Large population declines for sand tiger sharks (Carcharias taurus) in parts of its global range are well documented, resulting in a strong need for biologically informed conservation and management measures. Although sand tigers in the western North Atlantic have been listed as a Species of Concern by the US government since 1997, details of their seasonal migratory movements and especially vertical habitat use patterns along the US East Coast are limited. Understanding these movement patterns is vital to reducing fishery-related mortality of these sharks and informing other management efforts aimed at recovery of their stocks in the US Atlantic. Although survey and fishery-dependent data have revealed a general picture of the seasonal distribution patterns of sand tiger sharks, details of the areas specifically used by these sharks and their movements between such areas remain unclear. Additionally, information on vertical habitat use such as preferred depth and temperature, as well as variability observed among sexes, size classes and geographic locations would provide insight into the fine-scale distribution of sand tigers to aid better management practices. Here, I report on the horizontal and vertical movements of sand tiger sharks along the US East Coast determined through use of pop-up archival transmitter (PAT) tags and supplemental acoustic telemetry. PAT tags were deployed on 14 sand tiger sharks in Delaware Bay in late summer 2008. Sufficient archived depth and temperature data were obtained from 11 sharks (eight male, three female), and sufficient light data allowed construction of long-term horizontal tracks for 10 sharks (seven male, three female) using a Kalman filter state-space model. Duration of tag deployment per animal ranged from 64-154 days ( =121.6). All seven male sharks left Delaware Bay in late summer/early autumn and migrated south along the US East Coast reaching waters off North Carolina, where they remained until transmitter detachment during the winter months. In contrast, all three females moved out of Delaware Bay into deeper, offshore waters east of the bay near the continental slope. During southern migration of males, average depth utilized was positively correlated to shark size. The smallest males spent on average over 90% of their time in waters <40 >m, whereas intermediate and large sized males spent only 54 and 38% of their time at depths <40 >m, respectively. Female sharks spent an average of 46% of their time in waters range, spending at least 95% of their time in waters 17-23oC, with little difference between size classes or sexes. Horizontal movements of male migrating sand tigers also revealed several areas of concentrated activity along their southern migratory routes. Migratory patterns of sand tiger sharks along the US East Coast appear most similar to patterns displayed by this species along the coast of South America. Further delineation of western North Atlantic continental shelf and slope core areas of sand tiger shark activity, especially for females, will inform efforts to reduce interactions with commercial fisheries and measures to avoid habitat degradation - management aspects that will aid in reducing mortality and enhance rebuilding of sand tiger stocks along the US East Coast.

Beef quality in Brazil is important for both consumers and the food industry due to high demand and competitiveness in the domestic and international markets. Therefore, it is necessary to develop research to improve beef quality of Nellore cattle (Bos indicus), mainly tenderness, one of the main features to add value to meat. New-generation technologies provide accurate, rapid and inexpensive information on the entire genome, showing great advantage over conventional methods for sequencing and gene expression. However, these new technologies generate large database, which require the use of bioinformatics tools for data analyses of sequencing and for a better understanding of biological regulation mechanisms , cellular control, gene interactions, among other applications. In a previous study, samples were collected from the Longissimus dorsi muscle of 790 animals from Nellore cattle and shear force assessments were made 24 hours after slaughter, with seven and 14 days of aging. Aiming to identify differentially expressed (DE) genes, 34 samples from Nellore animals with extreme levels of estimated breeding value (EBV) for shear force (SF) were selected, sequenced by the method of RNA sequencing (RNA-Seq) (Illumina HiScanSQ). This study performed the processing of data generated by RNA-Seq using software QuasiSeq and Cuffdiff. In the QuasiSeq analysis, 22 DE genes were found, while in the Cuffdiff analysis, 113 DE genes were found. To better understand the biological process involved in meat tenderness, integrative analysis identified possible regulators that can explain the activity of transcriptional regulation in this process using partial correlation coefficient with information theory (PCIT), phenotypic impact factor (PIF) and regulatory impact factor (RIF) methods. The genes found in the PCIT analysis USP2, GBR10, ANO1 and TMBIM4; microRNAs found in RIF analysis bta-mir-133a-2 and bta-mir-22, and the genes with high PIF value MB, ENO3, CA3 could be fundamental to unravel the complex molecular mechanisms that control the meat tenderness in Nellore cattle. / A qualidade da carne bovina no Brasil é importante tanto para o consumidor, como para a indústria alimentícia devido à alta competitividade e exigência do mercado nacional e internacional. Portanto, é necessário o desenvolvimento de pesquisas para melhorar a qualidade da carne bovina da raça Nelore (Bos indicus), principalmente a maciez, que é considerada uma das principais responsáveis por agregar valor à carne. Tecnologias de nova geração proporcionam informações precisas, rápidas e baratas de todo genoma, mostrando grande vantagem em relação aos métodos convencionais de sequenciamento e de estudos de expressão gênica. Essas novas tecnologias geram um grande volume de dados, sendo necessário o uso de ferramentas de bioinformática para realizar as análises de sequenciamento e ter uma maior compreensão de mecanismos biológicos de regulação, controle celular, interações gênicas, entre outras aplicações. Em um estudo prévio, foram coletadas amostras do músculo Longissimus dorsi de 790 animais da raça Nelore e foram realizadas avaliações da força de cisalhamento 24 horas após abate, e com sete e 14 dias de maturação. Com o objetivo de identificar genes diferencialmente expressos (DE), foram selecionadas no total 34 amostras de animais da raça Nelore com valores extremos de valor genético estimado (EBV) para força de cisalhamento (SF), e sequenciados pelo método de sequenciamento de RNA (RNA-Seq) (Illumina HiScanSQ). Neste estudo foi realizado o processamento dos dados gerados pelo RNA-Seq através dos softwares QuasiSeq e Cuffdiff. Foram encontrados 22 genes DE para as análises do QuasiSeq e 113 genes DE para as análises do Cuffdiff. Para melhor compreensão dos processos biológicos envolvidos na maciez da carne, análises integrativas identificaram possíveis reguladores que podem explicar a atividade de regulação transcricional neste processo utilizando os métodos do Coeficiente de Correlação Parcial com Teoria da Informação (PCIT), Fator de Impacto Fenotípico (PIF) e Fator de Impacto Regulatório (RIF). Os genes encontrados nas análises análises do PCIT USP2, GBR10, ANO1 e TMBIM4, assim como os microRNAs encontrados nas análises do RIF, bta-mir-133a-2 e bta-mir-22 e os genes de maior valor de PIF MB, ENO3, CA3 podem ser fundamentais para desvendar os complexos mecanismos moleculares que controlam a maciez da carne na raça Nelore.

The oviduct plays an important role in the complex process of fertilization and in the early phase of embryo development. Isolation and characterization of some components of bovine oviduct participating in the formation of oviductal sperm reservoir was a subject of the present study. Two affinity sorbents containing immobilized components of bull seminal plasma (non-separated proteins of bull seminal plasma and their phosphorylcholine binding fraction) were prepared and used for the study of interaction of immobilized ligands with components of oviductal epithelium. Two types of preparation of oviductal membrane proteins of the isthmus region were isolated: complete membrane proteins and the apical fraction of membrane proteins. These preparations were separated using prepared affinity matrices. in both cases only an insignificant amount of proteins was found in the adsorbed fractions. Further attention has been paid to the identification of four protein zones detected after electrophoretic separation in the presence of SDS (rel. mol. wt. 15 500 - 18 500) in the fraction of apical membrane proteins. These proteins were identified after the electrophoretic separation and tryptic digestion using MS analysis as bovine histones H4, H2A typ 2-C, H2B typ 1-K a H3.3. Proteins identified as bovine...

O objetivo deste estudo foi avaliar o efeito da produção do leite, das exigências líquidas de lactação e do peso de vacas de corte sobre a eficiência energética, econômica e ambiental do sistema de cria. Diversos genótipos utilizados no sistema de cria nacional foram avaliados em três experimentos tendo seus dados analisados por meta-análise. Os genótipos estudados foram Nelore (NL), Angus x Nelore (AN), Canchim x Nelore (CN), Caracu x Nelore (CR) e Simental Nelore (SN). Um experimento inicial definiu a melhor forma de avaliação da produção de leite e da forma da curva de lactação. Foram testadas as metodologias de pesagem do bezerro antes e após a mamada (PMP) e de ordenha mecânica (OM). Os resultados destes estudos permitiram primeiramente defender as seguintes questões: i) a técnica OM é melhor que PMP para predizer diferenças genéticas e ambientais na produção do leite entre vacas de corte e ii) dados obtidos pela OM e analisados pelos modelos não-lineares de efeitos mistos (NLEM) permitem a inclusão dos efeitos que afetam as curvas de lactação e as exigências das vacas. Na análise do modelo de cria, com objetivo de avaliar o efeito dos diferentes parâmetros e características produtivas, alguns métodos estatísticos foram utilizados. Estes incluíram além da modelagem das curvas de lactação por NLEM, o uso da meta-análise, assim como de modelos de equações estruturais para estudo do modelo ambiental e econômico. Nas simulações do ciclo completo de cria foi possível verificar o impacto dos parâmetros avaliados nos experimentos, incluindo o peso adulto e a produção de leite. Em função da inexistência de dados de reprodução, o modelo não assumiu nenhum efeito de genótipo ou exigências sobre as taxas reprodutivas. Os resultados demonstram que o aumento do peso adulto reduz a eficiência do sistema de produção e reduz a lucratividade da produção por unidade de peso de bezerro a desmama (P < 0.05). O aumento da produção de leite aumenta a eficiência e a lucratividade do setor de cria. Vacas Nelore apresentam menor demanda energética que vacas Nelore x Bos taurus (8 a 20% menor, P = 0,036). Vacas com maior potencial de produção de leite, e mais leves são também mais lucrativas e concomitantemente apresentam menores impactos ambientais (menor produção total de gases de efeito estufa). / Our objective was to evaluate the effects of milk production, net energy requirements for lactation and mature live weigh of beef cows on energetic, economic and environmental efficiency of the cow-calf system. Several genotypes were used in a model that simulates the Brazilian cow-calf system in which data from three large experiments were analyzed by metaanalyses. The genotypes were Nellore (NL), Angus x Nellore (AN), Canchim x Nellore (CN), Caracu x Nellore (CR) and Simental Nellore (SN). An initial experiment defined the best approach to measure milk production as well as the parameters of the lactating curve. Two methodologies were tested: weigh-suckle-weigh (WSW) and machine milking (MM). Our results support the following: i) MM methodology is superior than WSW to predict genetic and environmental differences in milk production among beef cows and; ii) MM data analyzed by non-linear mixed (NLMM) models allow the evaluation of how different characteristics (e.g. genotype) affect the shape of the lactation curve and the net energy and protein requirements of the cows. With the data from the experiments, a cow-calf biologic, environmental and economic model was developed. The objective was to evaluate the effect of different parameters and productive characteristics of animals on efficiencies. Several statistical methods were used: lactation curve modeling by non-linear mixed-effects models (NLME), meta-analysis and structural equation modeling to establish the model. The complete cow-calf cycle simulation demonstrated the impact of mature body weight (BW) and milk production . Due to the lack of experimental reproductive data, the model assumed no genotype or requirements effects on the reproductive rates which were maintained constant. Results show that increasing mature BW reduces the system efficiency and reduces profitability by kilogram of weaned calf. The increase in milk production increases the efficiency and profitability of the cow-calf system (P < 0.05). Nellore cows presented lower energetic requirements than Nellore x Bos taurus cows (8 to 20% lower, P = 0.036). Cows having greater milk production potential and lower mature body weight are more profitable and at the same time have lower environmental impacts (less greenhouse gases emission per unit of beef).

Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais / This study aimed to evaluate and to compare carcass traits and meat quality in cattle Nellore and F1 cross between Nellore and Araguaia, where 17 were from the Nellore group and 19 from ½ Nellore ½ Araguaia. All animals belonged to the same birth season and were finished in pasture systems, under the same nutritional, environmental, and management conditions. When the animals reached slaughter weight, they were taken to the industrial slaughterhouse where food was withdrawn for a 24 hour period (free access to water), later they were stunned, bled, the leather was removed and were eviscerated. The carcasses were weighed (hot weight), kept in chilled storage for approximately 24 hours at 4°C, and weighed once again to obtain the chilled carcass weight. The variables analyzed were carcass yield, length and width, leg length, thigh perimeter, loin eye area (LEA), retail cuts, cooling loss, pH, fat depth, marbling rate, intramuscular fat, color, shear force and sensory analysis. Differences (p > 0.05) were observed for the following variables; slaughter weight, hot and chilled carcass weights, carcass and leg lengths, thigh perimeter, LEA, retail cuts and lightness (L*), where the F1 cross between Nellore and Araguaia showed higher means for all of these traits, except for leg length and L*. Therefore, the crossbreeding between Nellore and Araguaia cattle did not affect the meat s sensory characteristics, but contributed to the improvement in carcass traits, being an alternative for farmers that aim for meat quality, with higher meat percentage. / Objetivou-se avaliar e comparar as características de carcaça e de qualidade da carne de bovinos Nelore e F1 resultantes do cruzamento entre as raças Nelore e Araguaia. Foram avaliados 17 animais do grupo Nelore e 19 ½ Nelore ½ Araguaia, que foram terminados à pasto, estando sob o mesmo regime nutricional, ambiente, manejo e pertenciam a mesma estação de nascimento. Quando atingiram o peso de abate, foram pesados e conduzidos ao frigorífico, onde permaneceram sob dieta hídrica por 24 horas, foram insensibilizados, sangrados, tiveram o couro removido e foram eviscerados. As carcaças foram pesadas, mantidas em câmara fria por aproximadamente 24 horas, à temperatura de 4 º C, e pesadas para obtenção do peso de carcaça fria. As variáveis analisadas foram: rendimento, comprimento e largura de carcaça, comprimento de perna, perímetro de coxão, área de olho de lombo (AOL), cortes comerciais, perdas no resfriamento, pH, espessura de gordura, taxa de marmoreio, gordura intramuscular, cor, força de cisalhamento e análise sensorial. Foram observadas diferenças (p > 0,05) para as variáveis peso de abate, quente e frio, comprimento de carcaça, e de perna, perímetro de coxão, AOL, de cortes comerciais e luminosidade (L*), sendo que os animais ½ Nelore ½ Araguaia apresentaram médias superiores para todas essas características, exceto para comprimento de perna e L*. Portanto, o cruzamento entre animais Nelore e Araguaia não influenciou nas características sensoriais das carnes e contribuiu para o aumento de características de carcaça, sendo uma alternativa ao produtor rural na obtenção de carne de qualidade, com maior percentual cárneo. / Mestre em Ciências Veterinárias

Capítulo 2- Objetivou-se avaliar sequencialmente os parâmetros hematológicos em bezerros da raça Senepol do nascimento até o desmame, verificar a influência do sexo e confrontar os resultados entre as faixas etárias. Foram utilizados 42 bezerros da raça Senepol (18 fêmeas e 24 machos), escolhidos aleatoriamente, provenientes de inseminação artificial e transferência de embrião. Os animais foram acompanhados da primeira semana de vida até 240 dias de idade. Foi realizado em cada animal dez (10) coletas de sangue durante os seguintes períodos: de 1 até 7 dias de idade, aos 15 dias, 30, 60, 90, 120, 150, 180, 210 e aos 240 dias de idade (desmame). Coletaram-se 3mL de sangue em tubo estéril contendo anticoagulante EDTA K3 (ácido etilenodiaminotetracetico tripotássico), por meio de venopunção da jugular externa para realização do hemograma completo. As amostras foram processadas em analisador hematológico veterinário Sysmex PocH 100 iv diff TM e confeccionou-se extensões sanguíneas para contagem diferencial de leucócitos. Para análise estatística foi utilizado o teste de Kruskal-Wallis (p<0,05) para testar a diferença entre as faixas etárias analisadas e o teste Mann-Whitney (p<0,05) para avaliar a diferença entre os sexos nos diferentes períodos. Houve diferença estatística (p<0,05) em todos os parâmetros do hemograma, exceto para a contagem de basófilos e monócitos (p>0,05). Não se observou influência do sexo (p<0,05) nos parâmetros hematológicos estudados. Concluiu-se existir influência da idade nos parâmetros hematológicos de bezerros da raça Senepol do nascimento até o desmame, entretanto não se observou influência do sexo nos parâmetros hematológicos. Capítulo 3 - Objetivou-se avaliar a influência de fatores sexuais e etários nos parâmetros bioquímicos séricos de bezerros da raça Senepol do nascimento até desmame. Foram utilizados 42 bezerros da raça Senepol (18 fêmeas e 24 machos), provenientes de inseminação artificial e transferência de embrião. Os animais foram acompanhados da primeira semana de vida até 240 dias de idade. Foi realizado em cada animal dez (10) coletas de sangue durante os seguintes períodos: de 1 até 7 dias de idade, aos 15, 30, 60, 90, 120, 150, 180, 210 e aos 240 dias de idade (desmame). Coletaram-se em cada período 4mL de sangue de cada animal por venopunção da jugular externa em tubo estéril com gel separador e ativador de coágulo para obtenção do soro. As amostras foram processadas em analisador automático multicanal ChemWell, previamente calibrado com calibra H e aferido com soro controle universal qualitrol H. Para análise estatística foi utilizado o teste de Kruskal-Wallis (p<0,05), para testar a diferença entre as faixas etárias analisadas, e o teste Mann-Whitney (p<0,05) para avaliar a diferença entre os sexos nos diferentes períodos. Verificou-se influência da faixa etária em todos os parâmetros bioquímicos séricos avaliados (p<0,05), e em relação a comparação entre machos e fêmeas, houve diferença estatística (p<0,05) somente para CK. Concluiu-se existir influência da idade e do sexo nos valores dos parâmetros bioquímicos séricos de bezerros da raça Senepol do nascimento até o desmame. Capítulo 3: Objetivou se avaliar a influência de fatores sexuais e etários nos parâmetros bioquímicos séricos de bezerros da raça Senepol do nascimento até desmame. Foram utilizados 42 bezerros da raça Senepol (18 fêmeas e 24 machos), provenientes de inseminação artificial e transferência de embrião. Os animais foram acompanhados da primeira semana de vida até 240 dias de idade. Foi realizado em cada animal dez (10) coletas de sangue durante os seguintes períodos: de 1 até 7 dias de idade, aos 15, 30, 60, 90, 120, 150,180, 210 e aos 240 dias de idade (desmame). Coletaram-se em cada período 4mL de sangue de cada animal por venopunção da jugular externa em tubo estéril com gel separador e ativador de coágulo para obtenção do soro. As amostras foram processadas em analisa dor automático multicanal ChemWell, previamente calibrado com calibra H e aferido com soro controle universal qualitrol H. Para análise estatística foi utilizado o teste de Kruskal Wallis (p<0,05), para testar a diferença entre as faixas 20 etárias analisadas, e o teste Mann- Whitney (p<0,05) para avaliar a diferença entre os sexosnos diferentes períodos. Verificou-se influência da faixa etária em todos os parâmetros bioquímicos séricos avaliados (p<0,05), e em relação a comparação entre machos e fêmeas, houve diferença estatística (p<0,05) somente para CK. Concluiu-se existir influência da idade e do sexo nos valores dos parâmetros bioquímicos séricos de bezerros da raça Senepol do nascimento até o desmame. / Chapter 2 - The objective of this study was to evaluate haematological parameters sequentially in Senepol breed calves from birth to weaning, verify the influence of sex and compare the results among age groups. 42 calves of the Senepol breed were used (18 females and 24 males), chosen at random, all of which came from artificial insemination and embryo transfer. The animals were accompanied since the first week of life up to 240 days old. Ten (10) blood samples were obtained from every animal during the following periods: from 1 to 7, 15, 30, 60, 90, 120, 150, 180, 210 and 240 days of age (weaning). Three ml of blood were collected in sterile tubes containing anticoagulant EDTA K3 (tripotassium etilenodiaminotetracetico acid), from the external jugular venipuncture for the complete hemogram. The samples were processed in the veterinary Hematology Sysmex PocH 100 iv diff TM analyzer and blood extensions were made for the blood differential leukocyte count. For statistical analysis we used the Kruskal-Wallis test (p < 0.05) to test the difference between the age groups and the Mann-Whitney test (p < 0.05) to assess the difference between the sexes in different periods. There was statistical difference (p < 0.05) in all parameters of the hemogram, except for the count of basophils and monocytes (p > 0.05). Influence of sex was not observed (p < 0.05) in the hematological parameters studied. We concluded there is influence of age in hematological parameters of the Senepol breed calves from birth to weaning, however we did not observe any influence of sex in the hematological parameters. Chapter 3 - The objective of this study was to evaluate the influence of sex and age factors in serum biochemical parameters of the Senepol breed calves from birth to weaning. 42 calves of the Senepol breed were used (18 females and 24 males), coming from artificial insemination and embryo transfer. The animals were accompanied from the first week of life up to 240 days old. Ten (10) blood samples were obtained from every animal during the following periods: from 1 to 7, 15, 30, 60, 90, 120, 150, 180, 210 and 240 days of age (weaning). We collected four ml of blood from each animal in each period from the external jugular venipuncture in sterile tubes with separator gel and clot activator to obtain the serum. The samples were processed in automatic multichannel Analyzer ChemWell, previously calibrated with Calibra H and benchmarked with universal control serum qualitrol H. For statistical analysis we used the Kruskal-Wallis test (p < 0.05), to test the difference between the age groups, and the Mann-Whitney test (p < 0.05) to assess the difference between the sexes in the different periods. We verified the influence of age on serum biochemical parameters evaluated (p < 0.05). Regarding the comparison between males and females, there was statistical difference (p < 0.05) only for CK. We concluded that there is influence of age and gender on the values of serum biochemical parameters of the Senepol breed calves from birth to weaning. Chapter 3: The objective of this study was to evaluate the influence of sex and age factors in serum biochemical parameters of the Senepol breed calves from birth to weaning. 42 calves of the Senepol breed were used (18 females and 24 males), coming from artificial insemination and embryo transfer. The animals were accompanied from the first week of life up to 240 days old. Ten (10) blood samples were obtained from every animal during the following periods: from 1 to 7, 15, 30, 60, 90, 120, 150, 180, 210 and 240 days of age (weaning). We collected four ml of blood from each animal in each period from the external jugular venipuncture in sterile tubes with separator gel and clot activator to obtain the serum. The samples were processed in automatic multichannel Analyzer ChemWell, previously calibrated with Calibra H and benchmarked with universal control serum qualitrol H. For statistical analysis we used the Kruskal-Wallis test (p < 0.05), to test the difference between the age groups, and the Mann -Whitney test (p < 0.05) to assess the difference between the sexes in the different periods. We verified the influence of age on serum biochemical parameters evaluated (p < 0.05). Regarding the comparison between males and females, there was statistical difference (p < 0.05) only for CK. We concluded that there is influence of age and gender on the values of serum biochemical parameters of the Senepol breed calves from birth to weaning / Dissertação (Mestrado)

O objetivo deste estudo foi avaliar o efeito da produção do leite, das exigências líquidas de lactação e do peso de vacas de corte sobre a eficiência energética, econômica e ambiental do sistema de cria. Diversos genótipos utilizados no sistema de cria nacional foram avaliados em três experimentos tendo seus dados analisados por meta-análise. Os genótipos estudados foram Nelore (NL), Angus x Nelore (AN), Canchim x Nelore (CN), Caracu x Nelore (CR) e Simental Nelore (SN). Um experimento inicial definiu a melhor forma de avaliação da produção de leite e da forma da curva de lactação. Foram testadas as metodologias de pesagem do bezerro antes e após a mamada (PMP) e de ordenha mecânica (OM). Os resultados destes estudos permitiram primeiramente defender as seguintes questões: i) a técnica OM é melhor que PMP para predizer diferenças genéticas e ambientais na produção do leite entre vacas de corte e ii) dados obtidos pela OM e analisados pelos modelos não-lineares de efeitos mistos (NLEM) permitem a inclusão dos efeitos que afetam as curvas de lactação e as exigências das vacas. Na análise do modelo de cria, com objetivo de avaliar o efeito dos diferentes parâmetros e características produtivas, alguns métodos estatísticos foram utilizados. Estes incluíram além da modelagem das curvas de lactação por NLEM, o uso da meta-análise, assim como de modelos de equações estruturais para estudo do modelo ambiental e econômico. Nas simulações do ciclo completo de cria foi possível verificar o impacto dos parâmetros avaliados nos experimentos, incluindo o peso adulto e a produção de leite. Em função da inexistência de dados de reprodução, o modelo não assumiu nenhum efeito de genótipo ou exigências sobre as taxas reprodutivas. Os resultados demonstram que o aumento do peso adulto reduz a eficiência do sistema de produção e reduz a lucratividade da produção por unidade de peso de bezerro a desmama (P < 0.05). O aumento da produção de leite aumenta a eficiência e a lucratividade do setor de cria. Vacas Nelore apresentam menor demanda energética que vacas Nelore x Bos taurus (8 a 20% menor, P = 0,036). Vacas com maior potencial de produção de leite, e mais leves são também mais lucrativas e concomitantemente apresentam menores impactos ambientais (menor produção total de gases de efeito estufa). / Our objective was to evaluate the effects of milk production, net energy requirements for lactation and mature live weigh of beef cows on energetic, economic and environmental efficiency of the cow-calf system. Several genotypes were used in a model that simulates the Brazilian cow-calf system in which data from three large experiments were analyzed by metaanalyses. The genotypes were Nellore (NL), Angus x Nellore (AN), Canchim x Nellore (CN), Caracu x Nellore (CR) and Simental Nellore (SN). An initial experiment defined the best approach to measure milk production as well as the parameters of the lactating curve. Two methodologies were tested: weigh-suckle-weigh (WSW) and machine milking (MM). Our results support the following: i) MM methodology is superior than WSW to predict genetic and environmental differences in milk production among beef cows and; ii) MM data analyzed by non-linear mixed (NLMM) models allow the evaluation of how different characteristics (e.g. genotype) affect the shape of the lactation curve and the net energy and protein requirements of the cows. With the data from the experiments, a cow-calf biologic, environmental and economic model was developed. The objective was to evaluate the effect of different parameters and productive characteristics of animals on efficiencies. Several statistical methods were used: lactation curve modeling by non-linear mixed-effects models (NLME), meta-analysis and structural equation modeling to establish the model. The complete cow-calf cycle simulation demonstrated the impact of mature body weight (BW) and milk production . Due to the lack of experimental reproductive data, the model assumed no genotype or requirements effects on the reproductive rates which were maintained constant. Results show that increasing mature BW reduces the system efficiency and reduces profitability by kilogram of weaned calf. The increase in milk production increases the efficiency and profitability of the cow-calf system (P < 0.05). Nellore cows presented lower energetic requirements than Nellore x Bos taurus cows (8 to 20% lower, P = 0.036). Cows having greater milk production potential and lower mature body weight are more profitable and at the same time have lower environmental impacts (less greenhouse gases emission per unit of beef).

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Made available in DSpace on 2014-07-29T15:07:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissetacao_Alinne_Cardoso.pdf: 859535 bytes, checksum: a45dbde90862dccc30a5f324f2f39357 (MD5) Previous issue date: 2008-04-11 / The Pantaneiro cattle reveal docility, resistance to illnesses and parasites, and an incredible ability to adapt to Pantanal's edophoclimatic conditions. The cattle may be used without considerable investment to explore low-quality natural pastures in which other breeds might endure low productivity or even survival difficulties. Thus the determination of the normal blood constituents of Pantaneiro bovines was set in order to reveal further information regarding the physiological aspects of these animals. Therefore 293 blood samples were collected from two rural properties, one from Mato Grosso and the other from Mato Grosso do Sul. These individuals were classified in five groups according to their age group, as follows: G1, G2, G3, G4, and G5. The parameters under investigation were the erythrogram and the leukogram. Initially the data was submitted to descriptive statistics which included the determination of averages, standard deviation, and coefficients of variation. Subsequently data was submitted to the Kruskall Wallis test in order to establish the age relationship and to the Mann-Whitney test in order to establish the sex relationship. Age advancement revealed an increase in MCV, MCH, and in the number of eosinophils. Age advancement showed a reduction in the number of red blood cells, hemoglobin, MCHC, segmented neutrophils, and band neutrophils. The values of globular volume and monocytes revealed a rising behavior up to 35 months of age and subsequently suffered a reduction as age advanced. The values of lymphocytes and total leukocytes presented a rising behavior up to 11 months of age and a subsequent decline as age increased. The results of this research failed to show any relations between hematological parameters and the sex factor / Os primeiros rebanhos bovinos foram trazidos pelos portugueses, para suprirem as necessidades de trabalho e comida da colônia, se dispersaram por diversas regiões no nosso país, desenvolvendo características únicas em cada uma delas. No Pantanal desenvolveu-se o bovino Pantaneiro, que é extremamente prolífero e muito adaptado a esta região. Com a introdução dos zebuínos estes animais foram sendo substituídos, chegando hoje a uma condição de quase total desaparecimento. Com o intuito ajudar no processo de conservação da raça, este trabalho tem como objetivo determinar os parâmetros hematológicos e bioquímicos para estes animais, bem como a relação deles com a idade e sexo. Foram coletadas amostras de 293 animais de duas propriedades, uma no Mato Grosso e outra no Mato Grosso do Sul. Estudaram-se os componentes do hemograma, determinando-se os valores do eritrograma e do leucograma. A idade mostrou relação com todos os parâmetros hematológicos, sendo eles número total de hemácias, a concentração de hemoglobina, hematócrito, volume corpuscular médio, hemoglobina corpuscular média, concentração de hemoglobina corpuscular média, leucócitos totais, neutrófilos, linfócitos, bastonetes, eosinófilos e monócitos. Nenhum dos constituintes morfológicos sanguíneos mostrou relação com o sexo. Estudou-se também os constituintes bioquímicos e as enzimas séricas, determinando-se os valores de aspartato aminotransferase (AST), fosfatase alcalina (ALP), gama glutamiltransferase (GGT) e creatino quinase (CK), bilirrubinas, proteína total, albumina, globulinas, uréia e creatinina, glicose, colesterol e fibrinogênio plasmático. A idade mostrou relação com todas as bioquímicas e enzimas estudadas, com exceção da bilirrubina indireta. O sexo mostrou relação com uréia, colesterol, glicose e fibrinogênio.

Attività antropiche e pressioni di mercato stanno rapidamente riducendo la biodiversità. Per questa ragione, conservare il patrimonio ecosistemico, tassonomico e genetico risulta fondamentale al fine di garantire potenziale adattativo alle specie, e, in ultima analisi, un futuro sostenibile per il pianeta. Al fine di minimizzare la perdita di biodiversità, numerosi metodi sono stati proposti per priorizzare ecosistemi, specie e popolazioni. Il presente lavoro di tesi fornisce in primo luogo una revisione di tali approcci, proponendo un albero decisionale volto a favorirne un corretto utilizzo. Secondariamente, la variabilità genomica neutrale del bufalo d’acqua (Bubalus bubalis L.) è investigata per mezzo di un pannello di marcatori SNP a media densità, rivelando due centri di domesticazione (India Nord-occidentale, Cina-Indocina) e possibili rotte di migrazione per gli ecotipi ‘river’ e ‘swamp’. L’adattamento locale ad East Coast Fever, patologia endemica delle popolazioni bovine in Africa Sub-sahariana, è stato inoltre studiato in bovini autoctoni Ugandesi (Bos taurus L.) combinando tecniche di modellizzazione delle nicchie ecologiche e di genomica del paesaggio. L’approccio ha portato ad indentificare PRKG1 e SLA2 come possibili geni di adattamento. I risultati sono discussi alla luce delle possibili implicazioni nella conservazione del bufalo e nella gestione delle risorse genetiche animali Ugandesi. / Biodiversity is quickly disappearing due to human impact on the biosphere, and to market pressure. Consequently, the protection of both wild and domestic species needs to become a priority in order to preserve their evolutionary potential and, ultimately, guarantee a sustainable future for coming human generations. To date, tens of methods have been proposed to prioritize biodiversity for conservation purposes. Here, an ontology for priority setting in conservation biology is provided with the aim of supporting the selection of the most opportune methodologies given specific conservation goals. Further, two case studies are presented characterizing neutral and adaptive genomic diversity in water buffalo (Bubalus bubalis L.) and indigenous Ugandan cattle (Bos taurus L.), respectively. In particular, two independent domestication centres (North-western India and Indochina) and separate migration routes are suggested for the ‘river’ and ‘swamp’ water buffalo types. In the case of indigenous Ugandan cattle, the integration of species distribution modelling and landscape genomics techniques allowed the identification of PRKG1 and SLA2 as candidate genes for local adaptation to East Coast Fever, a vector-borne disease affecting bovine populations of Sub-Saharan Africa. Results are discussed for their implications in water buffalo conservation and Ugandan cattle adaptive management.