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Análise de marcadores de células tronco e progenitores das células de polpa dentária e de vibrissas de camundongos C57BL6. / Analysis of stem cells and progenitor markers of dental pulp cells and vibrissae of C57BL6 mice.

Souza, Dener Madeiro de 14 September 2016 (has links)
Os tecidos da polpa dentária e vibrissa são dois microambientes celulares que compartilham a mesma origem embrionária. Ambos possuem o seu nicho especifico pós-natal que abrigam células tronco adultas (CTA). O objetivo do trabalho foi investigar a expressão diferencial dos marcadores de células pluripotentes, mesenquimais e neuroepiteliais nas populações de células tronco isoladas das vibrissas (CTV) e polpa de dente (CTPD) de camundongos C57BL-6. Resultados obtidos no presente trabalho, utilizando o método de imunofluorescência, revelaram que as CTA de ambos tecidos expressam um amplo painel de marcadores de pluripotência (Oct4, Nanog e Sox2), mesenquimais (CD73, CD90 e CD105), hematopoiético (CD34), crista neural (CKit), neuronal (Nestina) e epitelial (Integrina α6, LGR5 e LGR6) e indica possível potencial destas células em diversas linhagens celulares. Desta forma, células isoladas destes tecidos podem ser interessantes para serem aplicadas em diversos tratamentos na medicina regenerativa. Portanto, o estudo comparativo da expressão de um amplo painel de marcadores de células tronco em CTV e CTPD pode vir a aumentar o leque de possibilidades de sua utilização na terapia celular. Com isso, as células isoladas de polpa dentária foram submetidas à análise de expressão de marcadores já citados e a outros conhecidamente positivos e específicos para os folículos piloso como Citoqueratina 15 (CK15), LRig1 e Blimp1. Foram realizados ensaios de imunofluorescência, imunohistoquímica, citometria de fluxo e RT-PCR. Os dados obtidos nos permitiram concluir, que as CTA isoladas das ambas as fontes são bastante semelhantes em relação ao seu imunofenótipo, porém as características da sua diferenciação precisam ainda ser analisadas. / The tissues of the dental pulp and vibrissae are two cellular microenvironments that share the same embryonic origin. Both have their postnatal specific niche that keep adult stem cells (ASC). The objective of this study was to investigate the differential expression of pluripotent markers, mesenchymal and neuroepithelial in populations of stem cells isolated from whiskers (WSC) and dental pulp (DPSC) C57BL-6 mice. Results obtained in this study, using immunofluorescence, revealed that the ASC both tissues express a broad panel of pluripotency markers (Oct4, Nanog and Sox2), mesenchymal cells (CD73, CD90 and CD105), hematopoietic (CD34), crest neural (cKIT), neuronal (Nestin) and epithelial (Integrin α6, LGR5 and LGR6) and indicates possible potential of these cells in several cell lines. Thus, isolated cells of these tissues may be interesting for application in various treatments in regenerative medicine. Therefore, the comparative study of the expression of a broad panel of stem cell markers in WSC and DPSC could increase the range of possibilities for their use in cell therapy. Thus, the isolated cells were subjected to the dental pulp marker expression analysis cited above and others known to be positive and specific to hair follicles as Cytokeratin 15 (CK15), and LRig1 Blimp1. Immunofluorescence assays were performed, immunohistochemistry, flow cytometry and RT-PCR. The data allowed us to conclude that the ASC isolated from both sources are quite similar with respect to their immunophenotype, but the characteristics of differentiation remain to be analyzed.
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Estudo comparativo entre as técnicas de coloração de Sellers, imunoflorescência direta e inoculação em camundongos aplicadas ao diagnóstico laboratorial da raiva canina / Comparative study between the techniques of Coloration of Sellers, direct immunofluorescence and inoculation in mice applied to laboratory diagnosis of canine rabies

Germano, Pedro Manuel Leal 14 December 1976 (has links)
Procedeu-se ao estudo comparativo das técnicas - de Coloração de Sellers, Imunofluorescência Direta e Inoculação em Camundongos, utilizadas na rotina de diagnóstico laboratorial da raiva e praticadas sobre 2.242 amostras de cérebro de cães, enviadas ao Instituto Pasteur de São Paulo, durante o período de janeiro de 1974 a abril de 1976. As técnicas de Inoculação em Camundongos e de Imunofluorescência Direta foram as que apresentaram maior grau de Sensibilidade, sendo essa associação a que forneceu maior Concordância e valor significante mais alto para o x2 (Qui quadrado). A técnica de Coloração de Sellers foi a que apresentou menor grau de Sensibilidade e sua associação com as técnicas de Imunofluorescência Direta e de Inoculação em Camundongos forneceu resultados de Concordância e x2 (Qui quadrado) inferiores aos obtidos pela associação dessas duas técnicas. / A comparative study was made of three techniques: Coloration of Sellers, Direct Immunofluorescence, and Inoculation in Mice - used in the routine of laboratory diagnosis of rabies and applied on 2,242 samples of dog brains which were sent to the Pasteur Institute of Sã0 Paulo, between January 1974 and April 1976. The techniques of mice inoculation and of direct immunofluorescence were the ones which presented higher degree of sensitivity; this association resulted in a greater rapport and a higher significative value for the x2 (square Qui). The techniques of Sellers Coloration resulted in a lower degree of sensitivity, and its association with the techniques of direct immunofluorescence and inoculation in mice gave over results of rapport and x2 than those obtained by the association of the two latter techniques.
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Influência do enxerto de pele humana irradiada na regeneração tecidual de camundongos nude / Skin graft influence in human tissue radiated in Nude mice regeneration

Miranda, Jurandir Tomaz de 28 June 2016 (has links)
Nas últimas décadas tem aumentado o interesse pelos enxertos de pele humana radioesterilizadas, para aplicação principalmente em queimaduras extensas e profundas. Isto se deve ao fato destes enxertos apresentarem rápida aderência e menor potencial antigênico, em comparação com os demais tratamentos utilizados. A proposta deste estudo foi avaliar a histoarquitetura do enxerto de pele humana irradiada com doses de 25 kGy, 50 kGy e não irradiada, durante o processo de reparação tecidual, em camundongos Nude submetidos a enxertia de pele na região dorsal. Três grupos de animais receberam enxertos de pele humana irradiada (25 kGy e 50 kGy) e não irradiada e foram eutanasiados no 3º, 7º e 21º dia após a realização da cirurgia. Após os procedimentos histológicos de rotina, as amostras de tecido foram coradas com hematoxilina e eosina (HE) para a quantificação de queratinócitos, fibroblastos, células de defesa e vasos sanguíneos e a reação de imunofluorescência (IF) foi realizada para a determinação da expressão de colágeno do tipo I humano e do colágeno dos tipos I e III de camundongo. A quantificação, tanto das células quanto dos tipos de colágeno foi realizada por análise de imagem, utilizando o programa Image-Pro PLus 6.0. Os resultados histológicos demostraram que a pele humana irradiação, quando enxertada, influencia o aumento do número de células no local de cicatrização ao longo do tempo, principalmente na dose de 25 kGy, além de proporcionar uma melhor dispersão destas células. No 21º dia, os três grupos de animais com enxertia de pele humana tiveram parte do enxerto incorporado no processo de cicatrização. O grupo não irradiado apresentou maior incorporação do enxerto (43%), porém menor produção de colágeno do tipo III de camundongo (22%). Já os grupos com enxertia de pele irradiada apresentaram menor incorporação do enxerto (6 e 15%), mas com maior produção de colágeno do tipo III de camundongo (35% e 28%, para 25 kGy e 50 kGy, respectivamente). Com este estudo pôde-se concluir que o grupo irradiado a 25 kGy, apresenta maior proliferação celular e formação de vasos,além de melhor remodelamento da região de cicatrização. / Over the last few years it has increased the interest in the human skin grafts radio sterilized for application mainly in extensive and deep burns. Because these grafts quickly grip and present antigenic lower potential, compared with other treatments used. The purpose of this study was to evaluate the histoarchitecture of human skin grafts irradiated with doses 25 kGy, 50 kGy and non-irradiated during the pepair tissue process in nude mice submitted by skin grafting in the dorsal region. Three groups of animals received irradiated human skin grafts (25 kGy and 50 kGy) and non-irradiated and were euthanized on the 3rd, 7th and 21th day after the surgery. Indeed, routine histologic procedures, tissue samples were stained with hematoxylin and eosin (HE) for quantification of keratinocytes, fibroblasts, immune cells and blood vessels and immunofluorescence (IF) was performed to determine the expression human collagen type I and collagen type I and III mouse. Therefore, quantification of both the cells and the collagen types was performed by image analysis using Image-Pro Plus 6.0 software. Histologic results demonstrated at a dose of 25 kGy that human skin irradiation when grafted influences the increase in the number of cells in wound site over time and it provides better dispersion of these cells. In addition, on the 21st day, three groups of animals with human skin graft were embedded part of the graft in the healing process. On the other hand, the group not irradiated showed greater incorporation of the graft (43 %), but less production of collagen type III mouse (22 %). Since the groups irradiated skin graft showed lower graft incorporation (6 and 15%), but with greater production of collagen type III mice (35 % and 28 % to 25 kGy and 50 kGy, respectively). In conclusion, this study presented that the group irradiated to 25 kGy and it has a higher cell proliferation and vessel formation, and better remodeling of the healing area.
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The CB1R system within the nucleus accumbens of vervet monkeys

Kucera, Ryan 04 1900 (has links)
No description available.
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O cotransportador Na+, K+, 2Cl- e a secreção de cloreto branquial em camarões Palaemonidae (Decapoda, Crustacea): padrões moleculares, fisiológicos e evolutivos / The Na+,K+,2Cl- cotransporter and the gill chloride secretion in Palaemonid shrimps (Decapoda, Crustacea): molecular, physiological and evolutionary patterns.

Maraschi, Anieli Cristina 22 May 2018 (has links)
Como resultado do seu passado evolutivo, a família dos camarões Palaemonidae reúne representantes de ambientes osmóticos dos mais variados. Sejam de ambientes marinhos, estuarinos ou dulcícolas, estáveis ou variáveis, as espécies destes camarões mantêm a concentração osmo-iônica da hemolinfa independente da concentração do meio. Essas espécies hiper-regulam a osmolalidade e íons da hemolinfa em meio diluído e água doce e hipo-regulam em meio concentrado ou água do mar. Um importante local de transporte iônico envolvido na regulação osmo-iônica é o epitélio brânquial, pois nas membranas de seus ionócitos constituintes encontra-se um conjunto de transportadores que efetuam o movimento transepitelial de íons. Dentre estes transportadores, o simportador Na+, K+, 2Cl- (NKCC) é considerado ter um papel na secreção de sal, objetivo primário dessa investigação. Espécies representativas de habitat marinho do gênero Palaemon foram coletadas em regiões de estuário e de poça de maré, e de habitat dulcícola do gênero Macrobrachium foram coletadas em rios que desembocam no mar e também em riachos continentais sem influência do aporte salobro. Avaliou-se os limites letais de salinidade superior (LSS50) das espécies marinhas P. northropi e P. pandaliformis e dulcícolas diádromas M. acanthurus, M. olfersi, M. amazonicum que dependem de água salobra para completo desenvolvimento larval, e hololimnéticas M. potiuna e M. brasiliense com ciclo reprodutivo completo em água doce. Objetivou-se aqui (i) caracterizar os mecanismos de hiperregulação (condição controle de 18 S P. northropi, 17 S P. pandaliformis, água doce <0,5 S nas espécies de Macrobrachium) e hiporegulação [a curto (24 h) e longo prazo (120 h) em salinidade correspondente a 80% da LSS50] da osmolalidade e [Cl-] da hemolinfa, da expressão gênica e proteica e a localização por imunofluorescência do NKCC nos ionócitos branquiais; (ii) da existência de um padrão filogenético nesses parâmetros; e (iii) testar as hipóteses de um efeito da salinidade na evolução da expressão gênica e proteica desse simportador. As espécies de Palaemon apresentaram os maiores limites de tolerância ao aumento da salinidade, assim como exibiram uma maior capacidade hiporegulatória a longo prazo (120 h) comparada aos representantes de Macrobrachium. Dentre as espécies de Macrobrachium, os limites de tolerância foram maiores nas espécies diádromas do que nas hololimnéticas. Os parâmetros LSS50, osmolalidade e [Cl-] da hemolinfa demonstraram-se estruturados na filogenia, sendo as semelhanças compartilhadas justificadas pela estreita proximidade entre as espécies. As análises filogenéticas revelaram que a capacidade hiper-regulatória da [Cl-] da hemolinfa foi correlacionada com a expressão gênica do simportador NKCC nas brânquias, enquanto que a síntese proteica do NKCC parece estar associada à hiper-regulação da osmolalidade da hemolinfa. A avaliação da localização do NKCC por imunofluorescência demonstrou que o simportador está distribuído em ambas as células que compõem o epitélio das brânquias, as células pilares e células do septo intralamelar. A localização na porção inferior das franjas e no corpo da célula pilar e por toda célula do septo não diferiu entre as espécies, e também não difereiu entre as condições controle e a curto e longo prazo em salinidade elevada. Esses resultados em conjunto sugerem a importância do NKCC também na captação de sal pelas brânquias. Houve um aumento da síntese proteica do NKCC nas brânquias dos representantes de Macrobrachium, exceto M. potiuna, quando em salinidade elevada. Observou-se que este aumento é explicado pela proximidade filogenética entre as espécies. Não houve mudança na transcrição de RNAm para o NKCC apesar do aumento na síntese proteica, o que sugere uma possível regulação pós-transcricional. A reconstrução da história evolutiva da osmorregulação, incorporando o conceito de filofisiologia, revelou a existência de mecanismos em nível molecular, celular e sistêmico que evoluíram acompanhando os eventos cladogenéticos dos Palaemonidae durante a irradiação e ocupação de diferentes nichos osmóticos. / Owing to their evolutionary history, the shrimp family Palaemonidae includes species from widely distinct osmotic environments. Whether from marine, estuarine, or fresh waters, inhabiting stable or variable osmotic niches, these shrimps maintain the osmotic-ionic concentration of their hemolymph independently of the concentration of the external medium. These species hyper-regulate hemolymph osmolality and ions in dilute medium and fresh water and hypo-regulate this fluid in concentrated medium or seawater. The gill epithelium constitutes an important interface of ion transport, and its constituent ionocytes express an ensemble of ion transporters that enable active transepithelial ion movements. The Na+, K+, 2Cl- cotransporter (NKCC) is thought to play a significant role in compensatory salt secretion. Species representative of the marine habitat (Palaemon) were collected from estuaries and tidal pools; diadromous species from the fresh water habitat (Macrobrachium) were collected near the mouths of rivers that flow into the sea, while hololimnetic species were collected in continental streams lacking the influence of brackish waters. The critical upper salinity limits (LSS50) of the marine species P. northropi and P. pandaliformis and the diadromous freshwater species M. acanthurus, M. olfersi, M. amazonicum that depend on brackish water for complete larval development, and the hololimnetic M. potiuna and M. brasiliense that complete their reproductive cycle entirely in fresh water were established. Our objectives were to characterize the mechanisms of hyper-regulation (control condition 18 S P. northropi, 17 S P. pandaliformis, fresh water <0.5 S for Macrobrachium) and hypo-regulation [short-term (24 h) and long-term 120 h) at salinities corresponding to 80% of LSS50] of hemolymph osmolality and [Cl-], gene and protein expression, and NKCC localization for immunofluorescence in the gill ionocytes; (ii) the existence of a phylogenetic pattern in these parameters; and (iii) to test hypotheses for a salinity effect on the evolution of the gene and protein expression of this symporter. The species of Palaemon had the highest tolerance limits to increased salinity, and also exhibited a greater hypo-regulatory capacity for long-term acclimation compared to the species of Macrobrachium. Among the Macrobrachium species, the LSS50 were higher in the diadromous species than in the hololimnetic species. The parameters LSS50 and osmolality and [Cl-] of the hemolymph were phylogenetically structured, similarities being shared by closely related species. The hyper-regulatory capacity of hemolymph [Cl-] correlated with NKCC gene expression in the gills, while NKCC protein synthesis appears to be associated with hyper-regulation of hemolymph osmolality. Immunofluorescence analysis showed that the NKCC was located in both cell types that constitute the gill epithelium, the pillar cells and the septal cells. The location of the NKCC in the lower flanges and perikarya of the pillar cells and throughout the septal cells, did not differ among species, and also did not differ among control conditions or short and long-term exposure at high salinity. These results together also suggest the importance of the NKCC in salt uptake by the gills. When in high salinity there was an increase in NKCC protein synthesis in the gills of the Macrobrachium species, except for M. potiuna. This increase can be explained by the phylogenetic proximity among those species, which excludes adaptive inferences. There was no change in NKCC mRNA transcription, which suggests possible post-transcriptional regulation. The reconstruction of the evolutionary history of osmoregulation, incorporating the concept of phylophysiology, revealed the existence of mechanisms at the molecular, cellular and systemic levels that have evolved accompanying the cladogenetic events of the Palaemonidae during their radiation and occupation of different osmotic niches.
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Desenvolvimento das glândulas salivares menores: relação morfológica paralela entre a expressão das isoformas de TGF- e marcadores citoesqueletais da maturação glandular / Developing human minor salivary glands: morphological parallel relation between the expression of TGF-beta isoforms and cytoskeletal markers of glandular maturation

Uyekita, Sabrina Hitomi 24 March 2010 (has links)
A morfogênese das glândulas salivares envolve eventos complexos e coordenados, dependentes da interação epitélio-mesênquima e do microambiente. Fatores de crescimento coordenam vários desses processos biológicos e o fator transformador de crescimento-beta (TGF-) mostra-se relevante. Utilizando imunoistoquímica e imunofluorescência, a distribuição do TGF-1, 2 e 3 foi mapeada e sua expressão comparada com a expressão de marcadores de maturação em glândulas salivares humanas obtidas de fetos que tinham entre 4ª e 24ª semanas de vida intra-uterina. O TGF-1 foi detectado durante a fase pseudoglandular no mesênquima. Nas outras etapas da diferenciação glandular esse fator foi expresso no citoplasma das células acinares até a glândula salivar adulta. O TGF-2 foi detectado desde o estágio de botão inicial da glândula salivar. Sua expressão foi observada nas células ductais e sua presença aumentada ao longo da diferenciação glandular. O TGF-3 foi visto durante a fase pseudoglandular das glândulas salivares, inicialmente fraco nas células ductais e foi o único detectado em células mioepiteliais. A troca de subunidades de TGF- durante a maturação das glândulas salivares sugere mudanças estimuladas durante os complexos estágios de desenvolvimento dessas glândulas. O presente estudo reafirma essa evidência, e mostra que as subunidades do TGF- são fatores importantes durante a diferenciação de glândulas salivares. / Morphogenesis of salivary glands involves complex coordinated events. Synchronization between cell proliferation, polarization and differentiation, which are dependent on epithelialmesenchymal interactions and on the microenvironment, is a requirement. Growth factors mediate many of these orchestrated biological processes and transforming growth factor-beta (TGF- ) appears to be relevant. Using immunohistochemistry and immunofluorescence, we have mapped the distribution of TGF- 1, 2 and 3 and compared it with the expression of maturation markers in human salivary glands obtained from fetuses ranging from weeks 4 to 24 of gestation. TGF- 1 first appeared during pseudoglandular stage in the surrounding mesenchyme and, in the more differentiated stages, was expressed in the cytoplasm of acinar cells throughout the adult gland. The TGF- 2 was detected since the bud initial stage of the salivary gland. Its expression was observed in ductal cells and increased along gland differentiation. The TGF- 3 was detected from the pseudoglandular stage of the salivary gland, being weakly expressed on ductal cells, and it was the only factor detected on myoepithelial cells. The data suggest that TGF- have a role to play in salivary gland development and differentiation.
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Estudo comparativo entre as técnicas de coloração de Sellers, imunoflorescência direta e inoculação em camundongos aplicadas ao diagnóstico laboratorial da raiva canina / Comparative study between the techniques of Coloration of Sellers, direct immunofluorescence and inoculation in mice applied to laboratory diagnosis of canine rabies

Pedro Manuel Leal Germano 14 December 1976 (has links)
Procedeu-se ao estudo comparativo das técnicas - de Coloração de Sellers, Imunofluorescência Direta e Inoculação em Camundongos, utilizadas na rotina de diagnóstico laboratorial da raiva e praticadas sobre 2.242 amostras de cérebro de cães, enviadas ao Instituto Pasteur de São Paulo, durante o período de janeiro de 1974 a abril de 1976. As técnicas de Inoculação em Camundongos e de Imunofluorescência Direta foram as que apresentaram maior grau de Sensibilidade, sendo essa associação a que forneceu maior Concordância e valor significante mais alto para o x2 (Qui quadrado). A técnica de Coloração de Sellers foi a que apresentou menor grau de Sensibilidade e sua associação com as técnicas de Imunofluorescência Direta e de Inoculação em Camundongos forneceu resultados de Concordância e x2 (Qui quadrado) inferiores aos obtidos pela associação dessas duas técnicas. / A comparative study was made of three techniques: Coloration of Sellers, Direct Immunofluorescence, and Inoculation in Mice - used in the routine of laboratory diagnosis of rabies and applied on 2,242 samples of dog brains which were sent to the Pasteur Institute of Sã0 Paulo, between January 1974 and April 1976. The techniques of mice inoculation and of direct immunofluorescence were the ones which presented higher degree of sensitivity; this association resulted in a greater rapport and a higher significative value for the x2 (square Qui). The techniques of Sellers Coloration resulted in a lower degree of sensitivity, and its association with the techniques of direct immunofluorescence and inoculation in mice gave over results of rapport and x2 than those obtained by the association of the two latter techniques.
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Estudo do potencial vascular de precursores de vasos coronários em sítio adulto. / Study of the vascular potential of coronary vessel precursors in adult site.

Oliveira, Bruno de 13 April 2011 (has links)
O Proepicárdio (PE) é uma estrutura transitória que dá origem aos componentes dos vasos coronários. Para avaliar seu potencial vascular em sítio adulto, transplantamos um coração neonatal para o pavilhão auricular de um animal adulto. Duas semanas depois, 2 PEs de embriões GFP+ foram transferidos para a superfície deste coração. Em outro grupo, transferimos os PEs diretamente para o pavilhão auricular. Para avaliar a incorporação de células GFP, e investigar sua diferenciação realizamos ensaios de imunofluorescência (IF) para GFP em combinação com outros marcadores. A adição do PE em sítio adulto teve como resultado a participação deste em processos de vasculogênese, iniciando a formação de novos vasos sanguíneos via formação de ilhotas sanguíneas e em um processo angiogênico, diferenciando-se em células endoteliais que se incorporaram aos vasos já existentes. Baseados nisso podemos afirmar que o PE possui potencial vasculogênico/angiogênico em sítio adulto, podendo ser exploradas como modelo para revascularização cardíaca e recuperação de tecidos vasculares. / The Proepicárdio (PE) is a transient structure giving rise to all components of the coronary vessels. To evaluate the vasculogenic potential of the PE in an adult site, a neonatal heart was transplanted into the subcutaneous of an adult ear Later, two PE from GFP-transgenic mice were transferred to the surface of this heart. In another group, we transferred the PEs directly into the ear pinna. To evaluate the incorporation of GFP cells derived from the PE, and to investigate their possible differentiation, we performed immunofluorescence (IF) for GFP in combination with other markers. The addition of PE in an adult site resulted in its participation in a vasculogenic and in an angiogenic processes. Based on this we conclude that PE cells can differentiate and likely participate in a neovascularization process when transplanted to adult sites. These findings demonstrate that the vasculogenic potential of the PE cells is conserved in an adult site and our model is adequate to study the mechanisms involved in the development and regeneration of vasculature.
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Towards subcellular localization of the human proteome using bioimaging

Stadler, Charlotte January 2012 (has links)
Since the publication of the complete sequence of the human genome in 2003 there has been great interest in exploring the functions of the proteins encoded by the genes. To reveal the function of each and every protein, investigation of protein localization at the subcellular level has become a central focus in this research area, since the localization and function of a protein is closely related. The objective of the studies presented in this doctoral thesis was to systematically explore the human proteome at the subcellular level using bioimaging and to develop techniques for validation of the results obtained. A common imaging technique for protein detection is immunofluorescence (IF), where antibodies are used to target proteins in fixated cells. A fixation protocol suitable for large-scale IF studies was developed and optimized to work for a broad set of proteins. As the technique relies on antibodies, validation of their specificity to the target protein is crucial. A platform based on siRNA gene silencing in combination with IF was set-up to evaluate antibody specificity by quantitative image analysis before and after suppression of its target protein. As a proof of concept, the platform was then used for validation of 75 antibodies, proving it to be applicable for validation of antibodies in a systematic manner. Because of the fixation, there is a common concern about how well IF data reflects the in vivo subcellular distribution of proteins. To address this, 500 proteins were tagged with green fluorescent protein (GFP) and used to compare protein localization results between IF to those achieved using GFP tagged proteins in live cells. It was concluded that protein localization data from fixated cells satisfactory represented the situation in vivo and together exhibit a powerful approach for confirming localizations of yet uncharacterized proteins. Finally, a global analysis based on IF data of approximately 20 % of the human proteome was performed, providing a first overview of the subcellular landscape in three different cell lines. It was found that the intracellular distribution of proteins is complex, with many proteins occurring in several organelles. The results also confirmed the close relationship between protein function and localization, which in a way further strengthens the accuracy of the IF approach for detection of proteins at the subcellular level. / <p>QC 20121017</p> / The Human Protein Atlas
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Morphological and physiological studies of the carbon concentrating mechanism in Chlamydomonas reinhardtii

Chan, Kher Xing January 2019 (has links)
Chlamydomonas reinhardtii possesses a single-cell-based CO2-concentrating mechanism (CCM). The CCM is an important element of algal photosynthesis, metabolism, growth and biomass production, which works by increasing the concentration of inorganic carbon (Ci) in the pyrenoid, a dense RuBisCO-packed structure within the chloroplast. This suppresses RuBisCO oxygenase activity and associated photorespiration. The enhanced efficiency of CO2 assimilation in the pyrenoid via CCM had been modelled theoretically as a requirement for successful CCM in higher plant systems. The ultimate aim of my research is to understand the biogenesis of the pyrenoid using a set of CCM mutants with pyrenoidal defects. Immunofluorescence methods and spot growth tests under different CO2 concentrations were performed on mutants with CCM defects generated by an insertional mutagenesis screen. Morphological and physiological characterisation of these mutants revealed differences in the pyrenoid morphology, the ability for RuBisCO to aggregate into the pyrenoid and the formation of thylakoidal tubule network associated with the pyrenoid. The thylakoid tubule network may be linked to the transport of inorganic carbon into the pyrenoid as part of the CCM. Further characterisation of one of the mutants gave rise to the hypothesis that the gene of interest, Cre11.g467712 (SAGA), is a multi-functional anchor protein related to the structural formation of the pyrenoid and may be another essential component of the pyrenoid.

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