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Clonagem de promotores de cana-de-açúcar e análise do transcriptoma de genótipos segregantes para teor de sacarose / Cloning of sugarcane promoters and transcriptome analysis of genotypes segregating for sugar contentAndrade, Rodrigo Fandiño de 23 November 2012 (has links)
A cana-de-açúcar é uma gramínea com fotossíntese do tipo C4, com capacidade de acumular sacarose nos colmos em quantidades que excedem 50% de seu peso seco, característica única no reino vegetal (Moore, 1995). Sacarose e seu derivado mais importante, etanol, são dois produtos de grande importância mundial. Assim, o teor de sacarose em cana tem fundamental importância no aumento da produtividade dessas duas commodities. O melhoramento clássico parece ter alcançado seu limite, já que incrementos expressivos no teor de sacarose em novas variedades não têm sido observados e tudo aponta para a necessidade de estudos que levem a uma maior compreensão dos mecanismos moleculares associados à produção, transporte e acúmulo de sacarose em cana (Casu et al., 2005; Moore, 1995). Procurar seqüências promotoras de genes de interesse é importante para a obtenção de transgênicos, já que promotores constitutivos não apresentam resultados satisfatórios em cana (Lakshmanan et al., 2005). É também objetivo aqui hibridar mRNA de genótipos de cana-de-açúcar com segregação para acúmulo de sacarose, em uma plataforma customizada de oligos (Agilent), com aproximadamente 44k elementos, que compõe uma representatividade gênica não alcançada em esforços anteriores com microarranjos de cDNA. Genome walking foi a técnica utilizada na obtenção de regiões à montante do primeiro éxon, predito in silico, para três proteínas quinase de interesse, SASGMS11561, SASGMS16343 e SASGMS09047, que se mostraram moduladas em experimentos anteriores de hibridação com amostras segregantes para conteúdo de sacarose. Foi obtido sucesso nos três casos, tendo os fragmentos de DNA sido seqüenciados e oportunamente alinhados à montante dos correspondentes genes ortólogos em sorgo, bem como ao banco ainda em construção de contigs do genoma de cana-de-açúcar, obtidos por shotgun. A plataforma Agilent, com seus 43803 SAS únicos, mostrou-se uma ferramenta muito adequada para as hibridações de genótipos de mais alto Brix contra genótipos de mais baixo Brix. Um total de 569 genes diferencialmente expressos foram obtidos em pelo menos uma das três hibridações realizadas. Um grupo de genes, de diferentes categorias e perfis de modulação, foi validado por PCR em tempo real, obtendo uma taxa de aproximadamente 90%. Apesar do grande número de SAS diferencialmente expressos, por volta de 70% dos mesmos ainda se encontram não categorizados, seja por falta de similaridade de seqüência em bancos de dados de organismos próximos ou pela alta complexidade e esforço prático na cura desse processo de categorização manual. Assim, três fragmentos de seqüências promotoras para três proteínas quinase de interesse foram obtidos e seqüenciados, como parte dos esforços do grupo em formar um catálogo de promotores específicos para cana-de-açúcar. Um grupo de genes foi analisado dos resultados das hibridações por seus papéis relevantes nos processos que levam ao maior teor de sacarose em cana, devidamente corroborados por trabalhos do próprio grupo, bem como de outros / Sugarcane is a C4 plant with the unique characteristic of being capable of accumulating sucrose in its culms in quantities that exceed 50% of its dry weight (Moore, 1995). Sucrose and ethanol are highly valued products in the world of today. Sucrose content is a trait with fundamental importance in the on-going process of increasing productivity of these two sugarcane byproducts. Classic improvement of sugarcane seems to have reached its practical limits, given that it has become increasingly harder to obtain varieties with increased sugar content. This obstacle points towards the necessity of better comprehension of the molecular mechanisms associated to the production, transport and accumulation of sucrose in sugarcane (Casu et al., 2005; Moore, 1995). The search for promoter sequences of genes of interest is crucial for the production of transgenic lines, since the use of constitutive promoters in sugarcane has been highly problematic, leading to unsatisfactory results in most cases (Lakshmanan et al., 2005). Another objective was to hybridize sugarcane genotypes with contrasting sugar content in a customized Agilent oligo platform, containing approximately 44k elements, which signifies the best effort so far regarding gene representativeness. Genome walking was the chosen technique to obtain upstream regions of the first in silico predicted exon of three proteins kinases of interest, SASGMS11561, SASGMS16343 and SASGMS09047, all of them selected from previous hybridization experiments with contrasting sucrose content samples. Success was achieved in all three cases, and the obtained fragments were sequenced and aligned to their respective syntenic region on the sorghum genome as well as on contigs from an increasingly larger bank of genomic sugarcane sequences, from our group, which has been acquired using the shotgun sequencing method. The Agilent platform, with its 43803 unique sugarcane assembled sequences (SAS), has proven valuable as a powerful high scale tool for the hybridization of genotypes with contrasting Brix values (high versus low Brix). A total of 569 differentially expressed genes were obtained from at least one of the three experiments accomplished. A group of genes from different categories and modulation profiles was depicted and validated through real time PCR, with an approximate validation rate of 90%. Although the number of differentially expressed genes is high, around 70% of them is still uncategorized, mostly because of their unique identity and therefore lack of reference organisms to compare with and the high complexity and laboriousness of categorizing them manually. In summary, three promoter fragments from three different protein kinases of interest were obtained and sequenced, as a part of a greater effort to create a sugarcane promoter sequence catalogue. From the hybridization assays, a group of genes were analyzed, due to their putative importance in the processes that lead to a higher sucrose content in sugarcane, also corroborated by previous studies from our group as well as from others.
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Caracterização da madeira de árvores de clones de Eucalyptus grandis, E. saligna e E. grandis x urophylla. / Wood characterization of Eucalyptus grandis, E. saligna and E. grandis x urophylla clones.Arango Alzate, Sandra Bibiana 30 November 2004 (has links)
No Brasil e em diversos países têm sido verificados significativos avanços na silvicultura clonal intensiva com diferenças marcantes existentes entre os clones de espécies e de híbridos de Eucalyptus quanto aos parâmetros de crescimento e de desenvolvimento. Ao mesmo tempo, nos últimos tempos, foi introduzido o conceito de uso múltiplo do lenho das árvores com a utilização da madeira como fonte de celulose e papel, madeira sólida e outras aplicações como estratégia de aumento da rentabilidade do empreendimento florestal. Pelo exposto, o presente trabalho de pesquisa teve como objetivo a caracterização da madeira de árvores de 8 anos de clones de Eucalyptus grandis, E. saligna e de E. grandis x urophylla, visando possibilitar a otimização do seu uso. De plantações clonais localizadas no município de São Miguel de Arcanjo-SP da Cia Suzano de Celulose e Papel, foram selecionados os 5 melhores clones de cada espécie e híbrido pelas suas características silviculturais. Para cada clone foram selecionadas e cortadas as 10 melhores árvores (total de 150 árvores) e foram mensurados os parâmetros dendrométricos (DAP, altura total, altura comercial, espessura da casca). Do tronco dessas árvores foram cortados cilindros de madeira, em 5 porcentagens da altura do tronco e no DAP, em um total de 900 amostras. Em condições de laboratório, as amostras de madeira foram preparadas e analisadas com respeito aos parâmetros de qualidade da madeira anatômicos (caracterização da estrutura anatômica, variabilidade radial das dimensões das fibras, vasos, cerne e alburno) e físicos (densidade básica, densidade aparente através de densitometría de raios X, variabilidade radial da densidade) proporcionando a obtenção do índice de unifomidade da madeira. Os resultados possibilitaram a detalhada caracterização dos clones de cada árvore com respeito às variações ao longo do seu tronco e no sentido radial das amostras do DAP, a saber: (i) o teor médio de casca e alburno foi superior nos clones de E.saligna, o de cerne nos de E. grandis, (ii) os valores médios de densidade básica da madeira foram de 0,46; 0,47 e 0,49 g/cm3 para o E. grandis, E. saligna e E. grandis x urophylla; ocorreram variações longitudinais dentro e entre os clones das espécies de Eucalyptus, (iii) foram observadas variações quali e quantitativas dos elementos anatômicos da madeira entre espécies e híbrido de Eucalyptus, (iv) o valor médio da densidade aparente da madeira foi de 0,46; 0,54 e 0,54 g/cm3 nos clones de E. grandis, E. saligna e E. grandis x urophylla, respectivamente, (v) o índice de uniformidade indicou maior homogeneidade da madeira dos clones de E. grandis e E. saligna. A partir dos resultados obtidos foram preconizados alguns usos potenciais da madeira dos clones das duas espécies e híbrido de Eucalyptus. / In Brazil, as in many other countries, it has been verified significant advances in intensive clone silviculture with remarkable differences between clones of species and hybrids of Eucalyptus based on parameters of growth and development. At the same time, during these last years, it has been introduced the concept of multiple uses of trees log, having the wood as cellulose and paper source, solid wood and other applications as strategies for rising rentability of forestry enterprise. For the above, this research was based on wood of 8-year-old clones of Eucalyptus grandis, E. saligna and E. grandis x urophylla, heading to the optimization of its use. The 5 best clones of each specie and hybrid were selected based on their characteristics silviculturais and were chosen from clone cultures of Cia Suzano de Celulose e Papel, located at the district of São Miguel Arcanjo, in SP. For every clone it was selected and sliced the 10 best trees (over 150) and their dendrometrics parameters were measured (DHP, total highness, commercial highness, thicket bark etc). These trees had their log sliced in cylinders of wood, in 5 percentage of highness of the log and DHP, over a total amount of 900 sample. Under laboratory conditions, these wood samples were prepared and analyzed respecting the parameters about the wood quality related to its aspects anatomic (anatomic structure, radial variability of dimensions fibers, vases, heartwood and sapwood) and physics aspects (basic density, density based on densitometry of x-rays, radial variability of parameters about the wood quality related to its aspects anatomic (anatomic structure, radial variability of dimensions fibers, vases, heartwood and sapwood) and physics aspects (basic density, density based on densitometry of x-rays, radial variability of density) to obtain the uniformity index of wood. The results provided a detailed characterization of the clones of each tree related to the variations all over their log and related to the radial direction of DHP samples, as to know: (i) medium content of bark and sapwood was superior in clones of E.saligna, the heartwood in E.grandis, (ii) the medium values of wood basic density were 0,46; 0,47; 0,49 g/cm3 for the E.grandis, E.saligna and E.grandis x urophylla; it has occurred longitudinal variations inside and between clones of eucalyptus species, (iii) it was observed the variations about quality and quantity of anatomic elements of wood between species and hybrid of eucalyptus, (iv) the medium values of density apparent of wood was 0,46; 0,54; 0,55 g/cm3 in clones of E.grandis, E.saligna and E. grandis x urophylla, (v) the uniformity index indicated more homogeneity of wood in clones of E.grandis and E. saligna. Starting from these results, it had been stated some potencial uses of cloned wood for the 2 species and hibryd of Eucalyptus.
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Arte transmídia: um estudo sobre uma forma de expressão artística na era digital / Transmedia art: a study about a form of artistic expression in the digital eraAllegretti, Luciana 06 April 2018 (has links)
Esse estudo se dedica a fazer uma reflexão sobre a arte transmidiática através da apropriação das tecnologias digitais criadas a partir do advento do computador e da internet. Apesar de não ser novo o uso de múltiplas plataformas, a conexão entre as pessoas e o grande fluxo de informação trocada pela internet possibilita um novo ambiente criativo e uma nova relação entre público e arte. O trabalho tem seu início analisando a perspectiva histórica dessas novas tecnologias, que se tornaram ubíquas, e disserta sobre sua hibridação com o universo artístico, levando em conta a interatividade com o público e a cocriação. Para compreensão deste cenário tecnossocial, a pesquisa discorre sobre a penetração das novas tecnologias no cotidiano e seu impacto na sociedade. Finalmente, o estudo apresenta e descreve uma seleção de obras que podem ser definidas ou foram criadas como transmidiáticas, e examina sua produção e circulação na sociedade. / This study reflects on transmedia art through the use of the digital technologies that emerged with the advent of the computer and the internet. Even though the use of multiple platforms isnt new, the interpersonal links and the significant flux of data and information exchanged through the internet enables a new creative environment and a new relationship between art and its public. Observing these new and ubiquitous technologies from a historic viewpoint, this work examines its hybridization with the art world, its interaction with the public and collaborative co-creation. To comprehend this techno-social scenario, the research explains the advance of new technologies in everyday life and its impact on society. Finally, the study presents and describes a selection of artworks that could be defined or were created as transmedia art, its production process and the way society reaches and absorbs it.
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Phytomonas e outros Tripanossomatídeos em insetos no Estado de Rondônia - Amazônia Ocidental. / Phytomonas and others Trypanosomatids of insects in Rondonia State, Occidental Amazon.Godoi, Mara Maria Izar de Maio 15 March 2001 (has links)
Tripanossomatídeos particularmente os do gênero Phytomonas, podem infectar, frutos, látex, seiva, floema e flores de muitas famílias de vegetais, e foram detectados em insetos fitófagos de seus possíveis vetores em várias regiões do Velho e Novo Continente. Em contraste com a enorme variedade da flora e da fauna entomológica da Amazônia Brasileira, poucas espécies têm sido descritas albergando tripanossomatídeos. Os tripanossomatídeos pertencentes a estes gêneros podem apresentar formas evolutivas típicas que permitem a sua identificação morfológica. No entanto as formas promastigota, existentes tanto no ciclo evolutivo dos gêneros Herpetomonas, Leptomonas e Phytomonas, não permitem a identificação morfológica, sendo necessário parâmetros adicionais para a diferenciação entre os gêneros. A dificuldade do cultivo in vitro", impede a correta avaliação da presença destes parasitas em insetos e plantas, impossibilitando uma avaliação do universo dos tripanossomatídeos. No presente trabalho foram realizadas 37 coletas de hemípteros adultos, no estado de Rondônia, nas duas estações climáticas regional durante o período de 1998 a 1999. Foram coletados 244 hemípteros pertencentes a 17 espécies diferentes as quais 13 se revelaram portadoras de tripanossomatídeos. Das amostras positivas foram feitos esfregaços em lâminas e corados com Giemsa para posterior análise morfológica e morfométrica. Numa segunda etapa fizemos aplicação do PCR (reação em cadeia da Polimerase) em DNA recuperado de esfregaços em lâminas para pesquisa de tripanossomatídeos de insetos e plantas seguido de hibridação com sonda SL3 específica para pesquisa do gênero Phytomonas, com vistas a um estudo preliminar da presença de tripanossomatídeos e Phytomonas em Hemípteros Fitófagos no estado de Rondônia sem necessidade de isolamento e cultura axênica dos parasitas. / Tripanossomatids, particularly Phytomonas, may infect the fruit, latex, sap, phloem and flowers of many plant families. These parasites have also been detected in phytofagous insects which are potential vectors in many areas of the Old and New World. In spite of the enormous variety of flora and entomological fauna of the Brazilian Amazon only a few species have been described harbouring tripanossomatids. Some genera of tripanossomatids present typical morphological forms which they can be identified. However, the promastigote form occurs in the genera Herpetomonas, Leptomonas and Phytomonas, so other parameters are needed to separate them. The difficulties of in vitro cultivation also hinders determining the presence of these parasites in both insects and plants, thus making it impossible to estabilish realistic incidence rates of these ubiquitous parasites. In the present study 37collections of adult hemipterans were made in Rondônia State during the different regional seasons of 1998 to 1999. A total of 244 bugs belonging to 17 species were collected of which 13 had trypanosomatid infections. Methanol fixed smears of all the infections were made on glass slides and stained with Giemsa for the morphological studies and morphometric analyses. In a second phase, we used the PCR (Polimerase Chain Reaction) to recover DNA from the methanol fixed smears. The PCR products were hybridized with the SL3 probe which is specific for Phytomonas. The aim of this preliminary study was to locate trypanosomatids infections in phytophagous Hemiptera captured in Rondônia State and then determine which of these belonged to the genus Phytomonas without the necessity of isolation in culture.
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Avaliação do potencial produtivo do milho híbrido AGN-30A06 em espaçamentos e populações diferenciadas / Evaluation of mayze potential productivity (hybrid AGN-30A06) using different row spacing and plant population densityDe Cesaro, Volmar 02 March 2009 (has links)
Com o objetivo de avaliar o potencial produtivo do milho híbrido AGN-30A06 em espaçamentos e populações diferenciadas, além de analisar o índice bromatológico do grão produzido visando verificar o efeito do manejo do nitrogênio empregado, foi conduzido um experimento de campo na área da Escola Agrotécnica Federal de Concórdia, em Concórdia, SC, utilizando o delineamento experimental de blocos casualizados, no esquema de parcelas subdivididas, com duas repetições. Foram utilizados os espaçamentos entre linhas de 0,45 m, 0,60 m e 0,80m com as populações de 60.000, 70.000 e 80.000 plantas por hectare. As maiores produtividades de grãos foram obtidas com o espaçamento de 0,45m. Dentre as três densidades populacionais, aquela que proporcionou um melhor resultado foi com 80.000 plantas por hectare e espaçamento entre linhas de 0,45m. Isso permite concluir que é possível aumentar a produtividade de grãos com o incremento de densidade de plantas sob o espaçamento reduzido. Quanto à bromatologia, pode-se concluir que: (i) quanto maior for a adubação, maior será o teor de óleo, menor será o teor de proteína, melhor será a qualidade dos grãos e menor será a incidência de doenças; e (ii) quanto menor for a adubação, maior será o teor de proteína, menor será o teor de óleo; e maior será a quantidade de grãos avariados. / With the purpose of evaluating the mayze potential yield (hybrid AGN-30A06) using different row spacing and plant population, in addition to analyzing the grain bromatological index and verifying the nitrogen management effect, a field experiment was carried out at \'Escola Agrotécnica Federal de Concórdia\', in Concórdia, State of Santa Catarina, Brazil, using the randomized block design (split-plot) with two replications. The following spacing between plant rows were used: 0.45 m, 0.60 m and 0.80 m with populations of 60,000, 70,000 and 80,000 plants per hectare. The higher values of grain productivities were obtained with the spacing between plant rows of 0.45 m. Among the three plant densities, 80,000 plants per hectare with spacing between plant rows of 0.45 m provided a better result. This indicates that it is possible to increase grain yield increasing plant density under reduced spacing between plant rows. Related to the bromatology, it was verified that: (i) high level of fertilization results higher oil content, lower protein content, better quality of grain and lower incidence of diseases and (ii) low level of fertilization results higher protein content, lower oil content and greater amount of damaged grains.
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Estrutura genética de zonas de hibridação natural entre Epidendrum fulgens e E. puniceoluteum (Orchidaceae) / Genetic structure of natural hybrid zones between Epidendrum fulgens and E. puniceoluteum (Orchidaceae)Pinheiro, Fabio 25 February 2010 (has links)
Epidendrum L. é o maior gênero de Orchidaceae da região Neotropical com cerca de 1500 espécies, e os processos de diversificação no grupo são pouco conhecidos. Apesar de existirem muitos relatos sobre hibridação no gênero, não há trabalhos que tenham testado essa hipótese em populações naturais. Epidendrum fulgens Brongn. e E. puniceoluteum F. Pinheiro & F. Barros são espécies que ocorrem ao longo do litoral brasileiro, freqüentemente em simpatria. Para testar a eficiência de suas barreiras reprodutivas, foi examinada a distribuição da variação genética dentro e entre populações simpátricas e alopátricas dessas duas espécies. Nove loci de microsatélites nucleares, e cinco loci de microssatélites de cloroplasto foram utilizados para genotipar 463 indivíduos de oito populações, ao longo de toda distribuição geográfica das espécies. A utilização de métodos de atribuição Bayesianos (programas STRUCTURE e NEWHYBRIDS) detectou a existência de grande quantidade de híbridos nas populações simpátricas. As zonas de hibridação são constituídas por híbridos F1, F2 e retrocruzamentos. A introgressão foi assimétrica, ocorrendo preferencialmente de E. fulgens para E. puniceoluteum. Na população da Ilha do Cardoso, foi detectada a predominância de indivíduos F1 e F2, enquanto nas demais localidades a maior parte dos indivíduos híbridos foi identificada como sendo retrocruzamentos na direção de E. puniceoluteum. Em Florianópolis, não foi possível observar a existência de indivíduos puros de E. puniceoluteum, apenas indivíduos exibindo fortes sinais de introgressão, revelando que o processo de hibridação pode interferir na integridade genética das espécies, levando um dos parentais à extinção. O presente estudo sugere que hibridação e introgressão podem ter papel importante na diversificação em Epidendrum e mostra a importância de investigar zonas de hibridação para melhor entender as barreiras reprodutivas e os processos de especiação nas espécies neotropicais de orquídeas. / Among members of the genus Epidendrum , the largest orchid genus of the Neotropics, E. fulgens and E. puniceoluteum occur along the seashore in Brazilian Atlantic Rainforest in sympatric populations. To test the strength of their reproductive barriers, we examined the distribution of genetic variation within and among sympatric and allopatric populations of these two species. Nine specifically developed nuclear microsatellite loci and five chloroplast microsatellite loci were used to genotype 463 individuals from eight populations across species geographical range. All six sympatric populations analyzed present hybrid zones, indicating that hybridization between E. fulgens and E. puniceoluteum is a common phenomenon. Bayesian assignment analysis detected the presence of F1 and F2 individuals, and signs of introgression as well, demonstrating a high potential for interspecific gene flow. The introgression patterns are assimetrical, with differences among populations. Introgression occurs preferentially from E. fulgens to E. puniceoluteum. In Florianópolis population the hybridization seems to lead a species erosion, where pure individuals of E. puniceoluteum where not found. This study suggests that hybridization and introgression could play an important role in the diversification of Epidendrum , and indicated the importance to investigate hybrid zones for better understanding reproductive barriers and speciation processes in Neotropical orchid species.
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Isolamento reprodutivo entre linhagens brasileiras de Helicoverpa zea e Helicoverpa armigera (Lepidoptera: Noctuidae) / Reproductive isolation between Brazilian strains of Helicoverpa zea and Helicoverpa armigera (Lepidoptera: Noctuidae)Sousa, Dayana Rosalina de 06 June 2016 (has links)
O gênero Helicoverpa Hardwick, 1965 (Lepidoptera: Noctuidae: Heliothinae) compreende insetos pragas de distribuição cosmopolita. Historicamente no Brasil, H. zea (Boddie) é a principal praga do gênero, no entanto, em 2013 foi reportado pela primeira vez no território brasileiro H. armigera (Hübner). Estudos filogenéticos, morfológicos e ecológicos têm relacionado estas duas espécies como irmãs. A possibilidade de hibridação entre H. armigera e H. zea em condições naturais desperta interesse sobre os mecanismos genéticos, reprodutivos, de desenvolvimento e comportamentais de especiação dessas espécies. Além disso, H. armigera e H. zea são pragas severas para diversos cultivos, o que torna o entendimento destes processos crucial para o desenvolvimento de estratégias de controle. Dentro deste contexto, nosso objetivo foi confirmar a viabilidade e a adaptabilidade da prole híbrida entre as linhagens brasileiras de H. zea e H. armigera. Associado a isso, nós também testamos a tolerância da linhagem híbrida a deltametrina e plantas geneticamente modificadas (Bt). E por último, aplicamos marcadores moleculares em indivíduos oriundos do campo para identificar a ocorrência natural de possíveis indivíduos híbridos em diferentes cultivos e regiões do território brasileiro. Nossos resultados confirmam a possibilidade de surgimento de uma prole híbrida fértil entre as linhagens brasileiras de H. zea e H. armigera. Assim como os marcadores nucleares sugerem a presença de indivíduos híbridos em condições naturais no território brasileiro. Os mecanismos pré-copulatórios de especiação parecem ser menos efetivos na manutenção do isolamento reprodutivo, visto que os testes de escolha revelaram cruzamentos interespecíficos recíprocos entre as espécies. A linhagens híbridas tiveram um menor intervalo de tempo entre cada geração (T) ao serem comparadas com as linhagens parentais puras, porém a capacidade de fêmeas gerarem fêmeas e a capacidade de manter a população em crescimento (Ro, rm,) foram menores que as linhagens puras, indicando uma tendência à extinção das populações ao longo das gerações. As proles híbridas tiveram índice de sobrevivência a deltametrina equivalente ao da linhagem parental H. armigera, já os indivíduos híbridos da geração F2 (F1xF1) apresentaram menor sobrevivência em relação a H. armigera. Não houve sobrevivência das linhagens parentais e híbridas nos testes de sobrevivência ao algodão Bt. A baixa viabilidade de cruzamentos híbridos em laboratório e a baixa frequência no campo confirmaram isolamento reprodutivo entre H. zea e H. armigera, mesmo que parcial. / The genus Helicoverpa Hardwick, 1965 (Lepidoptera: Noctuidae: Heliothinae) includes insect pests of cosmopolitan distribution. Historically in Brazil, H. zea is the main pest of the genus (Boddie), however in 2013 H. armigera (Hübner was first reported in Brazil). Phylogenetic, morphological and ecological traits have suggested these two species are \"sibling species\". The possibility of hybridization between H. armigera and H. zea under natural conditions arouses interest in genetic, reproductive, developmental and behavioral mechanisms of speciation between these species. In addition, H. armigera and H. zea are severe pests in several crops, which makes the understanding of these processes critical to the development of control strategies. Within this context, our goal was to carry out interspecific bioassays of behavior and development to confirm the viability and fitness of hybrid offspring between Brazilian strains of H. zea and H. armigera. Furthermore, we tested the tolerance of the hybrid strains to deltamethrin and genetically modified cotton plant (Bt). Finally, we applied molecular markers in specimens from different regions and hosts to identify the possible occurrence of natural hybrid specimens in Brazil. Our results confirm the possibility of emergence of a fertile hybrid offspring between Brazilian strains of H. zea and H. armigera. In addition nuclear markers suggest the presence of individual hybrids in natural conditions in Brazil. Pre-copulatory speciation mechanisms are not effective in the maintenance of reproductive isolation, since the choice tests showed reciprocal interspecific crosses between species. The hybrid strains showed lower developmental time among generations (T) when compared with the parental strains. However, hybrid females have lower reproductive capacity and maintaining growing population (Ro, RM, λ), indicating an extinction trend of populations over generations. The hybrid individuals F1 showed equivalent survival to deltamethrin than H. armigera parental strain, however hybrid individuals F2 (F1xF1) showed lower survival to H. armigera. There were no survival of the parental and hybrid strains to Bt cotton. The low viability of interspecific crosses in the laboratory and the low frequency in the field confirmed reproductive isolation between H. zea and H. armigera Brazilian strains, even partial.
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Melhoramento de Saccharomyces cerevisiae mediante cruzamento massal para produção de etanol 2G em fermentações com reciclo de células / Saccharomyces cerevisiae improvement by mass mating for production of 2G ethanol in fermentation with cell recycleOsni Florencio Junior 07 April 2017 (has links)
É crescente a busca por fontes de energia renováveis em substituição a o uso dos combustíveis fósseis, devido a grande preocupação mundial com o aquecimento global e as mudanças climáticas. O Brasil é considerado o detentor do processo de produção de etanol mais economicamente viável. Estimativas apontam para o fato de que a produção de etanol de primeira geração não será suficiente para atender a futura demanda global pelo biocombustível. Diante disto, a produção de etanol a partir da biomassa lignocelulósica se mostra como uma potencial solução. No entanto, durante o pré-tratamento e a hidrólise da biomassa, há formação de vários compostos tóxicos tais como o furfural, HMF, ácido fracos, e compostos fenólicos, os quais exercem efeitos inibitórios sobre as leveduras, tendo como consequência queda no rendimento fermentativo. Além das vantagens tecnológicas que o processo industrial brasileiro apresenta quanto à incorporação da produção de etanol 2G nas plantas já existentes, soma-se a abundância de matéria prima proveniente da própria indústria sucroalcooleira. No entanto, é de extrema necessidade o desenvolvimento de leveduras capazes de resistir as diversas condições inibitórias provenientes do novo substrato, as quais são potencializadas pelo reciclo celular. Neste sentido, o presente trabalho objetivou o desenvolvimento de novas linhagens de leveduras através das técnicas de hibridação e evolução adaptativa/seleção. Para isto, foi realizado o cruzamento massal envolvendo 5 linhagens de Saccharomyces cerevisiae, previamente selecionadas por demonstrar alta tolerância em fermentações em mosto misto a base de hidrolisado lignocelulósico e melaço de cana-de-açúcar. Inicialmente estudos foram realizados com a intenção de se obter altas taxas de esporulação, a fim de se propiciar uma grande quantidade de cruzamentos aleatórios para consequente geração de uma ampla biodiversidade, aumentando assim a possibilidade de se obter indivíduos com fenótipos melhorados. A cultura resultante do cruzamento massal foi seguida de evolução adaptativa/seleção, buscando, após cerca de 51 gerações, um enriquecimento da cultura com as linhagens mais tolerantes. Por meio de avaliação de crescimento em microplacas (DO 600nm), foram selecionadas 10 isolados evoluídos, os quais foram submetidos a ensaio de fermentação em bancada, simulando tanto quanto possível as condições industriais. Ao final, foi possível destacar uma linhagem por apresentar teor de reserva de trealose significativamente maior que as demais linhagens avaliadas, demonstrando assim a geração de um fenótipo melhorado. / Searching for renewable energy sources to substitute the fossil fuels use is growing, due to a great concern worldwide for global warming and climate change. Brazil is considered the holder of the most economically viable process of ethanol production. Estimates indicate that ethanol production of first generation will not be enough to supply future global demand for biofuel. Therefore, an ethanol production from the lignocellulosic biomass show up as a potential solution; however, during biomass pretreatment and hydrolysis, several toxic compounds such as furfural, HMF, weak acid, and phenolic compounds are formed, which exert inhibitory effects on yeasts, resulting in a fermentative yield decrease. Besides the technological advantages, presents in Brazilian industrial processes to incorporation of 2G ethanol production in existing factories, add up the abundance of feedstock comes from the own sugar and alcohol industry. However, the development of yeasts strains, resisting to inhibitory conditions from the new substrate which are potentiated by the cellular recycle, is extremely necessary. In this sense, the present work aimed the development of new yeasts strains by hybridization and adaptive evolution techniques. Mass mating was carried out involving 5 strains of Saccharomyces cerevisiae, previously selected by demonstrating high tolerance to fermentation from mixed-must composed by lignocellulosic hydrolyzate and sugarcane molasses. Previous studies were carried out to get high rates of sporulation that promote random crosses and broad biodiversity, in order to obtain individuals with improved phenotypes. The culture resulting from the mass mating was followed by an adaptation/selection, during 51 generations, generating enrichment of more tolerant strains. By means of microplate growth evaluation (DO 600nm), 10 evoluted isolates were selected, which were submitted to lab scale fermentation, simulating as much as possible as industrial conditions. At the end, it was possible to highlight a lineage demonstrating significantly higher trehalose reserve content than the other lineages evaluated, thus demonstrating a generation of an improved phenotype.
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Estudo dos cromossomos de espécies alocadas em incertae sedis (Characiformes, Characidae) com o uso de diferentes marcadores citogenéticos /Piscor, Diovani. January 2012 (has links)
Resumo: Dentre os Characiformes a família Characidae é o grupo com maior número de espécies da ordem apresentando peixes de pequeno e grande porte. A subfamília Tetragonopterinae, antes considerada como a subfamília com o maior número de espécies foi considerada como um grupo polifilético. A partir de então, somente o gênero Tetragonopterus foi mantido na subfamília e todos os demais gêneros de Tetragonopterinae foram alocados em incertae sedis dentro de Characidae. Muitos exemplares pertencentes a este grupo, já tiveram seus cromossomos estudados, demonstrando que o número diploide mais frequente é 2n=50/2n=52 cromossomos. Outra característica marcante compartilhada por muitas espécies da família é o primeiro par metacêntrico maior do que os demais cromossomos do complemento A. Diante das problemáticas taxonômicas apresentadas na literatura para o grupo incertae sedis e considerando que ainda há muito que ser estudado sobre a citogenética dos mesmos, o presente trabalho constituiu em realizar análises dos cromossomos de espécies dos gêneros Bryconamericus, Piabina, Hyphessobrycon e Astyanax, visando detectar possíveis variações que permitam um melhor entendimento das relações evolutivas entre as populações desses gêneros em incertae sedis. Para tanto, os cromossomos das espécies Bryconamericus stramineus da bacia do rio Iguatemi - MS; Bryconamericus turiuba, Bryconamericus cf. iheringii, Piabina argentea, Hyphessobrycon eques e três populações de Astyanax fasciatus provenientes da bacia do rio Corumbataí - SP; Astyanax abramis do córrego Bento Gomes (MT); Astyanax mexicanus e Astyanax eigenmanniorum provenientes de loja de aquário e duas populações de Astyanax altiparanae provenientes do ICMBio- CEPTA - Pirassununga (SP) e córrego Guaçu... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Among the Characiformes, the Characidae family is the largest group of the order involving large and small fish. The subfamily Tetragonopterinae, previoulsy considered as the subfamily with the greatest number of species was considered as a polyphyletic group. Since then, only the genus Tetragonopterus was kept in the subfamily and all other Tetragonopterinae species were considered as incertae sedis within Characidae. Many specimens belonging this group had been their chromosomes studied, demonstrating that the most frequent diploid number is 2n=50/52 chromosomes. Another striking feature shared by many species of the family is the first metacentric pair larger than the other chromosomes of the complement A. Given the taxonomic problems presented in the literature for the group incertae sedis and considering that much remains to be studied about the cytogenetics of these group, the present work was to perform analysis of chromosomes of the genus Bryconamericus, Piabina, Astyanax and Hyphessobrycon, to detect possible variations that allow a better understanding of evolutionary relationships among populations in these genus in incertae sedis. The chromosomes of Bryconamericus stramineus Iguatemi River basin - MS; Bryconamericus turiuba, Bryconamericus cf. iheringii, Piabina argentea, Hyphessobrycon eques and tree populations of Astyanax fasciatus from Corumbataí River basin - SP; Astyanax abramis from stream Bento Gomes (MT); Astyanax mexicanus and Astyanax eigenmanniorum from aquarium store and two populations of Astyanax altiparanae from the ICMBio-CEPTA - Pirassununga (SP ) and stream Guaçu (MS) were analyzed using classical techniques such as Giemsa staining, Ag-RON, Cband and CMA3 addition to applying the technique of fluorescence in situ hybridization (FISH) with 18S and... (Complete abstract click electronic access below) / Orientador: Patricia Pasquali Parise-Maltempi / Banca: Luciana Bolsoni Lourenço / Banca: Carlos Alexandre Fernandes / Mestre
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Física como disciplina escolar: investigando sua dimensão cultural / Physics as school discipline: Investigating its cultural dimensionSousa, Paula Fernanda Ferreira de 25 April 2014 (has links)
O presente trabalho visa investigar em que medida a Física, reconhecida por seu caráter paradigmático e, portanto, com leis bem definidas, está sujeita aos elementos culturais da escola. Dessa forma, pretendeu-se investigar a existência (ou não) de um conhecimento físico \"naturalizado\" e universal, para além das características de diferentes culturas nacionais. Dentro de um quadro teórico que reconhece a articulação entre os vários aspectos da complexa realidade escolar, as referências de investigação contemplaram, também, âmbitos mais gerais nos quais a disciplina escolar está inserida. Esses âmbitos foram representados pelas políticas educacionais, pelos currículos, pelas propostas pedagógicas da escola, pelo perfil da comunidade escolar e pelos materiais didáticos. Para isso, optou-se por um estudo de caso de uma escola bicultural brasileira e espanhola, e elaboraram-se três procedimentos de investigação: o primeiro, documental, teve foco na análise dos objetivos da escola em conjunto com as legislações brasileira e espanhola. O segundo, com foco nas relações da cultura escolar, centrado nos protagonistas (alunos e professora), com vivência em contextos escolares de países diferentes. Por último, o terceiro, com foco na análise da abordagem do conhecimento escolar de Física, através de sua organização curricular e dos materiais didáticos utilizados, representados por livros brasileiros e espanhóis. Do conjunto dos resultados obtidos, foi possível verificar que a Física, como disciplina escolar, está sujeita aos elementos culturais da escola, permitindo-se identificar aspectos que contribuem para sua \"desnaturalização\". Mais do que isso, foi possível reconhecer na escola estudada o surgimento de uma cultura híbrida, através de um processo não livre de tensões e movido, aparentemente, por objetivos educacionais distintos. De acordo com o estudo realizado, o produto híbrido desse processo parece ser constituído por uma cultura escolar que integra elementos complementares, sem predomínio de um ou de outro contexto cultural, e com potencial, aparentemente, para promover uma formação mais rica, devido a maior diversificação. / The goal of this research is to investigate possible national cultural elements in the introduction of Physics knowledge in high schools. This means to inquire in which extent a paradigmal science as this one, with universal laws, is presented through equivalent approaches in different cultural contexts. As school subjects are integrated in complex structures, we take into consideration theoretical references about curriculum policies, cultural schooling, and school textbooks discussions. With this purpose we developed a case study about a bicultural school, in São Paulo, attending Spanish and Brazilian students. This study was developed in three different instances: the first, with focus in documental elements extracted from school project and curriculum strategies; the second, with particular attention to student perceptions of their cultural experiences; and the third, based on the analysis of material, practices and physics textbooks used in classroom. Our results indicate that there are, in fact, significant cultural contributions in this subject, and this do not allow a \"naturalization\" of school physics content. Moreover, it was possible to identify this particular school as a hybrid cultural construction, not free of tensions and contradictions, but integrating different and complementary contributions, with potential to promote a richer scientific education.
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