Submitted by Setor de Tratamento da Informa??o - BC/PUCRS (tede2@pucrs.br) on 2015-07-07T13:22:11Z No. of bitstreams: 1 471669 - Texto Completo.pdf: 642214 bytes, checksum: 15f92d44ec9d54a455925b6917080ee4 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-07-07T13:22:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 471669 - Texto Completo.pdf: 642214 bytes, checksum: 15f92d44ec9d54a455925b6917080ee4 (MD5) Previous issue date: 2015-02-09 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico - CNPq / Currently, the execution of biological research that is able to classify and characterize the biodiversity and its ecological relations has been increasingly important and necessary in order to achieve environmental conservation. Conservation physiology is concerned about studying and qualifying many variables related to an organism, so that is possible to increase the knowledge about the functioning of a given species and to detail main environmental requirements or to establish periods of natural vulnerability. The genus Hyalella presents an American distribution and has a great importance on the food chain where it occurs, and becoming a fundamental link in processes of energy transference. The amphipod Hyalella kaingang, a very recent described species and so far not very studied, was used on this study of seasonal variation, and the objective of the present work was to analyze the metabolic behavior, the metabolic allocation, the levels of lipid peroxidation and the activity of antioxidant enzymes of the species. Thirty animals from each sex were used each season of the year, which were collected at Centro de Pesquisa e Conserva??o da Natureza (CPCN) Pr?-Mata, located at S?o Francisco de Paula, Rio Grande do Sul.In the field, animals were euthanized by cryoanesthesia and in the laboratory they were homogenized in order to quantify levels of total proteins, glycogen, lipids, triglycerides, glycerol lipid peroxidation and the activity of the antioxidant enzymes superoxide dismutase, catalase and glutathione S- transferase. There was significative difference in the levels of glycogen, lipids, triglycerides, lipoperoxidation and in the activity of the enzymes superoxide dismutase and glutathione S-transferase over a full seasonal cycle in both males and females. The results of biomarkers from energetic metabolism and from oxidative stress indicate a feeding trend directed to the ingestion of proteins, and it is also suggested that the reproductive period of the species may be long-lasting, with this hypothesis being based also on the observation of pregnant females in many of the analyzed seasons. It is also suggested that there may be a reproductive peak during autumn. However, more studies must be done with this species so that the knowledge about its reproductive biology, general ecology and physiology can be increased. The present work also reinforces the idea that must be a greater interaction between different scientific fields so that a more precise profile of any given organism can be stated. / Atualmente, a realiza??o de levantamentos biol?gicos que sejam capazes de classificar e caracterizar a biodiversidade e suas rela??es ecol?gicas tem sido cada vez mais importante e necess?ria na busca da conserva??o ambiental. A fisiologia da conserva??o preocupa-se em estudar e qualificar diversas vari?veis relacionadas a um organismo, para que assim seja poss?vel ampliar os conhecimentos acerca do funcionamento de determinada esp?cie e detalhar necessidades b?sicas ambientais ou estabelecer per?odos de vulnerabilidade natural. O g?nero Hyalella, de distribui??o americana, tem uma grande import?ncia nas cadeias tr?ficas onde ocorrem, tornando-se uma liga??o fundamental em processos de transfer?ncia energ?tica. O anf?podo Hyalella kaingang, uma esp?cie recentemente descrita e pouco estudada, foi utilizada nas pesquisas referentes ?s an?lises sazonais, e o objetivo do presente trabalho foi analisar o funcionamento metab?lico, a aloca??o energ?tica, os n?veis de lipoperoxida??o e atividades de enzimas antioxidantes da esp?cie. Foram utilizados 30 animais de cada sexo em cada esta??o do ano, os quais foram coletados dentro do Centro de Pesquisa e Conserva??o da Natureza (CPCN) Pr?-Mata, no munic?pio de S?o Francisco de Paula, Rio Grande do Sul.Em campo, os animais foram eutanaziados por crioanestesia e no laborat?rio, homogeneizados para a quantifica??o dos n?veis de prote?nas, glicog?nio, lip?dios, triglicer?deos, glicerol, lipoperoxida??o e a atividade das enzimas super?xido dismutase, catalase e glutationa S-transferase. Houve diferen?a significativa nos n?veis de glicog?nio, lip?dios, triglicer?deos, lipoperoxida??o e na atividade das enzimas super?xido dismutase e glutationa S-transferase ao longo de um ciclo sazonal, tanto em machos como em f?meas.Os resultados encontrados a partir dos biomarcadores de metabolismo energ?tico e do estresse oxidativo indicam tend?ncias alimentares direcionadas ao consumo predominantemente de prote?nas, e tamb?m que o per?odo reprodutivo da esp?cie seja longo, hip?tese baseada tamb?m na observa??o de f?meas ov?geras em muitas esta??es. Sugere-se tamb?m, que exista um pico de atividade reprodutiva no outono. Contudo, mais estudos devem ser realizados com a esp?cie para que possam ser aprofundados os conhecimentos acerca da biologia reprodutiva, ecologia geral e fisiologia desta esp?cie. O presente trabalho refor?a a ideia de que deve haver uma maior integra??o entre diferentes campos cient?ficos para que se possa obter um perfil mais preciso de um determinado organismo.

Submitted by Setor de Tratamento da Informa??o - BC/PUCRS (tede2@pucrs.br) on 2015-07-15T14:17:46Z No. of bitstreams: 1 472306 - Texto Completo.pdf: 801698 bytes, checksum: 626a3d4510251f50c8f5b4a071c6c979 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-07-15T14:17:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 472306 - Texto Completo.pdf: 801698 bytes, checksum: 626a3d4510251f50c8f5b4a071c6c979 (MD5) Previous issue date: 2015-03-27 / Insular populations have always been the subject of interest for ecological and genetic studies. The insular Cavia intermedia is one of the rarest mammals in the world, with an average census size of about 40 individuals, corroborated by an extremely low genetic diversity and effective population size (Ne). Here, we used restricted site-associated DNA sequencing (RAD-seq) to obtain genome wide sequence data of C. intermedia and its continental sister species, C. magna to study their molecular diversity and demographic history. We have generated approximately 10 millions of useable reads of 300 bp for 20 individuals each of both species. However, both using the Cavia porcellus draft genome as a reference or de novo approaches and applying stringent filters for quality and missing data, only about a hundred loci could be used. This final dataset generated widely different molecular diversity and divergence time values between methods of analyses, some compatible with the previous studies (e.g., Ne ~60 for C. intermedia) but some with significantly larger values. We suggest that to obtain a high quality and very informative dataset it would be necessary to significantly increase the sequence data as well as apply other assembly approaches. / Popula??es insulares sempre tem sido objeto de interesse para estudos gen?ticos e ecol?gicos. A esp?cie insular Cavia intermedia ? um dos mam?feros mais raros no mundo, com um tamanho de censo populacional de aproximadamente 40 indiv?duos, corroborado por uma diversidade gen?tica e tamanho populacional efetivo (Ne) extremamente baixos. Aqui, n?s usamos sequenciamento de DNA associado a s?tios de restri??o (no ingl?s, RAD-seq) para obter dados de sequencias ao longo do genoma de C. intermedia e sua esp?cie-irm? continental, C. magna, para estudar sua diversidade molecular e hist?ria demogr?fica. N?s geramos um total de 10 milh?es de reads de 300 bp para 20 indiv?duos de cada esp?cie. Entretanto, mesmo usando o genoma de Cavia porcellus como refer?ncia ou abordagem de novo e aplicando filtros rigoroso para qualidade e dados faltantes, apenas uma centena de loci puderam ser usados. Este conjunto final de dados gerou valores de diversidade molecular e tempo de diverg?ncia amplamente diferentes entre os m?todos de an?lise, alguns compat?veis com estudos anteriores (e.g., Ne ~60 para C. intermedia) mas alguns com valores significativamente maiores. N?s sugerimos que para obter um conjunto de dados de alta qualidade e muito informativo seria necess?rio aumentar significativamente os dados de sequ?ncia bem como aplicar outras abordagens de montagem.

Submitted by Setor de Tratamento da Informa??o - BC/PUCRS (tede2@pucrs.br) on 2015-08-24T11:48:55Z No. of bitstreams: 1 473894 - Texto Completo.pdf: 1659057 bytes, checksum: 383308bc4b42bc590384f39d9acfbe42 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-08-24T11:48:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 473894 - Texto Completo.pdf: 1659057 bytes, checksum: 383308bc4b42bc590384f39d9acfbe42 (MD5) Previous issue date: 2015-03-04 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico - CNPq / The Galapagos fur seal, Arctocephalus galapagoensis, shows one of the most restricted species distribution range under the Otariidae family, with its distribution restricted to northwest of Galapagos Islands. Among the major threats to the conservation of Galapagos fur seals was the exploitation, that almost drove the species to extinction in the early nineteenth century due to the high economic and subsistence value of its skin and blubber. Currently, the species faces frequents events of El Ni?o that affect the base of the food chain in the equatorial Pacific Ocean, consequently the predatory and top predatory species like the fur seals. Both hunting and El Ni?o events led the species to Red List of Endangered Species of International Union for Conservation of Nature, indicating a ?50% of population in the last 30 years. However, until now, there are no studies related to conservation problems and genetic variability and how genetic variability is represented in the space along the distribution range of Galapagos fur seal. To access the information about genetic diversity, population structure and demographic oscillation as well as how genetic variability is represented in the space we used molecular techniques applying two kinds of markers: a mitochondrial marker (control region, maternal inheritance) and nuclear marker (18 microsatellites loci, bi parental inheritance). The fur seals were sampled in the three major Galapagos fur seals colonies: Cape Hammond (Fernandina Island), Banks Bay (Isabela Island) and Cape Marshall (Isabela Islands). Our results showed that there is a strong female natal fidelity with 33.9% of mtDNA occurring among partitioned colonies. In this sense, this natal philopatry, was converted in fine-scale matrilineal population structure. In the other hand, the population structure inferred by nuclear loci was week. This suggests that males are the main responsible by gene flow among sampled localities, even in a highly mobile species like Galapagos fur seal. Here we discuss the importance of natal philopatry and fine-scale matrilineal population structure of Galapagos fur seal species and their implications for management and conservation in the one of the most representative wildlife sanctuaries, the Galapagos archipelago. / O lobo-marinho-de-Gal?pagos, Arctocephalus galapagoensis, apresenta uma das mais restritas distribui??es geogr?ficas dentro da fam?lia Otariidae, distribuindo-se especialmente ? regi?o noroeste das Ilhas Gal?pagos. Entre as principais amea?as ? conserva??o da esp?cie est? a ca?a, respons?vel pela quase extin??o da esp?cie no in?cio do s?culo XIX, devido ao alto valor econ?mico e de subsist?ncia da pele e gordura destes animais; e tamb?m os recorrentes eventos do fen?meno El Ni?o, o qual afeta toda a base da cadeia tr?fica do Pac?fico equatorial e, por consequ?ncia, as esp?cies predadoras e de topo de cadeia tr?fica como o lobo-marinho-de-Gal?pagos. Tanto a ca?a, quanto os recorrentes eventos de El Ni?o, levaram a esp?cie ? Lista Vermelha de Esp?cies Amea?adas de Extin??o da Uni?o Internacional para a Conserva??o da Natureza (do ingl?s IUCN), indicando que houve ?50% de redu??o populacional observada nos ?ltimos 30 anos. No entanto, at? o momento, n?o h? estudos que verificaram poss?veis efeitos dos problemas mencionados sobre a variabilidade gen?tica da esp?cie, nem como esta variabilidade est? representada espacialmente ao longo da ?rea de distribui??o do lobo-marinho-de-Gal?pagos. Para obter as informa??es de diversidade gen?tica, estrutura??o populacional e para verificar poss?veis oscila??es demogr?ficas, bem como verificar como a variabilidade est? distribu?da no espa?o n?s utilizamos de t?cnicas moleculares, aplicando o uso de dois tipos de marcadores de DNA: um mitocondrial (mtDNA - de heran?a exclusivamente materna), atrav?s da aplica??o de parte da regi?o controladora, e outro nuclear (heran?a bi-parental), atrav?s da aplica??o de 18 loci de microssat?lites de DNA em amostras coletadas nas tr?s maiores col?nias da esp?cie: Cabo Hammond (Ilha Fernandina), Ba?a Banks (Ilha Isabela) e Cabo Marshall (Ilha Isabela). Verificamos com nossos resultados que mesmo as col?nias analisadas estando distante cerca de 70 Km h? uma forte fidelidade das f?meas ao s?tio de nascimento, com 33,9% da varia??o no mtDNA estando particionada entre col?nias. Por outro lado, a estrutura populacional inferida atrav?s dos loci nucleares foi fraca. Nossos resultados al?m de mostrar uma forte fidelidade das f?meas ao s?tio de nascimento, mostrou que os machos s?o os principais respons?veis pelo fluxo g?nico e que a fidelidade ao s?tio de nascimento das f?meas pode ser convertida em estrutura??o gen?tica espacial em fina escala, mesmo em esp?cies que apresentam alta capacidade de deslocamento como ? o caso de diversas esp?cies de pin?pedes e, em especial, o lobo-marinho-de-Gal?pagos. Neste sentido, discutimos tamb?m neste estudo a import?ncia da filopatria natal e consequente estrutura??o gen?tica em fina escala para o manejo e conserva??o do lobo-marinho-de-Gal?pagos, neste que um dos maiores e mais representativos santu?rios da vida silvestre, o arquip?lago de Gal?pagos.

Submitted by Setor de Tratamento da Informa??o - BC/PUCRS (tede2@pucrs.br) on 2015-09-21T20:09:04Z No. of bitstreams: 1 475033 - Texto Completo.pdf: 5153821 bytes, checksum: 55008245de341b36e557bd5e4574ff24 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-09-21T20:09:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 475033 - Texto Completo.pdf: 5153821 bytes, checksum: 55008245de341b36e557bd5e4574ff24 (MD5) Previous issue date: 2015-05-27 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico - CNPq / Inserted into the grassland matrix of the pampa biome is Espinal ecoregion with distinctive arboreal components, predominantly located in Argentina with a small insertion in Brazil, more precisely in the most western portion of Rio Grande do Sul. This ecosystem is considered threatened and of high conservation priority in Argentina. In the state of Rio Grande do Sul its remnants are restricted to the Espinilho State Park and its neighboring areas. At the national scope, this region is a household to a bird species group restricted to this ecosystem, and several of them are classified as endangered. Although widespread relevance in the literature on the species and its Espinal habitat relationship we lack studies in the region, especially on population densities and vegetation features selected for these species. Thus, we aimed to answer questions related to density of breeding territory and vegetation features that may be acting in the distribution of the assemblage of territorial birds in Espinal ecosystem in the state. Four different plots (in sizes and characteristics) were selected (total of 206.2 ha) and nine spot-mapping census were carried out in each area during the 2012/2013 breeding season. Birds were color and metal banded previously in the plots to facilitate later identification of territories. Fifty-one species provided data of at least one territory. The territory densities (territory / 100 ha) ranged from 0.09 to 110.96. Common species in state as Zonotrichia capensis, Sicalis flaveola and Troglodytes musculus had higher densities. Five of seven measured variables show statistically difference (Kruskal-Wallis test, P <0.05) between the areas: tree density, tree richness, tree width, herbaceous height and shrubs density. Twenty-one species preferred areas with high coverage of tree layer. Areas with high herbaceous height favored grassland or occupants of shrubby areas, as Volatinia jacarina, Sicalis luteola, Sporophila caerulescens and Euscarthmus meloryphus. Places where other tree species occur, beyond the most characteristic species of Espinal ecosystem (Prosopis spp., Vachelia caven) were used for more edge-forested species such as Elaenia parvirostris, Turdus amaurochalinus, Synallaxis frontalis, Poospiza melanoleuca, Cranioleuca pyrrhophia and Cyanocorax chrysops. Ground foraging species including those of some conservation interest, such as Asthenes baeri, Drymornis bridgesii, Coryphistera alaudina, Pseudoseisura lophotes and Gubernatrix cristata, selected areas with livestock presence with reduced herbaceous height and lower shrubs density. Our data suggest prudence in the cattle removal after the acquisition of new areas of Espinilho State Park, requiring the monitoring of all actions aimed at further any change in vegetation structure. Such changes may reflect negatively on the use of areas for some species. / A ?rea de estudo est? inserida numa matriz campestre do bioma pampa, em uma ecoregi?o conhecida como del espinal ou espinhal com componentes arb?reos marcantes, predominantemente situada no territ?rio argentino, com uma pequena representa??o no Brasil, mais precisamente no extremo oeste do Rio Grande do Sul. Esta forma??o ? considerada amea?ada e de alta prioridade de conserva??o na Argentina e, no estado do Rio Grande do Sul e seus remanescentes est?o restritos ao Parque Estadual do Espinilho e ?reas lim?trofes. Na esfera nacional esta regi?o abriga um grupo de esp?cies de aves de distribui??o restrita a esta forma??o, sendo diversas delas classificadas como amea?adas de extin??o. Apesar da relev?ncia amplamente difundida na literatura sobre a especificidade das esp?cies de espinilho a seu habitat, carecemos de estudos na regi?o, especialmente sobre as densidades populacionais e as caracter?sticas na vegeta??o selecionadas por estas esp?cies. Desta forma este estudo teve por objetivo responder quest?es ligadas a densidade de territ?rios reprodutivos e caracter?sticas na vegeta??o que podem estar atuando na distribui??o da assembleia de aves territorialistas na ?rea do Parque Estadual do Espinilho. Quatro ?reas de tamanhos e caracter?sticas distintas foram selecionadas (total de 206,2 ha) e nove amostragens foram realizadas em cada ?rea durante a esta??o reprodutiva de 2012/2013 com o uso do m?todo de mapeamento de territ?rios (spot-mapping). Previamente, indiv?duos foram anilhados nas ?reas com anilhas met?licas e coloridas de modo a facilitar a posterior identifica??o dos territ?rios. Para um total de 51 esp?cies foram coletados dados que possibilitaram a identifica??o de, no m?nimo, um territ?rio. As densidades de territ?rios (territ?rio / 100 ha) variaram entre 110,96 at? 0,09. Esp?cies comuns no Estado como Zonotrichia capensis, Sicalis flaveola e Troglodytes musculus foram as esp?cies com maiores densidades. Sete vari?veis da vegeta??o foram medidas e cinco delas demonstraram diferen?as significativas (Kruskal-Wallis, P < 0,05) entre as ?reas: densidade de arb?reas; riqueza de arb?reas, circunfer?ncia do caule das arb?reas, altura do estrato herb?ceo e densidade de arbustos. ?reas com elevada cobertura do estrato arb?reo foram preferidas por 21 esp?cies. ?reas com altura elevada do estrato herb?ceo favoreceram esp?cies campestres ou ocupantes de ?reas arbustivas, como Volatinia jacarina, Sicalis luteola, Sporophila caerulescens e Euscarthmus meloryphus. Os locais onde ocorrem outras esp?cies arb?reas, al?m das esp?cies mais caracter?sticas da forma??o Espinilho (Prosopis spp., Vachelia caven) foram utilizados por esp?cies de ?reas mais florestadas (borda de floresta) como por exemplo Elaenia parvirostris, Turdus amaurochalinus, Synallaxis frontalis, Poospiza melanoleuca, Cranioleuca pyrrhophia e Cyanocorax chrysops. As ?reas com presen?a de gado apresentaram reduzida altura do estrato herb?ceo e menor densidade de arbustos, caracter?sticas selecionadas por esp?cies que forrageiam no solo, entre elas, algumas de interesse de conserva??o, como Asthenes baeri, Drymornis bridgesii, Coryphistera alaudina, Pseudoseisura lophotes e Gubernatrix cristata. Nossos dados sugerem cautela nas a??es de retirada do gado ap?s a aquisi??o de novas ?reas do Parque Estadual do Espinilho, sendo necess?rio o monitoramento de todas as medidas que visem promover qualquer altera??o na estrutura da vegeta??o, fator que pode refletir de forma negativa na utiliza??o das ?reas por algumas esp?cies.

Submitted by Setor de Tratamento da Informa??o - BC/PUCRS (tede2@pucrs.br) on 2015-11-27T13:31:20Z No. of bitstreams: 1 476493 - Texto Completo.pdf: 10028874 bytes, checksum: 9fa9c4e7c9a4562d60d6d4f21cbd7baa (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-27T13:31:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 476493 - Texto Completo.pdf: 10028874 bytes, checksum: 9fa9c4e7c9a4562d60d6d4f21cbd7baa (MD5) Previous issue date: 2015-03-26 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico - CNPq / The hoary fox (Lycalopex vetulus) is the smallest Brazilian canid and an endemic species of the Cerrado biome, including adjacent transitional areas harboring open habitats. Recent studies reported some evidence suggesting a potential hybridization process between L. vetulus and L. gymnocercus in a contact zone that has likely been formed recently. Using microsatellite and mtDNA markers, we investigated the influence of historical processes on the population structure of L. vetulus, as well as the occurrence of hybridization between this species and L. gymnocercus. For these purposes, tissue and blood samples from animals representing most of the hoary fox distribution were obtained (n = 61), as well as from L. gymnocercus (n = 30) sampled in their contact zone and adjacent areas. Our results showed high levels of genetic diversity for L. vetulus (haplotype diversity: Hd = 0.98 and expected heterozygosity: He = 0.81) and different population scenarios with each of the molecular marker types, suggesting male-mediated gene flow. We also observed a south-north partition, with no haplotype sharing between these regions. This pattern is similar to the one observed in a sympatric canid (Cerdocyon thous) and in various other Atlantic Forest vertebrates, raising the hypothesis that species occurring in open habitats may undergo equivalent vicariant processes. Six individuals caught in the contact zone showed signs of mixing with L. gymnocercus in the composition of their microsatellite genotypes, five of which presenting introgressed mtDNA haplotypes from the same species. These results support the inference of hybridization between these canids, likely induced by anthropogenic effects (i.e. deforestation in the Atlantic Forest). Our study illustrates how the fragmentation and alteration of natural habitats can play an important role in the genetic composition of wild populations, and should provide useful data for the design of conservation strategies on behalf of both species. / A raposinha-do-campo (Lycalopex vetulus) ? o menor dos can?deos brasileiros sendo end?mica do bioma Cerrado, por?m podendo ser encontrada tamb?m em ?reas de transi??o adjacentes. Estudos recentes investigaram as rela??es filogen?ticas entre as esp?cies do g?nero Lycalopex e indicaram que L. vetulus ? a esp?cie mais basal deste grupo, cuja diversifica??o ocorreu h? apenas 1 milh?o de anos. Al?m disso, obtiveram evid?ncias que sugerem a ocorr?ncia de um potencial processo de hibrida??o entre L. vetulus e L. gymnocercus em uma zona de contato rec?m-formada. Usando dados de microssat?lites e DNA mitocondrial, investigamos a influ?ncia dos processos hist?ricos nos padr?es de estrutura populacional de L. vetulus, bem como a ocorr?ncia de hibrida??o entre esta esp?cie e L. gymnocercus. Com este objetivo, foram obtidas amostras de tecido e sangue provenientes de animais que representam a maior parte da distribui??o de L. vetulus (n = 61), bem como amostras de L. gymnocercus (n = 30) oriundas da zona de contato entre ambas as esp?cies e ?reas adjacentes. Nossos resultados mostraram altos n?veis de diversidade gen?tica para L. vetulus (diversidade haplot?pica: Hd = 0,98 e heterozigosidade esperada: He = 0,81) e diferentes cen?rios populacionais de acordo com o marcador molecular utilizado, o que sugere um fluxo g?nico influenciado pelos machos e filopatria das f?meas. Observou-se tamb?m uma parti??o norte-sul entre dois grupos filogeogr?ficos, n?o existindo o compartilhamento de hapl?tipos entre essas regi?es. Este padr?o ? semelhante ao observado em outra esp?cie simp?trica de can?deo (Cerdocyon thous) e em v?rios outros vertebrados da Floresta Atl?ntica, levantando a hip?tese de que tamb?m esp?cies que ocorrem em habitats abertos possam ser afetadas por processos vicariantes equivalentes. Seis indiv?duos capturados na zona de contato mostraram sinais de mistura com L. gymnocercus na composi??o de seu gen?tipo, com cinco destes apresentando hapl?tipos de mtDNA compartilhados. Estes resultados suportam a exist?ncia de hibrida??o entre estas esp?cies, provavelmente induzida por efeitos antropog?nicos (desmatamento na Mata Atl?ntica). Nosso estudo ilustra como a fragmenta??o e a altera??o de habitats naturais pode afetar a constitui??o gen?tica de popula??es nativas, fornecendo dados ?teis para o delineamento de estrat?gias de conserva??o para as duas esp?cies.

Submitted by Setor de Tratamento da Informa??o - BC/PUCRS (tede2@pucrs.br) on 2016-02-12T10:25:45Z No. of bitstreams: 1 TES_BARBARA_BORGES_CALEGARI_PARCIAL.pdf: 201037 bytes, checksum: 842e14f9326d662b1b590ec126cc0e5f (MD5) / Made available in DSpace on 2016-02-12T10:25:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TES_BARBARA_BORGES_CALEGARI_PARCIAL.pdf: 201037 bytes, checksum: 842e14f9326d662b1b590ec126cc0e5f (MD5) Previous issue date: 2015-08-27 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico - CNPq / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / The Auchenipteridae have an extensive and confusing taxonomic and phylogenetic history. Several studies developed since 1766 involving descriptions of species generated controversial results about the composition of the family and their interrelationships. The weakness of the systematic knowledge and diversity of the family hinders the understanding about the evolutionary history since the informative potential of morphology, molecules and biogeography was not yet fully explored. A comprehensive and densely sampled phylogenetic study of the species relationships of the Auchenipteridae, a Neotropical family of inseminating catfishes, is here documented based on combined datasets, morphological and molecular. The present study aimed to include most species of Auchenipteridae (109 species), as well as several members of other siluriform families representing the outgroup (28 species comprising Mochokidae, Aspredinidae, Doradidae, Ariidae, Pimelodidae, Cetopsidae, and Diplomystidae) to embrace the greater diversity of forms existing within Siluriformes, providing a robust comparison between the taxa and providing therefore a series of information from different sources including morphology (261 characters) and molecular data (2814 characters based on four genes: COI, 16S, RAG2, and MyH6). The parsimony analysis based on combined data yielded 1691 maximally parsimonious trees and the strict consensus corroborated the monophyly of the superfamily Doradoidea, the family Auchenipteridae and its two subfamilies, Centromochlinae and Auchenipterinae as well. The new classificatory proposal also raises the number of tribes within Auchenipteridae from two to nine, evidencing the following major groups within Auchenipterinae: Liosomadoradini, Trachelyopterini, Asterophysini, Auchenipterini, and Ageneiosini; and in Centromochlinae: Gelanoglanini, Gephyromochlini, Centromochlini, and Glanidini. Additionally, most of auchenipterid genera were recovered as monophyletic, except for Centromochlus and Tatia. Centromochlus is restricted to only three species while Tatia is recovered as the most specious centromochline genus including the currently Centromochlus simplex, C. reticulatus and Pseudotatia parva, herein reallocated. To address the paraphyly of Centromochlus and Tatia, two new genera of Centromochlinae were proposed and a nomenclatural reorganization of the species in these genera was conducted. Furthermore, Glanidium and Trachycorystes resulted as paraphyletic, and a new combination for Glanidium leopardum, resurrecting Gephyromochlus, to allocate this taxa and a new genus of Auchenipterinae to allocate Trachycorystes menezesi were proposed. Notwithstanding, Ageneiosus was recovered as paraphyletic since Ageneiosus militaris was recovered as sister group to Ageneiosus and Tympanopleura. The paraphyly of Ageneiosus seems to be an artifact of morphological missing data for A. militaris and until these data are included in the analysis to readily test the position of this species, both genera are maintained as valid. A synapomorphy list and the diagnosis for each clade are presented under a new classification proposal. Furthermore, the interrelationship and monophyly of the genera and major groups are discussed and compared to previous propositions. / Auchenipteridae possui uma extensa e confusa hist?ria taxon?mica e filogen?tica. Diversos estudos desenvolvidos desde 1766 envolvendo descri??es de esp?cies geraram resultados controversos a cerca da composi??o da fam?lia e suas rela??es de parentesco. A defici?ncia no conhecimento da sistem?tica e diversidade da fam?lia tem dificultado a compreens?o sobre a hist?ria evolutiva, uma vez que o potencial informativo morfol?gico, molecular, e biogeogr?fico ainda n?o foi totalmente explorado. Um estudo filogen?tico compreensivo e densamente amostrado das rela??es de parentesco das esp?cies de Auchenipteridae, uma fam?lia de bagres Neotropical inseminadores, ? aqui documentado atrav?s de um conjunto de dados combinados, morfol?gicos e moleculares. O presente estudo objetivou incluir a maioria das esp?cies de Auchenipteridae (109 esp?cies), bem como diversos membros de outras fam?lias de Siluriformes representando o grupo externo (28 esp?cies de Mochokidae, Aspredinidae, Doradidae, Ariidae, Pimelodidae, Cetopsidae, e Diplomystidae) para contemplar a grande diversidade de formas existente dentro de Siluriformes, fornecendo uma robusta compara??o entre os t?xons al?m de uma s?rie de informa??es de diferentes fontes incluindo dados morfol?gicos (261 caracteres) e moleculares (2814 caracteres de quatro genes: COI, 16S, RAG2 e MYh6). A an?lise de parcim?nia baseada em dados combinados produziu 1691 ?rvores maximamente parcimoniosas e o consenso estrito corroborou a monofilia da superfam?lia Doradoidea e de Auchenipteridae e, tamb?m, de suas duas subfam?lias Centromochlinae e Auchenipterinae. A nova proposta de classifica??o aumenta o n?mero de tribos em Auchenipteridae, de duas para nove, evidenciando os seguintes grandes grupos dentro de Auchenipterinae: Liosomadoradini, Trachelyopterini, Asterophysini, Auchenipterini, and Ageneiosini; e quatro novas tribos em Centromochlinae: Gelanoglanini, Gephyromochlini, Centromochlini, e Glanidini. Adicionalmente, a maioria dos g?neros de auchenipter?deos foi recuperada como monofil?tica, exceto por Centromochlus e Tatia. Centromochlus ? restringido a somente tr?s esp?cies, enquanto que Tatia ? recuperado como g?nero mais diverso incluindo as atuais esp?cies Centromochlus simplex, C. reticulatus e Pseudotatia parva, aqui realocadas. Para resolver a parafilia de Centromochlus e Tatia, dois novos g?neros de Centromochlinae s?o propostos e uma reorganiza??o nomenclatural destes g?neros ? feita. Adicionalmente, Glanidium e Trachycorystes resultaram como parafil?ticos, e uma nova combina??o ? proposta para Glanidium leopardum, revalidando Gephyromochlus para alocar este t?xon e tamb?m um novo g?nero de Auchenipterinae para alocar Trachycorystes menezesi. N?o obstante, Ageneiosus foi recuperado como parafil?tico, uma vez que A. militaris foi recuperado como grupo irm?o do clado Ageneiosus e Tympanopleura. A parafilia de Ageneiosus parece ser um artefato de dados morfol?gicos faltantes para A. militaris e at? os mesmos serem inclu?dos na an?lise para realmente testar a posi??o desta esp?cie, os dois g?neros s?o mantidos como v?lidos. Uma lista de sinapomorfias e as diagnoses dos clados s?o apresentadas sob uma nova proposta de classifica??o. Ainda, as rela??es de parentesco e a monofilia dos g?neros e grandes grupos s?o discutidas e comparadas ? proposi??es pr?vias.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:08:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 397838.pdf: 1192704 bytes, checksum: 7ccf2868b7a0051ab601e134c300c5e9 (MD5) Previous issue date: 2007-01-17 / Embora a regi?o neotropical seja considerada como a mais rica em n?mero de esp?cies de peixes de ?gua doce do mundo, poucos estudos objetivaram a compreens?o da diversidade gen?tica em esp?cies de ampla distribui??o. Analisadas sob uma perspectiva de varia??o gen?tica, estas esp?cies podem ser ?timos modelos para compreens?o da rela??o hist?rica entre as bacias hidrogr?ficas. Com o objetivo de determinar os padr?es caracter?sticos da varia??o gen?tica nas popula??es de H. malabaricus nas bacias hidrogr?ficas do Rio Grande do Sul e bacias vizinhas, foram utilizados marcadores gen?ticos moleculares (RAPD=136 amostras e Seq?enciamento SNPs= 48 amostras) e definidos tr?s clados entre as popula??es: o primeiro com animais da Bacia Hidrogr?fica do Rio Uruguai -BHRU (exceto Alto Uruguai) e um ponto da Argentina; o segundo, com animais da Bacia Hidrogr?fica da Lagoa dos Patos-BHLP e Bacia Hidrogr?fica do Rio Tramanda?-BHRT e o terceiro clado com os animais do Alto Uruguai, BHLP e BHRT. As amostras do litoral brasileiro, que foram inclu?das com o intuito de estabelecer compara??es, fizeram um grupo ? parte, com exce??o das amostras de S?o Paulo e Paran? que constitu?ram o segundo clado. Em rela??o ? metodologia utilizada, verificou-se que ambas mostraram uma semelhan?a nos resultados obtidos, por?m o Seq?enciamento mostrou-se mais sens?vel na elabora??o dos agrupamentos.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:08:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 398604.pdf: 11571612 bytes, checksum: 5daf16bb95ffcb098498d92af708d644 (MD5) Previous issue date: 2007-12-21 / Este trabalho contem informa??es extensivamente revisadas sobre a taxonomia e distribui??o dos peixes-bruxa. Ele inclui todas as esp?cies nominais da fam?lia Myxinidae, a qual compreende 2 subfam?lias, 6 g?neros e 69 esp?cies. Informa??es sobre cada esp?cies incluem: nomes v?lidos e descri??es originais; sin?nimos; material examinado; caracter?sticas diagn?sticas; tamanho m?ximo; distribui??o e habitat; interesse pesqueiro; observa??es (quando necess?rio); e nomes vernaculares. Pela primeira vez s?o apresentadas chaves de identifica??o e mapas de distribui??o para todos os g?neros e esp?cies, observando-se amplia??es na distribui??o de muitas delas. As subfam?lia Paramyxininae Berg, 1947 e Quadratinae Wisner, 1999 s?o consideradas sin?nimos j?nior de Eptatretinae Bonaparte, 1850. O g?nero Quadratus Wisner, 1999 ? considerado sin?nimo j?nior de Paramyxine Dean, 1904. Uma esp?cie de Eptatretus e duas de Myxine s?o sinonimizadas. Duas novas esp?cies s?o descritas: Eptatretus lakeside Mincarone & McCosker, 2004, do Arquip?lago de Gal?pagos, e Eptatretus goliath Mincarone & Stewart, 2006, da Nova Zel?ndia. A inclina??o da curva acumulativa de diversidade temporal indica que o n?mero de esp?cies de Myxinidae ainda est? longe de ser conhecido. Cruzeiros de pesquisa direcionados a regi?es pouco exploradas e o uso de novas tecnologias de coleta poder?o revelar esp?cies ainda n?o descritas.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:08:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 395848.pdf: 2738008 bytes, checksum: 39198f00dc6b62c6a5f604fc92b4854b (MD5) Previous issue date: 2003-04-25 / Os trabalhos que comp?e o corpo desta tese oferecem informa??es sobre aspectos biol?gicos e ecol?gicos de moluscos bivalves que ocorrem no estado de Mato Grosso. Registros pioneiros tratando sobre: 1 - morfologia ultraestrual das conchas, 2 - comportamento populacional frente a par?metros biom?tricos, 3 gametog?nese e ciclo sexual, e 4 - padr?es relacionados a sele??o de part?culas, taxa de filtra??o e respira??o, s?o considerados para duas esp?cies de Anodontites Brugui?re, 1792, g?nero de ocorr?ncia exclusiva na Am?rica do Sul. Utilizando abordagens de morfologia funcional, ecologia de popula??es e experimental, os principais resultados obtidos foram: 1 - A. trapesialis (LAMARCK, 1819) e A. elongatus (SWAINSON, 1823) possuem valvas constitu?das por tr?s segmentos, peri?straco, camada prism?tica e camada nacarada, semelhante aos demais Unionoida. Estruturas como pregas, arcos, microsestrias e esp?culas s?o descritas e diferenciadas para cada uma das esp?cies; 2 - quando comparadas popula??es provenientes de diferentes locais, ambas as esp?cies apresentaram diferen?as significativas frente ?s vari?veis peso da concha e altura, ficando demonstrado que as esp?cies apresentam plasticidade fenot?pica decorrentes de diferen?as ambientais; 3 as duas esp?cies s?o espermatozeugmatas, com gametog?nese cont?nua ao longo do ano, apresentando picos de produ??o e elimina??o de gametas durante as esta??es de vazante e seca; 4 A. trapesialis apresenta um potencial de filtra??o com capacidade de reten??o de part?culas entre 0,5 e 1,5 g.l-1/h. Paralelamente ao desenvolvimento dos estudos com as esp?cies nativas, foi observada na regi?o, a presen?a de duas esp?cies invasoras, Corbicula largillierti (PHILIPPI, 1844) e Corbicula fluminea (M?LLER, 1774). Como conhecimento complementar ? tese, foi acrescentado um capitulo que traz a hist?ria da invas?o de Corbiculidae na Am?rica do Sul e ainda apresenta dados biom?tricos das popula??es aplicado para diferenciar as duas esp?cies no limite Norte do Pantanal de Mato Grosso. Este conjunto de informa??es pretende compor uma base de dados, visando subsidiar a elabora??o de programas de manuten??o da biodiversidade e monitoramento da qualidade de ?guas interiores, utilizando bivalves de ?gua doce como organismos sentinelas e indicadores de altera??es ambientais.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 379849.pdf: 665244 bytes, checksum: 26bf7fd97c89bcf21998d7a11111c37f (MD5) Previous issue date: 2006-03-06 / O presente estudo foi realizado na Reserva Biol?gica do Lami (30? 15 S; 51? 05 W), uma ?rea com aproximadamente 179 ha localizada no munic?pio de Porto Alegre, Brasil. As atividades de campo compreenderam visitas bimensais a tr?s banhados semi-permanentes, com dura??o aproximada de dois dias e duas noites cada, entre agosto de 2004 e julho de 2005. Observamos diferen?as nos s?tios utilizados por machos, f?meas e juvenis, com machos ocupando locais mais profundos e mais distantes da margem. A distribui??o temporal dos indiv?duos, vocaliza??es e amplexos indicaram que, no local de estudo, a reprodu??o de P. minutus ? estacional prolongada, e regulada por fatores abi?ticos. Os machos em atividade de vocaliza??o apresentaram diferen?a significativa em rela??o os machos n?o vocalizantes para todos os fatores abi?ticos di?rios analisados (temperatura do ar, temperatura da ?gua, umidade relativa do ar e pluviosidade), bem como na temperatura do ar e pluviosidade mensais. A quantidade de machos, f?meas e juvenis em atividade foi influenciada pelo menos por um dos fatores ambientais mensais ou di?rios analisados. Os machos apresentaram duas vocaliza??es distintas: o canto de an?ncio e o canto territorial, este ?ltimo podendo apresentar uma ou duas notas. A freq??ncia dominante do canto de an?ncio n?o apresentou correla??o com a massa e o CRC dos machos gravados. Foram observados dois encontros agon?sticos entre machos; em um houve apenas intera??o ac?stica entre os indiv?duos, e no outro intera??o ac?stica e f?sica. Os machos apresentaram atividade de vocaliza??o predominantemente noturna e ocasionalmente diurna, com pico por volta das 23 horas. O n?mero de machos vocalizando variou significativamente ao longo do ano, sendo maior de maio a novembro, com pico em setembro.