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Detecção do papilomavírus humano em carcinoma espinocelular de orofaringe através da reação em cadeia da polimerase. Correlação com dados demográficos, clínico-patológicos e de sobrevida

Kawata, Leandro Toyoji [UNESP] 06 December 2007 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:06Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-12-06Bitstream added on 2014-06-13T20:03:02Z : No. of bitstreams: 1 kawata_lt_dr_araca.pdf: 1246612 bytes, checksum: 16cc6433f58bd5e31123db2601352d36 (MD5) / Os resultados da presença do papilomavírus humano (HPV) em relação ao câncer das vias aerodigestivas superiores são muito controversos. Destas vias, a orofaringe tem sido a localização com maior prevalência de HPV, o que desperta grande interesse dos pesquisadores sobre a real participação do vírus na carcinogênese desta região. Este trabalho teve como objetivo verificar a prevalência de HPV em pacientes com carcinoma espinocelular de orofaringe, através da reação em cadeia polimerase (PCR) e correlacioná-la com dados demográficos, clínico-patológicos e de sobrevida. O estudo foi realizado através da análise de 27 peças oriundas de blocos de parafina obtidos de pacientes portadores de carcinoma espinocelular de orofaringe diagnosticados e tratados no Centro de Oncologia Bucal da Faculdade de Odontologia de Araçatuba - UNESP. Foram realizadas extrações do DNA com o QIAamp DNA minikit, conforme instrução do fabricante. Após confirmar a presença e integridade do DNA, foi realizada a nPCR para detecção do HPV. Dois grupos foram formados considerando-se a presença ou ausência do HPV. Foram amplificadas 26 amostras para o gene -globina sendo que o HPV foi detectado em 50% dos casos estudados. Não houve diferença estatisticamente significativa entre os grupos em relação as variáveis clínico-patológicas e a sobrevida. / Reports on the presence of human papillomavirus (HPV) in upper aerodigestive tract are very controversial. In this tract, the oropharynx has been the site with the highest prevalence of HPV, which encourage the great interest of researchers for the real role of the virus in the carcinogenesis of this area. This study had the objective of verifying the HPV prevalence in patients with oropharyngeal squamous cell carcinoma using polymerase chain reaction (PCR) and its correlation with demographic data, clinicopathological aspects and survival. This study was accomplished by the analysis of embedded paraffin tissues of oropharyngeal squamous cell carcinoma from 27 patients diagnosed and treated in São Paulo State University, Dentistry College of Araçatuba – UNESP. DNA extraction was accomplished with QIAamp DNA minikit, according to the manufacturer´s protocol. After confirming the presence and integrity of DNA, nPCR for HPV was performed. Two groups were formed, considering patients with HPV and without HPV. -globin gene was PCR amplified in 26 samples and the HPV detected in 50% of the studied cases. There was no statistically significant difference between the groups in relation of clinicopathological variables and survival.
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Ocorrência de microrganismos oportunistas e superinfectantes em crianças com 6, 12 e 18 meses de idade e suas mães

Bianco, Karina Gerhardt [UNESP] 01 September 2009 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:33:00Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-09-01Bitstream added on 2014-06-13T21:05:38Z : No. of bitstreams: 1 bianco_kg_dr_araca.pdf: 593186 bytes, checksum: 17495f8ff3d7eb5b38f94d38fa706d98 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A primeira infância é a fase mais importante para o estabelecimento de condições de saúde, desenvolvimento da microbiota bucal e para o estabelecimento de hábitos. Desde que a grande maioria das infecções graves que acometem as crianças está associada a microrganismos superinfectantes e multirresistentes a antimicrobianos, cujo estabelecimento na cavidade bucal de bebês não é adequadamente descrito, foi objetivo do estudo, analisar a presença de um grupo desses microrganismos em crianças com seis meses de idade e suas mães, ao longo de doze meses de acompanhamento, bem como a presença de genes de resistência aos principais antimicrobianos nas amostras clínicas oriundas das mães e seus bebês. Para tanto, 68 pares de bebês e suas mães foram selecionados. Após levantamento de dieta dos bebês e das condições socioeconômicas das famílias, realizava-se a coleta de saliva e biofilme subgengival das mães e saliva das crianças, para avaliação microbiológica. Esses procedimentos foram repetidos, em todos os pares, quando os bebês completaram doze e dezoito meses de idade, acrescentando-se nessas ocasiões a coleta do biofilme dental das crianças. A detecção dos diferentes microrganismos oportunistas era realizada pela amplificação do DNA dos microrganismos alvo empregando-se as reações em cadeia da DNA polimerase (PCR). As condições de saúde da mucosa bucal e gengiva foram satisfatórias para os bebês, enquanto a maioria das mães era portadora de gengivite ou periodontite. Crianças cujas mães tinham gengivite mostraram maior freqüência desses patógenos na saliva e no biofilme. Os principais microrganismos oportunistas detectados em mães e crianças foram os membros da família Enterobacteriaceae, além de Enterococcus spp., E. faecalis, Helicobacter spp. e Helicobacter... / Early childhood is the most important phase for the establishment of health conditions, development of oral microbiota and the establishment of habits. As the vast majority of infections that affect children is associated with superinfecting microorganisms and multi-resistant ones to antibiotics, whose establishment in the oral cavity of babies is not adequately described, the objective of this study was to analyze the presence of a group of these microorganisms in children aged six months of age and their mothers over twelve months of monitoring, as well as the presence of resistance genes to key antimicrobials in clinical samples derived from mothers and their babies. For this, 68 pairs of infants and their mothers were selected. After surveying the diet of babies and families' socioeconomic conditions, it was performed the collection of the mothers’ saliva and subgingival biofilm and their children’s saliva for microbiological evaluation. These procedures were repeated in all pairs, when babies completed twelve and eighteen months of age, adding on these occasions the collection of their dental biofilm. The detection of different opportunistic microorganisms was performed by amplification of target DNA of microorganisms through the chain reactions of DNA polymerase (PCR). Health conditions of oral mucosa and gingiva were satisfactory for the babies, while most of the mothers was a carrier of gingivitis or periodontitis. Children whose mothers had gingivitis showed increased frequency of these pathogens in saliva and biofilm. The main opportunistic microorganisms detected in mothers and children were members of the family Enterobacteriaceae, and Enterococcus spp., E. faecalis, Helicobacter spp. and Helicobacter pylori. Other infectious agents such as cytomegalovirus and Epstein-Barr virus were rarely detected in these... (Complete abstract click electronic access below)
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Efeitos do controle da placa supragengival na doença periodontal crônica. Avaliação clínica, imunológica e microbiológica

Vergani, Solange Alonso [UNESP] 26 March 2005 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:33:28Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2005-03-26Bitstream added on 2014-06-13T20:45:02Z : No. of bitstreams: 1 vergani_sa_dr_arafo.pdf: 639289 bytes, checksum: 6483b0519cf455414c9e0881668e277f (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O objetivo do presente estudo foi o de avaliar os efeitos do controle de placa supragengival, em pacientes com doença periodontal crônica generalizada, por meio dos parâmetros clínicos microbiológicos e imunológicos. Foram selecionados 30 pacientes, com idade entre 32 e 59 anos, apresentando 4 bolsas entre 3 e 5mm e 4 bolsas entre 6 e 10mm e sem envolvimento sistêmico. Após o exame inicial, os pacientes foram submetidos a raspagem supragengival e receberam instruções de higiene oral, sendo acompanhados semanalmente por um período de 30 dias. Os parâmetros clínicos avaliados foram profundidade de sondagem, recessão gengival, índice de placa, índice gengival e sangramento à sondagem. Amostras de fluido crevicular das bolsas foram coletadas para análise da concentração dos mediadores de inflamação interleucina-1b e prostaglandina E2 e identificação pela reação de polimerase em cadeia dos microrganismos Porphyromonas gingivalis, Actinobacillus actinomycetemcomitans, Bacteroides forsythus, Prevotella intermedia e Prevotella nigrescens. Os resultados demonstraram a ocorrência de melhoras evidenciadas pelos parâmetros clínicos avaliados. Observou-se ainda uma redução significante no número de Porphyromonas gingivalis, Bacteroides forsythus, Prevotella intermedia e Prevotella nigrescens. O microrganismo A. actinomycetemcomitans não apresentou diferença significante. Para o exame imunológico não foram encontradas diferenças nos níveis de interleucina-1b, sendo constatado ainda um aumento nas concentrações de prostaglandina E2 nas bolsas de 6 a 10mm que apresentavam sangramento no final do tratamento. Concluiu-se que decisão da necessidade de tratamento periodontal em sítios profundos, após a realização do controle de placa supragengival, baseada somente na ausência de sangramento à sondagem pode subestimar... . / The aim of the present study was to evaluate the effect of supragingival plaque control, in patients with generalized chronic periodontal disease using clinical, microbiological and immunological parameters. 30 patients were selected, aged 32 to 59 years, presenting 4 periodontal pockets between 3 and 5mm and 4 pockets between 6 and 10mm. After initial exam patients received supragingival scaling and oral hygiene instructions, which were reinforced once a week for 30 days. Clinical parameters were probing depth, gingival resection, plaque index, gingival index and bleeding upon probing. Samples of crevicular fluid were taken for analyses of interleukin-1b and prostaglandin E2 and for identification by polymerase chain reaction of Porphyromonas gingivalis, Actinobacillus actinomycetemcomitans, Bacteroides forsythus, Prevotella intermedia and Prevotella nigrescens. The results demonstrated an improvement of the clinical parameters. The microbiological findings indicate reduction of Porphyromonas gingivalis, Bacteroides forsythus, Prevotella intermedia, and Prevotella nigrescens. A. actinomycetemcomitans did not show significant difference. In regard to the immunological exam, no differences were observed in interleukin-1b concentration. Prostaglandin E2 concentrations were elevated in pockets between 6 and 10mm with persistent bleeding upon probing after treatment. In conclusion the decision for treatment needs after supragingival plaque control only based on the absence of bleeding upon probing might underestimate the periodontal disease activity.
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Caracterização molecular de Cryptosporidium spp. em calopsitas (Nymphicus hollandicus) /

Panegossi, Mariele Fernanda da Cruz. January 2017 (has links)
Orientador: Katia Denise Saraiva Bresciani / Banca:Sandra Valéria Inácio / Banca:Jancarlo ferreira Gomes / Resumo: Cryptosporidium spp. é um protozoário que completa seu ciclo biológico na superfície de células epiteliais do trato gastrintestinal, respiratório e urinário de mamíferos, aves, répteis, anfíbios e peixes. Foi incluído na Iniciativa das Doenças Negligenciadas da Organização Mundial da Saúde (OMS) por sua estreita relação à população com baixo poder aquisitivo e precárias condições de saneamento básico. Esse gênero de parasito causa doença clínica e subclínica em Psitaciformes, com detecção de Cryptosporidium meleagridis, Cryptosporidium baileyi, Cryptosporidium galli e dos genótipos I, II, III, IV e V. A calopsita é um dos psitacídeos mais vendidos atualmente, sendo frequentemente encontrada em residências. O contato próximo com humanos é motivo de preocupação, uma vez que pode ser reservatório desse coccídio intestinal, sendo imprescindível atentar para medidas de prevenção, controle e diagnóstico dessa enfermidade parasitária. Os métodos baseados na microscopia são mais utilizados para o diagnóstico de Cryptosporidium spp., por serem menos onerosos. No entanto, apenas a caracterização molecular é capaz de identificar a espécie de Cryptosporidium spp. Em relação ao tratamento dessa enfermidade em aves, é importante ressaltar que ainda não há quimioterapia efetiva disponível. Boas condições de higiene e saneamento básico são essenciais, a fim de prevenir e controlar surtos dessa enfermidade em humanos e animais. / Abstract: Cryptosporidium spp. is protozoa that complete their biological cycle on the surface of epithelial cells of the gastrointestinal, respiratory and urinary tract of mammals, birds, reptiles, amphibians and fish. This parasite was included in the World Health Organization's Neglected Diseases Initiative because of its close relationship to the population with low purchasing power and poor basic sanitation conditions. This infection causes clinical and subclinical disease in Psitaciformes with detection of Cryptosporidium meleagridis, Cryptosporidium baileyi, Cryptosporidium galli and genotypes I, II, III, IV and V. The cockatiel is one of the best selling psittacines currently found in homes. Close contact with humans is cause for concern, since they may be reservoirs of this coccidia, being essential to watch for measures of prevention, control and diagnosis of this parasitic disease. The methods based on the microscopy are more used for the diagnosis of cryptosporidiosis, because they are less expensive. However, only molecular characterization is able to identify the species of Cryptosporidium spp. in relation to the treatment of this disease in poultry, it is important to emphasize that there is still no effective chemotherapy available. Good hygiene and basic sanitation conditions are essential, in order to prevent and control disease in animals and animals. / Mestre
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Investigação de Leishmania spp. em Didelphis spp. (Linnaeus, 1756) na cidade de Bauru-São Paulo

Santiago, Maria Emília Bodini [UNESP] 17 May 2007 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-05-17Bitstream added on 2014-06-13T19:55:42Z : No. of bitstreams: 1 santiago_meb_me_araca.pdf: 627508 bytes, checksum: 44ceb6f8db17a4d01854a3c87789a723 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / No período de março de 2005 a fevereiro de 2006, coletaram-se amostras de sangue e medula óssea de 112 gambás (Didelphis sp.) na região urbana da cidade de Bauru,estado de São Paulo, Brasil, com o objetivo de se verificar a possibilidade destes animais atuarem como reservatórios de Leishmania. Em amostras de soro foram detectados, anticorpos anti – Leishmania sp. pela técnica de ensaio imunoenzimático em fase sólida indireto (ELISA) e em medula óssea o DNA de Leishmania sp foi amplificado por meio da reação em cadeia pela polimerase (PCR) utilizando os primers 13A e 13B. Na reação de ELISA das 107 amostras analisadas 71,02% apresentaram se positivas, no PCR das 112 amostras de medula óssea analisadas 91,56% foram positivas. A evidência de fatores epidemiológicos de risco como, a presença do parasito circulante e dos vetores levam a acreditar que o gambá possa estar incluindo no ciclo da transmissão da Leishmaniose na cidade de Bauru. / Between March 2005 and February 2006, blood and Bone marrow samples were collected from 112 Opossums (Didelphis sp.) in the urban region of Bauru city - São Paulo state - Brazil . The objective was to verify the possibilities of these animals to be the reservoir of Leishmaniasis. Anti- Leishmania sp. antibodies were detected in serum by the Enzyme-Linked Immunosorbent Assay (ELISA) and DNA from Leishmania sp was detected in bone marrow through polymerase chain reaction (PCR). The 13A and 13B primers were used to perform the PCR. From 107 samples analysed with ELISA, 71,02% were positive for Leishmania sp, and positive outcome of 91,56% was observed by PCR. The evidence of epidemiologic risk factors like, the presence of a circulating parasite and of vectors leads to the conclusion that Opossums might be included in the leishmaniasis transmission cycle in Bauru city.
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Ocorrência e caracterização molecular de Cryptosporidium spp. em bezerros leiteiros da região noroeste do Estado de São Paulo

Oliveira, Fernando Paes de [UNESP] 12 July 2010 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-07-12Bitstream added on 2014-06-13T18:55:51Z : No. of bitstreams: 1 oliveira_fp_me_araca.pdf: 209460 bytes, checksum: 16f297129399701b5967432ef69fe128 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Um total de 196 amostras fecais de bezerros leiteiros mestiços, de 7 a 30 dias de idade de ambos o sexos foram colhidas em 31 propriedades com o objetivo de determinar a ocorrência de Cryptosporidium na região Noroeste do Estado de São Paulo, assim como caracterizar molecularmente as espécies envolvidas nesta parasitose. Realizou-se a análise microscópica pela técnica de coloração negativa com verde malaquita em todas as amostras de fezes. Para identificação molecular de Cryptosporidium, utilizou-se a reação de nested PCR, utilizando primers específicos para amplificação de fragmentos do gene codificador da subunidade 18S do RNA ribossômico e do gene da glicoproteína GP 60, submetendo o produto da PCR a sequenciamento e análise filogenética. Por meio de exame de fezes, foi observada positividade de 2% (4/196), por meio de microscopia, e de 10,7% (21/196) pela nested PCR. Como resultado do sequenciamento, foram identificadas quatro espécies de Cryptosporidium: C. parvum (subtipo IIa15G2R1) C. ryanae, C. bovis e C. andersoni. Esta descoberta de C. parvum subtipo IIaA15G2R1 na região estudada ilustra a utilidade da subtipagem. Embora estes resultados iniciais baseados em subtipos com GP60 sejam úteis para compreender a dinâmica de transmissão das espécies de Cryptosporidium, o número de amostras analisadas é relativamente pequeno e muito mais ainda pode ser pesquisado. É interessante notar que as informações de tipagem molecular com o gene 18S rRNA e a subtipagem com o gene GP60, permitem que os epidemiologistas possam rastrear as fontes de surtos das diferentes espécies de Cryptosporidium. / A total of 196 fecal samples from crossbred calves, 7-30 days old of both sexes were collected in 31 properties with the objective of determining the prevalence of Cryptosporidium in the northwestern region of São Paulo, as well as characterizing the molecular species involved in this parasite. We performed microscopic analysis by the technique of negative staining with malachite green in all stool samples. For molecular identification of Cryptosporidium, we used the reaction of nested PCR using specific primers for amplification of gene fragments coding for the 18S subunit ribosomal RNA gene and the glycoprotein GP 60 by subjecting the PCR product sequencing and phylogenetic analysis. By stool examination, positivity was observed 2% (4 / 196) by means of microscopy, and 10.7% (21/196) by nested PCR. As a result of sequencing, we identified four species of Cryptosporidium: C. parvum (subtype IIa15G2R1) C. Ryanair, C. bovis and C. andersoni. This discovery of C. IIaA15G2R1 parvum subtype in the studied region illustrates the usefulness of subtyping. Although based on these initial results with GP60 subtypes are useful for understanding the transmission dynamics of the species of Cryptosporidium, the number of samples is relatively small and much more can still be searched. It is interesting to note that the information of molecular typing with 18S rRNA gene and subtyping with the GP60 gene, allow epidemiologists can track sources of outbreaks of different species of Cryptosporidium.
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Detecção de reações cruzadas por Leishmania spp. e Trypanosoma spp. em cães pelo ensaio imunoenzimático indireto, pela reação de imunofluorescência indireta e reação em cadeia de polimerase

Viol, Milena Araúz [UNESP] 18 August 2011 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:18Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-08-18Bitstream added on 2014-06-13T20:16:26Z : No. of bitstreams: 1 viol_ma_me_araca.pdf: 293015 bytes, checksum: bdc10c5bc3d8d20c951f2fc3b6dc7f4e (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O objetivo deste estudo foi detectar reações cruzadas por Leishmania spp. e Trypanossoma cruzi pelo Ensaio Imunoenzimático Indireto (ELISA), pela Reação de Imunofluorescência Indireta (RIFI) e pela Reação em Cadeia da Polimerase (PCR). Assim, foram colhidas 408 amostras sanguíneas de cães domiciliados no município de Araçatuba,SP, de ambos os sexos, de diversas raças e com idade a partir de seis meses. Em relação à Leishmania spp., pela RIFI, 14,95 % (61/408) foram reagentes. A positividade por meio do ELISA, foi de 20,10% (82/408) e pela PCR, 29,66% (121/408), com diferença significativa para o sexo e a idade destes animais (p<0,05). Para Trypanosoma spp., a ocorrência de anticorpos pelo ELISA foi de 10,54% (43/408) e pela PCR, 2,45% (10/408) cães foram positivos. Pela RIFI, 10,29% (42/408) dos animais foram considerados positivos e somente o sexo apresentou diferença significativa (p<0,05). Neste trabalho, constatou-se que 10,54%(43/408) dos animais foram soropositivos por ELISA para Trypanosoma spp., sendo que 79,07%(34/43) obtiveram resultados positivos no diagnóstico molecular para Leishmania spp. e dos 10,29% (42/408) positivos por RIFI, 95,24% (40/42) dos cães confirmaram a infecção por este parasita. Por meio dos resultados obtidos, pode-se inferir que foram evidenciadas reações cruzadas nos ensaios sorológicos para ambos os protozoários, nos animais analisados neste trabalho / The aim of this study was to detect cross-infection by Leishmania spp. and Trypanosoma spp. by indirect immunosorbent assay (ELISA), by Indirect Immunofluorescence (IFA) and by the Polymerase Chain Reaction (PCR). Thus, blood samples were collected from 408 domestic dogs of both sexes, different races and ages from six months. For Leishmania spp. by IFA, 14.95% (61/408) were positive. Positive by ELISA, was 20.10% (82/408), and PCR 29.66% (121/408), with significant difference for sex and age of animals (p <0.05). For Trypanosoma spp., the occurrence of antibodies by ELISA, was 10.54% (43/408), and PCR, 2.45% (10/408) dogs were positive. By IFA, 10.29% (42/408) of the animals were considered positive and only sex was significant difference (p <0.05). In this work it was found that 10.54% (43/408) animals were seropositive by ELISA for Trypanosoma spp., 79.07% (34/43) had positive results in molecular diagnostic for Leishmania spp. and 10.29% (42/408) positive by IFA, 95.24% (40/42) dogs confirmed the infection by this parasite. Through the results obtained can be inferred that cross-infection were observed by both protozoa in animals of this paper
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Valor prognóstico e preditivo de genes candidatos selecionados após análise de oligoarrays em carcinomas mamários

Bueno, Renata Camargo [UNESP] 16 March 2012 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:56Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-03-16Bitstream added on 2014-06-13T20:36:37Z : No. of bitstreams: 1 bueno_rc_me_botfm_parcial.pdf: 184986 bytes, checksum: b4cc84cead8ca822c1ea62e1786a52da (MD5) Bitstreams deleted on 2015-03-20T11:45:13Z: bueno_rc_me_botfm_parcial.pdf,Bitstream added on 2015-03-20T11:45:48Z : No. of bitstreams: 1 000703048.pdf: 4139830 bytes, checksum: 4590a1be2f4cbb732b2d65f21b421cde (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Neste estudo foi proposto (1) validar a assinatura genética de metástase previamente identificada pelo grupo para cinco genes candidatos (POLR1B, IKBKB, TRIP10, PGM5 e ATM), identificados como centrais em redes biológicas e correlacionar os dados de expressão com os dados clínicos e histopatológicos das pacientes; (2) confirmar o valor prognóstico do gene ATM e o seu mecanismo de regulação pelo miR-203, miR-421, miR- 576-5p, miR-664, miR-26a, miR-26b e miR-18a. Foi utilizada a metodologia de RT-qPCR em 63 amostras de carcinomas mamários (CM) e 5 de tecido mamário normal. Foram observadas correlações positivas entre os níveis de expressão dos genes detectados pela técnica de microarray e RT-qPCR, embora sem significância estatística. Não foram observadas diferenças significativas na expressão destes genes nos CM quando comparados às amostras de mama normais. Nas comparações entre os níveis de expressão e as características clínicas e histopatológicas pode-se observar que os genes IKBKB, POLR1B e PGM5 apresentaram aumento significativo de expressão em tumores ER positivos. Foram observadas diminuições significativas dos transcritos de IKBKB, TRIP10, PGM5 e ATM em tumores HER2 positivos; para os genes PGM5 e ATM houve uma diminuição significativa de expressão nos tumores grau III. A análise da expressão proteica do ATM foi realizada por imunoistoquímica em 926 amostras de CM organizadas em quatro plataformas de microarranjos de tecidos. Foi verificada a diminuição da expressão da proteína ATM nos tumores quando comparados com a amostra de tecido mamário normal e sua diminuição estava associada a tumores de alto grau e metástase à distância. Pacientes com tumores ATM-negativos apresentaram diminuição do tempo de sobrevida livre de doença e de... / The present study aimed: 1) to validate the genetic signatures of metastasis previously detected by our group for five candidate genes (POLR1B, IKBKB, TRIP10, PGM5, and ATM), identified as central in biological networks, and to correlate the findings with clinical-histopathological data; 2) to confirm the prognostic value of the ATM gene and its mechanism of regulation by miR-203, miR-421, miR-576-5p, miR-664, miR-26a, miR- 26b and miR-18a. Sixty-three breast carcinomas (BC) samples and 5 normal breast tissue samples were evaluated by RT-qPCR. Positive correlations were observed between the gene expression levels detected by microarray and RT-qPCR, although not statistically significant. There was no significant difference between BC and normal samples. Overexpression of IKBKB, POLR1B, and PGM5 genes were significantly associated with ER positive tumours. Significant downexpression of IKBKB, TRIP10, PGM5 and ATM transcripts were observed in HER2-positive tumours. PGM5 and ATM downexpression were statistically associated with grade III tumours. ATM protein expression was evaluated by immunohistochemistry in 926 BC samples organized into four tissue microarray platforms. A decreased ATM protein expression was observed in tumours when compared to normal tissue as well as with high grade tumours and distant metastasis. Patients with ATM-negative tumours showed a decrease of diseasefree survival and overall survival. After multivariate analysis, ATM revealed to be an independent prognostic marker in BC and have been associated with lower risk of metastasis and death by disease (P<0.001, HR=0.535, and P<0.001, HR=0.534, respectively). A negative correlation between the transcript levels of ATM and the miR- 664 (P=0.035, r=-0.293), and miR-421 (P=0.075 e r=-0.249, respectively) was verified. The miR-26a... (Complete abstract click electronic access below)
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Morcegos como hospedeiros de Leishmania spp. em área endêmica para leishmaniose visceral

Oliveira, Fernanda Muller de [UNESP] 06 July 2012 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:09Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-07-06Bitstream added on 2014-06-13T19:49:57Z : No. of bitstreams: 1 oliveira_fm_me_araca.pdf: 788257 bytes, checksum: 350efb1f930e09b50897c9123c540f6f (MD5) / A leishmaniose visceral é uma doença em franca expansão no Brasil e que tem a participação de algumas espécies animais na manutenção de seu ciclo. Este trabalho objetivou investigar a presença de Leishmania spp. em morcegos de área endêmica para leishmaniose visceral e investigar a participação destes animais como possíveis reservatórios desta zoonose. Avaliou-se a presença de DNA dos parasitas, por meio da PCR, em amostras de baço e pele de 375 quirópteros originários de 19 cidades do Estado de São Paulo, Brasil, áreas endêmicas e com transmissão intensa para leishmaniose visceral. A amplificação de kDNA de Leishmania spp. por PCR foi positiva em 4,53% dos quirópteros, sendo que a maior positividade foi observada em amostras de baço (94,1%) e dois animais foram positivos tanto para amostras de pele como de baço; a presença de DNA do gene SSU 18S rRNA de Trypanosoma spp., também investigada, foi positiva em 4,53% das amostras sendo 23,5% positivas somente na amostra de baço, 76,5% somente na amostra de pele. Um animal apresentou positividade tanto para Leishmania spp. como para Trypanosoma spp. Os resultados indicam a ocorrência de Leishmania spp. em quirópteros da área endêmica para leishmaniose visceral, indicando a possibilidade de serem reservatórios desta zoonose / Visceral leishmaniasis is a disease with increasing incidence in Brazil and that has some animal species contributing to its maintenance. This study aimed at investigating the presence of Leishmania spp. in bats from an endemic area for visceral leishmaniasis, in order to assess its participation as possible potential reservoirs for this zoonosis. We collected spleen and skin samples of 375 bats from 19 cities in the State São Paulo, Brazil, areas of intense visceral leishmaniasis transmission. kDNA Leishmania ssp. amplification by PCR was positive in 4.53% bats and a higher positivity was seen in spleen samples (94.1%); two bats were positive for both skin and spleen samples. Trypanosoma spp. genomic DNA amplification was also investigated and 4.53% of the samples were positive, 23.5% of these were positive only for spleen, 76.5% for skin. One bat was positive for both Leishmania spp. and Trypanosoma spp. DNA amplification. These results demonstrate the occurrence of Leishmania spp. in bats from endemic area for visceral leishmaniasis, indicating the possibility of these being reservoirs of this zoonosis
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Detecção de microrganismos, quantificação de endotoxinas e avaliação in vivo do extrato glicólico de própolis em dentes com necrose pulpar e lesão periapical

Xavier, Ana Claudia Carvalho [UNESP] 07 June 2011 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:24:37Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-06-07Bitstream added on 2014-06-13T18:20:50Z : No. of bitstreams: 1 xavier_acc_me_sjc.pdf: 1016350 bytes, checksum: a962a7e714de7e776f6fedbac277efc6 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Este estudo avaliou in vivo a ação do extrato glicólico de própolis 12%, como substância química auxiliar em tratamentos endodônticos de dentes com necrose pulpar e lesão periapical. A avaliação foi realizada através da cultura e detecção de microrganismos por Reação em Cadeia Polimerase (PCR) e da quantificação de endotoxinas. Além disso, foi avaliada a correlação entre o tamanho da lesão periapical e a quantidade de endotoxinas presente. Foram selecionados 30 dentes, os quais foram divididos em 3 grupos (n=10), de acordo com a substância química auxiliar utilizada para a instrumentação: NaOCl) Hipoclorito de sódio 1%; CLX) Clorexidina gel 2%, intercalada com solução salina; PRO) Extrato glicólico de própolis 12%, intercalado com solução salina. As radiografias iniciais foram digitalizadas e as lesões periapicais foram medidas através de software específico. Foram realizadas 3 coletas do conteúdo do canal radicular: após a abertura coronária, após instrumentação e após 14 dias da medicação intracanal. A medicação intracanal utilizada foi o hidróxido de cálcio com propilenoglicol. Em todas as coletas realizou-se: detecção de microrganismos por PCR; avaliação do crescimento microbiológico em diferentes meios de cultura e quantificação de endotoxinas através do teste cinético cromogênico (LAL). Os resultados foram analisados através dos testes de Kruskal Wallis, Dunn (nível de significância 5%) e correlação linear de Pearson. A quantidade de microrganismos e endotoxinas, nas 2ª e 3ª coletas, diminuiu em relação à 1ª coleta, em todas as soluções avaliadas (p<0,05). Os canais apresentaram diversidade microbiana, com predominância de Parvimonas micra, Tanerella forsythia e Prevotella nigrescens. Concluiu-se que o extrato glicólico de própolis 12% apresentou atividade antimicrobiana e antiendotóxica semelhante aos demais... / The aim of this study was in vivo evaluated of 12% propolis glycolic extract action in root canal treatments, through the culture of microorganisms, quantification of endotoxins and detection of microorganisms by molecular method of polymerase chainreaction (PCR). A total of 30 human teeth were divided into 3 groups (n=10) according to the auxiliary chemical solution used for biomechanical preparation: NaOCl) sodium hypoclorite 1%; CLX) 2% chlorhexidine gel; PRO) 12% propolis glycolic extract. Collections were performed immediately after coronary open, after instrumentation and after 14 days with intracanal medication. For all collections were performed the following tests: microorganisms detection by PCR; assessment of microbiological growth and analyzing the amount of endotoxi (Limulus amoebocyte lysate). The results showed a decrease in the amount of microorganisms and endotoxins in the 2nd and 3rd collections of all irrigation solutions. The canals showed microbial diversityy, but Parvimonas micra was predominantly. It was concluded thar all solutions are evaluated antimicrobial and anti-endotoxic similar. The most common microorganism present in root canals with pulp necrosis and periapical lesion was Parvimonas microns. There is a evidence that the higher amount of endotoxins is in the biggest lesions

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