BMPs ocupam papel central na diferenciação e crescimento celulares. A sinalização intracelular das BMPs depende de substratos conhecidos como BR-SMADs (SMAD1/5/8). Em ilhotas pancreáticas de ratas grávidas, onde ocorre aumento da massa endócrina e da síntese e secreção de insulina, houve aumento da expressão do receptor BMPR1A. Em camundongos knockout para BMPR1A houve diminuição da expressão de genes-chave na exocitose de grânulos de insulina. Tais eventos estão associados à redução da atividade das BR-SMADs. O objetivo deste trabalho foi avaliar, em células <font face=\"Symbol\">b INS1E, o perfil de expressão gênica em larga escala após silenciamento das BR-SMADs. As expressões relativas de Munc18a, Munc18b e Snap23 foram reduzidas quando do silenciamento das BR-SMADs (n=3, p<0,05 vs CTL). O silenciamento de SMAD1 (n=3, p<0,05 vs CTL) ou SMAD5 (n=3, p<0,05 vs CTL) acarretaram redução do mRNA de Sintaxina 4. Conclui-se que as BR-SMADs estão envolvidas na regulação da secreção de insulina modulando proteínas envolvidas na fusão de vesículas contendo grânulos de insulina à membrana plasmática de células INS1E. / BMPs play a determinant role in cell differentiation and growth. BMP intracellular signaling involves the substrates know as BR-SMADs (SMAD1/5/8). BMPR1A receptor expression was upregulated in pancreatic islets from pregnant rats, in wich endocrine mass and insulin secretion are increased. Mice with attenuated BMPR1A signaling in <font face=\"Symbol\">b cells showed decreased expression of key genes involved in insulin exocytosis. These events are associated with reduction of BR-SMADs activity. The aim of this work was to perform a screening to evaluate changes in expression profiles after knockdown of BR-SMADs in INS1E <font face=\"Symbol\">b cells. Relative expressions of Munc18a, Munc18b and Snap23 were diminished after knockdown of the BRSMADs (n=3, p<0,05 vs CTL). Only SMAD1 (n=3, p<0,05 vs CTL) and SMAD5 (n=3, p<0,05 vs CTL) silencing caused reduction of sintaxin 4 expression. These data point to the involvement of BR-SMADs in the regulation of insulin secretion by modulating the expression of proteins responsible by fusion of insulin-containing granules to the membrane of INS1E cells.

A causa mais comum da osteoporose é o declínio do hormônio sexual feminino, o estrógeno, que ocorre após a menopausa. Esse hormônio regula a produção de citocinas que influenciam a proliferação dos osteoclastos, aumentando a reabsorção óssea. Os efeitos da cafeína no metabolismo ósseo são controversos e podem estar associados ao aumento significativo de doenças periodontais, fraturas, aumento do cálcio urinário e redução da densidade mineral óssea, por exercer efeitos inibidores sobre as funções dos osteoblastos. O principal objetivo deste estudo foi avaliar o efeito in vitro de diferentes concentrações de cafeína no metabolismo de células osteoblásticas da medula óssea de ratas osteoporóticas. Após aprovação pela Comissão de Ética no Uso de Animais, ratas Wistar foram divididas em dois grupos experimentais: controle (C) e submetidas à ovariectomia (OVX). Após 60 dias da cirurgia, as ratas foram sacrificadas para coleta dos fêmures e das células mesenquimais da medula óssea, que foram induzidas à diferenciação em osteoblastos com meio osteogênico com três concentrações de cafeína (1, 3 e 5 mM - grupos OVX1, OVX3 e OVX5) e cultivadas em placas de 24 poços (n = 5) para avaliação da proliferação celular, atividade de fosfatase alcalina (ALP) bioquímica e in situ, detecção e quantificação de nódulos mineralizados e análise da expressão de genes relacionados à atividade osteoblástica através de PCR em tempo real. Os ensaios foram realizados em triplicata e analisados por meio do software estatístico GraphPad Prism, com nível de significância fixado em 5%. A proliferação celular foi menor nos grupos osteoporóticos com adição de cafeína, tendo a menor queda o grupo com adição de 1mM. O método bioquímico de ALP não foi significante nos períodos analisados, entretanto, aos 10 e 14 dias, a atividade aumentou quando a concentração de cafeína era maior. Já na atividade de ALP in situ, o grupo OVX1 foi o que apresentou melhor resultado nos períodos avaliados (p < 0,05), com pico aos 14 dias. A quantificação de matriz mineralizada foi maior no grupo OVX comparado ao grupo C; entre as concentrações, a maior quantificação dos nódulos de cálcio se deu no grupo com 1mM de cafeína. Os resultados obtidos no PCR mostraram que o gene para fosfatase alcalina teve maior expressão no grupo OVX, seguido do grupo OVX1 aos 7 e 10 dias; a expressão gênica de osteocalcina foi maior para o grupo OVX1 aos 10 e 14 dias e esse grupo apresentou a maior expressão em todos os períodos para os genes Runx2 e RankL. No caso do Bmp4, o grupo OVX3 foi o mais expresso aos 10 e 14 dias. Os genes osteoprotegerina e osteopontina variaram sua expressão de acordo com o período e grupo avaliado. A expressão de osterix foi similar entre os grupos aos 7 e 10 dias, enquanto a expressão de Bsp, aos 7 e 14 dias, mostrou semelhança entre os grupos controle e OVX1. Frente aos resultados obtidos, sugere-se que a concentração de 1mM de cafeína pareceu ser a menos prejudicial ao metabolismo das células osteoblásticas neste modelo experimental de osteoporose. / The most common cause of osteoporosis is the decrease of estrogen after menopause. This hormone regulates the production of cytokines that influence osteoclast proliferation, increasing bone resorption. The effects of caffeine in bone metabolism are controversial and may be associated to periodontal disease, bone fractures, increase of urinary calcium levels and reduction of mineral bone density due to inhibition of osteoblast activities. Thus, the goal of this investigation was to evaluate the in vitro effect of different caffeine concentrations in the metabolism of bone marrow osteoblastic cells from osteoporotic rats (OVX). After Ethical Committee approval, wistar female rats were divided in two experimental groups: control (C) and submitted to ovariectomy (OVX). After 60 days of surgery, femurs were removed to isolate bone marrow mesenchymal cells, which were induced to osteoblastic differentiation in osteogenic medium along with three different concentrations of caffeine (1, 3 and 5 mM - OVX1, OVX3 e OVX5 respectively) and posteriorly seeded in 24-well plates (n = 5) to evaluate cell proliferation, alkaline phosphatase activity and its in situ detection, detection and quantification of mineralized nodules as well as assess quantitative expression of genes associated to osteoblastic activity by means of real time PCR. All the experiments were performed in triplicate and analyzed by means of the statistical software GraphPad Prism for p<0.05. Cell proliferation was diminished in the all osteoporotic groups that received caffeine, with group OVX1 being the less affected. Biochemical assay of ALP activity did not show differences among the groups in the periods analyzed; nevertheless there was a tendency to a higher activity proportional to the higher concentration of caffeine. The in situ detection of ALP showed better results in group OVX1 after 14 days of culture. Mineralized matrix quantification was higher in OVX groups when compared to control group; among the concentrations, the higher quantification of calcium nodules was in group OVX1. The results obtained with PCR showed that the gene for ALP had its highest expression in OVX group, followed by OVX1 at 7 and 10 days; expression of osteocalcin was higher in OVX1 after 10 and 14 days and this same group presented higher expression in all periods for genes Runx2 e Rankl. Analysis of Bmp4 gene showed that it was expressed in group OVX3 after 10 and 14 days. The genes that code for osteoprotegerin and osteopontin had different expression values in accordance to the period and group evaluated. The expression of osterix was similar between the groups after 7 and 10 days, whereas the expression of Bsp was similar between control and OVX1 groups after 7 and 14 days. The results suggest that the concentration of 1mM of caffeine is the most beneficial to the metabolism of osteoblastic cells in a model of osteoporosis.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:55Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-11-20Bitstream added on 2014-06-13T21:01:35Z : No. of bitstreams: 1 daud_rd_dr_sjrp.pdf: 374546 bytes, checksum: 6286f38c9fc3dc578888faa92f95d070 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Através de experimentos de campo, laboratório e de casa de vegetação foi analisada a susceptibilidade de diferentes clones de seringueira ao ataque de Calacarus heveae Feres (Acari, Eriophyidae). Em campo foram estudadas a dinâmica populacional de ácaros fitófagos e sua influência na estrutura da comunidade de ácaros em seis clones da seringueira, em área pertencente a empresa Plantações Edouard Michelin, Itiquira, MT. Para isso, foram amostrados 10 folíolos de 10 diferentes plantas em seis parcelas clonais, num intervalo médio de 14 dias, no período de março de 2004 a março de 2005. Em experimentos realizados no Laboratório de Acarologia do Depto. de Zoologia e Botânica, UNESP, São José do Rio Preto, foram acompanhados o ciclo biológico, a reprodução e sobrevivência populacional de 20 indivíduos de C. heveae em folíolos destacados dos clones GT 1, PB 235 e RRIM 600. Os ensaios foram repetidos quatro vezes, sendo cada repetição realizada em período em que se registrou a ocorrência do ácaro no campo. Em ensaio realizado em casa de vegetação, no campus da UNESP, São José do Rio Preto, SP, foi verificada a influência do ataque de C. heveae nos processos fisiológicos foliares e na produção de látex em 9 e 11 mudas dos clones RRIM 600 e GT 1, respectivamente, com cinco meses de idade. Foi verificado que a abundância de cada espécie fitófaga diferiu entre os seis clones estudados e, consequentemente, exerceu influência na ocorrência e distribuição das espécies diretamente ou indiretamente relacionadas. Os clones mais susceptíveis ao ataque de C. heveae foram PB 260 e RRIM 600, enquanto os mais resistentes PB 235, PB 217 e GT 1. Em arenas confeccionadas com folíolos destacados, C. heveae apresentou rápido ciclo biológico e maior taxa reprodutiva... / The susceptibility of different rubber tree clones to the attack of Calacarus heveae Feres (Acari, Eriophyidae) was analyzed through field, laboratory and greenhouse essays. In the field essay, we studied the population dynamics of phytophagous mites and its influence on the mite community structure in six rubber trees clones, in a farm belonging to the Plantações Edouard Michelin, Itiquitira, MT. For that, 10 leaflets of 10 different plants were sampled from each of the six clonal plots, from March 2004 to March 2005. We observed in essays performed in the Laboratory of Acarology of Depto. Zoology and Botany, UNESP, São José do Rio Preto, the biological cycle, reproduction and population survivorship of 20 C. heveae individuals reared on detached leaflets of clones GT 1, PB 235 and RRIM 600. The essays were repeated four times, in the periods when C. heveae was more abundant in the field. For the greenhouse essay, performed in UNESP, São José do Rio Preto, SP, we verified the influence of C. heveae attack on physiological processes and on the latex yield in 9 and 11 five-months aged seedlings of the clones RRIM 600 and GT 1, respectively. The phytophagous species had different abundances on the six rubber tree clones and, consequently, influenced the occurrence and distribution of other mite species. The most susceptible clones to the attack of C. heveae were PB 260 and RRIM 600, while the most resistant were PB 235, PB 217 and GT 1. In the arenas made of detached leaflets, C. heveae had faster development, high reproductive rate and survivorship increase on PB 235 and RRIM 600. Probably, the different ages of the plants used in field and laboratory essays influenced the conflicting results in relation to PB 235 susceptibility to C. heveae. The C. heveae attack decreased the photosynthetic rate... (Complete abstract click electronic access below)

Maspina, proteína da família das serpinas, tem um único gene descrito, porém diversas funções biológicas foram observadas: modulação da adesão; inibição do crescimento, da angiogênese e da invasão tumoral; efeito pró-apoptótico entre outras. Está no núcleo, no citoplasma e na membrana plasmática. Tantas funções e localizações não podem ser justificadas apenas por sua estrutura primária. Maspina pode sofrer modificações pós-traducionais controlando sua atividade, localização subcelular e interações proteicas. Propôs-se assim, caracterizar a modificação de maspina pela adição de SUMO. Dois prováveis sítios de sumoilação, nas lisinas 47 e 277 e um provável motivo de interação com SUMO entre aminoácidos 156 e 159 foram encontrados pelos programas de predição SUMOplot, SUMOsp e GPS-SBM. A estrutura 3D de maspina dessas regiões mostra que são compatíveis e coerentes com sumoilação. Ensaio de imunoprecipitação sugere que maspina endógena é sumoilada na linhagem MCF-10A. Esses dados sugerem que sumoilação pode ser importante na regulação das funções biológicas de maspina. / Maspin, a protein from the serpin family, has only one gene described, but diverse biological functions observed: adhesion modulation; inhibition of growth, of angiogenesis and of tumoral invasion; pro-apoptotic effect and others. It is in the nucleus, the cytoplasm and the plasma membrane. Those many functions and localizations cant be justified only by its primary structure. Maspin could suffer posttranslational modifications controlling its activity, subcellular localization and protein interaction. So, we propose to characterize maspin modification by the addition of SUMO. Two possible sumoylation sites in lisines 47 and 277 and a possible SUMO interacting motif between amino acids 156 and 159 were found by prediction programs SUMOplot, SUMOsp and GPS-SBM. The 3D structure of maspin in those regions shows that they are compatible and coehrent with sumoylation. Immunoprecipitation assay suggests that endogenous maspin is sumoylated in MCF-10A cell line. This data suggest that sumoylation could be important in the regulation of maspin biological functions.

Orientador: Elizabeth Orika Ono / Banca: João Domingos Rodrigues / Banca: Valdir Zucareli / Banca: Nobuyo Narita / Banca: José Carlos Cavichioli / Resumo: Ao longo desse trabalho foram desenvolvidos três experimentos, onde objetivou-se estudar a atividade de enzimas antioxidantes e as trocas gasosas ao longo do processo de cicatrização em dois métodos de enxertia em mudas de maracujazeiro. Após esse período foi estudado o desenvolvimento e crescimento dessas mudas, assim como o comportamento do aparato fotossintético. Quando as mudas estavam adultas foi avaliado a campo o desempenho agronômico, assim como a qualidade dos frutos e o seu potencial antioxidante, assim como o desempenho do aparato fotossintético. Os tratamentos foram: plantas não enxertada de Passiflora edulis Sims, plantas enxertadas convencionalmente e plantas enxertadas com manutenção de dois sistemas radiculares, sendo o porta-enxerto utilizado a Passiflora gibertii. Com base nos resultados obtidos concluiu-se que a utilização de plantas enxertadas e com manutenção de dois sistemas radiculares proporcionou produtividade e qualidade de frutos semelhante ao das plantas não enxertadas. Essas plantas ao longo do processo de cicatrização apresentaram menor atividade de enzimas antioxidantes, assim como menor tempo para recuperação do aparato fotossintético, após o processo da enxertia. Após a cicatrização, todos os tratamentos apresentaram o mesmo comportamento fotossintético. / Abstract: Throughout this study, it was developed three experiments, which aimed to study the activity of antioxidant enzymes and gas exchange during the healing process in two grafting methods in passion fruit seedlings. After this period has been studied the development and growth of these seedlings, as well as the behavior of the photosynthetic apparatus. When the seedlings were grown, was rated the field agronomic performance, as well as fruit quality and their antioxidant potential, as well as the performance of the photosynthetic apparatus. The treatments were not grafted plants of Passiflora edulis Sims, conventionally grafted plants and grafted plants with maintaining two root systems, and the rootstock used to Passiflora gibertii. Based on the results obtained it was concluded that the use of grafted plants and maintaining two root systems provided yield and fruit quality equal to that of ungrafted plants. These plants throughout the healing process showed lower activity of antioxidant enzymes as well as shorter time for recovery of the photosynthetic apparatus. After healing, all treatments showed the same photosynthetic behavior. / Doutor

Orientador: Maurício Dutra Zanotto / Banca: Sérgio Gonçalves Dutra / Banca: Marcelo de Almeida Silva / Banca: Tiago Zoz / Banca: Leo Zimback / Resumo: O cártamo (Carthamus tinctorius L.) membro da família Asteraceae, atualmente é cultivado principalmente como planta oleaginosa. Pode ser utilizado como cultura de inverno em locais de temperaturas amenas e como cultura de primavera em locais de temperaturas mais baixas, apresenta boa adaptação em ambientes de clima mais seco. Atributos que podem torná-lo uma cultura de importante expressão no cerrado brasileiro, local o qual possui um longo período seco com temperaturas elevadas durante o inverno, dificultando o cultivo de outras espécies. Destaca-se como uma cultura estratégica, apresenta boa tolerância a estresse por déficit hídrico em especial no final de ciclo, além de características adequadas para mecanização facilitando o uso dos mesmos equipamentos utilizados nos demais cultivos como soja e milho. O objetivo deste trabalho é realizar um estudo genético para gerar informações aos programas de melhoramento genético. Foram avaliadas 10 combinações em dialelo completo sem recíprocos, em F1 e F2. Na geração F1 foram avaliadas as características de número de capítulos por planta, número de ramos por planta e produção de grãos por planta. Na geração F2 repetiram-se as avaliações realizadas em F1 acrescentando altura de planta, número de grãos por planta, número de grãos por capítulo e percentagem de óleo nos grãos. Após foi determinado a capacidade geral e específica de combinação e análise de correlação simples. As principais conclusões são: Os melhores cruzamento para pr... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Safflower (Carthamus tinctorius L.), a member of the Asteraceae family, it is currently cultivated mainly as an oilseed plant. It can be used as a winter crop in mild temperatures and as a spring crop in lower temperature. It is well adapted in drier climates. Attributes that can make it a crop of important expression in the Brazilian "Cerrado Area", a place that has a long dry period with high temperatures, making difficult the cultivation of other species. In this scenario the safflower is configured as a strategic crop that presents good stress tolerance due to water deficit, especially at the end of the season, besides characteristics suitable for mechanization, using the same equipment already used in other crops as corn and soybeans. The objective of this study is to perform a genetic study to provide information to breeding programs. We evaluated 10 combinations in complete diallel without reciprocal, in F1 and F2. In the F1 generation were evaluated: number of head per plant, number of branches per plant and seed production per plant. In the F2 generation the evaluations performed in F1 were repeated, and added plant height, number of seeds per plant, number of seeds per chapter and percentage of oil in the seeds. After general and specific combining ability were determined, also a simple correlation analysis was performed. The main conclusions are: The best crossing to seed production were PI537697/PI653152 e PI572450/PI653152 and to oil content were PI572450/PI572470 e PI572470/PI653152 ... / Doutor

Orientador: Lin Chau Ming / Banca: Natalia Hanazaki / Banca: Fatims Chechetto / Resumo: Neste trabalho pretende-se diagnosticar e analisar o manejo dos recursos vegetais hortícolas alimentares da agricultura tradicional da comunidade caiçara residente no interior e entorno do Parque Estadual da Serra do Mar (PESM)- Núcleo Picinguaba- situado no estado de São Paulo relacionando-os com a orientação e interferência na paisagem. Para tanto, busca-se, à luz da Etnoecologia Abrangente, por meio de ferramentas da Etnobotânica e da Antropologia, subsídio para a análise do modo de vida das populações considerando o uso e ocupação do solo assim como a inserção e importância de espécies alimentares, cultivadas e não-cultivadas, no dia-a-dia das pessoas. Foram obtidos dados em campo por meio da observação participante e com o uso de questionários e entrevistas estruturadas e semi-estruturadas. Utilizou-se o geopreocessamento a fim de se obter um mapa a partir de unidades de paisagem reconhecidas pelos agricultores correlacionando critérios êmicos de distinção da paisagem com aspectos fitossociológicos e de diversidade. Concluiu-se que o sistema de conhecimentos, crenças e sentimentos influenciam o manejo das espécies alimentares e das paisagens afetando diretamente a conservação e variabilidade de espécies de plantas e paisagens, ainda que haja pressão para substituições e impedimentos legais. A partir da argumentação de que é possível co-existir conservação de recursos naturais em locais onde habitam comunidades tradicionais tendo em vista seu modo de vida conservacionista, espera-se que este trabalho possa trazer contribuições para programas e políticas públicas de proteção às populações que têm sua cultura comprometida por restrições da legislação de uma UC e para conservação das espécies alimentares alvo do estudo / Abstract: This paper aims to diagnose and analyze the management of food plants resources of traditional agriculture of caiçara community resident in and around the Serra do Mar State Park (PESM) - Picinguaba situated in the state of São Paulo relating them to management and interference in the landscape . To do that, we seek the light of Comprehensive Ethnoecology, through tools of ethnobotany and anthropology, allowing the analysis of the way of life of the people considering the use and occupation as well as the inclusion and importance of food species, cultivated and non-cultivated, day-to-day lives. Field data were obtained through participant observation and the use of questionnaires and structured and semi-structured interviews. We used the geoprocessing in order to obtain a map from landscape units recognized by farmers correlating emic criterion for distinguishing the landscape with phytosociological and diversity aspects. We can conclude that the system of knowledge, beliefs and feelings influence the management of food plants species and landscapes directly affecting the conservation and variability of plant species and landscapes, although there is pressure to substitutions and legal impediments. From the argument that it is possible to co -exist conservation of natural resources in places with traditional communities considering their conservationist way of life, it is expected that this work will bring contributions to public programs and policies to protect the people who have their culture compromised by restrictions in the laws of a Conservation Unit (UC) and to the conservation of targeted food plants of this study / Mestre

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:23:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1451062 bytes, checksum: 39d55bd85f54e95a546d07249a16f7ab (MD5) Previous issue date: 2013-07-19 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The importance of coffee agriculture in Brazil is notorious, especially for the State of Minas Gerais, which is the Brazilian state that accounts for most of the national production. In the Southern region and in Zona da Mata they are concentrated most of the crops of the State; also, small holdings are predominant in the region and cultivation is done in mountain region, what makes it difficult mapping the crops by automated methods. The application of Artificial Neural Networks (ANNs), having as input variables Haralick s descriptors, has shown a promising approach for the discrimination of higher complexity classes. In this context, it aimed to develop a system to identify areas where coffee is cultivated using ANNs, having as input variables Haralick s descriptors. The studied area is located at the city of Araponga, where 59 fields were selected with coffee plantations for data collection. The software used for processing and sorting the images was MATLAB; and for evaluating the sorting performance, Arcgis was used. The methodology for the development of ANN consisted in two steps: in the first step, the ANN was trained with representative samples of each class of interest (coffee, forest, water, bare soil, and grassland, and urban area), thus verifying the potential to discriminate output classes; in the second step the objective was to classify the coffee plantations accordingly with the age. Kappa index was used for evaluating the performance of ANN; the usage of this coefficient is satisfactory for assessing the accuracy of a thematic class. Kappa index for discriminating the coffee region of the other class of interest was 65,18%, what can be considered a good index. To classify the coffee plantations accordingly with the age, Kappa index was variable (0.675 to 0.4783), being very good for the Itatiaia farm and reasonable to the Pedra Redonda farm. / A importância da cafeicultura para o Brasil é notória, em especial para o estado de Minas Gerais que é o estado brasileiro responsável pela maior parte da produção nacional. Nas regiões sul e da zona da mata onde estão concentradas a maior parte da lavoura no estado de Minas Gerias, há a predominância de pequenas propriedades e o cultivo é feito em região de montanha o que acaba dificultando o mapeamento por métodos automatizados. A aplicação de Redes Neurais Artificiais (RNAs) tendo como variáveis de entrada os descritores de Haralick tem se mostrado uma abordagem promissora na discriminação de classes de maior complexidade. Neste contexto objetivou-se desenvolver um sistema para identificar áreas cultivadas com café utilizando RNAs tendo como variáveis de entrada os descritores de Haralick. A área de estudo está localizada no município de Araponga, onde foram selecionados 59 talhões com plantios de café, sendo levantados dados relativos à idade e data de recepa. O software utilizado para o processamento e classificação da imagem foi o MATLAB, e para avaliar o desempenho da classificação foi o Arcgis. A metodologia para o desenvolvimento da RNA consistiu em duas etapas: na primeira a RNA foi treinada com amostras representativas de cada classe de interesse (café, mata, água, solo exposto e pastagem e área urbana), verificando assim o potencial em discriminar entre as classes de saída; na segunda etapa o objetivo foi classificar as plantações de café de acordo com a idade e com a data de recepa. Utilizou-se o índice Kappa para avaliar o desempenho da RNA, uma vez que o uso desse coeficiente é satisfatório na avaliação da precisão de uma classe temática. O índice Kappa para discriminar a região cafeeira das outras classes temáticas foi de 65,18%, o que pode ser considerado um índice bom. Para classificar os plantios de café em função da idade e data de recepa o índice Kappa foi variável (0,675 a 0,4783), sendo considerado muito bom para a fazenda Itatiaia e razoável para a fazenda Pedra Redonda.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:36:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 890349 bytes, checksum: 3a3c4b6898edfb8ec6ee997137629c1e (MD5) Previous issue date: 2009-03-20 / Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Plants acquired strategies I and II for iron absorption. Strategy I occurs in terrestrial plants and includes the reduction of iron in the ferric form (Fe+3) to ferrous form (Fe+2). Strategy II of iron absorption is present in grasses and is characterized by the release of phytosiderophores to the environment that chelate ferric iron. The grain filling process in cereals involves the transfer of assimilates directly from the xylem to the grain and also remobilization of assimilates from vegetative organs through the phloem. The aim of this work was to study the pattern of accumulated nutrients in seeds of rice genotypes cultivated in two regions of Brazil and to study the pattern and correlations among the nutrients accumulated in the grain. Moreover, it was verified the occurrence of transcripts homologous to rice (Oryza sativa) gene families known to be related to iron homeostasis in ESTs databases of Sorghum bicolor, Zea mays, Triticum aestivum and Saccharum officinalis and in a database containing only maize (Z. mays) endosperm ESTs. These analyses pointed to gene families that are functionally expressed in these species and specifically during the formation of the maize grain. For the analysis of accumulation of nutrients in the grain it was used ICP-MS and the data were subjected to statistical analysis: ANOVA, Pearson correlation and path analysis. The Pearson correlation results of accumulated nutrients in the grain do not demonstrated the direct and indirect effects of nutrients accumulated. On the other hand, the path analysis of these same data revealed a direct correlation of Fe with P, S and Ca in the experiment conducted in MG and direct correlation of Fe with P in the experiment conducted in the RS. The data of correlation between iron content in flag leaves and panicle of rice in different stages of development showed positive correlation. Moreover, the levels of Fe accumulated in the grain of the genotypes grown in MG were higher compared to those grown in RS. To verify the occurrence of homology, the amino acid sequences related to the rice transcripts were obtained from NCBI and KOME databases. The sequences of ESTs from other grass species were obtained from TIGR-Plant transcripts assemblies program and the maize endosperm database was obtained from NCBI. The genes were aligned using the program BLAST2 with TBLASTN tool with e-value of 1e-10 and minimal identity of 40%. It was found counterparts of the gene families studied in all species evaluated. The NAS gene family, related to phytosiderophores synthesis showed high conservation (about 70%) among Poaceae family members studied, except wheat and maize endosperm. The OsFER1 gene showed high conservation (80%) among all members of Poaceae. This suggests the importance of these gene families in the transport and accumulation of iron among the Poaceae species. It was found representatives from each one of the families IRT1, YSL and ZIP in maize endosperm which suggests that these genes may be functionally expressed during the formation of maize grain. / As plantas adquiriram estratégias I e II de absorção do ferro. A estratégia I ocorre em plantas terrestres e inclui a redução do ferro da forma férrica (Fe+3) para a forma ferrosa (Fe+2). A estratégia II de absorção de ferro está presente nas gramíneas e é caracterizada pela liberação de fitosiderósforos no ambiente que se complexam ao íon férrico. O processo de enchimento do grão em cereais envolve a transferência de assimilados diretamente do xilema para o grão e também a remobilização de assimilados de órgãos vegetativos, através do floema. O objetivo do presente trabalho foi estudar o padrão de nutrientes acumulados nas sementes de genótipos de arroz cultivados em duas regiões do Brasil e estudar o padrão e as correlações entre os nutrientes acumulados no grão. Além disso, foi verificada a ocorrência de transcritos homólogos a famílias gênicas de arroz (Oryza sativa) conhecidamente relacionadas com homeostase de ferro em bancos de ESTs de Sorghum bicolor, Zea mays, Triticum aestivum e Saccharum officinalis e em um banco contendo apenas ESTs de endosperma de milho (Z. mays). Estas análises permitiram prever quais famílias gênicas são funcionalmente expressas nestas espécies e especificamente durante a formação do grão de milho. Para as analises de acúmulo de nutrientes no grão foi utilizado o ICP-MS e os dados foram submetidos às analises estatísticas: ANOVA, correlação de Pearson e análise de trilha. Os resultados de correlação de Pearson dos nutrientes acumulados no grão não evidenciaram os efeitos diretos e indiretos dos nutrientes acumulados. Por outro lado a análise de trilha destes mesmos resultados demonstrou efeitos de correlação direta do Fe com P, S e Ca no experimento realizado em MG e correlação direta do Fe com P no experimento realizado no RS. Os dados de correlação entre teor de ferro acumulado nas folhas bandeiras de arroz e nas panículas nos diferentes estádios de desenvolvimento tiveram correlação positiva. Além disso, os teores de Fe acumulado no grão dos genótipos cultivados em MG foram superiores comparados aos cultivados no RS. Para verificar a ocorrência de homologia, as seqüências de aminoácidos referentes aos transcritos em arroz foram obtidas a partir do banco de dados NCBI e KOME. As seqüências de ESTs de banco de dados das espécies de gramíneas foram obtidas a partir do programa TIGRPlant transcripts assemblies e do banco de endosperma de milho foi obtido do NCBI. Os genes foram alinhados utilizando o programa BLAST2 com a ferramenta TBLASTN com e-value de 1e-10 e identidade mínima de 40%. Foram encontrados homólogos das famílias gênicas estudadas em todas as espécies avaliadas. A família gênica NAS, relacionada com a síntese de fitosideróforos, possui alta conservação (cerca 70%) entre os genes da família Poaceae estudada, com exceção do trigo e endosperma de milho. O gene OsFER1 apresentou alta conservação (cerca de 80%) entre todos os genes de Poaceae. Isto indica a importância dessas famílias gênicas no transporte e acúmulo de ferro entre as espécies de Poaceae. Foram encontradas representantes de cada uma das famílias IRT1, YSL e ZIP no endosperma de milho o que sugere que esses genes possam ser funcionalmente expressos durante a formação de grãos em milho.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2018-04-03T17:06:06Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2556158 bytes, checksum: 27b067863ed5da400bb343a3468852f4 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-03T17:06:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2556158 bytes, checksum: 27b067863ed5da400bb343a3468852f4 (MD5) Previous issue date: 2005-04-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Meloidogyne incognita é um nematóide endoparasita sedentário que induz a formação de galhas nas raízes das plantas suscetíveis. Em tomateiros com o gene Mi-1, as células próximas ao estilete dos juvenis de segundo estágio exibem reação de hipersensibilidade (HR) a partir de oito a doze horas após a inoculação. Esse trabalho objetivou identificar e caracterizar parcialmente genes envolvidos nas vias de transdução de sinais e nas respostas de defesa do tomateiro a Meloidogyne incógnita mediadas pelo gene Mi-1 utilizando a técnica de hibridização subtrativa seguida de amplificação por PCR (suppressive subtractive hybridization, SSH). A partir dos cultivares quase isogênicas de tomateiros Moneymaker (suscetível) e Motelle (resistente) inoculados com M. incognita foram construídas duas bibliotecas subtrativas enriquecidas para genes diferencialmente expressos na interação incompatível (MoI 24h e MoI 72h) e uma biblioteca para a interação compatível (MMI 24h). Foram seqüenciados 81 clones da biblioteca MoI 72h, 26 da MMI 24h e 620 da MoI 24h. As análises subseqüentes se concentraram nesta última porque as outras duas apresentaram elevada redundância ou muitos ESTs (Expressed Sequence Tags) com similaridade a genes não caracterizados. Na análise de expressão por macroarranjo, 126 (41%) entre os 307 clones não redundantes de cDNAs apresentaram expressão diferencial. A análise de Northern blot não apresentou sensibilidade suficiente para evidenciar diferenças nos níveis de expressão. Vinte e um genes foram submetidos à análise de expressão por PCR quantitativa e, entre estes, oito apresentaram indução duas horas após a inoculação. A classificação dos ESTs em categorias funcionais em potencial mostrou que 31% deles têm relação com resposta de resistência, resposta a patógenos, proteção à célula, sinalização celular ou a estresse abiótico. Os ESTs classificados como não caracterizados corresponderam a 26%. Entre os ESTs com similaridade a genes induzidos nessa interação relatados previamente, estão inibidores de proteases, quitinase, aquaporina, fenilalanina amônia liase, Ki1 e peroxidase. Entre os ESTs relacionados com defesa relatados em outros patossistemas estão os similares a genes que codificam para MAPK4, defensinas, proteínas de transferência de lipídios, PR10 e proteína 14-3-3. Os genes semelhantes a MtN19, D13F MYB ST1 e cinase dependente de cálcio parecem apresentar mais de uma cópia no genoma e os genes semelhantes a Myb1, gene relacionado à resposta de resistência, gene envolvido com a resistência sistêmica adquirida, Ki1 e a defensina parecem estar presentes em cópia única no genoma. Os transcritos dos genes correspondentes aos clones SSH08D08 (MtN19), SSH09A10 (peroxidase 10), SSH10H09 (semelhante a Ki1) e SSH09D04 (defensina) possuem cerca de 2,5 kb, 1,2 kb, 1,8 kb e 0,5 kb, respectivamente. A presença de muitos genes relacionados com defesa e a ausência de genes do patógeno na biblioteca demonstra que a subtração foi eficiente para enriquecer para genes diferencialmente expressos. A grande quantidade de genes identificados e parcialmente caracterizados fornece subsídios para o estudo funcional visando caracterizar as vias de respostas de defesa mediadas pelo gene Mi-1. / In the compatible interaction between tomato and root-knot nematode Meloidogyne incognita, galls are formed on the roots. The tomato gene Mi-1 confers resistance to M. incognita accompanied by a hypersensitive response. To elucidate the mechanisms underlying these interactions, three cDNA libraries enriched for transcripts differentially expressed in susceptible (MMI 24h) and in resistant (MoI 24h and MoI 72h) plants, respectively, were generated by suppressive subtractive hybridization (SSH). Twenty-six ESTs were generated from MMI 24h, 81 from MoI 72h and 620 from MoI 24h library. The library MoI 24 was further characterized because the first two were highly redundant or had many ESTs similar to unknown genes. The cDNA macroarray analysis of 307 nonredundant clones revealed that 126 (41%) corresponded to differentially expressed transcripts. Northern blot analysis did not show enough sensitivity to detect differential expression. Quantitative PCR was performed to investigate the expression patterns of 21 selected genes. Transcript accumulation occurred for eight out of the 21 genes two hours after M. incognita challenge in resistant plants. Classification of the ESTs into several putative functional categories showed that 31% of these ESTs represented genes involved in resistance response, pathogen and stress response, cell protection or signaling. Twenty-six percent of ESTs corresponded to genes with unknown functions. Among ESTs similar to genes known to be involved in plant- nematode interactions were trypsin-alpha amylase inhibitor, chitinase, aquaporin, phenylalanine ammonia-lyase, Ki1 and peroxidase. Among ESTs similar to genes reported in other pathosystems were MAPK4, defensins, lipid transfer proteins, PR10 and 14-3-3 proteins. The genes similar to MtN19, to D13F MYB ST1 and to calcium-dependent protein kinase 3 apparently are present in more than one copy in the tomato genome and the genes similar to Myb1, to disease resistance response protein, to systemic acquired resistance- related protein, to Ki1 and to plant defensin apparently have only one copy. The transcripts corresponding to SSH08D08 (MtN19), SSH09A10 (peroxidase 10), SSH10H09 (similar to Ki1) and SSH09D04 (plant defensin) clones have approximately 2,5 kb, 1,2 kb, 1,8 kb and 0,5 kb, respectively. The presence of various defense related genes and the absence of pathogen genes in the libraries give evidence of successfully subtraction for genes differentially expressed. The identification and partial characterization of these cDNAs will assist functional analysis aimed to elucidate the pathways activated by the Mi-1 gene.