Submitted by TATIANE CRISTINA SELEGUIM CHUD null (tatischud@gmail.com) on 2018-03-13T20:36:16Z No. of bitstreams: 1 Tese_Tatiane_Cristina_Seleguim_Chud.pdf: 4849443 bytes, checksum: b950a6891cf2829637cfa58f2ae8367a (MD5) / Approved for entry into archive by Neli Silvia Pereira null (nelisps@fcav.unesp.br) on 2018-03-16T18:20:58Z (GMT) No. of bitstreams: 1 chud_tcs_dr_jabo.pdf: 4849443 bytes, checksum: b950a6891cf2829637cfa58f2ae8367a (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-16T18:20:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 chud_tcs_dr_jabo.pdf: 4849443 bytes, checksum: b950a6891cf2829637cfa58f2ae8367a (MD5) Previous issue date: 2018-02-23 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Com o avanço das tecnologias genômicas, permitiu-se detectar no genoma de humanos e animais domésticos elevado número de variações estruturais cromossômicas, como variação no número de cópias (CNV). No melhoramento genético de animais domésticos, CNVs podem auxiliar no entendimento da variabilidade genética de características de importância econômica, pois a maioria dessas regiões influenciam a expressão de genes com funções biológicas específicas. Com a finalidade de verificar possíveis relações de CNVs com características de sanidade, reprodutivas e produtivas em rebanhos leiteiros, o objetivo deste trabalho foi detectar e caracterizar CNVs em bovinos da raça composta Girolando (Gir X Holandês), identificar CNVs específicas em animais Girolando oriundas de animais da raça Gir e Holandês e investigar a diferenciação populacional entre as três raças por meio da variação no número de cópias nas regiões próximas aos genes anotados no genoma bovino. Para detecção das CNVs por meio dos dados de painel de polimorfismo de nucleotídeo único (SNP), no capítulo 2, foram utilizados registros de 1.607 vacas genotipadas com painel de SNP de média densidade (50K SNP) e de 280 touros genotipados com painel de alta densidade (HD SNP). A detecção foi realizada por meio do modelo oculto de Markov implementado pelo programa PennCNV. Foram utilizados dois touros ressequenciados para identificação das CNVs pelo método “read -depth” por meio dos dados de sequenciamento de nova-geração (NGS). Um total de 203 e 213 regiões candidatas de CNVs foram selecionadas pelos painéis de 50K e HD, respectivamente. Deleções e duplicações relacionadas a resistência a parasitas, susceptibilidade à doenças e reprodução, foram encontradas principalmente nos cromossomos BTA 5 e BTA 17. A detecção e caracterização das CNVs realizadas em bovinos de leite de raça composta demonstrou melhor entendimento das características de adaptabilidade ao clima tropical, como resistência à doenças e eficiência reprodutiva. No capítulo 3, foram utilizados cinco animais da raça Holandês, 14 animais da raça Gir e dois animais da raça Girolando. Após o alinhamento do genoma foi realizada a detecção das CNVs pela metodologia baseada em “read-depth”. A estatística VST.foi calculada pela média do número de cópias nas regiões próximas aos genes anotados no genoma bovina. Genes relacionados com fertilidade (MEPCE, ASB3) e susceptibilidade às doenças (HLX, MIR-455) foram anotados nas regiões específicas compartilhadas entre Girolando e as raças formadoras (Gir e Holandês). Os valores de VST variaram de -0,37 a 0,98. Os genes AOX1, SLBP, TACC3 e PRAME, apresentaram elevado VST, indicando diferenciação populacional pelo número de cópias, possivelmente originárias durante os processos de domesticação das subespécies. Regiões especificas de CNVS foram identificadas nos animais Girolando provenientes do Gir e do Holandês. O estudo de diferenciação populacional evidenciou seleção positiva no genoma de animais da raça Gir e Girolando para características relacionadas à adaptação desses animais aos ambientes de clima tropical, possivelmente originadas do processo de domesticação. / The advances of the genomic technologies has enabled to identify a high number of chromosomal structural variations in human and domestic animal genomes, such as copy number variation (CNV). In animal breeding, CNVs may assist to understand genetic variability of the economic important traits due most of the CNVs influence gene expression with specific biological functions. To identify possible CNVs linked to health, reproductive and productive traits in dairy cattle, the objective of this work was to detect and to describe CNVs in Girolando cattle (Gir x Holstein), to identify breed-specific CNV regions in Girolando from Gir and Holstein, and to investigate the population differentiation among the breeds using the copy number located on regions within annotated genes. In chapter 2, the CNV detection using single-nucleotidepolymorphism (SNP) panel was carried out on 1.607 females genotyped with the medium-density SNP panel (50K SNP) and 280 bulls genotyped with high-density panel (HD SNP) using Hidden Markov model implemented by PennCNV software. CNV calling also was perform using read-depth method applied on next-generation sequencing (NGS) data from two bulls resenquenced. A total of 203 and 213 CNVs candidate’s regions were picked using 50K e HD panels, respectively. Deletions and duplications related to parasite resistance, to disease susceptibility, and to reproductive efficiency was observed mainly located on chromosome BTA 5 and BTA 17. The detection and characterization of the CNVs in composite dairy cattle breed demonstrated better understanding of the traits, such disease resistance and reproductive efficiency. In chapter 3, the CNV calling was carried out on three Girolando bulls, 14 Gir bulls, and five Holstein bulls resequenced using the “readdepth” method implemented by CNVnator software. The VST statistic was calculated for the average of the copy number in regions located near annotated genes. Genes linked to fertility (MEPCE, ASB3) and disease susceptibility (HLX, MIR-455) were mapped on specific regions shared between Girolando and the pure-breeds (Gir ans Holstein). VST values ranged from -0.37 to 0.98. The genes AOX1, SLBP, TACC3 and PRAME, showed high VST, indicating high level of the population differentiation for the copy number located on the regions near of these genes. We found CNVR regions in Girolando specific from Gir and Holstein. The population differentiation study evidenced positive selection in genome of the Gir and Girolando animals for traits related to the adaptability of the breeds in tropical environmental may have originated from the domestication process. / FAPESP : 15/08939-0

Transições de floresta-campo são encontradas em diversas regiões do mundo. Sob condições climáticas favoráveis, tem-se observado um padrão de aumento na densidade de lenhosas e expansão florestal sobre áreas de vegetação campestre. Este trabalho tem como objetivo identificar diferenças de composição de espécies lenhosas e composição funcional entre comunidades florestais e de transição, bem como identificar padrões funcionais destas comunidades em resposta a gradientes de clima e solo. Para tanto, foram coletados dados em 18 áreas de transição floresta-campo no sul do Brasil, considerando a densidade de espécies lenhosas e atributos foliares mensurados em cada habitat (floresta e transição). Os sítios de amostragem foram descritos por variáveis de clima e solo, gerando assim três matrizes ambientais (E): tipo de habitat, climática e edáfica. A análise dos dados envolveu ajustes de Procrustes entre matriz T (atributos médios da comunidade ponderados pela abundância das espécies) e matriz E (r (TE)) para detectar padrões de convergência de atributos, e entre diversidade funcional (R) e matriz E (r (RE)) para detectar padrões de divergência, relacionando estes padrões a cada matriz E. Os resultados indicaram padrões de convergência e divergência em relação à matriz de habitat. Comunidades florestais e de transição diferiram em termos de média de SLA e área foliar, e também quanto à diversidade funcional (ambos com valores maiores na floresta). Considerando os gradientes ambientais, as comunidades de ambos os habitats apresentaram padrões de convergência com o clima e o solo. Em matéria de clima, o principal resultado foi em relação ao SLA, com valores mais altos em áreas de florestas estacionais. Quanto ao solo, as comunidades florestais demonstraram uma associação de SLA e espessura da folha com o gradiente de matéria orgânica / fertilidade, porém as comunidades de transição não apresentaram padrões claros. Padrões de divergência em relação ao solo foram observados para ambos os habitats, mas só a floresta apresentou divergência em relação ao gradiente climático. Concluímos que, apesar das diferenças locais entre habitats em termos de composição de espécies lenhosas e estratégias funcionais, as comunidades de transição e de floresta estão respondendo de forma semelhante aos gradientes climáticos regionais. No geral, as espécies lenhosas demonstram ter estratégias funcionais relacionadas a atributos foliares que tem possibilitado o processo de adensamento de lenhosas em ecossistemas campestres em áreas de transição de floresta-campo. / Forest-grassland transitions are found in many different regions of the world. Through favorable climatic conditions, a pattern of woody encroachment and forest expansion over open grassy areas is observed. This work aims at identifying species composition and functional differences between forest and transition communities concerning woody plants, as well as functional patterns of communities in response to climate and soil gradients. We collected data in 18 forest-grassland transition areas in southern Brazil, considering woody plant species density and leaf traits that were measured for each habitat (forest and transition). Sites were described by climate and soil variables, leading to three different environmental matrices (E): habitat-type, climatic, and soil gradient. Data analysis involved Procrustes adjustment between matrix T (community-weighted mean traits) and matrix E (r(TE)) to detect trait-convergence, and between functional diversity (R) and matrix E (r(RE)) to detect patterns of divergence related to each matrix E. Results showed convergence and also divergence concerning the habitat-type matrix. Forest and transitional communities differed in terms of SLA and leaf area community-weighted means, and also in functional diversity. Concerning the environmental gradients, either forest or transition habitats presented convergence patterns with climate and soil gradients. Main results concerning climate were related to higher SLA at seasonal forest sites. As for soil, forest communities have demonstrated an association of SLA and leaf thickness with the organic matter/fertility gradient, but transition didn’t present clear patterns. Concerning alpha-divergence both habitats responded to soil gradients, but only forest presented divergence concerning climate. We conclude that although woody species of both habitats locally differed in species composition and their functional strategies, communities of forest and grassland transitions are responding similarly to broader climate gradients. Overall woody species seem to have leaf traits strategies that enabled the encroachment process of grassy ecosystems in forest-grassland transitions.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-11-01T15:06:18Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Karla da Silva Carneiro - 2017.pdf: 3925004 bytes, checksum: 34919ba64c10b1240fa3e19cf38d927a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-11-01T15:53:42Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Karla da Silva Carneiro - 2017.pdf: 3925004 bytes, checksum: 34919ba64c10b1240fa3e19cf38d927a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-11-01T15:53:42Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Karla da Silva Carneiro - 2017.pdf: 3925004 bytes, checksum: 34919ba64c10b1240fa3e19cf38d927a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-12-21 / Financiadora de Estudos e Projetos- Finep / In Brazil, the history of sugarcane is related to the social, economic and politic country development. Sugarcane cultivation is considered as the first organized economic activity in the country. The main purpose of sugarcane cultivation is for sugar and biofuel production, but in recent years the energy production from its biomass has also been explored, increasing the attention for this crop. Modern cultivated sugarcane varieties are hybrids from interspecific crosses between S. officinarum and S. spontaneum. The genetic breeding has given many contributions to sugarcane production and exploration, by the development of superior genotypes. The main sources of variability used in breeding programs are the germplasm banks. However, to explore these resources efficiently it is necessary to have basic information on the available levels of genetic diversity and on its structure, to support decisions on how they can be used in breeding programs. The purpose of this work was to characterize the genetic diversity and structure of a base population from the Ridesa/UFG sugarcane breeding program. A sample of 160 sugarcane clones were genotyped using 37,914 SNP markers. The population showed medium levels of genetic diversity. The average Nei’s gene diversity index was estimated to be 0,173, while the medium observed heterozygosity was a little higher (0,236). The genetic divergence, estimated by Roger’s modified distance varied from 0,20 to 0,30. SNP markers were efficient to identify individuals that are genetic divergent or similar, even without genealogy information. The population structure analysis, performed with the software Structure, suggested the existence of two clusters. Each clone had a fraction of its genome inside these two clusters, corroborating the fact that modern sugarcane cultivars are essentially hybrids. Our results suggest that, given the low level of genetic structure among clones, from the breeding programs standpoint, the evaluated population can be managed as weakly structured, although some small groups, including a small number of clones, had been detected. Among the evaluated clones, the least divergent pairs were those formed by the genotypes 023 and 011, and 066 and 036. The most divergent pairs were formed by the clones 131 and 084, and 131 and 063. / A história da cana-de-açúcar está intimamente relacionada com o desenvolvimento social, econômico e político do Brasil, sendo considerada por muitos como a primeira atividade economicamente organizada no país. A cana-de-açúcar é matéria prima para a produção de açúcar e etanol, tendo sido também utilizada nos últimos anos para a produção de energia. As modernas variedades de cana-de-açúcar são híbridos poliploides decorrentes do cruzamento interespecífico entre S. officinarum e S. spontaneum. O melhoramento genético tem contribuído de maneira importante para o setor, pelo desenvolvimento de genótipos superiores. O ponto de partida destes programas de melhoramento são os bancos de germoplasma. Para que esse recurso seja explorado de forma eficiente é preciso que as informações básicas, que irão permitir o dimensionamento da magnitude da diversidade genética disponível, sejam geradas. O presente trabalho teve como objetivo realizar a caracterização genética molecular de uma população base do programa de melhoramento genético da Ridesa/UFG, representada por uma amostra de 160 clones, pela utilização de 37.914 marcadores SNPs. A diversidade genética revelada por estes marcadores, em que a dosagem de cada alelo não é detectável em cada genótipo, em decorrência da poliploidia, foi de magnitude intermediária, com índice de diversidade genética de Nei estimado em 0,173. A estimativa de heterozigosidade média observada apresentou valor mais elevado 0,236. As estimativas de divergência genética obtidas pela distância de Rogers modificada por Wright variaram entre 0,20 e 0,30. Na análise de agrupamento foram identificados sete grupos de clones. O uso de SNPs foi eficiente em identificar pares de indivíduos geneticamente divergentes, mesmo sem dispor de informações de genealogia. A análise de estruturação genética pelo software Structure sugeriu, a princípio, a existência de dois grupos. Cada clone, no entanto, se revelou constituído por uma mistura relativamente homogênea dos dois grupos identificados, confirmando a natureza híbrida das cultivares modernas de cana-de-açúcar. Estes resultados sugerem que, dada o reduzido nível de estruturação da diversidade genética ao nível de clones, do ponto de vista de melhoramento, a população possa ser considerada como um grupo fracamente estruturado, com a presença de poucos grupos envolvendo pequeno número de genótipos. Entre os clones avaliados, os pares menos divergentes são constituídos pelos genótipos 023 e 011, e 066 e 036. Os pares mais divergentes são constituídos pelos clones 131 e 084, e 131 e 063.

Transições de floresta-campo são encontradas em diversas regiões do mundo. Sob condições climáticas favoráveis, tem-se observado um padrão de aumento na densidade de lenhosas e expansão florestal sobre áreas de vegetação campestre. Este trabalho tem como objetivo identificar diferenças de composição de espécies lenhosas e composição funcional entre comunidades florestais e de transição, bem como identificar padrões funcionais destas comunidades em resposta a gradientes de clima e solo. Para tanto, foram coletados dados em 18 áreas de transição floresta-campo no sul do Brasil, considerando a densidade de espécies lenhosas e atributos foliares mensurados em cada habitat (floresta e transição). Os sítios de amostragem foram descritos por variáveis de clima e solo, gerando assim três matrizes ambientais (E): tipo de habitat, climática e edáfica. A análise dos dados envolveu ajustes de Procrustes entre matriz T (atributos médios da comunidade ponderados pela abundância das espécies) e matriz E (r (TE)) para detectar padrões de convergência de atributos, e entre diversidade funcional (R) e matriz E (r (RE)) para detectar padrões de divergência, relacionando estes padrões a cada matriz E. Os resultados indicaram padrões de convergência e divergência em relação à matriz de habitat. Comunidades florestais e de transição diferiram em termos de média de SLA e área foliar, e também quanto à diversidade funcional (ambos com valores maiores na floresta). Considerando os gradientes ambientais, as comunidades de ambos os habitats apresentaram padrões de convergência com o clima e o solo. Em matéria de clima, o principal resultado foi em relação ao SLA, com valores mais altos em áreas de florestas estacionais. Quanto ao solo, as comunidades florestais demonstraram uma associação de SLA e espessura da folha com o gradiente de matéria orgânica / fertilidade, porém as comunidades de transição não apresentaram padrões claros. Padrões de divergência em relação ao solo foram observados para ambos os habitats, mas só a floresta apresentou divergência em relação ao gradiente climático. Concluímos que, apesar das diferenças locais entre habitats em termos de composição de espécies lenhosas e estratégias funcionais, as comunidades de transição e de floresta estão respondendo de forma semelhante aos gradientes climáticos regionais. No geral, as espécies lenhosas demonstram ter estratégias funcionais relacionadas a atributos foliares que tem possibilitado o processo de adensamento de lenhosas em ecossistemas campestres em áreas de transição de floresta-campo. / Forest-grassland transitions are found in many different regions of the world. Through favorable climatic conditions, a pattern of woody encroachment and forest expansion over open grassy areas is observed. This work aims at identifying species composition and functional differences between forest and transition communities concerning woody plants, as well as functional patterns of communities in response to climate and soil gradients. We collected data in 18 forest-grassland transition areas in southern Brazil, considering woody plant species density and leaf traits that were measured for each habitat (forest and transition). Sites were described by climate and soil variables, leading to three different environmental matrices (E): habitat-type, climatic, and soil gradient. Data analysis involved Procrustes adjustment between matrix T (community-weighted mean traits) and matrix E (r(TE)) to detect trait-convergence, and between functional diversity (R) and matrix E (r(RE)) to detect patterns of divergence related to each matrix E. Results showed convergence and also divergence concerning the habitat-type matrix. Forest and transitional communities differed in terms of SLA and leaf area community-weighted means, and also in functional diversity. Concerning the environmental gradients, either forest or transition habitats presented convergence patterns with climate and soil gradients. Main results concerning climate were related to higher SLA at seasonal forest sites. As for soil, forest communities have demonstrated an association of SLA and leaf thickness with the organic matter/fertility gradient, but transition didn’t present clear patterns. Concerning alpha-divergence both habitats responded to soil gradients, but only forest presented divergence concerning climate. We conclude that although woody species of both habitats locally differed in species composition and their functional strategies, communities of forest and grassland transitions are responding similarly to broader climate gradients. Overall woody species seem to have leaf traits strategies that enabled the encroachment process of grassy ecosystems in forest-grassland transitions.

Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2016-08-23T12:27:17Z No. of bitstreams: 1 Miguel Santana de Almeida Neto.pdf: 1157651 bytes, checksum: 9441b1beb74a542d2c1f48a97e3fcee5 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-23T12:27:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Miguel Santana de Almeida Neto.pdf: 1157651 bytes, checksum: 9441b1beb74a542d2c1f48a97e3fcee5 (MD5) Previous issue date: 2012-12-05 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The morphological patterns shown in the species result from the interactions between their phenotype, genotype, and environment through adaptive and evolutionary processes. Thus, this study aims to evaluate the role of phylogeny and feeding in the morphological patterns of the species of Characiformes order, testing the hypothesis that the environmental pressure interferes in the morphological patterns presented by species causing morphological divergence or convergence between them. The site selected for this research was the pond Curralinho, an marginal pond of the Rio São Francisco, located in the state of Pernambuco. In this work we used the twelve species of the Order Characiformes more abundant in the ecosystem evaluated, which were captured in the period from March/2007 to February/2008 Through morphological data and diet analysis, we found that segregation of Characiformes in morphologically distinct groups, reflecting dietary differences. Therefore, morphologically similar species tending to occupy the same trophic guild. The piscivorous Acestrorhynchus britskii, Acestrorhynchus lacustris, Hoplias malabaricus, Serrasalmus brandtii and Pygocentrus piraya showed morphological characteristics that allowed ingest relatively large prey. However, we observed differences in the efficacy of swimming performance of these piscivorous, indicating that the piscivorous that eat whole fish exhibit greater agility swimming performance in order to capture your evasive preys that presented adaptations to avoid and escape the predators. The species Roeboides xenodon and Leporinus reinhardti also preferably used fish in their diets, however, the morphology of these species did not show any adjustments found in majority of the piscivorous. The less swimming speed was evidentiated among the members of the guilds insectivorous and omnivorous, that using food items with lower mobility than fish, like insects, or immobile, such as vegetables. This lower efficiency in swimming performance does not seem to characterize a disadvantage for these species. These appear to preferentially occupy the margin of the water body, which offers greater resource availability for these fish. The relationship between morphology and trophic ecology was confirmed by the Mantel test. This test indicated that the ecological structure of the taxocenosis evaluated probably been shaped by evolutionary adaptations for use of a given resource. These adaptations may be evident when we observe the processes of adaptive convergence and divergence. / Os padrões morfológicos apresentados pelas espécies resultam da interação entre seu fenótipo, genótipo e ambiente, através de processos adaptativos e evolutivos. Dessa forma, este trabalho objetiva avaliar o papel da filogenia e do hábito alimentar nos padrões morfológicos das espécies da Ordem Characiformes, testando a hipótese de que a pressão ambiental interfere nos padrões morfológicos apresentados pelas espécies a ponto de causar divergência ou convergência morfológica entre elas. O local selecionado para esta pesquisa foi a lagoa Curralinho, uma lagoa marginal do Rio São Francisco, localizada no estado de Pernambuco. Neste trabalho foram utilizadas as doze espécies da Ordem Characiformes mais abundantes no ecossistema avaliado, sendo elas capturadas no período de março/2007 a fevereiro/2008. Através de dados morfológicos e análise da dieta, verifica-se que a segregação dos Characiformes em grupos morfologicamente distintos, refletiu de um modo geral, suas diferenças alimentares, com as espécies morfologicamente semelhantes propendendo a ocupar uma mesma categoria trófica. Os piscívoros Acestrorhynchus britskii, Acestrorhynchus lacustres, Hoplias malabaricus, Pygocentrus piraya e Serrasalmus brandtii apresentaram características morfológicas que os permitiram ingerir presas relativamente maiores. No entanto entre esses piscívoros observam-se diferenças na eficiência natatória, indicando que os piscívoros que ingerem peixes inteiros apresentam uma maior agilidade natatória para capturar suas presas evasivas, que se deslocam e apresentam adaptações para fugir de seus predadores. As espécies Roeboides xenodon e Leporinus reinhardti, também utilizaram preferencialmente peixes em suas dietas, no entanto, a morfologia dessas espécies não apresentou as adaptações encontradas na maioria dos piscívoros. A menor velocidade de natação foi evidenciada entre os integrantes das categorias insetívora e onívora, que utilizam itens alimentares com menor mobilidade que os peixes, como os insetos, ou imóveis, como os vegetais. Esta menor eficiência natatória não parece caracterizar uma desvantagem para essas espécies, visto que essas parecem ocupar preferencialmente as margens do corpo d’água, que oferece uma maior disponibilidade de recursos para estes peixes. A relação entre morfologia e ecologia trófica, confirmada pelo teste de Mantel, indica que provavelmente a estruturação ecológica da taxocenose avaliada vem sendo conformada por adaptações evolutivas para utilização de um determinado recurso. Essas adaptações podem ser evidenciadas, quando se observam os processos de convergência e divergência adaptativas.

Exalting political rights as one of the fundamental elements of citizenship, the paper deals with the reflex ineligibility (or ineligibility resulting from kinship), enunciated in article 14, § 7 of the Federal Constitution, a limiting rule of the fundamental right to eligibility - the so-called ius honorum (right to be voted). The study therefore proposes to verify the degree of commitment that this restriction, when unjustified, entails to the own democracy, passing, therefore, the analysis of the dimensions of the citizenship, the fundamentality of the political rights and the conditions of eligibility and its limitations - including reflexive ineligibility - invoking the teleology of such a norm. It examines, centrally, a special factual circumstance in which the application of article 14, paragraph 7 of the Federal Constitution entails serious legal distortions, culminating in the supposition of reality by legal fiction and provoking an entirely adverse effect to what the norm has sought to protect: the proven political divergence between the holder of the elective mandate and the relative who wishes to exercise the fundamental right to be voted. Reasonability and proportionality are therefore invoked as grounds for judicial decisions that refer to the ineligibility of such circumstances, and also presents the new technological mechanisms offered in the information society as instruments to prove the ideological divergence and consequent legitimation of decisions in such cases. Everything with the scope of demonstrating, therefore, that such legal understanding aims, above all, the safeguard of the own democracy and the citizenship. / Exaltando os direitos políticos como um dos elementos fundamentais da cidadania, o trabalho versa sobre a inelegibilidade reflexa (ou inelegibilidade decorrente de parentesco), enunciada no artigo 14, § 7º da Constituição Federal, norma limitadora do direito fundamental à elegibilidade – o denominado ius honorum (direito de ser votado). O estudo propõe-se, assim, a verificar o grau de comprometimento que tal restrição, quando injustificada, acarreta à própria democracia, perpassando, para tanto, a análise das dimensões da cidadania, da fundamentalidade dos direitos políticos e das condições de elegibilidade e suas limitações – dentre as quais se insere a inelegibilidade reflexa – invocando, sobremaneira, a teleologia de tal norma. Examina, centralmente, circunstância fática especial na qual a aplicação do artigo 14, §7º da Constituição Federal acarreta graves distorções jurídicas, culminando com a suplantação da realidade pelo ficcionismo jurídico e provocando efeito inteiramente adverso ao que a norma intentou proteger: a comprovada divergência política entre o titular do mandato eletivo e o parente que pretende exercer o direito fundamental de ser votado. Invoca-se, assim, a razoabilidade e a proporcionalidade como fundamentos das decisões judiciais que relativizam a inelegibilidade reflexa em tais circunstâncias, apresentando, ainda, os novos mecanismos tecnológicos presentes na sociedade da informação como instrumentos de comprovação da divergência ideológica e consequente legitimação das decisões judicias em tais casos. Tudo com o escopo de demonstrar, assim, que tal compreensão jurídica visa, acima de tudo, a salvaguarda da própria democracia e da cidadania. / São Cristóvão, SE

Made available in DSpace on 2014-07-29T14:52:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese_UFG_Keyla_ORibeiro.pdf: 2021366 bytes, checksum: 719945fe498cc8ef7b6d15b1343d35dd (MD5) Previous issue date: 2011-04-26 / Soybean is currently the most prominent crop in the Brazilian production of grains. Its main products include oil and meal, which have been used for the production of food and animal feed. The high protein contents represent the main attraction of soybean use in diet. Furthermore, soybean oil has also been used in the production of biodiesel. These industrial segments demands cultivars with similar profiles of fatty acids, in which case the oil guarantees a better oxidative stability. This profile corresponds to oils with low polyunsaturated acids contents, associated to high contents of monounsaturated fatty acids. For that, it becomes essential the chemical characterization of grains in cultivars, which could be extended to the genetic resources preserved in germplasm collections, with the purpose of breeding soybean in these traits. Nowadays the characterization of these resources is still deficient, mainly regarding special traits such as those previously mentioned. In this context, the objective of this study was to characterize a sub-collection of 527 accessions of soybean from the germplasm bank of Secretaria de Agricultura, Pecuária e Abastecimento do Estado Goiás (SEAGRO-GO), based on the physicochemical traits of the grain, including protein and oil contents in the meal, and the main fatty acids contents of the oil. The grains were obtained through a field trial carried out at the experimental unit of SEAGRO-GO (16°43 S; 49°7 W; 765 m), county of Senador Canedo - GO, in the 2007-2008 growing season. The experimental design was augmented blocks (blocks of Federer), with two check cultivars (Conquista and Monsoy 6101). The plots were constituted by one row of plants (5.0 m x 0.5 m). The protein contents were quantified by the Kjeldahl method, the oil by the Soxhlet method, and the fatty acids (palmitic, stearic, oleic, linoleic and linolenic) by FAME method (Fatty Acid Methyl Esters). To assess the genetic divergence among accessions the multivariate analyses used were: canonical variables, principal components and cluster analysis. The last one was performed by the hierarchical clustering method using UPGMA criteria. Canonical discriminant analysis was also performed on established similarity groups and on maturity groups of the accessions (early, intermediate and late). In the principal components analysis it was needed three components to retain 78% of the total variance, whereas in the canonical variables analysis only two of these variables captured 81.2% of this variation. About the phenotypic variation, it was observed that the studied sub-collection presents a relatively lowl variability among its accessions, in protein content (from 35.7% to 44.0%) and oil content (from 14.8% to 18.5%). For fatty acids, the germplasm showed a relatively wide variation, although characteristics of industrial interest such as high contents of oleic acid (greater than 40%) and low contents of polyunsaturated acids (less than 40%) are restricted to few accessions. Regarding the polyunsaturated acids, the germplasm presents satisfactory variability to the linoleic oil (omega-6), however, low variability to the linolenic acid (omega-3), especially in its upper limit. By cluster analysis they were established five similarity groups (A, B, C, D, and E) with the formation of subgroups in some them. The accessions of groups A and B present the largest oil and protein contents, respectively. The accessions of group C outstood with the best profile of oil quality (oxidative stability), and they were followed by the accessions of E and B groups. Among the germplasm with the best profiles of oil oxidative stability, it was still possible to identify in this collection five divergent groups of accessions with significant differences in fatty acids contents. The polyunsaturated and saturated fatty acids are the most relevant variables in the structuring of genetic diversity of this germplasm. / A soja é atualmente a cultura de maior destaque na safra brasileira de grãos. Entre seus principais produtos estão o óleo e o farelo, os quais têm sido matéria-prima para a produção de alimentos e ração animal. O elevado teor de proteína representa o principal atrativo do uso da soja na alimentação. Além disso, o óleo de soja tem sido também utilizado na produção de biodiesel. Esses segmentos industriais buscam cultivares com perfis semelhantes de ácidos graxos, cujo óleo garanta melhor estabilidade oxidativa. Isto corresponde a óleos com baixos teores de ácidos poli-insaturados, associados a elevados teores de ácidos graxos monossaturados. Para isso, torna-se indispensável a caracterização de atributos relacionados à qualidade do grão dos cultivares comerciais; o que pode ser estendido, para os propósitos de melhoramento da soja nesses atributos, aos recursos genéticos preservados em bancos de germoplasma. Atualmente a caracterização desses recursos ainda é deficiente, sobretudo quando se tratam de caracteres especiais como aqueles anteriormente mencionados. Nesse contexto, o objetivo deste trabalho foi caracterizar uma subcoleção de 527 acessos de soja do banco de germoplasma da Secretaria de Agricultura, Pecuária e Abastecimento do Estado de Goiás (Seagro-GO), com base nos teores de proteína, óleo e dos principais ácidos graxos no óleo. Os grãos foram obtidos de ensaio de campo conduzido na Unidade Experimental da Seagro-GO (16°43 S; 49°7 W; 765 m), município de Senador Canedo-GO, na safra 2007/2008. O delineamento experimental foi em blocos aumentados (blocos de Federer), com duas cultivares testemunhas (Conquista e Monsoy 6101) e parcela constituída de uma fileira de plantas (5,0 m x 0,5 m). Os teores de proteína foram quantificados pelo método Kjeldahl; de óleo, por Soxhlet; e os de ácidos graxos (palmítico, esteárico, oleico, linoleico e linolênico), pelo método FAME (Fatty Acid Methyl Esters). Para a avaliação da divergência genética entre os acessos, utilizaram-se as análises multivariadas de variáveis canônicas, de componentes principais e de agrupamento. Esta última foi realizada pelo método hierárquico aglomerativo, associado ao critério de ligação UPGMA. Também se realizaram análises discriminantes canônicas entre os grupos de similaridade identificados e entre os ciclos de maturação dos acessos (precoce, médio e tardio). Na análise de componentes principais foram necessárias três componentes para explicar 78% da variância total, ao passo que na análise de variáveis canônicas, apenas duas destas variáveis explicaram 81,2% dessa variação. Em relação à variação fenotípica, observou-se que a subcoleção apresenta variabilidade relativamente baixa entre os acessos, em seus teores de proteína (de 35,7% a 44,0%) e óleo (de 14,8% a 18,5%). Para os ácidos graxos, o germoplasma apresenta variação relativamente ampla, embora características de interesse industrial como elevados teores de ácido oleico (maiores que 40%) e baixos teores de ácidos poli-insaturados (menores que 40%) sejam restritas a poucos acessos. Quanto aos ácidos graxos poli-insaturados, o germoplasma apresenta variabilidade satisfatória para o ácido linoleico (ômega-6), porém, baixa variabilidade para o ácido linolênico (ômega-3), sobretudo em seu limite superior. Pela análise de agrupamento foram estabelecidos cinco grupos de similaridade multivariada (A, B, C, D e E), com formação de subgrupos em alguns deles. Os acessos dos grupos A e B apresentam os maiores teores de óleo e de proteína, respectivamente. Os acessos do grupo C destacam-se com os melhores perfis em qualidade do óleo (estabilidade oxidativa). Mesmo selecionando apenas o germoplasma com melhor perfil em estabilidade oxidativa do óleo, ainda foi possível identificar nessa coleção cinco grupos de acessos significativamente divergentes nos teores de ácidos graxos. As variáveis que se mostraram mais relevantes na estruturação da divergência genética desse germoplasma foram os teores de ácidos graxos poli-insaturados e saturados.

Submitted by Cássia Santos (cassia.bcufg@gmail.com) on 2017-08-30T10:51:56Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Tatianne Piza Ferrari Abreu - 2014.pdf: 3603386 bytes, checksum: a40d79ec7974327b452379ba2fc94097 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-09-15T13:17:53Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Tatianne Piza Ferrari Abreu - 2014.pdf: 3603386 bytes, checksum: a40d79ec7974327b452379ba2fc94097 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-09-15T13:17:53Z (GMT). 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This study aimed to study the evolutionary relationships and patterns of divergence among M. lemniscatus lineages and infer the historical biogeographic events that influenced the distribution and genetic variation. Twenty-nine individuals of M. lemniscatus were sampled from 16 localities in the states of Tocantins, Bahia, Goiás, Alagoas, Mato Grosso, Maranhão, Pará and Amazônia. Three mitochondrial regions (COI, 16S and ND4L) were sequenced, and together generated a fragment of 1595 bp and 23 different haplotypes. The analyses showed a very ancient lineage divergence ~ 4.5 Myr and high genetic differentiation among localities (FST=0.932; p<0.01), suggesting a limited gene flow among geographical regions. The demographic analyzes and neutrality tests indicated that there is no sign of expansion and that populations have constant size (Tajima’s D = 0.521; p = 0.763 and Mismatch distribution = 0.009; p= 0.779). In the analysis of the evolutionary relationship between haplotypes (by median-joining network method), no relationship between lineage and geographical space was found, suggesting incomplete lineage sorting. The results corroborate and give evidence that populations of M. lemniscatus were distributed in a more continuous region in the past, and the current distribution of this species may be the result of the reduction and separation of the geographical scope of their distribution, rather than having itself been an expansion event. This may be the result of cycles expansion of SDF and retraction of the rainforests during the cool and dry phases of the Quaternary. / Micrurus lemniscatus é uma espécie de cobra coral verdadeira sul-americana. Essa espécie possui uma ampla distribuição, ocorrendo em vários tipos de hábitats, incluindo Floresta Estacional Decidual e Semidecidual (FED), Matas de Galeria e Florestas Úmidas. No passado, os eventos do Terciário e as oscilações climáticas no Quaternário provavelmente influenciaram o padrão de distribuição dessas florestas, alterando a distribuição dos organismos associados à esses habitats. Hipotetiza-se que, os ciclos de expansão e retração florestal causados pelas flutuações climáticas podem ter influenciado a atual distribuição e estruturação genética de M. lemniscatus. Este trabalho teve por objetivo avaliar os padrões e relações evolutivas das linhagens genéticas de M. lemniscatus e compreender quais foram os eventos históricos biogeográficos que influenciaram a distribuição e a variação genética atual. Foram utilizados 29 amostras de indivíduos de M. lemniscatus de 16 localidades dos Estados de Tocantins, Bahia, Goiás, Alagoas, Mato Grosso, Maranhão, Pará, e Amazônia. Três regiões mitocondriais (COI, 16S e ND4L) foram sequenciadas, e juntas geraram um fragmento de 1595 pb e 23 diferentes haplótipos. As análises evidenciaram uma divergência bem antiga de linhagens, ~4,5 milhões de anos atrás e uma alta diferenciação genética entre as localidades (FST=0,932; p<0,01), o que sugere um fluxo gênico limitado entre essas regiões. As análises demográficas e testes de neutralidade indicaram que não há sinal de expansão e que as populações possuem tamanho constante (D de Tajima= 0,521; p= 0,763 e Distribuição de Mismatch= 0,009; p= 0,779). Na análise de relação evolutiva entre os haplótipos (pelo método median-joining network), não foi encontrada relação entre as linhagens e o espaço geográfico, sugerindo arranjo incompleto de linhagens. Os resultados corroboram e dão evidências de que as populações de M. lemniscatus eram distribuídas em uma região mais contínua no passado, e a atual distribuição desta espécie pode ser o resultado da redução e separação da abrangência geográfica de sua distribuição, ao invés de ter ocorrido propriamente um evento de expansão. Isso pode ser resultado dos ciclos de expansão das FED e retração das florestas úmidas durante as fases mais frias e secas do Quaternário.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-05-15T13:45:59Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Mariana Rodrigues Feitosa Ramos - 2015.pdf: 5145646 bytes, checksum: 488fb72c7846f0fe96bae9cbfed74b2a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-05-15T13:46:24Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Mariana Rodrigues Feitosa Ramos - 2015.pdf: 5145646 bytes, checksum: 488fb72c7846f0fe96bae9cbfed74b2a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-15T13:46:24Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Mariana Rodrigues Feitosa Ramos - 2015.pdf: 5145646 bytes, checksum: 488fb72c7846f0fe96bae9cbfed74b2a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2015-09-15 / The success of plant breeding programs depends on the choice of progenitors capable of producing progeny with desired characteristics, which are the raw material for the genetic selection. This study aimed to evaluate the combining ability of two groups of genitors, composed of 12 genotypes of rice, selected based on the high grain yield performance in each location (Goiania and Boa Vista), and their respective crosses, through complete diallel cross scheme without reciprocals, in two generations (F2 and F7). The experimental design was a randomized blocks, and it were evaluated the traits grain yield (PG) and days to flowering (DF), and estimated the varietal effect ( ̂), the average heterosis, varietal heterosis ( ̂ ) and specific heterosis ( ̂ in every generation, and for each group, the general combining ability ( ̂ ) of the parents. Significant differences were detected among the parents of both groups, for both traits, and were considered the most promising for the selection of new inbred lines, the combinations involving genitors with the highest values and positive effects of ̂ For PG trait in Goiânia, it were identified Canela Curta, Maninjau, Epagri 108 and Diamante, and in Boa Vista, the best genotypes were BRS Jaburu, BG90-2, Mearim, BRS Biguá and Chililica. For the DF trait in Goiânia, the genitors showing a decrease in the number of days to flowering and increased ̂ were Araguaia, CT11632, IRAT 122, Pratinha Branco and TOx 503, while for Boa Vista it were TOx 514, BRS Jaburu, Itaqui , BG90-2, BRS Biguá and IR54R. The use of SSR markers to infer the potential success of a certain hybrid combination, both in F2 and F7 generation, has not been indicated for the group of genitors evaluated. / O sucesso de programas de melhoramento de plantas autógamas depende da escolha de genitores capazes de produzir progênies com características desejadas. Dessa forma, este estudo teve como objetivo avaliar o potencial de dois grupos, de Goiânia e Boa Vista, com 12 genitores de arroz, e seus respectivos cruzamentos, por meio de cruzamentos dialélico completo sem os recíprocos, em duas gerações (F2 e F7), quanto às características agronômicas, em delineamento em blocos ao acaso. Para a os caracteres produção de grãos (PG) e dias até o florescimento (DF), foram avaliados: o efeito varietal ( ̂), a heterose média, a heterose varietal ( ̂ ) e a heterose específica ( ̂ em cada geração, e para cada grupo, obteve a estimativa da capacidade geral de combinação (gi) dos genitores. Foram detectadas diferenças significativas entre os genitores, de ambos os grupos, quanto às características agronômicas avaliadas, e foram consideradas mais promissoras, para a seleção de novas linhagens, as combinações envolvendo os genitores com as maiores magnitudes e efeitos positivos de ̂ para o caráter PG, em Goiânia foram Canela Curta, Maninjau, Epagri 108 e Diamante, além de serem os genitores mais produtivos. Para o caráter DF, os genitores que apresentaram as estimativas no sentido de diminuir o caráter, isto é, os mais precoces foram Araguaia, CT11632, IRAT 122, Pratinha Branco e TOx 503. Para o dialelo de Boa Vista teve como destaque os genitores BRS Jaburu, BG90-2, Mearim, BRS Biguá e Chililica, os quais apresentaram maiores magnitudes ̂ e efeitos positivos para o caráter PG. Quanto ao efeito ̂ para o caráter DF, os genitores TOx 514, BRS Jaburu, Itaqui, BG90-2, BRS Biguá e IR54R apresentaram efeitos negativos, reduzindo o caráter

Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-11-30T15:17:06Z No. of bitstreams: 1 Tese - Juan D. V. Fajardo.pdf: 1097421 bytes, checksum: 1917d39a17d14e35ca1fed4547529859 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-11-30T15:17:26Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Tese - Juan D. V. Fajardo.pdf: 1097421 bytes, checksum: 1917d39a17d14e35ca1fed4547529859 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2016-11-30T15:17:46Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Tese - Juan D. V. Fajardo.pdf: 1097421 bytes, checksum: 1917d39a17d14e35ca1fed4547529859 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-30T15:17:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese - Juan D. V. Fajardo.pdf: 1097421 bytes, checksum: 1917d39a17d14e35ca1fed4547529859 (MD5) Previous issue date: 2016-02-26 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The guaraná (Paullinia cupana var. Sorbilis (Mart.) Ducke) is a native plant valued by Amazonian peoples, especially by Sateré-Maue tribe in northern Amazon region on the border with the state of Pará. Research shows that guaraná has stimulating and therapeutic properties that make it an important input for chemical refrigerants, pharmaceutical, and cosmetics. The aim of the study was to evaluate genetic, estimate variance components for morphological characteristics, and production of guaraná progenies. In the experiment conducted in the city of Maués-Am / EMBRAPA were evaluated 36 progenies brothers guaraná means in experimental design of randomized blocks with two replications and six plants per plot for agronomic characters and fruit yield (g.plant-1.year-1) arranged in two rows of three plants, spaced 5 m x 5 m. The analysis of quantitative character production (g.plant-1.year-1) was based on the average production over six years. The average of the best individual production was 28,355 g.plant-1.year-1, which is ten times higher than the state average productivity. Progenies have enough genetic diversity for selection of progeny and senior individuals with controlled crossings or intercross could generate a base population with high productivity and sufficient genetic diversity increases the likelihood of recovery of superior genotypes. / O guaranazeiro (Paullinia cupana var. sorbilis (Mart.) Ducke) é uma planta nativa valorizada pelos povos Amazônicos, especialmente pela tribo Sateré- Maué no norte da região Amazônica, na fronteira com o estado do Pará. As pesquisas mostram que o guaraná tem propriedades estimulantes e terapêuticas o que o tornam um importante insumo para as indústrias químicas de refrigerantes, farmacêuticas, e cosméticos. O objetivo do estudo foi avaliar valores genéticos, estimar componentes de variância para caracteres morfoagronômicos, e da produção de progênies de guaranazeiro. No experimento conduzido na cidade de Maués-Am/EMBRAPA, foram avaliadas 36 progênies de meios irmãos de guaranazeiro em delineamento experimental de blocos ao acaso com duas repetições e seis plantas por parcela para os caracteres agronômicos e produção de frutos (g.planta-1.ano-1) dispostas em duas fileiras de três plantas, no espaçamento de 5 m x 5 m. A análise do caráter quantitativo Produção (g.planta-1.ano-1) foi baseado na média da produção ao longo de seis anos. A média da produção do melhor indivíduo foi de 28.355 g.planta-1.ano-1, que é dez vezes maior do que a produtividade média estadual. As progênies apresentam diversidade genética suficiente para a seleção de progênies e de indivíduos superiores que com cruzamentos controlados ou intercruzamentos poderiam gerar uma população base com alta produtividade e diversidade genética suficiente aumentando a probabilidade de recuperação de genótipos superiores.