Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas. Núcleo de Pesquisas em Ciências Biológicas, Pró-Reitoria de Pesquisa e Pós Graduação, Universidade Federal de Ouro Preto. / Submitted by Maurílio Figueiredo (maurilioafigueiredo@yahoo.com.br) on 2014-09-19T22:13:51Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 22190 bytes, checksum: 19e8a2b57ef43c09f4d7071d2153c97d (MD5) DISSERTAÇÃO_AnálisePerfilExpressão.pdf: 2789555 bytes, checksum: 3ca47b9100f7ac2ba4c0f11d49c5c832 (MD5) / Approved for entry into archive by Gracilene Carvalho (gracilene@sisbin.ufop.br) on 2014-11-07T12:23:09Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 22190 bytes, checksum: 19e8a2b57ef43c09f4d7071d2153c97d (MD5) DISSERTAÇÃO_AnálisePerfilExpressão.pdf: 2789555 bytes, checksum: 3ca47b9100f7ac2ba4c0f11d49c5c832 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-11-07T12:23:09Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 22190 bytes, checksum: 19e8a2b57ef43c09f4d7071d2153c97d (MD5) DISSERTAÇÃO_AnálisePerfilExpressão.pdf: 2789555 bytes, checksum: 3ca47b9100f7ac2ba4c0f11d49c5c832 (MD5) Previous issue date: 2013 / Análises pós genômicas têm propiciado avanços significativos sobre a biologia do parasito Schistosoma mansoni. Particularmente, experimentos de transcrissômica em larga escala apontaram genes essenciais, ligados a vias de degradação proteica intracelular, com expressão diferencial ao longo do ciclo de vida do parasito. Tais achados corroboram com as marcantes alterações fenotípicas observadas após a penetração no hospedeiro vertebrado e o extenso remodelamento corporal necessário para a instalação e maturação do verme adulto no sistema porta-hepático.A presente investigação objetivou determinar o perfil de expressão de subunidades constituintes do proteassoma 26S, em fases larvais e adultas do verme. Neste intuito, oligonucleotídeos específicos para amplificação parcial das subunidades Rpn10 e alfa 7 foram confeccionados. Após a extração de RNA total de vermes adultos seguido de RT-PCR, observou-se amplificação de produtos de aproximadamente 251 e 753 pb, de massas moleculares esperadas para os amplicons relacionados às subunidades Rpn10 e alfa 7, respectivamente. Os produtos de amplificação foram purificados do gel e clonados utilizando o sistema Gateway®. Novos ciclos de amplificação demonstraram a obtenção de plasmídeos recombinantes para as duas subunidades. Entretanto, experimentos de expressão heteróloga em bactérias BL21 não permitiram a detecção epurificação das subunidades alfa 7 e Rpn10 recombinantes no lisado celular. Como proposta alternativa, utilizou-se o plasmídeo PET28a® recombinante contendo a região codificadora da subunidade Rpn10 de S. mansoni, gentilmente cedido pela Dra. Enyara Rezende Morais (Laboratório de Biologia Molecular de Parasitos - Universidade de São Paulo). Após transformação em BL21, seleção de clones recombinantes e indução com IPTG, análises por SDS-PAGE e coloração do gel por Coomassie revelaram a expressão de uma proteína recombinante de massa molecular em torno de 55 kDa. Uma preparação de Rpn10 em alto grau de homogeneidade foi obtida após purificação por afinidade em resina de níquel. Anticorpos policlonais anti-SmRpn10 recombinante foram gerados em camundongos Swiss e utilizados para avaliação do perfil de expressão de Rpn10 em extratos solúveis de cercárias, esquistossômulos (de 3h e 3 dias), vermes adultos, ovos e miracídios. A partir de eletroforese bidimensional, utilizando separação isoelétrica em gel de gradiente linear (pH 3-10) e Western blotting, foram detectadas 3 isoformas para Rpn10 em todos os estágios investigados. Essas apresentaram aumento de expressão no estágio de cercária, o qual foi novamente confirmado por Western blotting 1D comparando as fases analisadas. Este achado refere-se ao primeiro relato da existência de isoformas para a subunidade Rpn10 constituinte do proteassoma 26S e agrega diversidade ao perfil de subpopulações possíveis e alternativas deste complexo proteolítico em S. mansoni __________________________________________________________________________________________ / ABSTRACT: Post-genomic analyses have allowed significant advances towards understanding the biology of the human parasite Schistosoma mansoni. In particular, large scaletranscriptome experiments highlighted essential genes related to proteolytic pathways exhibiting differential expression profiles throughout the parasite´s life cycle. Such findings corroborate with the marked phenotypic alterations observed after penetration into the vertebrate host and the extensive body remodeling required for maturation of the adult stage in the hepatic portal system. The present investigation aimed to determine the expression profile of 26S proteasome constituent subunits in both larvae and adult stages. Specific oligonucleotides were first designed for amplification of the subunits Rpn10 and alpha 7. After RNA extraction from adult worms and RT-PCR, amplification products at the expected molecular size (~250 and 750 bp) related to Rpn10 and alpha 7 subunits, respectively, were obtained. The amplification products were purified from the agarose gel and cloned using the Gateway® system. New amplification cycles demonstrated the production of recombinant plasmids for the two subunits under investigation. However, heterologous expression in Escherichia coli (BL21 strain) did not allowed detection and,purification of the respective recombinant proteins from cell lysates. As an alternative, the PET28a® recombinant plasmid containing the full length Rpn10 subunit of S. mansoni was kindly provided by Dr. Enyara R. Morais (Laboratório de Biologia Molecular de Parasitos – Universidade de São Paulo) and employed in this study. After transformation of BL21 E. coli cells, selection of recombinant clones and induction of expression using IPTG, SDS-PAGE analysis revealed the expression of a recombinant protein exhibiting molecular mass around 55 kDa. A homogenous fraction of His-tagged recombinant Rpn10 was obtained after its purification from the cell lysate using a nickel column. Polyclonal antibodies anti-Rpn10 were raised in Swiss mice and used for evaluation of the expression profile of this subunit in soluble extracts from cercariae, 3h schistosomula, adult worms, eggs and miracidia. A two dimensional gel approach (2-DE), using linear pH3-10 gradient for the first dimension, coupled to Western blotting revealed the existence of at least 3 isoforms for Rpn10 subunit in all investigated stages. Such isoforms exhibited upregulation in the cercariae, which was later confirmed by a comparative 1D Western blotting experiment. To our knowledge, this finding refers to the first report for the existence of Rpn10 isoforms and contributes adding further complexity to alternative possibilities of 26S proteasome assembly in S. mansoni.

Submitted by Chaylane Marques (chaylane.marques@ufpe.br) on 2015-03-13T19:03:26Z No. of bitstreams: 2 clebia almeida_tese.pdf: 1062339 bytes, checksum: 83d2e479419c76959eec81539c16d8ed (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-13T19:03:26Z (GMT). No. of bitstreams: 2 clebia almeida_tese.pdf: 1062339 bytes, checksum: 83d2e479419c76959eec81539c16d8ed (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2012-02-14 / FACEPE; EMBRAPA / A cana-de-açúcar (Saccharum spp.) tem considerável importância para a economia do Brasil, sobretudo para a região Nordeste. Dos fatores ambientais que limitam a produtividade dessa cultura, o déficit hídrico é considerado um dos mais importantes. A descoberta de proteínas que respondem ao déficit hídrico pode ser importante para os programas de melhoramento genético da cana-de-açúcar, uma vez que estas proteínas podem aumentar a tolerância a esse tipo de estresse. Dessa forma, o objetivo geral deste projeto foi comparar as variedades RB 72910, RB 931011 e RB 867515 submetidas a estresse hídrico utilizando uma abordagem proteômica. Inicialmente a variedade, não comercial, RB 72910 foi utilizada na construção de uma biblioteca de cDNA por meio da técnica de hibridização subtrativa por supressão (SSH) com o objetivo de isolar genes de defesa relacionados a estresses abiótico. Dos 122 clones obtidos, 40 clones mostraram similaridade com sequências depositadas em bancos de dados, 37 genes envolvidos em mecanismos de defesa, 24 foram similares a proteínas com função desconhecida e 21 clones foram associados ao desenvolvimento e manutenção celular. O gene que codifica para trealose-6-fosfato sintase, envolvido na resposta à seca, teve sua expressão confirmada por PCR quantitativo na variedade RB 72910. O padrão de expressão de proteínas foi avaliado por eletroforese bidimensional (2-DE). As plantas de cana foram submetidas à restrição de água durante 30 dias até atingir condições de déficit hídrico severo (20% de umidade gravitacional do solo). Sete proteínas tiveram sua expressão aumentada nas plantas tratadas em relação ao tratamento controle, enquanto três foram diminuídas Para comparar o perfil de expressão de proteínas das três variedades, foram utilizadas as técnicas 2-DE e espectrometria de massas (MALDI-TOF-MS/MS). Vinte plantas de cada variedade foram cultivadas em vasos (30 L) em casa de vegetação por três meses, sendo submetidas ao déficit hídrico por supressão da irrigação durante o terceiro mês. As análises revelaram mudanças significativas na intensidade de 53 spots de proteínas, as quais tiveram suas expressões aumentadas ou diminuídas em resposta à seca. Para a variedade RB 72910 foram seqüenciadas 4 proteínas que apresentaram aumento de expressão nas plantas submetidas ao déficit hídrico: ubiqitina, ácido indol-3- acético 34, NADH plastoquinona oxidoredutase e trealose-6-fosfato sintase. Para a variedade RB 931011 foram seqüenciadas 5 proteínas: aceto lactato sintase, fatores responsivos ao etileno e trealose-6-fosfato sintase. Para a RB 867515 foram seqüenciadas 6 proteínas: proteína do fotossistema I ycf4, proteínas de senescência foliar, citocinina oxidase, NADH dehidrogenase subunidade F, metionina amino peptidase e proteína de transporte ATPase Ca2+. Em plantas, o acúmulo de trealose está relacionado com a tolerância à seca. Sendo assim a trealose-6-fosfato sintase constitui uma possível candidata para a transformação genética para obtenção de plantas mais tolerantes ao déficit hídrico ou para a sua utilização como biomarcador em cana-de-açúcar.

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:52:37Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4547_1.pdf: 1702711 bytes, checksum: 8957e7b4102418b67fc1815c352e9631 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2007 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Melxi® é um fitoterápico confeccionado com o mel de abelha e o extrato de abacaxi (Ananas comosus L.). O mel apresenta ações anti-sépticas e bactericidas, sendo constituído de 78% de carboidratos, 1,5% de proteínas e 0,18% de sais minerais, além de 5,72% de vitaminas e outros elementos. O extrato bruto do abacaxi contém uma mistura complexa de proteinases, denominada de bromelina, além de outras enzimas e inibidores de proteases como também sacarose, frutose e glicose. A eficácia terapêutica da bromelina tem sido relatada em diversas publicações, sendo uma das mais importantes à ação mucolítica e fluidificante sobre secreções de vias aéreas. Este trabalho teve como objetivo estudar o efeito do xarope Melxi® sobre o tecido pulmonar e do lavado broncoalveolar em modelo animal de doença inflamatória do trato respiratório. Ratos machos Wistar foram divididos em quatro grupos, sendo: Grupo I = Controle não sensibilizado; Grupo II = Controle sensibilizado; Grupo III = sensibilizado tratado com salina e Grupo IV = sensibilizado tratado com Melxi®. Os animais dos Grupos II, III e IV foram pré-sensibilizados com 2 injeções intraperitoneais (IP) de 200 μl de solução de ovoalbumina (OVA) a 1% (p/v) em intervalos de 10 dias, seguido de sensibilização com 4 aplicações intranasais de 50 μl da (OVA) obedecendo ao mesmo intervalo de tempo. Após a sensibilização o Grupo IV recebeu 2 ml do xarope Melxi®, por gavagem orogástrica, 3 vezes ao dia, enquanto o Grupo III recebeu 2 ml de NaCl a 0,9% (p/v) nas mesmas condições, durante 7 dias. Todos os animais foram anestesiados com solução de pentobarbital. O pulmão e o lavado bronco-alveolar foram coletados e processados para eletroforese bidimensional (2D). Parte do pulmão foi removido e fixado em formalina a 10%, corados pela hematoxilina/eosina(HE), pelo alcian blue(AB) e pelo ácido periódico de Schiff(PAS), para análise histopatológica. Os tecidos pulmonares do Grupo IV corados pelo PAS apresentaram uma redução nos depósitos intracelulares de glicosaminoglicanos quando comparados com animais do Grupo II. As imagens obtidas dos géis de eletroforese 2-D foram analisadas pelo software 2D Plantinum da Amersham Biociences. Os perfis eletroforéticos das proteínas nos lavados bronco-alveolares dos diferentes grupos estudados demonstraram pequenas alterações, apenas a nível das proteínas de baixo peso molecular na região de pH alcalino da focalização isoelétrica (IEF). Enquanto nos tecidos pulmonares, os quatro grupos apresentaram-se bastante semelhantes. Os resultados obtidos sugerem que tenha havido uma diminuição na produção de muco pelas células do epitélio brônquico nos animais tratados pelo Melxi®, entretanto, estas alterações não parecem ter influenciado o perfil protéico pulmonar dos animais tratados quando comparados com os controles

SOUSA, F. M. L. Estudo das características do aparelho reprodutivo, epitélio seminífero e mapas eletroforéticos bidimensionais do plasma seminal de carneiros Morada Nova. 2010. 91 f. Dissertação (Mestrado em Zootecnia) - Centro de Ciências Agrárias, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2010. / Submitted by Daniel Eduardo Alencar da Silva (dealencar.silva@gmail.com) on 2014-12-10T19:34:09Z No. of bitstreams: 1 2010_dis_fmlsousa.pdf: 576755 bytes, checksum: f5cddfae0f4b87979c19cb614cd3cf53 (MD5) / Approved for entry into archive by José Jairo Viana de Sousa(jairo@ufc.br) on 2016-03-22T15:06:43Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2010_dis_fmlsousa.pdf: 576755 bytes, checksum: f5cddfae0f4b87979c19cb614cd3cf53 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-03-22T15:06:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2010_dis_fmlsousa.pdf: 576755 bytes, checksum: f5cddfae0f4b87979c19cb614cd3cf53 (MD5) Previous issue date: 2010 / Information on the reproductive physiological aspects about Morada Nova breed, especially for males, are still few and the lack of knowledge about that becomes a hindrance to implementation best management strategies and reproductive biotechnologies, based on this, this study aimed to describe the biometric characteristics of the reproductive tract in Morada Nova sheep as well as quantitative and qualitative aspects of spermato genesis and correlate them, and to characterize the electrophoretic maps of the seminal plasma of these animals. Semen was collected by electroejaculation in 15 male sheep of the Morada Nova breed, of which only 12 responded. The samples were centrifuged, for separation of seminal plasma , where it was used to determine of total protein concentration and protein profile by denaturing electrophoresis in polyacrylamide gel (SDS - PAGE). Biometric data were obtained from the testicles, epididymis and accessory s ex glands of the group of 15 animals that were slaughtered with an average age of 42 weeks and average weight of 28 kg. Immediately before slaughter, was taken to measure scrotal circumference (SC) of each animal . Then , the testicles, epididymis and access ory sex glands were weighed and measured individually (left and right). Testicles samples were fixed in Bouin's fluid for evaluation of seminiferous tubules. The testicular parenchyma was evaluated for diameter (TD), volume (VT) and length of seminiferous tubules, germinal epithelium height (EA) and a population of Sertoli cells and germinal cells. The proportion of testicular parenchyma occupied by seminiferous tubules was equivalent to 84.8 ± 0.1%. The overall yield of spermatogenesis was 59.8 ± 3.73 cell s. Each Sertoli cell (SC) was able to sustain 7.7 ± 0.51 round spermatids. Were realized analyses using Pearson correlation (p <0.05) between the studied characteristics and the variables were described as means and their respective standard errors using t he statistical program Statview, 5.0 (SAS, 2003). No difference was detected between the left and right values for any of the testicular parameters, epididymal and accessory sex glands. Significant correlations were found between weight and other measures testicle: length (TL), diameter (TD) and volume of parenchyma (VPAR) and other measures of reproductive tract as weight (PEP) and total length of the epididymis (TLE) and of body of the epididymis (LBEp). The testicular weight and diameter, were indicators of the reproductive function of the ram was correlated with all histologic described. For electrophoresis analysis, a total of 103 spots were identified, 45 these being present in all gels, and these spots presents in gel indicate the presence of importan t proteins in the seminal plasma. According to the results, measures of gonads showed correlations with the other structures of the reproductive tract and spermatogenic activity, and electrophoretic maps of seminal fluid were similar to Santa Inês sheep ad ults / Informações sobre aspectos fisiológicos reprodutivos da raça Morada Nova, especialmente para os machos, ainda são escassas e a falta destes conhecimentos torna-se um empecilho para aplicação de melhores estratégias de manejo e biotécnicas reprodutivas. Baseado nisto, este estudo teve como objetivos descrever as características biométricas do aparelho reprodutivo em ovinos Morada Nova e os aspectos quanti-qualitativos da espermatogênese e correlacioná-los, bem como caracterizar os mapas eletroforéticos das proteínas do plasma seminal destes animais. Foi realizada coleta de sêmen, por meio de eletroejaculação em 15 ovinos da raça Morada Nova, dos quais apenas 12 responderam. As amostras de sêmen foram centrifugadas para separação do plasma seminal, onde este foi utilizado na determinação da concentração protéica total e do perfil protéico através de eletroforese desnaturante em gel de poliacrilamida (SDS-PAGE). Os dados biométricos foram obtidos a partir dos testículos, epidídimos e das glândulas sexuais acessórias do grupo de 15 animais que foram abatidos com idade média de 42 semanas e peso vivo médio de 28 kg. Imediatamente antes do abate, foi tomada a medida de circunferência escrotal (CE) de cada animal. Em seguida, os testículos, epidídimos e glândulas sexuais acessórias foram pesados e mensurados individualmente (direito e esquerdo). Amostras dos testículos foram fixadas em fluido de Bouin para avaliação dos túbulos seminíferos. O parênquima testicular foi avaliado quanto ao diâmetro (DT), volume (VT) e comprimento dos túbulos seminíferos, altura do epitélio germinativo (AE) e população de células de Sertoli e germinativas. A proporção do parênquima testicular ocupado por túbulos seminíferos foi o equivalente a 84,8 ± 0,1%. O rendimento geral da espermatogênese foi de 59,8 ± 3,73 células. Cada célula de Sertoli (CS) foi capaz de sustentar 7,7 ± 0,51 espermátides arredondadas. Foram realizadas análises de correlação de Pearson (p < 0.05) entre as características estudadas e as variáveis foram descritas na forma de médias e respectivos erros-padrão através do programa estatístico StatView, 5.0 (SAS, 2003). Nenhuma diferença foi detectada entre os valores direito e esquerdo para nenhum dos parâmetros testiculares, epididimários ou das glândulas sexuais acessórias. Correlações significativas foram verificadas entre peso e as demais medidas testiculares: comprimento (CT), diâmetro (DT) e volume do parênquima (VPar) e outras medidas do aparelho reprodutor como peso (PEp) e comprimento total (CEp) do epidídimo e comprimento do corpo do epidídimo (CCorpEp). O peso e diâmetro testicular, mostraram-se indicadores da função reprodutiva do carneiro estando correlacionado com todas as variáveis histológicas descritas. Com relação à análise eletroforética bidimensional, um total de 103 spots foram identificados, estando 45 destes presentes em todos os géis, os spots presente indicam a presença de proteínas importantes do plasma seminal. De acordo com os resultados obtidos, as medidas das gônadas apresentaram correlações com as demais estruturas do trato reprodutivo e atividade espermatogênica, e os mapas eletroforéticos do fluido seminal mostraram-se semelhantes aos de ovinos Santa Inês adultos.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Ciência dos Alimentos, Florianópolis, 2016. / Made available in DSpace on 2016-10-18T03:05:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 341958.pdf: 2212678 bytes, checksum: 6c1d80fbabb7329a2f6b28745066a1da (MD5) Previous issue date: 2016 / Análises amplas de perfil podem complementar a avalição de culturas vegetais alimentares. A proteômica comparativa permite observar diferenças entre o perfil de proteínas entre duas culturas equivalentes, que diferem apenas pela expressão de uma característica. Neste contexto, as técnicas de eletrophorese bidimensional (2-DE) seguida de espectrometria de massa (MS) foram utilizadas para avaliar variedades de feijão geneticamente modificado (GM) Embrapa 5.1 e genótipos de milhos mutantes com diferentes teores de flobafenos. No primeiro trabalho, o perfil de proteínas dos grãos de duas variedades de feijão, Pérola e Pontal, derivadas do evento Embrapa 5.1, foram comparadas com suas contrapartes não-GM. Foram detectados 23 spots diferencialmente acumulados entre Pérola GM e Pérola não-GM e 21 spots diferencialmente acumulados entre Pontal GM e Pontal não-GM. Entre os spots detectados como diferencialmente acumulados, oito proteínas foram identificadas em Pérola e quatro proteínas em Pontal. A função das proteínas identificadas nas variedades Pérola e Pontal não foram as mesmas, indicando que a variabilidade observada não está relacionada a transformação genética. Além disso, aplicamos análise de componentes principais (PCA) aos dados obtidos por 2-DE e a variação entre as variedades foi explicada nos dois primeiros componentes. No segundo trabalho, comparou-se os proteomas dos grãos de dois genótipos de milho não comerciais, P1-rr (R) e P1-ww (W) que apresentam alto e baixo conteúdo de flobafenos, respectivamente. A comparação por ANOVA resultou em 55 spots diferencialmente expressos. Após análise de MS, oito proteínas foram identificadas. Aplicou-se PCA a porcentagem de volume de 135 spots combinados em todos os seis géis analisados, e foi observada a separação dos perfis de proteína dos dois genótipos de milho. Os resultados obtidos nos dois estudos demonstram que a técnica 2-DE seguida por MS, acompanhada de PCA, é aplicável para análise de grãos que se diferenciam pela expressão de uma característica, assim como é possível diferenciar cultivares GM e não GM.<br> / Abstract : Profile analyses are complementary for crop food assessment. The comparative proteomics allows observing differences between the protein profiles between two equivalent cultures that differ in a feature. In this context, two-dimensional electrophoresis (2-DE) technique was used followed by mass spectrometry (MS) to evaluate genetically modified (GM) common bean varieties (EMBRAPA 5.1) and maize genotypes with different phlobaphenes contents. In the present work grain proteome profiles of two Embrapa 5.1 common bean varieties, Pérola and Pontal, and their non-GM counterparts were compared by two dimensional gel electrophoresis (2-DE) followed by mass spectrometry (MS). Analyses detected 23 spots differentially accumulated between GM Pérola and non - GM Pérola and 21 spots between GM Pontal and non-GM Pontal. Among them, eight proteins were identified in Perola varieties, and four proteins were identified in Pontal. Although, they were not the same proteins in Perola and Pontal varieties, indicating that the variability observed may not be due the genetic transformation. Moreover, we applied principal component analysis (PCA) on 2-DE data, and variation between varieties was explained in first two principal components. In this study the grain proteomes of the two genotypes of non-commercial maize, P1-rr (R) and P1-ww (W), with high and low flavonoid content, were also compared. ANOVA comparison resulted in 55 spots differentially accumulated. After MS analyses, eight proteins were identified. PCA was applied in the volume percentage of the 135 matched spots in all six gels. The multivariate analysis showed the separation of protein profiles of the two maize genotypes using 2-DE data. The results of both studies show that 2-DE followed by MS, accompanied by PCA, is applicable for profile analysis of grains that differ by one characteristic, and it is possible to differentiate between GM and non-GM varieties.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:19Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-11-23Bitstream added on 2014-06-13T20:16:29Z : No. of bitstreams: 1 soares_la_me_arafcf.pdf: 482117 bytes, checksum: 977f1b9fe29b6c45730789f06700afaa (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / São evidentes a necessidade de novas substâncias antifúngicas e a grande importância dos produtos naturais no desenvolvimento de novas ferramentas terapêuticas. Assim, neste estudo avaliou-se a atividade antifúngica dos derivados sintéticos esterificados do ácido protocatecuico. Todos os isolados apresentaram bons resultados ao teste de suscetibilidade aos derivados sintéticos do ácido protocatecuico demonstrando que 62,5% foram ativos em relação para dois isolados de T. rubrum (Tr1 e Tr2), T. rubrum MYA 3108 (Tr3) e isolado clínico T. interdigitale (Tm1) e 68,7%, para isolado clínico T. interdigitale (Tm2) e T. interdigitale ATCC 40131 (Tm3) dos 16 compostos testados. Como referência para avaliação da Concentração Inibitória Mínima (CIM) foram considerados todos os resultados com valores ≤ 62,5 ug\mL. A combinação fluconazol mais protocatecuatos de pentila, hexila, heptila, octila e nonila foi aditivo para isolados clínicos Tr1, Tm1 e Tm3, exceto a combinação com fluconazol mais protocatecuato de heptila, que revelou um efeito sinérgico contra Tm3. A griseofulvina em combinação com protocatecuato de nonila mostrou atividade sinérgica em duas linhagens de dermatófitos, atividade aditiva para quatro linhagens. Oito derivados do ácido protocatecuico foram associados quimicamente com o miconazol sendo encontradas interações sinérgicas e aditivas. Foi testada a associação entre protocatecuatos e o antifúngico nistatina, resultando interações antagônicas, demonstrando assim que o polieno... / There is a clear need for new antifungal compounds, and the importance of natural products in the development of novel therapeutic tools. In this study, it was evaluated the antifungal activity of protocatechuic acid esters. All of the fungus isolated showed good results when testing susceptibility to synthetic derivatives of protocatechuic acid, showing that 62.5% were active against two strains of T. rubrum (Tr1 e Tr2), T. rubrum MYA 3108 (Tr3) and clinical isolate T.interdigitale (Tm1) and 68.7% for clinical isolate of T. interdigitale (Tm2) and T. interdigitale ATCC 40131 (Tm3) of the 16 compounds tested. Reference values of Minimum Inhibitory Concentration (MIC) were considered ≤ 62.5 ug/ mL. The combination of fluconazole plus pentyl, hexyl, heptyl, octyl and nonyl protocatechuates was additive to clinical isolates Tr1, Tm1 and Tm3, except the combination fluconazole plus heptyl protocatechuate, which showed a synergistic effect on Tm3. Griseofulvin in combination with nonyl protocatechuate exhibited synergistic activity two towards dermatophyte strains, additive interaction for four strains. When eight protocatechuic acid derivatives were chemically associated with miconazole, were observed synergistic and additive effects. We tested the association between protocatechuates and nystatin, resulting in antagonistic interactions. Thus it demonstrated that have not a polyene antifungal best when... (Complete abstract click electronic access below)

Orientador: Ana Marisa Fusco Almeida / Banca: Anderson Assunção Andrade / Banca: Luis Octávio Regasini / Resumo: São evidentes a necessidade de novas substâncias antifúngicas e a grande importância dos produtos naturais no desenvolvimento de novas ferramentas terapêuticas. Assim, neste estudo avaliou-se a atividade antifúngica dos derivados sintéticos esterificados do ácido protocatecuico. Todos os isolados apresentaram bons resultados ao teste de suscetibilidade aos derivados sintéticos do ácido protocatecuico demonstrando que 62,5% foram ativos em relação para dois isolados de T. rubrum (Tr1 e Tr2), T. rubrum MYA 3108 (Tr3) e isolado clínico T. interdigitale (Tm1) e 68,7%, para isolado clínico T. interdigitale (Tm2) e T. interdigitale ATCC 40131 (Tm3) dos 16 compostos testados. Como referência para avaliação da Concentração Inibitória Mínima (CIM) foram considerados todos os resultados com valores ≤ 62,5 ug\mL. A combinação fluconazol mais protocatecuatos de pentila, hexila, heptila, octila e nonila foi aditivo para isolados clínicos Tr1, Tm1 e Tm3, exceto a combinação com fluconazol mais protocatecuato de heptila, que revelou um efeito sinérgico contra Tm3. A griseofulvina em combinação com protocatecuato de nonila mostrou atividade sinérgica em duas linhagens de dermatófitos, atividade aditiva para quatro linhagens. Oito derivados do ácido protocatecuico foram associados quimicamente com o miconazol sendo encontradas interações sinérgicas e aditivas. Foi testada a associação entre protocatecuatos e o antifúngico nistatina, resultando interações antagônicas, demonstrando assim que o polieno... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: There is a clear need for new antifungal compounds, and the importance of natural products in the development of novel therapeutic tools. In this study, it was evaluated the antifungal activity of protocatechuic acid esters. All of the fungus isolated showed good results when testing susceptibility to synthetic derivatives of protocatechuic acid, showing that 62.5% were active against two strains of T. rubrum (Tr1 e Tr2), T. rubrum MYA 3108 (Tr3) and clinical isolate T.interdigitale (Tm1) and 68.7% for clinical isolate of T. interdigitale (Tm2) and T. interdigitale ATCC 40131 (Tm3) of the 16 compounds tested. Reference values of Minimum Inhibitory Concentration (MIC) were considered ≤ 62.5 ug/ mL. The combination of fluconazole plus pentyl, hexyl, heptyl, octyl and nonyl protocatechuates was additive to clinical isolates Tr1, Tm1 and Tm3, except the combination fluconazole plus heptyl protocatechuate, which showed a synergistic effect on Tm3. Griseofulvin in combination with nonyl protocatechuate exhibited synergistic activity two towards dermatophyte strains, additive interaction for four strains. When eight protocatechuic acid derivatives were chemically associated with miconazole, were observed synergistic and additive effects. We tested the association between protocatechuates and nystatin, resulting in antagonistic interactions. Thus it demonstrated that have not a polyene antifungal best when... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Os fungos filamentosos são microrganismos explorados devido ao potencial biotecnológico de seus produtos, nos quais as enzimas têm papel de destaque. Apesar de serem utilizadas em diversos segmentos industriais, as enzimas compõem um mercado que esta em franca expansão e em busca de melhores níveis de produção, de novas atividades enzimáticas, e outros. Os fungos filamentosos possuem mecanismos refinados de resposta a alterações exógenas. Sendo assim, os estudos proteômicos têm se tornado uma excelente ferramenta para explorar proteínas produzidas em resposta às variações ambientais, tais como, pH, fontes de nitrogênio e carbono, temperatura e tipos de bioprocessos. Um grupo especialmente afetado por estas variações é a produção de enzimas biotecnológicas. Neste trabalho, os perfis de proteínas intracelulares e/ou de enzimas secretadas foram identificados nos bioprocessos com Fusarium oxysporum URM 7401 e Myceliophthora thermophila, submetidos a diferentes condições de cultivo. As proteínas intracelulares de Fusarium oxysporum URM 7401, cultivado em bioprocesso submerso com diferentes pH ou fontes de nitrogênio, foram extraídas do micélio e fracionadas por eletroforese bidimensional (2DE). Os spots proteicos foram selecionados e identificados por espectrometria de massas MALDI- TOF/TOF-MS/MS. As proteínas secretadas foram avaliadas quanto às suas atividades enzimáticas utilizando substratos adequados para: peptidase, lipase, amilase, ?-glicosidase, CMCase, FPase, invertase, pectinase, xilanase e lacase. As proteínas presentes nos secretomas de Fusarium oxysporum URM 7401, cultivado em bioprocesso submerso com caseína e farinha de pena, e de Myceliophthora thermophila, cultivado em bioprocesso sólido com resíduos agroindustriais, foram identificadas por espectrometria de massas LC-ESI-MS/MS e também avaliadas quanto ao potencial de sacarificação de resíduos agroindustriais (farelo de trigo, palha de arroz e palha de soja). As proteínas selecionadas e identificadas, das diferentes condições de cultivo com Fusarium oxysporum URM 7401, em conjunto com os dados de produção enzimática demonstram a influência dos parâmetros dos bioprocessos no metabolismo de compostos, crescimento celular, síntese de nutrientes, estresse oxidativo, entre outros. Além do destaque na produção de enzimas, os extratos dos cultivos com caseína e farinha de pena foram capazes de degradar resíduos agroindustriais. A capacidade lignocelulolítica, conjugada a indução da via das fosfopentoses, sugerem que Fusarium oxysporum URM 7401 também tem potencial para a realização de bioprocesso consolidado e, consequentemente, para a produção de bioetanol. As proteínas do secretoma de Myceliophthora thermophila, quantificadas em ensaios enzimático e identificadas por espectrometria de massas LC-ESI-MS/MS, reforçaram o potencial hidrolítico e oxidativo deste microrganismo, com destaque especial para o grande número de enzimas ativas sobre carboidratos (CAZy) e oxirredutases. A ação deste arsenal enzimático também foi confirmada nos ensaios de degradação com resíduos agroindustriais; e indicaram um elevado potencial para sacarificação de resíduos ii lignocelulósicos. A compreensão dos mecanismos de produção e/ou secreção de proteínas pode ser auxiliada pela proteômica. Estes mecanismos, complementados pela identificação de enzimas biotecnológicas, podem elucidar as rotas metabólicas desencadeadas pelo microrganismo; e também na elaboração de estratégias que propiciem resultados satisfatórios nos bioprocessos. / Filamentous fungi are very exploited due to biotechnological potential of their products, which enzymes play a prominent role. Although they have been using in several industrial segments, the enzymes belong to an expansion market, that looking for a better levels of production, novel enzymatic activities and other. Filamentous fungi have a refined mechanisms for response to exogenous alterations. Thus, the proteomic studies have been become an excellent tool to explore proteins, which are produced in response to environmental changes, such as pH, nitrogen and carbon sources, temperature and kind of bioprocesses. A protein group that can be influenced by these variations is biotechnological enzymes. In this work, the profiles of intracellular proteins and/or of secreted enzymes were identified in the bioprocesses with Fusarium oxysporum URM 7401 and Myceliophthora thermophila, submitted to different culture conditions. The intracellular proteins from Fusarium oxysporum URM 7401, cultured in submerged bioprocess with various pH values or nitrogen sources, were extracted from mycelium and fractionated by bidimentional electrophoresis (2DE). The spots were selected and identified by MALDI-TOF/TOF-MS/MS mass spectrometry. The secreted proteins were evaluated, for their enzyme activities, using suitable substrates for peptidase, lipase, amylase, ?-glucosidase, CMCase, FPase, invertase, pectinase, xylanase and laccase. The proteins in secretomes from Fusarium oxysporum URM 7401, cultured in submerged bioprocess with casein and feather meal, and from Myceliophthora thermophila, cultured in solid state bioprocess with agroindustrial residues, were identified by LC-ESI-MS/MS mass spectrometer and they were also evaluated for saccharification potential of the agroindustrial residues (wheat bran, rice straw and soybean straw). The selected and identified proteins from Fusarium oxysporum URM 7401, obtained from different culture conditions, in addition to the enzyme production showed that bioprocess parameters influence the metabolism of compounds, cell growth, synthesis of nutrient, oxidative stress, among other. Besides this prominence in enzymes production, the extracts with casein or feather meal were able to degrade agroindustrial residues. The lignocellulolytic ability, conjugated to induction of the phosphopentoses pathways, suggest that Fusarium oxysporum URM 7401 also has potential for performing consolidated bioprocess and, consequently, for bioethanol production. The secretome proteins from Myceliophthora thermophila, quantified in enzymatic assays and identified by mass spectrometer LC-ESI-MS/MS, reinforce the hydrolytic and oxidative potential from this microorganism, with special emphasis for a great number of carbohydrate-active enzymes (CAZy) and oxidoreductases. The action of this enzymatic arsenal was also confirmed by agroindustrial residue degradation assays; and indicated a high potential for lignocellulosic residue saccharifications. The understanding about protein production and/or secretion mechanisms can be supported by proteomics. These mechanisms, complemented by the identification of biotechnological enzymes, can elucidate the metabolic pathways triggered by the microorganism; and can help to design better performing bioprocesses

Em bovinos, o sucesso no estabelecimento da gestação depende de interações entre o concepto e o útero. Tais interações ocorrem através de moléculas presentes no ambiente uterino. Falhas nesse processo causam 30-40% de perdas de gestação. As proteínas são constituintes desse ambiente e possuem um importante papel nesse processo. Objetivou-se na presente dissertação caracterizar o perfil protéico do ambiente uterino de fêmeas bovinas, ciclando ou prenhes, durante o período crítico, utilizando eletroforese bidimensional. O objetivo específico foi comparar a composição protéica de lavados uterinos obtidos in vivo, por sonda de folley ou post-mortem no dia 18 após o estro de vacas não inseminadas ou gestantes. Para a obtenção das amostras, 48 fêmeas bovinos tiveram seu ciclo estral sincronizado e foram alocadas aleatoriamente para receberem lavagens in vivo por sonda de folley (12 inseminadas e sete não inseminadas) ou para receberem lavagens post-mortem (12 inseminadas e cinco não inseminadas) no dia 18 após o estro. Após a coleta, os lavados foram processados e submetidos à eletroforese bidimensional. Os géis foram analisados utilizando o programa Image Master-2D ELITE V. 4.01 (GE Healthcare) para determinação do ponto isoelétrico (PI) e peso molecular relativo (PMR) das proteínas nos diferentes grupos e análise da densidade óptica. Foram selecionadas 178 proteínas presentes nos lavados. Em relação à distribuição das proteínas de acordo com o ponto isoelétrico, 74% (132/178) apresentaram PI entre 5,5 e 8, em relação ao peso molecular, 44% (79/178) das proteínas possuíam PMR menor que 50KDa enquanto 54% (95/178) entre 50 e 100KDa. Nos lavados realizados por sonda de folley (FC ou FP) foram selecionadas 151 proteínas, sendo 96 nos lavados de animais cíclicos e 86 nos prenhes. Os lavados realizados post-mortem (PMC ou PMP) apresentaram apenas 54 proteínas, das quais 24 estiveram presentes nos lavados PMC e 36 nos lavados PMP. Em relação ao estado reprodutivo 115 proteínas foram encontradas nos lavados dos animais cíclicos (FC ou PMC), enquanto 104 proteínas foram selecionadas nos lavados de animais prenhes (FP e PMP). Entre os lavados realizados por sonda de folley (FC e FP) 31 proteínas foram comuns entre os estados, enquanto entre os lavados realizados post-mortem (PMC e PMP) apenas seis proteínas estiveram presentes em ambos os lavados. Nos lavados realizados em animais ciclando (FC e PMC) cinco proteínas estiveram presentes em ambos os tipos de lavados, enquanto nos lavados realizados em animais prenhes (FP e PMP) 18 proteínas foram comuns em ambos os tipos de lavado. Entre os lavados FC e PMP ou FP e PMC, 15 e 6 proteínas, respectivamente, foram comuns. As proteínas presentes exclusivamente nos lavados de vacas prenhes, possivelmente estão envolvidas no diálogo materno-embrionário durante o processo de estabelecimento da gestação. Proteínas detectadas exclusivamente nos lavados obtidos via sonda de folley podem ser devidas ao influxo de proteínas do soro sanguíneo em resposta à manipulação do trato reprodutivo durante a obtenção dos lavados. Esperava-se uma maior efetividade dos lavados realizados post-mortem em relação aos realizados por sonda de folley. Entretanto os lavados obtidos por sonda de folley foram melhores por identificar um maior numero de proteínas, permitindo identificar diferenças maiores entre os lavados de animais ciclando e prenhes. Concluiu-se que a eletroforese bidimendional constitui um método adequado para avaliar quantitativamente o perfil protéico do ambiente uterino bovino e que tanto o estado reprodutivo quanto o método de obtenção de lavados uterinos modificam sua composição protéica. Novos estudos são necessários para se obter a seqüência de aminoácidos das proteínas localizadas para que se conheça sua identidade e função na gestação inicial de bovinos. / In the cattle, the outcome for the establishment of pregnancy depends on interactions between conceptus and uterus. These interactions occur through molecules presents in the uterine environment. Failure in this process causes 30-40% of loss in gestation. The proteins are component of this environment and have a important role in this process. The aim of this dissertation was to characterize the protein profile of the uterine environment in cows, cyclic or pregnant, during the critical period, using two-dimensional electrophoresis. The specific aim was to compare the protein composition of uterine washings recovered in vivo, through a folley catheter, with washings recovered post-mortem at day 18 after estrus of not inseminated or pregnant cows. To obtain the samples 48 cows had their estrous synchronized and here aleatoric put in the group to receive washings in vivo through the folley catheter (12 inseminated and seven not inseminated) or to be washed post-mortem (12 inseminated and five not inseminated) at day 18 after estrus. After the recover, the washings were proceeded and submitted to two-dimensional electrophoresis. The gels were analyzed using the software Image Master-2D ELITE V. 4.01 (GE Heathcare) to determine the isoelectric point (PI) and relative molecular weight (PMR) of the proteins presents in the different groups and analysis of the optical density. One hundred and seventy eight proteins were presents in the washings. The distribution of the proteins according to the PI, 74% (132/178) had PI between 5,5 and 8 and according to the PMR 44% (79/178) of the proteins showed PMR lower than 50KDa, while 54% (95/178) had PMR between 50 and 100KDa. In the washings recovered through the folley catheter (FC and FP) 151 proteins were selected, being 96 from the cyclic cows and 86 from the pregnant cows. The washings recovered post-mortem (PMC and PMP) showed only 54 proteins, from those 24 were present in the cyclic animals and 36 in the pregnant animals. According to the reproductive status 115 proteins were found in the washings from the cyclic animals (FC and PMC), while 104 proteins were selected from the washings of the pregnant animals (FP and PMP). Among the washings recovered through the folley catheter (FC and FP) 31 proteins were the same between the reproductive status. While in the washings recovered post-mortem (PMC and PMP) only six proteins were present in both washings. In washings done in the cyclic animals (FC and PMC) five proteins were presents in both kind of washings, while in washings done in the pregnant animals (FP and PMP) 18 proteins were the same in both kind of washings. Among the washings FC and PMP or FP and PMC, 15 and six proteins, respectively were the same. The proteins presents exclusively in the washings of the pregnant animals are probably involved with the embryo-maternal interplay during the process of pregnancy establishment. Proteins detected exclusively in the washings recovered through the folley catheter may be inflow of proteins from the serum, in response to the uterine manipulation during the process of washing. It was expected a better effect from the washings post-mortem than the ones through the folley catheter. However the washings from the folley catheter had a better result, because they identified a greater number of proteins which allowed identify greater differences between the washings from cyclic and pregnant animals. In conclusion, the two-dimensional electrophoresis is a adequate method to analyze the quantitatively proteins profile of the uterine environment in the cow and that both the reproductive status and the method to obtain the uterine washings modify the proteins composition. New studies are necessary to obtain the amino acids sequence of the proteins found so that we know their identity and function in the beginning of pregnancy in the cow.

Estudou-se o perfil de proteínas de plasma seminal de touros das raças Nelore (Bos taurus primigerus indicus) e Simental (Bos taurus primigerus taurus), criados a campo, em regime de acasalamento múltiplo e manejo extensivo, na região de Dourados/MS, a fim de analisar a relação entre estas proteínas e características ligadas ao desempenho reprodutivo de touros. Coletaram-se amostras de sêmen no período de inverno (Julho/2001) e verão (Fevereiro/2002), realizando-se inicialmente o exame andrológico nos animais, e em seguida a análise padrão do sêmen. O plasma seminal foi, então, submetido à dosagem de proteínas totais, à dosagem de substâncias reativas ao ácido tiobarbitúrico (TBARS), para avaliação da ocorrência de lipoperoxidação, e à eletroforese bidimensional de proteínas. Para análise do perfil proteico de plasma seminal da cada raça, foram utilizados os seguintes parâmetros: comparação entre os períodos de inverno e verão; comparação de grupos de amostras separados de acordo com a quantificação de características ligadas ao desempenho reprodutivo (morfologia espermática, dosagem de proteína total e dosagem de TBARS); e comparação de grupos de amostras separados de acordo com classificações para avaliação da capacidade reprodutiva, previamente descritas na literatura (Breeding Soundness Evaluations – BSEs). Os touros da raça Simental demonstraram menor adaptação às condições ambientais tropicais, com valores mais altos de defeitos espermáticos maiores, proteína total e dosagem de TBARS no período de verão. Observou-se grande variabilidade no perfil proteico entre as raças Nelore e Simental e, dentro de cada raça, encontrou-se expressiva variação individual. O perfil de proteínas de plasma seminal de touros Nelore apresentou 155 spots, entre os quais 04 se destacaram como possíveis marcadores de características ligadas ao desempenho reprodutivo. Já na raça Simental foram identificados 248 spots, com destaque para 04 spots, que demonstraram maior potencial como marcadores de características de interesse para a reprodução. Os resultados mostram que o perfil de proteínas de plasma seminal está relacionado ao desempenho reprodutivo de touros, fazendo-se necessários maiores estudos sobre as proteínas que se destacaram como marcadores, a fim de identificar as funções que elas exercem no trato reprodutivo e nos eventos ligados à fertilização. / Seminal plasma proteins profiles from Nelore (Bos taurus primigerus indicus) and Simmental (Bos taurus primigerus taurus) bulls, used for multiple-sire breeding under range conditions, at Dourados/MS region, were studied aiming to analyze the relation between these proteins and traits linked to bulls’ reproductive performance. Semen samples were collected in the winter (July/2001) and summer (February/2002). Initially, an andrological examination was performed, followed by standard semen analysis. Seminal plasma was subjected to total protein quantification, thiobarbituric acid reactive substances quantification (TBARS, to evaluate lipid peroxidation), and two-dimensional protein electrophoresis. To analyze seminal plasma protein profile of each breed, the following parameters were used: comparison between winter and summer, comparison among groups of samples divided by quantification of traits linked to reproductive performance (sperm morphology, total protein quantification, TBARS quantification) and comparison among groups of samples divided by breeding soundness evaluations (BSEs), previously reported in literature. Simmental bulls showed lower adaptability to tropical environment conditions, with higher values of major sperm defects, total protein and TBARS in the summer. A great variability was observed in the protein profile between Nelore and Simmental breeds, and, for each breed it was found great individual variability too. Nelore seminal plasma protein profile presented 155 spots, 04 of which were considered potential markers for traits linked to reproductive performance. For Simmental breed, 248 spots were identified, with special interest for 04 spots, which showed higher potential as markers to reproductive characteristics. Results show that seminal plasma protein profile is related to bulls’ reproductive performance. Further studies about those proteins which are potential markers are needed, to determine their function at bulls’ reproductive system and in the events related to fertilization.