Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2016-12-13T14:12:20Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_SistematicaDiversificacaoGeneros.pdf: 18979245 bytes, checksum: 81459d4261d5245f36b8c82afcfee28f (MD5) / Approved for entry into archive by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2016-12-21T16:54:32Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_SistematicaDiversificacaoGeneros.pdf: 18979245 bytes, checksum: 81459d4261d5245f36b8c82afcfee28f (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-21T16:54:32Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_SistematicaDiversificacaoGeneros.pdf: 18979245 bytes, checksum: 81459d4261d5245f36b8c82afcfee28f (MD5) Previous issue date: 2015-03-31 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Os avanços recentes no campo da sistemática de aves, especialmente com a inclusão de caracteres moleculares e vocais, tem levado a uma melhor compreensão dos processos históricos que geraram a diversidade de aves do Neotrópico e a um grande número de rearranjos sistemáticos e taxonômicos (Zink & Blackwell-Rago, 2000; Aleixo, 2002; D’Horta et al., 2008; Zimmer, 2008; Navarro-Sigüenza et al., 2008; Rheindt et al., 2008). Atualmente, existem diversas hipóteses que tentam explicar a diversidade presente e sua distribuição espacial, entre as principais podemos citar: a Hipótese paleogeográfica (Emsley, 1965); o modelo das barreiras ripárias (Wallace, 1852; Gascon et al., 2000); a hipótese dos refúgios (Haffer, 1969; 1997); a hipótese dos rios-refúgios (Ayres, 1992); e a hipótese de perturbação-vicariância (Colinvaux, 1993). Embora essas varias hipóteses biogeográficas tenham sido formuladas, apenas poucos estudos têm testado os padrões filogenéticos dos táxons Neotropicais (Derryberry et al., 2011; Patel et al., 2011; d’Horta et al., 2012; Ribas, et al., 2011; Smith et al., 2013, Bryson et al., 2014). E apesar do grau de complexidade das hipóteses propostas, alguns estudos (Bates et al., 1998; Tobias, et al., 2008; Antonelli, et al., 2010) tem proposto que a história evolutiva da biota neotropical pode ter sido influenciada por um mosaico de diferentes modelos ao longo do tempo, sugerindo um passado ainda mais complexo do que o previsto pelas hipóteses existentes.

Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2016-12-14T12:35:36Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_SistematicaMolecularBiogeografia.pdf: 2811528 bytes, checksum: 878aa9e10f794ed285286b0a834a8d96 (MD5) / Approved for entry into archive by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2016-12-22T12:20:06Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_SistematicaMolecularBiogeografia.pdf: 2811528 bytes, checksum: 878aa9e10f794ed285286b0a834a8d96 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-22T12:20:06Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_SistematicaMolecularBiogeografia.pdf: 2811528 bytes, checksum: 878aa9e10f794ed285286b0a834a8d96 (MD5) Previous issue date: 2013-06-28 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O gênero Megascops é o maior gênero de corujas (Strigidae) endêmico do Novo Mundo, com cerca de 20 espécies distribuídas do Canadá à Argentina, atingindo o ápice de sua diversidade nos Andes e na América Central. A diagnose dos táxons do gênero é em geral bastante difícil devido a uma grande similaridade morfológica entre a maioria dos mesmos, e ao polimorfismo presente em praticamente todas as populações. Estudos filogenéticos sobre o gênero incluíram poucos táxons e genes, e as relações de parentesco entre as espécies e subespécies de Megascops é muito pouco compreendida. Os táxons florestais amazônicos, M. watsonii watsonii e M.w. usta, separados pelo Rio Amazonas, e a espécie da Mata Atlântica M. atricapilla, por exemplo, são consideradas como proximamente relacionadas, mas estudos anteriores sugeriram que essas espécies são parapátricas em relação umas às outras. Dentro da distribuição de M.w. usta, há variações vocais geograficamente distribuídas, que sugerem a presença de espécies crípticas, e estudos mais aprofundados são necessários para que se compreenda melhor a situação taxonômica desse grupo. No presente trabalho, nós propomos uma filogenia para o gênero Megascops baseada em dados moleculares (Primeiro capítulo), e conduzimos um estudo de biogeografia e taxonomia dos táxons M. watsonii watsonii, M.w. usta e M. atricapilla baseado em dados moleculares, morfológicos e vocais (Segundo capítulo). Os dados moleculares em ambos os capítulos foram obtidos pelo sequenciamento de três genes mitocondriais (citocromo b, ND2 e CO1) e três nucleares (b-fibrinogênio 5, CHD e MUSK) para todas as amostras. Os dados moleculares foram analisados através de análises de Máxima Verossimilhança, Inferência Bayesiana e Árvore de Espécies. Análises de Relógio Molecular e de S-DIVA foram rodadas para inferir o tempo de divergência e as áreas ancestrais para todos os táxons analisados do gênero Megascops. Em todas as análises, Megascops é parafilético se incluirmos no gênero a espécie M. nudipes, que se agrupou próxima ao grupo externo, Otus flammeolus. As demais espécies se separam em três grandes clados: Um composto por M. choliba, M. koepckeae, M. albogularis, M. clarkii e M. trichopsis, um segundo composto por espécies andinas, e um terceiro com as espécies restantes. Muitos dos ramos receberam baixo apoio estatístico nas análises, o que torna a relação entre muitas espécies indeterminada, dentro dos grandes clados. As espécies M. watsonii e M. atricapilla são parafiléticas, e valores de divergência entre populações disjuntas de algumas espécies (M. vermiculatus, M.ingens, M. trichopsis) se aproximam dos de alguns pares de espécies inequívocas, sugerindo uma diversidade dentro do gênero 9 maior do que a atualmente reconhecida. A especiação dentro do gênero (excetuando-se M. nudipes) aconteceu nos últimos oito milhões de anos, e o gênero provavelmente se originou nos Andes, posteriormente colonizando as Américas. Megascops nudipes deve ser retirada do gênero Megascops. Mais estudos são necessários para avaliar a real situação taxonômica das espécies do gênero Megascops, especialmente as que apresentam subespécies, como M. vermiculatus e M. ingens. O soerguimento dos Andes pode ter desempenhado um papel extremamente importante na diversificação do gênero. Para os táxons Megascops watsonii watsonii, M.w. usta e M. atricapilla, foram sequenciados os mesmos genes, para 49 amostras de tecido muscular. Os dados foram analisados através de análises de Máxima Verossimilhança, Inferência Bayesiana, Árvore de Espécies e Relógio Molecular. Foram feitas medições morfométricas em 251 peles, e medidos parâmetros vocais de 85 gravações, cobrindo todas as regiões zoogeográficas habitadas por esses táxons. Os dados morfométricos e vocais foram analisados através de Análises de Função Discriminante, um método de diagnose de pares de espécies através de dados vocais também foi aplicado. Os dados moleculares se dividiram em seis clados bem apoiados, cuja distribuição não está de acordo com a taxonomia atual desse grupo de espécies. Um dos clados está restrito a poucos fragmentos de floresta atlântica muito pequenos e isolados, no leste do Brasil. Se reconhecido como uma espécie válida, quase certamente será o táxon em maior perigo de extinção dentro do gênero Megascops. As análises dos dados morfométricos não detectaram diferenças significativas entre os clados, e a grande variação no padrão de plumagem dentro das populações torna quase impossível fazer generalizações. Porém, alguns morfos tendem a ser mais comuns em algumas populações do que em outras. As análises vocais apontaram diferenças entre alguns dos clados, mas há uma considerável sobreposição entre alguns deles, e há variação vocal dentro de algumas populações, especialmente no clado de maior distribuição. A especiação desse grupo aconteceu durante o Pleistoceno-Plioceno, e os fatores mais importantes a definir a atual distribuição dos clados parecem ser a formação do atual sistema hídrico da Amazônia, uma posterior expansão da distribuição de algumas populações, e a separação da Amazônia e da Mata Atlântica, com uma divisão posterior dessa última pela formação do Rio São Francisco. Recomendamos a redefinição dos táxons M.w. watsonii, M.w. usta e M. atricapilla e o reconhecimento de outras três populações filogenéticas, duas das quais não possuem nome disponível.

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Tesis por compendio de publicaciones / Para poder entender el efecto de los parásitos sobre los hospedadores y la evolución de las interacciones parásito-hospedador es necesario comprender primero el efecto de los factores ambientales sobre estos organismos y su interacción, lo que a su vez requiere considerar tales factores a la escala adecuada según los organismos implicados. El objetivo principal de esta tesis es estudiar el efecto de factores abióticos, particularmente la temperatura, en la regulación de la diapausa del ectoparásito Carnus hemapterus. Este insecto es un díptero hematófago generalista con amplia distribución geográfica que parasita a los pollos de una gran variedad de especies aviares (en su mayoría trogloditas). El trabajo se desarrolló en una localidad árida del sureste de España (desierto de Tabernas), donde coexisten entremezclados tres tipos de hábitats (oquedades naturales en taludes de ramblas, cavidades en construcciones humanas, - principalmente puentes - y cajas nido) ocupados por Carnus hemapterus y sus hospedadores aviares. Como primer paso se determinó mediante sensores el microclima de las tres cavidades donde Carnus desarrolla su diapausa. Las características microclimáticas mostraron notables diferencias, siendo las cajas nido más inestables (frías y con marcada oscilación térmica), mientras que las otras oquedades fueron mucho más estables, presentando las cavidades en taludes condiciones más cálidas y secas que las de puentes. Esta heterogeneidad ambiental tiene importantes implicaciones tanto para los organismos endotermos que las habitan como para los ectotermos. Mediante experimentos de campo realizados con diversos hospedadores se comprobó en condiciones naturales la coexistencia de diapausas largas y cortas. Dado que la duración del ciclo de vida y número de generaciones al año (voltinismo) está determinado por la duración de la diapausa, registramos consecuentemente la coexistencia de moscas uni y bivoltinas tanto a nivel de población como de nido. Estos resultados muestran la naturaleza facultativa de la diapausa de Carnus así como el papel de las variables abióticas en la modulación de aquella. El estudio con cámaras climáticas de la influencia de la temperatura en la finalización de la diapausa y el patrón de emergencia mostró que aunque los choques de frío no son necesarios para que se termine la diapausa de Carnus, sí tienen importantes efectos, acelerando el desarrollo de la diapausa, adelantando la emergencia y acelerando su progreso respecto a condiciones constantes. Además, mediante experimentos en campo, comprobamos que las características térmicas particulares de los diversos microhábitats modularon el progreso de la diapausa, el comienzo de la emergencia y su patrón. En microclimas inestables (cajas nido) la fenología de emergencia se adelantó en la estación, pero su progreso fue más lento, alargando el periodo de emergencia en comparación con los microhábitats estables (puentes y taludes) entre los que no hubo diferencias en la emergencia. Comprobamos experimentalmente la consistencia de estos resultados cuando las diferencias microclimáticas fueron anuladas (homogeneizadas) en dos momentos de la fase de la diapausa; durante la diapausa invernal y al final de la fase de desarrollo de la post-diapausa. Estos resultados sugieren posibles procesos de adaptación o aclimatación a los microclimas. También se reveló la mayor sensibilidad de Carnus a cambios térmicos justo antes de la emergencia, lo que favorecería la percepción del cambio ambiental por la presencia del hospedador en el nido y consecuentemente la sincronización de la emergencia del parásito. El estudio de los requerimientos térmicos del parásito desveló que el desarrollo de la post-diapausa necesitó acumular menor cantidad de unidades de calor (grados día) en cajas nido, pero debido a las condiciones térmicas (fuerte oscilación con temperaturas extremas), el desarrollo fue ralentizado, necesitando más tiempo para desarrollarse que en cavidades térmicamente estables. En estas últimas cavidades los requerimientos térmicos fueron mayores (sobre todo en taludes), mostrando una tasa de emergencia similar entre ellas, pero acelerada con respecto a cajas nido. En definitiva, la presente tesis revela la importancia de considerar los factores abióticos a pequeña escala, así como los mecanismos que están actuando en la regulación del ciclo vital de parásitos para poder abordar futuros estudios fisiológicos, ecológicos o evolutivos entre otros. / Understanding the impact of parasites in their hosts and the evolution of host-parasite interactions requires previous knowledge on the effect of environmental factors on such organisms and its interaction. For this, it is critical to consider such factors at the appropriate scale, defined by the organisms under study. The main objective of this thesis is to study the effect of abiotic factors, particularly temperature, on the regulation of diapause of the ectoparasite Carnus hemapterus. This insect is a generalist haematophagous dipteran with a large geographic distribution that parasitizes nestling of a wide variety of bird species (mainly troglodyte ones). This work was developed in an arid locality in the southeast of Spain (Tabernas´ desert), where three types of habitats (natural burrows at sandy cliffs in the ramblas, cavities in human constructions, - mainly bridges - and nest boxes) coexist interspersed and are occupied by Carnus hemapterus and its avian hosts. Firstly, the microclimate of the three cavity types, where the diapause of Carnus takes place, was studied by data-loggers and considerable differences were found: nest boxes were colder and with marked thermal oscillation, while the temperature in the other cavities was much more stable. Moreover, burrows showed warmer and drier conditions than cavities in bridges. This environmental heterogeneity has important implications for the organisms (both endotherms and ectotherms) that inhabit these cavities. Field experiments performed with different host species in natural conditions revealed the co-occurrence of long and short diapauses. Since the duration of the life cycle and the number of generations per year (voltinism) is determined by the length of the diapause, we registered consequently, the co-occurrence of uni and bivoltine flies at both population and nest level. These findings illustrate the facultative nature of diapause of Carnus and the modulating role of abiotic variables. Experimental tests with climatic chambers of the influence of temperature in the termination of diapause and the emergence pattern showed that, although cold shocks are not necessary for the end of the diapause, they stimulate the development of diapause, advance the emergence and accelerate its progress when compared to constant conditions. Furthermore, by means of field experiments, we checked that the particular thermal features of the microhabitats modulated the progress of the diapause, the emergence start and its pattern. In habitats with fluctuating microclimate (nest boxes) the phenology of emergence occurred earlier in the season, but its emergence progress was slower, making the emergence longer compared with stable microhabitats (cavities in bridges and burrows) where no differences in emergence were found. We confirmed experimentally the consistency of such results when the microclimatic differences were removed in two different moments of the diapause: during the winter diapause and at the end of the development phase of the post-diapause. These findings suggest adaptation or acclimatization of individuals to specific microclimates. Also, a higher sensitivity of Carnus to thermal changes just before emergence was revealed, what would favor the perception of environmental changes due to the presence of the host in the nest and, consequently, the synchronization of the parasite emergence. The study of the thermal requirements of the parasite revealed that its post-diapause development needed to accumulate less heat units (degree day) in nest boxes than in the other cavity types. Yet, due to sharp thermal oscillation with extreme temperatures, the development was likely decelerated by development arrests. Thus, flies from nest boxes needed more time to develop than flies from thermally stable cavities. Flies from cavities in bridges and burrows showed higher thermal requirements (mainly in burrows), being the emergence rate similar between them, but faster when compared with flies from nest boxes. Finally, this thesis reveals the importance of considering the abiotic factors at a small scale and the mechanisms acting in the regulation of the life cycle of parasites before addressing future physiological, ecological or evolutionary studies.

El lenguado (Solea spp.) es una especie interesante para la producción acuícola. Las causas son su valoración gastronómica y la potencial sustitución de otras especies cultivadas en instalaciones en tierra sin modificaciones sustanciales. Sin embargo, su reproducción y alimentación siguen sin dominarse, constituyendo ésta última el sujeto de esta tesis. Para la alimentación, por sus hábitos nocturnos, el lenguado dispone de un equipamiento sensorial constituido por quimiorreceptores y mecanorreceptores, dependiendo escasamente de la visión. Los piensos que se desarrollen para su alimentación deben satisfacer unos requerimientos organolépticos muy especiales. En este trabajo se incorporan al pienso aromas comerciales y enzimas exógenos, al igual que se hace en otras producciones zootécnicas con la finalidad de promover la ingesta en primeras edades y camuflar sabores desagradables. Aquí dichas sustancias se comparan con la betaína, considerada esencial por diversos autores para larvas y juveniles de lenguado, y con piensos sin atrayentes. Todos los piensos utilizados se formulan con ingredientes habituales en piensos comerciales y se fabrican con métodos standard, para facilitar la transferencia de los resultados obtenidos al sector industrial.La influencia de la incorporación de aroma se evalúa en el comportamiento alimentario y en los parámetros productivos más relevantes: crecimiento, supervivencia y dispersión de tallas. Utilizando una metodología etológica adaptada a la conducta del lenguado se concluye que la incorporación de aroma mejora la atracción de los piensos evaluados, consiguiendo que los lenguados se aproximen al pienso y lo prueben. En referencia a la palatabilidad, en un lote que incluye dos subclases de peso, los peces grandes muestran cierta preferencia por los piensos con aroma, mientras que los peces pequeños prefieren la betaína que resulta más eficiente como estimulante de la ingesta. En experiencias a largo plazo utilizando diferentes piensos, la betaína muestra su eficiencia mejorando tanto crecimiento como supervivencia. En esta misma fase, la incorporación al pienso de enzimas proteolíticos no genera mejoras suficientes como para compensar su elevado coste. Después de esta fase, un pienso con aroma comercial promueve tasas de crecimiento y supervivencia interesantes. La dispersión de tallas mantiene una tendencia creciente con independencia del pienso utilizado. En las experiencias se evidencia la importancia del manejo en origen. Un lote de peces estrictamente clasificado en la hatchery y con una nutrición larvaria adecuada, alcanza la talla comercial mínima en menos de un año. Globalmente, el cultivo de lenguado parece viable sin exigir una especial complejidad técnica, aunque algunos aspectos del cultivo deben optimizarse.

En este trabajo se han analizado las siguientes características cariotípicas de diferentes especies de primates Simiiformes: 1) HOMOLOGIAS Y REORGANIZACIONES CROMOSÓMICAS. Mediante la comparación de su patrón de bandas G, se han determinado las homologías cromosómicas de dos especies del género Cebus (C. apella y C. capucinus) y de diferentes especies del género Ateles (A. belzebuth hybridus, A. b. marginatus, A. paniscus paniscus y A. p. chameck). Esta comparación ha permitido determinar las reorganizaciones cromosómicas que explicarían las homologías detectadas: 3 inversiones pericéntricas en el caso de las especies del género Cebus y 4 inversiones pericéntricas, una paracéntrica y una fusión en el caso de Ateles. La aplicación de la técnica de ZOO-FISH y bandas G secuenciales utilizando las sondas de todos los cromosomas humanos completos, ha permitido determinar las homologías entre la especie humana (HSA), Cebus apella (CAP) y Ateles belzebuth hybridus (ABH). La comparación de los cromosomas o segmentos cromosómicos homólogos de las especies comparadas, ha permitido determinar las reorganizaciones cromosómicas que explicarían las homologías detectadas, y las bandas implicadas en dichas reorganizaciones. Las reorganizaciones cromosómicas detectadas han sido: a) 11 fisiones, 10 fusiones, 12 inversiones pericéntricas, 9 activaciones/inactivaciones centroméricas y 3 inversiones paracéntricas al comparar HSA y CAP; b) 19 fusiones, 11 fisiones, 18 activaciones /inactivaciones centroméricas y 6 inversiones pericéntricas al comparar HSA y ABH; y c) 17 fusiones, 11 activaciones/inactivaciones centroméricas, 5 inversiones pericéntricas, 3 fisiones y 3 inversiones paracéntricas al comparar CAP y ABH. Se ha analizado la relación existente entre las bandas implicadas en reorganizaciones cromosómicas evolutivas de la especie humana y de CAP con la localización de lugares frágiles y bandas sensibles al efecto de las radiaciones ionizantes en ambos cariotipos. Aplicando el test de la Ji cuadrado, se ha podido concluir que las coincidencias observadas no son estadísticamente significativas. Se ha determinado también el cariotipo ancestral de los Platyrrhini, así como las homologías de estos cromosomas ancestrales con los del cariotipo humano.2) ANÁLISIS CUALITATIVO DE LA HETEROCROMATINA CONSTITUTIVA. Se ha realizado el análisis cualitativo de la heterocromatina constitutiva de 15 especies de primates Simiiformes: Homo sapiens, Pan troglodytes, Gorilla gorilla, Hylobates syndactylus, Macaca fascicularis, M. tibetana, Papio leucophaeus, P. sphinx, Cercopithecus aethiops, C. sabaeus, C. albogularis, Cebus apella, Ateles belzebuth hybridus, Aotus azarae y A. nancymai. Las técnicas utilizadas para realizar este análisis han sido: a) digestión in situ con los enzimas de restricción AluI, HaeIII, RsaI y Sau3A y b) tinción con el par DA/DAPI en cromosomas sin bandeo previo, en cromosomas con bandeo C previo, y en cromosomas con bandeo G/C previo. La homogeneidad en la heterocromatina intersticial y terminal (HIT), y la heterogeneidad en la heterocromatina de localización centromérica (HC) observadas en la mayor parte de las especies analizadas, parece indicar un origen evolutivo relativamente reciente de la HIT e independiente del de la HC, que tendría un origen más antiguo. / In this work, the following cytogenetic chraracteristics from different Simiiiformes species have been analyzed:1) CHROMOSOMAL HOMOLOGIES AND REORGANIZATIONS. G-banding comparison has been used to determine homologies between two species of Cebus genus (C. apella and C. capucinus), and from different Ateles subspecies (A. belzebuth hybridus, A. b. marginatus, A. paniscus paniscus y A. p. chameck). This study has allowed to establish chromosomal reorganizations that could explain the homologies detected: 3 pericentric inversions in Cebus species, and one paracentric and 4 pericentric inversions, and a fusion in the Ateles subspecies. ZOO-FISH and sequential G-banding technique using whole human chromosome probes, have been used to determine chromosomal homologies between humans (HSA), Cebus apella (CAP) and Ateles belzebuth hybridus (ABH). G-banding comparison of homologous chromosomes from those species has allowed to characterize the chromosomal reorganization that could explain the homologies detected, as well as the bands involved in these reorganizations. The chromosomal reorganizations detected are: a) 11 fissions, 10 fusions, 12 pericentric inversions, 9 centromeric activations/inactivations and 3 paracentric inversions when HSA and CAP were compared; b) 19 fusions, 11 fissions, 18 centromeric activations/inactivations and 6 pericentric inversions when HSA and ABH are compared and c) 17 fusions, 11 centromeric activations/inactivations, 5 pericentrics inversions, 3 fissions and 3 paracentric inversions when CAP and ABH are compared. Relationship between bands involved in evolutive chromosomal reorganizations of HSA and CAP and localization of Fragile Sites and bands sensitive to the ionized radiations in both karyotypes, have been analyzed. Using the Chi square test, results show that coincidences observed are not statistically significant. In this work, the ancestral karyotype of Platyrrhini group is proposed, as well as the homologies between its chromosomes and those of the human karyotype. 2) QUALITATIVE ANALYSIS OF CONSTITUTIVE HETEROCHROMATIN. Constitutive heterochromatin from 15 Simiiformes primate species has been analyzed: Homo sapiens, Pan troglodytes, Gorilla gorilla, Hylobates syndactylus, Macaca fascicularis, M. tibetana, Papio leucophaeus, P. sphinx, Cercopithecus aethiops, C. sabaeus, C. albogularis, Cebus apella, Ateles belzebuth hybridus, Aotus azarae y A. nancymai. Techniques used are: a) in situ digestion with the restiction enzymes AluI, HaeIII, RsaI and Sau3A and b) fluorescent staining with DA/DAPI on unbanded, C-banded and G/C banded chromosomes. The homogeneity in the interstitial and terminal heterochromatin (ITH), and the heterogeneity in centromeric heterochromatin (CH) observed in nearly all the species analyzed seem to indicate that ITH has a more recent evolutive origin than CH.

In the present thesis, we have studied the evolution of the inflammasome functions in fish. We observed that inflammasome and caspase-1 trigger pyroptotic cell death but they are not involved in the processing of IL-1β. In addition, we have developed a zebrafish-Salmonella infection model to study the role of the inflammasome in the clearance of intracellular bacteria. Finally, we have identified and characterized a new member of the IL-1 family, IL-1Fm2, which is exclusively present in most evolutionarily advanced teleosts. The identification of this new IL-1 family member helps to understand the evolution of this family of cytokines in vertebrates and point out to its complexity. / En la presente tesis doctoral se ha estudiado la evolución de las funciones del inflamasoma en peces, llegando a la conclusión de que tanto el inflamasoma como la caspasa-1 desencadenan muerte celular conocida como piroptosis, pero no son necesarios para el procesamiento de la IL-1β. Además se ha desarrollado un modelo de infección en pez cebra para el estudio del papel del inflamasoma en la eliminación de bacterias intracelulares, como Salmonella. Por último, se ha descrito un nuevo miembro de la familia de la IL-1, IL-1Fm2, perteneciente exclusivamente a los peces teleósteos más avanzados evolutivamente. La identificación de este nuevo miembro de la familia de la IL-1, IL-1Fm2, ayuda a entender la evolución de esta familia de citoquinas en vertebrados e indica su gran complejidad.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:44Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-04-15Bitstream added on 2014-06-13T19:46:43Z : No. of bitstreams: 1 haifig_i_dr_rcla.pdf: 2054555 bytes, checksum: 803fbe5e3da776dfaa8be8546198a21a (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Os cupins são insetos eussociais que apresentam divisão em castas entre os componentes das colônias. As castas apresentam adaptações morfofisiológicas para o melhor desempenho de determinadas funções e atividades comportamentais. A presente pesquisa objetivou analisar, do ponto morfológico, fisiológico e comportamental, as castas ápteras do cupim Velocitermes heteropterus que participam ativamente do forrageamento. No capítulo 1 deste volume é apresentado o estudo do polimorfismo da casta operária de V. heteropterus com duas subcastas, operários pequenos e grandes, baseado em caracteres morfométricos. Além disso, no capítulo 1 a rede de túneis escavadas por estes insetos foi caracterizada e as redes formadas por operários pequenos comparadas àquelas formadas por operários grandes e por grupos mistos dos dois tipos de operários. No capítulo 2 são apresentados os dados morfométricos dos outros componentes da linhagem áptera, ou seja, larvas e soldados, e também constam os dados de expressão gênica das celulases, os quais foram quantificados para ambos operários (pequenos e grandes) e soldados. Adicionalmente, no capítulo 2 é apresentado o sistema de desenvolvimento pós-embrionário da linhagem áptera de V. heteropterus. No capítulo 3 são apresentados dados sobre a dinâmica das trilhas de forrageamento de V. heteropterus. O fluxo de cupins saindo do ninho e retornando do alimento, a velocidade média individual e o número de colisões, bem como a distribuição espacial dos indivíduos nas trilhas, foram analisados durante as três primeiras horas desde o início do processo de forrageamento. A linhagem áptera de V. heteropterus apresenta um polimorfismo que está intimamente vinculado ao sexo e aos ínstares dos indivíduos. O polimorfismo dos componentes desta linhagem está relacionado... / Termites are eusocial insects that exhibit a division in castes among the members of the colonies. The current research had the aim to analyze, on the morphological, physiological and behavioral points of view, the apterous castes of the termite Velocitermes heteropterus that actively participate in foraging. The castes show morpho-physiological adaptations to develop certain functions and behavioral activities. In the chapter 1 of this volume it is presented the study of the polymorphism in the worker caste of V. heteropterus with two subcastes, major and minor workers, based on morphometric characters. In addition, in the chapter 1, the tunnel network excavated by these insects is characterized and the networks excavated by minor workers are compared to those excavated by major workers and mixed groups containing the two types of workers. In the chapter 2, the morphometric data on the other apterous individuals are presented, i. e., larvae and soldiers, and it is shown the cellulase gene expression, which were quantified for both workers (minors and majors) and soldiers. Additionally, in the chapter 2, the post-embryonic developmental system of the apterous line in V. heteropterus is presented. In the chapter 3, it is exhibit data on foraging trail dynamics of V. heteropterus. The flow of termites leaving the nest and returning from the food, the individual speed and the number of collisions, as well as the spatial distribution of the individuals in the trails, were analyzed for the first three hours from the beginning of the foraging process. The apterous line exhibit a polymorphism intimately related to the sex and instars of the individuals. The polymorphism of the members of this line is related to a differential contribution of the subcastes in tunneling and foraging processes, but does not seem to influence the... (Complete abstract click electronic access below)

Submitted by Alberto Vieira (martins_vieira@ibest.com.br) on 2018-05-24T17:53:23Z No. of bitstreams: 1 278475.pdf: 19892911 bytes, checksum: 01ecabe823cb648e15df92f3e73d46c3 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-24T17:53:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 278475.pdf: 19892911 bytes, checksum: 01ecabe823cb648e15df92f3e73d46c3 (MD5) Previous issue date: 1998-04-14 / CAPES / FUJB / FAPERJ / CEPEG / Foram estudados aspectos taxonômicos e da distribuição batimétrica e geográfica de nove espécies de Paramuriceidae (Bebryce cinerea, Bebryce sp., Heterogorgia uatumani, Muriceides hirtus, Muriceides aequatoriales, Muriceides sp., Placogorgia atlantica, Scleracis guadalupensis e Villogorgia nigrescens) e cinco espécies de Plexauridae (Muricea atlantica, Muricea flamma, Muricea laxa, Muricea midas e Muriceopsis sp.) encontradas na plataforma continental e ilhas oceânicas brasileiras, entre 20 e 400 m de profundidade. Dentre as espécies identificadas apenas até gênero, destaca-se Muriceopsis sp., que foi evidenciada como desconhecida para a ciência até o presente momento. Foi registrada uma nova ocorrência de gênero para o Brasil (V. nigrescens) e ampliadas as áreas de ocorrência de outras cinco espécies (B. cinerea, H. uatumani, P. atlantica, S. guadalupensis, M. flamma). Heterogorgia uatumani, Scleracis guadalupensis e Villogorgia nigrescens tiveram sua distribuição batimétrica ampliada. Apenas duas dentre as espécies aqui registradas têm ocorrência restrita ao Brasil (M. flamma e M. aequatoriales ). São discutidas propostas biogeográficas de diversos autores, sendo evidenciado que aquelas baseadas em material de águas muito rasas ( < 20 m) não são adequadas para a caracterização da fauna de octocorais aqui estudada. / Fourteen species of octocorals, from the Brazilian continental platform and oceanic islands, from depths between 20 and 400m, were studied regarding aspects of their taxonomy, bathymetry, and geographical distribution. These species included nine Paramuriceidae (Bebryce cinerea, Bebryce sp., Heterogorgia uatumani, Muriceides hirtus, Muriceides aequatoriales, Muriceides sp., Placogorgia atlantica, Scleracis guadalupensis, and Villogorgia nigrescens) and five Plexauridae (Muricea atlantica, Muricea flamma, Muricea laxa, Muricea midas, and Muriceopsis sp. ). Among the species identified only at the rank of genus, it was demonstrated that Muriceopsis sp. is a species yet to be properly described in nomenclatural terms. Villogorgia was recorded for the first time in Brazilian waters and the geographical limits of five other species were changed (B. cinerea, H. uatumani, P. atlantica, S. guadalupensis and M. flamma). H. uatumani, S. guadalupensis, and V. nigrescens had their species global bathymetric range widened. Only two of the species here recorded were endemic to Brazil (M. flamma and M. aequatoriales). Biogeographical hipothesis from different authors were discussed, and it was shown that those based on material from very shallow waters (< 20m) were not adequate to characterize the distribution of octocoral species here reported.

Submitted by Alberto Vieira (martins_vieira@ibest.com.br) on 2018-05-24T19:39:42Z No. of bitstreams: 1 273329.pdf: 13734066 bytes, checksum: 931ef194544d2a39cf8abb9127d71a2a (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-24T19:39:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 273329.pdf: 13734066 bytes, checksum: 931ef194544d2a39cf8abb9127d71a2a (MD5) Previous issue date: 1998-11-16 / CAPES / O objetivo deste estudo foi analisar os padrões de variação espaço-temporal das cladóceras marinhas na Baía de Guanabara quanto à ocorrência, abundância, distribuição e aspectos reprodutivos. A análise das variações sazonais foram feitas utilizando-se amostras coletadas com rede do tipo cônico- cilíndrica de 200μm de abertura de malha durante o ano de 1985. Para tal, a Baía de Guanabara foi dividida em três áreas: região externa (área A), influenciada pela água costeira-oceânica; região interna ( área C) influenciada pelo aporte fluvial; e uma região de transição ( área B ), com características intermediárias entre as duas primeiras. Duas espécies de cladóceras marinhas, pertencentes a dois distintos gêneros, foram identificadas: Penilia avirostris e Evadne tergestina. Estas espécies foram observadas nas três áreas da Baía, mas suas maiores densidades restringiram-se à região mais externa, onde foram registradas as maiores salinidades e as menores temperaturas de toda a região estudada. Penilia avirostris mostrou-se maís abundante no verão, com um máximo populacional sendo observado em março; justamente nesta época... / The present study investigated some aspects of temporal and spatial occurrence, abundance, distributions and reproduction of marine cladocerans in Guanabara Bay (Brazil). A seasonal analysis was made on the basis of samples obtained during 1985. Three areas were distinguished within Guanabara Bay: an external area (area A), being mainly influenced by oceanic waters; an internal area ( area C), being mainly influenced by fluvial waters; and a transitional area ( area B) between the two. Samples were collected during horizontal surface hauls using a conical net with 200μm mesh. Two species of marine cladocerans belonging to two genera have been found to occur in study region: Penilia avirostris Dana and Evadne tergestina Claus. These species were found to be presented throughout the three areas investigated, but were observed to be most abundant in external area (area A) where waters showed higher values of salinity and lower temperatures. Penilia avirostris exhibited greater densities in summer with a peak in March, when relative greater densities of nanoplankton organisms...