Made available in DSpace on 2015-04-14T13:35:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 429244.pdf: 7848641 bytes, checksum: 61cb9e48ce85b1b1f7a5bc2b6e4b3be6 (MD5) Previous issue date: 2011-01-18 / Este trabalho teve como objetivo principal desenvolver e validar um prot?tipo de Ambiente Colaborativo em Medicina Nuclear em um teste piloto, com profissionais experientes da ?rea de Medicina Nuclear. Inicialmente, foram detectadas as premissas, restri??es e funcionalidades necess?rias para o desenvolvimento e implementa??o deste ambiente. Bancos de Imagens Cl?nicas, Experimentais e Simuladas foram desenvolvidos, al?m de um Banco de Documentos e um prot?tipo para realizar a submiss?o facilitada de simula??es pelo m?todo Monte Carlo atrav?s de processamento em cluster computacional hospedado no Laborat?rio de Alto Desempenho da PUCRS. O prot?tipo foi desenvolvido no ambiente Moodle, amplamente utilizado pela comunidade cient?fica e acad?mica e foi avaliado com uma amostra de quinze profissionais experientes que atuam efetivamente na ?rea de Medicina Nuclear em um teste piloto de intera??o. Foram realizadas an?lises descritivas da amostra, bem como an?lises quantitativas e qualitativas da opini?o dos usu?rios no intuito de promover a melhoria desse ambiente. O Ambiente Colaborativo em Medicina Nuclear teve boa aceita??o pela amostra do teste piloto e poder? ser aprimorado para a futura aplica??o na rotina dos profissionais que atuam em servi?os de Medicina Nuclear, universidades e em pesquisas nesta ?rea.

Submitted by Setor de Tratamento da Informa??o - BC/PUCRS (tede2@pucrs.br) on 2016-06-22T19:31:46Z No. of bitstreams: 1 DIS_PEDRO_COSTA_KLEIN_COMPLETO.pdf: 6980963 bytes, checksum: a6ac65c82ee1febce8c50b5771036f44 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-22T19:31:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DIS_PEDRO_COSTA_KLEIN_COMPLETO.pdf: 6980963 bytes, checksum: a6ac65c82ee1febce8c50b5771036f44 (MD5) Previous issue date: 2016-03-29 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / The white matter lesion detection is an important procedure for the diagnostic of Multiple Sclerosis in patients. As important as the detection, monitoring the progression of the disease, by calculating the volumes of the lesions, also shows itself necessary. In clinical practice, this procedure is done manually by a professional or, in many cases, only a qualitative analysis is made. The manual nature of this procedure implies in a series of deficiencies on the procedure, such as variations between diagnoses from different experts on the same subject and variation between diagnostics from the same expert to the same subject at distinct moments. Yet, the manual procedure shows itself time consuming, due the large amount of slices acquired by exam and the need for a careful analysis from the expert to quantify the lesions. In order to avoid these problems, automatic approaches for Multiple Sclerosis lesion detection and quantification using computer aided diagnostic systems are proposed. These methods, mostly, demand for the acquisition of an extra modality of magnetic resonance images, where the anatomy of the brain is evidenced, thus allowing the white matter lesion identification. This additional exam goes beyond the scope of the traditional clinical practice, which implies in additional costs and prevents the method of being applied to old exams, for monitoring the disease progression. This work proposes a method for automatic detection and segmentation of Multiple Sclerosis Lesions that uses only the modality of magnetic resonance exam adopted for clinical practice, using probabilistic atlases spatially aligned to the patient?s exams for identifying the brain structures. The results obtained through the usage of the method into a set of 24 patients and 6 healthy controls of different ages, showed that the developed method is capable of detecting white matter lesions with some precision. However, the quantification of these lesions was impaired mostly due divergences between the white matter probabilistic atlas and the real white matter region of the exams. / A detec??o de les?es de subst?ncia branca ? um procedimento importante para o diagn?stico da Esclerose M?ltipla em pacientes. T?o importante quanto a detec??o, o acompanhamento da progress?o da doen?a, por meio do c?lculo da volumetria destas les?es, tamb?m se mostra necess?rio. Na pr?tica cl?nica, este procedimento ? realizado manualmente por um profissional, ou em muitas vezes ? somente realizada uma an?lise qualitativa. O car?ter manual deste procedimento implica em uma s?rie de defici?ncias no procedimento como varia??es entre diagn?sticos de diferentes especialistas para um mesmo paciente e varia??es entre diagn?sticos de um mesmo especialista para um mesmo paciente em momentos distintos. Ainda, a tarefa manual mostra-se muito custosa em tempo, devido ao grande n?mero de fatias adquiridas por exame e a necessidade de uma an?lise cuidadosa do especialista para a quantifica??o das les?es. Com o intuito de evitar estes problemas, abordagens autom?ticas para detec??o e quantifica??o de les?es de Esclerose M?ltipla atrav?s do uso de sistemas de diagn?stico auxiliado por computador v?m sendo propostas. Estes m?todos autom?ticos, em sua maioria, demandam a aquisi??o de uma modalidade adicional de imagem de resson?ncia magn?tica, na qual ficam evidenciadas as estruturas anat?micas do c?rebro, permitindo assim a identifica??o de les?es em subst?ncia branca. Este exame adicional foge ao escopo tradicional da pr?tica cl?nica, o que implica em custos adicionais e impede que estes m?todos sejam aplicados em exames antigos, para acompanhamento da progress?o da doen?a. Este trabalho prop?e um m?todo para detec??o e segmenta??o autom?tica de les?es de Esclerose M?ltipla que utiliza apenas a modalidade de exame de resson?ncia magn?tica utilizada na pr?tica cl?nica, utilizando para identifica??o das estruturas cerebrais atlas probabil?sticos alinhados ao espa?o do paciente. Os resultados obtidos atrav?s do emprego do m?todo em um conjunto de 24 pacientes e 6 controles de diferentes faixas et?rias, mostram que o m?todo desenvolvido ? capaz de detectar les?es de subst?ncia branca com certa precis?o. Entretanto a quantifica??o destas les?es mostrou-se prejudicada principalmente por diverg?ncias entre o atlas probabil?stico de subst?ncia branca e a regi?o real de subst?ncia branca nos exames.

Made available in DSpace on 2016-04-28T14:58:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2006- Jose Claudio de Oliveira Flores.pdf: 1453977 bytes, checksum: 7b91cd274e1470123d15754dce1eb1c8 (MD5) Previous issue date: 2006-12-08 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / The objective of this research was to diagnose organic production in Rio de Janeiro State, through the analysis of the annual visit reports produced by ABIO (certification agency of Rio de Janeiro state) certification agents from 1999 through 2002. The research covered 239 visit reports, from 156 organic growers located at various areas of Rio de Janeiro State. All variables contained on the reports were transferred to computer worksheets. They were then, classified into one of the three axes: technological, environmental or social. Each variable was then divided into items, which were scored, according to its conformity to the organic production rules. Basic statistics were applied to the individual variables which were discussed individually. Then, all scores were standardized by subtracting from the average and dividing by the standard deviation and submitted to an ordination by the three axes - technological, environmental and social. This ordination enabled a group diagnosis of the variables belonging to the three axes. A classification of the growers was then performed, by the sum of the scores for each axis for each year. Most variables contained on the report fitted on the technological axis. The majority of growers used techniques permitted by the legislation; however, no distinction seemed to be made between the recommended and the restricted practices by the growers, since they were used indistinguishably by growers with different profiles and from different regions. The heterogeneity verified among different growers, was in part, a result of the different degrees of conversion into the organic system. There was no relation between time of experience by the grower, with the level of adoption of recommended or restricted practices. The environmental axis also showed a very heterogeneous scenario, with no clear trend towards the location, time of experience, or degree of adoption of technologies. Market issues were the main cause of both, motivation of farmers to enter organic production as well as the main concern for the future of their properties. / O objetivo deste trabalho foi o de diagnosticar a produ??o org?nica no Estado do Rio de Janeiro por meio da an?lise dos relat?rios anuais de vistoria da ABIO (Associa??o dos Produtores Biol?gicos do Estado do Rio de Janeiro) referentes aos anos de 1999 a 2002. A pesquisa considertou 239 relat?rios de vistoria, pertencentes a 156 unidades de produ??o, situadas em diferentes locais do Estado do Rio. Todas as informa??es contidas no relat?rios de vistoria, foram transformadas em vari?veis e transferidas para planilhas. Elas foram ent?o alocadas em um dos tr?s eixos: tecnol?gico, ambiental ou social. Cada vari?vel foi subdividida em items, que eram quantificados de acordo com sua conformidade com as normas vigentes sobre produ??o org?nica no Estado. Estat?stica b?sica foi aplicada ? vari?veis, que foram discutidos individualmente. Ent?o, todos os valores atribu?dos ? diferentes vari?veis foram ent?o padronizados pela diferen?a entre a m?dia , dividida pelo desvio padr?o. Esses valores foram ent?o ordenados de acordo com os tr?s eixos tecnol?gico, ambiental e social. Essa ordena??o permitiu um diagn?stico em grupo das vari?veis. Uma classifica??o dos produtores foi feita por meio da soma dos valores padronizados, para cada ano. A maioria das vari?veis contidas nos relat?rios, encaixou-se no eixo tecnol?gico. A maioria dos produtores usou pr?ticas permitidas pela legisla??o, no entanto, n?o parece ter havido distin??o entre uso de pr?ticas recomendadas e o de pr?ticas permitidas, mas restritas. Essas foram usadas indiscriminadamente por produtores com diferentes perfis e tempos de ado??o de pr?ticas org?nicas. A heterogeneidade verificada entre os produtores foi, em parte, resultado dos diferentes graus de convers?o para o sistema org?nico. N?o houve rela??o entre tempo de experi?ncia do produtor com o n?vel de ado??o das pr?ticas restritas ou recomendadas. O eixo ambiental tamb?m mostrou um cen?rio muito diverso sem nenhuma tend?ncia aparente no que diz respeito ?s praticas usadas, localiza??o da propriedade, ou outra vari?vel qualquer. Os aspectos de mercado parecem ter sido a principal causa/motiva??o dos produtores para entrar na agricultura org?nica e parece ser tamb?m a principal causa de apreens?o dos produtores

Made available in DSpace on 2016-04-28T20:17:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2007 - Antonia Regina Sessa da Silva.pdf: 384094 bytes, checksum: 91d2147f8402249dead112e338e89b66 (MD5) Previous issue date: 2007-03-30 / Brazil has currently the second bigger flock of equines of the world and the brazilian equines breeding plays an important role in the development of the sector of agribusiness. Among the infectious disease that affect the national equines breeding, the Equine infectious anemia (EIAV) has been shown of difficult control. The Equine infectious anemia is caused by a retrovirus, it has a worldwide distribution, and it is recognized as the most important disease of equines. The most common clinical signals in the acute phase, are anemia followed of jaundice in the mucosae, ventral oedema, mioglobinury, caquexy and, mainly, intermittent fever. Once it has no treatment, Ministry of Agriculture, Cattle and Supplying determines, through legal mechanisms, a politics of obligatory examination in credentialed laboratories, for the transport and commercialization of equines in the country. The examination is based on the test of Coggins, an immunodiffusion in agar gel (IDGA) of the serum of the animal tested against antigen of the EIAV. As the infection is lifetime, positive animals are euthanasiated by Veterinarians of the Ministry of Agriculture. Considering that precision of the results is critical, once that false positives animals could uselessly be sacrificed, and false negatives will be preserved as infection source, diverse problems may occur, appeared the interest of a systematic analysis of the reproducibility of kits and on possible sources of error. For this purpose, positive and negative sera, referred by the repetition of the tests for Coggins and ELISA, had been evaluated by IDGA comparatively with three kits of different manufacturers. In the experiments of reproducibility, it observed a great distinction in the quality of the precipitation line promoted for the positive sera in the tests. This phenomenon may be justified by the use of the conditions techniques legal, determined for would carry of the Ministry of Agriculture that is distinct of the recommendation of the analyzed manufacturers of two of kits. Exactly thus, the evaluation of the reproducibility of the results of kits with the referred sera showed high correlation. / O Brasil possui atualmente o segundo maior rebanho de eq??deos do mundo e a Eq?ideocultura Brasileira desempenha um importante papel no desenvolvimento do setor de agroneg?cios. Entre as doen?as infecciosas que afetam a eq?inocultura nacional, a Anemia Infecciosa dos Eq?inos (AIE) tem se mostrado de dif?cil controle. A AIE ? causada por um retrov?rus, apresenta uma distribui??o mundial, e ? reconhecida como a mais importante doen?a dos eq?inos. Entre os sinais cl?nicos mais comuns, na fase aguda da doen?a, encontram-se a anemia seguida de icter?cia nas mucosas, edema ventral, mioglobin?ria, caquexia e, principalmente, febre intermitente. Como n?o h? tratamento, Minist?rio da Agricultura, Pecu?ria e Abastecimento (MAPA) determina, atrav?s de mecanismo legais, uma pol?tica de exame obrigat?rio em laborat?rios credenciados, para o transporte e comercializa??o de eq??deos no Pa?s. O exame ? baseado na prova de Coggins, uma imunodifus?o em ?gar gel do soro do animal testado contra ant?geno do v?rus da AIE. Como a infec??o ? vital?cia, animais soropositivos s?o eutanasiados por M?dicos Veterin?rios do MAPA. Considerando que a precis?o dos resultados ? cr?tica, posto que animais falso positivos podem ser sacrificados inutilmente, e falso negativos preservados como fonte de infec??o, surgiu o interesse de um an?lise sistem?tica da reprodutibilidade dos kits e poss?veis fontes de erro no diagn?stico. Para esta finalidade, soros positivos e negativos, referenciados pela repeti??o dos testes de Coggins e ELISA, foram avaliados pela prova de IDGA, comparativamente com tr?s kits de diferentes fabricantes. Nos experimentos de reprodutibilidade, observou-se uma grande distin??o na qualidade da linha de precipita??o promovida pelos soros positivos nos testes nos diferentes kits. Este fen?meno pode ser justificado pela utiliza??o das condi??es t?cnicas legais, determinadas por portaria do MAPA, que s?o distintas das recomenda??es dos fabricantes de dois dos kits analisados. Mesmo assim, a avalia??o da reprodutibilidade dos resultados dos kits com os soros referenciados mostrou elevada correla??o.

Made available in DSpace on 2016-04-28T20:17:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2006-Ione Soares Ferreira Ginuino.pdf: 594140 bytes, checksum: 1524f0a5e00c7f5bb986fa9cebab4c20 (MD5) Previous issue date: 2006-03-24 / With the objective to determine frequency, age and sex influences, and risk factor associated to Blastocystis hominis in feces of housed dogs and cats from the Metropolitan Region of Rio de Janeiro, Brazil, 234 fecal samples were collected by convenience from 175 dogs and 59 cats. To the diagnostic of B. hominis in fecal samples, direct examination was used, but ferric-hematoxilin and Gomori s trichrome techniques were used in order to confirm this diagnostic. Width and length of the parasite found in fecal samples varied from 10.07 to 13.80, and 12.66 to 19.93 to dogs and cats respectively. With regards the frequency of B. hominis in housed animals, 23.42 of dogs, and 23.72% of cats were positives, independent of animal sex. Animal s age was the important factor to determine, mainly in dogs, the risk of B. hominis transmission in dwellings. / Com o objetivo de determinar a morfologia, freq??ncia, influ?ncia da idade e sexo, e fatores de risco associados ? Blastocystis hominis nas fezes de c?es e gatos domiciliados na Regi?o Metropolitana do Rio de Janeiro, foram coletadas amostras fecais por conveni?ncia de 175 c?es e 59 gatos. Para o diagn?stico de B. hominis, foi utilizado o exame direto, e para confirma??o do diagn?stico foram usadas ?s t?cnicas de colora??o da hematoxilina f?rrica e tricr?mio de Gomori. A largura e o comprimento de B. hominis encontrado nas amostras fecais variaram de 10,07 a 13,80μm, e 12,66 a 19,93μm para c?es e gatos respectivamente. Quanto ? freq??ncia de B. hominis nos animais domiciliados, 23,42% dos c?es, e 23,72% dos gatos foram positivos, independente do sexo. A idade dos animais foi um importante fator para determinar, principalmente nos c?es domiciliados, o risco de transmiss?o de B. hominis.

Submitted by Sandra Pereira (srpereira@ufrrj.br) on 2016-08-05T14:19:01Z No. of bitstreams: 1 2010 - Raquel Saucier Gomes.pdf: 7033294 bytes, checksum: d1538edd22d0ad5fcbf8c9c1e86f330e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-05T14:19:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2010 - Raquel Saucier Gomes.pdf: 7033294 bytes, checksum: d1538edd22d0ad5fcbf8c9c1e86f330e (MD5) Previous issue date: 2010-02-09 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico, CNPq. / This study aimed to diagnose and characterize genetically the species and genotypes of Cryptosporidium in stool samples from poultry and exotic birds marketed in Rio de Janeiro involving possible risk factors for infection. We analyzed 180 poultry sold in local markets and 103 exotic birds from breeding and pet shops. For analysis, the DNA extracted from fecal sample suspension was used to amplify the 18S rDNA sequences by nested-PCR technique. The amplicons generated were subjected to RFLP using the enzymes SspI and VspI, and sequencing and phylogenetic analysis, to confirm the species. Different species of Cryptosporidium were indentified in faecal samples of poultry and exotic birds. In the analysis of sites of enzymatic cutting products of nested-PCR gene 18SR DNA, the species C. bailey was the only one that displayed a characteristic cut-off, but other samples were. The following species were diagnosed: C. baileyi (GU082387) infecting ducks (Anas platyrhynchus domesticus), C. parvum in quails (Coturnix japonica) (GU082384 and GU082386), chicks (Gallus gallus domesticus) (GU082390 and GU082391), duck (GU082388) and Manon (Lonchura striata domestica) (GU074390). The Avian genotype III was identified in caulker (Lonchura padda oryzivora) (GUO74384) and cockatiel (Nymphicus hollandicus) (GU074385, GU074386 and GU074387). The sequences of canaries (Serinus canarius) received access numbers GU074388 and GU074389, but it was not possible to identify the species of Cryptosporidium, because of the large genetic distance between them and those already deposited in GenBank, suggesting a new genotype or a new specie. Although C. baileyi and Avian genotype III are common in birds, the diagnosis of C. parvum is a worrying finding, since this species are more associated with mammals. Birds can be considered as reservoirs and disseminators of environmental infective form of the parasite, allowing the infection to a large number of species of hosts, including in the man in the epidemiological chain. / O presente trabalho teve por objetivo diagnosticar e caracterizar geneticamente esp?cies e/ou gen?tipos de Cryptosporidium em amostras fecais de aves dom?sticas e ex?ticas comercializadas no Estado do Rio de Janeiro, associando poss?veis fatores de risco da infec??o. Foram analisadas 180 aves dom?sticas comercializadas em mercados locais e 103 aves ex?ticas de criadouros e petshops. Para as an?lises, o DNA extra?do de suspens?o de amostra fecal foi utilizado na amplifica??o das seq??ncias do 18S rDNA atrav?s da t?cnica Nested-PCR. Os amplicons gerados foram submetidos ? RFLP, utilizando as enzimas SspI e VspI, e ao seq??nciamento, para a confirma??o das esp?cies. Foram identificadas esp?cies de Cryptosporidium em amostras fecais de aves dom?sticas e ex?ticas. Durante as an?lises dos s?tios de corte enzim?tico dos produtos da Nested-PCR do gene 18Sr DNA, a esp?cie C. baileyi foi a ?nica que apresentou padr?o de corte caracter?stico, por?m nas demais amostras foi necess?ria a confirma??o atrav?s do sequenciamento e estudo filogen?tico. Foi diagnosticado C. baileyi (GU082387) infectando patos (Anas platyrhynchus domesticus); C. parvum em codornas (Coturnix coturnix japonica) (GU082384 e GU082386), pintos (Gallus gallus domesticus) (GU082390 e GU082391), pato (GU082388) e manon (Lonchura striata domestica) (GU074390). O gen?tipo avi?rio III foi identificado pela primeira vez em calafate (Lonchura padda oryzivora) (GUO74384) e em calopsita (Nymphicus hollandicus) (GU074385, GU074386 e GU074387). As seq??ncias de can?rios (Serinus canarius) receberam os n?meros de acesso GU074388 e GU074389, por?m n?o foi poss?vel a identifica??o da esp?cie de Cryptosporidium, devido ? grande dist?ncia gen?tica entre elas e aquelas j? depositadas no GenBank, sugerindo novo gen?tipo ou uma nova esp?cie . Embora C. baileyi e o gen?tipo Avi?rio III sejam comuns em aves, o diagn?stico de C. parvum ? um achado preocupante, j? que esta esp?cie est? mais associada com mam?feros. Aves podem ser consideradas como reservat?rios e disseminadoras ambientais da forma infectante do protozo?rio, possibilitando a infec??o para um amplo n?mero de esp?cie de hospedeiros incluindo, nesta cadeia epidemiol?gica, o ser humano.

Submitted by Celso Magalhaes (celsomagalhaes@ufrrj.br) on 2017-10-19T13:49:16Z No. of bitstreams: 1 2016 - Claudia Bezerra da Silva.pdf: 8032175 bytes, checksum: ef71dd2a0e7801e9000e116c822a3a00 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-19T13:49:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016 - Claudia Bezerra da Silva.pdf: 8032175 bytes, checksum: ef71dd2a0e7801e9000e116c822a3a00 (MD5) Previous issue date: 2016-03-11 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / and investigate the circulation of this agent in dogs in the Itaguai microregion, Rio de Janeiro, Brazil, and dogs and ticks in two provinces of the island of Cuba, analyzing epidemiological aspects associated with infections caused by this bacterium in dogs. A new real-time polymerase chain reaction method (qPCR) was patterned to target the citrate synthase gene (gltA) for the identification of A. platys in naturally infected dogs. The primers and probe were designed to amplify a fragment of 84 base pairs based on gltA gene sequences of A. platys available in GenBank. 186 blood samples of dogs from Itaguai microregion, Rio de Janeiro, Brazil, were tested by qPCR. The same samples were tested by cytology and nested polymerase chain reaction (nPCR, 16S rDNA) to determine the performance of qPCR front of these techniques. 17.20% of the samples tested positive by qPCR were significantly more than that detected by nPCR (13.98%). The qPCR technique was more specific than cytology, due to false-positive results obtained by optical microscopy. The prevalence of A. platys in dogs from Itaguai microregion was 14.4%. Dogs less than six months, infested by ticks, that spend the most of the time restrict to domestic environment and without shelter are factors associated with infection by this hemoparasite in dogs in the study area. During research, A. platys held in Cuba, 100 blood samples were collected from residents dogs in four cities located in the provinces of Havana and Mayabeque. When inspecting the animals, found ticks were collected, identified and carefully grouped, forming a total of 49 pools. DNA extracted from blood samples from dogs and ticks were subjected nPCR (16S rDNA). Positive samples in nPCR were also subjected to conventional PCR (gltA gene), and the products were sequenced. Only the species Rhipicephalus sanguineus sensu lato was found in Cuban dogs and 10.2% (n=5/49) of these ticks added to 16.0% (n=16/100) dogs were considered positive for A. platys. All sequences analyzed of the gltA and 16S rDNA genes, respectively, showed a 99-100% identity with sequences from A. platys reported in other countries. Phylogenetic analysis showed two clusters defined for the 16S rDNA gene and three clusters defined for the gltA gene. Based on the gltA gene, the deduced amino acid sequence showed two points of non-synonymous mutations at positions 88 and 168 compared to the reference sequence DQ525687. A preliminary study on the epidemiological aspects associated with infection with A. platys showed no statistical association with the variables studied (p> 0.05). This study also to report the first evidence of A. platys in both dogs and ticks in Cuba also presents for the first time the development of a new qPCR method that contributes to the advancement of research involving A. platys. The epidemiological study in Brazil allowed us to identify significant factors in the occurrence of canine anaplasmosis, while in Cuba, it can be concluded that more research is needed to assess what the deciding factors in the transmission and spread of A. platys in that country. / platys, e investigar a circula??o deste agente em c?es na microrregi?o de Itagua?, Rio de Janeiro, Brasil, e c?es e carrapatos em duas prov?ncias da ilha de Cuba, analisando aspectos epidemiol?gicos associados ? infec??o causada por esta bact?ria em c?es. Um novo m?todo de rea??o em cadeia da polimerase em tempo real (qPCR) foi padronizado com alvo no gene citrato sintase (gltA) para a identifica??o de A. platys em c?es naturalmente infectados. Os oligoiniciadores e a sonda foram desenhados para amplificar um fragmento de 84 pares de base baseado em sequ?ncias do gene gltA de A. platys dispon?veis no GenBank. 186 amostras de sangue de c?es da microrregi?o de Itagua?, Rio de Janeiro, Brasil, foram testados pela qPCR. As mesmas amostras foram testadas pela citologia e rea??o em cadeia da polimerase nested (nPCR, 16S rDNA) para determinar o desempenho da qPCR frente ? essas t?cnicas. 17,20% das amostras testadas pela qPCR foram positivas, significativamente mais do que detectado pela nPCR (13,98%). A t?cnica de qPCR foi mais espec?fica que a citologia, em virtude dos resultados falsopositivos obtidos pela microscopia ?ptica. A preval?ncia de A. platys em c?es da microrregi?o de Itagua? foi de 14,4%. C?es com menos de seis meses, infestados por carrapatos, que possam maior tempo restrito ao ambiente dom?stico e sem abrigo s?o fatores associados a infec??o por este hemoparasito em c?es na regi?o do estudo. Durante investiga??o de A. platys realizada em Cuba, 100 amostras de sangue foram coletadas de c?es residentes em quatro cidades localizadas nas prov?ncias de Habana e Mayabeque. Ao inspecionar os animais, carrapatos encontrados foram coletados, identificados e criteriosamente agrupados, formando um total de 49 pools. Amostras de DNA extra?das do sangue dos c?es e de carrapatos foram submetidas a nPCR (16S rDNA). Amostras positivas na nPCR foram tamb?m submetidas a PCR convencional (gene gltA), e os produtos foram sequenciados. Somente a esp?cie Rhipicephalus sanguineus sensu lato foi encontrada em c?es cubanos, e 10,2% (n=5/49) desses carrapatos somado aos 16,0% (n=16/100) de c?es foram considerados positivos para A. platys. Todas as sequ?ncias analisadas dos genes gltA e 16S rDNA, respectivamente, mostraram uma identidade de 99-100% com sequ?ncias de A. platys reportadas em outros pa?ses. A an?lise filogen?tica mostrou dois clusters definidos para o gene 16S rDNA e tr?s clusters definidos para o gene gltA. Com base no gene gltA, a sequ?ncia de amino?cidos deduzidos demonstrou dois pontos de muta??es n?o-sin?nimas nas posi??es 88 e 168 comparados com sequ?ncia de refer?ncia DQ525687. Um estudo preliminar sobre os aspectos epidemiol?gicos associados com a infec??o por A. platys demonstrou nenhuma associa??o estat?stica com as vari?veis avaliadas (p > 0,05). O presente estudo al?m de relatar a primeira evid?ncia de A. platys em ambos c?es e carrapatos em Cuba, tamb?m apresenta pela primeira vez o desenvolvimento de um novo m?todo de qPCR que contribui para o avan?o da pesquisa envolvendo A. platys. O estudo epidemiol?gico realizado no Brasil permitiu identificar fatores importantes na ocorr?ncia da anaplasmose canina, enquanto em Cuba, pode-se concluir que mais investiga??es s?o necess?rias para avaliar quais os fatores decisivos na transmiss?o e dispers?o de A. platys nesse pa?s.

Submitted by Celso Magalhaes (celsomagalhaes@ufrrj.br) on 2017-11-07T13:04:43Z No. of bitstreams: 1 2016 - Paula de Carvalho Machado Araujo.pdf: 2347237 bytes, checksum: 44b7c9cb3df1557a677fc89555c2a535 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-07T13:04:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016 - Paula de Carvalho Machado Araujo.pdf: 2347237 bytes, checksum: 44b7c9cb3df1557a677fc89555c2a535 (MD5) Previous issue date: 2016-04-28 / This study was conducted in the Aman? Lake and Paran? region of the Aman? Sustainable Development Reserve located in the middle Solim?es region, state of Amazonas, Brazil. Research was done in three phases: the first used an adapted Free List method with 13 ranchers from the region. Subsequently, botanical specimens of species cited by at least three farmers were collected; photographic registers of these plants were also taken. Photographs were used in the next phase of research to inform a questionnaire applied to the same 13 farmers; the instrument used the Semantic Differentiation method, of 7 points, to understand ranchers? perceptions of the diverse characteristics of selected plants. The main objective of this study was to evaluate the perception of ranchers in relation to the origin, environment, and characteristics of plants that are part the of cow and water buffalo diet; and to further understand the cultural relevance, feed potential, and ecological function of these plants, comparing farmers? perceptions with findings from the scientific literature. In total 84 plant names were compiled, with 29 evaluated in this project / Este trabalho teve como ?rea de estudo o Lago e Paran? do Aman?, na Reserva de Desenvolvimento Sustent?vel Aman?, localizada na regi?o do M?dio Solim?es, no estado do Amazonas. Foram realizadas tr?s etapas da pesquisa: na primeira, utilizou-se uma adapta??o do m?todo de Lista Livre junto a 13 criadores da regi?o. Em seguida, foi realizada coleta bot?nica das esp?cies citadas por pelo menos 3 criadores, obtendo ainda registro fotogr?fico das mesmas. Estas fotos foram utilizadas na etapa seguinte a fim de ilustrar um question?rio com os mesmos 13 criadores onde utilizou-se o m?todo de Diferencial Sem?ntico de 7 pontos para conhecer as percep??es dos criadores sobre diversas caracter?sticas das plantas selecionadas. Este trabalho teve por objetivo principal avaliar a percep??o dos criadores da regi?o em rela??o ? origem, ambiente e caracter?sticas das plantas que fazem parte da dieta de bovinos e bubalinos, tentando compreender a relev?ncia cultural, o potencial forrageiro e as fun??es ecol?gicas das mesmas atrav?s das percep??es e dos achados de literatura. No total foram contabilizados 84 nomes diferentes de plantas, tendo sido avaliadas 29 plantas

Submitted by Jorge Silva (jorgelmsilva@ufrrj.br) on 2018-08-28T19:02:05Z No. of bitstreams: 1 2017 - Marcus Andr? Ferreira S?.pdf: 1043888 bytes, checksum: 7a3d94bc8171597abb3f0dde51169347 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-28T19:02:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2017 - Marcus Andr? Ferreira S?.pdf: 1043888 bytes, checksum: 7a3d94bc8171597abb3f0dde51169347 (MD5) Previous issue date: 2017-08-23 / Objectives of this study were to characterize the endometrial vascular perfusion of mares with bacterial endometritis using color Doppler ultrasonography and submitted to phytotherapeutic treatment. 19 crossbred and Mangalarga Marchador mares without endometritis were used. ImageJ 1.46r? was applied to evaluate the images. Additionally, subjective vascular uterine perfusion was estimated analyzing the percentage of color Doppler signals present in the mesometrial, myometrium and endometrium, in longitudinal section of the uterine body and transverse section of the uterine horns. Step 1. The mares (n=20) were submitted to intrauterine inoculation with Escherichia coli cepa from the equine uterus. The color Doppler ultrasound sessions were performed in M0 (moment immediately prior to intrauterine inoculation) and M1 (24 hours after intrauterine inoculation). Step 2. The animals were divided into two groups: control group (n=10) and treated group (n=10) using phytotherapic solution Fitoclean? (Organnact Animal Health, Curitiba, Paran?, Brazil). Both groups, color Doppler ultrasonography was performed at time T1 (immediately before starting treatment), T2 (24h after treatment) and T3 (48h after treatment). Step 3. Mares in which pathogens were identified in the samples collected during stage 2 were submitted to antibiotic therapy by intrauterine infusion using Gentamicin. Seven days after the antibiotic therapy, a new color Doppler ultrasound examination was performed. For statistical analysis, the Tukey test, t Student and Anova test was applied to compare the means obtained in the different periods and Chi Square were apllied to evaluation of phytoterapic effect. Step 1. It was found that the mean values of vascularization were no moment (P<0.05). Bacterial growth was observed in all samples collected. Step 2. The mean value of vascularization at time T1 in both groups was significantly higher (P<0.05) than the obtained at moments 2 and 3. At the time T1, we observed a significant increase in portion 1, while T2 showed a significant decreasing in this portion. Step 3. According to the results obtained in the culture and antibiogram examinations performed during the step 2, 13 mares (65%, 13/20) were submitted to antibiotic therapy through intrauterine infusion with Gentamicin. After that treatment, the vascularization observed decreased related to M1. With these results, we can conclude that in these conditions is possible the use of color Doppler ultrasonography as a method for bacterial endometritis; It was not possible to correlate results obtained by color Doppler ultrasonography with the traditional findings for the diagnosis of endometritis. / Os objetivos do presente estudo foram caracterizar atrav?s da ultrassonografia color Doppler a perfus?o vascular endometrial de ?guas com endometrite bacteriana e submetidas a tratamento fitoter?pico. Para tanto, foram utilizadas 20 ?guas mesti?a e Mangalarga Marchador livres de endometrite. O programa ImageJ 1.46r? foi utilizado para avalia??o das imagens. Adicionalmente, a perfus?o vascular subjetiva do ?tero foi estimada levando-se em considera??o o percentual de sinais Doppler coloridos presentes no mesom?trio, miom?trio e endom?trio, em corte longitudinal do corpo uterino e transversal dos cornos uterinos. Etapa 1. Todas as ?guas (n=20) foram submetidas a inocula??o intrauterina com cepa de Escherichia coli proveniente de ?tero equino. As sess?es de ultrassonografia color Doppler foram realizadas em M0 (momento imediatamente anterior ? inocula??o intrauterina) e M1 (24 horas ap?s a inocula??o intrauterina). Etapa 2. Os animais foram divididos aleatoriamente em dois grupos: grupo experimental 1 (n=10) e grupo experimental 2 (n=10) com solu??o fitoter?pica Fitoclean? (Organnact Sa?de Animal, Curitiba, Paran?, Brasil). Em ambos os grupos, os exames de cultura uterina, antibiograma, citologia endometrial e ultrassonografia modo B e color Doppler foram realizados nos momentos T1 (imediatamente antes de iniciar o tratamento), T2 (24h ap?s o tratamento) e T3 (48h ap?s o tratamento). Etapa 3. As ?guas em que foram identificados agentes patog?nicos nas amostras coletadas durante a etapa 2, foram submetidas ? antibioticoterapia por infus?o intrauterina utilizando Gentamicina. Sete dias ap?s a realiza??o da antibioticoterapia, foi realizado novos exame de ultrassonografia color Doppler. Para an?lise estat?stica, foi aplicado o teste de Tukey, teste t de Student e Anova para compara??o das m?dias obtidas nos diferentes per?odos e Qui Quadrado para avalia??o do efeito do fitoter?pico. Etapa 1. Verificou-se que os valores m?dios de vasculariza??o no momento M1 foram significativamente superiores aos obtidos em M0 para as tr?s partes do ?tero (P<0,05). Houve crescimento bacteriano em todas as amostras coletadas. Etapa 2. O valor m?dio de vasculariza??o no momento T1 em ambos os grupos foi significativamente superior (P<0,05) aos obtidos nos momentos 2 e 3. No momento T1, observou-se aumento significativo no segmento 1, enquanto que em T2 observou-se uma redu??o significativa neste segmento. Etapa 3. De acordo com os resultados obtidos nos exames de cultura e antibiograma realizados ap?s o t?rmino da etapa 2, 13 ?guas (65%, 13/20) foram submetidas a antibioticoterapia atrav?s de infus?o intrauterina com Gentamicina. Ap?s este tratamento, a vasculariza??o observada apresentou grande redu??o em compara??o ao momento M1. Diante destes resultados, concluiu-se que nas condi??es deste estudo foi poss?vel utilizar a ultrassonografia modo Color Doppler como m?todo diagn?stico para a endometrite bacteriana; n?o foi poss?vel correlacionar resultados obtidos atrav?s da ultrassonografia color Doppler com os achado nos exames tradicionais para diagn?stico da endometrite.

Made available in DSpace on 2014-12-17T14:07:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 JulioCPB_TESE.pdf: 3654750 bytes, checksum: 7f67c8015c3dc4175f16964a07eacd69 (MD5) Previous issue date: 2011-04-29 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / Plasma diagnostics by Optical Emission Spectroscopy were performed for electrical discharge in three gas mixture respecting the combinations z N2 y Ar x H2, z N2 y Ar x O2 e z N2 y Ar x CH4, in which the indexes z and y systematically vary from 1 to 4 and x varies from 0 to 4, every one has dimension SCCM, resulting in 80 combinations. From the all obtained spectrums, the species CH (387,1 nm), N2+ (391,4 nm), H&#946; (486,1 nm), H&#945; (656,3 nm), Ar (750,4 nm), O (777,4 nm) e O (842,6 nm) were analyzed because of their abundance and importance on the kinetic of reaction from the plasma to surface, besides their high dependences on the gases flows. Particularly interesting z, y and x combinations were chosen in order to study the influence of active species on the surface modification during the thermochemical treatment. From the mixtures N2 Ar O2 e N2 Ar CH4 were chosen three peculiar proportions which presented luminous intensity profile with unexpected maximum or minimum values, denominated as plasma anomaly. Those plasma concentrations were utilized as atmosphere of titanium treatment maintaining constant the control parameters pressure and temperature. It has been verified a relation among luminous intensity associated to N2+ and roughness, nanohardness and O atoms diffusion into the crystalline lattice of treated titanium and it has been seen which those properties becomes more intense precisely in the higher points found in the optical profile associated to the N2+ specie. Those parameters were verified for the mixture which involved O2 gas. For the mixture which involves CH4 gas, the relation was determinate by roughness, number of nitrogen and carbon atoms diffused into the titanium structure which presented direct proportionality with the luminous intensity referent to the N2+ and CH. It has been yet studied the formation of TiCN phases on the surface which presented to be essentially directly proportional to the increasing of the CH specie and inversely proportional to the increasing of the specie N2+ / Diagn?sticos de plasma por Espectroscopia de Emiss?o ?ptica foram realizados para descarga el?trica em tr?s misturas gasosas, dentro das seguintes combina??es: z N2 y Ar x H2, z N2 y Ar x O2 e z N2 y Ar x CH4, com os ?ndices z e y variando sistematicamente de 1 a 4 e x de 0 a 4, todos com dimens?o de SCCM, resultando em 80 combina??es. Dos espectros obtidos, foram analisadas as esp?cies CH (387,1 nm), N2+ (391,4 nm), H&#946; (486,1 nm), H&#945; (656,3 nm), Ar (750,4 nm), O (777,4 nm) e O (842,6 nm) por serem mais abundantes e importantes na cin?tica de rea??o do plasma ? superf?cie, al?m de suas altas depend?ncias dos fluxos de g?s. Foram escolhidas combina??es z, y e x, particularmente interessantes para estudar a influ?ncia das esp?cies ativas na modifica??o da superf?cie durante o tratamento termoqu?mico. Das misturas N2 Ar O2 e N2 Ar CH4 foram escolhidas tr?s propor??es peculiares que apresentavam perfis de intensidade luminescente com m?ximos ou m?nimos inesperados classificados aqui como anomalias de plasma. Essas concentra??es de plasma foram utilizadas como atmosfera de tratamento de amostras de tit?nio, mantendo-se constante os par?metros press?o e temperatura. Verificou-se rela??o entre intensidade luminosa associada ? esp?cie N2+ e a rugosidade, nanodureza e a difus?o do oxig?nio na rede cristalina do tit?nio tratado e viu-se que essas propriedades se intensificam precisamente nos pontos de m?ximo encontrados no perfil ?ptico dessa esp?cie. Esses par?metros foram verificados para mistura que envolvia o g?s O2. Para a mistura em que se fez presente o g?s CH4, a rela??o foi determinada por meio da rugosidade, n?mero de ?tomos de nitrog?nio e carbono difundidos no tit?nio, que apresentou proporcionalidade direta com a intensidade luminosa referente ?s esp?cies N2+ e CH. Ainda foi estudada a forma??o de fases TiCN na sua superf?cie, que essencialmente se mostra diretamente proporcional ao crescimento da esp?cie CH e inversamente proporcional ao crescimento da esp?cie N2+