Submitted by Ronildo Prado (ronisp@ufscar.br) on 2017-07-19T10:44:04Z No. of bitstreams: 1 TeseSRBJ.pdf: 5473127 bytes, checksum: 6ad9d0f7d24cadafbff18e445b8736d1 (MD5) / Approved for entry into archive by Ronildo Prado (ronisp@ufscar.br) on 2017-07-19T10:44:16Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseSRBJ.pdf: 5473127 bytes, checksum: 6ad9d0f7d24cadafbff18e445b8736d1 (MD5) / Approved for entry into archive by Ronildo Prado (ronisp@ufscar.br) on 2017-07-19T10:44:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseSRBJ.pdf: 5473127 bytes, checksum: 6ad9d0f7d24cadafbff18e445b8736d1 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-19T10:45:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseSRBJ.pdf: 5473127 bytes, checksum: 6ad9d0f7d24cadafbff18e445b8736d1 (MD5) Previous issue date: 2016-12-16 / Não recebi financiamento / Introduction. The datasets used in observational studies have instances belonging to two distinct groups (i.e. treatment group and control group), which are compared in order to estimate the effect of the treatment over the results. For such, in one of the approaches, called Propensity Score Matching (PSM), the propensity score for the instances of both groups is estimated and, subsequently, the correspondence of these instances is performed based on the values for the propensity score. The propensity score is the probability of attribution of a treatment based on the observed characteristics (e.g. income, sex and age). In this context, the logistic regression is widely used to estimate the propensity score and there is an great variety of instance correspondence methods. Objective. This doctor´s thesis has as its main objective to investigate computational alternatives in order to improve the quality of the instance correspondence in datasets that are manipulated in observational studies. Methodology. Techniques that estimate the propensity score and methods to perform the instance correspondence in observational studies were investigated. Thus, it was possible to investigate how the identical characteristics of the instances could be exploited in a new process to perform correspondence and, how ensembles could substitute the logistic regression by estimating the propensity scores of the instances, in the context of the PSM process. Proposal. This thesis proposes a new approach in the context of the PSM process, called “SEnsembles”, which aims to improve the quality of instance correspondence based on two main processes, which use techniques that separately consider the identical characteristics of the instances and the ensembles of regressors, more precisely, bagging, random forest and boosting. Results. The proposed approach “SEnsembles” improves the quality of the instance correspondence for the majority of calipers used (i.e. zero, 0.05, 0.10, 0.15, 0.20, 0.25 and 0.30) when compared to the baseline Nearest Neighbor Matching (NNM). Based on the experiments, when there was an improvement over the baseline, the technique that separates the identical characteristics of the instances presented improvements of up to 53.8% in the quality of correspondence, with an average of gains of 12.1%; and only 2.7% of average in the reduction of the number of pairs of instances matched. The technique which substituted the logistic regression for ensembles of regressors, in turn, presented the best correspondence with the caliper zero and with the values 0.20, 0.25 and 0.30, with improvements of up to 36.3% and an average of gains of 12.7%; and a slightly reduction of 7.6% in the number of pairs of instances matched. / Introdução. Os conjuntos de dados manipulados em estudos observacionais possuem instâncias pertencentes a dois grupos distintos (i.e. grupo de tratamento e grupo de controle), as quais são comparadas para estimar o efeito do tratamento sobre os resultados. Para isso, em uma das abordagens, chamada de Propensity Score Matching (PSM), estima-se o escore de propensão para as instâncias de ambos os grupos e, em seguida, efetua-se a correspondência dessas instâncias com base nos valores dos escores de propensão. O escore de propensão é a probabilidade de atribuição de um tratamento com base nas características observadas (por exemplo, renda, sexo e idade). Neste contexto, a regressão logística é amplamente utilizada para estimar o escore de propensão e há uma ampla variedade de métodos de correspondência de instâncias. Objetivo. Esta pesquisa de doutorado tem como objetivo principal investigar alternativas computacionais para melhorar a qualidade das correspondências de instâncias em conjuntos de dados que são manipulados em estudos observacionais. Metodologia. Investigou-se técnicas que estimam o escore de propensão e métodos para se efetuar a correspondência das instâncias em estudos observacionais. Assim, foi possível investigar como as características idênticas das instâncias poderiam ser exploradas em um novo processo de correspondência e, como ensembles, mais precisamente, bagging, random forest e boosting, poderiam substituir a regressão logística ao estimar os escores de propensão das instâncias, no contexto do processo de PSM. Proposta. Esta pesquisa propõe uma nova abordagem no contexto do processo PSM, denominada “SEnsembles”, que visa melhorar a qualidade da correspondência das instâncias com base em 2 processos principais, os quais utilizam técnicas que considerem em separado as características idênticas das instâncias e os ensembles de regressores, mais precisamente, bagging, random forest e boosting. Resultados. A abordagem proposta “SEnsembles” melhorou a qualidade da correspondência de instâncias para a maioria dos calipers utilizado (zero, 0,05, 0,10, 0,15, 0,20, 0,25 e 0,30) quando comparada ao baseline Nearest Neighbor Matching (NNM). Com base nos experimentos, quando houve ganho, a técnica que separa as características idênticas das instâncias proporcionou ganhos de até 53,8% na qualidade da correspondência, com média de 12,1% de melhoria e 2,7% de redução média do número de pares de instâncias correspondidas. Já a técnica que substituiu a regressão logística pelos ensembles proporcionou as melhores correspondências com o caliper zero e com os valores 0,20, 0,25 e 0,30, com ganhos de até 36,3% e, com média de 12,7% de melhoria e 7,6% de redução do número de pares de instâncias correspondidas.

Submitted by Vânia Casari Mussato null (vaniacasari@hotmail.com) on 2017-04-25T16:10:19Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_Vania_Casari_Mussato.pdf: 1286922 bytes, checksum: 0057f368a3285e7a1e5ec62f97e96210 (MD5) / Rejected by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo a orientação abaixo: O arquivo submetido não contém o certificado de aprovação. Corrija esta informação e realize uma nova submissão com o arquivo correto. Agradecemos a compreensão. on 2017-04-26T16:29:37Z (GMT) / Submitted by Vânia Casari Mussato null (vaniacasari@hotmail.com) on 2017-05-08T22:39:05Z No. of bitstreams: 2 Dissertação_Vania_Casari_Mussato.pdf: 1286922 bytes, checksum: 0057f368a3285e7a1e5ec62f97e96210 (MD5) dissertação_Vania_casari1.pdf: 1221552 bytes, checksum: 8063cdb0ce0e0bc36ba902406d97e5e8 (MD5) / Rejected by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo as orientações abaixo: Foram submetidos 2 arquivos PDF’s, apenas 1 arquivo deve ser submetido. O arquivo PDF não deve estar protegido e a dissertação/tese deve estar em um único arquivo, inclusive os apêndices e anexos, se houver. Corrija estas informações e realize uma nova submissão contendo o arquivo correto. Agradecemos a compreensão. on 2017-05-09T20:13:06Z (GMT) / Submitted by Vânia Casari Mussato null (vaniacasari@hotmail.com) on 2017-05-14T14:37:36Z No. of bitstreams: 1 DissertaçãoFinal_Vânia_Casari_Mussato.pdf: 1328651 bytes, checksum: b03c865d53d68c0a505ffc12f5024859 (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-05-16T12:49:04Z (GMT) No. of bitstreams: 1 mussato_vc_me_jabo.pdf: 1328651 bytes, checksum: b03c865d53d68c0a505ffc12f5024859 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-16T12:49:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 mussato_vc_me_jabo.pdf: 1328651 bytes, checksum: b03c865d53d68c0a505ffc12f5024859 (MD5) Previous issue date: 2017-04-11 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA) / As medidas de temperamento possuem notória relevância econômica devido a sua associação com características de interesse produtivo. Essas medidas podem ser utilizadas como critérios de seleção de bovinos, requerendo identificação de fatores ambientais que as influenciem, assim como a verificação de variabilidade genética e a inter-relação destas com as demais características de interesse ao sistema de produção. O objetivo deste estudo foi estimar parâmetros genéticos, fenotípicos e ambientais de quatro medidas de avaliação do temperamento de bovinos da raça Canchim. As medidas de temperamento utilizadas foram: tempo de saída (TS), escore composto de temperamento (ECT), escore total (ET) e reatividade (REAT). Neste trabalho foram analisadas 2090 informações de bovinos da raça Canchim provenientes da fazenda Canchim, pertencente à Embrapa Pecuária Sudeste, situada na cidade de São Carlos, SP. As características foram analisadas utilizando-se um modelo animal, por meio de análises bi-característica. Para todas as características, o grupo de contemporâneos (GC) foi formado por animais nascidos no mesmo ano e pertencentes ao mesmo sexo. As avaliações foram realizadas durante as fases de desmama, ano e sobreano. As medidas de temperamento apresentaram estimativas de herdabilidade que variaram de 0,07 (0,142) (TS na desmama) a 0,36 (0,240) (TS, ao sobreano). As baixas magnitudes das estimativas indicam que as características são influenciadas principalmente por práticas de manejo e pelas condições ambientais, sendo importante o conhecimento de tais fatores para ações de seleção. As estimativas de correlação genética foram maiores entre ETxREAT (1,00 no sobreano), enquanto entre ETxTS e REATxTS as estimativas foram de -0,26 e -0,43, respectivamente no sobreano. As correlações genéticas estimadas entre as medidas de temperamento sugerem que os mesmos conjuntos de genes aditivos atuam na determinação das diferentes medidas de temperamento. Os coeficientes de repetibilidade foram 0,34, 0,57 e 0,43 para as variáveis ET, REAT e TS, respectivamente. Os resultados demonstram que o temperamento pode vir a ser utilizado como critério de seleção visando obter animais mais dóceis. / Temperament is a trait of notable economic relevance, due to its association with management and productive trait, and can be used as a selection criterion of cattle, requiring identification of environmental factors that influence, as well as the verification of genetic variability and the interrelationship with the other characteristics of interest to the production system. The objective of this study was to estimate genetic, phenotypic and environmental parameters using four measures of temperament evaluated on Canchim cattle. The temperament measures used were: flight speed (TS), composite score of temperament (ECT), total score of temperament (ET) and reactivity (REAT). This study analyzed 2090 information of Canchim cattle from the Canchim farm belonging to Embrapa Pecuária Sudeste, located at São Carlos, SP. The temperament traits were analyzed using an animal model, through bi-trait analyzes. For all traits, the contemporaries group (CG) was formed by animals born in the same year and belonging to the same sex. The evaluations were carried out during the weaning, yearling and long yearling phases. The temperament measures showed heritability estimates ranging from 0,07 (0,142) (TS at weaning) to 0,36 (0,240) (TS at yearling) values of moderate to low magnitude that were influenced by management practices and environmental conditions, being important knowledge such factors for selection actions. The genetic correlation estimates were higher for ETxREAT (1.00 at long yearling), while for ETxTS and REATxTS they presented values of -0.26 and -0.43, respectively during long yearling. The estimated genetic correlations between the temperament measures suggest that the same sets of additive genes act to determine the different measures of temperament. The repeatability coefficients were 0.34, 0.57 and 0.43 for the ET, REAT and TS variables, respectively. The results show that temperament can be used as a selection criterion in order to obtain more docile animals.

Introdução: A miocardiopatia chagásica (MC) apresenta pior prognóstico que as etiologias isquêmica e não isquêmica de miocardiopatia, e acarreta alto custo. A fibrose miocárdica (FM) detectada pela Ressonância Magnética Cardíaca (RMC) mostrou-se um fator preditor independente de risco aumentado em diversas etiologias de insuficiência cardíaca. Na MC, a FM foi associada com marcadores conhecidos de pior prognóstico, como a disfunção ventricular esquerda e arritmia ventricular. Nossa hipótese é que a FM é um fator preditor independente de pior prognóstico na MC. Objetivos: Buscamos estabelecer o valor prognóstico da FM detectada pela RMC na predição de uma combinação de desfechos duros ou do desfecho secundário mortalidade por todas as causas. Adicionalmente, avaliamos se o valor prognóstico da FM é independente do Escore de Rassi. Métodos: Pacientes com MC foram incluídos retrospectivamente após a realização da RMC, que avaliou volumes e função cardíacos, além de quantificar a FM. Dados clínicos, de imagem e seguimento foram registrados, e o desfecho primário foi a combinação de mortalidade por todas as causas, transplante cardíaco, terapia antitaquicardia ou choque apropriado pelo cardiodesfibrilador implantável e morte súbita cardíaca abortada; o desfecho secundário foi mortalidade por todas as causas. Resultados: Foram incluídos no estudo130 pacientes, a maioria de mulher (53,9%), com idade média de 53,6±11,5 anos. A maioria dos pacientes (68,4%) não tinha sintomas de insuficiência cardíaca, apesar da dilatação ventricular esquerda (54%) e alterações da contratilidade (65,9%) serem comuns. A RMC mostrou dilatação do ventrículo esquerdo (volume diastólico final indexado médio de 118,6±50,5ml/m²) e disfunção sistólica (fração de ejeção média de 43,2±16,3%) e a FM foi identificada em 76,1%, massa média de 15,2±16,5g. Ao longo do seguimento médio de 6,8 anos, 58 (44,6%) pacientes atingiram o desfecho combinado e 45 (34,6%) faleceram. A MF associou-se ao desfecho primário como variável contínua (Razão de risco (RR) ajustada 1,031 (Intervalo de Confiança (IC) 95% 1,013-1,049; p=0.001) e nos pacientes com FM extensa ( >= 12,3g) (RR ajustado 2,107 (IC 95% 1,111-3,994I; p=0,022)) de forma independente ao Escore de Rassi. A FM expressa como variável contínua também se associou à morte por todas as causas (RRajustado1,028 (IC 95% 1,005-1,051; p=0,017)) de forma independente do Escore de Rassi, exceto quando analisada como variável categórica. Conclusões: A fibrose miocárdica é um preditor independente de pior prognóstico na miocardiopatia chagásica. Nossos dados apoiam o uso da RMC para estratificar melhor o risco nessa população e, possivelmente, guiar o tratamento / Background: Chagas cardiomyopathy (CC) portends worse prognosis than ischemic and other non-ischemic cardiomyopathies and carries a high economic burden. Myocardial fibrosis (MF) detected by cardiac magnetic resonance (CMR) has been demonstrated as an independent predictor of increased risk in several etiologies of heart failure. In CC, MF has been associated with know risk factors of poor outcome, such as left ventricular dysfunction and ventricular arrhythmia. We hypothesized that MF is an independent predictor of worse prognosis in CC. Objectives: we sought to determine the prognostic value of MF detected by CMR in predicting a combined endpoint of hard events or the secondary outcome of all-cause mortality. In addition, we evaluated if the prognostic value of MF is independent of the Rassi risk score. Methods: patients with CC were retrospectively followed after CMR evaluation of cardiac volumes, function and MF quantification. Clinical, imaging and follow-up data were recorded and the primary outcome was a combination of all-cause mortality, heart transplantation, anti-tachycardia pacing or appropriate shock from an implantable cardiac defibrillator and aborted sudden cardiac death; the secondary outcome was all-cause death. Results: 130 patients were included in the study, with a majority of females (53.9%) and a mean age of 53.6±11.5 years. Most patients (68.4%) had no symptoms of heart failure, even though left ventricular dilatation (54%) and wall-motion abnormalities (65.9%) were common. On CMR, left ventricular dilatation (mean end-diastolic volume index 118.6±50.5ml/m²) and dysfunction (mean ejection fraction 43.2±16.3%) were observed and MF was found in 76.1%, with a mean mass of 15.2±16.5g. Over a mean follow-up of > 6.2 years, 58 (44.6%) patients reached the combined endpoint and 45 (34.6%) patients died. Myocardial fibrosis mass was associated with the primary outcome both as continuous variable (adjusted HR 1.031 (1.013-1.049 95% CI; p=0.001) and in patients with extensive MF ( >= 12.3g) (adjusted HR 2.107 (1.111-3.994 95% CI; p=0.022), independently from the Rassi Score. Myocardial fibrosis mass expressed as a continuous variable was also associated with all-cause death (adjusted HR 1.028 (1.005-1.051 95% CI; p=0.017) independently from the Rassi Score, but not when analyzed as a categorical variable. Conclusions: Myocardial fibrosis is an independent predictor of adverse outcome in Chagas cardiomyopathy. Our data support the use of CMR in better stratifying risk in this population and possibly guiding therapy

Submitted by Danielle Karla Martins Silva (danielle.martins@ufpe.br) on 2015-03-12T12:34:22Z No. of bitstreams: 2 José Sérgio Casé de Oliveira.pdf: 1717088 bytes, checksum: 91394789d8ecc6a45d75afc3abd4503c (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-12T12:34:22Z (GMT). No. of bitstreams: 2 José Sérgio Casé de Oliveira.pdf: 1717088 bytes, checksum: 91394789d8ecc6a45d75afc3abd4503c (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2013 / CAPES / Esta dissertação tem por objetivo avaliar o poder do teste de má especificação proposto por Cribari-Neto & Lima (2007) em vários cenários que configuram má especificação do modelo de regressão beta, em particular: função de ligação incorreta, presença de outlier na amostra, omissão de variável regressora importante, estimação com dispersão constante quando o modelo verdadeiro possui dispersão variável (e vice-versa) e má especificação da distribuição da variável resposta. O desempenho do teste foi avaliado em modelos de regressão beta com dispersão fixa e variável. Adicionalmente, introduzimos um outro teste de má especificação, o qual também teve seu poder avaliado em diversos cenários de má especificação. O poder do teste proposto foi comparado ao do teste proposto por Cribari-Neto & Lima (2007). Os desempenhos dos testes em amostras finitas foram avaliados numericamente por meio de simulações de Monte Carlo. Por fim, apresentamos algumas aplicações com dados reais.

A presente tese foi dividida em 5 Experimentos. Os objetivos do Experimento 1 foram avaliar a utilização da gonadotrofina coriônica equina (eCG) e/ou do cipionato de estradiol (ECP) na dinâmica folicular e taxa de concepção de vacas holandesas submetidas a inseminação em tempo fixo (IATF). No D0, todos os animais (n = 782) receberam 2 mg de benzoato de estradiol (BE) e um dispositivo intravaginal de progesterona (CIDR). Oito dias depois, o CIDR foi retirado e todos os animais receberam PGF2?. Simultaneamente, os animais foram divididos em 4 grupos: G1) eCG + ECP no Dia 8; G2) eCG no Dia 8 + GnRH após 48h; G3) ECP no Dia 8; G4) GnRH após 48h. Amostras de sangue e exames utlra-sonográficos foram realizados frequentemente em um subgrupo de animais (n = 96). As análises estatísticas de todos os experimentos foram efetuadas com o proc GLIMMIX e proc MIXED do SAS. O uso de eCG e o escore de condição corporal (ECC) dos animais afetaram as concentrações circulantes de progesterona no diestro. Os animais do G2 apresentaram maior taxa de concepção que os do G4 (33,8% vs. 28,9%). Além disso, para animais de menor ECC, ficou evidente o benefício da aplicação de eCG (G2 = 44,4% vs. G4 = 6,1%). No Experimento 2 (n = 26), o objetivo foi comparar o efeito da administração da eCG no dia da remoção do CIDR em animais de menor (2,0-2,5) ou maior (3,0-3,5) ECC. Foram avaliadas algumas características do corpo lúteo (CL) como o volume e histologia, assim como as concentrações plasmáticas de progesterona no diestro. Independentemente da condição corporal dos animais, a eCG aumentou o volume do CL e a concentração plasmática de progesterona no diestro. O ECC afetou negativamente o volume e concentração de progesterona sérica no diestro. Não foi encontrado diferença na proporção de células grandes/pequenas, assim como no fluxo sanguíneo no CL entre os grupos experimentais. No Experimento 3, foi comparado a taxa de concepção em vacas de leite de alta produção (n = 388) após o uso do protocolo G2 do Experimento 1 (Capítulo I), com ou sem adição de ECP no momento da retirada do CIDR (novo ou usado). Não foi verificado efeito da adição do tratamento com ECP e nem do tipo do dispostivo na taxa de concepção. No Experimento 4 (n = 199), apesar no aumento verificado no diâmetro folicular no grupo tratado com GnRH 56h (17,8 mm) comparado com GnRH 48h (16,5 mm); e do atraso no momento da ovulação após a retirada do CIDR (GnRH 56h = 75,3h; GnRH 48h = 79,8h) não foi constatado qualquer diferença na concepção ao se atrasar a aplicação do GnRH de 48h para 56h em vacas inseminadas 16h depois do GnRH. No Experimento 5 (n = 185), a taxa de concepção não diferiu em animais que receberam o GnRH 48h ou 56h (momento da IATF) após a retirada do CIDR, indicando a possibilidade do emprego de um protocolo com apenas 3 manejos em vacas de leite de alta produção. / The current thesys has been divided in 5 Experiments. Objectives of Experiment 1 were to evaluate the effects of equine chorionic gonadotropin (eCG) and/or estradiol cypionate (ECP) on follicular dymanics and conception rate in Holstein cows receiving fixed timed artificial insemination (TAI). On D0, all cows (n = 782) received 2 mg of estradiol benzoate (EB) and one intravaginal progesterone device (CIDR). Eight days later, CIDR was removed and all animals were treated with PGF2?. Simultaneously, animals were divided in 4 groups: G1) eCG + ECP on Day 8; G2) eCG on Day 8 + GnRH 48h later; G3) ECP on Day 8; G4) GnRH 48h later. Blood samples and ultrasound exams were frequently performed in a subset of the animals (n = 96). All the statistical analyses for all experiments were performed with proc GLIMMIX and proc MIXED of SAS. Equine chorionic gonadotropin (eCG) treatment and body condition score (BCS) affected circulating progesterone in the diestrus. Cows in G2 had greater conception rates than cows in G4 (33,8% vs. 28,9%). In addition, in cows with lower BCS, eCG seems to be even more affective (G2 = 44,4% vs. G4 = 6,1%). In Experiment 2 (n = 26), the objective was to compare the effect of eCG the day of CIDR removal in animals with lower (2,0-2,5) or higher (3,0-3,5) BCS. Some variables such as corpus luteum (CL) volume, histology and circulating progesterone concentration in the diestrus were evaluated. Regardless of the body condition of the animals, eCG increased CL volume and circulating progesterone concentration in the diestrus. BCS negatively affected CL volume and circulating progesterone. There were no differences in large/small CL cell ratio, as well as CL blood flow between experimental groups. In Experiment 3, it was compared conception rate in dairy cows (n = 388) after using the same protocol G2 from Experiment 1 (Chapter I), with or without an ECP treatment at the time of CIDR (new or used) removal. Both ECP treatment and type of CIDR did not significantly affected conception rates. In Experiment 4 (n = 199), despite the fact that follicular diameter was increased in group GnRH 56h (17,8 mm) compared with GnRH 48h (16,5 mm); and of the delayed time of ovulation after CIDR removal (GnRH 56h = 75,3h; GnRH 48h = 79,8h), there were no differences in conception rates after delaying the GnRH treatment from 48h to 56h in cows inseminated 16h after GnRH. In Experiment 5 (n = 185), conception rate did not differ in animals that received GnRH 48h or 56h (at the time of TAI) after CIDR removal, indicating the possibility of using a protocol with only 3 handlings in high producing dairy cows.

O presente estudo teve como objetivo investigar a influência de diferentes sistemas de manejo sobre a reatividade, parâmetros produtivos e de qualidade de carne e carcaça de bovinos confinados. Para isso, foram utilizados 50 novilhos Nelore, alocados em confinamento sob dois sistemas diferentes quanto ao manejo, o tradicionalmente empregado em fazendas (MT) e o baseado em princípios racionais de trabalho e na biologia dos bovinos, conhecido popularmente como manejo racional ou gentil (MR). Os animais de ambos os tratamentos receberam a mesma dieta e ficaram em confinamento por 126 dias (± 18 dias). Foram colhidas, durante os manejos de pesagem em brete, informações quanto ao ganho diário de peso (GDP) e reatividade (através do Escore de Comportamento Composto - ECC). Calculou-se, ao fim do confinamento, o ganho diário médio de peso (GDPtot). Durante o abate, foram colhidas informações quanto à reatividade dos bovinos no bloco de atordoamento (ECCabt). Durante a desossa, foram registradas informações quanto a coloração (L*, a* e b*) das amostras de Longissimus dorsi colhidas, três de cada animal, uma para cada tempo de maturação (0, 7 e 14 dias). Apos o período de maturação, procedeu-se com as análises de perdas de água por exsudação (PAE) e por cozimento (PAC), bem como de força de cisalhamento (MAC). Os resultados indicam que ocorreram influencias dos sistemas de manejo nas características PAE e MAC, com valores superiores e inferiores, respectivamente, em MR. Ocorreram influencias na interação tratamento e manejos ocorridos no GDP, com resultados superiores em MT. No parâmetro MAC ocorreu diferença significativa em relação aos dias de maturação, com diminuição ao longo do tempo de maturação, alem de diferenças nos tratamentos na carne nao maturada, com valores inferiores para MR. As características Contusões (totais, no dianteiro, na ponta de agulha e no traseiro), ECCabt, de coloração (L*, a* e b*) e de PAC não apresentaram diferenças significativas entre os tratamentos ou suas interações. Constatou-se melhor qualidade de carne de animais MR, porém com ganhos de peso ligeiramente inferiores aos do MT. A reatividade apresentou tendência de diminuição ao longo do confinamento, com valores ligeiramente inferiores para animais MR nos manejos de pesagem em brete e mais acentuados no momento do abate. / The present study investigated the influence of different handling systems on the reactivity, production parameters and quality of meat and carcass of confined cattle. The experiment used 50 Nellore steers placed in feedlots that received two different handling systems: the traditionally used in the Brazilian farms (MT) and the based on rational principles of work and in the biology of cattle, known as gentle handling (MR).Both treatments received the same diet and remained in confinement for 126 days (± 18 days). Were taken over the handling in squeeze chute, information about the daily weight gain (GDP) and reactivity (through the Composite Behaviour Score - ECC). At the end of the confinement, the average daily weight gain (GDPtot) was calculated. During the slaughter, was collected information of the reactivity of cattle in stunning pen (ECCabt). During the boning, were recorded information about the color (L *, a * b *) of Longissimus dorsi samples. Three samples from each animal was collected, one for each maturation period (0, 7 and 14 days). After the maturation period, that was preceded with the analysis of water loses by exudation (PAE) and by cooking (PAC) and the shear-force (MAC). The results indicate that there were influences of the handling systems features in PAC and MAC, with values higher and lower, respectively, in MR. Occurred influences in treatment and management occurred in GDP, with superior results in MT. In the MAC, parameter was significant difference for days to maturity, with a reduction over maturation time, and differences in treatment in the meat does not mature, with lower values for MR. The characteristics contusions, ECCabt, meat color (L *, a * b *) and PAC showed no significant differences between treatments or their interactions. It was better quality of meat from animals MR, but with gains weight slightly lower than that of MT. The reactivity, although not significantly different, tended to decrease during the confinement, with slightly lower values for MR in the management of animals weighing more pronounced in squeeze chute and at slaughter.

A displasia coxofemoral é a afecção ortopédica mais frequente na espécie canina e, pela estatística apresentada pela Orthopaedic Foundation for Animals o buldogue inglês é a raça com maior acometimento proporcionalmente. Entretanto carece em literatura dados sobre o desenvolvimento e morbidade desta doença na raça. O objetivo desse estudo foi avaliar a morfologia e morfometria da articulação coxofemoral de cães da raça buldogue inglês por meio de exame radiográfico e por tomografia computadorizada comparando-os com achados da avaliação ortopédica e cinética. A hipótese proposta é de que buldogues podem apresentar alterações radiográficas compatíveis com a displasia coxofemoral sem apresentar manifestações clínicas da doença. De cada articulação avaliada foram adquiridos dados por meio de exame ortopédico, avaliação cinética, radiográfica e por tomografia computadorizada. Foram feitas avaliação subjetiva das alterações morfológicas radiográficas e aferição do ângulo de Norberg, ângulo de inclinação do colo femoral e o escore de subluxação dorsolateral. Os dados obtidos foram correlacionados por meio dos coeficiêntes de Spearman. Trinta cães foram avaliados, 20 machos e 10 fêmeas. As médias de idade e peso dos participantes do estudo foram de 3,5 anos e 26,1 kg respectivamente. 76,6% dos animais apresentaram escore de condição corporal acima do considerado ideal e 63,3% viviam em ambiente de piso liso. Entretanto esses fatores de risco avaliados não apresentaram correlação com nenhuma alteração pesquisada. 63,3% dos cães apresentaram alterações nas articulações dos joelhos e 40% nas articulações coxofemorais pela avaliação ortopédica. Pela palpação da articulação coxofemoral foram observadas alterações em 50% dos animais, sendo a crepitação leve representando 86,6% das alterações, e crepitação de grau moderado e discreta manifestação de dor em 13,3%. A frequência de alterações morfológicas radiográficas observada foi de 98,3% para subluxação coxofemoral, 81,6% para o achatamento da cabeça do fêmur, 70% para presença de osteófitos ou entesófitos periarticulares e 61,1% para o arrasamento acetabular. A conformação radiográfica da articulação coxofemoral mais frequente foi de cabeça femoral com formato discretamente elíptico e discretamente subluxada, bordas acetabulares craniolateral arredondada e dorsal encurtada com discreta presença de osteófitos. A média das mensurações morfológicas obtidas no estudo foram abaixo dos valores considerado de normalidade, sendo de 94,94° para o ângulo de Norberg, 27,13% para o escore de subluxação dorsolateral e 128,53° para o ângulo de inclinação do colo femoral. A presença de osteófitos periarticulares obteve correlação estatística com presença de crepitação à palpação da coxofemoral, assim como o arrasamento acetabular com a presença de dor ao exame ortopédico. Entretanto as manifestações clínicas não coincidiram proporcionalmente às alterações observadas pelos métodos de diagnóstico por imagem. É questionado se a conformação muscular da raça pode contribuir para contrabalancear a instabilidade articular apresentada pelos métodos avaliados / Hip dysplasia is the most common orthopedic disorder in dogs, and the statistics presented by the Orthopedic Foundation for Animals English Bulldog is the race with most animals affected proportionately. However it lacks in literature data of the development and morbidity of this disease in the race. The aim of this study was to evaluate the morphology and morphometry of the hip joint of English Bulldogs through radiographic examination and computed tomography comparing them with findings from orthopedic and kinetic evaluation. The hypothesis proposed is that Bulldogs may have radiographic changes compatible with hip dysplasia without showing clinical symptoms of the disease. From each joint evaluated were acquired data through orthopedic examination, and kinetics, radiographic and computed tomography evaluations. They were made subjective evaluation of radiographic morphological changes and measuring the Norberg angle, femoral neck inclination angle and the dorsolateral subluxation score. The data were correlated by the Spearman\'s rank. Thirty dogs were evaluated, 20 males and 10 females. The mean age and weight of the study participants was 3.5 years and 26.1 kg respectively. 76.6% of the animals had a body condition score considered above ideal and 63.3% lived in flat floor environment. However, these risk factors evaluated were not correlated with any changes searched. 63.3% of dogs showed changes in knee joints and 40% in hip joints by the orthopedic evaluation. Abnormalities were observed in 50% of animals by palpation of the hip joint, the slight crackle representing 86.6% of the changes, and moderate crackle and mild degree manifestation of pain in 13.3%. The frequency of morphological radiographic changes observed was 98.3% for hip subluxation, 81.6% for the femoral head flattening, 70% for the presence of periarticular osteophytes or entesophytes and 61.1% for the acetabular razing. The most common radiographic conformation of the hip joint was femoral head slightly elliptical shape and discreetly subdisluxated, rounded craniolateral acetabular edge and shrtened dorsal edge with discreet presence of osteophytes. The average morphological measurements obtained in the study were below the values considered normal, being 94.94° for the angle of Norberg, 27.13% for dorsolateral subluxation score and 128.53° for inclination angle of the femoral neck. The presence of periarticular osteophytes have statistical correlation with the presence of ckakle on palpation of the hip joint, as well as the acetabular razing with the presence of painful on orthopedic examination. However the clinical manifestations were not proportionaly coincidence with the changes observed by the diagnostic imaging methods. It questioned whether the muscle conformation of the race can help to counteract the instability joint presented by the evaluated methods

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No. of bitstreams: 1 danielemariaknuppdesouza.pdf: 8224549 bytes, checksum: bc3a45c095a6504198c18b63f1922033 (MD5) Previous issue date: 2013-04-25 / FAPEMIG - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Vaginose Bacteriana (VB) é uma síndrome polimicrobiana, caracterizada pelo desequilíbrio da microbiota vaginal, associada à substituição da população bacteriana vaginal predominantemente aeróbia (Lactobacillus spp.) por uma população anaeróbia (principalmente Gardnerella vaginalis), gerando descarga vaginal anormal em mulheres em idade reprodutiva. O objetivo desse trabalho foi a avaliação de aspectos fisiológicos e moleculares de G. vaginalis em pacientes com e sem VB, atendidas na rede pública (SUS) e privada de Juiz de Fora/MG, além da determinação do perfil de susceptibilidade a antimicrobianos. Amostras de secreção vaginal foram coletadas e processadas para isolamento seletivo, conforme descrito na literatura. G. vaginalis foi identificada presuntivamente pela β-hemólise ou hemólise difusa e os testes da oxidase e catalase. A identidade bacteriana foi confirmada por reação de POR. O gene codificador para a vaginolisina (vly) foi detectado por PCR. O perfil de susceptibilidade a drogas antimicrobianas foi determinado pelo método da diluição em ágar, de acordo as recomendações do CLSI para microrganismos anaeróbios. A genotipagem foi realizada por AP-PCR. De 89 pacientes, G. vaginalis foi isolada de 42 por cultivo em meio de cultura, sendo 35 com VB, 02 com quadro intermediário e 05 saudáveis. Em 47 pacientes não foi possível realizar o isolamento de G. vaginalis por método de cultivo, sendo a reação de PCR positiva para 26 destas pacientes. Para classificar as pacientes em sintomáticas e saudáveis, foi realizado o escore de Nugent, Todos os 204 isolados de G. vaginalis submetidos à reação de PCR tiveram sua identidade confirmada, e destes, em 96,5% foi detectado o gene vly. Quanto ao perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos, alta sensibilidade a ampicilina/sulbactam, clindamicina e cloranfenicol foi observada, e alta resistência foi observada a ampicilina, metronidazol, secnidazol e tinidazol. A cultura positiva de G. vaginalis, per se, não garante o diagnóstico de VB, já que os microrganismos fazem parte da microbiota residente. Não foi possível correlacionar a detecção do gene vly como marcador para determinação de linhagens patogênicas. A resistência bacteriana frente aos antimicrobianos mais utilizados na clínica corroboram outros estudos, e alertam para os riscos da terapia empírica rotineira. A técnica de genotipagem utilizada não permitiu o agrupamento de G. vaginalis, de acordo com sua origem de isolamento, sugerindo, assim, uma heterogeneidade populacional. Essa observação sustenta-se pelo não agrupamento bacteriano também em função da tipagem pelo perfil de susceptibilidade a antimicrobianos, embora outras técnicas de genotipagem não tenham sido utilizadas. Além disso, ainda não são descritos oligonucleotídeos iniciadores específicos para genotipagem de G. vaginalis por AP-PCR. Espera-se que esses resultados possam servir de base para suscitar discussões relacionadas ao tratamento empírico da vaginose bacteriana, considerando-se limitações na disponibilidade de diagnóstico ou mesmo terapia antimicrobiana. / Bacterial vaginosis (BV) is a polymicrobial syndrome characterized by an imbalance in the vaginal microbiota associated with the replacement of the vaginal bacterial population predominantly aerobic (Lactobacillus spp.) by an anaerobic population (especially Gardnerella vaginalis) leading to abnormal vaginal discharge in women of reproductive age. The aim of this study was to evaluate physiological and molecular aspects of G. vaginalis in patients with and without BV, treated at public (SUS) and private services in Juiz de Fora/MG, in addition to determining the antimicrobial susceptibility patterns. Vaginal secretion samples were collected and processed for selective isolation, as described in the literature. G. vaginalis was presumptively identified by 13-hemolysis or diffuse hemolysis and oxidase and catalase negative tests. The bacterial identity was confirmed by PCR. The encoding gene for vaginolisin (vly) was detected by PCR. Antimicrobial susceptibility patterns were determined by agar dilution method, according to CLSI guidelines for anaerobic microorganisms. Genotyping was performed by AP-PCR. Out of 89 patients, G. vaginalis was isolated from 42 by cultivation in culture medium, 35 of which with VB, 02 with intermediate clinical and 05 healthy. In 47 patients it was not possible to perform the isolation of G. vaginalis by cultivation method, with a positive PCR result for 26 of these patients. To classify patients in symptomatic and healthy, Nugent score was performed. All 204 isolates of G. vaginalis subjected to PCR reaction had its identity confirmed and, of these, vly gene was detected in 96.5%. Regarding antimicrobial susceptibility patterns, high sensitivity to ampicillin/sulbactam, clindamycin and chloramphenicol was observed, and high resistance was observed to ampicillin, metronidazole, secnidazole and tinidazole. The positive culture of G. vaginalis, per se, does not ensure the diagnosis of BV, as the microorganism may be considered resident microbiota. It was not possible to correlate vly gene detection as a marker for determination of pathogenic strains. Bacterial resistance against antimicrobial drugs commonly used in clinical corroborate with others studies, and warn to the risks of empiric therapy routine. The genotyping technique used did not allow G. vaginalis grouping, according to their source of isolation, suggesting, therefore, a heterogeneous population. This observation is sustained by the impossibility of grouping using the bacterial typing by antimicrobial susceptibility profile too, although other genotyping techniques have not been used. In addition, specific primers for genotyping G. vaginalis by AP-PCR have not been described yet. It is expected that these results can serve as basis for raising discussions related to empiric treatment of bacterial vaginosis, considering limitations in the availability of diagnostic or antimicrobial therapy.

Made available in DSpace on 2014-06-12T18:06:35Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo9497_1.pdf: 506400 bytes, checksum: e9f5ea43d7905d4b2ce5b74712cf8183 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2012 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Essa dissertação tem dois objetivos. O primeiro consiste na obtenção de um fator de correção tipo-Bartlett para a estatística escore nos modelos em série de potência não-lineares generalizados. O segundo é comparar o desempenho dos testes baseados nas seguintes estatísticas, a saber: escore e suas versões corrigidas, razão de verossimilhanças e suas versões corrigidas e a gradiente, no que tange ao tamanho e ao poder. Finalmente apresentamos uma aplicação a dados reais

Made available in DSpace on 2014-08-20T14:37:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_patricia_ferreira.pdf: 3549242 bytes, checksum: 6b4765bbb91c305da5c2ca96571c76db (MD5) Previous issue date: 2012-02-10 / In this work we have studied the relationship between biochemical metabolic parameters (of dogs) and body score, fasting and feeding. In order to evaluate the glycemia values, using a digital (portable) glucometer, it was used 6μL of venous and capillary blood. On the other hand, when we evaluated the glycemia, through enzymatic method (laboratory), only venous blood was used. To analyze the metabolic curve we have collected blood samples of fasting dogs and 0:30, 1:30, 3:00, 6:00, 9:00, and 12:00 hours after feeding with premium industrial food. The laboratorial analysis were realized by enzymatic determination through colorimetry. In order to correlate the body scores and dogs morphometry, we have defined the body score, the body mass index (BMI), and the average values of cutaneous fat at the right rib cage, thoracic, and tail base regions. Also, we have measured the thoracic and inguinal circumference ratio. To compare the body scores with the metabolism of carbohydrates and lipids the dogs were classified, according to their weight, as ideal weighted, overweighted and obese. We have measured the glycemia, cholesterol (total and fractions), and triglycerides. The glycemia average values, obtained with the portable glucometer, of capillary and venous blood were similar. The glycemic, VLDL fraction, and triglyceride levels are changed after feeding, while the other analyzed parameters (total cholesterol, HDL and LDL fractions) are not. The obese dogs presented higher BMI and subcutaneous fat values and lower circumference ratio values, when compared with the ideal weighted and overweighted ones. The VLDL fraction and triglyceride values were higher when measured at the obese dogs. It is concluded that the portable glucometer is reliable, since the average values of venous and capillary glycemia are similars. At the experiment conditions, it is possible to perform the biochemical analysis of glycemia, total and fraction cholesterol, and triglycerides values after 3h fasting. The analysis of body mass index, together with the subcutaneous fat values and the circumference ratio has proven to be a fast and effective method to classify dogs as ideal weighted, overweighted and obese. At the studied conditions, obese dogs presented higher triglycerides and VLDL cholesterol fraction levels, when compared with overweighted dogs. / O objetivo deste trabalho foi estudar os parâmetros bioquímicos metabólicos de cães relacionando com condição corporal, jejum e alimentação. Para avaliação da glicemia, com glicosímetro digital, foi utilizado 6μL de sangue capilar e venoso, e para dosagem pelo método enzimático foi utilizado sangue venoso. Para estudar a curva metabólica foram realizadas coletas sanguíneas em jejum e 0:30, 1:00, 1:30, 3:00, 6:00, 9:00 e 12:00 horas após o fornecimento de ração industrial premium. As análises laboratoriais foram feitas por determinação enzimática através da colorimetria. Para relacionar os escores corporais com a morfometria canina, definimos o escore corporal, o índice de massa corporal (IMC), as médias das dobras cutâneas e a razão entre as circunferências torácica e abdominal. Para comparar os escores corporais com o metabolismo de carboidratos e lipídios os cães foram classificados em peso ideal, sobrepeso e obeso. Mensurou-se a glicemia, o colesterol total, frações colesterêmicas e os triglicerídeos. Os valores médios da glicemia obtida por glicosímetro portátil, amostra capilar e venosa e pelo método enzimático laboratorial foram similares. Em relação à curva metabólica, os níveis glicêmicos, da fração VLDL e dos triglicérides, são alterados após a alimentação, enquanto os demais parâmetros analisados (colesterol total e frações HDL e LDL) não. Os cães obesos apresentaram maiores valores do IMC e das dobras cutâneas e menores valores da razão entre circunferências. Os valores da fração VLDL e os triglicerídeos foram maiores nos cães obesos. Conclui-se que as médias dos valores da glicemia capilar e venosa aferidas por glicosímetro digital são similares. Nas condições estudadas observamos que é possível fazer a análise bioquímica dos valores da glicemia, colesterol total, frações colesterêmica e triglicerídeos após 3 h de jejum. O índice de massa corporal juntamente com os valores das dobras cutâneas e da razão entre as circunferências dos cães são uma forma rápida e eficaz para classificar os cães nos escores corporais de peso ideal, sobrepeso e obeso. Nas condições estudadas, cães obesos apresentam níveis de triglicerídeos e fração colesterêmica VLDL mais elevados que em cães com sobrepeso.