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Caracterização fenotípica e genotípica de Enterococcus spp. isolados de amostras fecais de pinguins-de-magalhães (Spheniscus magellanicus) encontrados no litoral norte do Rio Grande do Sul, Brasil / Phenotypic and genotypic characterization of Enterococcus spp. from fecal samples of magellanic penguins (Spheniscus magellanicus) from the North coast of Rio Grande do Sul, Brazil

Prichula, Janira January 2015 (has links)
Os Enterococcus spp. apresentam uma natureza ubiquitária que lhes permite sobreviver em diversos nichos ecológicos. Estudos envolvendo enterococos isolados de animais marinhos são escassos. Em razão disso, este trabalho teve como objetivo isolar, identificar, avaliar o perfil de suscetibilidade aos antimicrobianos, a presença de fatores de virulência e a diversidade genética de enterococos isolados de amostras fecais de pinguins-de-magalhães (Spheniscus magellanicus) encontrados no Litoral Norte do Rio Grande do Sul, Brasil. No total, 172 enterococos foram isolados e identificados como E. faecalis (43%), E. faecium (33,7%), E. hirae (12,8%) e E. mundtii (10,5%). Cento e quatorze isolados foram sensíveis aos dez antimicrobianos testados. Fenótipos de resistência foram encontrados para ciprofloxacina (28,5%), eritromicina (25%), norfloxacina (14,5%) e tetraciclina (4,6%). Todos os isolados resistentes à tetracilina apresentavam o gene tet(M) e apenas dois não apresentaram o tet(L). O gene erm(B) não foi detectado nos resistentes à eritromicina. Genes de virulência, gelE e ace (43%) e asa (35,5%) foram detectados nos E. faecalis. A atividade de gelatinase foi verificada em 64 isolados. A maioria dos enterococos foi fraco formador de biofilme. A análise dos perfis gerados por PFGE revelou um grande número de clones. Em conclusão, os enterococos compõem a microbiota do trato gastrintestinal dos pinguins-de-magalhães e a detecção de determinantes de resistência e virulência indica que os enterococos podem constituir um reservatório de tais características e, sendo o ambiente marinho um meio de disseminação, é importante considerar o potencial deste gênero em ocasionar riscos à saúde desses animais e à do ecossistema marinho. / Enterococcus spp. shows a ubiquitous nature that enables survival in different ecological niches. Studies involving enterococci isolated from marine animals are scarce. For this reason, this study aimed to isolate, identify, evaluate the antimicrobial susceptibility profile, the presence of virulence factors and the genetic diversity of enterococci isolated from fecal samples of magellanic penguins (Spheniscus magellanicus) found in the North coast of Rio Grande do Sul, Brazil. Overall, 172 enterococci were isolated and identified as E. faecalis (43%) E. faecium (33.7%), E. hirae (12.8 %) and E. mundtii (10.5%). One hundred and fourteen isolates were susceptible to the ten tested antimicrobials. Resistance phenotypes were found for ciprofloxacin (28.5%), erythromycin (25%), norfloxacin (14.5%) and tetracycline (4.6%). The tetracycline resistant isolates showed the tet(M) gene and only two isolates didn’t present tet(L). The erm(B) gene wasn’t detected in erythromycin resistant isolates. Virulence genes, gelE/ ace genes (43%) and asa (35.5%) were found only in E. faecalis. The gelatinase activity was observed in 64 strains. The majority of enterococci were weak biofilm formers. The analysis of the profiles generated by PFGE has revealed a large number of clones. In conclusion, enterococci compose the microbiota of magellanic penguins and the detection of resistance and virulence determinants indicates that enterococci may constitute a reservoir of such characteristics and, as the marine environment is a way of dissemination, it is important to consider the potential of this genus in cause health risks of these animals and the marine ecosystem.
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Caracterização de Enterococcus spp. isolados de alimentos quanto à presença de genes de virulência, da descarboxilase e de atividade antimicrobiana / Characterization of Enterococcus spp. isolated from foodstuffs for the presence of virulence genes, decarboxylase and antimicrobial activity

Gomes, Myrna Barbosa January 2013 (has links)
Made available in DSpace on 2015-07-08T12:28:17Z (GMT). No. of bitstreams: 2 20.pdf: 1513435 bytes, checksum: 501f4d3d3ebc806b71620f9dc5fe634f (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2013 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde / Os micro-organismos do gênero Enterococcus constituem uma grande proporção das bactérias naturais da microbiota do trato gastrointestinal da maioria dos mamíferos, aves, répteis e insetos. São ubiquitários e podem ser encontrados amplamente distribuídos no meio ambiente, em solos, água, plantas e alimentos. Estes micro-organismos foram considerados durante muito tempo comensais com baixo potencial patogênico, mas a medida que aumentou o envolvimento destes micro-organismos nas infecções nosocomiais, multirresistência aos antimicrobianos de uso terapêutico e a falta de informações sobre seus fatores de virulência enfatizaram a importância das caracterizações. O objetivo deste trabalho foi caracterizar genotipicamente amostras de enterococos isoladas de leite e frangos quanto à presença de fatores de virulência, produção de aminas biogênicas e de bacteriocinas. As amostras analisadas pertencem a espécies Enterococcus faecalis, Enterococcus casseliflavus, Enterococcus gilvus, Enterococcus faecium, Enterococcus durans, Enterococcus gallinarum e Enterococcus hirae. A presença do gene agg foi detectada em 45 (71,4%) das amostras testadas, o gene cad em 41 (65,1%), o gene ccf em 55 (87,3%), o gene cob foi detectado em 39 (61,9%) das amostras, o gene cpd 45 (71,4%), o cylA em 7 (11,1%) amostras, o cylB em 13 (20,6%) amostras, do cylM em apenas 4 (6,3%) amostras e do gene gelE em 35 (55,5%). Foram detectadas 27 (42,8%) amostras com o gene tyrdc, porém não foi detectado neste estudo amostra possuidora do gene hdc. A produção de bacteriocina foi observada em 13 (20,6%) das amostras; sendo apenas o gene da enterolisina detectado em duas delas. Os resultados apresentados neste estudo ressaltam as características das amostras de enterococos isolados de alimentos quanto à presença de fatores responsáveis por agravos a saúde humana. / The microorganisms of genus Enterococcus constitute a large proportion of the natural bacteria of the gastrointestinal tract from most mammals, birds, reptiles and insects. They are ubiquitous and can be found widely distributed in the environment in soil, water, plants and foods. These microorganisms have been considered for a long time commensals, but with increasing severity of nosocomial infections caused by them, multidrug resistance to antimicrobial agents and the lack of information about its virulence factors show the importance of new characterizations. The aim of this study was to characterize genotypically enterococci isolates from milk and chicken for the presence of virulence factors, production of biogenic amines and bacteriocins. The samples belong to the species Enterococcus faecalis, Enterococcus casseliflavus, Enterococcus gilvus, Enterococcus faecium, Enterococcus durans, Enterococcus gallinarum, and Enterococcus hirae. The presence of the agg gene was detected in 45 (71.4%) of the samples tested, the cad gene in 41 (65.1%), gene ccf in 55 (87.3%), the gene cob was detected in 39 (61.9%) of the samples, the gene cpd 45 (71.4%), the cylA in 7 (11.1%) samples, cylB in 13 (20.6%) samples, the cylM in only 4 (6.3%) samples and gene gelE in 35 (55.5%). We detected 27 (42.8%) samples with gene tyrdc, but was not detected in this study sample possessing the gene hdc. The bacteriocin production was observed in 13 (20.6%) of samples, with only the gene of enterolisina A detected in two of them. The results presented in this study emphasize the characteristics of the samples of enterococci isolated from food for the presence of factors responsible for damages to human health.
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Estudo da degradação microbiana in vitro do Poli (1,4-trans-isopreno) (in natura) e em cones dentários. / Study of in vitro degradation of poly (1,4-trans-isoprene)(in nature)and in dental cones

Souza, Lute Rafael de January 2012 (has links)
SOUZA, L. R. Estudo da degradação microbiana in vitro do Poli (1,4-trans-isopreno) (in natura) e em cones dentários. 2012. 80 f. Dissertação (Mestrado em Química) - Centro de Ciências, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2012. / Submitted by Daniel Eduardo Alencar da Silva (dealencar.silva@gmail.com) on 2014-11-24T21:40:13Z No. of bitstreams: 1 2012_dis_lrsouza.pdf: 1340876 bytes, checksum: 7896c730622fb70cb15cf7a6f3caedb4 (MD5) / Approved for entry into archive by José Jairo Viana de Sousa(jairo@ufc.br) on 2016-01-27T22:32:46Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_dis_lrsouza.pdf: 1340876 bytes, checksum: 7896c730622fb70cb15cf7a6f3caedb4 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-27T22:32:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_dis_lrsouza.pdf: 1340876 bytes, checksum: 7896c730622fb70cb15cf7a6f3caedb4 (MD5) Previous issue date: 2012 / The gutta-percha cones used in endodontic therapy, consisting of poly (1,4-trans-isoprene), ZnO and/or BaSO4 and wax/resin, were meant to last a lifetime in root canals filled by them. However, there is evidence that these materials suffer degradation with the passage of time when there shutter intensified infections by microorganisms. The bacterium Enterococcus faecalis is one of those microorganisms commonly associated with persistent periapical infections. The prevalence of this bacterium in cases of re-treatment is between 29% and 79% of cases. The objective is to study the bacterial degradation of gutta-percha in medium containing E. faecalis, with the focus on organic matter, polyisoprene. Each sample cone was immersed in mineral salts medium with inoculum concentration of 5.4 x 105 CFU/mL for periods of 10 to 100 days. The cones were removed from contact with the inoculum at various times and analized. Were weighed and characterized by TGA, GPC, FTIR, NMR H1 and SEM. The growth of the inoculum was monitored by optical density measurements, determining of percentage of mineralization of CO2, measured dry biomass cells, measurements of pH and cell count. The antimicrobial activity of inorganic constituents of cones was verified by diffusion test pit. Was observed gradual loss of mass of the cones with the degradation time. The increase in the ash content at 800 °C, shows that there was a progressive loss of organic matter and an increased proportion of inorganic constituents. After contact with E. faecalis, polyisoprene isolated cones marks Odous® and Tanari® was analized and compared and the fresh polyisoprene by GPC and FTIR. The results show that in all three cases there is small and gradual loss of the molar mass of the polyisoprene constituents of material, the more evidente in polyisoprene in nature. Infrared spectra show that degradation also ocurrs with strutural modifications of the polymer, especially in the occurrence of deformation bands of C=O and OH/OOH, and variations in the pattern of cristalinity of the bands of C=C-H. The SEM images show that changes may ocurr in the surface morphology of the cones biodegraded, resulting the from selective attack to the organic component. The NMR H1 spectra of polyisoprene fresh show that the material has undergone minor structural changes in the molecules of polyisoprene during bioassay. All bioassays monitoring indicated that the inoculum grows continuously during the period of contact with the cones or polyisoprene in nature. The bacteria degrades the organic matter of the cones using them as a source of substrate and thereby causing voids cones that can cause failure in endodontic treatment. / Os cones de guta-percha usados em endodontia, compostos de poli (1,4-trans-isopreno), ZnO e/ou BaSO4 e ceras/resinas, foram feitos para durar a vida inteira nos canais radiculares por eles preenchidos. Entretanto, existem evidências de que esses materiais sofrem degradação com o decorrer do tempo de obturação intensificada quando existem infecções por microrganismos. A bactéria Enterococcus faecalis é um desses microrganismos, normalmente associada com infecções periapicais persistentes. A prevalência dessa bactéria em casos de re-tratamento ocorre entre 29 e 79% dos casos. O objetivo do trabalho é estudar a degradação bacteriana de cones de guta-percha em meio contendo E. faecalis, com o foco na matéria orgânica, o poliisopreno. Cada amostra de cone foi imersa em meio de sais minerais com inóculo de concentração de 5,4x105 UFC/mL por períodos de 10 a 100 dias. Os cones foram removidos do contato com o inóculo em tempos variados e analisados. Foram pesados e caracterizados por TGA, GPC, FTIR, MEV e RMN H1. O crescimento do inoculo foi monitorado através de medidas de densidade óptica, determinação da porcentagem de mineralização de CO2, medidas da biomassa seca de células, medidas de pH e contagem de células. A atividade antimicrobiana dos constituintes inorgânicos dos cones foi verificada mediante o teste de difusão em poço. Foi observada perda gradual de massa dos cones com o tempo de degradação. O aumento no teor de resíduos em 800°C, mostra que houve uma perda progressiva de matéria orgânica e um aumento na proporção de constituintes inorgânicos. Após o contato com E. faecalis, o poliisopreno isolado dos cones das marcas Odous® e Tanari® foi analisado e comparado com o poliisopreno in natura por GPC e FTIR. Os resultados mostram que nos três casos ocorre uma pequena e gradual perda de massa molar do poliisopreno constituintes do material, mais evidenciada no poliisopreno in natura. Os espectros de infravermelho mostram que a degradação também ocorre com modificações estruturais do polímero, especialmente no surgimento de bandas de deformação de C=O e OH/OOH; e variações no padrão de cristalinidade das bandas de C=C-H. As imagens de MEV mostram que podem ocorrer mudanças na morfologia da superfície dos cones biodegradados, resultado do ataque seletivo ao componente orgânico. Os espectros de RMN de H1 do poliisopreno in natura mostram que o material sofreu pequenas mudanças estruturais nas moléculas de poliisopreno durante o bioensaio. Todos os bioensaios de monitoramento indicaram que o inóculo cresce continuamente durante o período de contato com os cones ou com o poliisopreno in natura. A bactéria degrada a matéria orgânica dos cones usando-os como fonte de substrato e, consequentemente, causando vazios nos cones que podem ocasionar falhas no tratamanto endodôntico.
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Comparação de métodos convencionais e semi-automatizados para identificação de Enterococcus spp.frente à biologia molecular em identificações discrepantes / Comparison of convenciaonal and semi-automatized methods to identify Enterococcus spp versus molecular biology in discrepant identifications

Donato, Silvia Tavares January 2007 (has links)
DONATO, Silvia Tavares. Comparação de métodos convencionais e semi-automatizados para identificação de Enterococus spp. frente à biologia molecular em identificações discrepantes. 2007. 85 f. Dissertação )Mestrado em Microbiologia Médica)- Universidade Federal do Ceará. Faculdade de Medicina, Fortaleza, 2007. / Submitted by denise santos (denise.santos@ufc.br) on 2012-01-05T16:14:03Z No. of bitstreams: 1 2007_dis_stdonato.pdf: 1148725 bytes, checksum: a3c4b8df96851f37a091b98fb40e19c4 (MD5) / Approved for entry into archive by Eliene Nascimento(elienegvn@hotmail.com) on 2012-02-01T14:09:56Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2007_dis_stdonato.pdf: 1148725 bytes, checksum: a3c4b8df96851f37a091b98fb40e19c4 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-02-01T14:09:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2007_dis_stdonato.pdf: 1148725 bytes, checksum: a3c4b8df96851f37a091b98fb40e19c4 (MD5) Previous issue date: 2007 / The Enterococcus are Gram-positive cocci catalase negative - which inhabit the gastrointestinal, and genitourinary tract. They are identified manually and the procedure is based on the classic of Facklam, by semi-authomatized and automatized systems as well as by Molecular Biology. Due to the diversity of identification methods and aiming to verify the concordance among some methods, it was accomplished the identification of 62 bacteria strains proceeding from the collection of the Centro Especializado em Micologia Médica (CEMM) of the Federal University of Ceará, in Brazil. They were presumably identified as Enterococcus sp. e Enterococcus faecalis by the Facklam scheme. This study was begun with the identification for two manual methods, modified from the Facklam scheme – Modified 1 and Modified 2- and semi-automatized – API 20 Strep. For the inconsistent results definition we used the semi-automatized – BBL and the Molecular Biology- PRC. The Franklin scheme identified 16% (10) as strains of the genre Enterococcus sp. and 52% (84) as E. faecalis. The Modified Scheme 1 presented the following identification: 82, 2% (51) E. faecalis, 9, 7% (6) E. mundtii and 8, 1% (5) E. gallinarum. The Modified 2 identified 98, 4% (61) E. faecalis and 1, 6% (1) E. gallinarum. The API 20 Strep identified 51,6% (32) E. faecalis, 19,4% (12) A viridans, 13,0% (8) E. avium, 4,8% (3) S. agalactiae, 3,2% (2) E. faecium, 1,6% (1) S. acidominimus, 1,6% (1) Leuconoctocc sp., 1,6% (1) S. uberis, 1,6% (1) A. adiacens and1,6% (1) unacceptable. It was made the selection of 10 sample (strains), among them, the ones numbered (05, 13, 15, 20, 27, 31, 32, 33, 50 and 60), which presented discordant results among the systems Modified 1, Modified 2 and API 20 Strep to be identified by BBL Crystal and by PCR. The BBL identified 6 samples as E. faecium, including the control- strain E. faecalis ATCC 29212 and did not identify 4 samples. In the PCR, one sample did not amplify and 9 were identified as Streptococcus spp. One sample was identified as positive for the genre Enterococcus, but it did not for the species E. faecalis and 1 (one) was amplified for the species S. agalactiae. None of the samples presented were positive for the species E. gallinarum. The control-sample – E. faecalis ATCC 29212 – was correctly amplified. With the analysis of the results, it was noticed that there was identification concordance of the 62 strains in 84% of the samples among the manual systems (Facklam, Modified 1 and Modified 2) and in 52% of the samples among the manual and semi-automatized systems (API 20 Strep). In 10 samples with disagreeing results there was no identification concordance among the manual systems, API 20 Strep and the BBL. A PCR agreed with the manual systems and the BBL and did not agree with the API 20 step, in genre, in one sample. Correlating the PCR with the API 20 Strep, there was agreement, in genre, in 01 sample and disagreement with the other systems. / Os Enterococcus são cocos Gram-positivos catalase-negativos, habitantes do trato gastrintestinal e geniturinário. São identificados por meios manuais baseados no clássico de Facklam, por sistemas semi-automatizados, automatizados e por Biologia Molecular. Em vista da diversidade de métodos de identificação e com o intuito de se verificar a concordância entre alguns métodos, foi realizada identificação de 62 cepas bacterianas, advindas da coleção do Centro Especializado em Micologia Médica (CEMM) da Universidade Federal do Ceará, Brasil, presumidamente identificadas como Enterococcus sp. e Enterococcus faecalis pelo esquema de Facklam. Este estudo iniciou-se com a identificação por três métodos manuais: esquema de facklam e dois modificados deste - Modificado 1 e Modificado 2 - e semi-automatizado – API 20 Strep. Para a definição de resultados discordantes, recorreu-se ao semi-automatizado – BBL – e à Biologia Molecular – PCR. O esquema de Facklam identificou 16% (10) como cepas do gênero Enterococcus sp. e 84% (52) como E. faecalis. O esquema Modificado 1 apresentou a seguinte identificação: 82,2% (51) E. faecalis, 9,7% (6) E. mundtii, e 8,1% (5) E. gallinarum. O Modificado 2 identificou 98,4% (61) E. faecalis e 1,6% (1) E. gallinarum. O API 20 Strep identificou 51,6% (32) E. faecalis, 19,4% (12) A viridans, 13,0% (8) E. avium, 4,8% (3) S. agalactiae, 3,2% (2) E. faecium, 1,6% (1) S. acidominimus, 1,6% (1) Leuconoctocc sp., 1,6% (1) S. uberis, 1,6% (1) A. adiacens e 1,6% (1) Inaceitável. Foram selecionadas 10 amostras (cepas n°s 05, 13, 15, 20, 27, 31, 32, 33, 50 e 60), que apresentaram resultados discordantes entre os sistemas Modificado 1, Modificado 2 e API 20 Strep para serem identificadas pelo BBL Crystal e por PCR. O BBL identificou 6 amostras como E. faecium, inclusive a cepa-controle E. faecalis ATCC 29212 e não identificou 4 amostras. Na PCR, uma amostra não amplificou e 9 foram identificadas como Streptococcus spp.. Uma amostra apresentou-se positiva para o gênero Enterococcus, mas não para a espécie E. faecalis e 1 (uma) amplificou para a espécie S. agalactiae. Nenhuma das amostras se apresentou positiva para a espécie E. gallinarum. A amostra-controle – E. faecalis ATCC 29212 - foi amplificada corretamente. Com a análise dos resultados, verificou-se que houve concordância de identificação das 62 cepas em 84% das amostras entre os sistemas manuais (Facklam, Modificado 1 e Modificado 2) e em 52% das amostras entre os sistemas manuais e semi-automatizado (API 20 Strep). Nas 10 amostras com resultados discrepantes, não houve concordância de identificação entre os sistemas manuais, API 20 Strep e o BBL. A PCR concordou com os sistemas manuais e o BBL e foi discordante do API 20 Strep, em gênero, em 01 amostra. Correlacionando a PCR com o API 20 Strep, houve concordância, em gênero, em 01 amostra e foi discordante dos demais sistemas. Para aumentar a sensibilidade de identificação de Enterococcus spp. devem ser utilizados pelo menos dois métodos com testes fenotípicos. Amostras com identificações discordantes devem ser reidentificadas por PCR.
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Análise dos fatores de virulência em Enterococcus faecalis isolados de humanos, alimentos e frangos / Analysis of virulence factors in Enterococcus faecalis isolated from humans, foods and chickens

Cassenego, Ana Paula Vaz January 2014 (has links)
Este estudo objetivou investigar a distribuição e a relação entre os genes envolvidos com a virulência e formação de biofilme em 196 Enterococcus faecalis isolados de alimentos, clínicos e suabes cloacais de frangos de corte que receberam oocistos de Eimeria maxima e Eimeria acervulina e ração suplementada ou não com anticoccidiano. No primeiro experimento foi investigada a frequência dos genes agg, ace, tet(M), tet(L) e do operon bopABCD; e foi analisada a produção da enzima gelatinase em duas temperaturas de crescimento (36°C e 42°C). Assim como a capacidade de formar biofilme em meio de cultura suplementado com 10% de sangue, 10% de urina ou 0,75% de glicose por 70 Enterococcus faecalis isolados de frangos. Os Enterococcus faecalis isolados de frangos de corte que receberam oocistos de Eimeria maxima e Eimeria acervulina e ração suplementada ou não com anticoccidiano apresentaram capacidade de se adaptar a diferentes nichos biológicos, como por exemplo, sangue e urina. Foi observado um alto percentual dos genes dos fatores de virulência. No segundo experimento, foi avaliada a diversidade filogenética, com base no método de PCR, de 182 cepas isoladas de humanos, frangos de corte e alimentos. Estas cepas formaram quatro grupos filogenéticos (A, B, C e D) e quatro subgrupos (A1, A2, B1 e B2) com índice de similaridade entre 65 a 100%, demonstrando a adaptação de Enterococcus faecalis a diferentes ambientes. No terceiro experimento, foi determinada a capacidade de formação de biofilme de isolados clínicos e alimentares em diferentes meios de cultivo. Observou-se que o meio suplementado com 0,75% de glicose demonstrou ser o mais adequado para estabelecimento de forte aderência e, consequente formação do biofilme microbiano nos isolados de todas as origens. Em contrapartida, o meio suplementado com 10% de sangue foi o que registrou as maiores taxas de fraca formação de biofilme. Os estudos conduzidos demonstram características fenotípicas e genotípicas de Enterococcus faecalis que sugerem uma ampla adaptação ambiental entre os isolados pesquisados. / This study aimed to investigate the distribution and the relationship between genes involved in virulence and biofilm formation in 196 Enterococcus faecalis isolates from food, clinical and cloacal swabs of broilers that received oocysts of Eimeria maxima and Eimeria acervulina and diet supplemented or not with anticoccidial. The first experiment investigated the frequency of agg, ace, tet(M), tet(L) genes and bopABCD operon; production of gelatinase enzyme was analyzed at two growth temperatures (36°C and 42°C). Thus the ability to form biofilm in culture medium supplemented with 10% of blood, 10% of urine and glucose 0.75% for 70 Enterococcus faecalis isolates of chicken. The Enterococcus faecalis isolates from broilers that received oocysts of Eimeria maxima and Eimeria acervulina and supplemented or not with anticoccidial showed the ability to adapt to different biological niches, such as blood and urine. A high percentage of genes of virulence factors were observed. In the second experiment, we evaluated the phylogenetic diversity based on PCR method of 182 strains isolated from humans, broilers and food. These strains formed four phylogenetic groups (A, B, C and D) and four subgroups (A1, A2, B1 and B2) with similarity index between 65 and 100%, demonstrating the adaptation of Enterococcus faecalis to different environments. In the third experiment, the ability of biofilm formation of clinical and food isolates in different culture media was determined. It was observed that the medium supplemented with 0.75% glucose was shown to be more suitable for the establishment of strong adhesion and subsequent formation of the biofilm isolates from all sources. In other hand, medium supplemented with 10% blood was reported that the highest rates of weak biofilm formation. Studies conducted show phenotypic and genotypic characteristics of Enterococcus faecalis that suggest a broad environmental adaptation among the isolates studied.
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Probióticos autóctones em Crassostrea gasar de cultivo

Ferreira, Tamiris Henrique January 2016 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Aquicultura, Florianópolis, 2016. / Made available in DSpace on 2017-01-03T03:16:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 343104.pdf: 1046670 bytes, checksum: e9b58b4bd161b934fec770a523f5127f (MD5) Previous issue date: 2016 / O objetivo deste trabalho foi isolar cepas de bactérias da gônada e da parte final do intestino de Crassostrea gigas e avaliar sua utilização como probiótico na Crassostrea gasar desafiada com Vibrio parahaemolyticus a fim de melhorar a resposta imune de ostras adultas e a sobrevivência das larvas após desafio experimental. Apenas duas cepas de bactérias foram isoladas, uma a partir da gônada (Enterococcus faecium) e outra do intestino (Enterococcus durans), que seguiram para testes in vitro de antagonismo, taxa de crescimento, tempo de duplicação e contagem de células viáveis. Quanto a eventuais melhorias nos parâmetros imunológicos, microbiológicos e histológicos, as cepas de E. faecium e de E. durans foram aplicadas na água na concentração de 105 UFC ? mL-1 durante 15 dias para ostras adultas da espécie C. gasar, alimentadas com Chaetoceros muelleri. Enterococcus durans foi a única cepa utilizada para a sobrevivência das larvas "D". As larvas foram divididas em quatro grupos, Controle, tratado com E. durans, Controle desafiado com Vibrio parahemolyticus e E. durans desafiado com V. parahemolyticus. E. durans apresentou melhores resultados in vitro. Análises imunológicas das ostras demonstraram que a aplicação das cepas de E. durans mostrou maior título aglutinante e atividade de fenoloxidase após 15 dias de tratamento do que o grupo controle e o grupo tratado com E. faecium. A aplicação de E. faecium e Enterococcus durans promoveu o aumento do número de bactérias heterotróficas totais e ácido-láctica totais. A sobrevivência das larvas tratadas com o E. durans mostrou-se maior do que dos demais grupos. Tendo isso em vista, a cepa probiótica com o maior potencial para a cultura de C. gasar é a E. durans.<br> / Abtsract : The aim of this work was to isolate strains of bacteria from the gonad and final part of the intestine of Crassostrea gigas and evaluate its use as probiotic on Crassostrea gasar challenged with Vibrio parahaemolyticus, in order to improve the immune response of adult oysters and larval survival after experimental challenge. Only two bacterial strains were isolated, one from the gonad (Enterococcus faecium) and the other from the intestine (Enterococcus durans), which were followed by in vitro tests of antagonism, growth rate, doubling time and viable cell count. Towards possible improvements in the immune, microbiological and histological parameters, E. faecium (TG) and E. durans (TI) strains were enforced in water at a concentration of 105 CFU ? mL-1 during 15 days for adult oysters of the specie C. gasar which were fed with Chaetoceros muelleri. E. durans was the only strain used for larval survival "D". The larvae were divided into four groups, Control, treated with E. durans, Control challenged with Vibrio parahemolyticus and E. durans challenged with V. parahemolyticus. The strain that showed best in vitro results was E. durans bacteria. Immunological analyzes of oysters demonstrated that the application of E. durans strain showed higher binding capacity and phenoloxidase activity after 15 days of treatment than control groups and the one treated with E. faecium. The application of E. faecium and E. durans increased the numbers of total heterotrophic bacteria and the total lactic acid. The survival of the larvae treated with E. durans showed higher than that of other groups. In view of this, the probiotic strain with the highest potential for the cultivation of C. gasar is E. durans.
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Avaliação da colonização e resistência antimicrobiana de Enterococcus sp. isolados de "swabs" cloacais de frangos de corte / Colonization and antimicrobial resistance evaluation of Enterococcus sp. Isolated from cloacal swabs of broiler chickens

Cassenego, Ana Paula Vaz January 2010 (has links)
Bactérias comensais do intestino de frangos tornaram-se objeto frequente de estudos, pois a alta taxa de exportação desses produtos tem aumentado a preocupação com a qualidade e a sanidade de granjas no que se refere à nutrição animal, ganho de peso e doenças infecciosas. O objetivo do presente estudo foi verificar a influência de diferentes dietas para frangos de corte na colonização, assim como no fenótipo e genótipo de resistência antimicrobiana de isolados Enterococcus sp. Amostras de “swabs” cloacais de frangos de corte foram utilizadas para isolamento de Enterococcus sp. Os frangos foram submetidos a diferentes dietas contendo promotores de crescimento, probióticos, óleos essenciais e coccidiostáticos ionóforos, e divididos em grupos conforme o tratamento empregado. Foram obtidos 240 isolados de Enterococcus sp. confirmados para gênero através da técnica de Reação em Cadeia pela Polimerase (PCR), submetidos a testes bioquímicos e moleculares para identificação de espécie, determinados os perfis de susceptibilidade a diversos antimicrobianos e testados para a presença de genes de resistência tet(M), tet(L) e erm(B) por PCR. Observou-se uma alteração na composição ou no número de espécies de Enterococcus sp. de acordo com as dietas empregadas. Todas as dietas, independentes da presença ou não de coccidiostático ionóforo, apresentaram um aumento na freqüência de Enterococcus resistentes quando comparados com o grupo controle. No entanto, nos grupos que os frangos receberam coccidiostático ionóforo, a taxa de Enterococcus sp. isolados foi menor quando comparada aos isolados dos grupos que não receberam essa composição. Do total de isolados resistentes à tetraciclina, 94% e 30%, continham os genes tet(M) e tet(L), respectivamente. Dos isolados resistentes a eritromicina, 97,9% possuíam o gene de resistência erm(B). Não houve correlação das diferentes dietas para frangos de corte na colonização, fenótipo e genótipo de resistência antimicrobiana de isolados de Enterococcus sp. / Commensal bacteria from the gut of chickens have been frequently object of studies because the high rate of exportation of these products the concern with the quality and health of poultry, in relation to animal nutrition, weight gain and infectious diseases has been increasing. The principal aim of this study was to verify the influence of different diets treated to broilers, in the colonization of Enterococcus strains, and as well the phenotype and genotype of resistance strains. Samples from cloacal swabs of broiler chickens were used for the isolation of strains of Enterococcus sp. The broilers were subjected to diets with growth promoter, probiotics, essential oils and ionophore coccidiostat and divided into groups according to treatment used. Two hundred forty isolates of Enterococcus sp. were confirmed the genus using the polymerase chain reaction (PCR), subjected to biochemical and molecular species identification, antibiotic susceptibility profile and verification of antibiotic resistance genes tet(M), tet(L) e erm(B) by PCR. Accordingly to the diets employed to the chickens a changing the composition or the number of Enterococcus sp. was observed. All diets, regardless to the presence or absence of ionophore coccidiostat showed an increase in the frequency of Enterococcus resistant when compared with the control group. However, the groups that received ionophore coccidiostat, the rate of resistant Enterococcus sp. was lower than the groups that did not administered this composition. The isolates that presented resistant to tetracycline, 94% and 30%, contained the genes tet(M) and tet(L), respectively. In the isolates resistant to erythromycin, 97.9% had the gene erm(B). There was no correlation of different diets for broiler chickens on colonization, phenotype and genotype resistance in the Enterococcus sp strains.
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Análise comparativa da ação antimicrobiana dos cimentos endodônticos Acroseal, Sealapex e AH plus pós presa em biofilme de enterococcus faecalis

Rezende, Gabriely Cristinni [UNESP] 23 February 2015 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2015-06-17T19:33:56Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-23. Added 1 bitstream(s) on 2015-06-18T12:47:49Z : No. of bitstreams: 1 000830347.pdf: 242986 bytes, checksum: 3957e431d5fb3368b3a93a697bd645dd (MD5) / Enterococcus faecalis é uma bactéria Gram-positiva que pode resistir ao tratamento endodôntico e manter a infecção presente no sistema de canais radiculares. Assim, o uso de cimentos endodônticos com atividade antimicrobiana pode ajudar a eliminar microrganismo residuais que sobreviveram após o tratamento endodôntico. Diante dessa realidade, o presente estudo teve por objetivo avaliar comparativamente a ação antimicrobiana dos cimentos endodônticos Acroseal, Sealapex e AH Plus em um modelo de biofilme in vitro. Para a realização do estudo foram confeccionados 144 espécimes de dentina bovina, sendo doze blocos para cada cimento em cada tempo experimental que permaneceram em placas contendo meio de cultura inoculado com E. faecalis (ATCC 51299) para permitir a formação de biofilme. Decorrido 14 dias, os espécimes foram transferidos para outra placa onde discos dos cimentos testados foram colocados sobre o biofilme formado. As placas de cultura foram deixadas em estufa a 37°C e 5% de CO2 por 2, 7 e 14 dias. Espécimes sem aplicação dos cimentos foram utilizados como controle para cada período. Após cada tempo experimental, as amostras foram agitados em sonicador. As suspensões foram agitadas em vortex e foi realizada uma diluição seriada decimal em solução salina, sendo estas diluições plaqueadas em triplicata em meio de cultura m-Enterococcus ágar. As unidades formadoras de colônia foram contadas e os dados analisados estatisticamente usando os teste ANOVA, Shapiro-Wilk e Kruskal-Wallis one-way (p<0,05) para determinação do potencial antimicrobiano. Resultados: O Sealapex apresentou diferença estatística em todos os tempos experimentais quando comparado com os demais grupos. O AH Plus e o Acroseal mostraram atividade antimicroabina apenas no 14o dia de experimento. Conclusão: Nenhum... / Enterococcus faecalis is a gram positive bacteria that can resist to the endodontic therapy and maintain the infection present in the root canal system. Therefore, the use of endodontic sealers with antimicrobial activity could help to eliminate residual microorganism that have survived after endodontic treatment. The present study aimed to compare the antimicrobial activity of the endodontic sealers Acroseal, Sealapex and AH Plus in vitro biofilm model. It were prepared 144 bovine dentin specimens, twelve blocks for each cement in each experimental time that remained in plates containing culture medium inoculated with E. faecalis (ATCC 51299) for biofilm formation. After 14 days, the samples were transferred to another plate with test sealers and were kept at 37oC and 5% CO2 for 2, 7 and 14 days. Specimens without sealers were used as a control for each period. After each experimental, the samples were agitated in sonicator. The suspensions were agitated in vortex and serially diluted in saline and triple plaqued in m-Enterococcus agar. Colony forming unit were counted and the data were statistically analyzed using ANOVA, Shapiro-Wilk and Kruskal-Wallis one-way test (p<0.05) for the antimicrobial potential determination. Results: Sealapex showed significant difference in all experimental times in comparison to all other groups. AH Plus and Acroseal showed antimicrobial activity just at 14th experimental day. Conclusion: Neither of sealers setting tested was able to remove biofilm . The Sealapex showed higher antimicrobial activity in all experimental periods. All sealers examined the antimicrobial effectiveness was higher with over time
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Citocompatibilidade, propriedades antibiofilme e físicas e cimentos endodônticos associados à amoxilina

Andolfatto, Carolina [UNESP] 05 February 2015 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2015-09-17T15:25:03Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-05. Added 1 bitstream(s) on 2015-09-17T15:49:25Z : No. of bitstreams: 1 000845518_20160402.pdf: 83963 bytes, checksum: b27fb8e88a318385605bd8bd1405bf1a (MD5) Bitstreams deleted on 2016-04-04T12:10:26Z: 000845518_20160402.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-04-04T12:11:06Z : No. of bitstreams: 1 000845518.pdf: 674514 bytes, checksum: 62da913b8ef513635c243ef06495c521 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Cimentos endodônticos associados à amoxicilina têm sido pesquisados como uma alternativa para obturação do canal radicular. Os objetivos do presente estudo foram: Avaliar a citocompatibilidade do AH Plus e do Sealapex associados com amoxicilina em quantidade de 10% do peso total dos cimentos (Capítulo 1) e avaliar o escoamento e o tempo de presa dos cimentos AH Plus e Sealapex associados à amoxicilina em diferentes concentrações e a atividade antibiofilme dos cimentos associados a uma maior concentração de amoxicilina que não altera as propriedades físicas de ambos os cimentos (Capítulo 2). No Capítulo 1 a citocompatibilidade dos materiais foi avaliada utilizando fibroblastos L929 expostos por 24 horas a diferentes diluições dos extratos dos cimentos puros e associados à amoxicilina. Os ensaios de brometo de 3-(4,5-dimetil-2-tiazolil )-2,5-difenil-2Htetrazólio (MTT) e vermelho neutro foram utilizados para avaliação da viabilidade celular e a fluorescência para actina e α-tubulina foram utilizadas para análise do citoesqueleto. Os dados foram analisados empregando a análise de variância a dois critérios e pós teste de Bonferroni, com nível de significância de 5%. Os resultados mostraram que a incorporação de amoxicilina na concentração de 10% do peso total dos cimentos não diminuiu a viabilidade dos fibroblastos e não causou alterações estruturais nos componentes do citoesqueleto estudados. Conclui-se que à amoxicilina poderia ser um agente antimicrobiano promissor para ser incorporada aos cimentos endodônticos. No Capítulo 2 o escoamento a o tempo de presa dos cimentos puros ou associados à amoxicilina em concentrações de 0,25 a 10% foram estudadas de acordo com a especificação no6876 da Organização Internacional de Padronização (ISO 2012). A avaliação antibiofilme dos cimentos puros e associados à amoxicilina 1% foi realizada por teste de contato...(Resumo completo clicar acesso eletrônico) / Sealers associatedwith amoxicillinhave been developed as an alternative to root canal filling. The objectives of this study were to evaluate the cytocompatibility of AH Plus and Sealapex associated with amoxicillin in concentration of 10% of the total weight of sealer (Chapter 1) and evaluate the flow and the setting time of AH Plus sealer and Sealapex associated with amoxicillin at different concentrations and the activity of sealers antibiofilm associated with higher concentrations of amoxicillin which does not alter the physical properties of both sealers (Chapter 2). In Chapter 1 cytocompatibility of the materials was assessed using the L929 fibroblasts exposed for 24 hours with different dilutions of the extracts of pure sealer and associated with amoxicillin. The testing of 3- (4,5-dimethyl-2-thiazolyl) -2,5-diphenyl-2H-tetrazolium (MTT), and neutral red were used for evaluation of cell viability and fluorescence actin and α-tubulin were used for analysis of the cytoskeleton. Data were analyzed using analysis of variance and two criteria Bonferroni post test at 5% significance level. The results showed that incorporation of amoxicillin at a concentration of 10% by weight of the sealer did not decrease the viability of fibroblasts and did not cause structural changes in the cytoskeletal components studied. It is concluded that amoxicillin could be a promising antimicrobial agent to be incorporated in sealers. In chapter 2 the flow and setting time of the sealer pure or associated with amoxicillin from 0.25 to 10% concentrations were evaluated according to no 6876 specification of the International Organization for Standardization (ISO 2012). The antibiofilm evaluation of pure sealer and 1% associated with amoxicillin was performed by direct contact test with Enterococcus faecalis biofilm previously induced in bovine dentin for 14 days. Fresh sealer were in contact with the biofilm... (Complete abstract electronic access below)
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Avaliação da colonização e resistência antimicrobiana de Enterococcus sp. isolados de "swabs" cloacais de frangos de corte / Colonization and antimicrobial resistance evaluation of Enterococcus sp. Isolated from cloacal swabs of broiler chickens

Cassenego, Ana Paula Vaz January 2010 (has links)
Bactérias comensais do intestino de frangos tornaram-se objeto frequente de estudos, pois a alta taxa de exportação desses produtos tem aumentado a preocupação com a qualidade e a sanidade de granjas no que se refere à nutrição animal, ganho de peso e doenças infecciosas. O objetivo do presente estudo foi verificar a influência de diferentes dietas para frangos de corte na colonização, assim como no fenótipo e genótipo de resistência antimicrobiana de isolados Enterococcus sp. Amostras de “swabs” cloacais de frangos de corte foram utilizadas para isolamento de Enterococcus sp. Os frangos foram submetidos a diferentes dietas contendo promotores de crescimento, probióticos, óleos essenciais e coccidiostáticos ionóforos, e divididos em grupos conforme o tratamento empregado. Foram obtidos 240 isolados de Enterococcus sp. confirmados para gênero através da técnica de Reação em Cadeia pela Polimerase (PCR), submetidos a testes bioquímicos e moleculares para identificação de espécie, determinados os perfis de susceptibilidade a diversos antimicrobianos e testados para a presença de genes de resistência tet(M), tet(L) e erm(B) por PCR. Observou-se uma alteração na composição ou no número de espécies de Enterococcus sp. de acordo com as dietas empregadas. Todas as dietas, independentes da presença ou não de coccidiostático ionóforo, apresentaram um aumento na freqüência de Enterococcus resistentes quando comparados com o grupo controle. No entanto, nos grupos que os frangos receberam coccidiostático ionóforo, a taxa de Enterococcus sp. isolados foi menor quando comparada aos isolados dos grupos que não receberam essa composição. Do total de isolados resistentes à tetraciclina, 94% e 30%, continham os genes tet(M) e tet(L), respectivamente. Dos isolados resistentes a eritromicina, 97,9% possuíam o gene de resistência erm(B). Não houve correlação das diferentes dietas para frangos de corte na colonização, fenótipo e genótipo de resistência antimicrobiana de isolados de Enterococcus sp. / Commensal bacteria from the gut of chickens have been frequently object of studies because the high rate of exportation of these products the concern with the quality and health of poultry, in relation to animal nutrition, weight gain and infectious diseases has been increasing. The principal aim of this study was to verify the influence of different diets treated to broilers, in the colonization of Enterococcus strains, and as well the phenotype and genotype of resistance strains. Samples from cloacal swabs of broiler chickens were used for the isolation of strains of Enterococcus sp. The broilers were subjected to diets with growth promoter, probiotics, essential oils and ionophore coccidiostat and divided into groups according to treatment used. Two hundred forty isolates of Enterococcus sp. were confirmed the genus using the polymerase chain reaction (PCR), subjected to biochemical and molecular species identification, antibiotic susceptibility profile and verification of antibiotic resistance genes tet(M), tet(L) e erm(B) by PCR. Accordingly to the diets employed to the chickens a changing the composition or the number of Enterococcus sp. was observed. All diets, regardless to the presence or absence of ionophore coccidiostat showed an increase in the frequency of Enterococcus resistant when compared with the control group. However, the groups that received ionophore coccidiostat, the rate of resistant Enterococcus sp. was lower than the groups that did not administered this composition. The isolates that presented resistant to tetracycline, 94% and 30%, contained the genes tet(M) and tet(L), respectively. In the isolates resistant to erythromycin, 97.9% had the gene erm(B). There was no correlation of different diets for broiler chickens on colonization, phenotype and genotype resistance in the Enterococcus sp strains.

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