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Uso dos métodos clássico e bayesiano para os modelos não-lineares heterocedásticos simétricos / Use of the classical and bayesian methods for nonlinear heterocedastic symmetric models

Macêra, Márcia Aparecida Centanin 21 June 2011 (has links)
Os modelos normais de regressão têm sido utilizados durante muitos anos para a análise de dados. Mesmo nos casos em que a normalidade não podia ser suposta, tentava-se algum tipo de transformação com o intuito de alcançar a normalidade procurada. No entanto, na prática, essas suposições sobre normalidade e linearidade nem sempre são satisfeitas. Como alternativas à técnica clássica, foram desenvolvidas novas classes de modelos de regressão. Nesse contexto, focamos a classe de modelos em que a distribuição assumida para a variável resposta pertence à classe de distribuições simétricas. O objetivo geral desse trabalho é a modelagem desta classe no contexto bayesiano, em particular a modelagem da classe de modelos não-lineares heterocedásticos simétricos. Vale ressaltar que esse trabalho tem ligação com duas linhas de pesquisa, a saber: a inferência estatística abordando aspectos da teoria assintótica e a inferência bayesiana considerando aspectos de modelagem e critérios de seleção de modelos baseados em métodos de simulação de Monte Carlo em Cadeia de Markov (MCMC). Uma primeira etapa consiste em apresentar a classe dos modelos não-lineares heterocedásticos simétricos bem como a inferência clássica dos parâmetros desses modelos. Posteriormente, propomos uma abordagem bayesiana para esses modelos, cujo objetivo é mostrar sua viabilidade e comparar a inferência bayesiana dos parâmetros estimados via métodos MCMC com a inferência clássica das estimativas obtidas por meio da ferramenta GAMLSS. Além disso, utilizamos o método bayesiano de análise de influência caso a caso baseado na divergência de Kullback-Leibler para detectar observações influentes nos dados. A implementação computacional foi desenvolvida no software R e para detalhes dos programas pode ser consultado aos autores do trabalho / The normal regression models have been used for many years for data analysis. Even in cases where normality could not be assumed, was trying to be some kind of transformation in order to achieve the normality sought. However, in practice, these assumptions about normality and linearity are not always satisfied. As alternatives to classical technique new classes of regression models were developed. In this context, we focus on the class of models in which the distribution assumed for the response variable belongs to the symmetric distributions class. The aim of this work is the modeling of this class in the bayesian context, in particular the modeling of the nonlinear models heteroscedastic symmetric class. Note that this work is connected with two research lines, the statistical inference addressing aspects of asymptotic theory and the bayesian inference considering aspects of modeling and criteria for models selection based on simulation methods Monte Carlo Markov Chain (MCMC). A first step is to present the nonlinear models heteroscedastic symmetric class as well as the classic inference of parameters of these models. Subsequently, we propose a bayesian approach to these models, whose objective is to show their feasibility and compare the estimated parameters bayesian inference by MCMC methods with the classical inference of the estimates obtained by GAMLSS tool. In addition, we use the bayesian method of influence analysis on a case based on the Kullback-Leibler divergence for detecting influential observations in the data. The computational implementation was developed in the software R and programs details can be found at the studys authors
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The effect of ownership-control divergence on investment sensitivity to idiosyncratic risk: evidence from an emerging economy / O efeito da divergência propriedade-controle na sensibilidade do investimento ao risco idiossincrático: evidência de uma economia emergente

Caixe, Daniel Ferreira 05 February 2018 (has links)
This study investigates the moderating role of the agency conflict between controlling and minority shareholders on the investment-risk relationship. When the ownership-control structure is concentrated, the agency theory indicates that the separation between cash-flow rights and voting rights induces the controlling shareholder to extract private benefits. To assess the effect of ownership-control divergence on the investment-risk relation, we use system generalized method of moments estimator (SYS-GMM) in longitudinal data from 412 Brazilian firms between 1997 and 2010. Our results show that investment is less sensitive to idiosyncratic risk for companies in which the largest shareholder presents high levels of ownership-control divergence. The impact of excess voting rights on the investment-risk sensitivity holds after we group firms according to distinct corporate governance and financial characteristics, such as financial constraints, family control, board independence, and the type of control-enhancing mechanism. Board independence does not affect controlling shareholders\' behavior toward risky investments. Among the control-enhancing mechanisms, the issuance of dual class shares is the main driver of the lower investment sensitivity to idiosyncratic risk. Our findings are consistent with entrenchment effects in the sense that dominant shareholders may select riskier projects when investing other people\'s money, which have both managerial and policy implications. / Este estudo investiga o papel moderador do conflito de agência entre acionistas controladores e minoritários no relacionamento investimento-risco. Quando a estrutura de propriedade e controle é concentrada, a teoria da agência indica que a separação entre direitos de fluxo de caixa e direitos de voto induz o acionista controlador a extrair benefícios privados. Para avaliar o efeito da divergência propriedade-controle na relação investimento-risco, utilizamos o estimador de método dos momentos generalizado sistêmico (MMG-SIS) em dados longitudinais de 412 empresas brasileiras entre 1997 e 2010. Nossos resultados mostram que o investimento é menos sensível ao risco idiossincrático para empresas em que o maior acionista apresenta altos níveis de divergência propriedade-controle. O impacto dos direitos de voto em excesso na sensibilidade investimento-risco mantém-se após agruparmos as empresas de acordo com características de governança corporativa e financeiras, tais como restrições financeiras, controle familiar, independência do conselho e o tipo de mecanismo para aumento do controle. A independência do conselho não afeta o comportamento dos acionistas controladores em relação a investimentos arriscados. Entre os mecanismos para aumento do controle, a emissão de duas classes de ações é a principal direcionadora da menor sensibilidade do investimento ao risco idiossincrático. Nossas descobertas são consistentes com os efeitos de entrincheiramento no sentido de que os acionistas dominantes podem selecionar projetos mais arriscados ao investirem o dinheiro de outras pessoas, o que tem implicações gerenciais e políticas.
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Uso do melhor preditor linear não viesado (BLUP) em análises dialélicas e predição de híbridos. / Use of best linear unbiased prediction in diallel analysis and in prediction of single crosses.

Iemma, Mariana 14 March 2003 (has links)
A obtenção de híbridos de milho está relacionada com o aumento de produtividade dessa cultura. Para isso, normalmente são realizados cruzamentos entre linhagens de diferentes grupos heteróticos, que são determinados pelos melhoristas de forma que seja maximizada a divergência entre eles. A escolha dos genitores a serem cruzados pode ser facilitada pelo uso de cruzamentos dialélicos. Os modelos usados para a análise dos dialélicos permitem a estimação de parâmetros úteis para a seleção dos genitores e o estabelecimento de grupos heteróticos, sendo que os efeitos genéticos normalmente podem ser considerados como aleatórios. A forma tradicional de análise inclui tais efeitos na matriz de incidência dos efeitos fixos e emprega o método dos mínimos quadrados ordinários, o que impossibilita a análise usando a metodologia dos modelos mistos. Os objetivos deste trabalho foram comparar os resultados das análises dialélicas obtidas considerando o modelo fixo e o modelo misto e avaliar a eficiência do melhor preditor linear não viesado (BLUP) para predição de cruzamentos não realizados entre linhagens de milho, utilizando informações de marcadores moleculares RFLP para a estimação da matriz de parentesco. Foram considerados dados de 80 híbridos interpopulacionais e 20 testemunhas comerciais, avaliados em um látice 10 x 10 em três locais. Esses híbridos foram obtidos pelo cruzamento entre 8 linhagens do grupo heterótico BR-105 e 10 do grupo BR-106, as quais foram genotipadas com marcador RFLP. A análise dialélica foi realizada segundo a metodologia que considera o modelo genético como fixo e usa o método dos mínimos quadrados ordinários, e também usando a metodologia de modelos mistos, assumindo que a capacidade geral de combinação (CGC) dos dois grupos heteróticos e a capacidade específica de combinação (CEC) representam efeitos aleatórios. Além disso, foi avaliada a predição de híbridos simples não realizados, com base na matriz de covariâncias genéticas entre o híbrido não realizado e os híbridos preditores, usando as informações do marcador RFLP. Como todos os híbridos foram obtidos, foi simulada a retirada de cada um deles do conjunto, sendo sua performance predita a partir dos 79 restantes. Os resultados mostraram que, na comparação entre as análises dialélicas obtidas com as duas metodologias, embora os valores da CGC das linhagens da população BR-106 e da CEC tenham baixa correlação entre as duas metodologias (r=-0,11 e r=-0,06, respectivamente), a classificação dos híbridos mais produtivos sofre poucas alterações (r=0,99) e não causa dificuldades na seleção. A eficiência do BLUP para predição de cruzamentos não realizados entre linhagens de milho, utilizando informações de marcadores moleculares para a estimação da matriz de parentesco, mostrou a existência de moderada correlação entre os valores dos BLUP’s da produção de grãos e os valores preditos a partir dos híbridos observados restantes (r=0,35), o que indica que essa metodologia tem capacidade em predizer a estimativa de valores não observados, porém com alguma imprecisão. Os mesmos resultados foram observados entre as capacidades específicas de combinação observadas e as preditas (r=0,30). Conclui-se que a metodologia de modelos mistos pode ser usada, desde que com ressalvas, dada as correlações moderadas. / The obtainment of maize single crosses is related with increasing in productivity. To do so, inbred lines derived of different heterotic groups are crossed. These groups are established in such a way that the genetic divergences among them are maximized. Using diallel crosses can facilitate the choice of the inbred lines to be crossed. The models used to perform these analyses allow estimating genetic parameters that are useful in the selection of parental lines and in determining the heterotic groups. In these models, generally, the genetic effects are considered as random. However, these analyses are usually performed considering these effects in the matrix of fixed effects, and obtaining the parameter estimates according to the ordinary least squares method, making impossible using mixed linear models theory. The aims of this research were to compare the results of diallel analyses obtained by using fixed and mixed models, and evaluate the efficiency of the best linear unbiased predictor (BLUP) in predicting non-realized single crosses. Eighty interpopulation hybrids and twenty commercial checks were evaluated in a 10 x 10 lattice design with two replications located in three environments. These single crosses were obtained by crossing eight and ten inbred lines from BR-105 and BR-106 heterotic groups, respectively. These eighteen lines were genotyped by using RFLP molecular markers and then the coefficient of parentage among them was estimated. The genetic parameters general (GCA) and specific (SCA) combining abilities were estimated through diallel analyses, considering the linear model as fixed and using the ordinary least squares as the estimation method. Besides, GCA and SCA were predicted using BLUP and assuming the genetic effects as random. Besides, the prediction of non-realized single crosses was evaluated. To do so, each one of the 80 realized hybrids was predicted based on information of the others 79 single crosses and using the genetic variance-covariance matrix estimated using RFLP information. According to the results, it was found poor correlation between estimatives and predictions obtained considering the model as fixed or mixed, for GCA within BR-106 population (r=-0.11) and for SCA (r=-0.06). However, the ranking of the single crosses for productivity did not change (r=0.99) and did not make selection process more difficult. The efficiency of BLUP in predicting unrealized single crosses was moderated since the correlation between observed and predicted values was r=0.35, indicating some imprecision in these predictions. Similar results were obtained when comparing observed and predicted SCAs (r=0.30). It was possible to conclude that BLUP can be useful in diallel analyses and in prediction of single crosses, but some caution have to be account since the correlations presented moderate values.
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Estimação e diagnóstico na distribuição exponencial por partes em análise de sobrevivência com fração de cura / Estimation and diagnostics for the piecewise exponential distribution in survival analysis with fraction cure

Sibim, Alessandra Cristiane 31 March 2011 (has links)
O principal objetivo deste trabalho é desenvolver procedimentos inferências em uma perspectiva bayesiana para modelos de sobrevivência com (ou sem) fração de cura baseada na distribuição exponencial por partes. A metodologia bayesiana é baseada em métodos de Monte Carlo via Cadeias de Markov (MCMC). Para detectar observações influentes nos modelos considerados foi usado o método bayesiano de análise de influência caso a caso (Cho et al., 2009), baseados na divergência de Kullback-Leibler. Além disso, propomos o modelo destrutivo binomial negativo com fração de cura. O modelo proposto é mais geral que os modelos de sobrevivência com fração de cura, já que permitem estimar a probabilidade do número de causas que não foram eliminadas por um tratamento inicial / The main objective is to develop procedures inferences in a bayesian perspective for survival models with (or without) the cure rate based on piecewise exponential distribution. The methodology is based on bayesian methods for Markov Chain Monte Carlo (MCMC). To detect influential observations in the models considering bayesian case deletion influence diagnostics based on the Kullback-Leibler divergence (Cho et al., 2009). Furthermore, we propose the negative binomial model destructive cure rate. The proposed model is more general than the survival models with cure rate, since the probability to estimate the number of cases which were not eliminated by an initial treatment
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Detecting Influential observations in spatial models using Bregman divergence / Detecção de observações influentes em modelos espaciais usando divergência de Bregman

Danilevicz, Ian Meneghel 26 February 2018 (has links)
How to evaluate if a spatial model is well ajusted to a problem? How to know if it is the best model between the class of conditional autoregressive (CAR) and simultaneous autoregressive (SAR) models, including homoscedasticity and heteroscedasticity cases? To answer these questions inside Bayesian framework, we propose new ways to apply Bregman divergence, as well as recent information criteria as widely applicable information criterion (WAIC) and leave-one-out cross-validation (LOO). The functional Bregman divergence is a generalized form of the well known Kullback-Leiber (KL) divergence. There is many special cases of it which might be used to identify influential points. All the posterior distributions displayed in this text were estimate by Hamiltonian Monte Carlo (HMC), a optimized version of Metropolis-Hasting algorithm. All ideas showed here were evaluate by both: simulation and real data. / Como avaliar se um modelo espacial está bem ajustado? Como escolher o melhor modelo entre muitos da classe autorregressivo condicional (CAR) e autorregressivo simultâneo (SAR), homoscedásticos e heteroscedásticos? Para responder essas perguntas dentro do paradigma bayesiano, propomos novas formas de aplicar a divergência de Bregman, assim como critérios de informação bastante recentes na literatura, são eles o widely applicable information criterion (WAIC) e validação cruzada leave-one-out (LOO). O funcional de Bregman é uma generalização da famosa divergência de Kullback-Leiber (KL). Há diversos casos particulares dela que podem ser usados para identificar pontos influentes. Todas as distribuições a posteriori apresentadas nesta dissertação foram estimadas usando Monte Carlo Hamiltoniano (HMC), uma versão otimizada do algoritmo Metropolis-Hastings. Todas as ideias apresentadas neste texto foram submetidas a simulações e aplicadas em dados reais.
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Hierarquia e naturalidade, uma visão completa do problema e suas possíveis soluções / Hierarchy and naturalness, a complete vision on the problem and its possible solutions

Ronqui, Caique Meira 05 February 2018 (has links)
Submitted by CAIQUE MEIRA RONQUI null (cmeiraronqui@gmail.com) on 2018-04-05T02:12:52Z No. of bitstreams: 1 mestrado.pdf: 19390845 bytes, checksum: a1c62d106479845bd9047a91fbad6b1f (MD5) / Approved for entry into archive by Hellen Sayuri Sato null (hellen@ift.unesp.br) on 2018-04-05T16:59:15Z (GMT) No. of bitstreams: 1 ronqui_cm_me_ift.pdf: 19390845 bytes, checksum: a1c62d106479845bd9047a91fbad6b1f (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-05T16:59:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ronqui_cm_me_ift.pdf: 19390845 bytes, checksum: a1c62d106479845bd9047a91fbad6b1f (MD5) Previous issue date: 2018-02-05 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Elaboramos uma revisão de como o problema da hierarquia aparece na teoria Eletrofraca, pois entendemos que esse assunto ganhou importância e merece atenção especial. Apesar disso, notamos que muitos conceitos necessários para compreender a origem do problema encontram-se espalhados em diferentes livros e artigos, dificultando o acesso à informação. Por isso, apresentamos neste trabalho esses principais conceitos de maneira consolidada. / We develop a review on how the hierarchy problem appears in the Electroweak theory. Nowadays we think that this problem is greater in importance than it was in the past, so it deserves special attention, but we noticed several concepts needed to understand the problem are scattered in different books and papers, which hinders full access to information. Therefore, we intend to present the key subjects in a single document, because we didn't find similar work in previous studies. / 2015/19572-0
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Divergência genética em genótipos de cana-deaçúcar (Saccharum spp.) através de caracteres morfoagronômicos e por marcadores moleculares. / Genetic divergence in sugarcane genotypes (Saccharum spp.) through morphoagronomical characters and molecular markers.

Silva, Paulo Pedro da 30 August 2006 (has links)
This study had as objective to estimate the genetic divergence among sugarcane genotypes by means of morphoagronomical characters and molecular markers, and to verify the relation between these procedures. An experiment was conducted in Rio Largo, AL, using a randomized block design with four repetitions. The multivariated analysis of Principal Components, the genetic divergence based on the Mahalanobis 2 ii' D Generalized Distance, and the Average Euclidean Distance Standardized were used for the analysis of the quantitative characters. Based on these distances, a grouping analysis was performed by the More Distant Neighbor method and the UPGMA method, besides Tocher for 2 ii' D . Jaccard coefficient and UPGMA grouping were used in the evaluation of the genetic divergence by molecular markers and morphologic characters. The inconsistency as to formation of different groups between the Standardized Average Euclidean Distance and 2 ii' D of Mahalanobis characterize these two estimates as measures of different dissimilarity. In the same way, the grouping techniques by the More Distant Neighbor method and by UPGMA show graphical dispersions that are not coincident, with differences in relation to the number of groups and in the grouping pattern, while the grouping by UPGMA and obtained by Tocher showed the same agreements. The 2 ii' D Distance of Mahalanobis corresponded to the Principal Components technique, by showing the same groups made by Tocher and UPGMA, obtained from 2 ii' D . However, these techniques did not indicate agreement with the Standardized Average Euclidean Distance. The correlation between the genetic divergence through morphologic characters and estimated by molecular markers was significant, however, from average magnitude (r = 0,47), indicating to be complementary measurements. There was not significant correlation for the divergence obtained through quantitative characteristics with the morphologic characters and molecular markers obtained by the different estimators, as well as between Standardized Average Euclidean Distance and the Mahalanobis 2 ii' D , which indicates clearly that there is no relation between these estimates. / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Este trabalho teve como objetivos a estimação da divergência genética entre genótipos de cana-de-açúcar, por meio de caracteres morfoagronômicos e marcadores moleculares, e verificar a relação entre esses procedimentos. Foi conduzido um experimento em Rio Largo, AL, utilizando o delineamento em blocos casualisados com quatro repetições. Para a análise dos caracteres quantitativos foi utilizada a análise multivariada de Componentes Principais, divergência genética a partir da Distância Generalizada 2 ii' D de Mahalanobis e Distância Euclidiana Média Padronizada. Com base nestas distâncias, realizaramse análise de agrupamento pelo método Hierárquico do Vizinho mais Distante e método UPGMA, além de Tocher para 2 ii' D . Na avaliação da divergência genética por meio de marcadores moleculares e caracteres morfológicos, utilizou-se o coeficiente de Jaccard e agrupamento UPGMA. As inconsistências quanto à formação de diferentes grupos entre a Distância Euclidiana Média Padronizada e a Distância 2 ii' D de Mahalanobis caracterizam estas duas estimativas como medidas de dissimilaridade distintas. Da mesma forma as técnicas de agrupamento pelo método do Vizinho mais Distante e por UPGMA evidenciam dispersões gráficas não coincidentes, com diferenças quanto ao número de grupos e ao padrão de agrupamento, ao passo que o agrupamento por UPGMA e obtido por Tocher apresentaram a mesma concordância. A Distância 2 ii' D de Mahalanobis correspondeu à técnica de Componentes Principais, por apresentarem os mesmos grupos formados por Tocher e UPGMA, obtidos a partir de 2 ii' D . No entanto, estas técnicas não indicaram concordância com a Distância Euclidiana Média Padronizada. A correlação entre a divergência genética através de caracteres morfológicos e a estimada por marcadores moleculares foi significativa, porém, de média magnitude (r = 0,47), indicando serem medidas complementares. Não houve correlação significativa para a divergência obtida por meio de características quantitativas com os caracteres morfológicos e marcadores moleculares, obtida pelos diferentes estimadores, assim como, entre a Distância Euclidiana Média Padronizada e a 2 ii' D de Mahalanobis, o que indica claramente não existir qualquer relação entre estas estimativas.
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Eficiência nutricional para fósforo em linhagens de pimentão (Capsicum annuum L.) / Phosphorus efficiency of sweet pepper (Capsicum annuum L.) Lines

Moura, Waldênia de Melo 21 December 1995 (has links)
Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-10-06T15:42:24Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 21675326 bytes, checksum: 082faf2075cff63e9e468461265ca46e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-06T15:42:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 21675326 bytes, checksum: 082faf2075cff63e9e468461265ca46e (MD5) Previous issue date: 1995-12-21 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Foram avaliadas 10 linhagens de pimentão, quanto às suas exigências e eficiências nutricionais para fósforo. O experimento foi conduzido em casa de vegetação, em solo. Os tratamentos foram distribuídos em arranjo fatorial (10 x 5) x 4, constituídos de 10 linhagens, cinco doses de P (0, 250, 500, 750 e 1.000 mg de P/kg de solo) e quatro repetições, em delineamento de blocos casualizados. As linhagens apresentaram comportamentos diferenciados em resposta à adubação fosfatada, os quais foram decorrentes, principalmente, das variações na eficiência de utilização do fósforo no metabolismo e crescimento, uma vez que se observaram poucas diferenças na eficiência de absorção e de translocação do P entre as linhagens. A linhagem LlO destacou-se por apresentar alta eficiência para a maioria dos índices estudados. Também, as linhagens L7 e L8 mostraram bom desempenho, sendo a L8 nas menores doses de P (250 e 500 mg/kg) e a L7 nas maiores doses de P (750 e 1.000 mg/kg). Já as linhagens Ll e L2 apresentaram as menores eficiências para a maioria dos índices estudados. As demais linhagens exibiram comportamentos intermediários. De modo geral, todas as linhagens apresentaram níveis críticos de P na planta elevados, sendo as linhagens Ll, L3, L5 e L7 as mais exigentes em fósforo. Dentre as doses de P aplicadas no solo, a de 250 mg de P/kg foi a que melhor discriminou as linhagens, sendo, portanto, a indicada para estudos genéticos. Nesta dose, constatou-se que a produção de matéria seca da parte aérea foi o caráter que mais contribuiu para a divergência genética entre as linhagens, podendo ser um parâmetro adequado para seleção em estudos genéticos. / Ten sweet pepper (Capsicum annuum L.) lines were screened for phosphorus requirement and efficiency. An experiment was carried out in soil, in a greenhouse. The treatments were in a factorial layout (10 x 5) x 4, comprising ten lines, five doses of P (0, 250, 500, 750 and 1.000 mg P/kg soil) and four replications, in a randomized block desing. The differences among lines resulted from the variation in phosphorus utilization efficiency in the metabolism and growing, therefore low differences in the P-efficiency uptake and translocation among lines were observed. The LlO line showed high efficiency for the most index studied. The L8 line in P lowest doses (250 and 500 mg/kg soil) and L7 line in P highest doses (750 and 1.000 mg/kg soil) had both outstanding performance. The Ll and L2 lines, were the least efficient for the most index studied. The other lines were of intermediate efficiency. All lines had high plant critical levels of P, being the Ll, L3, L5 and L7 linesthe most exigent in phosphorus. The dose 250 mg P/kg soil was the best discrimination to rank the lines, therefore, being indicated for genetic studies. At this dose, it was verified that shoot dry matter was the caracteristic that contributed most for genetic divergence among lines, and it should be an adequate parameter for screening in genetic studies.
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Detecting Influential observations in spatial models using Bregman divergence / Detecção de observações influentes em modelos espaciais usando divergência de Bregman

Ian Meneghel Danilevicz 26 February 2018 (has links)
How to evaluate if a spatial model is well ajusted to a problem? How to know if it is the best model between the class of conditional autoregressive (CAR) and simultaneous autoregressive (SAR) models, including homoscedasticity and heteroscedasticity cases? To answer these questions inside Bayesian framework, we propose new ways to apply Bregman divergence, as well as recent information criteria as widely applicable information criterion (WAIC) and leave-one-out cross-validation (LOO). The functional Bregman divergence is a generalized form of the well known Kullback-Leiber (KL) divergence. There is many special cases of it which might be used to identify influential points. All the posterior distributions displayed in this text were estimate by Hamiltonian Monte Carlo (HMC), a optimized version of Metropolis-Hasting algorithm. All ideas showed here were evaluate by both: simulation and real data. / Como avaliar se um modelo espacial está bem ajustado? Como escolher o melhor modelo entre muitos da classe autorregressivo condicional (CAR) e autorregressivo simultâneo (SAR), homoscedásticos e heteroscedásticos? Para responder essas perguntas dentro do paradigma bayesiano, propomos novas formas de aplicar a divergência de Bregman, assim como critérios de informação bastante recentes na literatura, são eles o widely applicable information criterion (WAIC) e validação cruzada leave-one-out (LOO). O funcional de Bregman é uma generalização da famosa divergência de Kullback-Leiber (KL). Há diversos casos particulares dela que podem ser usados para identificar pontos influentes. Todas as distribuições a posteriori apresentadas nesta dissertação foram estimadas usando Monte Carlo Hamiltoniano (HMC), uma versão otimizada do algoritmo Metropolis-Hastings. Todas as ideias apresentadas neste texto foram submetidas a simulações e aplicadas em dados reais.
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Variabilidade de caracteres nutricionais e de produtividade de grãos em cultivares de milho / Variability of nutritional and productivity characters of grains in maize cultivars

Alves, Bruna Mendonça 19 February 2013 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / This study aimed to verify whether there is genetic variability regarding nutritional and productivity characters of grains among cultivars of early cycle, very early cycle and transgenic maize and whether variability exists, discuss the differences among the cultivars, in order to select cultivars for crossing. It was used data of three experiments conducted during the harvest 2009/2010, at the experimental area of the Plant Science Department of the Federal University of Santa Maria. During these experiments were analyzed 76 maize cultivars, being 36 of early cycle, 22 of very early cycle and 18 of transgenic cultivar. In each experiment, after the harvest, in each of the three replicates of each cultivar, it was measured the following variables: grain productivity, crude protein, lysine, methionine, cysteine, threonine, tryptophan, valine, isoleucine, leucine, phenylalanine, histidine, arginine, ethere extract, starch and amylose in percentage of crude material. For each experiment, it was made an analysis of variance of each variable, according to a randomized block design. The averages of cultivars were compared by using Scott-Knott test. For each experiment was used the cluster analysis. Initially, discarding of variables was done in three steps: 1) Removal of variables without significant importance for the cultivar (F test of ANOVA), 2) Removal of variables that increase multicollinearity in the correlation matrix among the variablesand 3) Removal of variables by main components analysis. With the remaining variables was determined the Mahalanobis distance matrix (D2) and the cultivar clustering was done by using UPGMA method. Posteriorly, it was built a dendogram and calculated the cophenetic correlation coefficient. In order to test the hypothesis of differences among the average profile, for each experiment, it was calculated the evaluation of multivariate analysis of variance. There is variability among the early cycle, very early cycle and transgenic cultivars regarding grain productivity and nutritional characters in maize. Except starch which showed no variability in early cycle cultivar and transgenic cultivar, and methionine variables for transgenic cultivars. Based on variables grain productivity, crude protein and amylose, three groups were formed for early maturity cultivars, three groups for veryearly cycle cultivars and two groups for transgenic cultivars. / O presente trabalho teve como objetivos, verificar se há variabilidade genética, em relação aos caracteres nutricionais e à produtividade de grãos, entre as cultivares de ciclo precoce, de ciclo superprecoce e transgênicas de milho, e, existindo variabilidade, avaliar a divergência genética entre as cultivares com a finalidade de selecionar cultivares para cruzamentos. Foram utilizados os dados de três experimentos conduzidos na safra agrícola 2009/2010, na área experimental do Departamento de Fitotecnia, da Universidade Federal de Santa Maria. Nesses experimentos, foram avaliadas 76 cultivares de milho, sendo 36 de ciclo precoce, 22 de ciclo superprecoce e 18 cultivares transgênicas. Em cada experimento, após a colheita, em cada uma das três repetições de cada cultivar, foram mensuradas as seguintes variáveis: produtividade de grãos, proteína bruta, lisina, metionina, cisteina, treonina, triptofano, valina, isoleucina, leucina, fenilalanina, histidina, arginina, extrato etéreo, amido e amilose em porcentagem da matéria bruta (%MB). Para cada experimento, foi realizada a análise de variância de cada variável, conforme o modelo matemático de blocos ao acaso. As médias das cultivares foram comparadas por meio do teste de Scott-Knott. Para cada experimento foi realizada a análise de agrupamento. Para isso, inicialmente foi feito o descarte de variáveis em três etapas: 1) retirada de variáveis sem efeito significativo para cultivar (teste F da ANOVA); 2) retirada de variáveis causadoras de multicolinearidade na matriz de correlação entre as variáveis e; 3) descarte de variáveis por meio da análise de componentes principais. Após, com as variáveis que permaneceram. Com as variáveis que permaneceram foi determinada a matriz de distância de Mahalanobis (D2) e o agrupamento das cultivares foi realizado por meio do método UPGMA. Posteriormente, foi construído um dendrograma e calculado o coeficiente de correlação cofenética (CCC). Para testar a hipótese da diferença entre os perfis de médias de cada grupo, para cada experimento, foi realizada a análise de variância multivariada. Há variabilidade entre as cultivares de ciclo precoce, de ciclo superprecoce e cultivares transgênicas em relação à produtividade de grãos e aos caracteres nutricionais de grãos de milho. O amido não apresentou variabilidade em cultivares de ciclo precoce e cultivares transgênicas e a variável metionina para cultivares transgênicas. Com base nas variáveis produtividade de grãos, proteína bruta e amilose, foram formados três grupos para as cultivares de ciclo precoce, três grupos para as cultivares de ciclo superprecoce e dois grupos para as cultivares transgênicas.

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