Made available in DSpace on 2014-12-17T15:03:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 KleitonCN_DISSERT.pdf: 3918645 bytes, checksum: fd0ad2d9340e0d6860f2ffe24703f4ce (MD5) Previous issue date: 2009-12-22 / Through out the course of a steady increase in search and recovery of space in the coastal zone, there is also an expanding concern about the erosion processes of this area. The main problem in coastal areas is that urbanization occurs in a disorderly fashion and unsustainable, further aggravating the problems of coastal dynamics. The study area of this work is located on the southern coast of Pirangi do Norte beach to about 20km south of Natal, capital of Rio Grande do Norte in the Parnamirim City. This area has the length of approximately 1km, divided into three sections (Western, Central and Eastern) with a morphology consisting of a tableland at the top, sea cliffs in the West and Central parts and sand dunes in the Eastern section, both vegetated, and a coastal plain on the inferior part associated with the presence of beach rocks. This study aimed to analyze the erosion processes operating in the excerpt of Pirangi do Norte beach and assess the feasibility of their monitoring making use of DGPS (Global Positioning System Differential mode). During the work it was carried out a physical description of the area through photo-interpretation and site survey after measurement of the shoreline in the period between November 2004 and November 2009 and beach profiles between August 2005 and July 2006. The analysis of the results of the annual surveys showed the occurrence of variations of the shoreline along the stretch traveled. Sites are identified in advancement coast from the sea and it was verified in loco the presence of erosion with deposition of materials on the lower part of the coastal bluff, the former position of the shoreline, showing a false notion of advancing it. This leads to the conclusion that the data collected in a survey of the shoreline should always be accompanied by photographic records of the local area and with the highest rate of erosion, thus avoiding the mistake of treating the deposit materials as evidence of progress coast. At the end of the study, after a review of various works to mitigate the erosion in the coastal zone, it is recommended to the area of study the adoption of an artificial feeding of the beach, aiming the minimization of the erosive effects of the tides. Moreover, it is suggested that even the continuity of monitoring, maintenance of existing vegetation and control of the occupation on the edge of sea cliffs / Em meio a um cont?nuo aumento da busca e valoriza??o do espa?o na zona costeira, cresce tamb?m a preocupa??o sobre os processos erosivos caracter?sticos desta ?rea. O maior problema nas zonas litor?neas ? que a urbaniza??o ocorre de forma desordenada e insustent?vel, agravando ainda mais os problemas decorrentes da din?mica costeira. A ?rea de estudo deste trabalho est? localizada no litoral Sul do Estado na praia de Pirangi do Norte, ? aproximadamente 20km ao Sul de Natal, capital do Rio Grande do Norte, no munic?pio de Parnamirim. Essa ?rea possui uma extens?o aproximada de 1km dividida em tr?s trechos (Oeste, Central e Leste) com morfologia formada por tabuleiro costeiro na parte superior, fal?sias nos trechos Oeste e Central e dunas no trecho Leste, ambas vegetadas, e uma plan?cie costeira na parte inferior associada ? presen?a de recifes de arenito. Este trabalho teve o objetivo de analisar os processos erosivos atuantes no trecho da praia de Pirangi do Norte e avaliar a viabilidade do seu monitoramento fazendo uso do DGPS (Sistema de Posicionamento Global em modo Diferencial). Foi realizada durante o trabalho uma caracteriza??o f?sica da ?rea por meio de fotointerpreta??o e vistoria local seguida de levantamentos da linha de costa no per?odo entre novembro de 2004 e novembro de 2009 e perfis de praia entre agosto de 2005 e julho de 2006. A an?lise sobre os resultados dos levantamentos anuais mostrou a ocorr?ncia de varia??es da linha de costa ao longo do trecho percorrido. Em locais identificados em planta como avan?o da costa em rela??o ao mar foi verificado in loco a presen?a de eros?o com dep?sito de materiais sobre o p? da fal?sia, antiga posi??o da linha de costa, dando a no??o de falso avan?o da mesma. Esse fato leva a conclus?o de que os dados coletados em um levantamento da linha de costa devem ser sempre acompanhados por registros fotogr?ficos da ?rea e locais com maior ?ndice de eros?o, evitando, assim, o equ?voco de tratar materiais de dep?sito como indicio de avan?o de costa. Ao final do trabalho, ap?s uma an?lise das diversas obras de mitiga??o dos processos erosivos na zona costeira, recomenda-se para o local de estudo a ado??o da alimenta??o artificial da praia, visando minimizar os efeitos erosivos das mar?s. Al?m disso, sugere-se ainda a continuidade do monitoramento, manuten??o da vegeta??o existente e controle da ocupa??o na borda dos trechos com fal?sias

Made available in DSpace on 2014-12-17T15:16:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 JanainaMDP_DISSERT.pdf: 3329925 bytes, checksum: bd99227fd454b40f0a50e6ed626ba87e (MD5) Previous issue date: 2011-08-29 / Objectives: To evaluate how to develop dynamic hyperinflation (DH) during exercise, the influence of pursed-lip breathing in (PLB) on breathing pattern and operating volume in patients with asthma. Methods: We studied 12 asthmatic patients in three moments: (1) anthropometry and spirometry, (2) submaximal incremental cycle ergometer test in spontaneous breathing and (3), submaximal incremental test on a cycle ergometer with PLB using the Opto-electronic plethysmography. Results: Evaluating the end-expiratory lung volume (EEV) during submaximal incremental test in spontaneous breathing, patients were divided into euvolume and hyperinflated. The RFL has increased significantly, the variation of the EEV group euvolume (1.4L) and decreased in group hyperinflated (0.272L). In group volume observed a significant increase of 140% in Vt at baseline, before exercise, comparing the RFL and spontaneous breathing. Hyperinflated group was observed that the RFL induced significant increases of Vt at all times of the test incremental baseline, 50%, 100% load and 66% recovery, 250%, 61.5% and 66% respectively. Respiratory rate decreased significantly with PLB at all times of the submaximal incremental test in the group euvolume. The speed of shortening of inspiratory muscles (VtRcp/Ti) in the hyperinflated increased from 1.6 ? 0.8L/s vs. 2.55 ? 0.9L/s, whereas in the RFL euvolume group ranged from 0.72 ? 0.31L/s vs. 0.65 ? 0.2L/s. The velocity of shortening of the expiratory muscles (VtAb/Te) showed similarity in response to RFL. In group hyperinflated varied vs. 0.89 ? 0.47 vs. 0.80 ? 0.36 and ? 1.17 ? 1L vs. 0.78 ? 0.6 for group euvolume. Conclusion: Different behavior in relation to EEV in patients with moderate asthma were observed, the HD and decreased EEV in response to exercise. The breathing pattern was modulated by both RFL performance as at home, making it more efficient / Objetivos: Avaliar como se desenvolve a hiperinsufla??o din?mica (HD) e as poss?veis modifica??es dos volumes pulonares operacionais durante o exerc?cio em respira??o espont?nea e respira??o em freno-labial (RFL) em pacientes asm?ticos. M?todos: Foram avaliados 12 pacientes asm?ticos em 3 momentos: (1) antropometria e espirometria, (2) teste incremental subm?ximo no cicloerg?metro em respira??o espont?nea e (3), teste incremental subm?ximo no cicloerg?metro com RFL utilizando a Pletismografia Opto-eletr?nica. Resultados: Avaliando o volume pulmonar expirat?rio final (EEV) durante o teste incremental subm?ximo em respira??o espont?nea, os pacientes foram divididos em grupo euvolume e grupo hiperinsuflado. A RFL aumentou, significativamente, a varia??o do EEV no grupo euvolume (1.4L) e diminuiu (0.272L) no grupo hiperinsuflado. No grupo euvolume observou-se aumento significativo de 140% no Vt na situa??o basal, pr?-exerc?cio, comparando a RFL e a respira??o espont?nea. No grupo hiperinsuflado foi observado que a RFL induziu aumentos significativos do Vt em todos os momentos do teste incremental, basal, 50%, 100% da carga e recupera??o em 66%, 250%, 61.5% e 66% respectivamente. A frequ?ncia respirat?ria diminuiu significativamente com a RFL em todos os momentos do teste incremental subm?ximo no grupo euvolume. A velocidade encurtamento dos m?sculos inspirat?rios (VtRcp/Ti) no grupo hiperinsuflado aumentou de 1.6 ? 0.8L/s vs. 2.55 ? 0.9L/s, com a RFL enquanto que no grupo euvolume variou de 0.72 ? 0.31L/s vs. 0.65 ? 0.2 L/s. A velocidade de encurtamento dos m?sculos expirat?rios (VtAb/Te) demonstrou similaridade em resposta a RFL. No grupo hiperinsuflado variou 0.89 ? 0.47 vs. 0.80 ? 0.36 e no grupo euvolume em 1.17 ? 1L vs. 0.78 ? 0.6. Conclus?o: Diferentes comportamentos em rela??o ao EEV nos pacientes com asma moderada foram observados, a HD e diminui??o do EEV em resposta ao exerc?cio. O padr?o respirat?rio foi modulado pela RFL tanto em exerc?cio como no repouso, tornando-o mais eficiente

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2016-12-29T17:01:51Z No. of bitstreams: 1 BriggidaDantasDeMoura_TESE.pdf: 2291552 bytes, checksum: 2fb9f82bd1437c5af48a519b0910e04e (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2017-01-02T19:38:29Z (GMT) No. of bitstreams: 1 BriggidaDantasDeMoura_TESE.pdf: 2291552 bytes, checksum: 2fb9f82bd1437c5af48a519b0910e04e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-02T19:38:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 BriggidaDantasDeMoura_TESE.pdf: 2291552 bytes, checksum: 2fb9f82bd1437c5af48a519b0910e04e (MD5) Previous issue date: 2016-04-15 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / A crescente atividade industrial de beneficiamento de polpas de frutas ? respons?vel pela gera??o de uma quantidade significativa de subproduto na forma de res?duos, constitu?dos basicamente de semente, casca e baga?o da fruta. Tais res?duos ainda s?o pouco aproveitados e o seu descarte direto pode resultar em preju?zos ambientais consider?veis. Portanto, ? de grande interesse cient?fico e tecnol?gico o desenvolvimento de estrat?gias para agregar valor econ?mico a estes res?duos. A secagem, por ser um dos processos mais utilizados na preserva??o de produtos aliment?cios, representa uma alternativa interessante de aproveitamento dos res?duos, podendo gerar um material com potencial aplica??o na forma de ingrediente para ra??o animal. Neste trabalho, foi realizado um estudo de secagem do res?duo de maracuj? atrav?s de um secador rotat?rio com recheio de inertes e fluxo concorrente, operando com alimenta??o intermitente do material. Diferentes condi??es de intermit?ncia e de temperatura do ar de secagem foram estudadas experimentalmente com o objetivo de avaliar o comportamento de resposta na sa?da do secador das seguintes vari?veis: umidade do s?lido; umidade do ar; temperatura do ar; e massa produzida cumulativamente ao longo da secagem. Tamb?m, um modelo matem?tico do processo foi implementado com o objetivo de descrever o comportamento de resposta din?mica nas condi??es estudadas. Tal modelo matem?tico foi escrito com base nos balan?os de massa e energia das fases s?lido e g?s (ar de secagem), resultando num sistema de equa??es diferenciais parciais (EDP), onde as vari?veis do processo (umidade e temperatura do s?lido e do g?s) s?o dependentes do tempo e do espa?o (dire??o da coordenada axial do secador). As propriedades fisico-quimicas e composicional do res?duo de maracuj? foram avaliadas e permitiram inferir importantes par?metros necess?rios ao modelo matem?tico. Testes iniciais de secagem em camada delgada demonstraram que a cin?tica de secagem apresenta uma caracter?stica de taxa constante, com constante de secagem dependente linearmente da temperatura. Um comportamento similar foi verificado no ajuste do modelo matem?tico do secador rotat?rio com os dados experimentais, onde se observou que a constante de secagem no termo de transfer?ncia de massa tamb?m apresentou forte correla??o com a temperatura de opera??o. De um modo geral, os valores calculados pelo modelo matem?tico acompanharam adequadamente a evolu??o de resposta de todas as vari?veis do processo, para todas as condi??es estudadas. Analisando-se a influ?ncia das condi??es operacionais em rela??o aos par?metros do modelo, observou-se que a dispers?o axial e a velocidade do s?lido foram influenciadas moderadamente pela intermit?ncia de alimenta??o, enquanto a constante de secagem e o coeficiente convectivo de transfer?ncia de calor foram fortemente influenciados pela temperatura. A partir do ajuste do modelo matem?tico do secador com as condi??es experimentais estudadas, simula??es explorat?rias foram feitas usando o modelo matem?tico em diferentes vaz?es de alimenta??o do material, tanto em regime cont?nuo quanto intermitente. O prop?sito principal com tais simula??es foi de avaliar qual a caracter?stica dimensional de projeto (L/Dc) do secador capaz de garantir uma melhor produ??o de material e que atenda uma especifica??o de umidade do produto. Tais resultados demonstraram a capacidade do modelo matem?tico para avalia??o dimensional de projeto b?sico, podendo ser tamb?m aplicado tanto na otimiza??o do processo quanto na implementa??o de estrat?gias avan?adas de controle. / The industrial fruit pulp processing is responsible for the generation of a significant amount of by-product in waste form, consisting essentially of seed, husk and rest of the fruit. These subproducts are still underutilized and their direct discard may result in considerable environmental damage. Therefore, it is of great scientific and technological interest to develop strategies able to add economic value to these waste. Drying is one of the processes most used for preservation of food products and represents an alternative for use in fruit waste. Drying processes can produce materials with potential application, mainly in form of ingredient for animal food. In this work, a drying study of passion fruit waste was performed using a rotary dryer containing inert loading and operating in concurrent flow with intermittent feed of material. Different experimental conditions were studied for intermittent material feed and air temperature, in order to evaluate the response behavior at the dryer outlet, verifying the following variables: moisture content of material; air absolute humidity; air temperature; mass (produced cumulatively during drying). Also, a mathematical model of the process was developed and implemented in order to describe the dynamic response characteristics in the studied conditions. This mathematical model was written based on microscopic balance of mass and energy for solid and gas phases, resulting in partial differential equations (PDE), where the process variables (temperature and moisture for solid and gas) are dependent on the time and space. Some physicochemical and compositional properties of passion fruit waste were evaluated, allowing to infer important parameters for the mathematical model. Drying in thin layer showed that the drying kinetics presents a characteristic of constant rate dependent linearly with the drying temperature. A similar behavior was observed in fitting the mathematical model of rotary dryer with the experimental data. It was noted that the drying constant for the mass transfer term also presented a strong correlation with the operating temperature. In general, the values calculated by the mathematical model were adequate in respect to all response variables and for all conditions studied. Analyzing the influence of operating conditions with respect to the model parameters, it was observed that the axial dispersion and the velocity of the solid were influenced moderately by the feed intermittence, while the constant of drying and the convective coefficient of heat transfer were strongly influenced by the temperature. From the mathematical model adjusted with the experimental conditions, exploratory simulations were performed in both continuous and intermittent regime and assuming different conditions of flow for the material. The main purpose with such simulations was to investigate the dimensional design feature (L/Dc) of the dryer, able to ensure better production and to comply with a product moisture specification. These results demonstrated that the mathematical model is able to perform a dimensional evaluation in equipment design as well as it can be applied for process optimization and advanced process control.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2017-02-13T19:44:50Z No. of bitstreams: 1 MenillaMariaAlvesDeMelo_DISSERT.pdf: 3756380 bytes, checksum: ee8b551187bf0b88e2a2414cc2bfa94e (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2017-02-14T21:18:32Z (GMT) No. of bitstreams: 1 MenillaMariaAlvesDeMelo_DISSERT.pdf: 3756380 bytes, checksum: ee8b551187bf0b88e2a2414cc2bfa94e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-14T21:18:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 MenillaMariaAlvesDeMelo_DISSERT.pdf: 3756380 bytes, checksum: ee8b551187bf0b88e2a2414cc2bfa94e (MD5) Previous issue date: 2016-07-29 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico (CNPq) / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / Venenos de escorpi?es constituem uma rica fonte de pept?deos, que podem ser classificados como pept?deos com liga??es dissulfeto e pept?deos sem liga??es dissulfeto. Pept?deos ani?nicos correspondem aos componentes sem liga??es dissulfeto mais abundante na pe?onha do escorpi?o Tityus stigmurus (esp?cie prevalente no nordeste brasileiro), sendo ricos em res?duos de ?cidos asp?rtico e glut?mico. Esta abordagem apresenta, pela primeira vez, a caracteriza??o estrutural e a avalia??o da atividade biol?gica de um pept?deo ani?nico presente na pe?onha do escorpi?o Tityus stigmurus, denominado TanP. A estrutura tridimensional do TanP foi predita por modelagem computacional e refinada por simula??es de din?mica molecular, sendo a estrutura secund?ria obtida por dicro?smo circular, e estabilidade estrutural avaliada em diferentes meios, pH, temperatura e presen?a de ?ons cobre. Al?m disso, utilizou-se a espectroscopia UV-vis?vel para avaliar a atividade quelante de TanP na presen?a de cobre. As atividades antimicrobiana, citot?xica, imunomoduladora e antioxidante tamb?m foram avaliadas. As an?lises de CD indicaram uma predomin?ncia de conforma??o rand?mica em meio aquoso, bem como mudan?as estruturais dependentes de pH e temperatura. Os ?ons cobre, ao se ligarem ao pept?deo, modificaram a estrutura do mesmo. Tais dados corroboraram com o que foi demonstrado na din?mica molecular. A raz?o molar de liga??o (TanP:cobre) na din?mica molecular foi 1:5, enquanto no ensaio de reatividade observou-se raz?es de 1:7 e 1:3, a depender da concentra??o de TanP na solu??o. TanP n?o induziu citotoxicidade para as c?lulas normais e cancer?genas testadas, e apresentou capacidade de inibir, in vitro, a libera??o de ?xido n?trico por macr?fagos estimulados por LPS. Desta forma, os resultados sugerem que TanP ? um pept?deo promissor para aplica??o terap?utica como um agente quelante, bem como agente imunomodulador e antioxidante. / Scorpion venoms are a rich source of peptides, which may be classified as disulfide-bridged or non-disulfide-bridged peptides. Among them, there are anionic peptides, rich in aspartic and glutamic acid residues. Despite being the most abundant component in the venom gland of Tityus stigmurus (the prevalent scorpion species in Northeast Brazil), they are poorly characterized in the literature. This work presents, for the first time, structural characterization and biological activity assays of an anionic peptide from the venom of the scorpion T. stigmurus, named TanP. The three-dimensional structure of TanP was obtained by computational modeling and refined by molecular dynamic (MD) simulations. Furthermore, we have performed circular dichroism (CD) analysis to predict TanP secondary structure, and UV-visible spectroscopy to evaluate its chelating activity. CD indicated predominance of random coil conformation in aqueous medium, as well as changes in structure depending on pH and temperature. TanP has chelating activity on copper ions, which modified the peptide?s secondary structure. These results were corroborated by MD data. The molar ratio of binding (TanP:copper) depends on the concentration of peptide. TanP was not cytotoxic to normal or cancer cell lines, and showed an ability to inhibit the in vitro release of nitric oxide by LPS-stimulated macrophages. In this way, the results suggest TanP is a promising peptide for therapeutic application as a chelating, immunomodulatory and antioxidant agent.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2017-03-23T17:14:28Z No. of bitstreams: 1 FelipeFerreiraMonteiro_DISSERT.pdf: 11211553 bytes, checksum: 03f13cf261814c6ce672e897f74a0031 (MD5) / Approved for entry into archive by Monica Paiva (monicalpaiva@hotmail.com) on 2017-03-23T17:19:25Z (GMT) No. of bitstreams: 1 FelipeFerreiraMonteiro_DISSERT.pdf: 11211553 bytes, checksum: 03f13cf261814c6ce672e897f74a0031 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-23T17:19:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 FelipeFerreiraMonteiro_DISSERT.pdf: 11211553 bytes, checksum: 03f13cf261814c6ce672e897f74a0031 (MD5) Previous issue date: 2015-04-14 / As cidades vivem uma constante muta??o, passando por transforma??es que buscam atender e compreender a popula??o residente e seu processo de urbaniza??o Compreender o processo de urbaniza??o vai al?m do ?mbito do crescimento da mancha urbana, abrange compreender como vive a sua popula??o e como ? produzido o espa?o da cidade. A velocidade de urbaniza??o e o crescimento da popula??o podem ocorrer em diferentes ritmos, levando em muitos casos a forma??o de cidades com estruturas e formas bem diferentes do que as esperadas, se considerarmos o numero de habitantes e como se distribuem, sendo muito desse fato decorrente das desigualdades na forma de consumir o espa?o que impactam diretamente no tamanho das cidades. A dispers?o do tecido urbano ? um dos reflexos do crescimento da cidade e das formas de consumir o espa?o, materializando o descompasso entre o espa?o urbano e a popula??o. Essa forma de ocupa??o da cidade pode ser vista como mais influente, de diferentes maneiras na vida dos usu?rios do espa?o urbano e na pr?pria morfologia urbana. A pesquisa busca avaliar como est? caracterizado o processo de dispers?o dentro das regi?es metropolitanas brasileiras e diante a esses resultados compreender como a estrutura et?ria da popula??o urbana esta associada as dimens?es urbanas e as , de dispers?o. ,para tal s?o propostas medidas para averiguar como se encontra a forma urbana, capturando a condi??o de dispers?o As medidas propostas consideram dimens?es espaciais urbanas para as regi?es metropolitanas brasileiras, sendo estas medidas: Tamanho, Continuidade, Grau de vizinhan?a, Propor??o de ?reas rurais, Densidade Domiciliar, Densidade populacional. Para cada uma dessas medidas foi avaliada sua correla??o com a estrutura demogr?fica de cada regi?o metropolitana estudada, a fim de testar a hip?tese de que a forma urbana esta associada a estrutura demogr?fica de sua popula??o. Os resultados encontrados demonstram a import?ncia de cada uma das medidas propostas, quando aplicado em todas as regi?es metropolitanas ser? poss?vel a an?lise estat?stica de correla??o com elementos demogr?ficos. / As cidades vivem uma constante muta??o, passando por transforma??es que buscam atender e compreender a popula??o residente e seu processo de urbaniza??o Compreender o processo de urbaniza??o vai al?m do ?mbito do crescimento da mancha urbana, abrange compreender como vive a sua popula??o e como ? produzido o espa?o da cidade. A velocidade de urbaniza??o e o crescimento da popula??o podem ocorrer em diferentes ritmos, levando em muitos casos a forma??o de cidades com estruturas e formas bem diferentes do que as esperadas, se considerarmos o numero de habitantes e como se distribuem, sendo muito desse fato decorrente das desigualdades na forma de consumir o espa?o que impactam diretamente no tamanho das cidades. A dispers?o do tecido urbano ? um dos reflexos do crescimento da cidade e das formas de consumir o espa?o, materializando o descompasso entre o espa?o urbano e a popula??o. Essa forma de ocupa??o da cidade pode ser vista como mais influente, de diferentes maneiras na vida dos usu?rios do espa?o urbano e na pr?pria morfologia urbana. A pesquisa busca avaliar como est? caracterizado o processo de dispers?o dentro das regi?es metropolitanas brasileiras e diante a esses resultados compreender como a estrutura et?ria da popula??o urbana esta associada as dimens?es urbanas e as , de dispers?o. ,para tal s?o propostas medidas para averiguar como se encontra a forma urbana, capturando a condi??o de dispers?o As medidas propostas consideram dimens?es espaciais urbanas para as regi?es metropolitanas brasileiras, sendo estas medidas: Tamanho, Continuidade, Grau de vizinhan?a, Propor??o de ?reas rurais, Densidade Domiciliar, Densidade populacional. Para cada uma dessas medidas foi avaliada sua correla??o com a estrutura demogr?fica de cada regi?o metropolitana estudada, a fim de testar a hip?tese de que a forma urbana esta associada a estrutura demogr?fica de sua popula??o. Os resultados encontrados demonstram a import?ncia de cada uma das medidas propostas, quando aplicado em todas as regi?es metropolitanas ser? poss?vel a an?lise estat?stica de correla??o com elementos demogr?ficos.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2017-04-25T16:34:19Z No. of bitstreams: 1 PriscillaDeLimaNunes_DISSERT.pdf: 1372351 bytes, checksum: b206f9e79c3e43f4c6047c24d30b20e1 (MD5) / Approved for entry into archive by Monica Paiva (monicalpaiva@hotmail.com) on 2017-04-25T16:41:51Z (GMT) No. of bitstreams: 1 PriscillaDeLimaNunes_DISSERT.pdf: 1372351 bytes, checksum: b206f9e79c3e43f4c6047c24d30b20e1 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-25T16:41:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PriscillaDeLimaNunes_DISSERT.pdf: 1372351 bytes, checksum: b206f9e79c3e43f4c6047c24d30b20e1 (MD5) Previous issue date: 2014-07-31 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico (CNPq) / Neste trabalho, as simula??es estacion?ria e din?mica foram realizadas para uma unidade de destila??o atmosf?rica de uma refinaria de petr?leo bruto. Esta unidade representa o n?cleo de quase todas as refinarias e possui um dos processos mais complexos, caracterizado por intera??es m?ltiplas e alto n?vel de n?o-linearidades. Para a realiza??o da das simula??es utilizou-se como ferramenta o simulador comercial de processos qu?micos UniSim? Design R420. A unidade atmosf?rica foi simulada levando em conta os equipamentos auxiliares principais. Ajustes de vari?veis do sistema foram realizados de forma a fazer com que as especifica??es dos produtos fossem atendidas. Uma an?lise de sensibilidade foi conduzida, avaliando as principais vari?veis do sistema de forma a obter os limites de converg?ncia da simula??o. O sistema foi ampliado do estado estacion?rio para simula??o din?mica. A partir da simula??o din?mica e dos dados de entrada e sa?da dos testes de identifica??o do projeto de implanta??o do controle avan?ado da unidade em estudo, aplicou-se os mesmos valores dos degraus nas mesmas vari?veis manipuladas na simula??o e observou-se a varia??o da vari?vel controlada. Foi poss?vel calcular o ganho do processo de cada vari?vel. Os ganhos obtidos na simula??o apresentaram sinais iguais e valores aproximados aos testes de identifica??o com exce??o do modelo da vari?vel PIC-030 que nos testes de identifica??o apresentou comportamento inesperado e n?o foi inclusa nos modelos do controlador. / Neste trabalho, as simula??es estacion?ria e din?mica foram realizadas para uma unidade de destila??o atmosf?rica de uma refinaria de petr?leo bruto. Esta unidade representa o n?cleo de quase todas as refinarias e possui um dos processos mais complexos, caracterizado por intera??es m?ltiplas e alto n?vel de n?o-linearidades. Para a realiza??o da das simula??es utilizou-se como ferramenta o simulador comercial de processos qu?micos UniSim? Design R420. A unidade atmosf?rica foi simulada levando em conta os equipamentos auxiliares principais. Ajustes de vari?veis do sistema foram realizados de forma a fazer com que as especifica??es dos produtos fossem atendidas. Uma an?lise de sensibilidade foi conduzida, avaliando as principais vari?veis do sistema de forma a obter os limites de converg?ncia da simula??o. O sistema foi ampliado do estado estacion?rio para simula??o din?mica. A partir da simula??o din?mica e dos dados de entrada e sa?da dos testes de identifica??o do projeto de implanta??o do controle avan?ado da unidade em estudo, aplicou-se os mesmos valores dos degraus nas mesmas vari?veis manipuladas na simula??o e observou-se a varia??o da vari?vel controlada. Foi poss?vel calcular o ganho do processo de cada vari?vel. Os ganhos obtidos na simula??o apresentaram sinais iguais e valores aproximados aos testes de identifica??o com exce??o do modelo da vari?vel PIC-030 que nos testes de identifica??o apresentou comportamento inesperado e n?o foi inclusa nos modelos do controlador.

Submitted by Ricardo Cedraz Duque Moliterno (ricardo.moliterno@uefs.br) on 2016-01-13T23:50:52Z No. of bitstreams: 1 TESE-FINAL-FRANCO-HENRIQUE-CORRIGIDO-V4.pdf: 27152448 bytes, checksum: 7d448c937bb21040514eedeaa37f689f (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-13T23:50:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TESE-FINAL-FRANCO-HENRIQUE-CORRIGIDO-V4.pdf: 27152448 bytes, checksum: 7d448c937bb21040514eedeaa37f689f (MD5) Previous issue date: 2015-11-06 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico - CNPq / According to WHO, Leishmaniasis is the second most important disease caused by protozoans. However, the available therapeutic arsenal for its treatment is limited and has low efficacy and safety profile. Once Leishmania ssp. are pteridine auxotrophs key enzymes of the folate metabolism have been targeted to circumvent this dilemma. However, Dihydrofolate Reductase-Thymidylate Synthase (DHFR-TS) inhibitors are ineffective against Leishmania major due to an alternative folate pathway regulated by Pteridine Reductase 1 (PTR1). Thus, identifying molecules that act on both enzymes is crucial to develop new leishmanicidal drugs. For that reason, the main goal of this study is to identify, through in silico approaches, (pharmacophore models), putative PTR1 inhibitors that also show structural requirements for L. major DHFR-TS inhibition. The pharmacophore models 10 and 20, PTR1 (2 H-bond donors, 4 H-bond acceptors and 3 hydrophobic centers) and DHFR-TS inhibitors (2 H-bond acceptors and 2 hydrophobic centers) respectively, show high performance to differentiate true-binders from decoys (AUCPTR1=0.90; AUCDHFR-TS=0.86) and to explain the structure-activity relationships for the inhibitors under study. Thus, these models were employed sequentially to select 10 molecules whose effect over the thermal stability of LmPTR1 was investigated by ThermoFluor?. According to this assay, two molecules stabilize LmPTR1: Z80393 (?Tm = 1.02?C) and Z33165 (?Tm = 0.9?C). Binding displacement assays with biopterin or NADPH showed that Z80393 binds within the substrate binding site, whereas Z33165 binds in the cofactor binding site. Z80303 effect over the catalytic activity of PTR1 was investigated by fluorimetry. This approach allowed us to determine the inhibitor?s potency (IC50=32.31 ? 1.18 ?M). Finally, Z80303 putative binding profile was generated by molecular docking and analyzed by Molecular Dynamics (productive phase= 15 ns). The results show that during 70% of the simulation, Z80393 H-bonds to Ser-111 and Arg-17 residues. Therefore, this study not only led to identification of a new class of LmPTR1 inhibitors, but also allowed us to determine its potency, mode of inhibition and binding profile towards its therapeutic target. / A leishmaniose tem sido indicada pela OMS como a segunda protozoose mais importante em termos de mortalidade e preval?ncia. Entretanto, o repert?rio de f?rmacos dispon?veis ? limitado e apresenta, na maioria dos casos, baixos ?ndices de efic?cia e seguran?a. Embora os protozo?rios do g?nero Leishmania sejam auxotr?ficos para folatos, inibidores da Diidrofolato Redutase-Timidilato Sintase (DHFR-TS) s?o pouco eficazes contra esse parasito. A baixa suscetibilidade se explica pela presen?a da Pteridina Redutase 1 (PTR1) que atua como via alternativa para a redu??o de ?cido f?lico ou de pteridinas n?o conjugadas, quando DHFR-TS est? inibida. Diante desse cen?rio, mol?culas que atuam sobre PTR1 e DHFR-TS de Leishmania ssp. parecem ser promissoras para o desenvolvimento de f?rmacos contra a leishmaniose. Por essa raz?o, o objetivo desse trabalho foi identificar, por triagem in silico (modelo farmacof?rico), potenciais inibidores de PTR1 que apresentem os requisitos estruturais m?nimos para inibir tamb?m DHFR de L. major. Os modelos farmacof?ricos 10 e 20, baseados em inibidores de PTR1 (2 doadores de lig. H, 4 aceitadores de lig. H e 3 centros hidrof?bicos) e DHFR-TS (2 aceitadores de lig. H e 2 centros hidrof?bicos) respectivamente, mostraram desempenho satisfat?rio em discriminar inibidores verdadeiros de falsos positivos (AUCPTR1=0,90; AUCDHFR-TS=0,86), al?m de explicarem a rela??o entre a estrutura qu?mica e a atividade biol?gica. Esses modelos foram usados sequencialmente para selecionar 10 mol?culas que tiveram seu efeito sobre a estabilidade t?rmica de LmPTR1 investigado por ThermoFluor?. Nesse ensaio foram identificadas duas mol?culas que estabilizaram LmPTR1: Z80393 (?Tm = 1,02?C) e Z33165 (?Tm = 0,9?C). Ensaios de deslocamento com biopterina ou NADPH mostraram que Z80393 compete com o substrato, enquanto Z33165 interage no s?tio do cofator. O efeito de Z80393 sobre a atividade catal?tica de LmPTR1 foi investigado por fluorimetria, permitindo determinar a pot?ncia desse inibidor (IC50=32,31 ? 1,18 ?M). Por fim, um modelo de intera??o para esse inibidor foi gerado por acoplamento molecular e a pose obtida foi analisada atrav?s de uma Din?mica Molecular com fase produtiva de 15 ns. Os resultados obtidos mostram que durante 70% da simula??o, Z80393 faz liga??es de H com os res?duos Ser-111 e Arg-17. Portanto, o presente trabalho n?o s? levou a identifica??o de uma nova classe de inibidores de LmPTR1, mas tamb?m permitiu caracterizar sua pot?ncia, modalidade de inibi??o e perfil de intera??o com seu alvo terap?utico.

Submitted by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2017-06-29T11:48:00Z No. of bitstreams: 1 DIS_LEONARDO_VERONESE_SOLETTI_COMPLETO.pdf: 4509586 bytes, checksum: 932e17294867261485737bead0bba62c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-29T11:48:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DIS_LEONARDO_VERONESE_SOLETTI_COMPLETO.pdf: 4509586 bytes, checksum: 932e17294867261485737bead0bba62c (MD5) Previous issue date: 2016-03-30 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico - CNPq / As a consequence of the post-genomic era an explosion of information and numerous discoveries made available large amounts of biological data. Even with the technology enhancements regarding protein structure prediction techniques, it is still not possible to find a tool to predict with precision the exact the three-dimensional structure of a given protein. This brings new challenges, starting from how to understand and organize these resources until sharing and reuse of successful experiments, as well as how to provide interoperability between data from different sources, without mentioning the diversity between tools and different user profiles. This kind of data flow is regularly addressed as command line scripts which require users to have programming skills. Such scripts have problems interfering, collecting and storing data while executing. Furthermore, these scripts and can be very complex leading to difficulties of implementation, maintenance and reuse. Another problem that arises when a set of tasks are proposed to be conducted through scripts is the possibility of missing any step in the process or running at incorrect order, leading to inconsistent results. It becomes necessary techniques and tools to ease this process in an organized way as a sequence of steps characterized by a workflow, thus automating this process. In this context, we sought to develop a scientific workflow model using bioinformatics tools and biology expertise to automate the process of protein refinement of polypeptides predicted by CReF method once the refinement process scripts were automated, it was possible to increase the amount of experiments while maintaining an acceptable quality criteria. Finally, was developed a web interface that facilitates the visualization of the results in an organized way. / Com o advento da era p?s-gen?mica surge, como consequ?ncia, uma explos?o de informa??es onde in?meras descobertas geram grande quantidade de dados biol?gicos. Mesmo com o avan?o da tecnologia nas t?cnicas de predi??o de estruturas de prote?nas, n?o ? poss?vel ainda se encontrar uma ferramenta capaz de predizer com precis?o exata a estrutura 3D de prote?nas. Em decorr?ncia disso, surgem novos desafios para entender e organizar esses recursos nas pesquisas, o compartilhamento e reuso de experimentos bem-sucedidos, assim como prover interoperabilidade entre dados e ferramentas de diferentes locais e utilizados por usu?rios com perfis distintos. As atividades de estudos do fluxo destes dados, inicialmente, baseiam-se em scripts que auxiliam na entrada, processamento e resultado final da an?lise, normalmente executados por linha de comando, o que obriga seus usu?rios a terem dom?nio de algoritmos e l?gica de programa??o. Tais scripts apresentam problemas em interferir, coletar e armazenar dados ao longo de sua execu??o, e podem ser muito complexos, ocasionando a dificuldades de implementa??o, manuten??o e reuso. Outro problema ? quando um conjunto de tarefas a serem realizadas atrav?s de scripts, podem ter o risco de faltar algum passo no processo ou n?o ser executado na ordem certa, obtendo-se com isso resultados n?o satisfat?rios. Torna-se necess?rio t?cnicas e ferramentas que facilitem esse processo, de maneira organizada como uma sequ?ncia de etapas caracterizados por um fluxo de execu??o, automatizando-se assim este processo. Neste contexto, buscou-se desenvolver um modelo de workflow cient?fico utilizando-se ferramentas de bioinform?tica e de conhecimentos da biologia para automatizar o processo de refinamento de prote?nas, do polipept?dio predito pelo m?todo CReF. Os scripts do processo de refinamento foram automatizados, com isso foi poss?vel aumentar a quantidade de experimentos, mantendo um crit?rio de qualidade aceit?vel. Para o resultado final do processo, desenvolveu-se uma interface web que facilita a visualiza??o dos resultados de uma forma organizada.

Submitted by Sandra Pereira (srpereira@ufrrj.br) on 2016-10-25T13:39:22Z No. of bitstreams: 1 2015 - Carine Cristina Gon?alves Galv?o.pdf: 2315391 bytes, checksum: 154e1cdd3a9bb2de5fd18d636c4a6543 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-25T13:39:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015 - Carine Cristina Gon?alves Galv?o.pdf: 2315391 bytes, checksum: 154e1cdd3a9bb2de5fd18d636c4a6543 (MD5) Previous issue date: 2015-02-24 / Funda??o Carlos Chagas Filho de Amparo ? Pesquisa do Estado do RJ - FAPERJ / Some animals have extremely complex relationships including the formation of matriarchal societies, alliances and communities, specific long-term relationships, and formation of flexible groups, such as dolphins. Ilha Grande Bay, along with Sepetiba Bay, have the largest population of Sotalia guianensis throughout its distribution, with about 1311 individuals in the first one, and 1043 individuals in the second, where it has been registered groups with up to 450 individuals. This study aimed to analyze the social organization of the mothers of S. guianensis from Ilha Grande Bay. The mothers were considered those dolphins observed at least five times in high proximity of a calf; all its associates were also classified as females and included in the analysis. The analysis of these mothers? social structure was carried out in SOCPROG? software (2.5 version) using a Half Weight Index (HWI). It was performed an analysis of the community division by modularity which indicated that individuals do not form independent clusters. A Monte Carlo permutation test was done and showed the presence of preferred associations among some dyads. Finally, a temporal analysis was performed with the use of mathematical models fitted to the Lagged Association Rate to try to explain how associations behave over time. The social structure of the 25 mothers identified in Ilha Grande Bay seems to be poorly differentiated, forming a large social network with weak associations between dyads, and following a fission-fusion dynamics. There was no statistical difference in the associations between and within classes (mothers X females). This work is a contribution to the understanding of the species? social dynamics, which are still poorly known, and highlights the need for more research in the area. / Alguns animais possuem rela??es extremamente complexas, incluindo forma??o de sociedades matriarcais, alian?as e comunidades, relacionamentos espec?ficos de longa dura??o, e forma??o de grupos flex?veis, como ? o caso dos golfinhos. A Ba?a da Ilha Grande, juntamente com a Ba?a de Sepetiba, possui a maior popula??o de Sotalia guianensis em toda a sua distribui??o, com estimativa de 1311 indiv?duos na primeira, e 1043 indiv?duos na segunda, onde j? foram registrados grupos com at? 450 indiv?duos. Este trabalho teve como objetivo analisar a organiza??o social das m?es de S. guianensis da Ba?a da Ilha Grande. Foram consideradas m?es aqueles golfinhos vistos no m?nimo cinco vezes em forte proximidade de um filhote, e todos os seus associados foram classificados como f?meas e inclu?dos nas an?lises. A an?lise da estrutura social destas m?es foi feito no programa SOCPROG? (vers?o 2.5) atrav?s do ?ndice Half Weight (HWI). Foi feita uma an?lise de divis?o de comunidades por modularidade que indicou que os indiv?duos n?o formam agrega??es independentes. Um teste de permuta??o de Monte Carlo foi realizado e mostrou a presen?a de associa??es preferidas entre algumas duplas. Por fim, uma an?lise temporal foi realizada com a utiliza??o de modelos matem?ticos ajustados ? Lagged Association Rate para tentar explicar como as associa??es se comportam no decorrer do tempo. A estrutura social das 25 m?es identificadas de S. guianensis na Ba?a da Ilha Grande se mostrou pouco diferenciada, formando uma grande rede com fracas associa??es entre duplas, seguindo uma din?mica de fiss?o-fus?o. N?o houve diferen?a estat?stica nas associa??es entre e dentro das classes (m?es X f?meas). Este trabalho ? uma contribui??o para o entendimento das din?micas sociais da esp?cie, que ainda s?o pouco conhecidas, e ressalta a necessidade de mais pesquisas na ?rea.

Submitted by Jorge Silva (jorgelmsilva@ufrrj.br) on 2018-06-13T18:03:48Z No. of bitstreams: 1 2017 - Marcos Paulo Henrique.pdf: 3532368 bytes, checksum: 3f54ade5dd907b58b5188d1e09da2e44 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-13T18:03:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2017 - Marcos Paulo Henrique.pdf: 3532368 bytes, checksum: 3f54ade5dd907b58b5188d1e09da2e44 (MD5) Previous issue date: 2017-01-27 / This investigation is focused on the development of activities, implementation (in the computer lab and in the classroom) and the analysis of learning of students in the 8th and 9th year of a public school in the city of Rio Claro (RJ). Specifically, the research considered the conceptual development in a teaching practice that values the dialogue, debate and writing, among other ways of registration, in a reflection with activities from the use of traditional GeoGebra (desktop) and GeoGebra application (version for smartphones). This analysis was not done to compare the two environments used, but identify contributions and challenges linked to the implementation of these resources for appropriation of knowledge. The concepts were polygons, regular polygons and parallel lines with a transverse. Data collection was carried out as follows: (a) audio recording, activities, geometric constructions files, photographic records and researcher's journal (implementation in the lab) and (b) audio and video recording, smartphones? screen capture used by students, and daily activities sheet of researcher (implementation in the classroom). In implementations of activities with computers, are highlighted the various forms of visualization and construction around the geometric object provided by dynamic geometry environment and mediation, as a tool of teaching work, as some contributions to the construction and development of the concept of regular polygon. It was observed during the implementation of the survey, some difficulties presented by the students related to handling of GeoGebra on a computer, as well as challenges to implementation of pedagogical practices in the computer lab, where multiple computers were defective. As contributions in the implementation of activities, stands out the motivator appeal, particularly, in working with parallel lines cut by transversal, using GeoGebra application. The experience showed and proved exciting, allowing the students to conclude that there are a set of elements (angles, straight position etc.), variants and invariants, along with the use and exploration of forms handled. As challenges, you can point out the difficulty of viewing properties in a building for cases where smartphone screen is small. / A presente investiga??o centrou-se na elabora??o de atividades, na implementa??o (no laborat?rio de inform?tica e em sala de aula) e na an?lise do aprendizado de alunos do 8? e 9? ano do Ensino Fundamental de uma escola p?blica de Rio Claro (RJ). Especificamente, a pesquisa analisou o desenvolvimento conceitual em uma pr?tica docente que valoriza o di?logo, a argumenta??o e a escrita, entre outras formas de registro em uma reflex?o com atividades a partir da utiliza??o do GeoGebra convencional (desktop) e o GeoGebra aplicativo (vers?o para smartphones). A an?lise n?o consiste em comparar os dois ambientes utilizados, mas identificar contribui??es e desafios atrelados ? implementa??o destes recursos para apropria??o do conhecimento. Os conceitos foram pol?gonos, pol?gonos regulares e retas paralelas com uma transversal. A coleta de dados foi realizada da seguinte maneira: (a) grava??o em ?udio, folha de atividades, os arquivos referentes ?s constru??es geom?tricas, registros fotogr?ficos e di?rio do pesquisador (implementa??o no laborat?rio) e (b) grava??o em ?udio e v?deo, captura da tela dos smartphones utilizados pelos estudantes, folha de atividades e di?rio do pesquisador (implementa??o em sala de aula). Em rela??o ?s implementa??es de atividades com computadores, destacamos as v?rias formas de visualiza??o e constru??o de um objeto geom?trico proporcionado pelo ambiente de geometria din?mica e a media??o, como ferramenta do trabalho docente, como algumas contribui??es para a constru??o e desenvolvimento do conceito de pol?gono regular. Observamos dificuldades apresentadas pelos estudantes no que se refere ao manuseio do GeoGebra em um computador, assim como desafios para implementa??o de pr?ticas pedag?gicas no laborat?rio de inform?tica, como v?rios computadores com defeito. Como contribui??es do smartphone na implementa??o de atividades, destacamos o apelo motivador que este recurso traz ?s aulas. Particularmente, no trabalho com retas paralelas cortadas por transversais, o uso GeoGebra aplicativo mostrou-se instigante por permitir aos alunos a observa??o de um conjunto de elementos (?ngulos, posi??o de retas etc.) variantes ou invariantes e, juntamente com o manuseio e explora??o das formas manuseadas. Como desafios ? poss?vel apontar a dificuldade de visualiza??o de propriedades em um constructo para casos em que a tela do smartphone ? pequena.