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Diversidade genética de Myrciaria floribunda (West ex Willdenow) Berg (Cambuí) em paisagem fragmentada da Serra da Mantiqueira, MG. / Genetic diversity of myrciaria floribunda (West ex Willdenow) Berg (Cambuí) in fragmented landscapes of the Mantiqueira Hills, MG.Giuliana Mara Patrício Vasconcelos 27 May 2002 (has links)
Este trabalho diz respeito à diversidade genética de Myrciaria floribunda (West ex Willdenow) Berg (cambuí), uma espécie arbórea de sub-bosque, em paisagem fragmentada da Serra da Mantiqueira, MG. A diversidade genética foi estudada a partir dos dados de análises eletroforéticas de isoenzimas. Foram coletadas folhas de indivíduos jovens em duas populações dentro de um fragmento controle (5810,27 ha) e em dois fragmentos menores (18 e 10 ha), sendo quarenta plantas por fragmento. Através da análise de sete locos isoenzimáticos foi avaliada o número médio de alelos por loco (Â), número médio de alelos por loco polimórfico (Âp), porcentagem de locos polimórficos ( $ P ), heterozigosidade média esperada ( $ He ), heterozigosidade observada ( $ Ho ) e freqüências alélicas, utilizando-se alelos de baixa freqüência. A heterozigosidade observada para os quatro fragmentos foi elevada (entre 0,288 a 0,386). A variação genética intrapopulacional, avaliada pela riqueza alélica foi menor nos fragmentos menores que nas populações contida no fragmento controle. Alguns alelos encontrados em menor freqüência no fragmento controle tiveram suas freqüências reduzidas nos fragmentos menores, sendo que um alelo foi perdido nos fragmentos menores, provavelmente devido à redução do tamanho populacional durante a fragmentação, ou à deriva genética após a fragmentação ou a amostragem realizada. O índice de diversidade gênica de Nei (heterozigosidade esperada) não foi muito diferente entre as quatro populações, apesar de mostrar uma tendência à diminuição nos fragmentos menores. Os indivíduos jovens analisados apresentaram valores de f = 0,0864, sugerindo que estas populações tem vindo de cruzamentos panmíticos, provavelmente anteriores ao processo de fragmentação. Estas quatro populações apresentaram pequena diferenciação genética entre elas ( p q = 0,0555), o número estimado de migrantes foi relativamente alto (Nm= 4,25). Este trabalho desta forma não foi capaz de detectar o efeito da fragmentação na endogamia desta espécie. / This research is about effects of forest fragmentation on the genetic diversity of Myrciaria floribunda (West ex Willdenow) Berg (cambuí), a tropical tree species from the Atlantic Forest (Mantiqueira hills), State of Minas Gerais. This work is about genetic diversity studies of de Myrciaria floribunda (cambuí), a late successional species from fragmented landscapes of the Mantiqueira hills. Genetic diversity was assessed using electrophoresis of isozymes. Leaves from juveniles trees were collected from four populations, two within a control fragment (5810,27 ha) and from two other small fragments (18 e 10 ha). Forty plants were sampled per populations. Seven loci were studied regarding the average number of alleles per locus (Â), the average number of alleles per polymorphic loci (Âp), percentage of polymorphic loci ( $ P ), expected ( $ He ) and observed heretozigosity ( $ Ho ), and allelic frequency, using alleles of low frequency. The observed heterozigosity was high for all fragments (from 0,288 to 0,386). Within population genetic diversity, measured by allelic richness was lower in small fragments compared with the large fragment. Low frequency alleles found in the large fragment showed an even lower frequencies in the two small fragments. One allele was lost in the small fragments, probably due to a reduction in population size because of the fragmentation process, and probably due to genetic drift or sampling strategy. Neis diversity index (expected heterozigosity) did not differ among populations, although lower in the small fragments. The result for f = 0,0864 indicated that the current populations probably were originated from panmmitic populations, established before the fragmentation process. Little genetic differentiation was detected among populations ( p q = 0,0555), however the number of migrants was considerably high (Nm= 4,25). Therefore this work was not able to detect the effects of endogamy due to the forest fragmentation on the studied species.
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A regeneração natural como indicadora de conservação, de sustentabilidade e como base do manejo adaptativo de fragmentos florestais remanescentes inseridos em diferentes matrizes agrícolas / Natural forest regeneration as an indicator of conservation, sustainability and as the basis of adaptive management of forest remnants embedded in different agricultural matricesJulia Raquel de Sá Abilio Mangueira 19 June 2012 (has links)
O cenário atual do estado de São Paulo reflete o cenário de degradação observado na Floresta Atlântica do país, onde os remanescentes florestais estão muito fragmentados, degradados e imersos em uma paisagem agrícola, dominada predominantemente por matrizes de cana de açúcar e pastagens. Neste contexto, objetivamos investigar se a regeneração natural da borda de fragmentos florestais tem características distintas nessas duas matrizes agrícolas dominantes. Nossa hipótese foi que de a regeneração natural em fragmentos inseridos em matrizes de cana de açúcar e pastagem são distintas, porque essas matrizes definem diferentes trajetórias de degradação sobre a flora de fragmentos naturais. Este trabalho foi desenvolvido na bacia do rio Corumbataí, onde indivíduos de espécies arbustivo e arbóreas do estrato regenerante (mínimo de 30cm de altura até 15 cm de perímetro à altura do peito) foram amostrados em 60 transectos de 30x2m (subdivididos em transectos contíguos de 10x2m) sistematicamente distribuídas a partir da borda de 12 fragmentos selecionados na bacia. Primeiramente, foi feita uma caracterização florística geral da regeneração natural das bordas de fragmentos florestais inseridos nas duas matrizes agrícolas. Posteriormente, foram utilizadas as variáveis número de indivíduos.hectare-1 (RN_HA) e número de espécies/m2 (NESP_M2) e diversidade florística (ISHANNON) para analisar as diferenças da estrutura e composição da regeneração natural nas duas matrizes. Essas mesmas variáveis foram utilizadas para analisar estatisticamente o efeito de indicadores de conservação dos fragmentos, como entrada de gado, presença de eucaliptos no dossel e abundância de gramíneas e lianas, sobre a regeneração natural. A similaridade florística entre remanescentes das paisagens foi calculada através do Índice de Similaridade de Jaccard. Em todos os transectos, foram amostrados 5886 regenerantes, divididos em 58 famílias, 220 espécies e 18 morfoespécies. O índice de Jaccard mostrou que houve similaridade florística (45%) entre os regenerantes dos fragmentos da matriz de pastagem e cana de açúcar. Nos fragmentos inseridos na matriz de pastagem, a entrada de gado foi o indicador de conservação de fragmentos que apresentou maior interferência sobre a regeneração natural, diminuindo tanto o número de indivíduos por unidade de área quanto a diversidade florística. Para a paisagem de cana, a fonte de variação que mais interferiu na estrutura da regeneração foi a presença de eucaliptos no dossel, que aumentou o número de indivíduos por unidade de área. A abundância de gramíneas e lianas e a presença de epífitas não apresentaram influência sobre a regeneração quando analisados tipo de matriz ou tamanho do fragmento. Entre os sub-transectos contíguos de 10m, não houve variação na estrutura e composição da regeneração natural, indicando que nesta profundidade de borda a vegetação regenerante é homogênea quanto à florística, diversidade e classificação sucessional. Os resultados indicam que, mesmo inseridos em paisagens agrícolas profundamente antropizadas, os remanescentes florestais ainda detém elevada diversidade florística. A regeneração natural mostrou-se um bom indicador de qualidade atual e futura dos remanescentes florestais, e demonstrou, juntamente com os indicadores de conservação, que os fragmentos são passíveis de manejo, o que poderá potencializar o papel de conservação da biodiversidade exercido pela regeneração natural. / At São Paulo state, Brazil, the scenario of the Atlantic Forest reflects the scenario of degradation of the biome in the country, where forest remnants are embedded in an agricultural landscape, dominated by sugar cane fields and pasture fields. In this context, we aimed to investigate if natural forest regeneration responds differently to each agricultural matrix. Our hypothesis was that forest regeneration composition in remnants surrounded by sugar cane fields is different of forest regeneration composition in remnants surrounded by pasture fields, because these agricultural matrices impact differently forest biota. The present research was developed in Corumbataí river basin, in the countryside of São Paulo state. Shrub and tree individuals, from regeneration layer, were sampled in 60 plots 30x2 meters long (subdivided in plots 10x2 meters long) systematically distributed on the edges of 12 fragments. Firstly, we characterized the natural regeneration of the edges of forest remnants embedded in agricultural landscapes. Then we used the variables number of individuals.ha-1 (RN_HA), number of species/m2 (NESP_M2) and floristic diversity (ISHANNON) to analyze the differences in structure and composition of forest natural regeneration between sugar cane fields and pasture fields. These variables were used to analyze the statistical effects of conservation indicators, such as cattle entrance on forest remnants, abundance of woody-vines and grasses, and presence of eucalyptus trees on forest canopy, on natural regeneration. Floristic similarity between forest remnants was assessed by Jaccard Similarity Index. 5886 saplings were sampled among the 60 plots, divided in 57 families, 214 species and 31 morphospecies. Jaccard index indicated floristic similarity (45%) among the fragments inserted in sugar cane field and pasture field. Among the fragments inserted in pasture field, cattle entrance was the conservation indicator with the strongest interference over natural regeneration, decreasing both the number of plants per area and the floristic diversity. At sugar cane landscape, presence of eucalyptus on forest canopy increased the number of individuals per area. Grass and woody-vines abundance and presence of epiphytes were not significant for any variable, when analyzed with matrix type or fragment size. Among the subplots of 10m long, there was no variation of structure and composition of natural regeneration, what indicates that, in relation to floristic, diversity and sucessional classification, the regenerant vegetation is homogeneous in the first 30 meters of the edge. The results indicate that, even embedded in anthropogenic agricultural landscapes, the remnants studied still retain high floristic diversity. Natural regeneration has shown to be a good indicator of actual and future quality of forest remnants, and, together with conservation indicators, demonstrated that the fragments studied are subject to management actions, which may improve the role of biodiversity conservancy developed by natural regeneration
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Análise da Avifauna da RPPN Rio dos Pilões (Santa Isabel, SP), visando à conservação das espécies de um "Hotspot" da Mata Atlântica / Analysis of Avifauna from RPPN Rio dos Piloes (Santa Isabel, SP), aim at on the conservation from the species by one hotspot from Brazilian Atlantic ForestLuccas Guilherme Rodrigues Longo 13 July 2007 (has links)
A maior parte da biodiversidade global está concentrada nas florestas tropicais. Um dos principais fatores que ocasionam o desaparecimento dessa diversidade é a perda de hábitats pelas ações antrópicas, como o desmatamento e o crescimento urbano desordenado. Fragmentos florestais que possuem elevada biodiversidade, altas taxas de endemismo e fortes pressões antrópicas, são chamados de hotspots. A Floresta Atlântica é um dos hotspots brasileiros mais devastados. Por serem sensíveis as alterações do ambiente, as aves são consideradas importantes bioindicadores da qualidade dos ecossistemas. O presente estudo foi realizado na Reserva Particular do Patrimônio Natural (RPPN) Rio dos Pilões, em uma região antropizada e com remanescentes de Mata Atlântica (Floresta Ombrófila Densa Montana), localizada no município de Santa Isabel, no Estado de São Paulo. A RPPN pertence a um empreendimento imobiliário que visa à integração entre as atividades de proteção dos recursos naturais com as ações humanas. Com o intuito de conhecer e analisar a comunidade de aves da RPPN estudou-se três ambientes principais: um ambiente de campo antrópico (ACA), um ambiente antrópico inundado (AAI) e um ambiente florestal antropizado (AFA). O estudo foi realizado de maio de 2005 a maio de 2006, utilizandose o método de captura e recaptura com redes-neblina e o método de observações em trajetos irregulares, sendo o primeiro aplicado no AFA e o segundo no ACA e no AAI. Foram registradas 141 espécies de aves em um total de 1.824 horas de trabalhos. Estas espécies estão distribuídas em 20 ordens, 46 famílias, 125 gêneros, resultando em 2.243 indivíduos observados, 184 capturados e 17 recapturados. A curva acumulada de espécies não mostrou tendência à estabilização, sugerindo que o esforço de coleta despendido não tenha sido suficiente para amostrar toda a comunidade, indicando assim que novas espécies possam ser registradas. Os Não-Passeriformes somaram 56 espécies, com maior representatividade nas famílias Ardeidae e Trochilidae. Os Passeriformes foram os mais representativos, com 85 espécies, sendo Tyrannidae a de maior número. O ambiente que apresentou maior riqueza foi o AAI com 85 espécies, seguido pelo AFA com 72 e o ACA com 52 espécies. As espécies mais freqüentes (FR) foram Patagioenas picazuro no ACA, Thraupis sayaca no AAI e Chiroxiphia caudata no AFA. A análise da freqüência de ocorrência (FO) mostrou que a maioria das espécies teve FO abaixo de 25%, enquanto que poucas espécies apresentaram FO maior que 75%. As espécies com maiores FO foram Vanellus chilensis, Pitangus sulphuratus, T. sayaca e Basileuterus leucoblepharus. A comunidade foi agrupada em 13 guildas tróficas, sendo a insetívora a de maior predomínio em todos os ambientes. Das espécies registradas, 04 são migrantes e 03 estão ameaçadas de extinção. Embora a RPPN apresente um elevado grau de degradação, possui elevada riqueza e diversidade de espécies de aves, fator este que pode contribuir não somente para aumentar seu valor de conservação, como também auxiliar na implantação de projetos de restauração ecológica dos remanescentes. / The most of global biodiversity is intent in the tropical forests. One of the main factors that they cause the disappearance of this diversity is the loss of habitats for the anthropic actions, as the deforestation and the disordered urban growth. Forest fragments that possess high biodiversity, high taxes of endemism and forts anthropics pressures, are called hotspots. The Atlantic Forest is a Brazilian hotspots more deforested. By being sensible the alterations of the environment, the birds are considered the most important bioindicators of the quality of ecosystems. The present study River of the Piloes was carried through in the Particular Reserve of Patrimony Natural (RPPN), in an anthropic region and with remainders of Atlantic Forest, located in the city of Santa Isabel, State of Sao Paulo. The RPPN belongs to a real estate enterprise that aims at the integration enters the activities of protection of the natural resources with the actions human beings. Whit the intention to know and to analyze the community of birds of the RPPN one studied three main environments: environment of anthropic field (ACA), anthropic environment flooded (AAI) and the anthropic forest environment (AFA). The study has been at the May of 2006 to May of 2005, using the capture method with mist-nets and the method of irregular courses, being the first one applied in the AFA, and as in the ACA and the AAI. They had been registered 141 species of birds in a total of 1.824 working hours. These are distributed in 20 orders, 46 families, 125 genders, resulting in 2.243 observed individuals, 184 captured and 17 recaptured. The accumulated curve of species as soon as did not show to trend to the stabilization, suggesting that the expended effort of collection has not been enough to show to all the community, indicating new species can be registered. The Non- Passeriformes had added 56 species, with bigger representation in the families Ardeidae and Trochilidae. The Passeriformes had been most representative, with 85 species and in Tyrannidae are the bigger. The environment that presented greater wealth was the AAI with 85 species, AFA with the 72 and the ACA with 52 species. The most frequent species (FR) had been Patagioenas picazuro in ACA, Thraupis sayaca in AAI and Chiroxiphia caudata in AFA. The analysis of the occurrence frequency (FO) showed that the majority of the species had FO below of 25%, whereas few species had presented bigger FO that 75%. The bigger with FO had been Vanellus chilensis, Pitangus sulphuratus, T. sayaca and Basileuterus leucoblepharus. The community was grouped in 13 trophic guilds, being the insectivora of the bigger predominance in all environments. Of the registered species, 04 are migrants and 03 are threatened of extinguishing. Although the RPPN presents one high degree of degradation, it possess high wealth and diversity of species of birds, it is the factor that can contribute to not only increase its value of conservation, as well as auxiliary in the implantation of projects of ecological restoration of the remainders.
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Caracterização florística e classificação vegetacional de um fragmento florestal urbano do oeste do Paraná / Floristic characterization and vegetation classification of an urban forest fragment in the western Paraná, BrazilSilva, Jéssica Patrícia Borges da 28 June 2016 (has links)
Submitted by Edineia Teixeira (edineia.teixeira@unioeste.br) on 2018-03-05T19:21:33Z
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Previous issue date: 2016-06-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The aim of this work was to define the vegetation type of the urban fragment 4 Parque Ecológico Paulo Gorski (PEPG) and evaluate the influences of the climate and 5 altitudinal environmental variables on the floristic composition. The total of 1332 6 arboreal individuals of circumference at breast height equal or greater than 15 cm, 7 totalizing 71 species, were sampled. In addition, 401 species from 12 works developed 8 in the Rainforest (RF), Deciduous Forest (DF), Semideciduous Forest (SF) and 9 Araucaria Forest (AF) from southern and southeastern Brazil were used to build a 10 matrix of relative abundance for the floristic similarity. The environmental variables 11 from PEPG and other fragments were extracted from WorldClim. The floristic 12 similarity was evaluated through a group analysis using Simpson's Paradox, and the 13 significance was evaluated through the similarity analysis. The environmental variables 14 were compared between groups through the one-way ANOVA test. The characteristic 15 species from each group were evaluated by a similarity percentage analysis. Three 16 coincidental groups were formed, with the following vegetation types: RF with 20% of 17 similarity, DF/SF with 39% and AF with 32%. Although the PEPG environmental 18 variables have shown themselves as intermediate between AF and DF/FS, this fragment 19 has grouped with other areas from AF.
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O transporte de carga por Acromyrmex subterraneus: investigação do efeito da marcação química e da atividade individualAmaral, Kelly Oliveira do 20 February 2017 (has links)
Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2017-10-09T19:25:02Z
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Previous issue date: 2017-02-20 / As operárias de formigas cortadeiras coletam fragmentos vegetais frescos, os quais são utilizados como substrato para o cultivo do fungo simbionte. A dieta alimentar das operárias de formigas cortadeiras, sobretudo da prole, consiste no consumo do fungo simbionte, o que torna o forrageamento uma atividade primordial para o sucesso de suas colônias. Desse modo, a massa do fragmento vegetal transportado a colônia está diretamente relacionada ao sucesso do forrageamento, pois esta interfere na velocidade de deslocamento das operárias e no aporte de alimento para a colônia. Buscando identificar os fatores que podem modular a determinação da carga transportada em formigas cortadeiras, foi avaliado como o feromônio de trilha influencia na determinação do fragmento vegetal transportado por operárias de Acromyrmex subterraneus. Paralelamente, verificou-se a interferência do sinal químico no fluxo de operárias, bem como da carga transportada na velocidade de deslocamento. Utilizando uma trilha com marcação química prévia no início do forrageamento, não se registrou variação da massa vegetal transportada, no entanto, houve redução do fluxo de operárias que saem da colônia e das que retornavam sem transportar carga, bem como da velocidade de deslocamento das operárias com carga. Uma vez que a pista química feromonal interferiu no fluxo de operárias ao longo da trilha de forrageamento, supõe-se que a determinação da carga transportada pode estar relacionada com as interações entre as operárias. No segundo experimento, foi investigado se a atividade individual da forrageira de Acromyrmex subterraneus influencia na determinação do fragmento vegetal transportado. Observando forrageiras individualmente marcadas durante um mesmo evento de forrageamento, foi registrado o número de viagens realizadas transportando fragmento vegetal, no qual verificou-se que a atividade individual da forrageira não interferiu na massa foliar transportada, isto é, a massa do fragmento vegetal transportado foi a mesma independente do número de viagens realizado por uma mesma operária. Registrou-se ainda que maioria das operárias realizou até três viagens, sendo, portanto, a maior parte do transporte de folhas realizado por operárias que não desempenham exclusivamente a atividade de forrageamento, as quais são denominadas de operárias não elite. Sugerindo um esforço coletivo da colônia em garantir o sucesso do forrageamento. Deste modo, inclui-se junto aos fatores físicos, por exemplo, a relação entre tamanho da operária e fragmento e aos mecanismos de coleta e obtenção de recurso, as interações entre os indivíduos da colônia, que se mostram fundamentais para modulação da carga vegetal transportada pelas operárias. / Cutting ant workers collect fresh plant fragments, which are used as substrate for the cultivation of the symbiotic fungus. The diet of cutter ant workers, especially offspring, consists of the consumption of the fungus symbiont, which makes foraging a prime activity for the success of their colonies. Thus, the mass of the plant fragment transported to the colony is directly related to the success of the foraging, since this interferes in the speed of the workers' movement and in the feeding of the colony. To identify the factors that can modulate the determination of the load carried in leaf cutting ants, it was evaluated how the trail pheromone influences the determination of the vegetal fragment carried by the workers of Acromyrmex subterraneus. At the same time, there was interference of the chemical signal in the flow of workers, as well as the load carried in the displacement speed. Using a trail with prior chemical marking at the beginning of foraging, no variation of the transported vegetable mass was recorded, however, there was a reduction in the flow of workers leaving the colony and those returning without carrying cargo, as well as the speed of movement of workers with load. Since the pheromonal chemical track interfered with the flow of workers along the foraging trail, it is assumed that the determination of the transported load may be related to the interactions between the workers. In the second experiment, it was investigated whether the individual activity of the forage of Acromyrmex subterraneus influences the determination of the transported plant fragment. By observing individually tagged forages during the same foraging event, the number of trips carried out carrying vegetable fragment was recorded, in which it was verified that the individual activity of the forage did not interfere in the transported foliar mass, that is, the mass of the transported vegetable fragment was the same independent of the number of trips made by the same worker. It was also recorded that most of the workers had carried out up to three trips, being therefore most of the transport of leaves realized by workers who do not exclusively perform the foraging activity, which are denominated of non-elite workers. Suggesting a colony's collective effort to ensure foraging success. In this way, the physical factors, for example, the relation between worker size and fragment and the mechanisms of collection and obtaining of resources are included, the interactions between the individuals of the colony, which are fundamental for modulation of the transported vegetal load by the workers.
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Detecção do gene 16Sr-RNA e identificação de patógenos bacterianos, causadores de sepse neonatal precoce, pela técnica da RFLP-PCR ("Restriction Fragment Length Polymorfism - Polymerase Chain Reaction") / Detection of gene 16SR-RNA and identification of bacterail pathogens which cause neonatal sepsis through technique of RFLP-PCR - restriction fragmente lenght polymorfism - polymerase chain reactionPavan, Tycha Bianca Sabaini, 1983- 23 August 2018 (has links)
Orientador: Sergio Tadeu Martins Marba / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-23T19:06:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2013 / Resumo: O objetivo do trabalho foi descrever e avaliar a capacidade da "RFLP-PCR" para detectar patógenos bacterianos em recém-nascidos (RN) e determinar seu uso diagnóstico na sepse neonatal precoce (SNP). Foram avaliados RNs assintomáticos, filhos de gestantes com fatores de risco para infecção ovular e RNs com apresentação de sintomas clínicos sugestivos para SNP, nas primeiras 48 horas de vida, atendidos na unidade neonatal do CAISM/UNICAMP/SP. Realizou-se extração genética das amostras de 200?L de sangue total através do kit QIAamp DNA Mini kit column (Qiagen), seguida da detecção do gene universal bacteriano 16 S rRNA e identificação microbiana pelas sucessivas digestões com enzimas de restrições - HaeIII, AluI, DdeI, MnlI. Foram avaliados 65 RN assintomáticos e 178 RN com apresentação de sinais clínicos sugestivo de SNP. Os patógenos detectados foram K. pneumoniae, S. pneumoniae, L. monocytogenes, P. aeruginosa, E.coli, S.pyognes, S. agalactiae, S. epidermidis e S. aureus. Resultados duvidosos ou bactérias não identificadas ocorram em 56 amostras. A positividade da "RFLP-PCR" foi de 55,3% no grupo assintomático e 51,6% no grupo sintomático, sem diferença estatística (p=0,583). Houve comprovação de sete RN com sepse por cultura e 24 com sepse clínica e foram encontrados valores de sensibilidade de 87,8%, especificidade de 46,6%, valores preditivo positivo de 23,3% e preditivo negativo de 95,4%. Em conclusão, o uso da técnica mostrou uma taxa de acurácia baixa para o diagnóstico para a SNP satisfatória / Abstract: Study objective was to describe and evaluate the ability of RFLP-PCR for detection of bacterial pathogens in newborn and to determine its diagnostic utility in early neonatal sepsis. There were evaluated asymptomatic newborns, children of mothers with risk factors for infection ovulate and newborns with presentation of clinical symptoms suggestive of early neonatal sepsis, occurring before 48 hours of life, evaluated at neonatal unit at CAISM-UNICAMP. Whole blood samples were taken from newborns - 200 ?L each. A genetic extraction were performed using QIAamp DNA Mini kit column (Qiagen) and also the detection of bacterial universal 16 S rRNA gene, subsequent microbial identification using restriction digestion enzymes - HaeIII, AluI, DdeI, MnlI. There were 65 asymptomatic infants and 178 symptomatic newborns. The identified bacteria were K. pneumoniae, S. pneumoniae, L. monocytogenes, P. aeruginosa, E.coli, S.pyognes, S. agalactiae, S. epidermidis and S. aureus. Uncertain or unidentified pathogens occurred in 56 samples. RFLP-PCR positivity was 55,3% in the asymptomatic group and 51,6% in the symptomatic group, with no statistical difference (p=0,583). There were culture comproved sepsis in 7 infants and in 24 newborns were made a diagnostic of clinical sepsis. Diagnostic indexes were: sensibility 87.8%, specificity 46.6%, positive predictive value 23.3% e negative predictive value 95.4%. In conclusion, RFLP-PCR had an unsatisfactory accuracy index early neonatal sepsis / Mestrado / Saude da Criança e do Adolescente / Mestra em Ciências
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Genotipagem , utilizando a sequencia de inserção IS6110, de cepas de Mycobacterium tuberculosis isoladas de pacientes portadores da infecção pelo HIV em Moçambique, Africa / IS6110 Polymorphism in Mycobacterium tuberculosis isolates from HIV infected patients living in Mozambique, AfricaBasso, Audrey Jordão 24 August 2006 (has links)
Orientador: Marcelo de Carvalho Ramos / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-07T12:21:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2006 / Resumo: A técnica do estudo do polimorfismo de fragmentos de restrição, com a pesquisa da seqüência de inserção IS6110 (IS6110-RFLP), é o método de genotipagem mais empregado mundialmente para a caracterização de isolados de M. tuberculosis. Ela pode ser empregada para o estudo de surtos, epidemias ou para estudos de genética populacional. Em Moçambique, onde a tuberculose tem uma elevada prevalência, não há informação suficiente sobre os padrões genotípicos obtidos com a IS6110-RFLP de cepas locais de M. tuberculosis. A descrição dos padrões obtidos com essa metodologia pode ser útil localmente para propósitos epidemiológicos ou, internacionalmente, para descrever o relacionamento de cepas isoladas em Moçambique com outras áreas do mundo. Neste estudo, uma coleção de 158 isolados de M. tuberculosis, identificados com o emprego da análise de fragmentos de restrição após a amplificação de trecho do gene hsp65 (hsp65-PRA), recuperados de pacientes infectados pelo HIV com tuberculose pulmonar e que residiam em Maputo, Moçambique, foram genotipados. O número de seqüências IS6110 obtido variou de 1 to 18, com 21.5% dos isolados exibindo menos de seis cópias. Um total de 10 ¿clusters¿ foram caracterizados, um com três isolados e os demais com dois cada. Os isolados que exibiram menos de seis seqüências não foram incluídos na análise, dado o baixo poder discriminatório do método. Baseado no coeficiente de similaridade, 85% dos isolados tinham mais do que 65% de homologia. Esses dados mostram que, isolados de M. tuberculosis obtidos em Moçambique, África, podem ser analisados, para fins epidemiológicos com o auxílio dessa técnica de genotipagem. Entretanto, um considerável número de isolados exibiu um número pequeno de cópias da seqüência IS6110 e um segundo marcador genético, como a espoligotipagem, deve ser utilizado / Abstract: IS6110 RFLP has been the most widely used genetic subtyping method for M. tuberculosis strains, to characterize disease outbreaks or for evolutionary genetics studies. In Mozambique, where tuberculosis exhibits a high prevalence, there is not enough information about IS6110-RFLP patterns of local M. tuberculosis strains. The description of the fingerprinting patterns obtained with this methodology can be useful locally for epidemiological purposes, and internationally to investigate the relatedness of strains isolated in Mozambique to other areas of the world. In this study, a collection of 158 isolates of M. tuberculosis strains, as identified by using hsp65-PRA, recovered from HIV-infected patients with pulmonary tuberculosis residing in Maputo, Mozambique, was genotyped. The number of IS6110 copies ranged from 1 to 18, with 21.5% of strains exhibiting less than six copies. A total of 10 clusters were found, one consisting of three strains and all the others of two strains. Isolates showing less than six bands were not included in the cluster analyses due to low discriminatory power of the analysis. Based on similarity coefficients 85% of strains had more than 65% homology. This data show that M. tuberculosis strains obtained in Mozambique, Africa can be analyzed for epidemiological purposes with the use of this genotyping technique. However, a considerable number of strains exhibited a low number of IS6110 copies, and a second genetic marker as spoligotyping has to be used. / Mestrado / Clinica Medica / Mestre em Clinica Medica
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Purificação e caracterização do fragmento Fab anti-digoxina obtido pela técnica de phage display. / Purification and characterization of anti-digoxin Fab fragments obtained by phage display technology.André Luís Inocencio 23 March 2016 (has links)
A digoxina é um dos medicamentos indicados para o tratamento de falência cardíaca. Possui janela terapêutica estreita, sendo responsável por casos de intoxicação. O único antídoto disponível para a desintoxicação é o anticorpo policlonal DigiFab®, no formato Fab. O seu uso é eficaz, porém de custo elevado. Clones bacterianos produtores de fragmento Fab monoclonal anti-digoxina foram obtidos previamente pelo nosso grupo, pela técnica de phage display. Neste trabalho as variantes Fab dos 4 clones foram expressas em E.coli para estabelecer o método para a purificação. Com a obtenção dos fragmentos Fab purificados, foi caracterizada a sua afinidade ao antígeno e especificidade, em ensaios de inibição por digoxina, digitoxina, digoxigenina e ouabaina. Os parâmetros cinéticos da ligação dos fragmentos Fab dos 4 clones e do DigiFab® foram avaliados por SPR. Nas condições experimentais, não foram verificadas diferenças significativas entre os produtos dos 4 clones e o comercial, demonstrando o potencial dos fragmentos Fab monoclonais obtidos como antídoto à digoxina. / Digoxin is a medication indicated for heart failure treatment. Its therapeutic window is narrow, being responsible for intoxication cases. The only antidote available for the detoxification is a polyclonal antibody - DigiFab® in Fab format. Its use is effective, but costly. Bacterial clones producing anti-digoxin monoclonal Fab fragments were previously obtained by our group using phage display technology. In this work the Fab variants of the 4 clones were expressed in E.coli to establish the purification method. The purified fragments were characterized regarding the affinity to the antigen and the specificity through inhibition assays with digoxin, digitoxin, digoxigenin and ouabain. The binding kinetic parameters of Fab fragments of the 4 clones and the commercial product to Dig-BSA conjugate were assessed by SPR. Under the experimental conditions no significant differences were observed among the 4 clones and the commercial product, demonstrating the potential of monoclonal Fab fragments as an antidote to digoxin.
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Unidade e fragmento: uma leitura da composição proustiana a partir dos cadernos 53 e 55 de Albertine / Unity and fragment: a reading of the Proustian composition using exercise books 53 and 55 of Albertine as a starting pointCarla Cavalcanti e Silva 08 March 2010 (has links)
Embora o romance Em busca do tempo perdido seja incontestavelmente uma obra inacabada, não se trata, entretanto, de uma obra incompleta. Seu fechamento circular, promovido pelo diálogo entre o primeiro e último volumes, foi tema de grande parte da crítica proustiana. Com relação à sua composição, seu processo escritural passou por diversas mudanças e a construção, equiparada à execução de uma catedral, poderia igualmente ser caracterizada pela colagem, montagem ou costura dos fragmentos textuais esboçados nos setenta e cinco cadernos de rascunho. A busca pela unidade em meio a essa profusão de textos levou o escritor à atividade incessante de releitura e reescritura e, consequentemente, ao inacabamento da obra. O trabalho que ora apresentamos tem por objetivo o estudo dessa composição, a partir da leitura e análise dos cadernos 53 e 55, ambos consagrados à elaboração da história de Albertine. / Although the novel In Search of Lost Time is certainly unfinished, it is not an incomplete work. Its round ending, promoted by the dialogue between the first and last volumes, was the subject of much Proustian criticism. With respect to its composition, its writing process has gone through many changes and the construction, equivalent to the execution of a cathedral, could also be characterized by the process of montage or the stitching of textual fragments contained in Prousts seventy-five exercise books. The search for unity amongst this profusion of texts has led the writer to the ceaseless activity of rereading and rewriting and thus to the incompleteness of the work. The analysis presented here is aimed at studying this composition, having the reading and the analysis of exercise books 53 and 55, both related to the elaboration of the story of Albertine, as a starting point.
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Uso do frit de laranja em dietas para tilápia-do-Nilo desempenho produtivo e sistema antioxidante /Vicente, Igor Simões Tiagua January 2017 (has links)
Orientador: Margarida Maria Barros / Resumo: Foi avaliada a capacidade antioxidante do frit de laranja (OF) no desempenho produtivo, perfil hematológico e atividade das enzimas antioxidante na tilápia-do-Nilo submetidas ao estresse térmico. Um grupo de 440 tilápias-do-Nilo machos (31.7g ± 0.34) foram distribuidos em 40 aquários 250 – L (11 peixes/caixa) e arraçoados com cinco dietas práticas com diferentes níveis de OF 0, 0.2, 0.4, 0.6, 0.8% OF por 70 dias. As dietas foram formuladas para conter 26% de proteína digestível e 14.24 MJ de energia digestível kg-1. Após o período de alimentação foi determinado o desempenho produtivo, perfil hematológico, e atividade das enzimas antioxidante. Após, os peixes foram submetidos ao estresse térmico (32°C) durante três e o mesmo perfil hematológico e atividade das enzimas antioxidante foram determinados. Não houve diferença estatística no desempenho produtivo entre os tratamentos. Peixes alimentados com as dietas 0 Of demonstraram menores valores no perfil hematológico após o estresse térmico (P < 0.05). Os peixes alimentados com dietas que continham 0.6 OF apresentaram menor taxa de hematócrito e os alimentados com 0.8 OF menores taxas de hemoglobin e hematócrito após o desafio de estresse térmico. Peixes alimentados com dietas que continham 0.4 OF demonstraram valores mais baixos de volume corpuscular médio (VCM) e maiores valores de concentração de hemoglobina corpuscular media (CHCM) quando comparados antes e após estresse térmico. As dietas com inclusão de frit de laranja det... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The antioxidant capacity of dietary orange frit (OF) on growth, hematological profile and antioxidant enzymes activity of Nile tilapia subjected to heat-induced stress (HIS) was analyzed. A group of 440 male Nile tilapia (31.7g ± 0.34) was randomly distributed in 40 250-L aquaria (11 fish/tank) and fed five practical diets with graded levels of OF at 0, 0.2, 0.4, 0.6 and 0.8% OF orange frit kg-1 diet for 70 days. The diets were formulated to contain 26% digestible protein and 14.24 MJ digestible energy kg-1. After the feeding period, growth performance, hematological profile and antioxidant enzymes activity were determined. Then, fish were subjected to HIS (32°C) for three days and the same hematological profile and antioxidant enzymes activity were determined. There was no statistical difference for growth performance among treatments. Fish fed 0 OF diet showed lower hematological profile after HIS (P < 0.05). Fish fed 0.6OF presented lower hematocrit and fed 0.8 OF lower hemoglobin and hematocrit after HIS. Fish fed 0.4 OF showed the lowest mean corpuscular volume (MCV) and the highest mean corpuscular hemoglobin concentration (MCHC) comparing the vales before and after HIS. Dietary orange frit determined different activities (P < 0.05) for catalase before HIS. Fish fed 0 OF diet showed the highest activity and 0.2 OF the lowest. After HIS fish fed 0 OF and 0.2 OF showed the lowest activity and 0.6 OF the highest (P < 0.05). A comparison of the values before and after HIS s... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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