Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2016-10-13T12:20:42Z No. of bitstreams: 1 Joanna Dourado.pdf: 721470 bytes, checksum: 1ade18b6e4af854fcb0abb1162f7c2bb (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-13T12:20:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Joanna Dourado.pdf: 721470 bytes, checksum: 1ade18b6e4af854fcb0abb1162f7c2bb (MD5) Previous issue date: 2009-02-13 / Shrimp farming all over the world has been affected in the last years by many diseases, that have contributed to the development indexes decline in the production of farmed marine shrimp. On top of the losses due to diseases, it's important to mention that some of the vibrio species are zoonotic agents, meaning they can also cause diseases in humans. Given the importance of bacteria of the genus Vibrio to shrimp farming and public health, the aim of this study was to evaluate marine shrimp, correlate the clinical findings with the presence of the vibrio bacteria and identify the isolated species in the water of the ponds of cultivated marine shrimp in Pernambuco. The samples were collected from four coastal farms and the laboratory analysis consisted of the research and identification of the vibrio bacteria in the hepatopancreas and in the water of the tanks, and identification of any alteration by examination of fresh samples. Thiosulphate citrate bile salt agar (TCBS) was used as the culture media and the selected colonies were later biochemically tested. Four hundred and eighty shrimps were analyzed, of hose 424 (88.33%) showed to have vibrio and one or more alterations. There were identified a total of 903 alterations, the most frequent of muscle tissue (329; 36.43%) and the least frequent of the hepatopancreas tubules (121; 13.40%). When analizing the growth cycle, it was observed the largest number of alterations (503; 55.7%) in the dry season. Taking into account the weight of the shrimps, it was observed 540 (59.8%) alterations when the average weight was 8g. Out of all the analyzed animals, 314 (65.42%) showed to have vibrio, being 38 samples from the ponds water and 605 shrimp isolated. The most abundant species was V. mediterranei, (21.31%), considered an environmental species non pathogenic to shrimp, and the least abundant species were V. campbellii, V. rotiferanus, V. shiloni, V. splendidus, V. tapetis and V. wodanis (0.16 %). A dependency between the alterations found on the exam and the presence of the vibrio was noticed, showing that the aforementioned exam, combined to microbiological analyzes, is an important tool that should be used when monitoring the farms. It was also noticed a great variety of pathogenic and non pathogenic species of vibrio in the studied samples. Such microorganisms could, eventually, be related to shrimp and human infections, which could represent a risk for shrimp farming and public health respectively. / A carcinicultura mundial tem enfrentado nos últimos anos vários impactos causados por enfermidades, que contribuíram para a queda dos índices de desenvolvimento na produção de camarão marinho cultivado. Além das perdas causadas devido às enfermidades, ressalta-se que algumas espécies de víbrio são agentes zoonóticos, ou seja, podem causar doenças também em humanos. Dada a importância das bactérias do gênero Vibrio para a carcinicultura e saúde pública, objetivou-se avaliar camarões marinhos, associar os achados clínicos com a presença de bactérias do gênero Vibrio e identificar as espécies isoladas da água dos viveiros e de camarões marinhos (Litopenaeus vannamei) cultivados no litoral do estado de Pernambuco. As amostras foram coletadas em quatro carciniculturas do litoral e as análises laboratoriais compreenderam pesquisa e identificação de bactérias do gênero Víbrio no hepatopâncreas e na água dos viveiros, e identificação de alterações através do exame a fresco. Para o isolamento das espécies foi utilizado o meio de cultivo Ágar Tiossulfato Citrato Sais de Bile Sacarose (TCBS) e as colônias selecionadas foram posteriormente submetidas a provas bioquímicas. Foram analisados no total 480 camarões, destes 424 (88,33%) apresentaram um ou mais tipos de alteração. Foi identificado um total de 903 alterações, sendo a mais freqüente a da musculatura (329; 36,43%) e a menos freqüente a alteração dos túbulos do hepatopâncreas (121; 13,40%). Com relação ao ciclo de cultivo, foi observado o maior número de alterações (503; 55,7%) no período de estio. Levando-se em consideração a média de peso dos camarões verificou-se 540 (59,8%) alterações quando os mesmos estavam com peso médio de 8 g. Do total de animais analisados 314 (65,42%) apresentavam vibrio e uma ou mais alteração no exame a fresco. Foi obtido um total de 643 isolados de Vibrio, sendo 38 de amostras de água dos viveiros e 605 isolados de camarão. A espécie mais abundante foi V. mediterranei (21,31%), considerada espécie ambiental e não patogênica para o camarão, e as espécies de menor predominância foram V. campbellii, V. rotiferianus, V. shiloni, V. splendidus, V. tapetis e V. wodanis (0,16%). Foi verificada uma dependência entre as alterações encontradas no exame a fresco e a presença de vibrio, concluindo-se que o referido exame, associado à análise microbiológica é uma importante ferramenta que deve ser utilizada no monitoramento da saúde dos animais. Verificou-se também uma ampla variedade de espécies patogênicas e não patogênicas de víbrio nas amostras estudadas, que podem eventualmente estar relacionados a infecções nos camarões e nos humanos, representando um risco para a carcinicultura e para a saúde pública respectivamente.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2016-10-18T11:49:13Z No. of bitstreams: 1 Lilian Maria Nery de Barros Goes.pdf: 490274 bytes, checksum: f5fc8ea054d8a75de4f16f6764893075 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-18T11:49:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Lilian Maria Nery de Barros Goes.pdf: 490274 bytes, checksum: f5fc8ea054d8a75de4f16f6764893075 (MD5) Previous issue date: 2008-07-02 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The blood cells normal values knowledge is one of the most valuable clinical labs technique which allows the systemic and morphologic anomaly, when identification is not cleary shown in the organism, identification. At the mammals medicine these values are great known, but on the shrimp culture there still be too much to clear up about haemolynph. Several studies have been realized aiming determines the different kinds of cells and their respective functions. However, the important information like the normal values of the hemocytes total counting (HTC) in different development phases to the Litopenaeus vannamei species and the existence of hemocytes behavior variations on males and females, as well as its relation to anatomo-histopatologic alterations, still being unknown. In face of the exposed, it was aimed to verify the hemocytes behavior on the different cultivated L. vannamei shrimp development phases, the sexual quantitative variation existence, the sodium citrate and Ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA) efficacy as anticoagulant, beyond its relation to the detected alterations at the fresh and histopathology exams. 20 samples of haemolynph were collected weekly, being ten (five males and five females) using the sodium citrate anticoagulant and ten using the EDTA anticoagulant. The collects were realized in two aquariums (A and B), on summer and winter times at a commercial shrimp culture located in Goiana/Pernambuco estate. 0,1mL of haemolynph on a proportion of 1:1 (anticoagulant with 10%concentration:haemolynph) were collected from each shrimp to clinical pathology analyses. The hemocyties/mm3counting was realized immediately after the collect and after a five hours interval. The results were statistically analyzed using multiple linear moulds (P<0,05). The entire sample animals showed themselves healthy doesn’t presenting significant interference of the detected alterations on the fresh and histopathology exams over the HTC. The male shrimps presented bigger HTC than the females, thus the animals age interfered at the HTC, getting bigger counting on elder animals. In relation to the seasonality, the winter cultivated animals presented bigger counting than the summer cultivated. Both the sodium citrate and the ETDA preserved correctly the samples designated to HTC immediately after the collect. It was concluded that the sex, the age and the seasonality interfere directly over the HTC and the sodium citrate at 10% and the EDTA at 10% are indicated to the HTC immediately after the collect. / O conhecimento dos valores normais das células sanguíneas é uma das mais valiosas técnicas de laboratório clínico, que permite a identificação de anormalidades morfológicas e sistêmicas, não aparentes, no organismo. Em mamíferos estes valores são amplamente conhecidos, porém em camarões, ainda há muito que se desvendar a respeito da hemolinfa. Muitos estudos têm sido realizados visando determinar os diferentes tipos celulares e suas respectivas funções. Todavia, informações importantes como os valores normais da contagem total dos hemócitos (CTH) em diferentes fases do desenvolvimento para a espécie Litopenaeus vannamei e a existência de variações no comportamento dos hemócitos de indivíduos machos e fêmeas, bem como sua relação com alterações anatomohistopatológicas, ainda são desconhecidas. Diante do exposto, objetivou-se verificar o comportamento dos hemócitos nas diferentes fases de desenvolvimento de camarões L. vannamei cultivados, a existência de variação quantitativa entre sexos, a eficácia do citrato de sódio e do ácido etilenodiaminotetracético de sódio (EDTA) como anticoagulantes, além de sua relação com alterações detectadas aos exames a fresco e histopatológico. Semanalmente, coletaram-se 20 amostras de hemolinfa, sendo dez (cinco machos e cinco fêmeas) utilizando o anticoagulante citrato de sódio e dez utilizando o anticoagulante EDTA. As coletas foram realizadas em dois viveiros (A e B), nos períodos de inverno e verão numa carcinicultura comercial localizada em Goiana estado de Pernambuco. De cada camarão foi coletado 0,1mL de hemolinfa na proporção de 1:1 (anticoagulante com concentração de 10%:hemolinfa) para as análises de patologia clínica. As contagens de hemócitos/mm3 foram realizadas imediatamente após a coleta e após intervalo de cinco horas. Os resultados foram analisados estatisticamente utilizando-se modelos lineares múltiplos (P<0,05). Todos os animais amostrados apresentaram-se hígidos, não havendo interferência significativa das alterações detectadas aos exames a fresco e histopatológico sobre a CTH. Os camarões machos apresentaram maiores CTH do que as fêmeas, assim como a idade dos animais interferiu na CTH, obtendo-se maiores contagens em animais mais velhos. Em relação à sazonalidade, os animais cultivados no inverno apresentaram maiores contagens que os cultivados no verão. Tanto o citrato de sódio quanto o EDTA preservaram adequadamente as amostras destinadas CTH imediatamente após a coleta. Conclui-se que o sexo, a idade e a sazonalidade interferem diretamente sobre a CTH e que o citrato de sódio a 10% e o EDTA a 10% são indicados para a CTH imediatamente após a coleta.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-10-09T14:17:33Z No. of bitstreams: 1 Carlos Eduardo Rangel de Andrade.pdf: 2708803 bytes, checksum: cfe99e895be7276027f4d0c1d7468f40 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-09T14:17:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Carlos Eduardo Rangel de Andrade.pdf: 2708803 bytes, checksum: cfe99e895be7276027f4d0c1d7468f40 (MD5) Previous issue date: 2016-02-26 / On the coast of Pernambuco, the shrimp trawl fishery occurs in estuaries, hollows and water near the coast. The most commonly used gear are based on simple traditional techniques such as beach seining, more recreational character (almost exclusively on the north coast) and shrimp trawling. Despite the economic and ecological importance, little is known about the fishing on the coast of this state. There are about 50 vessels operated with trawling in Pernambuco, where about 100 fishermen are divided into five communities (Recife, Jaboatão dos Guararapes, Barra de Sirinhaém, Tamandaré e São José da Coroa Grande) all located on the southern coast. The most active fishing effort on this feature, is concentrated in Barra de Sirinhaém. Until now, probably because of lack of local knowledge about the activity, it was not possible to observe more effective measures in order to protect the marine shrimp on the coast of Pernambuco, as was done for the rest of the region among Alagoas and Bahia (IN 14 de 2004, MMA). Taking into account the scarcity of studies on "shrimp trawling in Pernambuco," this manuscript is justified by the need to characterize the shrimp trawling on the coast of this state, where Barra de Sirinhaém has been identified as the main fishing warehouse that resources, characterize the used boats, fishing equipment, the production of this resource for the community and time of year and the impact on bycatch. To date we have not identified any measures to reduce the ecological impact of fishing with the use of bycatch reduce devices (BRD), which justifies the use of three BRD, during work with the order to quantify and qualify the bycatch, and present measures to mitigate the impact of this activity on the fish community of the region. An analysis was made of the economic cost of trawling activity in Pernambuco, thus paving the way for measures that can guide the activity. / No litoral de Pernambuco, a pescaria de arrasto de camarão ocorre em estuários, reentrâncias e águas próximas à costa. Os apetrechos mais utilizados são baseados em técnicas tradicionais simples, como os arrastos de praia, mais de caráter recreativo (quase exclusivamente no litoral norte) e arrastos com portas a partir de embarcações. Apesar da relevância econômica e ecológica, pouco se conhece sobre essa pesca no litoral desse estado. Existe cerca de 50 embarcações que operam com pesca de arrasto em Pernambuco, onde aproximadamente 100 pescadores se dividem entre cinco comunidades (Recife, Jaboatão dos Guararapes, Barra de Sirinhaém, Tamandaré e São José da Coroa Grande), todas localizadas no litoral sul. O maior esforço de pesca atuante sobre esse recurso, está concentrado na localidade de Barra de Sirinhaém. Até o presente momento, provavelmente em virtude dos escassos conhecimentos locais sobre a modalidade, não foi possível observar medidas mais eficazes, a fim de proteger o camarão marinho na costa de Pernambuco, como foi feito para ao resto da região compreendida entre Alagoas e Bahia (IN 14 de 2004, MMA). Tendo em conta a escassez de trabalhos sobre o tema "pesca de arrasto de camarão em Pernambuco", este manuscrito se justifica pela necessidade de caracterizar a pesca arrasteira de camarão na costa deste estado, onde Barra de Sirinhaém foi identificada como o principal entreposto de pesca desse recurso, caracterizar as embarcações empregadas, os equipamentos de pesca, a produção deste recurso por comunidade e época do ano e o impacto sobre a ictiofauna acompanhante. Até o presente momento não foram identificados nenhuma medida para reduzir o impacto ecológico dessa pescaria com a utilização de dispositivos para reduzir as capturas indesejadas (Dispositivos para Reduzir a Captura de Fauna Acompanhante - DRFA), o que justifica a utilização de três DRFA, no decorrer do trabalho com o objetivo de quantificar e qualificar a fauna acompanhante, além de apresentar medidas para mitigar o impacto dessa atividade sobre a comunidade de peixes da região. Foi feita uma análise do custo econômico da atividade de arrasto em Pernambuco, abrindo assim, os caminhos para medidas que possam nortear a atividade.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-10-10T12:46:11Z No. of bitstreams: 1 Bruna Paula Torres Quinto.pdf: 1332950 bytes, checksum: 3c3850f7c2273a457c6895307ca6537b (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-10T12:46:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Bruna Paula Torres Quinto.pdf: 1332950 bytes, checksum: 3c3850f7c2273a457c6895307ca6537b (MD5) Previous issue date: 2016-08-30 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The depletion of fisheries combined with growing demand from aquaculturists for fish meal to manufacture feed has led to increased costs for this product. In the search for ways to make aquaculture less dependent on fisheries, several alternative raw materials are being used to manufacture feed for fish and crustaceans. In this study we used tilapia carcasses from fish filleting operations to produce fish protein hydrolysates and subsequently incorporated them into feed for marine post-larval shrimp. Two fish protein hydrolysates were produced (FPH) with hydrolysis times of 1 (FPH1) and 2 hours (FPH2). The commercial protease alcalase was used in the reaction. The hydrolysates obtained were subjected to structural and nutritional analysis. The following data were determined: degree of hydrolysis, electrophoretic profile, zymography, composition (to the hundredth), and levels of amino acids and fatty acids. The degree of hydrolysis obtained ranged from 34.01 to 48%. Peptides from 10 to 250 kDa were detected, and 4 bands were observed in the zymography for each hydrolysate, with weights ranging from 75 to 250 kDa. The levels of crude protein hydrolysates were 68.04% (FPH1) and 70.69% (FPH2). Next, experimental feeds were prepared containinggradual substitutions of fish meal with the hydrolysates FPH1 and FPH2 in the proportions of 0% (control), 10%, 20%, and 30%, totaling seven formulated feeds (0%, H110%, H120%, H130%, H210%, H220%, and H230%). These feeds were fed to marine shrimp in the initial post-larvae phase 12 for 45 days. At the end of the crop, the performance of the shrimp fed the experimental feed was evaluated. We found that the shrimp fed the formulations containing FPH2 had better growth than the other treatments, proving that hydrolysate can be used in feed for post-larvae stage Litopenaeus vannamei, replacing 15% of fish meal. / A depleção dos estoques pesqueiros associada a crescente demanda da aquicultura por farinha de peixe para fabricação de rações tem ocasionado a elevação de seu custo. Na busca de meios para tornar a aquicultura menos dependente da pesca, diversas matérias primas alternativas estão sendo utilizadas na fabricação de rações para peixes e crustáceos. No presente estudo foram utilizadas carcaças de tilápia provenientes de indústrias de filetamento de pescado na fabricação de hidrolisados proteicos de peixe e sua posterior incorporação em rações para pós-larvas de camarões marinhos. Foram produzidos dois hidrolisados de peixe (HPP) com tempos de hidrólise de uma (HPP 1) e duas horas (HPP 2). Foi utilizada a protease comercial alcalase na reação. Os hidrolisados produzidos foram caracterizados estruturalmente e nutricionalmente. Foram determinados os graus de hidrólise, os perfis eletroforéticos, zimograma, composição centesimal e teores de aminoácidos e ácidos graxos. Os graus de hidrólise obtidos variaram de 34,01 a 48 %. Foram detectados peptídios de 10 a 250 kDa e foram observados 4 bandas no zimograma, para cada hidrolisado, cujos pesos variaram de 75 a 250 kDa. Os teores de proteína bruta dos hidrolisados foram de 68,04% (HPP 1) e 70,69 % (HPP 2). Em seguida foram elaboradas 7 rações experimentais que continham substituições graduais de farinha de peixe nas proporções de 0% (controle), 10, 20 e 30 % pelos hidrolisados HPP1 e HPP2 totalizando sete dietas formuladas (0%, H110%, H120%, H130%, H210%, H220% e H230%). Essas rações foram fornecidas para camarões marinhos na fase inicial de pós-larva 12 durante 45 dias. Ao término do cultivo foi avaliado o desempenho zootécnico dos camarões alimentados com as rações formuladas. Foi constatado que os camarões alimentados com as rações contendo o HPP 2 tiveram melhores crescimentos que os demais tratamentos, provando que o hidrolisado pode ser utilizado em rações para pós larvas de Litopenaeus vannamei substituindo em 15 % a farinha de peixe.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-10-24T12:55:35Z No. of bitstreams: 1 Marcelo Augusto Soares Rego.pdf: 833356 bytes, checksum: 1a5a4f1c36e44f371f7effe11bc5b82f (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-24T12:55:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Marcelo Augusto Soares Rego.pdf: 833356 bytes, checksum: 1a5a4f1c36e44f371f7effe11bc5b82f (MD5) Previous issue date: 2016-02-25 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Biofloc Technology (BFT) is considered an alternative, sustainable culture system of the marine shrimp Litopenaeus vannamei. However, there are doubts about its financial return in the short and long period of time, as well as uncertainties regarding losses caused by variations in major economic items and shrimp performance. The Thesis evaluated the economic viability, risk and the efficiency of BFT in comparison to a conventional system of a shrimp farm located in the State of Pernambuco, Brazil. Data for the BFT and conventional farming systems were obtained from 9 production cycles in three 625 m2 ponds lined with HDPE and 12 production cycles in the farm’s conventional ponds, respectively. Viability indicators were favorable for both systems, with greater expressiveness of net present value (NPV) for the BFT (R$ 353,591.00) and internal rate of return (IRR) 4.5 times greater for the conventional (131.86%). When used the Monte Carlo Method (MMC) it was found to BFT system the failure probability of 7%, 10% and 15% when combined with a discount rate of 10%, 13% and 16% respectively. According the Data Envelopment Analysis (DEA) four productions cycles (7.0%) were classified as technically efficient on the farm over the years 2013 and 2014. There was significant difference in the average technical efficiency scores of production systems. There was greater influence of management on the conventional system efficiency, while the production scale was the factor to influence the reduction of the average technical efficiency score of BFT system. The works provide useful information to improve the L. vannamei culture and give greater security to the investment in the BFT system by producers in the Northeast region of Brazil. Both culture systems represent important investment alternatives for the rural sector of Brazil, confirmed by the favorable results of profitability and viability. / A tecnologia de bioflocos (BFT) é apontada como uma alternativa para o cultivo sustentável do camarão marinho Litopenaeus vannamei. Porém, existem dúvidas quanto ao seu retorno financeiro, no curto e no longo período de tempo, como também incertezas relacionadas à probabilidade de perdas diante de variações futuras nos principais índices econômicos e de desempenho zootécnico. Assim, objetivou-se com os estudos avaliar aspectos relacionados à viabilidade econômica, ao risco e a eficiência dos sistemas BFT e convencional em fazenda de criação de camarão do litoral sul do estado de Pernambuco. Para a obtenção das informações necessárias para as análises, utilizaram-se três viveiros (625 m2 cada) forrados com polietileno de alta densidade (PEAD) operando nos moldes do sistema BFT e informações do sistema convencional da mesma fazenda. Na análise de investimento, os indicadores foram favoráveis para ambos os sistemas, com maior expressividade do valor presente líquido (VPL) para o BFT (R$ 353.591,00) e taxa interna de retorno (TIR) 4,5 vezes maior para o convencional (131,86%). Porém, através de simulações pelo Método de Monte Carlo (MMC), verificou-se risco apenas no sistema BFT, com probabilidade de 7, 10 e 15% quando submetido à taxa de desconto de 10, 13 e 16%, respectivamente. Ao avaliar os ciclos produtivos da fazenda ao longo de 2013 e 2014, por meio da análise envoltória de dados (DEA), detectaram-se apenas quatro produções (7,0%) eficientes tecnicamente. Ao comparar os sistemas produtivos, verificou-se diferença significativa nos escores médios de eficiência técnica destes. Em relação às operações dos ciclos produtivos, foi constatada uma maior influência do manejo na ineficiência do sistema convencional, enquanto a escala produtiva foi o fator a influenciar na redução do escore médio de eficiência técnica do sistema BFT. Os resultados dos estudos permitirão o aperfeiçoamento do cultivo do camarão L. vannamei, além de dar maior segurança para o investimento no sistema BFT pelos produtores da região Nordeste do Brasil. Ambos os sistemas de produção de camarão representam importantes alternativas de investimento para o setor rural brasileiro, confirmado pelos resultados favoráveis de rentabilidade e viabilidade.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-10-27T12:44:53Z No. of bitstreams: 1 Joana Angelica Lyra Vogeley de Carvalho.pdf: 1376015 bytes, checksum: 83c8b8a2eb0e7f8feefee9e03ebf6461 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-27T12:44:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Joana Angelica Lyra Vogeley de Carvalho.pdf: 1376015 bytes, checksum: 83c8b8a2eb0e7f8feefee9e03ebf6461 (MD5) Previous issue date: 2016-03-31 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / This study focused on selecting wild shrimp Bacillus for a probiotics use in shrimp farming. Bacillus circulans and Bacillus subtilis were isolated from the Farfantepenaeus subtilis intestine and have showed antagonism against Vibrio harveyi, Vibrio alginolyticus, Vibrio vulnificus and Vibrio mimicus in in vitro tests. Afterwards, these bacteria inhibited Vibrio parahaemolyticus ATCC 17802 (VP) in a wide pH and salinity range and produced lipase, amylase and protease in vitro showing that these Bacillus had the needed requirements for in vivo experiments. Thus, juveniles of Litopenaeus vannamei were grown according to the following diet: feed + B. subtilis (BS); feed + B. circulans (BC) and feed without bacteria (Control). Every 15 days samples were collected in order to quantify the bacteria and enzyme activity. After 45 days, the shrimp’s weight fed with BS and BC was significantly higher when compared to the control group. There was a significant increase in Bacillus spp. and a Vibrio spp. reduction in the intestine and hepatopancreas, especially after the 30th and 45th day mark. The trypsin, chymotrypsin, lipase and amylase also had significant increase in shrimp fed with BC and BS, especially after the 30th day mark. After 60 days, the immune system gene expression (proPO, LGBP and HEM) increased significantly in the shrimp fed with BS and BC. In addition to these experiments, the shrimp were infected (by injection) and challenged (water) against VP. The shrimp fed with BC diet had significantly higher survival rates after the injection and there were no differences after the challenge. The proPO expression did not differ between diets after infection or challenge. There was a Vibrio spp. reduction and a significant Bacillus spp. increase in the shrimps’ intestines which were fed with BC and BS diets after the challenge. The Bacillus spp. increase in shrimp fed with BC and BS diets suggest that there was colonization in the gastrointestinal tract during all the experimental period. This may have increased the enzyme activity improving digestion and weight gain, reduced the Vibrio spp. and increased the immune system gene expression, making the shrimp more resistant to infection (BC diet). Thus, B. circulans and B. subtilis have showed the potential for its application as probiotics in shrimp farming. / O objetivo desse estudo foi selecionar Bacillus de camarões selvagens para uso como probiótico na carcinicultura. Bacillus circulans e Bacillus subtilis foram isolados do intestino de Farfantepenaeus subtilis e demonstraram antagonismo contra Vibrio harveyi, Vibrio alginolyticus, Vibrio vulnificus e Vibrio mimicus em testes in vitro. Posteriormente, essas bactérias inibiram Vibrio parahaemolyticus ATCC 17802 (VP) em uma ampla faixa de pH e salinidade e produziram lipase, amilase e protease in vitro, demonstrando que esses Bacillus possuíam características requeridas para experimentos in vivo. Então, juvenis de Litopenaeus vannamei foram cultivados com as dietas: ração + B. subtilis (BS); ração + B. circulans (BC) e ração sem bactérias (Controle). A cada 15 dias, amostras foram coletados para quantificação bacteriana e de atividade enzimática. Ao final de 45 dias, o peso dos camarões alimentados com BS e BC foi significativamente maior comparados ao grupo controle. Houve um significativo aumento de Bacillus spp. e redução de Vibrio spp. no intestino e hepatopâncreas, sobretudo após 30 e 45 dias. As atividades da tripsina, quimotripsina, lipase e amilase aumentaram significativamente nos camarões alimentados com BC e BS, principalmente após 30 dias. Após 60 dias, a expressão de genes do sistema imunológico (proPO, LGBP e HEM) aumentou significativamente nos camarões alimentados com BS e BC. Adicionalmente, os camarões foram infectados (injeção) e desafiados (água) com VP. A sobrevivência dos camarões alimentados com BC foi significativamente maior após infecção e não houve diferenças após desafio. A expressão da proPO não diferiu entre as dietas após infecção e desafio. Houve uma redução de Vibrio spp. e significativo aumento de Bacillus spp. no intestino dos camarões alimentados com BC e BS após desafio. Durante todo o período experimental, o aumento de Bacillus nos camarões alimentados com BC e BS sugere que houve colonização no trato digetório de B. circulans e B. subtilis. Isso pode ter incrementado a atividade enzimática, melhorando a digestão e ganho de peso, reduzido Vibrio spp. e aumentado a expressão de genes do sitema imunológico, tornando os camarões mais resistentes ao VP (dieta BC). Assim, B. circulans e B. subtilis apresentam potencial para utilização como probiótico na carcinicultura.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-07T11:34:15Z No. of bitstreams: 1 Alexandre Duarte Rodrigues da Silva.pdf: 439100 bytes, checksum: 1b2fd1350f22fda3959acac92bbccf28 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-07T11:34:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Alexandre Duarte Rodrigues da Silva.pdf: 439100 bytes, checksum: 1b2fd1350f22fda3959acac92bbccf28 (MD5) Previous issue date: 2010-06-14 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Culture of Litopenaeus vannamei in freshwater (0.0 g L-1) and low alkalinity and hardness (<50 mg L-1 CaCO3) were performed during 2008 to 2009, with the aim of evaluating the influence of adding of lime, to maximize production indices of shrimp. Post-larvae of this species, with 10 to 12 days (PL10-12), were initially acclimated to fresh water and then stored at density of 17 PL m-2, 12 experimental ponds of 60 m2. The concentrations of lime (4.0, 8.0, 12.0 and 16.0 t ha-1 cycle-1) were evaluated in the presence or absence of fertilizer-based K+ and Mg2+, in completely randomized. The diet was formed based pelleted feed, shrimp with 32% protein, and administered at feeders. The monitoring of physical and chemical qualities of water was carried out in different phases. After 60 days of cultivation,the best survival were observed in treatments of 8.0 and 12.0 t ha-1 without fertilizer, and application of 4.0 t ha-1 in crops with fertilizer. It was concluded that the use of lime favors the growth of L. vannamei in freshwater. / Cultivos do Litopenaeus vannamei, em água doce (0,0 g L-1) e com baixa alcalinidade e dureza (< 50 mg L-1 CaCO3) foram realizados no período de 2008 a 2009, com o objetivo de avaliar a influência da adição de calcário dolomítico, para maximizar os índices zootécnicos desses camarões. Pós-larvas dessa espécie, com 10 a 12 dias (PL10-12), foram inicialmente aclimatadas a água doce e, posteriormente, estocados a densidade de 17 PL m-2, em 12 viveiros experimentais de 60 m2. As concentrações de calcários (4,0, 8,0, 12,0 e 16,0 t ha-1 ciclo-1) foram avaliadas na presença ou não de fertilizantes a base de K+ e Mg2+, em experimentos inteiramente casualizados. A dieta foi constituída a base de ração peletizada,para camarão com 32% de proteína, e administrada em comedouros. O monitoramento das qualidades físicas e químicas da água foi realizado, nas diferentes fases experimentais. Após 60 dias de cultivo, as melhores sobrevivências foram observadas nos tratamentos de 8,0 e 12,0 t ha-1, sem fertilizante, e na aplicação de 4,0 t ha-1 em cultivos com fertilizante. Concluiu-se que a utilização do calcário dolomítico favorece o cultivo do L. vannamei em água doce.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-10T11:11:21Z No. of bitstreams: 1 Edvaldo Cavalcanti de LIma Neto.pdf: 1484364 bytes, checksum: 176b6dea99569a96a24729551d8d6cab (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-10T11:11:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Edvaldo Cavalcanti de LIma Neto.pdf: 1484364 bytes, checksum: 176b6dea99569a96a24729551d8d6cab (MD5) Previous issue date: 2006-02-20 / Viruses are among the most harmful pathogens found in aquaculture and are the most numerous and diverse of the pathogenic agents described to crustaceans. The knowledge about genes associated to immunity viral response, as well as the relationships between pathogen and host still very incomplete. Moreover, shrimp cell lines are not available, thus limiting primary systems of cellular culture to assist searches in genomic expression. The Expressed Sequence Tags (ESTs) analyses have become a common tool used to identify genes involved in some specific biological functions, particularly in organisms in which genomic data are not available. The Laboratory of Applied Genetics (LAGA) of the Universidade Federal Rural de Pernambuco (UFRPE) is one of the members of the Shrimp EST Genome Project (ShEST), assisting on sequencing and search for genes related to shrimp immune response against the viral infections. Libraries of different tissues (muscle, hepatopancreas, ocular peduncle)and different larval stages of Litopenaeus vannamei were sequenced using BigDye Terminator Sequencing Kit (Applied Biosystems) or ET-Dye Terminator (Amersham/GE Healthcare) and M13 universal primer (5'-TGTAAAACGACGGCCAGT-3'). The sequences were analyzed in automated sequencers MegaBace1000 (Amersham/GE Healthcare) and Applied Biosystems 377 (ABI377). These sequences were analyzed using the Basic Local Alignment Search Tool (BLAST). The results presented homology with interferon system proteins, like 2’,5’-Oligoadenylate binding protein, Toll like receptors, JAK/STAT and Interferon like protein. The 2’,5’-Oligoadenylate binding protein would be the first protein related to interferon system described in shrimps. A lot of sequences are still need to be investigated to complete the whole genome of Litopenaeus vannamei, nevertheless there are indications that this animal has a complex antiviral defense system, similar to interferon. / Os vírus estão entre os patógenos mais danosos encontrados na aqüicultura e são os mais numerosos e diversificados descritos para os crustáceos. O conhecimento sobre os genes associados à resposta imune viral, bem como a relação entre patógenos e hospedeiro ainda é escasso. Além disso, não há disponibilidade de linhas de célula para camarões, o que limita os sistemas primários de cultura celular, que por sua vez subsidiam pesquisas voltadas à expressão gênica. A análise de Seqüências Expressas Identificadas Expressed Sequence Tags (ESTs) tem se tornado uma prática comumente utilizada para identificar genes envolvidos em funções biológicas específicas, especialmente em organismos onde os dados genômicos ainda não estão disponíveis. O Laboratório de Genética Aplicada (LAGA) da Universidade Federal Rural de Pernambuco (UFRPE) é um dos participantes do projeto genoma EST do camarão Litopenaeus vannamei (ShEST) auxiliando no seqüenciamento e busca de genes de L. vannamei que atuam na resposta imune dos camarões contra as infecções virais. Foram seqüenciadas bibliotecas de diferentes tecidos (músculo, hepatopâncreas, pedúnculo ocular, etc) e diferentes fases larvais de Litopenaeus vannamei usando BigDye Terminator Sequencing Kit (Applied Biosystems) ou ET-Dye Terminator (Amersham/GE Healthcare) e o primer M13 universal (5'-TGTAAAACGACGGCCAGT-3'). As seqüências foram analisadas em seqüenciadorores automáticos MegaBace1000 (Amersham/GE Healthcare) e Applied Biosystems 377 (ABI377). Estas seqüências foram analisadas usando-se a Basic Local Alignment Search Tool (BLAST). Os resultados obtidos apresentaram homologia com proteínas do sistema interferon, como 2’,5’-Oligoadenylate binding protein, Toll like receptors (TLRs), JAK/STAT e interferon like protein (IntlP). A 2’,5’-Oligoadenylate binding protein pode ser a primeira proteína descrita para camarões que está relacionada ao sistema interferon. Muitas seqüências ainda precisam ser processadas para completar o genoma de Litopenaeus vannamei, contudo já há indícios de que este tenha um complexo sistema de defesa contra vírus, semelhante ao sistema interferon.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-10T11:59:02Z No. of bitstreams: 1 Elizabel Oliveira Silva.pdf: 202306 bytes, checksum: 5779b75737b7f15c90824c1eeae271ac (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-10T11:59:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Elizabel Oliveira Silva.pdf: 202306 bytes, checksum: 5779b75737b7f15c90824c1eeae271ac (MD5) Previous issue date: 2006-02-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The objective of that work was to determine the coefficient of apparent digestibility of the dry matter ando f the crude protein and the apparent digestibility corrected by leaching of the dry matter, being used ration with vegetable ingredients in substitution of the animal protein in complete diets for the shrimp sea L. vannamei (Boone, 1931). The experiment was accomplished in the Station of Aquaculture in UFRPE. It was used juvenile shrimps of the species L vannamei, with weight medium initial of 4 + 1,5g, originated Farm Costa Dourada – PE. The animals were housed in 16 glass aquariums (60x40x50 cm), with 6 animals for aquarium. The experimental diets will consist of four rations with different levels of vegetable protein (0%, 25%, 50% and 75%) in substitution the fish flour. The experimental design used was allocated in with four treatments and four repetition. It was not verified of the substitution of the animal protein on the apparent digestibility of the protein (94, 91; 96, 20; 93, 33; 92, 48%) and dry matter (93, 33; 95, 30; 92, 25; 90, 92%) as well as in the apparent digestibility corrected by leaching of the dry matter ( 93,36; 95, 06; 91, 46; 90, 64%) of the experimental diets, respectively. / O objetivo desse trabalho foi determinar o coeficiente de digestibilidade aparente da matéria seca e da proteína bruta e a digestibilidade aparente corrigida por lixiviação da matéria seca, utilizando-se ração com ingredientes vegetais em substituição da proteína animal em dietas completas para o camarão marinho Litopenaeus vannamei (Boone, 1931). O experimento foi realizado na Estação de Aqüicultura da UFRPE. Utilizou-se camarões juvenis da espécie Litopenaeus vannamei, com peso médio inicial de 4 ± 1,5g, provenientes da Fazenda Costa Durada – PE. Os animais foram alojados em 16 aquários de vidros (60x40x50 cm), com 6 animais por aquário. AS dietas experimentais consistirão de quatro rações com diferentes níveis de proteína vegetal (0%, 25%, 50% e 75%) em substituição a farinha de peixe. O delineamento experimental utilizado foi inteiramente casualizado com quatro tratamentos e quatro repetições. Não foi verificado influencia da substituição da proteína animal sobre a digestibilidade aparente da proteína (94, 91; 96, 20; 93, 33; 92,48%) e matéria seca (93, 33; 95, 30; 92, 25; 90, 92%) bem como na digestibilidade aparente corrigida por lixiviação da matéria seca (93, 36; 95,06; 91, 46; 90, 64%) das dietas experimental, respectivamente.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-13T13:52:09Z No. of bitstreams: 1 Flavia Maria Maciel Carneiro de Souza.pdf: 432222 bytes, checksum: 47380c92c63248a05ae6b56a5134cf13 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-13T13:52:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Flavia Maria Maciel Carneiro de Souza.pdf: 432222 bytes, checksum: 47380c92c63248a05ae6b56a5134cf13 (MD5) Previous issue date: 2007-02-15 / Marine shrimp Farfantepenaeus subtilis is found along the Brazilian northeast coast. It tolerates salinity variations and grows quickly under culture conditions. However, it has a feeding habit predominantly carnivorous, using mainly polichaets as your main feeding source. The present work aimed at to induce the natural food in the experimental culture of F. subtilis through different fertilization strategies. A randomized entirely design with three treatments and three replicates was applied, being one with inorganic fertilizer: Control (CT) - 3 mg/L of urea and 0.3 mg/L of mono ammonium phosphate; and two with organic fertilizers: Wheat bran (FT) - 25 g/m2; Soybean meal (FS) – 18.75 g/m2. Nine 500L fiber glass tanks were used, with a stocking density of 16 shrimps/m2 (≈ 2.0 g), that were fed with a 35% crude protein commercial ration at 8:00, 12:00 and 16:00 hrs. The water and plankton samples were accomplished biweekly, and benthos was monthly. During the culture the water quality maintained it self adequate to shrimp culture. The growth data showed no significant difference (P≤0.05) among the treatments, where it was verified a growth rate of 0.44 g/week and a mean survival of 75%. With relation to the natural food, the phytoplankton (921 cells/mL) was predominated by the diatoms with 86, 49 and 83%, respectively, for thetreatments CT, FT and FS. The phytobenthos was also represented by Bacilariofíceae with 88%, 66% and 78%, respectively, for CT, FT and FS. The zooplankton (9.220 individuals/L) it was represented mainly by rotifers in the treatments CT (45%), FT (38%) and FS (65%). In zoobenthos the predominance was copepods in the treatments CT (97%), FT (91%) and FS (88%). The study showed similarity among the organic and inorganic fertilizers, indicating that the fertilization process was not efficient to supply enough natural food organisms, but it was observed that the three protocols applied were similar in terms of the F. subtilis shrimps growth and maintenance of water quality. / O camarão marinho Farfantepenaeus subtilis é encontrado por toda a costa do Nordeste do Brasil, tolera variações de salinidade e se desenvolve rapidamente sob condições de cultivo. Porém, tem um hábito alimentar predominantemente carnívoro, destacando-se os poliquetas como seu principal item alimentar. O presente trabalho objetivou induzir o alimento natural no cultivo experimental de F. subtilis, através de diferentes estratégias de fertilização. Foi adotado um delineamento inteiramente casualizado com três tratamentos, sendo um com fertilizante inorgânico: Controle (CT) - 3 mg/L de uréia e 0,3 mg/L de monoamônio fosfato; e dois com fertilizantes orgânicos: Farelo de Trigo (FT) - 25 g/m2 e Farelo de Soja (FS) – 18,75 g/m2, com três réplicas para cada tratamento. Foram utilizados nove tanques circulares em fibra de vidro, com capacidade de 500 L, os quais foram estocados com 16 camarões/m2 (≈2,0g). A alimentação artificial constou de ração comercial com 35% de proteína bruta e foi ofertada em bandejas, às 8:00, 12:00 e 16:00 h. As coletas de água e de plâncton foram realizadas quinzenalmente, e as coletas de bentos mensalmente.Durante o cultivo a qualidade de água se manteve adequada ao cultivo da espécie. Os dados de crescimento demonstraram não haver diferença estatística (P≤0,05) entre os tratamentos, onde foi constatado um crescimento de 0,44 g/semana e sobrevivência média de 75%. Quanto ao alimento natural, no fitoplâncton a média geral observada foi de 921 cél./mL e predominaram as diatomáceas com 86%, 49% e 83%, respectivamente, nos tratamentos CT, FT e FS. O fitobentos também foi representado pelas bacilariofíceas com 88%, 66% e 78,%, respectivamente, para os tratamentos CT, FT e FS. O zooplâncton teve uma média geral de 9.220 ind./L e esteve representado principalmente por rotíferos 45%, 38% e 65%, respectivamente, para CT, FT e FS. O zoobentos foi representado por copépodos com 97%, 91% e 88,%, respectivamente, para CT, FT e FS. O estudo demonstrou similaridade entre os fertilizantes orgânicos e inorgânicos, sugerindo que a fertilização não foi eficiente quanto à indução do alimento natural. Porém, demonstrou-se que os três protocolos testados foram igualmente eficientes para o crescimento do F. subtilis e para manutenção da qualidade da água.