As espécies da subfamília Astrodoradinae foram revisadas e uma análise filogenética conduzida. Foram reconhecidas 21 espécies distribuídas em sete gêneros. Acanthodoras e Agamyxis, outrora considerados próximos a Platydoras foi considerado sinônimo ju nior de A. weddellii e uma nova espécie é descrita do alto Araguaia. Os gêneros Merodoras e Physopyxis foram considerados sinônimos A. ananas, A. bolivarensis, A. cristatus, A. lyra e A. nheco. Duas novas espécies de Astrodoras são reconhecidas, ocorrendo sintopicamente com A. asterifrons em alguns lugares da bacia amazônica. Scorpiodoras calderonensis é revalidado e sua localidade tipo elucidada, revelando-se ser Tabatinga. Além disso, uma nova espécie de Scorpiodoras foi descrita no médio rio Madeira. A análise cladística foi feita com base em 101 caracteres codificados para 28 táxons, resultando em uma única árvore mais parcimoniosa com 279 passos. O monofiletismo de Astrodoradinae foi sustentado por sete sinapomorfias não exclusivas: fontanela craniana anterior oval ou circular, número reduzido de costelas (oito ou menos), coracóide não coberto completamente por musculatura ventral, número reduzido de vértebras (34 ou menos), para-hipural fusionado aos hipurais 1 e 2, infra-orbital 1 participando da órbita e terceiro escudo timpânico expandido. Anadoras é considerado o gênero mais basal de Astrodoradinae, seguido por (Acanthodoras + Agamyxis) (Amblydoras (Scorpiodoras (Hypodoras + Astrodoras))). / The species of the subfamily Astrodoradinae was revised and a phylogenetic analysis performed. Twenty-one species, belonging to seven genera, are recognized as valid. Acanthodoras and Agamyxis, formely considered to be related to Platydoras,are included into Astrodoradinae. Anadoras regani is considered as a junior synonym of A. weddellii and a new species is described from the upper Araguaia. The genera Merodoras and Physopyxis are placed in synonym with Amblydoras,which has six valid species: A. affinis, A. ananas, A. bolivarensis, A. cristatus, A. lyra and A. nheco.Two new species of Astrodoras are described and occur syntopically in some places in the Amazon basin. Scorpiodoras calderonensis is reerected and its type locality elucidated as Tabatinga. Furthermore, a new species of Scorpiodoras is discribed from the middle rio Madeira. The cladistic analysis was performed based on 101 characters coded for 28 taxa and resulted in a single most parcimonious tree with 279 steps. The monophyly of Astrodoradinae is supported by seven non-exclusive synapomorphies: anterior cranial fontanel oval or circular, reduced number of ribs (eigth or less), ventral face of coracoid not completely covered by muscles, reduced number of vertebrae (34 or less), parhypural fused to hipural 1 and 2, infra-orbital 1 participating of orbit and third tympanic scute expanded. Anadoras is considered the most basal genus of Astrodoradinae, followed by (Acanthodoras + Agamyxis)(Amblydoras (Scorpiodoras (Hypodoras + Astrodoras))).

Este trabalho teve como objetivo testar o monofiletismo de Mezilaurus e a relação deste com os gêneros do \"grupo Mezilaurus\" (sensu Rohwer & Rudolph 2005), incluindo um número maior de táxons do que os tratamentos anteriores, além de revisar os limites morfológicos entre as espécies deste gênero. O \"grupo Mezilaurus\" (sensu Rohwer & Rudolph 2005), emergiu em filogenias prévias como monofilético, composto pelos gêneros Anaueria, Chlorocardium, Mezilaurus, Sextonia e Williamodendron. O trabalho baseou-se em sequências dos marcadores moleculares trnH-psbA e ITS de nove espécies de Mezilaurus e 15 espécies de grupos-externos. Análises de Parcimônia e Bayesiana foram empregadas com os marcadores separadamente e combinados. Os resultados obtidos demonstraram o \"grupo Mezilaurus\" como não monofilético e posicionamento incerto de Chlorocardium e Anaueria. Os Mezilauroides (sensu Rohwer & Rudolph 2005), com Mezilaurus, Sextonia e Williamodendron emergiu como monofilético, entretanto, o gênero Mezilaurus, atualmente circunscrito, não é monofilético e, uma de suas espécies, M. mahuba, surgiu como grupo-irmão de Sextonia. Por essa razão, a espécie foi removida de Mezilaurus e restabelecida como Clinostemon. Com base nessa nova circunscrição, foram realizadas as revisões taxonômicas de Mezilaurus e Clinostemon, baseadas em coleta de material botânico em expedições de campo e análises de aproximadamente 550 espécimes de exsicatas, oriundas de cerca de 60 herbários. Mezilaurus (15 espécies) e Clinostemon (1 espécie) compartilham folhas congestas no ápice dos ramos, produto de seu crescimento rítmico apositivo, flores bissexuadas, três estames férteis, representando a terceira série do androceu, anteras biloceladas e fruto com cúpula de pateliforme a plana com tépalas persistentes. Clinostemon, entretanto, apresenta anteras encurvadas e um par de glândulas nos filetes. Foram realizadas sinonimizações, lectotipificações e a descrições de quatro novas espécies de Mezilaurus para a ciência, elaboradas chaves de identificação, descrições morfológicas, além de comentários taxonômicos, fenológicos e de conservação e disponibilizadas ilustrações das espécies dos dois gêneros. / This study aimed to test the monophyletism of Mezilaurus and its relation within the \"Mezilaurus group\" clade (sensu Rohwer & Rudolph 2005), including more taxa than the previous treatments, and to revise the morphological boundaries between the species of the genus. The \"Mezilaurus group\" had emerged as monophyletic in previous phylogenies, with Anaueria, Chlorocardium, Mezilaurus, Sextonia, and Williamodendron. The work was based in the molecular markers trnH-psbA and ITS of nine Mezilaurus species, and 15 species from the outgroup. Parsimony and Bayesian analysis were performed with the markers both separately and combined. The results demonstrate that the \"Mezilaurus group\" is not monophyletic and uncertain position of Chlorocardium and Anaueria. The Mezilauroids, containing Mezilaurus, Sextonia, and Williamodendron, arose as monophyletic, although the Mezilaurus genus, as currently defined, is not monophyletic and M. mahuba emerged as sister of Sextonia. Therefore, it was necessary to remove M. mahuba of its circumscription, and reinstate this species as Clinostemon. Based on this circunscription, were carried out the taxonomic revisions of Mezilaurus and Clinostemon, based on collecting botanical specimens in expeditions, and analisys of 550 specimens of exsiccates from about 60 herbaria. Mezilaurus (15 species) and Clinostemon (1 species) have rythmic branching with distally clustered leaves, bisexual flowers, three fertile stamens, representing the third androecial whorl, 2-locular anthers, fruit with a minute discoid cupule, and persistent tepals. However, Clinostemon has recurved anters and one par of glands at the base of filaments. Synonymizations, lectotypifications, description of four new species of Mezilaurus to science, keys, morphologic descriptions, fenological aspects and conservation, taxonomic commentaries and ilustrations are presented for the two genera.

As espécies da subfamília Astrodoradinae foram revisadas e uma análise filogenética conduzida. Foram reconhecidas 21 espécies distribuídas em sete gêneros. Acanthodoras e Agamyxis, outrora considerados próximos a Platydoras foi considerado sinônimo ju nior de A. weddellii e uma nova espécie é descrita do alto Araguaia. Os gêneros Merodoras e Physopyxis foram considerados sinônimos A. ananas, A. bolivarensis, A. cristatus, A. lyra e A. nheco. Duas novas espécies de Astrodoras são reconhecidas, ocorrendo sintopicamente com A. asterifrons em alguns lugares da bacia amazônica. Scorpiodoras calderonensis é revalidado e sua localidade tipo elucidada, revelando-se ser Tabatinga. Além disso, uma nova espécie de Scorpiodoras foi descrita no médio rio Madeira. A análise cladística foi feita com base em 101 caracteres codificados para 28 táxons, resultando em uma única árvore mais parcimoniosa com 279 passos. O monofiletismo de Astrodoradinae foi sustentado por sete sinapomorfias não exclusivas: fontanela craniana anterior oval ou circular, número reduzido de costelas (oito ou menos), coracóide não coberto completamente por musculatura ventral, número reduzido de vértebras (34 ou menos), para-hipural fusionado aos hipurais 1 e 2, infra-orbital 1 participando da órbita e terceiro escudo timpânico expandido. Anadoras é considerado o gênero mais basal de Astrodoradinae, seguido por (Acanthodoras + Agamyxis) (Amblydoras (Scorpiodoras (Hypodoras + Astrodoras))). / The species of the subfamily Astrodoradinae was revised and a phylogenetic analysis performed. Twenty-one species, belonging to seven genera, are recognized as valid. Acanthodoras and Agamyxis, formely considered to be related to Platydoras,are included into Astrodoradinae. Anadoras regani is considered as a junior synonym of A. weddellii and a new species is described from the upper Araguaia. The genera Merodoras and Physopyxis are placed in synonym with Amblydoras,which has six valid species: A. affinis, A. ananas, A. bolivarensis, A. cristatus, A. lyra and A. nheco.Two new species of Astrodoras are described and occur syntopically in some places in the Amazon basin. Scorpiodoras calderonensis is reerected and its type locality elucidated as Tabatinga. Furthermore, a new species of Scorpiodoras is discribed from the middle rio Madeira. The cladistic analysis was performed based on 101 characters coded for 28 taxa and resulted in a single most parcimonious tree with 279 steps. The monophyly of Astrodoradinae is supported by seven non-exclusive synapomorphies: anterior cranial fontanel oval or circular, reduced number of ribs (eigth or less), ventral face of coracoid not completely covered by muscles, reduced number of vertebrae (34 or less), parhypural fused to hipural 1 and 2, infra-orbital 1 participating of orbit and third tympanic scute expanded. Anadoras is considered the most basal genus of Astrodoradinae, followed by (Acanthodoras + Agamyxis)(Amblydoras (Scorpiodoras (Hypodoras + Astrodoras))).

Este trabalho teve como objetivo testar o monofiletismo de Mezilaurus e a relação deste com os gêneros do \"grupo Mezilaurus\" (sensu Rohwer & Rudolph 2005), incluindo um número maior de táxons do que os tratamentos anteriores, além de revisar os limites morfológicos entre as espécies deste gênero. O \"grupo Mezilaurus\" (sensu Rohwer & Rudolph 2005), emergiu em filogenias prévias como monofilético, composto pelos gêneros Anaueria, Chlorocardium, Mezilaurus, Sextonia e Williamodendron. O trabalho baseou-se em sequências dos marcadores moleculares trnH-psbA e ITS de nove espécies de Mezilaurus e 15 espécies de grupos-externos. Análises de Parcimônia e Bayesiana foram empregadas com os marcadores separadamente e combinados. Os resultados obtidos demonstraram o \"grupo Mezilaurus\" como não monofilético e posicionamento incerto de Chlorocardium e Anaueria. Os Mezilauroides (sensu Rohwer & Rudolph 2005), com Mezilaurus, Sextonia e Williamodendron emergiu como monofilético, entretanto, o gênero Mezilaurus, atualmente circunscrito, não é monofilético e, uma de suas espécies, M. mahuba, surgiu como grupo-irmão de Sextonia. Por essa razão, a espécie foi removida de Mezilaurus e restabelecida como Clinostemon. Com base nessa nova circunscrição, foram realizadas as revisões taxonômicas de Mezilaurus e Clinostemon, baseadas em coleta de material botânico em expedições de campo e análises de aproximadamente 550 espécimes de exsicatas, oriundas de cerca de 60 herbários. Mezilaurus (15 espécies) e Clinostemon (1 espécie) compartilham folhas congestas no ápice dos ramos, produto de seu crescimento rítmico apositivo, flores bissexuadas, três estames férteis, representando a terceira série do androceu, anteras biloceladas e fruto com cúpula de pateliforme a plana com tépalas persistentes. Clinostemon, entretanto, apresenta anteras encurvadas e um par de glândulas nos filetes. Foram realizadas sinonimizações, lectotipificações e a descrições de quatro novas espécies de Mezilaurus para a ciência, elaboradas chaves de identificação, descrições morfológicas, além de comentários taxonômicos, fenológicos e de conservação e disponibilizadas ilustrações das espécies dos dois gêneros. / This study aimed to test the monophyletism of Mezilaurus and its relation within the \"Mezilaurus group\" clade (sensu Rohwer & Rudolph 2005), including more taxa than the previous treatments, and to revise the morphological boundaries between the species of the genus. The \"Mezilaurus group\" had emerged as monophyletic in previous phylogenies, with Anaueria, Chlorocardium, Mezilaurus, Sextonia, and Williamodendron. The work was based in the molecular markers trnH-psbA and ITS of nine Mezilaurus species, and 15 species from the outgroup. Parsimony and Bayesian analysis were performed with the markers both separately and combined. The results demonstrate that the \"Mezilaurus group\" is not monophyletic and uncertain position of Chlorocardium and Anaueria. The Mezilauroids, containing Mezilaurus, Sextonia, and Williamodendron, arose as monophyletic, although the Mezilaurus genus, as currently defined, is not monophyletic and M. mahuba emerged as sister of Sextonia. Therefore, it was necessary to remove M. mahuba of its circumscription, and reinstate this species as Clinostemon. Based on this circunscription, were carried out the taxonomic revisions of Mezilaurus and Clinostemon, based on collecting botanical specimens in expeditions, and analisys of 550 specimens of exsiccates from about 60 herbaria. Mezilaurus (15 species) and Clinostemon (1 species) have rythmic branching with distally clustered leaves, bisexual flowers, three fertile stamens, representing the third androecial whorl, 2-locular anthers, fruit with a minute discoid cupule, and persistent tepals. However, Clinostemon has recurved anters and one par of glands at the base of filaments. Synonymizations, lectotypifications, description of four new species of Mezilaurus to science, keys, morphologic descriptions, fenological aspects and conservation, taxonomic commentaries and ilustrations are presented for the two genera.

A tribo Glandulocaudini inclui os gêneros Lophiobrycon, Glandulocauda e Mimagoniates e dez espécies, distribuídas em ambientes de água doce do leste e sul do Brasil, no Paraguai e nordeste do Uruguai. São peixes neotropicais de pequeno porte, cujo grau de especialização morfológica e comportamental, bem como os padrões de distribuição das espécies, constituem interessante modelo para estudos evolutivos e para o entendimento de padrões biogeográficos de peixes de água doce na América do Sul. Embora os trabalhos sobre sistemática e biogeografia realizados recentemente representem avanço considerável no conhecimento de Glandulocaudini, nenhum foi embasado fundamentalmente em evidências moleculares. Além disso, amostragens recentes revelaram aspectos inéditos relativos à distribuição de populações alopátricas das espécies Glandulocauda melanopleura e Mimagoniates microlepis e estes novos dados indicaram a necessidade de estudos mais aprofundados em nível populacional, envolvendo a análise combinada de dados moleculares e morfológicos. A presente tese aborda estas questões, e para isto está dividida em três capítulos. No primeiro capítulo foi realizada uma análise filogenética com base em sequências gênicas do mtDNA e nuDNA para a tribo Glandulocaudini, que representa a primeira hipótese de relações proposta com base em dados moleculares para o grupo. No segundo e o terceiro capítulos foram realizadas análises filogenéticas, filogeográficas, de demografia histórica, e análises morfológicas das populações alopátricas de Mimagoniates microlepis e Glandulocauda melanopleura, respectivamente. / The tribe Glandulocaudini comprises three genera, Lophiobrycon, Glandulocauda and Mimagoniates, and ten species, distributed in freshwater environments of eastern and southern Brazil, Paraguay, and northeastern Uruguay. Its members include small Neotropical fishes, whose degree of morphological and behavioral specialization, as well as the distributional patterns of the species are of great value for evolutionary studies and understanding of biogeographical patterns of South American freshwater fishes. Although studies on systematics and biogeography carried out recently represent considerable progress on the knowledge of Glandulocaudini, none was grounded in molecular evidence. Furthermore, recent samples revealed unknown aspects concerning the allopatric distributions of populations of Glandulocauda melanopleura and Mimagoniates microlepis, and this new data indicates the need of more deep studies at population levels, combining both molecular and morphological analysis. This thesis addresses such issues and for this purpose it is divided in three chapters. In the first chapter, a phylogenetic analysis of the tribe Glandulocaudini, based on mtDNA and nuDNA data was performed, representing the first hypothesis of relationship for the group based on molecular data. In the second and third chapters, analysis of phylogeny, phylogeography and historical demography were performed, as well as morphological studies on allopatric population of Mimagoniates microlepis and Glandulocauda melanopleura, respectively.

Made available in DSpace on 2016-04-28T20:16:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2007- Sthefane D avila de Oliveira e Paula-01.pdf: 3469002 bytes, checksum: 6411676587b6fa03e9508964399be8e0 (MD5) Previous issue date: 2007-02-15 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico / The aim of the present study was to obtain data on helminth fauna in Columba livia, in municipality of Juiz de Fora, Minas Gerais, Brasil; to describe the structure of the helminth infracommunities present in this host and to clarify questions concerning morphology, sistematics and ecology of some of the component species. The helminthological study of 35 hosts revealed the presence of two digenetic trematodes, Tanaisia (Paratanaisia) bragai (prevalence 51.42%, mean intensity 288.8 ? 403.86 and mean abundance 148 ? 320.9) and T. inopina (prevalence 2.85% and mean abundance 0.68 ? 4.05); five cestodes, Raillietina allomyodes (prevalence 34.28%, mean intensity 6.66 ? 9.14 and mean abundance 2.28 ? 6.11), Raillietina sp. (prevalence 37.14%, mean intensity 9 ? 10.68 and mean abundance 3.34 ? 7.7), Skrjabinia bonini (prevalence 20%, mean intensity 2.14 ? 1.21 and mean abundance 0.42 ? 1), Skrjabinia sp.( prevalence 5.7%, mean intensity 6 ? 7 and mean abundance 0.34 ? 7) and Fuhrmanneta sp. (prevalence 2.85% and mean abundance 0.028 ? 0.16) and four nematodes, Baruscapillaria obsignata (prevalence 51.42%, mean intensity 29.72 ? 44.2 and mean abundance 15.28 ? 34.7); Ascaridia columbae (prevalence 51.42%, mean intensity 60.55 ? 79.88 and mean abundance 31.14 ? 64.2); Tetrameres fissipina (prevalence 14.28%, mean intensity 346.3 ? 504.4 and mean abundance 49.42 ? 212.1) and Synhmanthus (Dyspharynx) nasuta (prevalence 2.85% and mean abundance 0.028 ? 0.16). Among the examined hosts, 97.2 % were found parasitized by at least one helminth species. In accordance with the prevalence of each species T. bragai, A. columbae and B. obsignata were considered secondary species and T. inopina, T. fissipina, S. nasuta, S. bonini, Skrjabinia sp., R. allomyodes, Raillietina sp. and Fuhrmanneta sp. were considered satellite species. All the species exhibited aggregate distributions, wich is the most common distribution pattern in helminth populations. Taxonomic and ecologic aspects of B. obsignata infrapopulations were analised and the results are discussed in terms of possible factors influencing the processes that lead to niche restriction and biased sex ratios in parasite infrapopulations. Additionaly, studies on morphology and sistematics of some component species were performed. Tanaisia (Paratanaisia) bragai and T. inopina specimens were analised by means of confocal laser scanning microscopy. Two new species of Raillietina and Skrjabinia were described and the sequences of the ITS2 ribossomal DNA of these species were determined and combined with other available Raillietina and Skrjabinia sequences in GenBank, in order to perform a phylogenetic study. / O conhecimento da helmintofauna de Columba livia, no Brasil, teve in?cio com as investiga??es a respeito do parasitismo em animais dom?sticos. Esses he lmintos foram relativamente bem estudados, sob o aspecto faun?stico. No entanto, existem lacunas no conhecimento da morfologia, sistem?tica e ecologia das esp?cies. O conhecimento sobre a morfologia e, consequentemente, os caracteres utilizados na sistem?tica, se restringem quase totalmente `as informa??es que a microscopia de luz pode fornecer. N?o existem estudos sobre a ecologia das infracomunidades desses parasitos, no Brasil. Al?m disso, as rela??es entre algumas esp?cies ainda s?o incertas, sendo necess?ria a revis?o da posi??o taxon?mica e filogen?tica desses helmintos. O presente trabalho teve como objetivos gerais: 1- conhecer a helmintofauna de C. livia, no munic?pio de Juiz de Fora, Minas Gerais; 2- determinar a estrutura da comunidade desses helmintos; 3- elucidar quest?es relativas ? morfologia, sistem?tica e ecologia de algumas das esp?cies componentes dessa comunidade. Para este fim, foram necropsiadas 35 aves e os helmintos coletados foram processados segundo as t?cnicas helmintol?gicas conve ncionais e quantificados. Foram calculados o ?ndice de dispers?o, para determinar o padr?o de distribui??o das infrapopula??es; o ?ndice de concentra??o de domin?ncia de Simpson, para avaliar a presen?a de esp?cie dominante na estrutura da comunidade e o ?ndice de Brillouin (H), para determinar a diversidade parasit?ria da comunidade. O estudo helmintol?gico revelou a presen?a de duas esp?cies de digen?ticos, Tanaisia (Paratanaisia) bragai (preval?ncia 51.42%, intensidade m?dia 288.8 ? 403.86 e abund?ncia m?dia 148 ? 320.9) e T. inopina (preval?ncia 2.85% e abund?ncia m?dia 0.68 ? 4.05); cinco esp?cies de cest?ides, Raillietina allomyodes (preval?ncia 34.28%, intensidade m?dia 6.66 ? 9.14 e abund?ncia m?dia 2.28 ? 6.11), Raillietina sp. (preval?ncia 37.14%, intensidade m?dia 9 ? 10.68 e abund?ncia m?dia 3.34 ? 7.7), Skrjabinia bonini (preval?ncia 20%, intensidade m?dia 2.14? 1.21 e abund?ncia m?dia 0.42 ? 1), Skrjabinia sp. (preval?ncia 5.7%, intensidade m?dia 6 ? 7 e abund?ncia m?dia 0.34 ? 7) e Fuhrmanneta sp. (preval?ncia 2.85% e abund?ncia m?dia 0.028 ? 0.16) e quatro esp?cies de nemat?ides, Baruscapillaria obsignata (preval?ncia 51.42%, intensidade m?dia 29.72 ? 44.2 e abund?ncia m?dia 15.28 ? 34.7); Ascaridia columbae (preval?ncia 51.42%, intensidade m?dia 60.55 ? 79.88 e abund?ncia m?dia 31.14 ? 64.2); Tetrameres fissipina (preval?ncia 14.28%, intensidade m?dia 346.3 ? 504.4 e abund?ncia m?dia 49.42 ? 212.1) e Synhimanthus (Dyspharynx) nasuta (preval?ncia 2.85% e abund?ncia m?dia 0.028 ? 0.16). Aspectos da taxon?mia e ecologia das infrapopula??es de B. obsignata foram abordados e os resultados discutidos em termos dos poss?veis fatores com influ?ncia nos processos que levam `a restri??o de nicho e raz?es sexuais enviezadas. Adicionalmente, foram realizados estudos sobre a morfologia e sitem?tica de algumas das esp?cies componentes. Aspectos da morfologia de Tanaisia (Paratanaisia) bragai e T. inopina, foram elucidados utilizando-se como ferramenta a microscopia de varredura a laser confocal. Um estudo filogen?tico de esp?cies dos g?neros Raillietina e Skrjabinia, foi realizado atrav?s da an?lise de seq??ncias da regi?o espa?adora transcrita interna 2 (ITS2) do DNA ribossomal e duas esp?cies novas foram descritas.

A tribo Glandulocaudini inclui os gêneros Lophiobrycon, Glandulocauda e Mimagoniates e dez espécies, distribuídas em ambientes de água doce do leste e sul do Brasil, no Paraguai e nordeste do Uruguai. São peixes neotropicais de pequeno porte, cujo grau de especialização morfológica e comportamental, bem como os padrões de distribuição das espécies, constituem interessante modelo para estudos evolutivos e para o entendimento de padrões biogeográficos de peixes de água doce na América do Sul. Embora os trabalhos sobre sistemática e biogeografia realizados recentemente representem avanço considerável no conhecimento de Glandulocaudini, nenhum foi embasado fundamentalmente em evidências moleculares. Além disso, amostragens recentes revelaram aspectos inéditos relativos à distribuição de populações alopátricas das espécies Glandulocauda melanopleura e Mimagoniates microlepis e estes novos dados indicaram a necessidade de estudos mais aprofundados em nível populacional, envolvendo a análise combinada de dados moleculares e morfológicos. A presente tese aborda estas questões, e para isto está dividida em três capítulos. No primeiro capítulo foi realizada uma análise filogenética com base em sequências gênicas do mtDNA e nuDNA para a tribo Glandulocaudini, que representa a primeira hipótese de relações proposta com base em dados moleculares para o grupo. No segundo e o terceiro capítulos foram realizadas análises filogenéticas, filogeográficas, de demografia histórica, e análises morfológicas das populações alopátricas de Mimagoniates microlepis e Glandulocauda melanopleura, respectivamente. / The tribe Glandulocaudini comprises three genera, Lophiobrycon, Glandulocauda and Mimagoniates, and ten species, distributed in freshwater environments of eastern and southern Brazil, Paraguay, and northeastern Uruguay. Its members include small Neotropical fishes, whose degree of morphological and behavioral specialization, as well as the distributional patterns of the species are of great value for evolutionary studies and understanding of biogeographical patterns of South American freshwater fishes. Although studies on systematics and biogeography carried out recently represent considerable progress on the knowledge of Glandulocaudini, none was grounded in molecular evidence. Furthermore, recent samples revealed unknown aspects concerning the allopatric distributions of populations of Glandulocauda melanopleura and Mimagoniates microlepis, and this new data indicates the need of more deep studies at population levels, combining both molecular and morphological analysis. This thesis addresses such issues and for this purpose it is divided in three chapters. In the first chapter, a phylogenetic analysis of the tribe Glandulocaudini, based on mtDNA and nuDNA data was performed, representing the first hypothesis of relationship for the group based on molecular data. In the second and third chapters, analysis of phylogeny, phylogeography and historical demography were performed, as well as morphological studies on allopatric population of Mimagoniates microlepis and Glandulocauda melanopleura, respectively.

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:26:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TAUHYL_Luis_Gustavo_2013.pdf: 16388420 bytes, checksum: 22a4e66470251df0d031f3ed7f9d2aec (MD5) Previous issue date: 2013-11-13 / Financiadora de Estudos e Projetos / The Family Calliphoridae is a diverse group of taxonomic, biogeographic, veterenary, forensic and medical importance, with more than 1200 species. The subfamily Toxotarsinae is endemic for the Neotropical region, has eleven species and is distributed mainly in the Andes countries and south of Brazil. Several authors have already studied this group and contributed with wide literature. The Toxotarsinae species are easily recognizable, but there are some difficulties to classify higher-specific taxa. This is the first phylogeny made for Toxotarsinae and it was necessary for better understanding of this group evolution. The aim of this work was to study the relationship among Toxotarsinae species through cladistics analysis. The character matrix was developed exclusively with morphological information. It was performed heuristic analisys using pacimony with equal weighting analyses obtained from Winclada and implied weighting obtained with TNT. The ingroup was compound for all Toxotarsinae species, Toxotarsus ambrosianus, T. nigrocyaneus, T. humeralis, S. chlorogaster, S. magellanica, S. dichroa, S. splendida, S. roraima, S. versicolor e S. maurii, and Neta chilensis, and the outgroup was compound by: Lucilia cuprina (Wiedemann, 1830), Calliphora nigribasis (Macquart, 1851) e Chrysomya megacephala (Fabricius, 1775). Equal weighting analysis resulted in only one most parsimoniously topology ((Sarconesia roraima + (Neta chilensis + S. magellanica)) + (S. splendida + (S. maurii + (S. versicolor + (S. dichroa + (S. chlorogaster + (Toxotarsus nygrocianeus + (Toxotarsus humeralis + Toxotarsus ambrosianus)))))))), with L=105, IC=58 e IR=71. Toxotarsinae appears as a monophyletic group, supported by nine synapomorphies. The ingroup species formed two branches: Sarconesia roraima+ supported by two synapomorphies, and S. splendida+ supported by ten synapomorphies. Implied weighting analysis resulted one tree, with different topologies with k values between 1 3. Based on the obtained topologies, the genus Sarconesia is polyphyletic and the other two genera, Neta and Toxotarsus, are among Sarconesia. The original Toxotarsus species remain togheter and supported by eleven synapomorphies at the apex of S. splendida+ clade. The taxa distribution in topology obligates the proposition of nomenclatural changes. Neta chilensis of S. roraima+ branch will be transferred to genus Sarconesia, and S. splendida+ branch will be transferred to Toxotarsus. An identification key was developed with the new combinations is presented. / A família Calliphoridae é um grupo de importância taxonômica, biogeográfica, veterinária, forense e médica e é composta por pouco mais de 1200 espécies. A subfamília Toxotarsinae é endêmica à região Neotropical, possui onze espécies e distribui-se, principalmente, nos países andinos e sul do Brasil. Vários autores já estudaram os Toxotarsinae, o que confere um amplo material de estudo. As espécies pertencentes a este grupo são facilmente reconhecidas, mas há certa dificuldade na classificação dos táxons supra-específicos, razão pela qual este estudo foi realizado. O objetivo do trabalho, portanto, foi o de estudar as relações de parentesco entre espécies de Toxotarsinae (Calliphoridae: Diptera) através de análise cladística. A matriz de caracteres foi desenvolvida exclusivamente com caracteres morfológicos. Foram realizadas análises heurísticas usando parcimônia com e sem pesagem nos programas Winclada e TNT, respectivamente. O grupo interno foi composto por todas as 11 espécies de Toxotarsinae, sendo três de Toxotarsus, Toxotarsus ambrosianus, T. nigrocyaneus e T. humeralis, sete de Sarconesia, S. chlorogaster, S. magellanica, S. dichroa, S. splendida, S. roraima, S. versicolor e S. maurii e uma do gênero monotípico Neta, Neta chilensis. O grupo-externo foi composto por três espécies: Lucilia cuprina (Wiedemann, 1830), Calliphora nigribasis (Macquart, 1851) e Chrysomya megacephala (Fabricius, 1775). A análise sem pesagem resultou em apenas uma topologia ((Sarconesia roraima + (Neta chilensis + S. magellanica)) + (S. splendida + (S. maurii + (S. versicolor + (S. dichroa + (S. chlorogaster + (Toxotarsus nygrocianeus + (Toxotarsus humeralis + Toxotarsus ambrosianus)))))))), com L=105, IC=58 e IR=71. Toxotarsinae aparece como um grupo monofilético, com suporte de nove sinapomorfias. As espécies foram agrupadas em dois ramos internos: Sarconesia roraima+ suportado por duas sinapomorfias e S. splendida+ por dez sinapomorfias. As análises com pesagem implícita resultaram em uma árvore, com mudanças na topologia apenas com valores de k entre 1 - 6. Com base nas topologias obtidas, tanto com como sem pesagem, o gênero Sarconesia apareceu como táxon polifilético, pois os dois outros gêneros, Neta e Toxotarsus, foram incluídos entre suas espécies. As espécies do gênero Toxotarsus permanecem juntas suportadas por onze sinapomorfias no ápice do clado S. splendida+. A distribuição dos táxons na topologia tem como consequência a proposição de alterações nomenclaturais. A espécie Neta chilensis será transferida para o gênero Sarconesia e as do clado S. splendida+ serão transferidas para o gênero Toxotarsus. Uma chave de identificação com as novas combinações é apresentada.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Na Colômbia ocorrem 787 espécies de anfíbios. Por causa da preocupação com o estado de conservação de muitas dessas espécies, tem se sugerido que na Colômbia deveriam-se priorizar as pesquisas em taxonomia e ecologia em regiões sub-amostradas a fim de intensificar o conhecimento e conservação dos anfíbios colombianos. Baseados em uma análise cienciométrica de 319 trabalhos sobre a ecologia dos anfíbios colombianos publicados entre 1840 e 2014 (No Capítulo 1), identificamos as tendências nos esforços realizados em distintos temas de pesquisa, e a distribuição regional e taxonômica desses estudos. A maioria dos estudos (67%) foi realizada na região Andina colombiana em comparação com outras regiões naturais da Colômbia. Apenas 46% das espécies de anfíbios ocorrendo na Colômbia foi tratada nos estudos analizados, e a maioria (58%) delas é da região Andina. Entre as publicações analizadas identificamos 14 temas de pesquisa em ecologia, dos quais ecologia reprodutiva (26%), conservação de espécies (23%) e dieta (14%) foram os mais pesquisados. Nossos dados mostraram que na Colômbia há um considerável avanço na pesquisa sobre a ecologia dos anfíbios do país, mas ainda são necessários esforços para cobrir muitos vazios de informação para muitas regiões e para muitas espécies de anfíbios que possuem dados incipientes. No sudoeste da Cordilheira Ocidental colombiana há pouca informação ecológica sobre os anfíbios ali ocorrendo. A fim de saber alguns aspectos ecológicos dessas espécies, desenvolvimos três estudos sobre a diversidade e ecologia de anfíbios presentes na Reserva Natural Río Ñambí (a seguir RNRÑ). No Capítulo 2 apresentamos uma análise sistemática do gênero Andinophryne (Família Bufonidae), composto por três espécies, A. atelopoides, A. colomai (presente na RNRÑ) e A. olallai. As filogenias mostraram que Andinophryne está incorporado dentro de Rhaebo. Portanto, sinonimizamos Andinophryne sob Rhaebo e discutimos as sinapomorfias morfológicas putativas para Rhaebo. Além, fornecemos informações ecológicas e sobre o estado de conservação das três espécies incluídas na nova combinação taxonômica. No Capítulo 3 apresentamos uma lista de 19 espécies de anfíbios pertencentes a oito famílias, com uma dominância numérica da família Craugastoridae e do gênero Pristimantis. As espécies com a maior abundância relativa (> 25%) foram Pristimantis labiosus e P. verecundus. Sete diferentes modos de reprodução foram reconhecidos, com a maioria das espécies (68%) possuindo desenvolvimento direto de ovos. Cinco (26%) das espécies registradas estão classificadas dentro das categorias de maior ameaça de extinção. Reportamos para sete espécies a extensão da faixa de distribuição geográfica latitudinal na Colômbia. No Capítulo 4 comparamos a dieta de jovens e adultos de P. labiosus para identificar se houve uma mudança ontogenética no tamanho de presa consumido com o aumento na largura da boca. A dieta foi composta por 19 categorias de presas (> artrópodes), com as duas classes de idade consumindo um similar espectro de categorias. Os jovens têm um nicho trófico maior (0,45) do que os adultos (0,25), com uma sobreposição de nicho relativamente baixa (0,39) entre eles. Apesar da diferencia na largura da boca entre jovens e adultos, não houve uma correspondente mudança ontogenética no tamanho de presa consumida. Consideramos P. labiosus como um predador generalista que parece consumer uma ampla gama de tipos e tamanhos de presas / Colombia harbors 787 species of amphibians. Because of concerns with the conservation status of many of these species, it has been suggested that in Colombia should prioritize research in taxonomy and ecology in undersampled regions in order to enhance the knowledge and conservation of Colombian amphibians. Based on a scientometric analysis of 319 works on ecology of Colombian amphibians published between 1840 and 2014 (Chapter 1), we identified trends in the efforts made in different research topics, and both regional and taxonomic distribution of these studies. Most studies (67%) was conducted in the Colombian Andean region compared to other natural regions of Colombia. Only 46% of amphibian species occurring in Colombia was included in the reviewed studies, and the most of them (58%) is from the Andean region. Among the reviewed publications, we identified 14 research topics in ecology, of which reproductive ecology (26%), species conservation (23%), and diet (14%) were the most investigated. Our data showed that in Colombia, there is a considerable advance in research on amphibian ecology, but we need further efforts to fill many gaps in information for many regions and for many amphibian species possessing incipient data. In southwestern of the Colombian western Andes there is little information about the species occurring there. In order to know some ecological aspects of these species, we conducted three studies on diversity and ecology of the amphibians present in the Reserva Natural Río Ñambí (hereafter RNRÑ). In the Chapter 2, we show an analysis of the systematics of the genus Andinophryne (Family Bufonidae), composed by three species, A. atelopoides, A. colomai (present in the RNRÑ) and A. olallai. The phylogenies showed that Andinophryne is embedded within Rhaebo. Therefore, we synonymize Andinophryne under Rhaebo and we discussed the putative morphological synapomorphies for Rhaebo. In addition, we provide ecological informations and on the conservation status of the three species included in the new taxonomic combination. In the Chapter 3, we show a list of 19 amphibian species from eight families, with a numerical dominance of the Family Craugastoridae and of the genus Pristimantis. The species with the highest relative abundance (>25%) were Pristimantis labiosus and P. verecundus. Seven different reproductive modes were recognized, with most species (68%) presented direct development of eggs. Five (26%) of the species recorded are classified in the categories of greatest threat of extinction. We report for seven species an extension of the latitudinal distribution range in Colombia. In the Chapter 4, we compared the diet of juveniles and adults of P. labiosus in order to identify if there was an ontogenetic shift in the prey size consumed as mouth width increases. The diet was composed of 19 prey categories (> arthropods), and the two age-classes consumed a similar array of prey categories. Juveniles had a broader trophic niche (0.57) than adults (0.25), with a relatively low trophic overlap among them (0.39). Although we found differences in mouth width between juveniles and adults, we did not observe a corresponding ontogenetic shift in prey size consumption. We consider that P. labiosus is a generalist predator, consuming a wide range of prey types and sizes

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Na Colômbia ocorrem 787 espécies de anfíbios. Por causa da preocupação com o estado de conservação de muitas dessas espécies, tem se sugerido que na Colômbia deveriam-se priorizar as pesquisas em taxonomia e ecologia em regiões sub-amostradas a fim de intensificar o conhecimento e conservação dos anfíbios colombianos. Baseados em uma análise cienciométrica de 319 trabalhos sobre a ecologia dos anfíbios colombianos publicados entre 1840 e 2014 (No Capítulo 1), identificamos as tendências nos esforços realizados em distintos temas de pesquisa, e a distribuição regional e taxonômica desses estudos. A maioria dos estudos (67%) foi realizada na região Andina colombiana em comparação com outras regiões naturais da Colômbia. Apenas 46% das espécies de anfíbios ocorrendo na Colômbia foi tratada nos estudos analizados, e a maioria (58%) delas é da região Andina. Entre as publicações analizadas identificamos 14 temas de pesquisa em ecologia, dos quais ecologia reprodutiva (26%), conservação de espécies (23%) e dieta (14%) foram os mais pesquisados. Nossos dados mostraram que na Colômbia há um considerável avanço na pesquisa sobre a ecologia dos anfíbios do país, mas ainda são necessários esforços para cobrir muitos vazios de informação para muitas regiões e para muitas espécies de anfíbios que possuem dados incipientes. No sudoeste da Cordilheira Ocidental colombiana há pouca informação ecológica sobre os anfíbios ali ocorrendo. A fim de saber alguns aspectos ecológicos dessas espécies, desenvolvimos três estudos sobre a diversidade e ecologia de anfíbios presentes na Reserva Natural Río Ñambí (a seguir RNRÑ). No Capítulo 2 apresentamos uma análise sistemática do gênero Andinophryne (Família Bufonidae), composto por três espécies, A. atelopoides, A. colomai (presente na RNRÑ) e A. olallai. As filogenias mostraram que Andinophryne está incorporado dentro de Rhaebo. Portanto, sinonimizamos Andinophryne sob Rhaebo e discutimos as sinapomorfias morfológicas putativas para Rhaebo. Além, fornecemos informações ecológicas e sobre o estado de conservação das três espécies incluídas na nova combinação taxonômica. No Capítulo 3 apresentamos uma lista de 19 espécies de anfíbios pertencentes a oito famílias, com uma dominância numérica da família Craugastoridae e do gênero Pristimantis. As espécies com a maior abundância relativa (> 25%) foram Pristimantis labiosus e P. verecundus. Sete diferentes modos de reprodução foram reconhecidos, com a maioria das espécies (68%) possuindo desenvolvimento direto de ovos. Cinco (26%) das espécies registradas estão classificadas dentro das categorias de maior ameaça de extinção. Reportamos para sete espécies a extensão da faixa de distribuição geográfica latitudinal na Colômbia. No Capítulo 4 comparamos a dieta de jovens e adultos de P. labiosus para identificar se houve uma mudança ontogenética no tamanho de presa consumido com o aumento na largura da boca. A dieta foi composta por 19 categorias de presas (> artrópodes), com as duas classes de idade consumindo um similar espectro de categorias. Os jovens têm um nicho trófico maior (0,45) do que os adultos (0,25), com uma sobreposição de nicho relativamente baixa (0,39) entre eles. Apesar da diferencia na largura da boca entre jovens e adultos, não houve uma correspondente mudança ontogenética no tamanho de presa consumida. Consideramos P. labiosus como um predador generalista que parece consumer uma ampla gama de tipos e tamanhos de presas / Colombia harbors 787 species of amphibians. Because of concerns with the conservation status of many of these species, it has been suggested that in Colombia should prioritize research in taxonomy and ecology in undersampled regions in order to enhance the knowledge and conservation of Colombian amphibians. Based on a scientometric analysis of 319 works on ecology of Colombian amphibians published between 1840 and 2014 (Chapter 1), we identified trends in the efforts made in different research topics, and both regional and taxonomic distribution of these studies. Most studies (67%) was conducted in the Colombian Andean region compared to other natural regions of Colombia. Only 46% of amphibian species occurring in Colombia was included in the reviewed studies, and the most of them (58%) is from the Andean region. Among the reviewed publications, we identified 14 research topics in ecology, of which reproductive ecology (26%), species conservation (23%), and diet (14%) were the most investigated. Our data showed that in Colombia, there is a considerable advance in research on amphibian ecology, but we need further efforts to fill many gaps in information for many regions and for many amphibian species possessing incipient data. In southwestern of the Colombian western Andes there is little information about the species occurring there. In order to know some ecological aspects of these species, we conducted three studies on diversity and ecology of the amphibians present in the Reserva Natural Río Ñambí (hereafter RNRÑ). In the Chapter 2, we show an analysis of the systematics of the genus Andinophryne (Family Bufonidae), composed by three species, A. atelopoides, A. colomai (present in the RNRÑ) and A. olallai. The phylogenies showed that Andinophryne is embedded within Rhaebo. Therefore, we synonymize Andinophryne under Rhaebo and we discussed the putative morphological synapomorphies for Rhaebo. In addition, we provide ecological informations and on the conservation status of the three species included in the new taxonomic combination. In the Chapter 3, we show a list of 19 amphibian species from eight families, with a numerical dominance of the Family Craugastoridae and of the genus Pristimantis. The species with the highest relative abundance (>25%) were Pristimantis labiosus and P. verecundus. Seven different reproductive modes were recognized, with most species (68%) presented direct development of eggs. Five (26%) of the species recorded are classified in the categories of greatest threat of extinction. We report for seven species an extension of the latitudinal distribution range in Colombia. In the Chapter 4, we compared the diet of juveniles and adults of P. labiosus in order to identify if there was an ontogenetic shift in the prey size consumed as mouth width increases. The diet was composed of 19 prey categories (> arthropods), and the two age-classes consumed a similar array of prey categories. Juveniles had a broader trophic niche (0.57) than adults (0.25), with a relatively low trophic overlap among them (0.39). Although we found differences in mouth width between juveniles and adults, we did not observe a corresponding ontogenetic shift in prey size consumption. We consider that P. labiosus is a generalist predator, consuming a wide range of prey types and sizes