Orientador: Julio Antonio Lombardi / Banca: Milton Groppo Junior / Banca: Reinaldo Monteiro / Resumo: (Flora Vascular não-arbórea do Parque Estadual de Porto Ferreira, SP, Brasil). O Parque Estadual de Porto Ferreira (PEPF) localiza-se no município de Porto Ferreira, na região nordeste do Estado de São Paulo, entre as coordenadas geográficas 21º49'S e 47º25'W e em altitudes que variam de 540 a 608 metros. Trata-se de um fragmento de 611,55 hectares formado por Floresta Estacional Semidecídua e Cerradão. O objetivo central do estudo (tratado no capítulo um) foi realizar o levantamento da flora vascular não-arbórea (arbustivoherbácea, incluindo também trepadeiras, epífitas e pteridófitas), muitas vezes não inventariada em estudos fitossociológicos, como os já realizados na área. O levantamento florístico foi realizado de Março de 2010 à Setembro de 2011 por meio de coletas de exemplares ao longo de trilhas estabelecidas na área de estudo. A flora não arbórea amostrada do PEPF é constituída por 241 espécies distribuídas em 57 famílias. As famílias mais representativas, quanto ao número de espécies, são respectivamente: Asteraceae (24), Poaceae (19), Rubiaceae (16), Bignoniaceae (12), Malpighiaceae e Piperaceae (11), Fabaceae (10), Sapindaceae (9), Cyperaceae (8), Malvaceae e Orchidaceae (7), Polypodiaceae, Commelinaceae e Solanaceae (6). Concluímos que a contribuição da flora não arbórea para o PEPF é significativa, uma vez que corresponde a quase 50% da flora total. É importante destacar que seis espécies desse levantamento constam na lista de espécies vegetais ameaçadas do estado de São Paulo: Cissampelos pareira, Galianthe vaginata, Lepismium warmingianum, Psychotria capitata, Psychotria tenuifolia e Streptochaeta spicata. O resultado do estudo de similaridade florística entre cada uma das oito áreas analisadas e o presente estudo não foi significativo. O capítulo dois trata da hipótese... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: (Non-arboreal Vascular Flora of the Parque Estadual de Porto Ferreira, São Paulo, Brazil). The Parque Estadual de Porto Ferreira (PEPF) is located in the town of Porto Ferreira, in the northeast of São Paulo, between the geographical coordinates 21º 49' S and 47º 25' W and at altitudes ranging from 540 to 608 meters. It is a fragment of 611.55 hectares formed by semideciduous forest and cerradão. The central objective of the study was to conduct a floristic survey of non-arboreal vascular flora (including climbers, epiphytes and ferns), not sampled in most phytosociological studies, the results are in chapter one. The survey was conducted from March 2010 to September 2011 by collecting samples along paths established in the study area. The non-arboreal flora recorded in PEPF includes 241 species distributed in 57 families. The most representative families, on the number of species, are, respectively, Asteraceae (24), Poaceae (19), Rubiaceae (16), Bignoniaceae (12), Malpighiaceae and Piperaceae (11), Fabaceae (10), Sapindaceae (9), Cyperaceae (8), Malvaceae and Orchidaceae (7), Polypodiaceae, Commelinaceae, and Solanaceae (6). We conclude that the contribution of non-arboreal species for PEPF floristics is significant, once it corresponds to almost 50% of the total known flora. Six species of this survey are listed as endangered plant species in the state of São Paulo: Cissampelos pareira, Galianthe vaginata, Lepismium warmingianum, Psychotria capitata, Psychotria tenuifolia and Streptochaeta spicata. Lists from eight areas sampled in other studies and the present results were compareted for floristic similarity, but the results shown no significance. The chapter two deals with the hypothesis of a gradient of herbaceous species along area of cerradão and semideciduous forest, as there is for the trees, it also describes the floristic and structure... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Lin Chau Ming / Coorientador: Márcia Ortiz Mayo Marques / Banca: Dirceu Maximino Fernandes / Banca: Carmem Silva Fernandes Boaro / Banca: Glyn Mara Figueira / Banca: Ernane Roine Martins / Resumo: O estudo foi realizado com a espécie Phyllanthus amarus Schumach. & Thonning. (Euphorbiaceae) também conhecido por "quebra-pedra". Evidências científicas demonstram sua ação terapêutica contra a hepatite B, Aids e cálculos renais dentre outras. Atualmente a matéria, planta seca, é obtida via extrativismo com qualidade farmacológica e sanitária incerta. A ação contra cálculos renais é atribuída aos metabólitos presente no extrato aquoso das folhas, já a atividade antiviral é atribuída por alguns pela ação do complexo de substâncias presentes. As lignanas, especialmente a filantina e hipofilantina, são utilizadas como marcador de qualidade química da planta para este fim. A biossíntese das lignanas ocorre pela rota metabólica do ácido chiquímico envolvendo a felalanina, a enzima fenilalanina amônioliase e por fim o acido cinâmico. A rota metabólica do acido chiquimico bem como a atividade da fenilalanina amônioliase é dependente de fatores ecofisiológicos, do metabolismo do nitrogênio e de estresses ambientais. A densidade de plantio e idade de colheita afeta o microclima do dossel, a arquitetura, o ponto de competição por recursos, a produtividade de biomassa e, possivelmente, a qualidade química da planta. Portanto, o objetivo deste trabalho é determinar a densidade ideal de cultivo e a idade de colheita do Phyllanthus amarus Schumach. & Thonn. genótipo CPQBA/UNICAMP 14, primando pela máxima qualidade química e produtividade. O experimento foi em blocos ao acaso sob esquema fatorial 4 x 6 sendo 4 espaçamentos entre plantas (0,05; 0,10; 0,20; 0,30 m x 0,5m entre linha) por 6 idades de colheita (30; 45; 60; 75; 90 e 105 dias após transplantio (DAT) com cinco repetições. O P. amarus apresentou dois ciclos fenológicos completos no período de 105 dias. O primeiro ciclo... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The present study was accomplished with the species Phyllanthus amarus Schumach. & Thonn. (Euphorbiaceae) also known by " stone-breaker ". Scientific evidences demonstrate its therapeutic action against hepatitis B, SIDA and renal stones among others. Now the plant is obtained through extractivism and its pharmacology and sanitary quality is uncertain. The action against renal stones is attributed to the presence of chemical compound in the aqueous extract of the leaves'. The antiviral activity is already attributed to the action of the compound. The lignans, especially phyllanthin and hypophyllanthin has been used as marker of chemical quality of the plant for this aim. The biosynthesis of the lignans occurs in shikimic acid metabolic route starting with the participation of the, phenylalanine, phenilalanine ammonium liase and cinamic acid. The shikimic acid metabolic route and phenil alanine ammonium liase is highly dependent on ecophysiology factors, the metabolism of the nitrogen and of environmental stresses. The planting density and crop age have influence on architecture, the competition for resources and the biomass productivity, and possibly, the chemical quality of the plant. Therefore, the objective of this work is to determine the ideal density of cultivation and the age of crop of the Phyllanthus amarus Schumach. & Thonn. genotype CPQBA/UNICAMP 14, aiming to best chemical quality and productivity. The experiment was carried out in blocks to the under factorial design 4 x 6 being 4 spaces among plants (0,05; 0,10; 0,20; 0,30 m x 0,5m among lines) for 6 crop ages (30; 45; 60; 75; 90 and 105 days after planting (DAT)) with five repetitions. The species presented in the period of 105 days, two cycles, vegetative and reproductive, where the interval between 70 and 90 days... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Regina Maria Monteiro de Castilho / Coorientador: Pedro Cesar dos Santos / Banca: Marco Eustaquio de Sa / Banca: Marcelo Vieira Ferraz / Resumo: O mercado nacional de flores e plantas ornamentais se encontra em plena expansão, principalmente o de mudas. Com o intuito de auxiliar os viveiristas quanto à produção de mudas, faz-se necessário buscar por estratégias que viabilizem a produção das mesmas. EXPERIMENTO I: O objetivo desse trabalho foi avaliar o efeito de tratamentos pré- germinativos e de diferentes substratos na germinação dos diásporos e no crescimento da parte aérea de plântulas de Dypsis decaryi. O experimento foi realizado na Universidade Estadual Paulista - UNESP, Campus de Ilha Solteira, conduzido em casa de vegetação (Pad & Fan, temp. 25oC ±3) no período de abril a setembro de 2011; delineamento foi o inteiramente casualizado em esquema fatorial 4 x 3, sendo 1 testemunha e 3 tratamentos pré-germinativos (escarificação mecânica; escarificação mecânica + submersão em água por 24h; submersão em água por 24h) e 3 substratos (areia, substrato comercial e vermiculita). Cada tratamento compôs-se de 100 diásporos, sendo que cada 10 destes constituiu uma repetição, assim, os mesmos foram postos a germinar em vasos de plástico preto (1,3L) preenchidos com os substratos correspondentes. Avaliou-se: % de germinação, índice de velocidade de germinação (IVG), tempo médio de germinação (TMG) e altura de parte aérea da plântula. A não escarificação das sementes, escarificação mecânica e escarificação mecânica + submersão em água por 24 h podem ser utilizadas para a germinação das sementes de D. decaryi. Maiores porcentagens de germinação foram obtidas quando se utilizou a vermiculita. O maior IVG, assim como o menor TMG, foram obtidos com a utilização de vermiculita aliado à escarificação mecânica + submersão em água por 24 h. O substrato Bioplant® proporcionou o maior incremento em altura... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The domestic market for flowers and ornamental plants is booming, especially seedlings. In order to assist the nursery on the seedling production, it is necessary to seek strategies that enable the production of the same. EXPERIMENT I: The objective of this study was to evaluate the effect of pre-germination treatments and different substrates on the germination of the seeds and shoot growth of seedlings of Dypsis decaryi. The experiment was conducted at the Universidade Estadual Paulista - UNESP, Ilha Solteira, conducted in a greenhouse (Pad & Fan, temp. 25 o C ± 3) in the period April to September 2011; design was completely randomized in a factorial 4 x 3, with 1 control and 3 pre-germination treatments (mechanical scarification; chiseling + submersion in water for 24 hours, submersion in water for 24 hours) and 3 substrates (sand, vermiculite and commercial substrate). Each treatment consisted of 100 diaspore, and 10 of these was a repetition, so they were made to germinate in black plastic pots (1.3 L) filled with the corresponding substrates. We evaluated: % germination, germination speed index (GSI), mean germination time (MGT) and height of the seedling shoot. Failure of seed scarification, chiseling and chiseling + submersion in water for 24 h can be used for seed germination of D. decaryi. Higher germination percentages were obtained when using the vermiculite. The largest IVG, as well as lower TMG were obtained with the use of vermiculite together with chiseling + submersion in water for 24 h. The substrate Bioplant ® provided the greatest height of the seedling shoot, but it was not affected by pre-germination treatments. EXPERIMENT II: The objective was to determine the most suitable substrate for the initial development of seedlings of D. decaryi. The seedlings resulting from the first experiment... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Dagoberto Martins / Coorientador: Dirceu Maximino Fernandes / Banca: Eduardo A. Lemus Erasmo / Banca: Pedro Luis da Costa A. Alves / Resumo: O presente trabalho objetivou verificar o efeito de diferentes níveis de macronutrientes na extração destes elementos, no teor contido na massa seca, bem como no crescimento de Heteranthera reniformis. O experimento foi conduzido em casa-devegetação no Núcleo de Pesquisas Avançadas em Matologia (NUPAM), pertencente ao Departamento de Produção Vegetal da FCA/UNESP, Campus de Botucatu-SP. O estudo foi realizado em duas etapas: a primeira consistiu de um ensaio com cinco diluições correspondentes a 20, 40, 60, 80 e 100% da solução completa de Sarruge (1975), além de uma testemunha constituída por água destilada por 32 dias, com o intuito de selecionar uma solução base (diluição a 80%) que condicionasse o melhor desenvolvimento da planta sendo utilizada para a aplicação dos níveis de nutrientes para a etapa seguinte do estudo. O delineamento experimental utilizado foi o inteiramente ao acaso com duas testemunhas (solução base e água destilada) e quatro níveis (0, 25, 50, 75% da solução base) avaliados individualmente em N, P, K, Ca, Mg e S, com quatro repetições, conduzido no período de 35 dias. As avaliações foram constituídas pela massa seca (folha, caule, raiz e total), medidas biométricas na raiz (volume, comprimento e diâmetros), área foliar, número de folhas, teores dos nutrientes e quantidade de extração dos respectivos nutrientes (caule, raiz e total)... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: This research aimed to study the effect of different macronutrients levels, its extraction and amounts in dry biomass, as well as to verify its influence over Heteranthera reniformis growing. The trial was carried out inside green-house at Núcleo de Pesquisas Avançadas em Matologia (NUPAM) of Plant Production Department of FCA/UNESP, Campus of Botucatu-SP. The study was realized at two steps: the first one consisted of five dilutions correspondent at 20, 40, 60, 80 and 100% of complete Hoagland solution adjusted for Sarruge (1975). Distil water was used to select a complete check (dilution at 80%), and as a basic solution just to apply the nutrients levels for the second step. It was used the Complete Random Blocks as experimental design, with two treatments control (basic solution and distil water) 4 replications and four levels (0, 25, 50, 75 of the nutrient solution selected) and two evaluated alone in N, P, K, Ca, Mg and S during 35 days period. The characteristics evaluated were dry biomass (leaf, stem, root and total), root biometric dimensions (volume, length an diameters), foliar area, number of leaves, macronutrients grades (leaf, stem and root) and extraction quantity of respective nutrients. The limiting factors of H. reniformis growing were the omissions of N, P and Mg. The most favorable conditions for plant development occurred at solutions of 75% of P an 50% of N, K, Mg and S, that provided the biggest foliar area results (465.5; 512.6; 524.3 and 516.2 cm2, respectively) and leaves numbers (46; 75; 42; 69 and 53 leaves, respectively). The majors total dry biomass and stem dry biomass (3.77 and 2.81 g, respectively) were obtained with addition of 50% of N, while the biggest leaves dry biomass (1,27 g) occurred at 50% of Mg. The stem dry biomass showed the highest plant proportion, that varied between 49.9 and 74.6% related to the total plants components... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Made available in DSpace on 2013-08-07T19:12:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000411902-Texto+Completo-0.pdf: 1844382 bytes, checksum: 931e1914fb940d53059306226fa0e0ea (MD5) Previous issue date: 2009 / Brassica napus L. is considered self-fertile, although, studies indicate that the foraging from Apis mellifera L. increase its productivity. Considering the importance of the culture in Rio Grande do Sul, it was evaluated the pollinator potential of A. mellifera L. in B. napus flowers according to the anthesis phenophases and the increase in production through the pollination induction. The phases of anthesis were characterized and related to the stigma receptivity and the pollen grains viability. In parallel, the behavior of bees on flowers was followed considering the touched structures, the resources colleted, the number of flowers visited by plant, the time of permanence on flowers and the floral fidelity. The frequency of insects visits to the flowers was registered and related to the development of the culture. From the pollination tests (autogamy; insects visits: handly pollination among flowers from the same plant: handly pollination among flowers from distinct plants) it was compared the productivity of siliquas and seeds. Including the visitors insects registered the Hymenoptera (92,35%) stood out among the most frequent insects, from which 99,83% were A. mellifera. During foraging the bees touched anthers and stigmas, visited among 1-7 flowers/plant, remained on the flowers for 1-43 seconds and carried only B. napus pollen grains. The period with potential of pollination by A. mellifera happened during the second and third phases of anthesis and the relation among the frequency of these bees and the flowering progress was significantly positive. The productivity of seeds/plant increased from 28,36% to 55,12% with pollination induction. Bees foraging increased the productivity of B. napus and this production could still be increased with the rise and management of bees in the culture during the flowering period. / Brassica napus L. é considerada autofértil, entretanto, estudos indicam que o forrageio de Apis mellifera L. eleva sua produtividade. Considerando-se a crescente importância da cultura no Rio Grande do Sul, avaliou-se o potencial polinizador de A. mellifera L. em flores de B. napus de acordo com as fenofases da antese e o incremento na produção através da indução de polinização. Os estágios da antese foram caracterizados e relacionados à receptividade do estigma e à viabilidade dos grãos de pólen. Paralelamente, o comportamento das abelhas nas flores foi acompanhado considerando-se as estruturas tocadas, os recursos coletados, o número de flores visitadas por planta, o tempo de permanência nas flores e a fidelidade floral. A freqüência de visitas de insetos às flores foi registrada e relacionada ao desenvolvimento da cultura. A partir de testes de polinização (autogamia; visitação de insetos; polinização manual entre flores da mesma planta; polinização manual entre flores de plantas distintas) comparou-se a produtividade de síliquas e sementes. Dentre os insetos antófilos registrados Os Hymenoptera (92,35%) destacaram-se entre os insetos mais freqüentes, dos quais 99,83% eram A. mellifera. Durante o forrageio as abelhas tocaram anteras e estigmas, visitaram entre 1-7 flores/ planta, permaneceram nas flores de 1-43 segundos e carregaram exclusivamente grãos de pólen de B. napus. O período com potencial de polinização por A. mellifera ocorreu durante o segundo e terceiro estágios da antese e a relação entre a freqüência dessas abelhas e o curso da floração foi significativamente positiva.A produtividade de sementes/planta elevou-se de 23,63% para 61,87% com indução de polinização. O forrageio das abelhas elevou a produtividade de B. napus e essa produção ainda poderia ser aumentada com o adensamento e manejo dirigido de abelhas na cultura durante o período de floração.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:41Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-08-24Bitstream added on 2014-06-13T19:59:34Z : No. of bitstreams: 1 dias_jac_me_ilha.pdf: 430189 bytes, checksum: 26c6b78e26276b7502067db3fe784c82 (MD5) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / O mercado nacional de flores e plantas ornamentais se encontra em plena expansão, principalmente o de mudas. Com o intuito de auxiliar os viveiristas quanto à produção de mudas, faz-se necessário buscar por estratégias que viabilizem a produção das mesmas. EXPERIMENTO I: O objetivo desse trabalho foi avaliar o efeito de tratamentos pré- germinativos e de diferentes substratos na germinação dos diásporos e no crescimento da parte aérea de plântulas de Dypsis decaryi. O experimento foi realizado na Universidade Estadual Paulista - UNESP, Campus de Ilha Solteira, conduzido em casa de vegetação (Pad & Fan, temp. 25oC ±3) no período de abril a setembro de 2011; delineamento foi o inteiramente casualizado em esquema fatorial 4 x 3, sendo 1 testemunha e 3 tratamentos pré-germinativos (escarificação mecânica; escarificação mecânica + submersão em água por 24h; submersão em água por 24h) e 3 substratos (areia, substrato comercial e vermiculita). Cada tratamento compôs-se de 100 diásporos, sendo que cada 10 destes constituiu uma repetição, assim, os mesmos foram postos a germinar em vasos de plástico preto (1,3L) preenchidos com os substratos correspondentes. Avaliou-se: % de germinação, índice de velocidade de germinação (IVG), tempo médio de germinação (TMG) e altura de parte aérea da plântula. A não escarificação das sementes, escarificação mecânica e escarificação mecânica + submersão em água por 24 h podem ser utilizadas para a germinação das sementes de D. decaryi. Maiores porcentagens de germinação foram obtidas quando se utilizou a vermiculita. O maior IVG, assim como o menor TMG, foram obtidos com a utilização de vermiculita aliado à escarificação mecânica + submersão em água por 24 h. O substrato Bioplant® proporcionou o maior incremento em altura... / The domestic market for flowers and ornamental plants is booming, especially seedlings. In order to assist the nursery on the seedling production, it is necessary to seek strategies that enable the production of the same. EXPERIMENT I: The objective of this study was to evaluate the effect of pre-germination treatments and different substrates on the germination of the seeds and shoot growth of seedlings of Dypsis decaryi. The experiment was conducted at the Universidade Estadual Paulista - UNESP, Ilha Solteira, conducted in a greenhouse (Pad & Fan, temp. 25 o C ± 3) in the period April to September 2011; design was completely randomized in a factorial 4 x 3, with 1 control and 3 pre-germination treatments (mechanical scarification; chiseling + submersion in water for 24 hours, submersion in water for 24 hours) and 3 substrates (sand, vermiculite and commercial substrate). Each treatment consisted of 100 diaspore, and 10 of these was a repetition, so they were made to germinate in black plastic pots (1.3 L) filled with the corresponding substrates. We evaluated: % germination, germination speed index (GSI), mean germination time (MGT) and height of the seedling shoot. Failure of seed scarification, chiseling and chiseling + submersion in water for 24 h can be used for seed germination of D. decaryi. Higher germination percentages were obtained when using the vermiculite. The largest IVG, as well as lower TMG were obtained with the use of vermiculite together with chiseling + submersion in water for 24 h. The substrate Bioplant ® provided the greatest height of the seedling shoot, but it was not affected by pre-germination treatments. EXPERIMENT II: The objective was to determine the most suitable substrate for the initial development of seedlings of D. decaryi. The seedlings resulting from the first experiment... (Complete abstract click electronic access below)

Marismas são ecossistemas entremarés altamente produtivos que suportam grandes variações de salinidade e são cobertos por vegetação herbácea adaptada que abriga diversos microrganismos. Os objetivos do presente trabalho foram isolar e avaliar a diversidade e o potencial biotecnológico de leveduras associadas ao filoplano de macrófitas aquáticas de uma marisma da Ilha da Pólvora – RS. Foram realizadas cinco coletas de hastes e folhas de três espécies de macrófitas Scirpus maritimus, Spartina alterniflora e Spatirna densiflora entre junho de 2012 e janeiro de 2013. As amostras foram colocadas em solução de Tween 20 a 0,5% e incubadas a 200 rpm por 30 minutos. Em seguida foram realizadas diluições decimais seriadas (10-1, 10-2 e 10-3) e um volume de 0,1mL foi inoculado em ágar malte levedura acidificado ao pH 4.0 e suplementado com 0.04% de cloranfenicol e 0.01% de bifenila. As placas foram incubadas por 7 dias a 20 – 25 oC e as colônias isoladas e purificadas em meio Glucose Yeast Peptone. Isolados de leveduras e fungos leveduriformes foram agrupados de acordo com a morfologia de colônia e testados quanto a afinidade ascomicética ou basidiomicética em meio uréia/DBB. O potencial biotecnológico dos isolados foi avaliado por meio de testes enzimáticos para a produção das enzimas de interesse industrial amilase, esterase, caseinase, celulase, gelatinase e lipase. As leveduras que obtiveram maior produção também foram testadas quanto à capacidade de degradar o corante azóico Acid Red 357. Foram obtidos 102 isolados, 37 leveduras de afinidade basidiomicética, 27 leveduras de afinidade ascomicética e 38 fungos leveduriformes. Cinco linhagens tiveram as regiões D1/D2 e/ou região ITS do DNA sequenciadas, sendo duas delas pertencentes à espécie Hortaea werneckii, de importância clínica. Dos 102 isolados, todos produziram lipase, 63,7% esterase, 50% gelatinase, 47% amilase, 45% caseinase e 45% celulase. As linhagens testadas no meio com o corante azóico obtiveram crescimento muito rápido e foram capazes de clarear a cor do meio, porém devem ser futuramente testadas em outras concentrações de corante para uma melhor visualização do resultado. Os resultados do trabalho demonstram o grande potencial biotecnológico de leveduras e fungos leveduriformes associados ao filoplano de plantas de marismas e, portanto, sua capacidade de contribuir para o avanço da biotecnologia. / Salt marshes are highly productive intertidal ecosystems that support large variations in salinity and are covered by herbaceous vegetation that home many microorganisms. The objectives of this study were to isolate and evaluate the diversity and the biotechnological potential of yeasts associated with phylloplane of aquatic weeds in a salt marsh on the island of Pólvora - RS. Five surveys were carried, between June 2012 and January 2013, and stems and leaves of three species of macrophytes, Scirpus maritimus, Spartina alterniflora and Spartina densiflora, were collected. The samples were placed in 0.5% Tween 20 solution and incubated at 200 rpm for 30 minutes. Decimal serial dilutions (10-1, 10-2 and 10-3) were performed, and a volume of 0.1 mL was inoculated onto YM acidified to pH 4.0 and supplemented with 0.04% chloramphenicol and 0.01% biphenyl. Plates were incubated for 7 days at 20 - 25 ° C, and colonies were isolated and purified in GYP medium. Isolates of yeasts and yeast-like fungi were grouped according to colony morphology, and tested for ascomycetous or basidiomycetous affinity in urease / DBB medium. The biotechnological potential of the isolates was assessed by enzymatic assays for the production of enzymes of industrial interest amylase, esterase, caseinase, cellulase, lipase and gelatinase. Yeasts with the greatest production were also tested for their ability to degrade azo dye Acid Red 357. 102 yeast isolates were obtained, 37 with basidiomycetous affinity, 27 with ascomycetic affinity and 38 yeast-like fungi. Five strains had the D1 / D2 regions and / or the ITS region of rDNA sequenced, two of which is Hortaea werneckii, a species of clinical importance. Of the 102 isolates, all produced lipase, 63.7% esterase, 50% gelatinase, 47% amylase, 45% caseinase and 45% cellulase. The strains tested in the medium with the azo dye grew very rapidly, and were able to lighten the color of the medium, but they must be further tested in other dye concentrations for a better evaluation of the result. Our results demonstrate the great biotechnological potential of yeasts and yeast-like fungi associated with the phylloplane of macrophytes, and therefore their ability to contribute to the advancement of biotechnology.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular, 2014. / Submitted by Jaqueline Ferreira de Souza (jaquefs.braz@gmail.com) on 2014-05-27T13:14:11Z No. of bitstreams: 1 2014_RayaneNunesLima_Parcial.pdf: 885295 bytes, checksum: 3a9506e71c4557a00fffa96f5fd2010f (MD5) / Approved for entry into archive by Patrícia Nunes da Silva(patricia@bce.unb.br) on 2014-06-05T13:45:39Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_RayaneNunesLima_Parcial.pdf: 885295 bytes, checksum: 3a9506e71c4557a00fffa96f5fd2010f (MD5) / Made available in DSpace on 2014-06-05T13:45:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_RayaneNunesLima_Parcial.pdf: 885295 bytes, checksum: 3a9506e71c4557a00fffa96f5fd2010f (MD5) / Groundnut ringspot virus (GRSV) pertence ao gênero Tospovirus, o único da família de arbovírus Bunyaviridae capaz de infectar vegetais, sendo transmitido por tripes (Thysanoptera: Thripidae) de maneira circulativa propagativa. O genoma dos tospovírus é constituído por três segmentos de RNA fita simples denominados RNA S (Small), RNA M (Medium) e RNA L (Large). O RNA L codifica uma RNA polimerase dependente de RNA (RdRp); o RNA S codifica a proteína do nucleocapsídeo (N) e a proteína supressora do silenciamento gênico (NSs); e o RNA M codifica a proteína precursora das glicoproteínas Gn e Gc e a NSm, proteína de movimento viral célula-a-célula. As interações proteicas entre N e NSm são importantes para a disseminação da infecção viral na planta. Para a movimentação viral em plantas infectadas é necessária a oligomerização da proteína NSm, que forma túbulos que penetram os plasmodesmas celulares e promovem a passagem dos ribonucleocapsídeos virais de uma célula a outra. Os ribonucleocapsídeos são formados pela RNA polimerase viral (RdRp) e pelos segmentos de RNA (S, M e L) envolvidos pela nucleoproteína (N), que se oligomeriza para encapsidar todo o RNA viral. O presente trabalho investigou, pela primeira vez, as interações entre a proteína N e NSm de GRSV através da técnica de Fluorescência Bimolecular Complementar, bem como evidenciou a localização subcelular citoplasmática de cada interação. Um modelo tridimensional para a proteína N de GRSV foi construído in silico, por modelagem estrutural por homologia molecular, a partir das estruturas secundária e terciária da proteína N de LACV (La Crosse virus; Orthobunyavirus), e os domínios funcionais para a interação N x N e interação N x RNA foram definidos. A proteína N de GRSV apresenta um braço N-terminal (aa 1-32), um braço C-terminal (aa 224-258) e uma região globular com uma cavidade contendo resíduos de aminoácidos hidrofóbicos e positivos para a interação com o RNA. O alinhamento de sequências de aminoácidos da proteína N de todos os Tospovírus já caracterizados mostrou que os resíduos de aminoácidos preditos como chave para a conformação e interação da proteína N são conservados entre as espécies. Juntas, essas evidências abrem caminho para novos estudos acerca das interações proteicas a fim de elucidar o movimento célula-a-célula do GRSV e de outros Tospovírus. / Groundnut ringspot virus (GRSV) belongs to the genus Tospovirus, the only plant-infecting genus of the family Bunyaviridae, being transmitted by thrips (Thysanoptera: Thripidae) in a circulative propagative manner. The genome of tospoviruses consists of three single stranded RNA segments, termed S RNA (small) M RNA (Medium) and L RNA (Large). The L RNA encodes an RNA dependent RNA polymerase (RdRp). The S RNA encodes the nucleocapsid protein (N) and a gene silencing suppressor protein (NSs). The M RNA encodes the precursor protein of the Gn and Gc glycoproteins and the NSm protein, a viral cell-to-cell movement protein. Protein interactions between N and NSm are important to the viral infection spread in the plant. The NSm oligomerizes to form tubules that penetrate through plasmodesmata allowing the passage of viral ribonucleocapsids promoting cell-to-cell viral movement. The ribonucleocapsids are formed by the viral RNA polymerase (RdRp) and the RNA segments (S, M and L) surrounded by the nucleoprotein (N), which oligomerizes to encapsidate the viral RNA. This study investigated for the first time, homotypic and heterotypic interactions between N and NSm of the GRSV by Bimolecular Fluorescence Complementation (BiFC) in planta and showed the cytoplasmic subcellular localization of each interaction. A three-dimensional model for N GRSV protein was constructed in silico, by molecular homology modeling, from secondary and tertiary protein structures of N LACV (La Crosse virus; Orthobunyavirus) and the functional domains for N x N interaction and N x RNA interaction were defined. N GRSV protein presents an N-terminal arm (aa 1-32), a C- terminal arm (aa 224-258) and a globular region with a groove containing hydrophobic and positive amino acid residues for interaction with RNA. The alignment of amino acid sequences of the N protein of all characterized tospoviruses has shown that the amino acid residues important to protein fold and interaction of the N protein are conserved among all species. Together, this evidence allows further studies about the protein interactions involved to the cell-to-cell movement for GRSV and for other tospoviruses.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, 2013 / Submitted by Cristiane Mendes (mcristianem@gmail.com) on 2014-11-20T15:57:11Z No. of bitstreams: 1 2013_AdrianaRibeiroSilvaBatista.pdf: 1047867 bytes, checksum: 12e3ae6bf0f048123f1ab86e90f87883 (MD5) / Approved for entry into archive by Patrícia Nunes da Silva(patricia@bce.unb.br) on 2014-11-25T11:23:21Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_AdrianaRibeiroSilvaBatista.pdf: 1047867 bytes, checksum: 12e3ae6bf0f048123f1ab86e90f87883 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-11-25T11:23:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_AdrianaRibeiroSilvaBatista.pdf: 1047867 bytes, checksum: 12e3ae6bf0f048123f1ab86e90f87883 (MD5) / Pepper ringspot virus (PepRSV) é um tobravírus, até o momento, detectado somente no Brasil, que destaca-se dentro do gênero por apresentar curiosa associação entre as partículas virais e mitocôndrias do hospedeiro. Os poucos avanços descritos desde a década de 60 aos dias atuais não foram suficientes para demonstrar o mecanismo físico-químico que explica essa relação. Na tentativa de ampliar o campo de estudo em PepRSV, buscou-se contruir um cDNA infeccioso visando o desenvolvimento de uma ferramenta capaz de expressar proteínas heterólogas ou induzir o silenciamento gênico: “virus induced gene silencing” (VIGS). Essa tecnologia visa a mesma aplicabilidade do cDNA infeccioso de Tobacco rattle virus (TRV), que já apresentou resultados significativos na indução de VIGS, contudo não pode ser utilizado livremente no Brasil, pois esse vírus é conhecido como praga quarentenária no País. Por essa razão, o uso de TRV em território brasileiro é restrito, principalmente pela dificuldade na obtenção de uma autorização de uso. O PepRSV apresenta genoma bipartido de RNA fita simples. Durante a obtenção do clone desse vírus a ser utilizado como ferramenta molecular, os dois segmentos completos do RNA genômico foram clonados em vetores plasmidiais comerciais (pGEM-T Easy; pCR4) e modificados, em seguida, com a adição do promotor 35S de Cauliflower mosaic virus (CaMV) na extremidade 5' e uma sequência de ribozima na região 3' do genoma de cada segmento. Além da construção dessa ferramenta, propõe-se avaliar a variabilidade do RNA2 de PepRSV, estudos que, atualmente, está restrito a um único isolado. Dois isolados de PepRSV (Pivo4 e Lavrinha) obtidos em campos de tomateiro no município de Luziânia do Estado de Goiás foram utilizados nesse estudo. O RNA2, segmento genômico destes isolados foi sequenciado. A análise filogenética baseada na comparação de sequências de aminoácidos (aa) da capa proteica dos três isolados (Pivo4, Lavrinha e CAM) de PepRSV não separou Pivo4 e Lavrinha do isolado CAM, pois a inferência do algoritmo correspondente bootstrap foi irrelevante. Os isolados obtidos foram semelhantes ao isolado CAM e apresentaram ORF para capa proteica (CP), mas não apresentaram homólogos das ORFs 2a e 2b presentes em isolados da espécie tipo TRV que pertence ao mesmo gênero. A comparação entre os três isolados sugere a presença de uma inserção a downstream a ORF do CP nos isolados Pivo4 e Lavrinha em relação ao isolado CAM e também uma recombinação na região 3' UTR entre as moléculas de RNA2 e RNA1 dessesisolados. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / Pepper ringspot virus is a Tobravirus until now detected only in Brazil. It is a peculiar virus due to the occurrence of a curious association between viral particles and their host mitochondria. From the 60's to the present day, no studies have been able to demonstrate the physicochemical mechanism underlying this relationship. In an attempt to broaden the studies on PepRSV, it was planned to construct na infectious cDNA clone to be used as a viral vector for expression of heterologous proteins or a virus induced gene silencing (VIGS) vector. It is proposed the construction of an infectious cDNA of PepRSV with a similar applicability of the Tobacco rattle virus (TRV) vector. It is already shown that this vector is useful in the induction of VIGS. The TRV vector cannot be used in Brazil, because it is a quarantine pest. Hence the use of TRV in Brazil is extremely limited, mainly due to the difficulty of obtaining a permission to use in the Brazilian territory. The virus has a bipartite genome of single strand RNA components. During the construction development, the two complete segments of the genome of PepRSV were cloned in plasmid vectors (pGEM-T Easy; pCR4) and modified to contain a promoter 35 of Cauliflower mosaic virus in the 5' end and a ribozyme sequence in the 3' region of the genome of each segment. Additionally to this construction for infectious clones, we propose to assess the variability of the PepRSV RNA2, which was restricted to a single isolate. Two PepRSV isolates (Pivo4 and Lavrinha) obtained in tomato fields in the county of Luziânia, Goiás State. The genome segment (RNA 2) of these isolates was sequenced. Phylogenetic analysis based on the amino acid sequences of coat protein (CP) among three isolates did not separate those isolates in different ramifications due to lower bootstrap value. The isolates obtained were in agreement as CAM isolate for coat protein (CP) ORF feature, but do not showed homologous ORFs2a and 2b present in TRV isolates of the Tobravirus type species. By sequence comparison, Pivo4 and Lavrinha isolates had presentedlarge nucleotides insertion downstream of CP ORF as opposed to CAM isolate suggesting a recombination in 3'UTR between RNA1 and RNA2 of each isolate.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, Programa de Pós-Graduação em Agronomia, 2014 / Submitted by Ana Cristina Barbosa da Silva (annabds@hotmail.com) on 2014-12-05T14:26:45Z No. of bitstreams: 1 2013_ElaineVazJustino (2).pdf: 2132727 bytes, checksum: 4702b6ee4edad49b92dae9ab8a2d44f8 (MD5) / Approved for entry into archive by Patrícia Nunes da Silva(patricia@bce.unb.br) on 2014-12-08T12:07:02Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_ElaineVazJustino (2).pdf: 2132727 bytes, checksum: 4702b6ee4edad49b92dae9ab8a2d44f8 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-12-08T12:07:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_ElaineVazJustino (2).pdf: 2132727 bytes, checksum: 4702b6ee4edad49b92dae9ab8a2d44f8 (MD5) / A implantação de um campo de produção de qualquer espécie de planta propagada sexuadamente, como as pimentas do gênero Capsicum deve ser feita empregando sementes de alta qualidade. A qualidade é uma característica multifatorial representada pela soma dos atributos físicos, fisiológicos, genéticos e sanitários, através do qual as sementes expressam toda sua potencialidade em um determinado ambiente. A semente é, portanto, um insumo de grande proeminência no processo produtivo. O objetivo deste trabalho foi avaliar a qualidade fisiológica e genética das sementes de espécies de Capsicum por meio, respectivamente de estudos relacionados com a determinação da maturidade fisiológica das sementes e com a taxa de cruzamento natural. O trabalho foi conduzido nas instalações do campo experimental e laboratórios de sementes, de pós-colheita, de melhoramento genético e de análise genômica da Embrapa Hortaliças Brasília-DF. Para a determinação da maturidade fisiológica das sementes foi utilizada a cv. BRS Mari (C. baccatum var. pendulum). As sementes foram obtidas de frutos colhidos em diferentes estádios de maturação, sendo aos 20, 30, 40, 50, 60, 70 e 80 dias após a antese. Os frutos foram avaliados quanto ao teor de clorofila, teor de capsaicina, coloração e comprimento, e as sementes quanto ao teor de umidade, matéria seca, germinação, primeira contagem de germinação, emergência em casa de vegetação e envelhecimento acelerado. Para a determinação da taxa de cruzamento natural foi utilizado como genitor masculino a cultivar de pimenta (C. annuum) 'BRS Garça' e como genitor feminino o pimentão (C. annuum) 'Magali R'. O primeiro fruto maduro do genitor feminino foi colhido e as sementes extraídas, secadas e embaladas para posterior análise molecular. Destas sementes, foram produzidas mudas em casa de vegetação e as folhas jovens coletadas para extração de DNA. A análise molecular foi realizada mediante o emprego da técnica de PCR usando primers específicos para um gene (Pun-1) associado com a pungência de frutos. De acordo com os resultados, a maturidade fisiológica das sementes de pimenta cv. BRS Mari ocorreu aos 70 dias após antese, onde os frutos apresentaram a coloração vermelha. Neste estádio de desenvolvimento, a umidade das sementes foi de 39% e a germinação e emergência das plântulas de 88% e 77%, respectivamente. Notadamente, os picos mais altos da concentração de capsaicina foram observados nesta fase. O marcador específico para capsaicina mostrou-se eficiente para quantificar as taxas de cruzamento natural em condições naturais de Brasília. A taxa de cruzamento natural que ocorreu nas plantas e sementes foi de 10,8% e 1,2%, respectivamente. Estes resultados demonstram a utilidade desse marcador molecular na identificação da pureza genética das sementes bem como na manutenção, multiplicação de germoplasma e na produção de sementes comerciais de pimentas da espécie C. annuum. Além disso, nossos resultados reforçam a necessidade, nas condições brasileiras, de estabelecer sistemas de isolamento físico visando garantir a pureza (qualidade) genética de sementes de germoplasma de Capsicum. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The use of high quality seeds is an important issue to be considered in order to achieve a good stand establishment of field crops. Seed quality is a multifactor trait that represents the sum of the physical, sanitary, physiological and genetic, through which the seeds express all its potential in a given environment. The seed is thus an input of high importance in the production process. The objective of the present work was to evaluate the genetic and physiological quality of two Capsicum species in assays carried out to determine the physiological maturity of seeds as well as the rate of natural crossing. The experiments were carried out at the experimental fields and the laboratories from Embrapa Vegetables, Brasília, DF. The hot pepper „BRS Mari‟ (C. baccatum var. pendulum) was used in the assays aiming to determine the physiological seed maturity. Seeds of this cultivar were obtained from fruits harvested at different maturity stages: 20, 30, 40, 50, 60, 70 and 80 days after anthesis. Color, length, chlorophyll and, capsaicin content were determined on the fruits and seed moisture content, dry matter, germination, first count of germination, emergence under greenhouse conditions and accelerated aging were determined on the seeds. For the determination of the cross-pollination (outcrossing) rate under natural conditions, the hot pepper (C. annuum) „BRS Garça‟ as used as male parent and the bell pepper (C. annuum) „Magali R‟ as used as female parent. The first mature fruit of the female parent was harvested; the seeds were extracted, dried and packaged for subsequent analysis. Seedlings in the greenhouse were produced and the young leaves collected for DNA extraction. Molecular analysis was performed by using PCR assays with primers designed to target a gene (Pun-1) associated with fruit pungency. The physiological maturity of „BRS Mari‟ seeds occurred at 70 days after anthesis, where the fruits showed red color. At this stage, seed moisture content was 39% and the germination and seedling emergence had 88% and 77% respectively. Notably, the highest capsaicin accumulation levels were observed at this stage. The specific marker molecular for fruit pungency was effective for quantifying natural outcrossing rates under natural conditions in Brasília-DF. The rate of cross-pollination determined at plant and seed levels was 10.8% and 1.2%, respectively. These results indicated that this molecular marker may be helpful in the determining genetic purity of commercial hot pepper seed production. In addition, our results reinforce the notion that the physical isolation of the seed production fields is highly recommended under Brazilian conditions in order to preserve the genetic purity (quality) of Capsicum seeds.