Orientador: Vera Lúcia Mores Rall / Banca: José Paes de Almeida Nogueira Pinto / Banca: Luciano dos Santos Bersot / Resumo: Os manipuladores são importantes peças na qualidade dos alimentos, podendo ser causadores de intoxicações de origem alimentar, pela introdução de patógenos nos alimentos durante o processamento, distribuição e manipulação. As fossas nasais têm sido relatadas como a fonte mais importante de disseminação de Staphylococcus enterotoxigênico, seguido pelas mãos dos manipuladores. Nesse trabalho pesquisou-se a presença de estafilococos coagulase negativa e positiva em 3 cozinhas industriais diferentes entre 82 manipuladores de alimentos, onde foram analisados os esfregaços de fossas nasais e das mãos, com isolamento e identificação de 62 cepas coagulase-negativa (75,6%) e 20 cepas coagulase-positiva (24,4%). A prevalência dos isolados foi de 20 (24,4%) para S. aureus, 37 (45,1%) para S. warneri, 23 (28%) para S. epidermidis e 1 (1,2%) para as espécies S. capitis e S. xylosus.Os genes das enterotoxinas estafilocócicas A, B, C, D, E, G, H, I e J foram pesquisados pela PCR e entre as 20 cepas de Staphylococcus coagulase positiva, 19 (95%) foram positivas para um ou mais genes que codificam para as diversas enterotoxinas pesquisadas. O número de ECN produtores de enterotoxinas foi alto, de 46,8% (29 cepas positivas). Considerando-se todas as enterotoxinas, independente da espécie de Staphylococcus, o tipo mais comum foi a do tipo A, sendo observada em 17 cepas (35,4%) desse gênero, seguida por SEH e SEJ, ambas com 14 isolados (29,2%), SEG, sendo produzida por 13 cepas (27,1%), SEI, por 11 (22,9%) e SEE, SEB e SEC, por 7 (14,6%), 6 (12,5%) e 5 (10,4%), respectivamente. A SED não foi observada. A pesquisa das novas SES aumentou consideravelmente a porcentagem de cepas exterotoxigênicas dos dois grupos, aumentando assim, o potencial patogênico desse grupo de bactérias O papel dos ECN deve ser revisto e sua importância, reconhecida, pois, sempre foram considerados contaminantes de alimentos, sem despertar a atenção. / Abstract: The food handlers are important parts in the quality of foods, being able to cause foodborne disease, by the introduction of pathogens during the processing, distribution and manipulation of foods. Nasal cavities are the most important source of dissemination of enterotoxigenic Staphylococcus, followed by hands. The aim of this study was search negative and positive coagulase Staphylococcus in 82 food handlers distributed among three different industrial kitchens, analyzing nasal and hands swabs, with isolation and identification of 62 coagulase-negative (75,6%) and 20 coagulase-positive strains (24,4%). The prevalence was of 20 isolated (24,4%) for S. aureus, 37 (45,1%) for S. warneri, 23 (28%) for S. epidermidis and 1 (1,2%) for S. xylosus and S. capitis. Staphylococcal enterotoxins genes (A, B, C, D, E, G, H, I e J) had been searched by PCR. In 20 positive coagulase Staphylococcus, 19 (95%) were positive for one or more genes. The number enterotoxigenic ECN was high (46,8%). Considering all enterotoxins, independent of the species of Staphylococcus, the more common was SEA (35,4%), followed for SEH and SEJ, both with 14 strains (29,2%), SEG, being produced by 13 isolates (27,1%), SEI (22,9%) and SEE, SEB and SEC, for 7 (14,6%), 6 (12,5%) and 5 strains (10,4%), respectively. The SED was not observed. The detection of new SES increased the number of enterotoxigenic isolates in both groups, with the growing of pathogenic potential in this genus. The paper of ECN should be reviewed and its importance, recognized, because, had been always considered as contaminants of foods, without pay attention. / Mestre

Made available in DSpace on 2016-06-07T17:12:13Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-04-28. Added 1 bitstream(s) on 2016-06-07T17:16:47Z : No. of bitstreams: 1 000858080_20160630.pdf: 190100 bytes, checksum: 47dd9e01e892e41f2f90965bdb032201 (MD5) Bitstreams deleted on 2016-07-01T13:02:23Z: 000858080_20160630.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-07-01T13:03:19Z : No. of bitstreams: 1 000858080.pdf: 604042 bytes, checksum: 52a63eb5887518214744f20b5b57d70e (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Trueperella pyogenes são bactérias oportunistas caracterizadas por infecções piogênicas em animais, em geral refratárias aos tratamentos com antimicrobianos convencionais. Recentemente, os genes que codificam a exotoxina piolisina (plo), e fatores relacionados à adesão de T. pyogenes às células do animal susceptível, como fímbrias (fimA, fimC, fimE, fimG), neuraminidases (nanH, nanP), e proteína ligada ao colágeno (cbpA) têm sido associados a virulência do patógeno. O presente estudo investigou a ocorrência de multirresistência dos isolados aos antimicrobianos e a presença dos genes plo, fimA, fimC, fimE, fimG, nanH, nanP e cbpA em 41 linhagens de T. pyogenes isoladas de diferentes afecções em bovinos, caprinos, ovinos, equino e cão. T. pyogenes foi identificado predominantemente em casos de mastite (46,3%), abscessos (19,5%), pneumonia (9,8%), metritie (9,8%), linfadenite (7,3%), seguidos em menor frequência por encefalite (4,9%) e orquite (2,4%). A maior sensibilidade dos isolados foi observada para florfenicol (97,6%), azitromicina (97,6%), tetraciclina (95,2%), ceftiofur (92,7%), penicilina (92,7%), ampicilina (92,7%), gentamicina (90,3%) e eritromicina (87,8%). Em contraste, alta frequência de resistência dos isolados foi observada para bacitracina (46,3%), neomicina (31,7%), lincomicina (31,7%) e sulfametoxazole/trimetoprim (24,3%). O índice de resistência múltipla aos antimicrobianos - IRMA (>0,3) foi encontrado em 13 (31.7%) isolados, particularmente nos casos de mastite bovina. Dentre os isolados multirresistentes a três ou mais grupos de antimicrobianos, 12 (92,3%) foram identificados na espécie bovina, notadamente em infecções mamárias. Os genes mais frequentes detectados nos isolados foram: plo (40/41=97,6%), fimA (36/41=87,9%), nanP (34/41=82,9%), fimE (32/41=78,0%), nanH (28/41=62,3%), fimC (23/41=56,0%) e cbpA (5/41=12,2%). As principais associações de genes nos isolados foram observadas entre... / Trueperella pyogenes are opportunistic bacterium characterized by suppurative infections in domestic animals, commonly refractory to conventional therapy. Recently, genes which encode exotoxin pyolysin (plo), and factors that promote adhesion of T. pyogenes to host cells, such as fimbriae (fimA, fimC, fimE, fimG), neuraminidases (nanH, nanP), and collagen-binding protein (cbpA) have been associated to virulence of pathogen. The aim of present study was investigate occurrence of multi-drug resistance of isolates, as well the presence of genes plo, fimA, fimC, fimE, fimG, nanH, nanP, and cbpA in 41 T. pyogenes strains obtaned from bovine, goats, sheep, horses, and dog isolated among different clinical manifestations. T. pyogenes was identified predominantly in mastitis (46.3%), abscesses (19.5%), pneumonia (9.8%), metritis (9.8%), lymphadenitis (7.3%), followed by encephalitis (4.9%) and orchitis (2.4%). The strains showed major in vitro sensitivity to florfenicol (97.6%), azithromicin (97.6%), tetracycline (95.2%), ceftiofur (92.7%), penicillin (92.7%), ampicillin (92.7%), gentamicin (90.3%), and erythromycin (87.8%). In contrast, highest frequency of resistance among isolates was observed to bacitracin (46.3%), neomycin (31.7%), lincomycin (31.7%), and trimethropim/sulfamethoxazole (24.3%). Antimicrobial multiple resistance index - AMRI (>0.3) was found in 13 (31.7%) isolates, particularly in bovine mastitis cases. Among multi-drug resistant isolates to 3 or more group of antimicrobials, 12 (92.3%) were identified in bovine, predominantly in mammary infections. The most common genes detected among isolates were: plo (40/41=97.6%), fimA (36/41=87.9%), nanP (34/41=82.9%), fimE (32/41=78.0%), nanH (28/41=62.3%), fimC (23/41=56.0%), and cbpA (5/41=12.2%). The major associations between genes of isolates were plo, fimA, fimE, nanH, and nanP (10/41=24.4%), and plo, fimA, fimE, fimC, nanH, and nanP (8/41=19.5%), mainly in bovine mastitis. To ...

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:31Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-11-30Bitstream added on 2014-06-13T20:38:47Z : No. of bitstreams: 1 franco_mmj_me_botfmvz.pdf: 346897 bytes, checksum: a14c6f0c3027c35c0fd164665eee96a8 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / O leite constitui importante fonte de nutrientes para a alimentação humana. No entanto, também pode servir como veículo para disseminação de microorganismos patogênicos. A tuberculose e as micobacterioses estão entre as infecções mais debilitantes que acometem humanos e os animais, com evolução crônica e progressiva, tendo recrudescido sua incidência em vários países. Espécies de Mycobacterium sp. tem alta capacidade de sobrevivência em leite e seus subprodutos. O presente estudo investigou a ocorrência de micobactérias em amostras de leite bovino cru, de rebanhos do sudeste do estado de São Paulo, utilizando cultivo microbiológico nos meios de Lowenstein-Jensen e Stonebrink, seguido de tipificação molecular pelo teste de reação em cadeia pela polimerase com o uso de enzimas de restrição. Foram processadas 300 amostras, 100 de tanques de expansão individuais, 100 de tanques coletivos e 100 obtidas no comércio informal da região amostrada. Obteve-se isolamento de 15 diferentes espécies de Mycobacterium, a saber: M. bovis, M. gordonae, M. fortuitum, M. intracellulare, M. flavescens, M. duvalli, M. haemophilum, M. immunogenum, M. lentiflavum, M. mucogenicum, M. novocastrense, M. parafortuitum, M. smegmatis, M. terrae e M. vaccae. Os isolamentos ocorreram nas seguintes proporções: 9% das amostras de tanques individuais, 7% das amostras de tanques coletivos e 8% das amostras de leite informal. Não houve associação estatística entre a ocorrência de micobactérias com os fatores epidemiológicos considerados nas propriedades amostradas. Considerando o impacto das micobacterioses na saúde pública e animal, particularmente a tuberculose bovina, a prevenção da exposição da população ao risco destas infecções torna-se fundamental. A investigação da presença de micobactérias em leite pode contribuir na melhoria da segurança alimentar inerente ao produto / Milk represents an important source of nutrients for humans. However, it can also serve as a dissemination vehicle for pathogenic microorganisms. Tuberculosis and micobacteriosis are among the most debilitating diseases that affect humans and animals, being chronic and progressive, re-emerging its incidence in many countries. Mycobacterium sp. has high survivability in milk and its byproducts. The main objective of the study was to investigate the occurrence of mycobacteria in bovine raw milk samples from farms along southeast region of Sao Paulo state, using microbiological culture on Lowenstein-Jensen and Stonebrink media followed by molecular typification with polymerase chain reaction tests using restriction enzimes. Three hundred milk samples were processed, 100 from individual bulk tanks, 100 from collective bulk tanks and 100 obtained in informal trading of sampled region. Fifteen different isolates of Mycobacterium species were obtained: M. bovis, M. gordonae, M. fortuitum, M. intracellulare, M. flavescens, M. duvalli, M. haemophilum, M. immunogenum, M. lentiflavum, M. mucogenicum, M. novocastrense, M. parafortuitum, M. smegmatis, M. terrae and M. vaccae. Isolations occurred on following proportions: 9% of the individual bulk tanks samples, 7% of the collective bulk tanks samples and 8% of the informal trade milk samples. There was no statistical association between the occurrence of mycobacteria on samples with the epidemiological factors considered on sampled farms. Considering the impact of mycobacteriosis on public and animal health, especially bovine tuberculosis, is from main importance the prevention of public exposure to risk of these diseases. Investigative approaches of the presence of mycobacteria in raw milk may contribute to improvement of food security inherent in the product

A resistência bacteriana à antibióticos tem se tornado um grave problema em saúde pública. Os mecanismos de resistência estão emergindo e sendo disseminados globalmente, devido às deficiências nas condições sanitárias e uso indiscriminado de antibióticos em humanos e animais. Escherichia coli e Staphylococcus aureus estão entre as bactérias mais presentes quando se trata de resistência a antimicrobianos. Infecções causadas por Leptospira interrogans possuem limitadas opções de tratamento e pouco se progrediu a cerca desta situação nos últimos anos. O Brasil possui uma fauna rica em espécies de serpente. Dentre as serpentes peçonhentas que causam a maior parte dos acidentes ofídicos no país encontram-se os gêneros Bothrops e Crotalus. As peçonhas desses animais possuem uma diversidade de bioativos com funções biológicas, bioquímicas e farmacológicas. Por isso, diversos estudos têm sido realizados com essas substâncias a fim de se desenvolver novos fármacos. Em meio às diversas funções já descobertas sobre os bioativos das peçonhas, o potencial antimicrobiano tem sido alvo de importantes pesquisas visto o cenário mundial de resistência bacteriana. / Bacterial resistance to antibiotics has become a serious problem in public health. Resistance mechanisms are emerging and being disseminated globally due to deficiencies in health conditions and the indiscriminate use of antibiotics in humans and animals. Escherichia coli and Staphylococcus aureus are among the most present bacteria when it comes to antimicrobial resistance. Leptospira interrogans infections have limited treatment options and little progress has been made about this in last years. Brazil has an rich ecosystem in snake species. Among the venomous snakes that cause most of the ophidian accidents in the country are the genera Bothrops and Crotalus. The venom of these animals has a diversity of bioactives with biological, biochemical and pharmacological functions. Therefore, several studies have been done with these substances to develop new drugs. Regarding the several functions already discovered about venom bioactives, the antimicrobial potential has been the object of important researchs, considering the world scenario of bacterial resistance. / Dissertação (Mestrado)

Infecções causadas por STEC constituem problema de saúde pública, pois estão associadas à síndrome hemolítica urêmica e colite hemorrágica. A detecção de isolados STEC depende de um ensaio diagnóstico sensível, específico e de baixo custo. Neste sentido, o presente estudo teve como objetivo o desenvolvimento de um ELISA de captura utilizando anticorpos policlonais e monoclonais. Primeiramente definiu-se um meio de cultivo para maior expressão de Stx e produziu-se anticorpos monoclonais anti-Stx1 e anti-Stx2. Os resultados mostraram que o cultivo de isolados por 4h em caldo EC com ciprofloxacina induziu maior produção de Stx no sobrenadante bacteriano, e o anticorpo monoclonal anti-Stx1 produzido reconheceu a subunidade A de ambas as toxinas, além de apresentar maior constante de afinidade que o anti-Stx2. Desta forma, o ELISA de captura foi padronizado com 250 mg/ml da fração IgG do soro policlonal anti-Stx1 e anti-Stx2 na sensibilização e 2,5 mg/ml de anticorpo monoclonal anti-Stx1 na captura da toxina, apresentando 80,7% de sensibilidade e 100% de especificidade. / STEC infection is a public health problem, causing hemolytic-uremic syndrome and haemorrhagic colitis. The detection of STEC isolates depends on a sensitive, specific and low cost diagnostic method. Thus, the aim of this study was to develop a capture ELISA using polyclonal and monoclonal antibodies. For this purpose, first of all a growth media that induce better expression and production of Stx was defined and monoclonals anti-Stx1 e anti-Stx2 antibodies were produced. The results show that the growth of the isolates for 4hs in EC broth with ciprofloxacin increased the production of Stx in the bacterial supernantant, and the monoclonal anti-Stx1antibody produced was able to recognize the A subunit of both toxins, besides showing higher affinity constant than anti-Stx2. Thus, the capture ELISA was standardized using 250 mg/ml of the IgG enriched fraction of rabbit anti-Stx1 sera and anti-Stx2 for coating and 2,5 mg/ml of monoclonal anti-Stx1 antibody for the capture of the toxin, showing 80,7% of sensibility and e 100% de specificity.

A interface do implante com o componente protético geralmente apresenta lacunas que servem de nichos para a colonização bacteriana. A proposta deste estudo é verificar a eficácia do dimetacrilato na vedação desta interface. Foram utilizados 20 implantes ósseos Bone Level® Straumann, indicados para reabilitação protética unitária cimentada. Os pilares protéticos foram instalados nos grupos controle e experimental, adicionando-se o dimetacrilato à interface da conexão protética. Foram realizadas uma coleta inicial e uma coleta ao final do período de 90 dias no interior de cada implante, e através da técnica de PCR quantitativo foi analisada a infiltração e a detecção das espécies bacterianas Porphyromonas gingivalis, Treponema denticola, Tannerella forsythia. No Grupo Controle, todas as amostras apresentaram quantificação de microrganismos, confirmando infiltração bacteriana. No Grupo Experimental, apenas 30% das amostras apresentou quantificação após o período estudado. Assim, a ausência de bactérias no Grupo Experimental foi associada ao tratamento com o dimetacrilato para o período. Quando considerada a presença de pelo menos uma das bactérias específicas estudadas nas amostras, a diferença também foi estatisticamente significante. Entretanto, mais estudos devem ser desenvolvidos a fim de verificar se a vedação será eficiente por períodos mais longos. / The implant/prosthetic component interface often has gaps that serve as niches for bacterial colonization. The purpose of this study is to verify the effectiveness sealing this interface with dimethacrylate. Twenty two Straumann ® Bone Level implants was installed in areas with indication for single cemented prosthetic rehabilitation. The prosthetic components were installed in the control and experimental groups following the fabricant instructions, and adding the dimethacrylate in the interface of the experimental group. An initial collection and a second collection at the end of 90 days within each implant were performed, and after that, the technique of quantitative PCR was developed to analyze whether there was infiltration and detection of four bacterial species: Porphyromonas gingivalis, Treponema denticola, Tannerella forsythia. In the control group, all samples showed quantification of microorganisms, confirming bacterial percolation. In the control group, only 30% of the samples submitted quantification after the study period. Thus, the absence of bacteria in the experimental group was associated with the treatment for the period dimethacrylate. Considering the presence of at least one specific bacteria in the samples studied, the difference was also statistically significant. However, more studies should be conducted to verify that the seal will be effective for longer periods.

Gross, microscopic, and bacteriologic evaluation of broiler livers condemned by the Federal Inspection Service of Animal Products was performed. One hundred broiler livers were sampled at slaughter. Ninety of them had gross changes and 10 of them were grossly normal. The sampling was done in two slaughter houses located in the State of Rio Grande do Sul, Brazil. One of these two places slaughters 120,000 broilers/day, and the other one slaughters over 300,000 broilers/day. For the gross evaluation, the considered parameters were shape, color, size, texture, odor, and the presence of other visible lesions. The color of the liver was considered as the main gross change. Livers with gross changes in color, shape, size and/or texture were 47/90; brown-pale livers with other associated macroscopic lesions were 19/90; yellow or yellowish livers with other associated gross changes were 5/90; and green or greenish livers with other associated lesions were 19/90. The microscopic (morphologic) diagnoses consisted of multifocal heterophilic colangio-hepatitis, degeneration and/or centrilobular to bridging hepatic cellular necrosis, random necrotizing hepatitis, multifocal heterophylic pericolangitis and other unspecific changes. The bacteriological evaluation was leaded to the search of Escherichia coli, Salmonella sp. and Staphylococcus sp. It was utilized direct culture of the liver samples in selective culture midias. E. coli was isolated in 26/100 samples and Staphylococcus sp. in 24/100 samples, regardless the morphologic diagnosis. For the Salmonella sp. search it was used the conventional method indicated by the Department of Agriculture, however, there was no isolation of any bacteria of the Salmonella genus. The main gross and microscopic lesions were compatible with bacterial infections. It is concluded that the criteria for visceral condemnation used by the sanitary inspection was appropriated and efficient in the detection and elimination of the livers with potential infectious hazard. / Este trabalho avaliou através da macroscopia, histopatologia e bacteriologia, fígados de frangos (Gallus gallus) condenados pelo Serviço de Inspeção de Produtos de Origem Animal. Foram coletadas 100 amostras de fígados de frangos, das quais 90 apresentavam alterações macroscópicas e 10 amostras sem alterações. As coletas foram feitas em dois abatedouros localizados no Estado do Rio Grande do Sul. Estes trabalham sob o Serviço de Inspeção Federal, um deles abatendo 120.000 frangos/dia e o outro com um abate superior a 300.000 frangos/dia. Para avaliação macroscópica os parâmetros considerados foram a forma, coloração, tamanho, consistência, odor e presença ou não de lesões visíveis. Neste trabalho foi considerada a cor do órgão como sendo o principal parâmetro para caracterização das lesões macroscópicas, tendo-se observado fígados com alteração na cor, forma, tamanho e/ou consistência em 47/90 amostras; fígados marrom-pálidos e com outras alterações acroscópicas associadas perfizeram 19/90 amostras; fígados amarelos ou amarelados e com outras alterações associadas perfizeram 5/90 amostras e fígados verdes ou esverdeados e com outras alterações associadas perfizeram 19/90. Os diagnósticos histopatológicos incluíram colângio-hepatite heterofílica multifocal, degeneração e/ou necrose hepatocelular centrolobular e em ponte, hepatite necrosante aleatória, pericolangite heterofílica multifocal, peri-hepatite fibrinosa subaguda difusa acentuada e ainda outras alterações inespecíficas. A avaliação bacteriológica foi direcionada para pesquisa de Escherichia coli, Salmonella sp. e Staphylococcus sp. Utilizando-se cultivo direto das amostras de fígado em meios de cultura seletivos, isolou-se E. coli em 26/100 amostras e Staphylococcus sp. em 24/100 amostras, independentemente do diagnóstico morfológico obtido na avaliação histopatológica. Para pesquisa de salmonelas utilizouse a metodologia convencional preconizada pelo Ministério da Agricultura Pecuária e Abastecimento, entretanto não houve isolamento de nenhuma bactéria do gênero Salmonella. Pode-se observar o predomínio de lesões macroscópicas e microscópicas compatíveis com infecção bacteriana e concluir que os critérios de condenação de vísceras utilizados pela inspeção sanitária foram, neste caso, adequados e eficientes na eliminação de fígados com risco de transmissão de enfermidades.

Orientador: Adalberto Farache Filho / Banca: Wellington Cyro de Almeida Leite / Banca: João Bosco Faria / Resumo: A estação de tratamento de água (ETA) tem por finalidade primaria torná-la potável para o consumo humano. A principal etapa de um tratamento é a desinfecção, que elimina os organismos patogênicos presentes na água que oferecem riscos à saúde do consumidor. Um efeito indesejado da desinfecção é a interação do cloro com a matéria orgânica natural (MON) presente na água de mananciais, formando uma gama de produtos químicos secundários chamados de subprodutos da desinfecção (SPD). Mais de 700 SPD já foram relatados, sendo o grupo dos trihalometanos (THMs) formados em maior proporção. Os quatro principais compostos desse grupo são: Clorofórmio, Bromodiclorometano, Dibromoclorometano e Bromofórmio, referidos na literatura como trihalomentanos totais (THMt). A preocupação com a formação dos THMt se dá pelo fato de que várias pesquisas realizadas mostraram a correlação positiva principalmente do câncer de bexiga e intestino grosso com a água que contêm esses compostos. No Brasil, o Ministério da Saúde recomenda um teor máximo de THMt de 100 µg/L em água potável. Este trabalho teve como objetivo identificar a presença de THMt e analisar a qualidade sanitária da água das estações de tratamento até os reservatórios domiciliares nas cidades de Araraquara e Bariri/SP, e verificar, se essas atendem ao padrão de potabilidade exigido pela Portaria nº 2.914 de 12 de Dezembro de 2011. A qualidade da água da ETA de Araraquara/SP pode ser considerada satisfatória, necessitando de uma maior atenção em relação à quantidade de cloro residual livre e a contagem de bactérias heterotróficas. Em Bariri/SP, foram encontrados vários pontos em desacordo com a legislação vigente... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The water treatment stations (WTPs) has the primary purpose make it potable for human consumption. The principal stage of treatment is disinfection, which eliminates the pathogenic organisms present in the water that offer risks to consumer health. An unwanted effect of disinfection is the interaction of chlorine with natural organic matter (NOM) present in the water sources, forming a range of secondary chemicals called disinfection by-products (DBP). Over 600 SPD have been reported, and the group of trihalomethanes (THMs) formed in major proportion. The four major compounds of this group are: Chloroform, bromodichloromethane, and dibromochloromethane Bromoform, referred to in the literature as total trihalomentanos (THMt). The worry with the formation of THMt occurs by the fact that several surveys have shown a positive correlation especially bladder cancer and large intestine with water containing these compounds. In Brazil, the Ministry of Health recommends a maximum THMt of 100 µg / L in drinking water. This study aimed to identify the presence of THMt and analyze the sanitary quality of water in WTPs until reservoirs home of cities Araraquara and Bariri / SP, and check if they meet the potability standards. The water quality of the WTS Araraquara/SP, can be considered satisfactory, needing greater attention in relation to the amount of chlorine and heterotrophic bacterial count. In Bariri/SP, several points were found at variance with the law, mostly free residual chlorine, turbidity and total coliforms, requiring... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Márcio Garcia Ribeiro / Banca:: Liliane de Oliveira Dantas / Banca: Paulo Francisco Domingues / Resumo: Trueperella pyogenes são bactérias oportunistas caracterizadas por infecções piogênicas em animais, em geral refratárias aos tratamentos com antimicrobianos convencionais. Recentemente, os genes que codificam a exotoxina piolisina (plo), e fatores relacionados à adesão de T. pyogenes às células do animal susceptível, como fímbrias (fimA, fimC, fimE, fimG), neuraminidases (nanH, nanP), e proteína ligada ao colágeno (cbpA) têm sido associados a virulência do patógeno. O presente estudo investigou a ocorrência de multirresistência dos isolados aos antimicrobianos e a presença dos genes plo, fimA, fimC, fimE, fimG, nanH, nanP e cbpA em 41 linhagens de T. pyogenes isoladas de diferentes afecções em bovinos, caprinos, ovinos, equino e cão. T. pyogenes foi identificado predominantemente em casos de mastite (46,3%), abscessos (19,5%), pneumonia (9,8%), metritie (9,8%), linfadenite (7,3%), seguidos em menor frequência por encefalite (4,9%) e orquite (2,4%). A maior sensibilidade dos isolados foi observada para florfenicol (97,6%), azitromicina (97,6%), tetraciclina (95,2%), ceftiofur (92,7%), penicilina (92,7%), ampicilina (92,7%), gentamicina (90,3%) e eritromicina (87,8%). Em contraste, alta frequência de resistência dos isolados foi observada para bacitracina (46,3%), neomicina (31,7%), lincomicina (31,7%) e sulfametoxazole/trimetoprim (24,3%). O índice de resistência múltipla aos antimicrobianos - IRMA (>0,3) foi encontrado em 13 (31.7%) isolados, particularmente nos casos de mastite bovina. Dentre os isolados multirresistentes a três ou mais grupos de antimicrobianos, 12 (92,3%) foram identificados na espécie bovina, notadamente em infecções mamárias. Os genes mais frequentes detectados nos isolados foram: plo (40/41=97,6%), fimA (36/41=87,9%), nanP (34/41=82,9%), fimE (32/41=78,0%), nanH (28/41=62,3%), fimC (23/41=56,0%) e cbpA (5/41=12,2%). As principais associações de genes nos isolados foram observadas entre... / Abstract: Trueperella pyogenes are opportunistic bacterium characterized by suppurative infections in domestic animals, commonly refractory to conventional therapy. Recently, genes which encode exotoxin pyolysin (plo), and factors that promote adhesion of T. pyogenes to host cells, such as fimbriae (fimA, fimC, fimE, fimG), neuraminidases (nanH, nanP), and collagen-binding protein (cbpA) have been associated to virulence of pathogen. The aim of present study was investigate occurrence of multi-drug resistance of isolates, as well the presence of genes plo, fimA, fimC, fimE, fimG, nanH, nanP, and cbpA in 41 T. pyogenes strains obtaned from bovine, goats, sheep, horses, and dog isolated among different clinical manifestations. T. pyogenes was identified predominantly in mastitis (46.3%), abscesses (19.5%), pneumonia (9.8%), metritis (9.8%), lymphadenitis (7.3%), followed by encephalitis (4.9%) and orchitis (2.4%). The strains showed major in vitro sensitivity to florfenicol (97.6%), azithromicin (97.6%), tetracycline (95.2%), ceftiofur (92.7%), penicillin (92.7%), ampicillin (92.7%), gentamicin (90.3%), and erythromycin (87.8%). In contrast, highest frequency of resistance among isolates was observed to bacitracin (46.3%), neomycin (31.7%), lincomycin (31.7%), and trimethropim/sulfamethoxazole (24.3%). Antimicrobial multiple resistance index - AMRI (>0.3) was found in 13 (31.7%) isolates, particularly in bovine mastitis cases. Among multi-drug resistant isolates to 3 or more group of antimicrobials, 12 (92.3%) were identified in bovine, predominantly in mammary infections. The most common genes detected among isolates were: plo (40/41=97.6%), fimA (36/41=87.9%), nanP (34/41=82.9%), fimE (32/41=78.0%), nanH (28/41=62.3%), fimC (23/41=56.0%), and cbpA (5/41=12.2%). The major associations between genes of isolates were plo, fimA, fimE, nanH, and nanP (10/41=24.4%), and plo, fimA, fimE, fimC, nanH, and nanP (8/41=19.5%), mainly in bovine mastitis. To ... / Mestre

Submitted by PPG Pediatria e Sa?de da Crian?a (pediatria-pg@pucrs.br) on 2018-07-12T11:24:06Z No. of bitstreams: 1 Disserta??oLu SteffenVers?oFinal.pdf: 1086203 bytes, checksum: 9b8f206613da0e87460cd6110bcec5ac (MD5) / Approved for entry into archive by Sheila Dias (sheila.dias@pucrs.br) on 2018-07-17T11:24:05Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Disserta??oLu SteffenVers?oFinal.pdf: 1086203 bytes, checksum: 9b8f206613da0e87460cd6110bcec5ac (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-17T11:32:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Disserta??oLu SteffenVers?oFinal.pdf: 1086203 bytes, checksum: 9b8f206613da0e87460cd6110bcec5ac (MD5) Previous issue date: 2017-03-22 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / Introduction: Cystic Fibrosis is a disease characterized by recurrent infections and chronic inflammation of the respiratory system that lead to irreversible pulmonary complications. Infections are mainly caused by Staphilococcus aureos(SA) and Pseudomonas aeruginosa (PA). Early diagnosis for identification of colonizing germs is an important challenge. Guidelines suggest the use of swab cultures of the oropharynx or sputum. However, studies on molecular testing, or alternative methods of collection are still unconclusive. The involvement of the upper airway (nasopharynx and paranasal sinuses) has been cited as the primary source of infection. The present study aims to describe and compare the most frequent findings and pathogens in the nasal tract in patients with cystic fibrosis and to correlate findings with markers of severity and progression of lung disease. Methods: This is a retrospective study, which included patients with a diagnosis of Cystic Fibrosis (CF) who are followed up at the Multidisciplinary Outpatient Clinic of the Pediatric Pulmonology Unit of the Hospital S?o Lucas (Pontifical Catholic University of Rio Grande do Sul - PUCRS). Patients who have performed otorhinolaryngological evaluation (ENT) in the last two years (2015-2016) were included. The video naso endoscopy and nasal swab collection were part of the ENT evaluation. Results: 48 patients with CF were included, of which 30 (62.5%) were male. The mean age was 12.15 years ?6.60, and the mean predicted forced expiratory volume in the first second (FEV1%) was 83.36 ?30.04. When evaluating the presence and characteristic of nasal secretion, only 9 patients (18.7%) presented purulent secretion. Twenty-six patients (54.2%) presented grade 1 tonsils and 12 (25%) grade 2 or 3 patients. Nasal swab bacteriology was positive in 26 (54.1%) patients, from which 22 presented Staphylococcus aureos, 2 Pseudomonas aeruginosa, 1 Pseudomonas cepacea and 1 Stenotrophomonas maltophila (SM). In 22 patients (45.8%) the result of the culture was negative. In this study, patients who presented positive colonization by the traditional method (oropharynx / sputum) had a statistically significant chance of being identified also by nasal cavity culture (p<0.001). However, the association was not perfect, and showed a low correlation for the detection of gram negative germs. Nasal polyps were observed in 9 participants. When polyp is used as a marker of disease in nasal endoscopy, a strong association is observed between the presence of polyps and lower Shwachman-Kulczycki clinical score (p <0.001). Conclusions: the results of the culture obtained by collection of the nasal cavity were similar to those found by the standardized collection methods as markers of colonization of the inferior airway. In addition, nasal swabs is characterized as a non-invasive technique and showed to be sensitive to the identification of relevant pathogens in CF, especially SA. In addition, the presence of the polyp in the nasal cavity was shown to be associated with prognostic markers as Shwachman-Kulczycki clinical score. / Introdu??o: a fibrose c?stica ? uma patologia caracterizada por infec??es recorrentes e inflama??o cr?nica do sistema respirat?rio que levam a complica??es pulmonares, por vezes, irrevers?veis. As infec??es s?o causadas, principalmente pelos microorganismos Staphilococcusaureos(SA) e Pseudomonas aeruginosa(PA). O diagn?stico precoce para identifica??o dos germes colonizadores ? ainda um desafio. Consensos sugerem o uso de culturas de swab da orofaringe ou escarro. No entanto, pesquisa por testes moleculares como op??o, ou formas alternativas de coleta ainda s?o inconclusivos. O comprometimento da via a?rea superior (nasofaringe e seios paranasais) tem sido citada como fonte prim?ria de infec??o. O presente estudo tem por objetivo descrever e comparar as altera??es e os pat?genos mais frequentes no trato nasal em pacientes com fibrose c?stica e correlacionar os achados com marcadores de gravidade e progress?o da doen?a pulmonar. M?todos: este ? um estudo retrospectivo, que incluiu pacientes com diagn?stico de Fibrose C?stica (FC) que s?o acompanhados no Ambulat?rio Multidisciplinar de FC do Servi?o de Pneumologia Pedi?trica do Hospital S?o Lucas da Pontif?cia Universidade Cat?lica do Rio Grande do Sul (PUCRS), e que tenham realizado avalia??o otorrinolarigol?gica (ORL) entre os anos de 2015 e 2016. A videonasoendoscopia e a coleta de material da fossa nasal com o uso do swab fizeram parte da avalia??o ORL. Os marcadores de gravidade e progress?o da doen?a foram: ?ndice de massa corporal (IMC), volume expirat?rio for?ado no primeiro segundo(VEF1%) e o escore cl?nico de Shwachman-Kulczycki(S-K). Resultados: foram inclu?dos 48 pacientes com FC, sendo 30 (62,5%) do g?nero masculino. A m?dia de idade foi 12,15 anos ? 6,60, e a m?dia do percentual do valor previsto de volume expirat?rio for?ado no primeiro segundo (VEF1%) foi de 83,36 ? 30,04. Ao avaliar a presen?a e caracter?stica da secre??o nasal, apenas 9 pacientes (18,7%) apresentavam secre??o purulenta. Com rela??o as tonsilas far?ngeas, 26 pacientes (54,2%) apresentavam tonsilas grau 1 e 12 pacientes (25%) grau 2 ou 3. A bacteriologia do swab nasal foi positiva em 26 (54,1%) pacientes, onde 22 apresentavam Staphylococcus aureos, 2 Pseudomonas aeruginosa, 1 Pseudomonas cepacea e 1 Stenotrophomonas maltophila(SM). Em 22 pacientes (45,8%) o resultado da cultura foi negativo. Neste estudo, os pacientes que apresentavam coloniza??o positiva pelo m?todo tradicional (orofaringe/escarro), tinham uma chance estatisticamente significativa de serem identificados tamb?m pela cultura da cavidade nasal (p<0,001). Por?m a associa??o n?o ? perfeita, e demonstrou baixa correla??o para detec??o de germes gram negativos. Foram observados p?lipos nasais em 9 participantes. Quando utilizada a presen?a de p?lipo como marcador de doen?a na endoscopia nasal, observa-se uma forte associa??o entre a presen?a de p?lipos e o redu??o dos valores no escore cl?nico de Shwachman-Kulczycki (p<0,001). Conclus?es: os resultados da cultura obtidos pela coleta da fossa nasal foram semelhantes aos encontrados pelos m?todos de coleta padronizados como marcadores de coloniza??o da via a?rea inferior. Al?m de caracterizar-se como uma t?cnica pouco invasiva, o swab nasal mostra-se sens?vel ? identifica??o de pat?genos relevantes na FC, especialmente SA. Al?m disso, a presen?a do p?lipo na cavidade nasal mostrou ser um dado associado a marcadores de progn?stico medido pelo escore cl?nico de Shwachman-Kulczycki.