At Saab Dynamics AB there are a number of projects where cameras are an important part of a sensor system. Examples of such projects are monitoring for civil security and 3D mapping, where several cameras are used. The cameras can for example be located in airplanes, helicopters or cars and therefore it is important to have a robust function for recording data. One way to achieve a quick recording with sufficient storage size is to use SATA flash disks. To reduce the size and power consumption of the recording equipment and to enable project-specific adaptations it is desirable to use an FPGA as an interface to SATA devices. This thesis concerns the development of such an interface implemented on an FPGA. The theory behind the SATA interconnect standard is described along with the design work and its challenges.

Made available in DSpace on 2016-08-10T10:29:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 JOSE ANTONIO VIANA DE MORAIS.pdf: 5002285 bytes, checksum: e2868ed24afede10446be19dffff5108 (MD5) Previous issue date: 2010-05-28 / Human papillomavirus (HPV) is one of the infections through sexual intercourse more often disseminated throughout the world. In Brazil it is estimated that there are around 3 to 6 million cases of HPV. There are few studies about HPV in men. This study examined the therapeutic response of patients men infected with HPV and treated topic with a solution of 90% trichloroacetic acid (ATA 90%). Were treated between January 2007 and December 2008, at the Hospital for Tropical Diseases in Araguaina (TO) 1056 patients undergoing clinical analysis by means of physical examination and penioscopia. The records of these patients were analyzed and found that 589 (55.8%) were diagnosed with HPV. Of these, 529 were selected for study as these met the following inclusion criteria: patients with macroscopic and penioscópico of HPV, which did not undergo any treatment before consultation, which were treated only with ATA 90% before and monitored for any recurrence, at least twelve months. After collecting data it was found that only 68 (12,8%) patients treated with ATA 90% had recurrence of lesions. The age of initial and final of HPV ranged from 18 to 73 years. The average age of patients with recurrence was 34.9 years, coinciding with the peak of sexual activity and the presence of multiple parters. About 80% of cases of recurrence occurred in the first six months. The association with other sexual diseases was recorded and the most prevalent pathologies: balanoposthistis (31,3%), genital herpes (9,2%), gonococal urethritis (2,8%) and no-gonococcal urethritis (0,9%). We found that the presence of other STDs contributes to treatment failure, whereas 75% of cases had tumor recurrence ATA 90% occurred in patients with an STD associated with HPV. Regarding the location of the lesions, it was found that 61.1% occurred at the distal end of the male phallus. The number of lesions detected per patient ranged from 1 to 9, with the majority (82.3%) patients had 2-5 lesions. In this study, we identified that the prevalence of HPV infection in men, STD clinic with urological monitoring was high. The therapeutic efficacy of ATA 90% was higher than the values commonly found in the literature and the recurrence rate of patients was low. We suggest that monitoring of patients with HPV after treatment with ATA is 90% done with routine queries for up to twenty-four months and quarterly consultations with the cases of recurrence. We emphasize the need for a focus on serving the man aiming to prevent controllable diseases evolve into malignancies. / O papilomavírus humano (HPV) é uma das infecções por via sexual mais frequentemente disseminadas em todo o mundo. No Brasil estima-se que existam em torno de 3 a 6 milhões de casos de HPV. Há poucos estudos sobre o HPV em homens. Este trabalho analisou a resposta terapêutica de pacientes do sexo masculino infectados HPV e tratados topicamente com solução de ácido tricloroacético à 90% (ATA 90%). Foram atendidos entre janeiro de 2007 e dezembro de 2008, no ambulatório do Hospital de Doenças Tropicais de Araguaína (TO), 1056 pacientes submetidos a analise clínica por meio do exame físico minucioso e penioscopia. Os prontuários desses pacientes foram analisados e verificou-se que 589 (55,8%) apresentaram diagnóstico de HPV. Destes, 529 foram selecionados para o estudo por atenderem aos seguintes critérios de inclusão: pacientes com diagnóstico macroscópico e penioscópico de HPV, que não realizaram qualquer tratamento antes da consulta, que foram tratados exclusivamente com ATA 90% antes de qualquer recidiva e monitorados por, no mínimo, doze meses. Após coleta de dados verificou-se que apenas 68 (12,8%) pacientes que realizaram tratamento com ATA 90% apresentaram recidiva das lesões. A faixa etária de acometimento do HPV variou de 18 a 73 anos. A idade média dos pacientes com recidiva foi de 34,9 anos, coincidente com o pico de atividade sexual e a presença de múltiplos parceiros. Cerca de 80% dos casos de recidiva ocorreram nos seis primeiros meses. A associação com outras DSTs foi observada, sendo as patologias mais prevalentes: a balanopostite (31,3%), o herpes genital (9,2%), a uretrite gonocócica (2,8%) e a uretrite não gonocócica (0,9%). Verificamos que a presença de outra DST contribui para o insucesso terapêutico, visto que 75% dos casos de recidiva pós ATA 90% ocorreram em pacientes portadores de alguma DST associada ao HPV. Em relação à localização das lesões, verificou-se que 61,1% ocorreram na extremidade distal do falo masculino. O número de lesões encontradas por paciente variou de 1 a 9, sendo que a maioria (82,3%) dos pacientes apresentou de 2 a 5 lesões. Neste estudo, identificamos que a prevalência da infecção por HPV em homens, em ambulatório de DST com acompanhamento urológico foi elevada. A eficácia terapêutica do ATA 90% mostrou-se maior que os valores comumente encontrados na literatura e o índice de recidiva dos pacientes foi baixo. Sugerimos que o acompanhamento dos pacientes com HPV após o tratamento com ATA 90% seja realizado com consultas rotineiras por até vinte e quatro meses e com consultas trimestrais para os casos de recidiva. Reforçamos a necessidade de um enfoque no atendimento do homem com intuito de evitar que doenças controláveis evoluam para doenças oncológicas.

Submitted by admin tede (tede@pucgoias.edu.br) on 2017-10-02T12:52:56Z No. of bitstreams: 1 JOSÉ ANTONIO VIANA DE MORAIS 3.pdf: 4387158 bytes, checksum: 813e3206f05ae2289634baf546698b46 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-02T12:52:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 JOSÉ ANTONIO VIANA DE MORAIS 3.pdf: 4387158 bytes, checksum: 813e3206f05ae2289634baf546698b46 (MD5) Previous issue date: 2010-05-26 / Human papillomavirus (HPV) is one of the infections through sexual intercourse more often disseminated throughout the world. In Brazil it is estimated that there are around 3 to 6 million cases of HPV. There are few studies about HPV in men. This study examined the therapeutic response of patients men infected with HPV and treated topic with a solution of 90% trichloroacetic acid (ATA 90%). Were treated between January 2007 and December 2008, at the Hospital for Tropical Diseases in Araguaina (TO) 1056 patients undergoing clinical analysis by means of physical examination and penioscopia. The records of these patients were analyzed and found that 589 (55.8%) were diagnosed with HPV. Of these, 529 were selected for study as these met the following inclusion criteria: patients with macroscopic and penioscópico of HPV, which did not undergo any treatment before consultation, which were treated only with ATA 90% before and monitored for any recurrence, at least twelve months. After collecting data it was found that only 68 (12,8%) patients treated with ATA 90% had recurrence of lesions. The age of initial and final of HPV ranged from 18 to 73 years. The average age of patients with recurrence was 34.9 years, coinciding with the peak of sexual activity and the presence of multiple parters. About 80% of cases of recurrence occurred in the first six months. The association with other sexual diseases was recorded and the most prevalent pathologies: balanoposthistis (31,3%), genital herpes (9,2%), gonococal urethritis (2,8%) and no-gonococcal urethritis (0,9%). We found that the presence of other STDs contributes to treatment failure, whereas 75% of cases had tumor recurrence ATA 90% occurred in patients with an STD associated with HPV. Regarding the location of the lesions, it was found that 61.1% occurred at the distal end of the male phallus. The number of lesions detected per patient ranged from 1 to 9, with the majority (82.3%) patients had 2-5 lesions. In this study, we identified that the prevalence of HPV infection in men, STD clinic with urological monitoring was high. The therapeutic efficacy of ATA 90% was higher than the values commonly found in the literature and the recurrence rate of patients was low. We suggest that monitoring of patients with HPV after treatment with ATA is 90% done with routine queries for up to twenty-four months and quarterly consultations with the cases of recurrence. We emphasize the need for a focus on serving the man aiming to prevent controllable diseases evolve into malignancies. / O papilomavírus humano (HPV) é uma das infecções por via sexual mais frequentemente disseminadas em todo o mundo. No Brasil estima-se que existam em torno de 3 a 6 milhões de casos de HPV. Há poucos estudos sobre o HPV em homens. Este trabalho analisou a resposta terapêutica de pacientes do sexo masculino infectados HPV e tratados topicamente com solução de ácido tricloroacético à 90% (ATA 90%). Foram atendidos entre janeiro de 2007 e dezembro de 2008, no ambulatório do Hospital de Doenças Tropicais de Araguaína (TO), 1056 pacientes submetidos a analise clínica por meio do exame físico minucioso e penioscopia. Os prontuários desses pacientes foram analisados e verificou-se que 589 (55,8%) apresentaram diagnóstico de HPV. Destes, 529 foram selecionados para o estudo por atenderem aos seguintes critérios de inclusão: pacientes com diagnóstico macroscópico e penioscópico de HPV, que não realizaram qualquer tratamento antes da consulta, que foram tratados exclusivamente com ATA 90% antes de qualquer recidiva e monitorados por, no mínimo, doze meses. Após coleta de dados verificou-se que apenas 68 (12,8%) pacientes que realizaram tratamento com ATA 90% apresentaram recidiva das lesões. A faixa etária de acometimento do HPV variou de 18 a 73 anos. A idade média dos pacientes com recidiva foi de 34,9 anos, coincidente com o pico de atividade sexual e a presença de múltiplos parceiros. Cerca de 80% dos casos de recidiva ocorreram nos seis primeiros meses. A associação com outras DSTs foi observada, sendo as patologias mais prevalentes: a balanopostite (31,3%), o herpes genital (9,2%), a uretrite gonocócica (2,8%) e a uretrite não gonocócica (0,9%). Verificamos que a presença de outra DST contribui para o insucesso terapêutico, visto que 75% dos casos de recidiva pós ATA 90% ocorreram em pacientes portadores de alguma DST associada ao HPV. Em relação à localização das lesões, verificou-se que 61,1% ocorreram na extremidade distal do falo masculino. O número de lesões encontradas por paciente variou de 1 a 9, sendo que a maioria (82,3%) dos pacientes apresentou de 2 a 5 lesões. Neste estudo, identificamos que a prevalência da infecção por HPV em homens, em ambulatório de DST com acompanhamento urológico foi elevada. A eficácia terapêutica do ATA 90% mostrou-se maior que os valores comumente encontrados na literatura e o índice de recidiva dos pacientes foi baixo. Sugerimos que o acompanhamento dos pacientes com HPV após o tratamento com ATA 90% seja realizado com consultas rotineiras por até vinte e quatro meses e com consultas trimestrais para os casos de recidiva. Reforçamos a necessidade de um enfoque no atendimento do homem com intuito de evitar que doenças controláveis evoluam para doenças oncológicas.

Thesis (D.Min.)--Dallas Theological Seminary, 2004. / Includes abstract. Includes bibliographical references (leaves 527-542).

A baixa eficiência e a dificuldade de reprodução de resultados da técnica de transferência gênica mediada por espermatozoides (TGME) têm como possível explicação à ativação de endonucleases espermáticas. Assim, a inibição desta enzima poderia evitar a fragmentação de DNA (exógeno e genômico), possibilitando assim, o uso de maiores concentrações de DNA exógeno, aumentando a eficiência e garantindo a reprodutibilidade da técnica. O ácido aurintricarboxílico (ATA) é um inibidor geral de endonucleases (HALLICK et al., 1977), inclusive das endonucleases espermáticas (MAIONE et al., 1997; MAGNANO et al., 1998). Deste modo, o presente estudo objetivou avaliar a inibição das endonucleases espermáticas, pelo ácido aurintricarboxílico (ATA). Para isso, três experimentos foram realizados: 1) avaliar a inibição das endonucleases espermáticas pela adição do ácido aurintricarboxílico, após incubação com DNA exógeno; 2) verificar a eficiência do ATA na inibição de fragmentação de DNA genômico e 3) detectar o aumento nos índices de internalização após o uso de ATA. Para o primeiro experimento, um ensaio de digestão plasmidial com os plasmídeos PCX-EGFP e pmGENIE3 e três concentrações de ATA (10µM, 25µM e 50µM) foram testados. As digestões dos vetores plasmidiais ocorreram pela incubação dos plasmídeos PCX-EGFP e pmGENIE3, com e sem a presença de ATA, com extratos espermáticos. As incubações ocorreram durante 1 hora à 37ºC e os produtos foram analisados por eletroforese (2 horas, 100mV) em gel de agarose 0,7%. Os resultados foram avaliados em escala de cruzes, no qual 1 foi considerado digestão total dos plasmídeos e 3, a não digestão. Os resultados foram analisados em nível de significância de 5%. Os resultados demonstraram diferenças nas digestões dos dois vetores plasmidiais, sendo o pmGENIE3 mais susceptível à degradação pelo extrato espermático, demonstrando ausência de bandas em algumas replicatas (mediana=1). O PCX-EGFP apresentou inibição parcial da degradação já com 10µM de ATA. Já o pmGENIE só apresentou inibição da degradação com 25 ou 50µM de ATA. Assim a concentração utilizada nos experimentos consecutivos foi a de 50µM. Para o experimento 2, espermatozoides de camundongos da linhagem Bl-6/DBA (F1) foram incubados com duas concentrações (500 ou 1000ng) do plasmídeo PCX-EGFP, com ou sem pré-incubação com ATA. As incubações ocorreram durante 5 horas, em ar com 5% de CO2 à 37ºC. Assim, os espermatozoides foram submetidos ao teste de susceptibilidade à denaturação ácida e ao ensaio de cometa alcalino para verificar possível fragilidade da cromatina. Os dados demonstraram que o uso do ATA em espermatozoides murinos leva à fragilidade do genoma, independente de serem incubados com DNA exógeno e a concentração do mesmo. Além disso, foi possível verificar que pode existir um limiar de concentração ótima para que as endonucleases causem fragmentação do DNA cromossomal, o qual foi de 500ng. O uso de concentrações maiores, como 1000ng, pode ter agido como fator protetor ao DNA genômico, podendo este DNA exógeno ter sido o alvo primário das endonucleases, já que quando as amostras foram incubadas com essa concentração de plasmídeo, não houve altos índices de fragmentação no DNA endógeno. No experimento 3, espermatozoides de camundongos foram incubados com 500 ou 1000ng de PCX-EGFP/106 células, sendo ou não pré-incubados com ATA. O DNA genômico das células espermáticas foi extraído pelo método de fenol clorofórmio, diluído para concentração de 1ng/µl e submetidos à quantificação de DNA plasmidial pela técnica de quantificação absoluta em tempo real (qPCR). Os resultados demonstraram que o ATA não melhorou a eficiência de incorporação, já que tanto na concentração de 500 quanto na de 1000ng de DNA exógeno, a porcentagem foi menor (0,001% para os dois grupos) em relação aos grupos nos quais este não foi utilizado. Os grupos em que o ATA não foi utilizado não apresentaram diferença entre si demonstrando que a quantidade de 500ng de DNA exógeno foi suficiente na internalização deste ao espermatozoide, sendo a porcentagem de incorporação maior do que 1000ng (0,20% contra 0,10%). Contudo, o uso do inibidor de endonucleases, ao invés de aumentar os índices de incorporação apresentou resultados opostos, indicando que seu uso não trouxe melhorias para a técnica de TGME. / The low efficiency and low repeatability of sperm-mediated gene transfer (SMGT) could be due to the activation of sperm endonucleases. The inhibition of this enzyme would avoid genomic DNA fragmentation enabling the use of higher concentrations of exogenous DNA, increasing the efficiency and ensuring the reproducibility of this technique. Aurintricarboxilic acid (ATA) is a general inhibitor of endonucleases (HALLICK et al., 1977), including sperm endonucleases (MAIONE et al., 1997; MAGNANO et al., 1998). This study aimed to evaluate the inhibition of sperm endonucleases using the aurintricarboxilic acid (ATA). For that, three experiments were set: 1) evaluate the inhibition of sperm endonucleases by adding aurintricarboxilic acid after incubation with exogenous DNA, 2) study the inhibition efficiency of ATA in genomic DNA fragmentation and 3) detect exogenous DNA internalization after the use of ATA. For the first experiment, a plasmid digestion assay with pmGENIE3 and PCX-EGFP and three concentrations of ATA (10µM, 25µM and 50µM) were tested. The digestion of plasmid vector occurred by incubation of PCX-EGFP and pmGENIE3 with and without the presence of ATA with sperm extracts. Incubations took place for 1 hour at 37°C and the products were analyzed by electrophoresis (2 hours, 100mV) in 0,7% agarose gel. The results were evaluated on a cross scale whereas 1 was considered a total plasmid digestion and 3 no digestion. The results were analyzed with a significance level of 5%. The results show differences in the digestion of the two plasmid vectors, being pmGENIE3 more susceptible to degradation by sperm extract, demonstrating absence of bands in some replicates (median = 1). The PCX-EGFP showed a parcial inhibition of the degradation using 10µM ATA. PmGENIE3 presented inhibiting of degradation only using 25 or 50µM of ATA. Thus, the concentration used in the consecutives experiments was 50µM. For experiment 2, sperm from Bl-6/DBA (F1) mice strain were incubated with two concentrations (500 or 1000ng) of the PCX-EGFP plasmid, with and without pre-incubation with ATA. Incubation took place for 5 hours, with 5% CO2 in air, at 37°C. Sperm samples were subjected to acid denaturation susceptibility test and alkaline comet assay to check for possible chromatin fragility. The data showed that the use of ATA in murine sperm leads to a fragility of their genome, independently of the incubation with exogenous DNA and its concentration. Result showed that there might be a threshold concentration for chromosomal DNA fragmentation caused by endonucleases, which was 500ng of plasmid. The use of higher concentrations, as 1000ng, may be a protective factor for genomic DNA integrity, since exogenous DNA seems to be the primary target of endonucleases, showed by, lower DNA fragmentation levels. In experiment 3, sperm were incubated with 500 or 1000ng PCX-EGFP/106 cells, pre-incubated or not with ATA. Genomic DNA was extracted by phenol chloroform method, diluted to concentrations of 1ng/µl and subjected to quantification of plasmid DNA insertions by absolute quantification in real-time PCR (qPCR). The results showed that ATA did not improve the efficiency of DNA internalization, whereas both concentration of 500 and 1000ng presented a lower percentage of exogenous DNA integration (0.001% in both groups) compared with the groups in which ATA was not used. The groups without ATA did not differ indicating that the amount of 500ng of DNA was able to integrate exogenous DNA to sperm, and have higher percentage of incorporation compared to 1000ng (0,20% versus 0,10%). Thereby, the use of an endonuclease inhibitor instead of increasing integration indexes showed opposite results, indicating that its use did not bring improvements to the SMGT technique.

The thesis responds to the changes in customs procedures which Czech companies had to face after the Czech republic was joined to the customs territory of the EU. The first part of the thesis provides the basic characteristic of individual customs procedures and it is focused on the area of customs operations. The following sections concentrate on the issue of "transit" customs procedure. The scope of the thesis is a general approach of the realisation of international transport in transit. It demonstrates the most important changes which were caused by the membership of the Czech Republic in the EU. The thesis emhasizes Community transit, Common transit betweeen the Community and the EFTA countries and the carriage of goods based on the customs documents TIR a ATA. Due to its importance for facilitating international trade a special attention is given to the TIR customs transit system.

A baixa eficiência e a dificuldade de reprodução de resultados da técnica de transferência gênica mediada por espermatozoides (TGME) têm como possível explicação à ativação de endonucleases espermáticas. Assim, a inibição desta enzima poderia evitar a fragmentação de DNA (exógeno e genômico), possibilitando assim, o uso de maiores concentrações de DNA exógeno, aumentando a eficiência e garantindo a reprodutibilidade da técnica. O ácido aurintricarboxílico (ATA) é um inibidor geral de endonucleases (HALLICK et al., 1977), inclusive das endonucleases espermáticas (MAIONE et al., 1997; MAGNANO et al., 1998). Deste modo, o presente estudo objetivou avaliar a inibição das endonucleases espermáticas, pelo ácido aurintricarboxílico (ATA). Para isso, três experimentos foram realizados: 1) avaliar a inibição das endonucleases espermáticas pela adição do ácido aurintricarboxílico, após incubação com DNA exógeno; 2) verificar a eficiência do ATA na inibição de fragmentação de DNA genômico e 3) detectar o aumento nos índices de internalização após o uso de ATA. Para o primeiro experimento, um ensaio de digestão plasmidial com os plasmídeos PCX-EGFP e pmGENIE3 e três concentrações de ATA (10µM, 25µM e 50µM) foram testados. As digestões dos vetores plasmidiais ocorreram pela incubação dos plasmídeos PCX-EGFP e pmGENIE3, com e sem a presença de ATA, com extratos espermáticos. As incubações ocorreram durante 1 hora à 37ºC e os produtos foram analisados por eletroforese (2 horas, 100mV) em gel de agarose 0,7%. Os resultados foram avaliados em escala de cruzes, no qual 1 foi considerado digestão total dos plasmídeos e 3, a não digestão. Os resultados foram analisados em nível de significância de 5%. Os resultados demonstraram diferenças nas digestões dos dois vetores plasmidiais, sendo o pmGENIE3 mais susceptível à degradação pelo extrato espermático, demonstrando ausência de bandas em algumas replicatas (mediana=1). O PCX-EGFP apresentou inibição parcial da degradação já com 10µM de ATA. Já o pmGENIE só apresentou inibição da degradação com 25 ou 50µM de ATA. Assim a concentração utilizada nos experimentos consecutivos foi a de 50µM. Para o experimento 2, espermatozoides de camundongos da linhagem Bl-6/DBA (F1) foram incubados com duas concentrações (500 ou 1000ng) do plasmídeo PCX-EGFP, com ou sem pré-incubação com ATA. As incubações ocorreram durante 5 horas, em ar com 5% de CO2 à 37ºC. Assim, os espermatozoides foram submetidos ao teste de susceptibilidade à denaturação ácida e ao ensaio de cometa alcalino para verificar possível fragilidade da cromatina. Os dados demonstraram que o uso do ATA em espermatozoides murinos leva à fragilidade do genoma, independente de serem incubados com DNA exógeno e a concentração do mesmo. Além disso, foi possível verificar que pode existir um limiar de concentração ótima para que as endonucleases causem fragmentação do DNA cromossomal, o qual foi de 500ng. O uso de concentrações maiores, como 1000ng, pode ter agido como fator protetor ao DNA genômico, podendo este DNA exógeno ter sido o alvo primário das endonucleases, já que quando as amostras foram incubadas com essa concentração de plasmídeo, não houve altos índices de fragmentação no DNA endógeno. No experimento 3, espermatozoides de camundongos foram incubados com 500 ou 1000ng de PCX-EGFP/106 células, sendo ou não pré-incubados com ATA. O DNA genômico das células espermáticas foi extraído pelo método de fenol clorofórmio, diluído para concentração de 1ng/µl e submetidos à quantificação de DNA plasmidial pela técnica de quantificação absoluta em tempo real (qPCR). Os resultados demonstraram que o ATA não melhorou a eficiência de incorporação, já que tanto na concentração de 500 quanto na de 1000ng de DNA exógeno, a porcentagem foi menor (0,001% para os dois grupos) em relação aos grupos nos quais este não foi utilizado. Os grupos em que o ATA não foi utilizado não apresentaram diferença entre si demonstrando que a quantidade de 500ng de DNA exógeno foi suficiente na internalização deste ao espermatozoide, sendo a porcentagem de incorporação maior do que 1000ng (0,20% contra 0,10%). Contudo, o uso do inibidor de endonucleases, ao invés de aumentar os índices de incorporação apresentou resultados opostos, indicando que seu uso não trouxe melhorias para a técnica de TGME. / The low efficiency and low repeatability of sperm-mediated gene transfer (SMGT) could be due to the activation of sperm endonucleases. The inhibition of this enzyme would avoid genomic DNA fragmentation enabling the use of higher concentrations of exogenous DNA, increasing the efficiency and ensuring the reproducibility of this technique. Aurintricarboxilic acid (ATA) is a general inhibitor of endonucleases (HALLICK et al., 1977), including sperm endonucleases (MAIONE et al., 1997; MAGNANO et al., 1998). This study aimed to evaluate the inhibition of sperm endonucleases using the aurintricarboxilic acid (ATA). For that, three experiments were set: 1) evaluate the inhibition of sperm endonucleases by adding aurintricarboxilic acid after incubation with exogenous DNA, 2) study the inhibition efficiency of ATA in genomic DNA fragmentation and 3) detect exogenous DNA internalization after the use of ATA. For the first experiment, a plasmid digestion assay with pmGENIE3 and PCX-EGFP and three concentrations of ATA (10µM, 25µM and 50µM) were tested. The digestion of plasmid vector occurred by incubation of PCX-EGFP and pmGENIE3 with and without the presence of ATA with sperm extracts. Incubations took place for 1 hour at 37°C and the products were analyzed by electrophoresis (2 hours, 100mV) in 0,7% agarose gel. The results were evaluated on a cross scale whereas 1 was considered a total plasmid digestion and 3 no digestion. The results were analyzed with a significance level of 5%. The results show differences in the digestion of the two plasmid vectors, being pmGENIE3 more susceptible to degradation by sperm extract, demonstrating absence of bands in some replicates (median = 1). The PCX-EGFP showed a parcial inhibition of the degradation using 10µM ATA. PmGENIE3 presented inhibiting of degradation only using 25 or 50µM of ATA. Thus, the concentration used in the consecutives experiments was 50µM. For experiment 2, sperm from Bl-6/DBA (F1) mice strain were incubated with two concentrations (500 or 1000ng) of the PCX-EGFP plasmid, with and without pre-incubation with ATA. Incubation took place for 5 hours, with 5% CO2 in air, at 37°C. Sperm samples were subjected to acid denaturation susceptibility test and alkaline comet assay to check for possible chromatin fragility. The data showed that the use of ATA in murine sperm leads to a fragility of their genome, independently of the incubation with exogenous DNA and its concentration. Result showed that there might be a threshold concentration for chromosomal DNA fragmentation caused by endonucleases, which was 500ng of plasmid. The use of higher concentrations, as 1000ng, may be a protective factor for genomic DNA integrity, since exogenous DNA seems to be the primary target of endonucleases, showed by, lower DNA fragmentation levels. In experiment 3, sperm were incubated with 500 or 1000ng PCX-EGFP/106 cells, pre-incubated or not with ATA. Genomic DNA was extracted by phenol chloroform method, diluted to concentrations of 1ng/µl and subjected to quantification of plasmid DNA insertions by absolute quantification in real-time PCR (qPCR). The results showed that ATA did not improve the efficiency of DNA internalization, whereas both concentration of 500 and 1000ng presented a lower percentage of exogenous DNA integration (0.001% in both groups) compared with the groups in which ATA was not used. The groups without ATA did not differ indicating that the amount of 500ng of DNA was able to integrate exogenous DNA to sperm, and have higher percentage of incorporation compared to 1000ng (0,20% versus 0,10%). Thereby, the use of an endonuclease inhibitor instead of increasing integration indexes showed opposite results, indicating that its use did not bring improvements to the SMGT technique.

With gaining the independence and the emergence of a new state the linguistic situation in Kazakhstan has been changed. The restoration and return of historical names, the fi xing of unifi ed rules of the transferring of Kazakh toponyms into other languages became the basis of national onomastic policy of independent Kazakhstan. After the law “On languages in the Republic of Kazakhstan” adopted in 1997 the activity on improvement of orthographic norms and formulation of new rules of transferring geographical names from Kazakh into Russian started. As a result of these acts many distorted names of inhabited localities and administrative-territorial units are gradually being put into an appropriate norm. Many of them are still to be corrected according to new “Law on Administrative - Territorial Structure of the Republic of Kazakhstan” (December 8, 1993.) and Presidential Decree (December 29, 1995.), Government Resolution (March 5, 1996.) where the rules on Russian transferring of Kazakh onyms were approved. Due to such activity to former capital of Kazakhstan Alma-Ata was returned its original name Almaty. Thus, in our article we decided to give our point of view on some issues relating to grammatical adaptation of toponym Almaty in Russian language.

Arginine utilization in Pseudomonas aeruginosa with multiple catabolic pathways represents one of the best examples of metabolic versatility of this organism. To identify genes of this complex arginine network, we employed DNA microarray to analyze the transcriptional profiles of this organism in response to L-arginine. While most genes in arginine uptake, regulation and metabolism have been identified as members of the ArgR regulon in our previous study, eighteen putative transcriptional units of 38 genes including the two known genes of the arginine dehydrogenase (ADH) pathway, kauB and gbuA, were found inducible by exogenous L-arginine but independent of ArgR. The potential physiological functions of those candidate genes in L-arginine utilization were studied by growth phenotype analysis in knockout mutants. The insertion mutation of aruH encoding an L-arginine:pyruvate transaminase abolished the capability to grow on L-arginine of an aruF mutant devoid of a functional arginine succinyltransferase (AST) pathway, the major route of arginine utilization. The aruH gene was cloned and over-expressed in E. coli. Taking L-arginine and pyruvate as the substrates, the reaction products of recombinant enzyme were identified by MS and HPLC as 2-ketoarginine and L-alanine. Lineweaver-Burk plots of the data revealed a series of parallel lines characteristic of ping-pong kinetics mechanism, and the apparent Km and catalytic efficiency (Kcat/Km) were 1.6 ± 0.1 mM and 24.1 mM-1 s-1 for pyruvate and 13.9 ± 0.8 mM and 2.8 mM-1 s-1 for L-arginine. Recombinant AruH showed an optimal pH at 9.0 and substrate specificity with an order of preference being Arg > Lys > Met > Leu > Orn > Gln. These data led us to propose the arginine transaminase (ATA) pathway that removes the α-amino group of L-arginine via transamination instead of oxidative deamination by dehydrogenase or oxidase as originally proposed. In the same genetic locus, we also identified a two-component system, AruRS, for the regulation of arginine-responsive induction of the ATA pathway. Our latest DNA microarray experiments under D-arginine conditions also revealed PA3863 as the candidate gene encoding D-arginine dehydrogenase which might lead to the recognition of a wider network of arginine metabolism than we previously recognized.

Sugar apple (Annona squamosa L.), tropical fruit species, has brought attention of the new fruit markets around the world due to its exotic taste and attractive skin. In Brazilian orchards, genotypic differences among plants can be found arising from its alogamic sexual profile and the possibility of occuring natural mutations in the field. This study aimed primarily to establish a minimum list of morphologycal descriptors able to compare, separate and establish sugar apple cultivars. For this, we compared the typical cv. Crioula with the cv. Verdinha, a natural mutant that shows some differences to the standard Crioula type. Secondly, we studied a protocol for vegetative propagation by cuttings to clone the new established cultivar. For this, softwood cuttings of the cv. Verdinha treated with synthetic auxin (IBA) in the form of powder or liquid, at concentrations of 0, 1000, 2000, 3000 and 4000 mg/kg, associated to silver thiosulfate (STS) an known inhibitor of ethylene action at concentrations of 0, 2 and 4 mM. Finally, we studied the emergence of adventitious roots at the base of sugar apple cuttings, a considered difficult-to-root species. The results showed that it is possible to differentiate genotypes of sugar apple by using a list of simple morphological descriptors easily observed in branches, leaves and fruits. Cloning sugar apple by cuttings is a viable technique and it will possibly have commercial applications. Anatomical studies on adventitious roots formation in sugar apple leafy cuttings showed they arise indirectly from the healing callus tissues regardless of the use of IBA. / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A pinheira (Annona squamosa L.), espécie frutífera tropical, tem despertado o interesse de novos mercados de frutas, em todo o mundo, devido ao seu sabor exótico e atrativo. Em pomares brasileiros, diferenças genotípicas entre plantas podem ser encontradas decorrentes do perfil alogâmico de cruzamento da espécie e da possibilidade de mutações naturais em campo. Esse trabalho objetivou: estabelecer descritores morfológicos mínimos para a caracterização genética de cultivares de pinheira, por comparação entre as cultivares Crioula típica e um mutante com algumas características distintas ao tipo padrão denominado de cv. Verdinha. Em segundo lugar, estudou-se um protocolo de propagação assexuada por estaquia para os novos cultivares onde, estacas semilenhosas de pinheiras da cv. Verdinha foram submetidas a tratamentos com auxina sintética (AIB) na forma de pó ou líquida aplicada em sua base, nas concentrações de 0, 1000, 2000, 3000 e 4000 mg/kg, associada à aplicação do inibidor da ação do etileno tiosulfato de prata (STS) nas concentrações de 0, 2 e 4 mM. Por último, estudou-se o surgimento das raízes adventícias nas bases das estacas de pinheiras, espécies tida como de difícil enraizamento. Os resultados obtidos mostraram que é possível diferenciar morfologicamente genótipos de pinheiras utilizando-se uma lista de descritores mínimos morfológicos fáceis de serem observados visualmente nos ramos, folhas, frutos. A clonagem das plantas por estaquia é uma técnica viável e possivelvente de aplicação comercial. Os estudos anatômicos da formação das raízes adventícias nas estacas tem origem indireta, ou seja, surgem a partir dos calos de cicatrização formados nas bases das estacas enfolhadas de pinheira independente do uso do AIB.