Submitted by Isaac Francisco de Souza Dias (isaac.souzadias@ufpe.br) on 2016-02-25T18:49:42Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) DISSERTAÇÃO Camila Marques Queiroz.pdf: 1322318 bytes, checksum: fa38b127181cbd3fb8d4a21effd1f9e2 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-02-25T18:49:42Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) DISSERTAÇÃO Camila Marques Queiroz.pdf: 1322318 bytes, checksum: fa38b127181cbd3fb8d4a21effd1f9e2 (MD5) Previous issue date: 2015-02-24 / CAPES / O aumento da incidência de casos de dengue constitui um importante problema de saúde pública mundial. A patogênese da Febre Hemorrágica da Dengue (FHD) ainda não está completamente esclarecida. A invasão do vírus às células do sistema imunológico modifica o estado normal celular, induzindo a produção e a liberação de inúmeros mediadores imunológicos como espécies reativas de oxigênio, incluindo o óxido nítrico (NO) e citocinas pró-inflamatórias (IFN-α e IFN-β, TNF-α e IL-6). A indefinição acerca do papel desses mediadores imunológico durante a infecção humana pelo dengue vírus (DENV) e possível papel na disfunção endotelial justifica a realização do presente trabalho buscando esclarecer a dinâmica da relação vírus-hospedeiro frente ao agravamento da infecção. O objetivo desse estudo foi avaliar o potencial de marcador biológico da dosagem dos níveis séricos de NO e mediadores imunoinflamatórios em pacientes diagnosticados com dengue em sua forma grave. Foram analisadas 307 amostras de soros coletadas entre 2009 a 2011. A dosagem de NO foi realizada por reação de Griess e a dosagem das citocinas pelo método ELISA, seguindo as instruções sugeridas por cada kit, buscando correlacionar os valores séricos encontrados com a gravidade das formas clínicas da doença. Como resultado, não houve diferença nos níveis séricos de NO entre pacientes com Dengue Clássica (DC) ou FHD, infecção primária ou secundária ou mesmo entre os diferentes sorotipos virais. Analisando os resultados em tempos específicos de sintomatologia, observou-se que até os 02 dias iniciais, maiores níveis de NO foram detectados em pacientes com infecção primária em relação à infecção secundária, e principalmente nos pacientes com DC em relação aos pacientes com FHD. Na dosagem do TNF-α não houve diferença entre os grupos de pacientes estudados. Observou-se diferença entre dengue primária e dengue secundária, sendo maior a produção de IFN-α nos pacientes com dengue primária. A dosagem do IFN-β foi realizada, porém não foram detectados níveis séricos mínimos dessa citocina. Observamos a circulação de três sorotipos diferentes na mesma população de estudo, porém sem associação com os níveis de citocinas circulantes. Os dados sugerem que a quantificação sérica do NO e citocinas pró-inflamatórias na população estudada não auxilia como determinação de marcador biológico de dengue para formas graves da doença. / The increased incidence of dengue cases is an important problem of global public health. The pathogenesis of Dengue Hemorrhagic Fever (DHF) is not yet fully elucidated. The invasion of the virus into immune system cells modifies the cell normality, triggering the production and release of several immune mediators. With emphasis in oxygen reactive species, for example, nitric oxide (NO) and proinflammatory cytokines (IFN-α, IFN-β, TNF-α and IL-6). The uncertainty about the role of these immune mediators during the human infection by DENV justifies the need for new research, seeking to clarify the virus-host dynamics relationship in to the aggravation of infection. The aim of this study was to evaluate the prognostic potential of NO serum levels and others proinflammatory cytokines in patients diagnosed with dengue. We analyzed 307 serum samples collected between 2009 to 2011. The NO level was evaluated with the Griess reagent and the dosage of proinflammatory cytokines by ELISA technique following the instructions suggested by each kit seeking to correlate the serum levels with the severity of the clinical forms of the disease. As a result, there was no difference in serum levels of NO in patients with Classical Dengue (DC) or DHF, primary or secondary infection or even between different serotypes. Analyzing the results at specific times of symptomatology, it was observed that up to 02 days initial, high levels of NO were detected in patients with primary infection, compared to secondary infection, especially in patients with DC compared to patients with DHF. There was no difference in TNF-α levels among the groups of patients. It were observed significant differences between primary dengue and secondary dengue, with a higher IFN-α production in patients with primary dengue. The IFN-β dosage was performed, but there were no detected minimum serum levels of this cytokine. We observed the presence of three different serotypes in the same population studied, but no association with cytokine levels. The detection of elevated levels of NO in patients with DC, in the initial days of symptomatology, reinforces the potential role of this molecule in the control of the viral infection, however, was not found difference in later times of symptomatology. The data suggest that the serum quantification of NO and inflammatory cytokines in this population does not help to determine biological marker for severe forms of dengue disease.

Made available in DSpace on 2015-04-20T12:31:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Regina Maria Pinto de Figueiredo.pdf: 895178 bytes, checksum: 18bad8fbb4a4c9f02c1af51dee70295b (MD5) Previous issue date: 2008-01-29 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Dengue virus infection increased significantly in Brazil during the last decade, particularly after 1994, as a consequence of Aedes aegypti dissemination. Vector dispersion was followed by the introduction of DEN-1, DEN-2 and DEN-3 serotypes in major Brazilian cities and the co-circulation of different serotypes has led to the first cases of dengue hemorrhagic fever (DHF). This study had as objectives: Isolate in cell culture samples of dengue virus circulating in the state of Amazonas; identify the serotypes of the dengue virus through sorologicas and molecular techniques; to correlate the clinical and laboratory most important cases of dengue, of dengue hemorrhagic fever (DHF) and dengue by shock syndrome (DSS), with each serotype; comparing the results obtained through the sequencing parcial of genes C and prM of samples of dengue found in this study compared with the sequences deposited in GenBank. Between January 2005 and June 2007, 534 blood samples were collected from patients with clinical symptoms of dengue fever who were negative for malaria. Anti-dengue immunoglobulin M (IgM) specific antibodies were detected in 90 (16.8%) samples, from those 40 (44.4%) were PCR-amplified, 13 (32.5%) were typed as DEN-2, 23 (57.5%) as DEN-3 and 4 (10%) as DEN-4. Among the 40 PCR-positive samples, 52 (57,7%) were also positive for viral culture. DEN-3 was isolated from two patients diagnosed with hemorrhagic fever by the WHO criteria. As this work reports the first detection of dengue type 4 viruses in Amazonas, DEN-4 was identified from the sera of three patients with co- infection two of them were DEN-3/DEN-4 co-infection and one DEN-2 / DEN-4. A greater incidence of DEN-3 in relation to DEN-2 and DEN-4, and the absence of DEN-1 circulation. / A infecção pelo vírus dengue aumentou significantemente no Brasil durante a última década, particularmente depois de 1994, como conseqüência da disseminação do Aedes aegypti. A dispersão do vetor foi seguida pela introdução dos sorotipos DEN-1, DEN-2 e DEN-3 nas principais cidades brasileiras e a co-circulação de diferentes sorotipos permitiu o surgimento dos primeiros casos de dengue hemorrágico (DHF). Este estudo teve como objetivos: Isolar em cultura de células amostras dos vírus dengue circulantes no Estado do Amazonas; identificar os sorotipos do vírus dengue por meio de técnicas sorológicas e moleculares; correlacionar os aspectos clínicos e laboratoriais mais importantes dos casos de dengue, febre hemorrágica do dengue (DHF) e da síndrome de choque por dengue (DSS), com cada sorotipo e comparar os resultados obtidos por seqüenciamento parcial dos genes C e prM das amostras de dengue encontradas neste estudo em comparação com seqüências depositadas no GenBank. Entre janeiro de 2005 e junho de 2007, 534 amostras de sangue foram coletadas de pacientes com sintomas clínicos de dengue e negativos para malária. Anticorpos específicos anti-dengue (IgM) foram detectados em 90 (16,8%) amostras, dessas 40 (44,4%) foram amplificadas, 13 (32,5%) foram tipadas como DEN-2, 23 (57,5%) como DEN-3 e 4 (10%) como DEN-4. Entre as 40 amostras positivas por PCR, 52 (57,7%) foram também positivas no isolamento viral. DEN-3 foi isolado de dois pacientes diagnosticados com DHF pelos critérios da Organização Mundial de Saúde (OMS). No presente trabalho foi também registrada a primeira detecção de DEN-4 no Amazonas. O sorotipo DEN-4 foi identificado em três casos de co- infecção, dois deles foram co- infecções de DEN-3/DEN-4 e um DEN-2 / DEN-4. Foi observada uma incidência de DEN-3 em relação ao DEN-2 e DEN-4, e a ausência da circulação de DEN-1.

Made available in DSpace on 2014-06-12T18:07:46Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo788_1.pdf: 6555783 bytes, checksum: 65caeaca8f8ce8753df4239098b98438 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2010 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Os vírus dengue (DENV) são responsáveis por um amplo espectro de manifestações clínicas em diversas partes do mundo. Muitos mecanismos moleculares da biologia do DENV, incluindo replicação do genoma e patogênese viral, ainda não foram totalmente compreendidos. Novos avanços na elucidação destes mecanismos vêm sendo facilitados pelo desenvolvimento dos sistemas de genética reversa nas últimas décadas. No presente trabalho, nós descrevemos o desenvolvimento de um sistema de genética reversa para o vírus dengue tipo 3 (DENV3). Usando um sistema de dois plasmídeos, o genoma do DENV3 foi dividido em duas partes por PCR e os fragmentos gerados foram clonados em separado num vetor plasmidial. Um sítio de restrição foi inserido em ambas as construções, permitindo a posterior recuperação do genoma completo por ligação in vitro. Todos os plasmídeos foram construídos pela técnica de recombinação homóloga em levedura e propagados nela para prevenir qualquer instabilidade dos insertos em E. coli. A identidade das construções foi confirmada por sequenciamento, no qual foram identificadas mutações no genoma clonado. Para a recuperação do clone infeccioso in vitro, as duas partes dos genomas foram amplificadas por PCR, digeridas e unidas por ligação in vitro. Dois clones infecciosos foram recuperados e a transcrição in vitro, do produto das ligações, produziram RNAs virais genômicos. Células BHK-21, transfectadas por eletroporação com os RNAs sintetizados, foram avaliadas por ensaio de imunofluorescência, mostrando que estes RNAs são infecciosos. Após sucessivas passagens em cultivo celular, os DENV3 recuperados foram caracterizados in vitro. RT-PCR, a partir de RNA viral, e a análise de fragmentos de restrição confirmaram que ambos os vírus recuperados foram derivados do nosso sistema de dois plasmídeos. No ensaio de placa, os clones apresentaram fenótipos distintos. Após coloração convencional, enquanto o clone ICDENV3 #L43 apresentou placas com morfologia similar ao DENV3 selvagem, o clone ICDENV3 #L42 foi incapaz de formar placas. A análise de sequenciamento, a partir dos produtos de RT-PCR, identificou mutações específicas em cada um dos clones, as quais podem facilitar o crescimento dos vírus recuperados em cultivo celular. Este sistema é uma poderosa ferramenta que nos ajudará a elucidar aspectos moleculares da biologia do DENV, bem como a entender a relação entre mutações específicas e a patogênese do DENV

Pesquisas sobre Listeria monocytogenes em indústrias de produtos lácteos no Brasil são escassas. Três laticínios (A, B e C) produtores de queijos do Estado de São Paulo foram monitorados para a presença de L. monocytogenes no período de outubro/2008 a setembro/2009. Foram realizadas 12 coletas, correspondentes a 12 lotes de queijo produzidos, sendo quatro de cada laticínio. Em cada laticínio, as visitas foram realizadas com intervalos de aproximadamente 2 meses entre cada uma. Foram analisadas 393 amostras, sendo 201 de superfícies com e sem contato com alimentos e 192 de alimentos (leite cru e pasteurizado e queijo) água e salmoura, para pesquisa de L. monocytogenes. As análises foram realizadas de acordo com o método do Food and Drug Administration (FDA). Os resultados confirmam a presença de Listeria spp nas instalações dos três laticínios. L. monocytogenes, L. innocua, L. seeligeri e L. welshimeri foram as espécies isoladas neste estudo. Especificamente a espécie L. monocytogenes não foi encontrada no laticínio A, entretanto, o microrganismo foi isolado de 12,5% das amostras do laticínio B e de 9,1% do laticínio C. L. monocytogenes não foi isolada do leite cru dos silos, do leite pasteurizado, da água e dos queijos Minas frescal, nos 3 laticínios. Porém, no laticínio C, L. monocytogenes foi isolada de amostras de queijo Prato que foram incluídas apenas na 4ª coleta deste laticínio, além de ter sido isolada de amostras de salmoura. As maiores prevalências de contaminação por L. monocytogenes ocorreram em superfícies sem contato com alimentos, sendo positivas 51,6% das amostras do laticínio B e 21,7% do laticínio C. Em ambos os laticínios a bactéria também foi isolada de superfícies com contato com alimentos. Os resultados fornecem informações detalhadas dos pontos prioritários para o desenvolvimento de estratégias de controle de L. monocytogenes em laticínios e mostram a importância de programas de monitoramento ambiental do patógeno, mesmo em pequenas indústrias. Os 85 isolados identificados como L. monocytogenes revelaram-se de quatro sorotipos: 1/2a, 1/2b, 1/2c e 4b, com predomínio do 4b, em ambos os laticínios, o que é preocupante para a saúde pública. Com base nos resultados de PFGE (perfis combinados ApaI e AscI), 40 perfis (pulsotipos) foram obtidos. Pulsotipos foram isolados repetidamente entre coletas nos laticínios B e C, sugerindo persistência de linhagens nos laticínios. Apesar dos laticínios serem distantes e independentes, um pulsotipo foi compartilhado entre ambos. O laticínio A apresentou contaminação por mais de um pulsotipo de L. seeligeri e houve isolamento repetido de um pulsotipo dessa espécie, entre as coletas, sugerindo adaptação da bactéria e necessidade de controle do gênero Listeria nessa indústria. A ocorrência de um mesmo pulsotipo de L. monocytogenes com sorotipos diferentes (1/2b e 4b) mostra que a sorotipagem deve acompanhar análises mais refinadas como as de natureza genotípica. / Listeria monocytogenes surveys in cheese manufacturing plants in Brazil are rare. Three cheese manufacturing plants (A, B and C) in São Paulo state were monitored for the presence of Listeria monocytogenes during the period of October/2008 - September/2009. Twelve samples surveys were taken corresponding to 12 cheese lots produced, four in each plant. In each cheese plant, the samples were taken at intervals of approximately 2 months. There were 393 samples analyzed, 201 from surfaces with and without contact with food and 192 of food (raw and pasteurized milk and cheese), water and brine, with the objective of searching for L. monocytogenes. The analyses were performed in accordance with Food and Drug Administration (FDA) method. The results confirmed the presence of Listeria spp in the facilities of three plants. L. monocytogenes, L. innocua, L. seeligeri and L. weshimeri were the species isolated in this study. Specifically the L. monocytogenes specie was not isolated from plant A. However, the microorganism was isolated in 12.5% of the samples from plant B and 9.1% from plant C. Listeria monocytogenes was not isolated from raw milk in storage tanks, pasteurized milk, water or Minas frescal cheese samples from the three plants. Nevertheless, in plant C, L. monocytogenes was isolated in Prato cheese that was included only in the 4th sampling survey and also from the brine samples. The major prevalence of contamination by L. monocytogenes occurred on surfaces without contact with food, with 51.6% of the samples positive from plant B and 21.7% from plant C. In both plants, the microorganism was also isolated from food contact surfaces. The results provide detailed information about the critical points for the development of L. monocytogenes control strategies in cheese processing plants and, moreover, show the relevance of sampling programs of the pathogen, even in small cheese processing plants. The 85 isolates identified as L. monocytogenes were classified in four serotypes: 1/2a, 1/2b, 1/2c and 4b, with 4b dominating in both cheese plants, which is of concern to human health. On the basis of PFGE results (combined profiles ApaI and AscI), 40 profiles (pulsotypes) were found. Pulsotypes were isolated repeatedly among sampling surveys in plants B and C, suggesting persistence of lineages in the plants. Despite these plants being distant and independent, one pulsotype was shared between them. Plant A presented contamination by more than one pulsotype of L. seeligeri and there was a repetitive isolation of one pulsotype of this specie among samplings, suggesting adaptation of the bacterium and the need for control of the Listeria genus in this plant. The occurrence of one single pulsotype of L. monocytogenes with different serotypes (1/2b and 4b) show that serotyping should follow more refined analyses as the ones of genotypic nature.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2017-01-27T13:32:41Z No. of bitstreams: 1 FabianaLimaBezerra_TESE.pdf: 4985146 bytes, checksum: ce1c1005e6775f052912c875b1d39910 (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2017-01-31T13:32:42Z (GMT) No. of bitstreams: 1 FabianaLimaBezerra_TESE.pdf: 4985146 bytes, checksum: ce1c1005e6775f052912c875b1d39910 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-31T13:32:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 FabianaLimaBezerra_TESE.pdf: 4985146 bytes, checksum: ce1c1005e6775f052912c875b1d39910 (MD5) Previous issue date: 2016-06-14 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico (CNPq) / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / A dengue ? a mais importante arbovirose que afeta o homem e constitui-se em um grave problema de sa?de p?blica. A doen?a ? end?mica em regi?es tropicais e subtropicais, abrangendo mais de 100 pa?ses, correspondendo ? metade da popula??o mundial. As epidemias s?o recorrentes e estima-se que os v?rus da dengue causem 390 milh?es de infec??es a cada ano, sendo uma importante causa de morbidade. Apesar desse cen?rio, atualmente, ainda n?o se disp?e de um antiviral contra a dengue. Neste contexto, diversos estudos relatam a atividade antiviral dos polissacar?deos sulfatados obtidos das algas marinhas contra v?rus envelopados, cuja a??o est? associada ? interfer?ncia nas etapas iniciais do processo de infec??o viral. Neste estudo, avaliou-se a potencial atividade antiviral de extratos brutos ricos em polissacar?deos sulfatados obtidos das algas marrons Dictyota menstrualis (EBDMens) e Dictyota mertensii (EBDM) e das algas verdes Codium isthmocladum (EBCI) e Caulerpa sertularioides (EBCS) contra o v?rus dengue 2 (DENV-2), em linhagem de c?lulas Vero, usando diferentes estrat?gias metodol?gicas (tratamento simult?neo, tratamento p?s-infec??o, pr?-tratamento da c?lula, pr?tratamento do v?rus, adsor??o, p?s-adsor??o e penetra??o). A citotoxicidade dos extratos foi analisada pelo ensaio de redu??o do MTT. O estudo da atividade antiviral foi determinado pela quantifica??o do n?mero de c?pias do RNA viral por RT-qPCR ap?s 120 h de infec??o. Nenhum extrato exibiu toxicidade para as c?lulas Vero no ensaio de redu??o do MTT na concentra??o de 100 ?g/mL. Todos os extratos exibiram atividade antiviral quando adicionados durante os primeiros 90 minutos de infec??o, demonstrando redu??o significativa no n?mero de c?pias do RNA viral ap?s 120 horas. Os extratos EBDMens e EBDM foram mais eficazes nos ensaios de pr?-tratamento da c?lula e do v?rus, e o primeiro exerceu atividade antiviral superior ao EBDM durante a adsor??o viral. Os extratos EBCI e EBCS apresentaram atividade antiviral semelhante no ensaio de pr?-tratamento da c?lula. O EBCI foi mais eficaz na redu??o da adsor??o do DENV-2 em c?lulas Vero. Por?m, o EBCS se mostrou mais eficiente nos ensaios de pr?-tratamento do v?rus e penetra??o. Dentre os extratos avaliados, o EBCS parece ser o mais efetivo no combate ao DENV-2. Estes resultados revelam o potencial desses extratos ricos em polissacar?deos sulfatados como compostos com a??o antiviral, sugerindo que eles atuam nos est?gios iniciais da infec??o por DENV-2. / Dengue is considered the most important human arboviruses, and is a serious public health problem. This disease is endemic in tropical and subtropical regions, reaching more than 100 countries, which means the half of world population, and those epidemies have been appellant. It is estimated that Dengue virus could cause 390 millions of infections each year, and is an important cause of morbidity. Although this scenario, actually doesn?t exist a dengue antivirals still. Sorts of studies have showed antivirus activity of seaweed sulfated polysaccharides against enveloped viruses, which action seems to be associated to initials steps of infection process. In this study, was evaluated the potential antiviral activity of crude extracts rich in sulfated polysaccharides obtained from the brown algae Dyctiota menstrualis (EBDMens) and Dyctiota mertensii (EBDM), and green algae Codium isthmocladium (EBCl) and Caulerpa sertularioides (EBCS), tested against Dengue virus 2 (DENV-2) in Vero cell line, by using different methodological strategies (simultaneous treatment, post-infection treatment, cell pre-treatment, virus pre-treatment, adsorption, post-adsorption and penetration). The extracts cytotoxicity was evaluated by MTT reduction assay. The study of antiviral activity was determinated by quantifying viral RNA load using RT-qPCR, after 120 hours of infection. None extract has showed toxicity against Vero Cells in MTT reduction assay with 100 ?g/mL concentration. All extracts have shown antiviral activity when added during the first 90 minutes of infection, and a significant reduction of viral RNA number of copies after 120 hours. The EBDMens and EBDM extracts were more efficient to cell and virus pretreatment assays, and the first has showed higher antiviral activity than EBDM during viral adsorption. The EBCI and EBCS extracts have presented antiviral activity very similar in cell pre-treatment assay. EBCI was more efficient in the reduction of DENV-2 adsorption in Vero cell. However, EBCS has showed more efficient in cell pre-treatment and penetration assays. Between the extracts evaluated, EBCS seems to be more effective against DENV-2. These results have showed potential action of extracts rich in sulfated polysaccharides with antivirus activity, suggesting that they act in the initials steps of infection process of DENV-2.

Pesquisas sobre Listeria monocytogenes em indústrias de produtos lácteos no Brasil são escassas. Três laticínios (A, B e C) produtores de queijos do Estado de São Paulo foram monitorados para a presença de L. monocytogenes no período de outubro/2008 a setembro/2009. Foram realizadas 12 coletas, correspondentes a 12 lotes de queijo produzidos, sendo quatro de cada laticínio. Em cada laticínio, as visitas foram realizadas com intervalos de aproximadamente 2 meses entre cada uma. Foram analisadas 393 amostras, sendo 201 de superfícies com e sem contato com alimentos e 192 de alimentos (leite cru e pasteurizado e queijo) água e salmoura, para pesquisa de L. monocytogenes. As análises foram realizadas de acordo com o método do Food and Drug Administration (FDA). Os resultados confirmam a presença de Listeria spp nas instalações dos três laticínios. L. monocytogenes, L. innocua, L. seeligeri e L. welshimeri foram as espécies isoladas neste estudo. Especificamente a espécie L. monocytogenes não foi encontrada no laticínio A, entretanto, o microrganismo foi isolado de 12,5% das amostras do laticínio B e de 9,1% do laticínio C. L. monocytogenes não foi isolada do leite cru dos silos, do leite pasteurizado, da água e dos queijos Minas frescal, nos 3 laticínios. Porém, no laticínio C, L. monocytogenes foi isolada de amostras de queijo Prato que foram incluídas apenas na 4ª coleta deste laticínio, além de ter sido isolada de amostras de salmoura. As maiores prevalências de contaminação por L. monocytogenes ocorreram em superfícies sem contato com alimentos, sendo positivas 51,6% das amostras do laticínio B e 21,7% do laticínio C. Em ambos os laticínios a bactéria também foi isolada de superfícies com contato com alimentos. Os resultados fornecem informações detalhadas dos pontos prioritários para o desenvolvimento de estratégias de controle de L. monocytogenes em laticínios e mostram a importância de programas de monitoramento ambiental do patógeno, mesmo em pequenas indústrias. Os 85 isolados identificados como L. monocytogenes revelaram-se de quatro sorotipos: 1/2a, 1/2b, 1/2c e 4b, com predomínio do 4b, em ambos os laticínios, o que é preocupante para a saúde pública. Com base nos resultados de PFGE (perfis combinados ApaI e AscI), 40 perfis (pulsotipos) foram obtidos. Pulsotipos foram isolados repetidamente entre coletas nos laticínios B e C, sugerindo persistência de linhagens nos laticínios. Apesar dos laticínios serem distantes e independentes, um pulsotipo foi compartilhado entre ambos. O laticínio A apresentou contaminação por mais de um pulsotipo de L. seeligeri e houve isolamento repetido de um pulsotipo dessa espécie, entre as coletas, sugerindo adaptação da bactéria e necessidade de controle do gênero Listeria nessa indústria. A ocorrência de um mesmo pulsotipo de L. monocytogenes com sorotipos diferentes (1/2b e 4b) mostra que a sorotipagem deve acompanhar análises mais refinadas como as de natureza genotípica. / Listeria monocytogenes surveys in cheese manufacturing plants in Brazil are rare. Three cheese manufacturing plants (A, B and C) in São Paulo state were monitored for the presence of Listeria monocytogenes during the period of October/2008 - September/2009. Twelve samples surveys were taken corresponding to 12 cheese lots produced, four in each plant. In each cheese plant, the samples were taken at intervals of approximately 2 months. There were 393 samples analyzed, 201 from surfaces with and without contact with food and 192 of food (raw and pasteurized milk and cheese), water and brine, with the objective of searching for L. monocytogenes. The analyses were performed in accordance with Food and Drug Administration (FDA) method. The results confirmed the presence of Listeria spp in the facilities of three plants. L. monocytogenes, L. innocua, L. seeligeri and L. weshimeri were the species isolated in this study. Specifically the L. monocytogenes specie was not isolated from plant A. However, the microorganism was isolated in 12.5% of the samples from plant B and 9.1% from plant C. Listeria monocytogenes was not isolated from raw milk in storage tanks, pasteurized milk, water or Minas frescal cheese samples from the three plants. Nevertheless, in plant C, L. monocytogenes was isolated in Prato cheese that was included only in the 4th sampling survey and also from the brine samples. The major prevalence of contamination by L. monocytogenes occurred on surfaces without contact with food, with 51.6% of the samples positive from plant B and 21.7% from plant C. In both plants, the microorganism was also isolated from food contact surfaces. The results provide detailed information about the critical points for the development of L. monocytogenes control strategies in cheese processing plants and, moreover, show the relevance of sampling programs of the pathogen, even in small cheese processing plants. The 85 isolates identified as L. monocytogenes were classified in four serotypes: 1/2a, 1/2b, 1/2c and 4b, with 4b dominating in both cheese plants, which is of concern to human health. On the basis of PFGE results (combined profiles ApaI and AscI), 40 profiles (pulsotypes) were found. Pulsotypes were isolated repeatedly among sampling surveys in plants B and C, suggesting persistence of lineages in the plants. Despite these plants being distant and independent, one pulsotype was shared between them. Plant A presented contamination by more than one pulsotype of L. seeligeri and there was a repetitive isolation of one pulsotype of this specie among samplings, suggesting adaptation of the bacterium and the need for control of the Listeria genus in this plant. The occurrence of one single pulsotype of L. monocytogenes with different serotypes (1/2b and 4b) show that serotyping should follow more refined analyses as the ones of genotypic nature.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Na região Norte, Roraima destaca-se como um dos Estados hiper-endêmicos para o dengue, com circulação dos quatro sorotipos nos últimos três anos, e com uma elevada incidência da doença na última década. Por outro lado, sua localização geográfica tem um papel importante na entrada de novos genótipos/sorotipos do dengue ao Brasil. O DENV-1, depois de uma breve incursão no estado nos anos de 1981-1982, foi reintroduzido no ano 2000, e tem sido um dos sorotipos mais isolados até o ano de 2011, porém, existem poucos dados que mostram a ocorrência de variabilidade genética ou de alguma evolução na composição genética deste sorotipo durante as infecções ocorridas nos diferentes anos. O objetivo deste trabalho foi realizar a caracterização molecular do gene do envelope de isolados de DENV-1 durante epidemias ocorridas no período de 2008 a 2010 no estado de Roraima. As amostras foram inoculadas em células da linhagem C6/36 de Aedes albopictus, e identificadas por imunoflorescência indireta e pela técnica de RT-Hemi-Nested-PCR. Para a obtenção de um amplicom da região do envelope, uma RT-PCR foi realizada com o uso de iniciadores específicos, gerando um produto com 1724 pb. Os amplicons foram sequenciados e as sequências consenso foram obtidas usando o programa Geneious v.5.5.4. Para realização da análise molecular, as sequências foram comparadas com sequências referência dos quatro sorotipos do vírus dengue, e dos cinco genótipos do DENV-1 de diferentes partes do mundo, disponíveis no GenBank. A reconstrução filogenética foi realizada por dois métodos, o de Máxima Verossimilhança e o Bayesiano. Todos os isolados foram agrupados no genótipo V do DENV-1. As sequências utilizadas neste estudo apresentaram de 99-100% de similaridade com cepas de DENV-1 de Países e Estado vizinhos, como República Bolivariana da Venezuela, Guiana Inglesa, Colômbia e Amazonas, e se agruparam na árvore filogenética formando um subclado com cepas destes países e com outros da região do Caribe, indicando, mais uma vez, Roraima, como possível via de entrada de sorotipos/genótipos de dengue no país, fato totalmente comprovado quando houve a entrada e dispersão do genótipo II do vírus DENV-4 no ano de 2010. As cepas brasileiras do genótipo V do DENV-1 formaram três linhagens distintas. Os isolados deste estudo (2008-2010) se agruparam na linhagem III, diferente da cepa que circulou no Estado no de 2001, a qual era pertencente à linhagem II. Ao comparar estas sequências, foram encontradas quatro substituições de aminoácidos, duas (E428 e E436) provavelmente neutras que não modificaram a conformação tridimensional do envelope, pois trocaram aminoácidos de características físico-químicas similares (Leucina x Valina; Isoleucina x Valina) e duas substituições (E227 e E338) com alta probabilidade de modificar o envelope (Prolina x Serina; Leucina x Serina). Estes resultados provavelmente indicam uma evolução adaptativa no DENV-1, ou entrada de uma nova linhagem ao Estado, enfatizando a importância do monitoramento molecular de cepas de DENV circulantes em determinada região, permitindo um melhor entendimento do vírus. / In northern Brazil, Roraima is highlighted as one of the dengue virus hyperendemic states, where the four serotypes has been circulating for the last three years and with a high incidence of this disease in the last decade. On the other hand, its geographic localization has an important part on the entry of new genotypes/serotypes of dengue in Brazil. DENV-1, after a short incursion in the state in years 1981 and 1982, was reintroduced in 2000 and it was one of most isolated serotypes until 2011. Nevertheless, there is little data that shows the occurrence of genetic variability or any evolution in genetic composition from this serotype on infections occurred in different years. The objective of this project was to perform a molecular characterization of the envelope gene isolated from DENV-1 on infections occurred between 2008 and 2010 in Roraima. The samples were inoculated in C6/36 cells from Aedes albopictus, and identified by indirect immunofluorescence and RT-Hemi-Nested-PCR techniques. To obtain an amplicom from the envelope region, it was made an RT-PCR test with specific primers, generating a product with 1724 bp. The amplicons were sequenced and the consensus sequences were obtained using the program Geneious V.5.5.4. For molecular analysis, the current sequences were compared to sequences from the four serotypes of dengue virus and also compared to five genotypes of DENV-1 from different parts of the world available on GenBank. The phylogenetic reconstruction was made by two methods, Maximum-likelihood and Bayesian. All of the isolates were grouped in genotype V of DENV-1. The sequences showed 99-100% of similarity with strains of DENV-1 from neighbor countries and states as the Bolivarian Republic of Venezuela, Guyana, Colombia and Amazonas, they were grouped on a phylogenetic tree forming a subclade with strains of these countries and Caribbean region, and besides indicating, once more, Roraima as a possible entry route of serotypes/genotypes of dengue in Brazil, fact totally proven in 2010 with the entry and dispersion of genotypes II of DENV-4. The Brazilian strains of genotype V of DENV-1 formed three distinct lineages. The isolates of this study (2008-2010) were grouped in lineage III, different from the strain that circulated in the state in 2001, which belonged to lineage II. When these sequences were compared, it was found four aminoacid substitutions, two of them (E428 e E436) probably neutral which did not change tridimensional conformation of the envelope, since amino acids with similar physicochemical characteristics were changed (Leucine x Valine; Isoleucine x Valine), and two substitutions (E227 e E338) with high probability of changing the envelope (Proline x Serine; Leucine x Serine). These results may indicate an adaptive evolution of DENV-1 or the entry of a new lineage in the State, emphasizing the importance of molecular monitoring strains of DENV in circulation in certain regions, allowing better understanding of the virus.

A dengue é uma doença infecciosa de transmitida pela picada de mosquitos do gênero Aedes. O vírus da dengue (DENV), pertencente ao gênero Flavivirus, família Flaviviridae, é atualmente um importante problema de saúde pública em todo o mundo. São reconhecidos quatro sorotipos antigenicamente distintos (DENV-1, -2, -3 e -4). A doença causada por qualquer um dos sorotipos cursa de forma assintomática ou com quadro clínico que varia desde uma febre indiferenciada e autolimitada, passando pela febre clássica da dengue (FD) até quadros graves de febre hemorrágica da dengue (DHF). O diagnóstico clínico é difícil de ser realizado principalmente na fase aguda da doença em que os sintomas são muito similares aos de outras infecções febris agudas, ficando a cargo do laboratório o diagnóstico definitivo. Os métodos sorológicos para detecção de anticorpos IgM/IgG são os mais amplamente utilizados, mas inadequados para diagnóstico precoce uma vez que detectam anticorpos a partir do sexto dia do início dos sintomas. Os métodos moleculares estão sendo cada vez mais utilizados para o diagnóstico precoce por serem mais rápidos e sensíveis que a sorologia e o isolamento viral. Neste estudo comparamos a sensibilidade de uma RT-PCR em tempo real gênero específica com um ELISA para detecção da proteína NS1 comercialmente disponível analisando amostras de soro de pacientes com dengue. Também foram desenvolvidos dois protocolos de RT-PCR em tempo real para identificação do sorotipo viral, uma contendo primers para extremidade 5 do genoma viral e outra contendo primers para a região codificadora da proteína NS5. A RT-PCR em tempo real gênero específica mostrou-se mais sensível que o ELISA, principalmente nas amostras que apresentavam baixa carga viral. A RT-PCR em tempo real contendo os primers para a extremidade 5 apresentou uma sensibilidade baixa quando comparada com a RT-PCR genérica, porém foi mais sensível que aquela contendo os primers para a região codificadora da proteína NS5. Considerando os resultados obtidos, sugerimos uma estratégia de triagem dos casos suspeitos de dengue utilizando a RT-PCR genérica para posteriormente identificar o sorotipo viral com o protocolo que utiliza os primers da extremidade 5. Embora este último protocolo tenha sido pouco sensível, a identificação do sorotipo infectante em algumas amostras é suficiente para definir qual o sorotipo circulante durante uma epidemia. / Dengue is an infectious disease transmitted by the biting of mosquitoes of Aedes genus. Dengue virus (DENV), belonging to the Flavivirus genus, Flaviviridae family, is an important public health problem worldwide. Four antigenically distinct viruses are recognized (DENV-1, -2, -3, e -4). Infection with any of the virus serotypes causes a spectrum of the illness ranging from inapparent or mid viral syndrome to classic dengue fever (DF) and severe hemorrhagic disease (DHF). The clinical diagnosis is difficult especially in the acute phase of the disease when the symptoms are very similar to other febrile illness, corresponding to the laboratory the definitive diagnosis. Serological methods detecting antibodies IgM/IgG are the more widely used; however, they are inappropriate for early diagnosis since these methods detect antibodies after six day of the onset of symptoms. The molecular methods are more frequently used for the early diagnosis because they are faster and more sensitive than serological methods and virus isolation. In this study, we have compared the sensitivity of a generic real time RT-PCR with a commercial ELISA for the NS1 protein analyzing serum samples from patients with dengue virus infection. We have also developed two protocols of real time RT-PCR to identify dengue serotype, one of them containing primers to the 5 end and the other, primers to the NS5 coding region. The generic real time RT-PCR showed to be more sensitive than the ELISA, principally, between the samples with low viral load. The real time RT-PCR containing primers to the 5 end showed a lower sensitivity than the generic real time RT-PCR; however, it was more sensitive than that containing primers to the NS5 coding region. Considering these results, we suggest the use of the generic real time RT-PCR to screen the dengue suspected cases and then to identify the serotype using the protocol that include the primers to the 5 end. Although the last protocol has shown a low sensitive, the identification of the infecting serotype in some of the samples is enough to define which serotype is circulating during the epidemic period.

Objetivos: Avaliar o impacto global, direto, indireto e a tendência da duração de proteção da vacinação contra o Haemophilus influenzae tipo b (Hib), no estado de São Paulo (ESP) e no município de São Paulo (MSP), na população de 0 - 59 meses, comparando os períodos pré-vacinal (1996 - 1998) e pós-vacinal (2001 - 2009). Métodos: estudo com componente descritivo e de cunho analítico, retrospectivo. A população de estudo incluiu os menores de cinco anos residentes no ESP e no MSP. Adotou-se como definição de caso confirmado o menor de cinco anos identificado como positivo para o Hib em cultura e/ou contraimunoeletroforese e/ou látex e/ou RT-PCR, em amostra de LCR e sangue, e/ou vínculo epidemiológico. Os dados foram obtidos a partir do SINAN, SIGH-Web Instituto Adolfo Lutz e Fundação IBGE. As variáveis de estudo incluíram as demográficas, clínicas e relativas ao agente, apresentadas em séries temporais e períodos estabelecidos para parametrização e comparabilidade. O parâmetro das avaliações de impacto foi a magnitude da variação da incidência de meningite causada pelo Hib. Para cada estimativa de impacto construiu-se um Intervalo de Confiança (IC) de 95 por cento a partir do cálculo de Risco Relativo (RR). As estimativas do risco relativo (RR) e os respectivos intervalos de 95 por cento de confiança foram analisados utilizando-se o software R. Resultados: nos períodos considerados, foram descritos 1.561 casos confirmados de meningites por Hib no ESP, sendo 27,16 por cento (424/1.561) no MSP, e 80,78 por cento (1.261/1.561) dos casos foram registrados em menores de cinco anos. A maioria dos casos foi confirmada por cultura, com percentual médio de 65 por cento no ESP e 66 por cento no MSP. As taxas médias de incidência de meningites por Hib mais significativas no período pré-vacinal verificaram-se nos menores de um ano (30,56/105- ESP; 32,06/105 - MSP), considerada a faixa etária de maior risco de adoecimento. Após a introdução da vacina contra o Hib em 1999 (menores de dois anos), as taxas de incidência de meningites por Hib declinaram de forma sustentável nos períodos subsequentes analisados. A incidência de meningite por Hib durante o período pós-vacinal variou de 4,02/105- 1,68/105 nos menores de um ano, no ESP e MSP respectivamente e, de forma similar, de 1,43/105 1,01/105 nos menores de cinco anos. Nos menores de 7 - 23 meses (impacto direto), o percentual de redução foi de 95,11 por cento [66,43 - 99,29] no ESP e 95,91 por cento [70,63 - 99,43] no MSP. O impacto global observado nos menores de cinco anos foi 88,19 por cento [26,58 - 98,10] no ESP e 91,06 por cento [33,99 - 98,79] no MSP. Os dados de vigilância mostram que os casos de meningites por Hib continuam ocorrendo, porém em níveis baixos, ao longo de 10 anos após a introdução do esquema de três doses primárias da vacina conjugada específica. Conclusão: a partir deste racional pode-se inferir a utilidade prática e econômica a favor desta modalidade programática adotada no território paulista, com a evidência de redução relativa de meningites por Hib. / Objectives: To evaluate global impact, direct and indirect, as well as the tendency of the duration of vaccine protection against Haemophilus influenzae type b (Hib) in the state of São Paulo (ESP) and in the city of São Paulo (MSP), amongst the population between 0-59 months of age during the periods pre-vaccine (1996-1998) and post vaccine (2001-2009). Methods: a retrospective study with a descriptive component and with analytic venue. Studied population included children under five years old, dwelling in ESP and MSP. Criteria adopted as definition of confirmed case was child under five years of age identified as positive for Hib in culture and/or counterimmunelectroforesis and/or latex and/or RT/PCR, in LCR sample and blood. and/or epidemiologic link. Data were obtained from the SINAN, SIGH-Web Instituto Adolfo Lutz and IBGE Foundation. Variables under study included socio-demographic and clinical ones, and those related to the agent; they were presented in temporal series and periods established in order to allow parametric and comparison. Impact evaluation was established upon the variation of incidence magnitude of meningitis caused by Hib. For each impact estimate a Confidence Interval (IC) of 95 per cent from the calculus of Relative Risk (RR). Estimates of relative risk (RR) and the respective intervals of 95 per cent confidence were analyzed employing the R software. Results: During the analyzed periods 1561 confirmed cases of meningitis caused by Hib were described in the state of São Paulo, 27.16 per cent of which (424/1561) in MSP; 80.78 per cent (1261/1561) of the registered cases occurred in children under five years of age. The majority of the cases were confirmed by culture, with an average percentage of 65 per cent in ESP and 66 per cent in MSP. More significant average rates of meningitis per Hib during the pre-vaccine period were registered in children under one year of age (30.56/105- ESP; 32.06/105 - MSP), considered the bracket under higher risk of disease. After the introduction of the vaccine against Hib, in 1999 (for children under two years of age), the rates of meningitis incidence per Hib decreased in sustainable fashion for the subsequent periods analyzed. The incidence of meningitis per Hib during the post vaccine period varied from 4.02/105 - 1.68/105 for children under one year old, in ESP and MSP, respectively and, in similar way, from 1.43/105 to 1.01/105 for those under five years old. For children between 7-23 months old (direct impact), the percentage of reduction was of 95.11 per cent [66.43 - 99.29] in ESP and 95.91 per cent [70.63 - 99.43] in MSP, whereas the global impact observed in children under five years old was 88.19 per cent [26.58 - 98.10] in ESP and 91.06 per cent [33.99 98.79] in MSP. Surveillance data show that cases of meningitis by Hib continue to occur but in low levels along 10 years after the introduction of the three doses primary scheme of administration of the specific conjugated vaccine. Conclusion: from this rationale, it is possible to infer the practical and economic utility favoring this programmatic modality adopted in São Paulo, with the evidence of the relative reduction of meningitis caused by Hib.

A dengue é uma doença infecciosa de transmitida pela picada de mosquitos do gênero Aedes. O vírus da dengue (DENV), pertencente ao gênero Flavivirus, família Flaviviridae, é atualmente um importante problema de saúde pública em todo o mundo. São reconhecidos quatro sorotipos antigenicamente distintos (DENV-1, -2, -3 e -4). A doença causada por qualquer um dos sorotipos cursa de forma assintomática ou com quadro clínico que varia desde uma febre indiferenciada e autolimitada, passando pela febre clássica da dengue (FD) até quadros graves de febre hemorrágica da dengue (DHF). O diagnóstico clínico é difícil de ser realizado principalmente na fase aguda da doença em que os sintomas são muito similares aos de outras infecções febris agudas, ficando a cargo do laboratório o diagnóstico definitivo. Os métodos sorológicos para detecção de anticorpos IgM/IgG são os mais amplamente utilizados, mas inadequados para diagnóstico precoce uma vez que detectam anticorpos a partir do sexto dia do início dos sintomas. Os métodos moleculares estão sendo cada vez mais utilizados para o diagnóstico precoce por serem mais rápidos e sensíveis que a sorologia e o isolamento viral. Neste estudo comparamos a sensibilidade de uma RT-PCR em tempo real gênero específica com um ELISA para detecção da proteína NS1 comercialmente disponível analisando amostras de soro de pacientes com dengue. Também foram desenvolvidos dois protocolos de RT-PCR em tempo real para identificação do sorotipo viral, uma contendo primers para extremidade 5 do genoma viral e outra contendo primers para a região codificadora da proteína NS5. A RT-PCR em tempo real gênero específica mostrou-se mais sensível que o ELISA, principalmente nas amostras que apresentavam baixa carga viral. A RT-PCR em tempo real contendo os primers para a extremidade 5 apresentou uma sensibilidade baixa quando comparada com a RT-PCR genérica, porém foi mais sensível que aquela contendo os primers para a região codificadora da proteína NS5. Considerando os resultados obtidos, sugerimos uma estratégia de triagem dos casos suspeitos de dengue utilizando a RT-PCR genérica para posteriormente identificar o sorotipo viral com o protocolo que utiliza os primers da extremidade 5. Embora este último protocolo tenha sido pouco sensível, a identificação do sorotipo infectante em algumas amostras é suficiente para definir qual o sorotipo circulante durante uma epidemia. / Dengue is an infectious disease transmitted by the biting of mosquitoes of Aedes genus. Dengue virus (DENV), belonging to the Flavivirus genus, Flaviviridae family, is an important public health problem worldwide. Four antigenically distinct viruses are recognized (DENV-1, -2, -3, e -4). Infection with any of the virus serotypes causes a spectrum of the illness ranging from inapparent or mid viral syndrome to classic dengue fever (DF) and severe hemorrhagic disease (DHF). The clinical diagnosis is difficult especially in the acute phase of the disease when the symptoms are very similar to other febrile illness, corresponding to the laboratory the definitive diagnosis. Serological methods detecting antibodies IgM/IgG are the more widely used; however, they are inappropriate for early diagnosis since these methods detect antibodies after six day of the onset of symptoms. The molecular methods are more frequently used for the early diagnosis because they are faster and more sensitive than serological methods and virus isolation. In this study, we have compared the sensitivity of a generic real time RT-PCR with a commercial ELISA for the NS1 protein analyzing serum samples from patients with dengue virus infection. We have also developed two protocols of real time RT-PCR to identify dengue serotype, one of them containing primers to the 5 end and the other, primers to the NS5 coding region. The generic real time RT-PCR showed to be more sensitive than the ELISA, principally, between the samples with low viral load. The real time RT-PCR containing primers to the 5 end showed a lower sensitivity than the generic real time RT-PCR; however, it was more sensitive than that containing primers to the NS5 coding region. Considering these results, we suggest the use of the generic real time RT-PCR to screen the dengue suspected cases and then to identify the serotype using the protocol that include the primers to the 5 end. Although the last protocol has shown a low sensitive, the identification of the infecting serotype in some of the samples is enough to define which serotype is circulating during the epidemic period.