satisfactory respond to the selection.
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Estimação dos parâmetros genéticos do peso adulto em matrizes da raça Nelore / Genetic parameters estimation for mature weight in Nelore beef cattle

Victor Breno Pedrosa 07 December 2006 (has links)
O estudo das características produtivas visa a obtenção de animais possuidores de genótipos com potencial para altas produções mas que sejam também adaptados ao meio ambiente de criação extensiva no Brasil. Esses animais produtivos e adaptados poderiam otimizar os custos, tornando assim, sua criação sustentável em escala comercial. Apesar das características reprodutivas serem de extrema importância como objetivo de seleção, sua utilização não tem sido ampla em programas de melhoramento genético por serem consideradas de baixa herdabilidade. Entre as características produtivas existentes em bovinos de corte pode ser citada a caracterítica de peso adulto, que deve ser avaliado e monitorado o aumento do tamanho das fêmeas pela resposta indireta a seleção para peso, afim de confrontar os resultados economicamente. Dentro deste contexto foram avaliados dados de 74.547 animais com o objetivo de analisar o peso adulto e o peso adulto com repetibilidade (PAVr) em animais Nelore estimando a herdabilidade de características de desenvolvimento ponderal, utilizando modelos lineares; Estimar a correlação entre peso adulto (PAV) e características de peso ao sobreano (PS), conformação (CONF), precocidade (PREC), musculosidade (MUSC) e altura de garupa (AG); Determinar se há ou não vantagem em incluir o peso adulto em programas de seleção na raça Nelore. Os componentes de variância e de covariância foram estimados pelo método de máxima verossimilhança restrita (MTDFREML) utilizando-se o modelo animal. As estimativas dos coeficientes de herdabilidade foram de 0,43 para PAV e 0,41 para PAVr; 0,38 para PS; 0,23 para CONF; 0,19 para PREC; 0,22 para MUSC e 0,35 para AG. Os coeficientes de correlação genética obtidos variaram de 0,37 a 0,97. Os resultados sugerem que ganhos genéticos podem ser obtidos com a seleção para a característica de peso adulto, em monitoramento do tamanho de fêmeas na raça Nelore. A correlação entre as característica em estudo demonstra haver uma tendência de alteração das características de tamanho a partir da seleção para peso adulto. / The study of the productive traits aims the obtention of animals that have genotypes with potencial for high productions but that are also adaptable to the environment of the extensive creation in Brazil. These productive and adaptable animals could improve the costs, making therefore, their creation sustainable on a commercial scale. Although the reproductive characteristics have an extremely importance as an objective of the selection, its utilization have not been ample in genetic improvement programs for being considered as a low heritability trait. Between the productive traits existent in beef cattle it can be cited the mature weight trait, that must be evaluated and monitorated for the size increase control of the females by the indirect answer to weight selection, in order to confront, economically, the results. In this context it was evaluated data from 74.547 animals with the objective of analyze the mature weight and the adult weight with repeated measurements (MWr) in Nelore animals estimating the heritability of the ponderal development traits, using linear models; Estimate the correlation between mature weight (MW) and the post-weaning weight trait (PW), conformation (CONF), precocity (PREC), musculature (MUSC) and hip height (HH); Determine if there is an advantage in the inclusion of the mature weight in selection programs of the Nelore breed. The components of variance and covariance were estimated by the method of Restricted Maximum Likelihood Multiple Trait Derivative Free (MTDFREML) using the animal model. The estimation of the heritability coefficients were 0,43 for MW and 0,41 for MWr; 0,38 for PW; 0,23 for CONF; 0,19 for PREC; 0,22 for MUSC and 0,35 for HH. The genetic correlation coefficients varied from 0,37 to 0,97. The results suggest that genetic gains can be obtained with the selection for the mature weight characteristic, with the monitoration of the female sizes for Nelore breed. The correlation between the characteristics in study shows that there is a tendency for alteration in size characteristics through the selection for mature weight.
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Estudo genético da qualidade de carne em linhagem macho de frangos de corte / Genetic study of meat quality traits in a male broiler line

Leila de Genova Gaya 01 September 2006 (has links)
O presente trabalho teve como objetivo estimar os parâmetros genéticos e fenotípicos das características de qualidade de carne e de características de desempenho, carcaça e composição corporal em uma linhagem macho de frangos fornecida pela Agroceres Ross Melhoramento Genético de Aves S. A. As aves faziam parte do programa denominado sib test, ou teste de irmãos, aonde são coletadas informações de carcaça dos irmãos dos indivíduos a serem selecionados na referida linhagem, estes chamados de rebanho elite. As características de desempenho analisadas foram peso à seleção (PS), peso ao abate (PA) e medidas de ultra-sonografia de músculo peitoral (US). As características de carcaça analisadas foram o peso de peito (PPEI), o peso eviscerado (PE) e o peso de pernas (PPER) e as características de composição corporal analisadas foram o peso da gordura abdominal (GOR), o peso do fígado (FIG) e o peso do coração (COR). As características de qualidade de carne analisadas foram: medida de pH inicial (pHi), medida de pH em 6 horas após o abate (pH6), medida de pH final (pHf), amplitude inicial de queda de pH (AMi), amplitude final de queda de pH (AMf), teor de luminosidade (L*), teor de vermelho (a*), teor de amarelo (b*), perdas de água por exsudação (EXSU), perdas de água por descongelamento (CONG), perdas de água por cozimento (COZ) e força de cisalhamento (FC). Os componentes de (co) variância foram estimados por verossimilhança restrita, utilizando-se o programa MTDFREML. A matriz de parentesco foi composta por 107.154 animais. Para as características pH6, pHf e L* foram estimados coeficientes de herdabilidade moderados; para as demais características estes coeficientes foram baixos. As estimativas de correlações genéticas obtidas não foram indicativas de associações importantes entre as características de qualidade de carne e as características de desempenho, carcaça e composição corporal, exceto pela seleção a favor de PS, que pode reduzir as perdas de água da carne. As estimativas de correlações genéticas encontradas entre as características de qualidade de carne puderam contribuir para o entendimento dos mecanismos relacionados à qualidade da carne na linhagem analisada, de modo que CONG, FC e L* foram características capazes de trazer respostas correlacionadas favoráveis às demais e em maior ou menor grau apresentarem capacidade de resposta à seleção, recomendando-se sua utilização como critério de seleção quando na existência de necessidade de melhoria na qualidade da carne na linhagem estudada. Contudo, esta necessidade não foi aparente, uma vez que as tendências genéticas das características de qualidade de carne, além de terem sido de pequena magnitude, foram em sua maioria favoráveis à qualidade da carne da linhagem analisada. / This research was conducted to estimate genetic and phenotypic parameters of meat quality, performance, carcass and body composition traits in a male broiler line provided by Agroceres Ross Melhoramento Genético de Aves S. A. Broilers measured belonged to a sib test program, in which data from sibs of the individuals to be selected in this line, called elite flock, are collected. Performance traits analyzed were body weight at selection (PS), body weight at slaughter (PA) and ultrasound records of pectoral muscle (US). Carcass traits analyzed were meat breast weight (PPEI), eviscerated body weight (PE) and leg weight (PPER) and the body composition traits analyzed were abdominal fat weight (GOR), liver weight (FIG) and heart weight (COR). Meat quality traits analyzed were: initial pH measure (pHi), pH measure at 6 hours after slaughter (pH6), final pH measure (pHf), initial range of pH fall (AMi), final range of pH fall (AMf), lightness (L*), redness (a*), yellowness (b*), weep losses (EXSU), drip losses (CONG), shrink losses (COZ) and shear force (FC). (Co) variance components were estimated by restricted maximum likelihood method, using the software MTDFREML. The numerator relationship matrix was composed by 107.154 individuals. For pH6, pHf and L*, moderate heritability coefficients were estimated; for the other traits these coefficients were low. Genetic correlation estimates obtained indicated a small association among meat quality traits and performance, carcass and body composition traits, except for the selection to PS, which seemed to be able to reduce water losses of meat. Genetic correlations estimates among meat quality traits could orientated the understanding of the mechanisms related to meat quality in the analyzed line; CONG, FC and L* seemed to be able to bring favorable correlationed responses, so it was recommended its use as selection criterion if existing the necessity of improving the meat quality in the analyzed line. However, this necessity was not apparent, since the genetic trends of meat quality traits were small and favorable to meat quality in the analyzed broiler line.
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Genetic characterization of resistance to Haemonchus contortus in Morada Nova sheep /

Haehling, Marei Borsch von January 2020 (has links)
Orientador: Ana Carolina de Souza Chagas / Resumo: Nematódeos gastrintestinais são um grande obstáculo na produção de ovinos. A seleção para resistência tem sido uma abordagem eficiente e factível para lidar com esse problema. A utilização e investigação de marcadores genéticos para características de resistência poderiam acelerar o melhoramento genético e levar ao melhor entendimento dos mecanismos moleculares de resistência. O objetivo desse estudo foi verificar a possibilidade de seleção para características de resistência e resiliência em cordeiros da raça Morada Nova, estimar as potenciais respostas correlacionadas e avaliar se cinco polimorfismos de base única (SNPs, OAR2_14765360, OAR6_81718546, OAR11_62887032, OAR12_69606944 and OAR15_59871543) estão associados às características de resistência e resiliência. Um total de 287 cordeiros e 131 matrizes foram submetidas a dois desafios parasitários consecutivos e independentes por infecção oral com 4.000 larvas infectantes (L3) de Haemonchus contortus. Contagem de ovos por grama de fezes (OPG), volume globular (VG) e peso corporal vivo (PV) foram monitorados a cada uma ou duas semanas para 42 dias em cada desafio. Amostras de DNA de 287 cordeiros, 131 matrizes e 4 reprodutores machos foram amplificados por ARMS-PCR ou PCR-RFLP e os genótipos foram determinados. Estimativas de parâmetros genéticos foram obtidas para dias individuais de coleta, e para a característica como um todo com medidas repetidas, utilizando modelos animais mistos. A análise de variância (ANOVA) foi u... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Gastrointestinal nematodes are a major constraint in sheep production. Breeding for resistance has proven to be an effective and feasible approach to address this problem. The use and investigation of genetic markers for resistance traits could accelerate genetic progress and lead to a better understanding of underlying molecular mechanisms. The aim of this study was to verify the possibility of selection for resistance and resilience traits in Morada Nova lambs, to estimate potential correlated responses and to evaluate if five single nucleotide polymorphisms (SNPs) (OAR2_14765360, OAR6_81718546, OAR11_62887032, OAR12_69606944 and OAR15_59871543) are associated with resistance and resilience traits. A total of 287 lambs and 131 ewes were submitted to two consecutive independent parasite challenges by oral infection with 4,000 infective larvae (L3) of Haemonchus contortus. Faecal egg counts (FEC), packed cell volume (PVC) and body weight were measured every one or two weeks for 42 days in each trial. DNA samples from 287 lambs, 131 ewes and 4 rams were amplified by ARMS-PCR or PCR-RFLP and genotypes were determined. Estimates of genetic parameters were obtained for individual records as well as for overall traits with repeated measures, using mixed animal models. Analysis of variance (ANOVA) was used for association analyses between SNP genotypes and phenotypes. In case of significant association, the allele substitution effect was calculated based on a linear model. Heritabi... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Análise genética da produção in vitro de embriões em bovinos Guzerá / Genetic analysis of in vitro embryo production in Guzerá cattle

Perez, Bruno da Costa 04 February 2016 (has links)
O objetivo dessa pesquisa foi avaliar aspectos genéticos que relacionados à produção in vitro de embriões na raça Guzerá. O primeiro estudo focou na estimação de (co) variâncias genéticas e fenotípicas em características relacionadas a produção de embriões e na detecção de possível associação com a idade ao primeiro parto (AFC). Foi detectada baixa e média herdabilidade para características relacionadas à produção de oócitos e embriões. Houve fraca associação genética entre características ligadas a reprodução artificial e a idade ao primeiro parto. O segundo estudo avaliou tendências genéticas e de endogamia em uma população Guzerá no Brasil. Doadoras e embriões produzidos in vitro foram considerados como duas subpopulações de forma a realizar comparações acerca das diferenças de variação anual genética e do coeficiente de endogamia. A tendência anual do coeficiente de endogamia (F) foi superior para a população geral, sendo detectado efeito quadrático. No entanto, a média de F para a sub- população de embriões foi maior do que na população geral e das doadoras. Foi observado ganho genético anual superior para a idade ao primeiro parto e para a produção de leite (305 dias) entre embriões produzidos in vitro do que entre doadoras ou entre a população geral. O terceiro estudo examinou os efeitos do coeficiente de endogamia da doadora, do reprodutor (usado na fertilização in vitro) e dos embriões sobre resultados de produção in vitro de embriões na raça Guzerá. Foi detectado efeito da endogamia da doadora e dos embriões sobre as características estudadas. O quarto (e último) estudo foi elaborado para comparar a adequação de modelos mistos lineares e generalizados sob método de Máxima Verossimilhança Restrita (REML) e sua adequação a variáveis discretas. Quatro modelos hierárquicos assumindo diferentes distribuições para dados de contagem encontrados no banco. Inferência foi realizada com base em diagnósticos de resíduo e comparação de razões entre componentes de variância para os modelos em cada variável. Modelos Poisson superaram tanto o modelo linear (com e sem transformação da variável) quanto binomial negativo à qualidade do ajuste e capacidade preditiva, apesar de claras diferenças observadas na distribuição das variáveis. Entre os modelos testados, a pior qualidade de ajuste foi obtida para o modelo linear mediante transformação logarítmica (Log10 X +1) da variável resposta. / The objective of this research was to evaluate genetic aspects permeating in vitro embryo production in Guzerá cattle. The first study aimed for estimating genetic and phenotypic (co)variances among embryo production traits and detecting possible genetic association with the age at first calving (AFC). Low and medium heritabilities were detected for oocyte and embryo production traits. A weak genetic association between artificial reproduction traits and AFC was identified. The second study evaluated genetic and inbreeding trends in the Brazilian Guzerá population. Female donors and in vitro produced embryos were considered as two subpopulations in order to perform comparisons and infer over differences in inbreeding and genetic annual variations. Embryos\' subpopulation showed higher genetic gains for age at first calving and milk production than donors\' subpopulation and the general population. Higher annual mean inbreeding values were also detected for the embryos\' subpopulation. The third study examined the effects of donor, sire (used for in vitro fertilization) and embryos\' inbreeding coefficient over in vitro embryo production traits in Guzerá cattle. Donors\' and embryos\' inbreeding effects over the analyzed traits were detected. Fourth and final study was designed to compare the performance of Linear and Generalized Linear Mixed Models under Restricted Maximum Likelihood method when fitting discrete variables. Four hierarchical models assuming different distributions for the response variable were fit to the (count) data. Inference was performed upon residual diagnostics and comparison of variance component ratios between models within each trait. Poisson models outperformed both linear (with and without variable transformation) and negative binomial models for goodness of fit and predictive ability despite clear differences in each trait\'s distribution. Logarithmic transformation (Log10 X +1) showed lowest goodness of fit among all models tested.
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ESTUDO DA INTERAÇÃO GENÓTIPO X AMBIENTE SOBRE CARACTERÍSTICAS PRODUTIVAS NA RAÇA HOLANDESA EM DIFERENTES REGIÕES DO PARANÁ

Moreira, Raphael Patrick 17 July 2017 (has links)
Submitted by Angela Maria de Oliveira (amolivei@uepg.br) on 2017-09-13T13:51:47Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) Moreira, Raphael Patrick.pdf: 1363040 bytes, checksum: 74bca5c71c7cd6e6549ae07aa1b28433 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-09-13T13:51:47Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) Moreira, Raphael Patrick.pdf: 1363040 bytes, checksum: 74bca5c71c7cd6e6549ae07aa1b28433 (MD5) Previous issue date: 2017-07-17 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A larga utilização da inseminação artificial favoreceu que diferentes genótipos fossem distribuídos em distintas regiões ao redor do mundo. A falta de adaptação a algumas condições ambientais pode causar um efeito denominado interação genótipo x ambiente, principalmente em características poligênicas, ocorrendo alterações nos parâmetros genéticos. Deste modo, objetivou-se avaliar a interação genótipo x ambiente através das correlações genéticas para produção de leite (PL), produção de gordura no leite (PG) e produção de proteína no leite (PP). Foram utilizadas 57.967 vacas primíparas, com lactações entre os anos 1990 e 2015 e matriz de parentesco de 106.417 animais para estimar a correlação genética entre três regiões de climas distintos. O banco de dados utilizado pertence a Associação Paranaense de Criadores de Bovinos da Raça Holandesa – APCBRH e foi dividido por região de acordo com a classificação climática em, R1) Clima mesotérmico úmido e super úmido; R2) Clima mesotérmico sem estação seca e R3) Clima mesotérmico com estação seca. Os efeitos inclusos no modelo foram efeitos fixos do grupo de contemporâneo (rebanho e ano de nascimento), como covariável a idade ao parto e o efeito genético aditivo como efeito aleatório. Os parâmetros genéticos foram estimados pelo método REML, utilizando o programa VCE 6.0. Para obtenção dos valores genéticos utilizou-se o programa PEST2, e posteriormente, os touros foram classificados e submetidos às correlações de Pearson e Spearman, respectivamente. Foram verificados os animais coincidentes entre as regiões, considerando os touros 10% melhores classificados em cada região para realização da comparação estatística. A herdabilidade variou entre as regiões de 0,16 a 0,21 para PL, de 0,17 a 0,25 para PG e de 0,10 a 0,17 para PP. As correlações genéticas, correlações de Pearson, correlações de Spearman e porcentagem de animais coincidentes para as três características entre as regiões foram todas maiores que 0,90 e, portanto, próximas de um. Os resultados obtidos demonstram não haver interação genótipo x ambiente para as três características avaliadas dentro das distintas classificações climáticas no Paraná. Ou seja, a estimativa do valor gênico de um animal em determinada região poderá também ser utilizado para outra região, sem significativo viés no progresso genético da característica. Além do mais, como não houve alteração significativa da predição genética entre regiões do Paraná, apenas um programa de seleção pode ser adotado, o qual incluiria todos os rebanhos da raça Holandesa do estado, reduzindo seu custo e tempo. / The wide use of artificial insemination has favored that different genotypes be distributed in different regions around the world. The lack of adaptation to some environmental conditions can cause an effect called genotype x environment interaction, mainly in polygenic characteristics, with changes in genetic parameters. The objective of this study was to evaluate the genotype x environment interaction through genetic correlations for milk yield (MY), milk fat yield (FY) and milk protein yield (PY). A total of 57,967 primiparous cows with lactations between 1990 and 2015 and a relationship matrix of 106,848 animals were used to estimate the genetic correlation between three regions of different climates. The database used belongs to the Associação Paranaense de Criadores de Bovinos da Raça Holandesa- APCBRH and was divided by region according to the climatic classification in, R1) mesothermic climate moist and super humid, R2) mesothermic climate without dry season, R3) mesothermic climate with dry season. The effects included in the model were fixed effects of the contemporary group (herd and year of birth), as covariate the age at birth and the additive genetic effect as random effect. The genetic parameters were estimated by the REML method, using the VCE 6.0 program. To obtain the genetic values, the PEST2 program was used, in which the bulls were later classified and submitted to the Pearson and Spearman correlations, respectively. The coincident animals between the regions were verified, considering the bulls 10% better classified of each region for the accomplishment of the statistical comparison. The heritability between the regions ranged from 0.16 to 0.21 for MY, from 0.17 to 0.25 for FY and from 0.10 to 0.17 for PY. Genetic correlations, Pearson correlations, Spearman correlations and percentage of coincident animals for the three characteristics between regions were all higher than 0.90 and therefore close to one. The results obtained demonstrate that there is no interaction genotype x environment for the three characteristics evaluated within the distinct climatic classifications in Paraná. That is, the estimation of the genetic value of an animal in one region may also be used for another region, without significant bias in the genetic progress of the trait. Moreover, since there was no significant change in genetic prediction between regions of Paraná, only one selection program could be adopted, which would include all the herds of the state of Holstein, reducing their cost and time.
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Objetivos de seleção e valores econômicos para bovinos Nelore em sistema de ciclo completo / Breeding Objectives and Economic Values for Nellore Cattle in a Full-Cycle System

Moreira, Heverton Luís 15 September 2015 (has links)
O objetivo do presente trabalho foi definir os objetivos de seleção e estimar os valores econômicos para característica de importância econômica em um sistema de bovinos de corte criados em regime de ciclo completo, além de estimar os parâmetros genéticos para características produtivas, reprodutivas e de qualidade de carcaça avaliadas no programa de seleção Nelore Brasil. O desenvolvimento do modelo bioeconômico foi realizado considerando as informações do sistema de produção e dos parâmetros biológicos com objetivo de estabilizar o rebanho e calcular o número de animais em cada categoria, obter as informações de desempenho produtivo e econômico (receita e despesas) do sistema pecuário, e por fim a obtenção dos valores econômicos das características contidas no objetivo de seleção em sistema de ciclo completo, que para tal, foram utilizadas planilhas interligadas do programa Microsoft Excel®. Os valores econômicos foram estimados simulando o aumento de 1% no valor da característica do objetivo de seleção, mantendo as demais constantes. A estimação dos parâmetros genéticos foi pelo método de Máxima Verossimilhança Restrita (REML) usando o modelo animal, utilizando o software WOMBAT e o ganho genético anual para as características de reprodução, carcaça e desenvolvimento ponderal foi estimado pela regressão linear do valor genético (VG) em função do ano de nascimento. O modelo bioeconômico foi eficaz na estimação das fontes de receitas e despesas do sistema de produção e os valores econômicos estimados seguindo a ordem de importância para o ciclo completo foram R$ 3,69 para peso ao abate de macho (PAM), R$ 3,63 para peso a desmama de macho (PDM), R$ 3,58 para taxa de desmama (TD), R$ 3,40 para peso ao abate de fêmea (PAF), R$ 2,30 para peso a desmama de fêmea (PDF) e R$ 0,13 para peso ao adulto de vaca (PAV). Portanto, o PAM foi à característica de maior impacto no sistema de produção, porém, todas promoveram retorno econômico positivo com exceção do PAV que foi praticamente nulo. As estimativas de herdabilidade para as características de produção, reprodução e qualidade de carcaça foram favoráveis ao progresso genético por seleção direta. As correlações estimadas demonstram que machos com maior perímetro escrotal tendem a ser mais pesados e esses apresentarem maior rendimento e acabamento da carcaça. O processo de Resumo 13 seleção empírica utilizado pelo programa Nelore Brasil está sendo eficiente, de acordo com os resultados positivos dos progressos genéticos nas estimativas de tendência. Portanto todas as características avaliadas no sistema de ciclo completo tiveram importância econômica positivas, indicando que o processo de seleção trariam aumentos de lucratividade e as avaliadas geneticamente poderiam ser incluídas como critério de seleção contribuindo com a maximização da resposta esperadas para as características do objetivo de seleção. / The objective of this study was to define the objectives of selecting and estimating economic values for characteristics of economic importance in a system of beef cattle raised in fullcycle scheme. We also aimed to estimate the parameters for genetic reproductive and productive characteristics of carcass quality evaluated in the breeding program Nellore Brazil. The bio-economic model was developed considering the information and production system of biological parameters to stabilize the herd and calculate the number of animals in each category, obtain information on economic performance (revenue and expenses) of the livestock system, and finally to obtain economic values of the characteristics contained in the objective of selection in full-cycle system. We used interlinked spreadsheets in the Microsoft Excel®. The economic values were estimated by simulating the increase of 1% for the value of the characteristic of objective selection, keeping the others constant. The estimation of genetic parameters was obtained by the method of Restricted Maximum Likelihood (REML) using the animal model in the WOMBAT software and genetic gain for annual breeding characteristics; weighted carcass and development were estimated by linear regression of genetic value (GV) depending on the year of birth. The bio-economic model was effective in estimating revenue and expenditure sources of the production system and the estimated economic values, following the order of importance for the complete cycle, were R$ 3.69 for slaughter weight of male (SWM), R$ 3.63 for weaning weight of male (WWM), R$ 3.58 for weaning rate (WR), R$ 3.40 for the slaughter weight of female (SWF), R$ 2.30 for weaning weight of female (WWF) and R$ 0.13 for adult cow weight (ACW). Therefore, SWM had the greatest impact on the production system, however, all aspects promoted positive economic return with the exception of ACW, which was practically null. Heritability estimates for production, reproduction and carcass characteristics and quality were favorable to genetic progress for direct selection. The estimated correlations demonstrate that males with larger scrotal perimeter tend to be heavier and have higher carcass yield and finishing. The empirical selection process used by the program Brazil Nellore is efficient, according to the positive results of the genetic progress in trend estimates. Therefore, all features evaluated in the fullAbstract 16 cycle system had positive economic importance, indicating that the selection process could bring gains in profitability and the genetically evaluated characteristics could be included as a breeding criterion, contributing to the maximization of the expected response for the traits of interest in breeding programs.
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Melhoramento genético de arroz: modelos biométricos aplicados na avaliação de caracteres agronômicos e reação ao estresse por frio durante o período de germinação / Genetic improvement of rice: biometric models applied in the evaluation of agronomic traits and reaction to cold stress during the germination stage

Danielowski, Rodrigo 20 December 2017 (has links)
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Os cruzamentos e linhagens foram derivadas das seguintes formações: BRS Atalanta x LTB 06012; BRS Atalanta x SCS BRS Tio Taka; BRS Atalanta x BRS Chuí; BRS Chuí x LTB 06012; BRS Chuí x Oro; Oro x SCS BRS Tio Taka; SCS BRS Tio Taka x LTB 06012. As sementes foram conduzidas até a geração F4, quando então foram utilizadas nestes experimentos. As famílias de cada cruzamento foram semeadas em delineamento de linhas com pais intercalares em dois blocos. Em cada parcela foram marcadas 10 plantas para a coleta dos dados morfológicos e posteriormente avaliações de componentes de rendimento em laboratório. Cada planta marcada deu origem as sementes F5, que do cruzamento Oro x SCS BRS Tio Taka deram origem as 170 linhagens avaliadas em laboratório em função do estresse por frio durante a germinação. O experimento para a avaliação quanto a reação ao estresse por frio das linhagens foi montado em delineamento de blocos aumentados de Federer. Foram utilizadas duas câmaras do tipo BOD, uma com temperatura de 25°C e duração de 7 dias e outra a 13°C com duração de 28 dias. Foram avaliados o comprimento de parte aérea, raiz e coleóptilo, além da contagem de sementes germinadas aos 14 e 21 dias para o tratamento com frio. A estimação dos componentes de variância obtidos a partir dos dados a campo resultou na obtenção de parâmetros genéticos e de variância entre e dentro das famílias com diferentes níveis de herdabilidade para os caracteres estudados em cada cruzamento, sendo a seleção baseada na família a que resultará em maior sucesso na seleção. A avaliação de diferentes grupos de caracteres possibilitou o estudo das correlações canônicas, onde foi possível detectar a dependência entre o grupo de variáveis morfoagronômicas com os parâmetros de rendimento de grãos em todos os cruzamentos avaliados. Com a avaliação das linhagens em resposta ao estresse por frio, foi possível detectar efeito significativo entre as linhagens estudadas para quase todas as variáveis analisadas no tratamento controle e no tratamento sob estresse por frio. Para o cruzamento entre as cultivares Oro e SCS BRS Tio Taka foi possível concluir que; a seleção baseada na família resultará em maior sucesso no melhoramento dos caracteres agronômicos; as correlações obtidas revelaram que a seleção baseada no aumento do comprimento de panícula e na redução do ciclo, resultam em aumento da massa total de grãos; para a reação ao estresse por frio durante a germinação, um total de 104 linhagens foram potencialmente tolerantes, sendo que 13 destas foram superiores a cultivar tolerante (Oro) na avaliação da redução do comprimento de coleóptilo. / The objective of this study was to evaluate, through biometric models, agronomic characteristics and reaction to cold stress on germination in populations and lineages formed from seven crosses of rice genotypes. The experiment was conducted in the experimental field of Embrapa Clima Temperado, Estação Experimental Terras Baixas and in Genomics and Plant Breeding Center at Faculty of Agronomy Eliseu Maciel, the two locations in the Capão do Leão / RS. The crosses and lineages were derived from the following formations: BRS Atalanta x LTB 06012; BRS Atalanta x SCS BRS Tio Taka; BRS Atalanta x BRS Chuí; BRS Chuí x LTB 06012; BRS Chuí x Oro; Oro x SCS BRS Tio Taka; SCS BRS TIO Taka x LTB 06012. Seeds were conducted until the F4 generation, when they were used in these experiments. The families of each crossing were sown in the design of lines with intercalated parents in two blocks. In each plot 10 plants were marked for the collection of morphological data and later evaluations of yield components in the laboratory. Each labeled plant gave rise to seeds F5, that of the crossing Oro x SCS BRS Tio Taka gave rise to the 170 lines evaluated in the laboratory as a function of cold stress during germination. The experiment to evaluate the cold stress reaction of the lineages was set up in a Federer augmented block design. Two BOD chambers were used, one with a temperature of 25°C and duration of 7 days and another at 13°C with duration of 28 days. the length of aerial part, root and coleoptile, as well as germinated seed counts were evaluated at 14 and 21 days for cold treatment. The estimation of variance components obtained from the field data resulted in obtaining genetic parameters and components of variance between and within populations with different levels of heritability for the characters studied in each population, being the selection based on the family that will be the most successful in the selection. The evaluation of different groups of characters enabled the study of canonical correlations, where it was possible to detect the dependence between the group of morpho-agronomic variables and grain yield parameters in all the evaluated crosses. With the evaluation of the lineages in response to cold stress, it was possible to detect a significant effect among the studied lineages for almost all the variables analyzed in the control treatment and in the treatment under cold stress. For the cross between the cultivars Oro and SCS BRS Tio Taka it was possible to conclude that: family-based selection will result in greater success in improving agronomic traits; the correlations revealed that the selection based on the increase of the panicle length and the reduction of the days for the flowering, results in an increase of the total mass of grains; for the reaction to cold stress during germination, a total of 104 lines were potentially tolerant, 13 of which were superior to the tolerant cultivar (Oro) in the evaluation of coleoptile length reduction.

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