The fungi are being opportunistic, with wide distribution in nature, including the hospital environment, where it is frequent the presence of microorganisms that cause hospital infection, especially in immunocompromised patients. To identify and quantify the fungal microbiota in air, the filters of air-conditioners and samples of newborns from the neonatal ICU at University Hospital / HUPA, Maceió, Alagoas. Were held 20 exhibitions of collections totaling 400 disposable Petri dishes containing Sabouraud agar medium plus antibiotic. The plates were placed randomly inside and open the two neonatal ICUs (A and B) for 20 minutes. Also, there were 20 samples of the filters of air-conditioners of neonatal ICUs and conducted the direct examination and culture of clinical samples from newborns. CFU were isolated in 1209, these 675 (55.8%) were isolated CFU before cleaning to be done in the neonatal ICU and 534 (44.2%) CFU obtained after cleaning. Of 697 CFU of the environment of the NICU, 372 were isolated before and 325 after cleaning. Environment B, were obtained of 512 CFU and 303 CFU were obtained before cleaning and 209 after UFC. During the study species of Cladosporium was the most representative in the air and in the filters of air-conditioners. The clinical sample was more representative urine with 79.5%. Among the identified yeast Candida parapsilosis was present in 38.9% of environmental isolates of yeast and Candida albicans was isolated in 20% of clinical samples of newborns. The presence of pathogenic fungi in the two environments of the neonatal ICU and clinical samples of infants, demonstrating the need for constant monitoring to take control of microorganisms in hospital environments, especially in intensive care units where there is the presence of immunocompromised patients prone to develop fungal infections. / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Os fungos que são dispersos pelo ar atmosférico são denominados de fungos anemófilos e são importantes por causar patologias em pacientes imunocomprometidos. Com o objetivo de monitorar a microbiota fúngica do ar, dos filtros dos condicionadores de ar e das amostras clínicas dos recémnascidos internados na UTI neonatal do Hospital Universitário de Maceió - AL foram realizadas coletas de amostras do ar através da técnica de exposição de placas de Petri contendo o meio ágar Sabouraud acrescido de antibiótico. O material sólido dos filtros dos condicionadores de ar foi coletado utilizando um swab esterilizado. E das amostras clínicas dos recém-nascidos foram realizados o exame direto e cultura. Para identificação dos fungos filamentos foram comparadas as características macro e microscópicas e as leveduras foram identificados através da técnica de PCR. Entre as 400 exposições de placas realizadas foram isoladas 1029 UFC, sendo 675 (55,8%) UFC obtidas antes e 534 (44,2%) após a limpeza. Das 40 amostras analisadas dos filtros dos condicionadores de ar foram obtidas 303 UFC, sendo o fungo Cladosporium cladosporioides com maior frequência tanto no ar com 186 (15,4%) UFC como nos filtros dos condicionadores de ar com 77 (37,7%). Não foram isolados fungos filamentosos das amostras clínicas dos recém-nascidos. Entretanto as leveduras Candida albicans, C. tropicalis e C. parapsilosis foram obtidas tanto das amostras do ar como dos recém-nascidos com exceção de C. guilliermondii que foi isolada apenas das amostras do ar.

Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-06-13T19:52:28Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 900033 bytes, checksum: 926dd6909a489ebf5e20a47f5be2e8be (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-13T19:52:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 900033 bytes, checksum: 926dd6909a489ebf5e20a47f5be2e8be (MD5) Previous issue date: 2004-02-11 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O presente trabalho teve como objetivo estudar o efeito da admi- nistração de frutooligossacarídeos (FOS) e inulina adicionados a dietas enterais na translocação de Klebsiella em camundongos. Foram utilizados camundongos albinos suíços, com 5 a 6 semanas de vida, divididos em nove tratamentos, contendo diferentes combinações entre FOS, inulina, antibiótico e corticóide, e ausência ou presença de Klebsiella. Nos períodos equivalentes a 1, 2, 4, 6 e 8 dias após a administração da dieta contaminada com Klebsiella via oral, os animais foram sacrificados e seus órgãos: baço, coração, fígado, pulmão e rins, foram coletados, pesados e armazenados em sacos plásticos estéreis, a 4 o C por 24 horas para análise da presença de colônias típicas de Kebsiella. Fragmentos desses órgãos foram mantidos em solução fixadora para estudos histológicos. Com o objetivo de identificar a translocação do intestino para os órgãos analisados, foi feita comparação, com base em marcadores moleculares RAPD, entre a estirpe de Klebsiella inoculada na dieta e aquelas isoladas dos órgãos. Os resultados indicaram que os animais dos tratamentos III, V, VII e VIII, que receberam droga imunodepressora associada ou não com a dieta contaminada apresentaram estabilização ou perda de peso; enquanto aqueles que receberam a dieta com ou sem prebióticos, sem medicação imunodepressora ou presença de Klebsiella na mesma, apresentaram ganho de peso, assim como o grupo controle, alimentado com dieta AIN-93G. A adição de FOS e inulina na dieta, na concentração de 15,3 mg 100 g -1 por dia) resultou em translocação por um período menor de tempo quando comparado aos animais que não receberam prebióticos na dieta. No entanto, essa dose de prebióticos não resultou em aumento do peso do ceco desses animais. Análise do perfil genético das colônias isoladas dos órgãos, demonstraram translo- cação da Klebsiella endógena do animal. Análises histológicas demonstraram características mais intensas de inflamação nos animais imunodeprimidos que receberam a dieta contaminada sem prebióticos, onde foi detectada maior contagem de UFC g -1 típicas de Klebsiella em relação aos animais imunode- primidos que receberam dieta enteral contaminada com prebióticos. / This work aimed to study the effect of the fructooligossaccharide addition (FOS) and inulin in enteral diets in the Klebsiella translocation in mice. Alb swiss mice was used, with 4 to 6 weeks, divided in nine treatments contening different combinations among FOS, inulin, antibiotic and corticoid, and contaminant lack or presence. In the period equivalent to 1, 2, 4, 6, and 8 days after the oral administration of Klebsiella, the animals were sacrificed and its organs: spleen, heart, liver, lung and kidneys were collected, heavy and stored in sterile plastic bags at 4 o C during 24 hours for presence of typical colonies of Klebsiella analysis. Small fragments of those organs were maintained in fixed solution for histologic studies. Aiming to identify which the isolated ones that translocated from the intestine to the analyzed organs, it was made comparison, based in molecular markers RAPD, between the inoculated Klebsiella strain and those ones isolated. The results indicated that the animals that received immunosuppressive chemotherapeutic agent, associated or not with contaminated diet (treatments II, V, VII and VIII), presented stabilization or weight loss. Those animals that received the diet with or without prebiotics, ixwithout immunosuppressive agent or contaminat presence, presented weight gain, as well as the control group, food with AIN-93G diet. The FOS and inulina addition in the diet (15,3 mg 100 g -1 a day) resulted in translocation for a smaller period of time when compared to the animals that didn't receive prebiotics in the diet. However, that prebiotics dose didn't result in increase of the weight of the animals caecum. Analysis of the isolated colonies genetic profile of the tissues suggests Klebsiella endogenous translocation in the animal. Histologic analyses demonstrated more intense characteristic of inflammation in the immunodepressed animals that received the diet without prebiotics and contamined, in relation to the immunodepressed animals that received contaminated diet and with prebiotics.

Dissertação (mestrado) - Pontifícia Universidade Católica do Paraná, Curitiba, 2005 / Bibliografia: f. 88-96 / A infecção hospitalar tem sido muito discutida e estudada na prática médica. Enquanto a sua história acompanha a história dos hospitais, sua repercussão na sociedade se apresenta social e economicamente com tamanha gravidade que somente nos Estados Unidos

Made available in DSpace on 2015-07-22T20:50:00Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-09-28 / Introdução: Estudos recentes têm enfatizado a tolerância zero à infecção hospitalar (IH), não sendo mais aceita como consequência da internação em Unidade de Terapia Intensiva Neonatal (UTIN). Objetivo: Avaliar a efetividade da implantação das medidas de controle e prevenção sobre a densidade de incidência das IH em unidade neonatal. Método: Estudo de coorte prospectiva com intervenção, que incluiu recém-nascidos portadores de um ou mais critérios NNISS, realizado em uma unidade neonatal pública de referência na região Amazônica. A avaliação foi executada em dois períodos: pré-intervenção (1º/01-30/06/2005) com 1173 pacientes e pós-intervenção (1º/01-30/06/2006) com 855 pacientes. A intervenção compreendeu a implantação de: treinamento da equipe assistencial sobre a técnica para higienização das mãos (jul/2005); Clorhexidine 2% para assepsia da pele no curativo cirúrgico e punção vascular e álcool gel 70% para higienização das mãos (set/2005); racionalização de antimicrobianos, escore hematológico e proteína C reativa seriados para suspensão da antibioticoterapia (set/2005) e isolamento de contato para IH por germes resistentes (nov/2005). Durante o estudo, o cateter central de inserção percutânea não foi utilizado. IH foi considerada conforme os critérios de Garner et al (1988). Mensalmente foi calculada a densidade de incidência das IH e a taxa de utilização de cateter central e de ventilação pulmonar mecânica, nas fases pré e pósintervenção. As características clínicas entre os dois grupos foram comparadas com test t e quiquadrado e as densidades de incidência de IH e as taxas de utilização de cateteres e de ventiladores, segundo a distribuição de Poisson. Resultado: As características demográficas foram semelhantes nos dois períodos (média de peso ao nascer 2250g e de idade gestacional 34 semanas, PN<1500g - 18%, sexo masculino - 53% e cirurgia de médio/grande porte - 4%). O período pré- vs pós-intervenção evidenciou: pacientes com IH - 22% vs 13% (p<0,001) e RN PN <1500g com IH - 61% vs 27% (p<0,001). O número de pacientes-dia foi respectivamente de 16.606 e 15.060 nas fases pré e pós-intervenção. A comparação das duas fases evidenciou que a densidade de incidência das IH reduziu de 20,6 para 10,0 por mil pacientes-dia e a densidade de incidência da infecção da corrente sanguínea associada a cateter foi de 30,5 para 10,0 por mil cateteres-dia, enquanto a densidade de uso de cateter central passou de 50,1 para 63,6. A pneumonia associada à ventilação mecânica foi reduzida de 22,9 para 6,5 por mil ventiladoresdia, sendo que a densidade de uso da ventilação permaneceu entre 11,6 e 15,5 nos dois períodos. A evolução para óbito relacionado à IH ocorreu em 63% dos pacientes antes da intervenção e caiu para 13% após a intervenção (p<0,001). Conclusão: Esforços associados a medidas de prevenção e controle de infecção resultaram na queda significativa das densidades de incidência de infecção hospitalar em UTI neonatal da Amazônia. / Introduction: Recent researches have emphasized zero tolerance against nosocomial infection (NI), no longer accepted as a consequence of admission to the Neonatal Intensive Care Unit (NICU). Objective: To evaluate the effectiveness of the implementation of control and prevention measures on the incidence density of NI in the neonatal ICU. Method: Prospective cohort study with intervention, which included infants with one or more NNISS’s criteria, performed in a reference public neonatal ICU in the Amazon region. The evaluation was made in two periods: pre-intervention (Jan/01/05 - Jun/30/05) with 1173 patients and postintervention (Jan/01/06 - Jun/30/06) with 855 patients. The intervention included the implementation of team training on the technique for hand hygiene (Jul/05), 2% chlorhexidine for skin antisepsis in surgical dressing and vascular puncture and 70% alcohol gel for hand hygiene (Sep/05), rationalization of antimicrobial, hematological score and C-reactive protein serials for suspension of antibiotic therapy (Sep/05) and contact isolation to NI caused by resistant germs (Nov/05). During the study, the percutaneous inserted central catheter was not used. NI was considered according criteria of Garner et al (1988). Monthly incidence densities of NI and the density of central catheter and mechanical ventilation were calculated in pre-and post-intervention period. Clinical characteristics between the two groups were compared with test t and chi-square and the incidence densities of NI and the densities of catheters and ventilators, according to the Poisson distribution. Results: Demographic characteristics were similar in both periods (average birthweight 2250g and 34 weeks gestational age, BW <1500 g - 18%, male - 53% and major surgery - 4%). The period pre-intervention versus post-intervention showed patients with NI - 22% vs 13% (p <0.001) and VLBW infants with NI - 61% vs 27% (p <0.001). The number of patient-days was 16,606 and 15,060 respectively in pre and postintervention. The comparison among the two period showed that the incidence density of NI reduced from 20.6 to 10.0 per 1000 patient-days and the density of bloodstream infection associated with catheter use was 30.5 to 10.0 per 1000 catheter-days, while the density of central catheter use increased from 50.1 to 63.6. The pneumonia associated to mechanical ventilation was reduced from 22.9 to 6.5 per 1000 ventilator-days, and the density of use of ventilation remained between 11.6 and 15.5 in the two periods. Death related to NI occurred in 63% of patients before intervention and decrease to 13% after the intervention (p <0.001). Conclusion: Efforts associated with measures of prevention and infection control have resulted in significant decrease of incidences of nosocomial infection in neonatal intensive care unit of the Amazon. / TEDE / BV UNIFESP: Teses e dissertações

Dissertação (mestrado profissional) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências da Saúde, Programa de Pós-Graduação Multidisciplinar em Saúde, Florianópolis, 2014. / Made available in DSpace on 2015-02-05T20:44:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 328279.pdf: 1423537 bytes, checksum: 1de1db579c126e433556cb52ecc52e1c (MD5) Previous issue date: 2014 / As neoplasias malignas do sistema hematopoiético atingem células primordiais para o funcionamento do sistema imune e para a manutenção de todos tecidos. Frequentemente o paciente onco-hematológico passa por períodos neutropênicos, que podem ser devidos à própria doença, ou como consequência dos efeitos adversos da terapia antineoplásica. Os antineoplásicos são na maioria citotóxicos e causam diversos danos à integridade das mucosas do paciente, facilitando a entrada de microrganismos infecciosos. Por isso, o paciente apresenta risco acentuado em contrair infecções e maior dificuldade em combatê-las. Sendo assim, o objetivo deste trabalho foi identificar as características das infecções que acometem os indivíduos portadores de doenças onco-hematológicas assistidos pelo Serviço de Hematologia do HU/UFSC. Dos 41 pacientes internados analisados, 97% apresentaram infecções ao longo de alguma das internações, visto que foram internados uma ou mais vezes, totalizando 100 internações. Em 40% das internações analisadas foram observados processos infecciosos. Ao total foram registradas 54 infecções. As infecções hospitalares (IH) representaram 67% do total de infecções, sinalizando a necessidade de um controle de infecções mais efetivo. As bactérias Gram negativas foram responsáveis por 64,5% das IH comprovadas laboratorialmente, as quais são espécies com características resistentes e de difícil tratamento. As bactérias Gram positivas foram responsáveis principalmente por colonização em cateteres centrais. As cepas detectadas causadoras de infecções nos pacientes do estudo apresentaram ampla resistência bacteriana, o que exigiu medicamentos mais potentes. Os fungos confirmados laboratorialmente como causadores de IH são da espécie Candida spp do tipo não albicans, cujas opções de tratamento medicamentoso são restritas. Os casos suspeitos de infecções fúngicas pulmonares, apesar do tratamento realizado, culminaram em 75% de óbitos. Visto a alta mortalidade obtida, é de suma importância prevenir não só as infecções bacterianas como também as fúngicas. Foram analisados fatores que incrementam o risco do paciente em desenvolver infecções, onde a neutropenia é a condição clínica mais crítica (P<0,001*; Razão de chance: 22,5; Intervalo de confiança: 95%, 7,0 - 77,6). Outras características como tempo de internação superior a 10 dias (P<0,001*; Razão de chance: 7,9; Intervalo de confiança: 95%; 3,2 - 19,6) e a colonização do paciente com microrganismos resistentes (P = 0,002*; Razão de chance: 4,0; Intervalo de confiança: 95% 1,6 - 9,7) também somam riscos para odesenvolvimento de infecções. Não houve associação entre o tipo de doença onco-hematológica (linfoma ou leucemia) e o desenvolvimento de infecções (P = 0,52). O perfil de sensibilidade microbiana e a alta porcentagem de pacientes colonizados demandaram o uso de medicamentos mais potentes, os quais estão sendo amplamente utilizados pelos pacientes. Este fato favorece o aparecimento de mais cepas resistentes e acarreta um custo alto para o HU/UFSC. Os custos dos antimicrobianos aumentam principalmente quando uma infecção é detectada, seja esta hospitalar (R$ 5.010,73/internação) ou não (R$ 3.364,56/internação). Portanto, o atendimento hospitalar deve priorizar a prevenção do desenvolvimento de infecções no paciente neutropênico, com um tratamento diferenciado do mesmo, no sentido de diminuir custos com os antimicrobianos, evitar prejuízos na realização do protocolo antineoplásico e zelar pela vida do paciente.<br> / Abstract : Malignant neoplasias of the hematopoietic system involve primordial cells of the immune system functioning and maintenance of tissues. Onco-hematological patients undergoing through neutropenic periods very frequently. It may be due to the disease itself or as a result of the adverse effects of chemotherapy. Antineoplastic drugs are generally cytotoxic and cause serious damage to the integrity of the patient's mucous, which facilitates the entrance of infectious microorganisms. Thus, the patient has an increased risk for infections and difficulty of fighting against them. Therefore, the aim of this work was to identify characteristics of the infections that affect patients with hematologic malignancies, assisted by the Hematology Service of the Federal University of Santa Catarina's Hospital (HU/UFSC). From 41 hospitalized analyzed patients, 97% were affected by infections along some admission, since they could be hospitalized more than one time. This work totalized 100 admissions. From these analyzed hospitalizations, 40% infectious processes were observed. In total, 54 infections were recorded. Nosocomial infections (IH) accounted for 67% of all infections, indicating the necessity of more effective control of infections. Gram negative bacteria were observed in 64.5 % of IH in laboratorial exams, which are species that present resistance and hard to treat characteristics. Gram positive bacteria are mainly responsible for core colonization of catheters. Strains of gram-positive bacteria causing infections in study patients were detected and showed extensive bacterial resistance, which required more potent drugs. Some fungi were confirmed by laboratory exams as cause of nosocomial infection. The species that were detected are represented by species of non-albicans Candida spp. which drug options are restricted. Suspected cases of pulmonary fungal infections despite treatment carried out, resulted in 75% of deaths. Analyzing the high mortality obtained it is of great importance to prevent bacterial infections as well as yeast. Factors that increase a patient's risk for developing infections were analyzed: Neutropenia is most critical clinical condition (P < 0.001; Odds ratio (OR) 22.5, 95% IC , 7.0 to 77.6). Other characteristics such as length of stay greater than 10 days (P < 0.001 * , OR 7.9, 95% IC 3.2 to 19.6 ) and the colonization of patients with resistant microorganisms were also added risk for developing infections (P = 0.002 * ; OR 4.0, 95% IC 1.6 to 9.7). There was no association between the type of onco-hematological disease (lymphoma or leukemia) and the development of infections (P = 0.52). The profile of microbial sensitivity and highpercentage of patients colonized demanded the use of more potent agents, which are being widely used. This fact favors the occurrence of more resistant strains and carries higher costs to HU/UFSC. The costs of antimicrobials increases significantly when an infection is detected, whether the infection is of hospital cause (R$ 5010.73/patient) or not (R$ 3364.56/patient). Therefore, hospital care should focus in prevention infections in neutropenic patients with differential treatment of these patients, in order to reduce costs with antimicrobials, to avoid losses in the preparation of antineoplastic protocol and to watch over the patient's life.

Submitted by Anderson Silva (avargas@icict.fiocruz.br) on 2012-05-23T19:07:54Z No. of bitstreams: 1 ana_carolina_ga_teixeira_ioc_bp_0014_2010.pdf: 1653062 bytes, checksum: c8bcad08106fd76eb4c45a58831e4f12 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-05-23T19:07:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ana_carolina_ga_teixeira_ioc_bp_0014_2010.pdf: 1653062 bytes, checksum: c8bcad08106fd76eb4c45a58831e4f12 (MD5) Previous issue date: 2010 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) FIOCRUZ / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / Os Rotavirus A (RV-A) são os principais causadores de gastroenterites em crianças menores de cinco anos de idade. Estes vírus estão diretamente associados à diarréia e vômito e são transmitidos pela propagação de pessoa a pessoa por via fecal-oral; entretanto, a transmissão ambiental de RV-A pelo contato com superfícies contaminadas tem sido descrita em hospitais. O objetivo deste estudo foi estabelecer um protocolo para detecção de RV-A em superfícies e fômites, a fim de avaliar o RV-A como marcador biológico de contaminação de superfícies hospitalares. Um estudo piloto foi realizado para avaliação e determinação da metodologia de recuperação viral a ser utilizada em estudo no Centro de Tratamento Intensivo de um hospital da rede particular situado na cidade do Rio de Janeiro, Brasil. Neste local, no período de janeiro a junho de 2009, foram realizadas coletas mensais de 12 superfícies e fômites de 7 leitos do CTI, totalizando 504 amostras provenientes de: suporte para álcool gel, botão de descarga, cadeira do acompanhante, suporte de clorexidina, tampa da lixeira de resíduos comuns, maçaneta interna da porta do leito, controle da cama, maçaneta externa do banheiro, teclado da bomba de infusão, controle remoto, mesa de apoio e telefone. As amostras foram obtidas por fricção de ―swabs” embebidos em meio de cultura (DMEM) e a extração do ácido nucléico viral realizada pelo método de isotiocianato de guanidina/sílica, seguida da síntese do cDNA utilizando iniciador randômico (pdN6). Protocolos de reação em cadeia da polimerase (PCR) qualitativa e quantitativa foram utilizados para detecção e quantificação do RV-A pela amplificação parcial dos genes que codificam para a proteína estrutural VP6 e a não estrutural NSP3, respectivamente. Das 504 amostras analisadas, 25 (5%) foram positivas para RV-A pela RT-PCR, ao passo que pela Nested-PCR este número aumentou para 73 (14,5%). Destas 45 (61,6%) foram quantificadas pela qPCR com carga viral variando de 3,4 x 100cg/mL a 2,9 x 103cg/mL. O sequenciamento nucleotidico dos produtos obtidos pela nested-RT-PCR confirmaram a contaminação por RV-A. A detecção de RV-A em superfícies hospitalares aponta para a necessidade de um maior controle de higienização que reduza a contaminação por vírus, e sugere a utilização do RV-A como marcador biológico de contaminação de superfícies hospitalares. / Rotavirus A (RV-A) is the main cause of acute gastroenteritis in children under five years of age. This virus is directly associated with diarrhea and vomiting and is transmitted by spread from person to person by the fecal-oral route, however, environmental transmission of RV-A by contact with contaminated surfaces has been described in hospitals. The aim of this study was to establish a protocol for detection of RV-A on surfaces and fomites in order to assess RV-A as a contamination biomarker of hospital surfaces. A pilot study was performed for evaluation and determination of viral recovery methods to be used in a study in the intensive care unit (ICU) of a private hospital located in the city of Rio de Janeiro, Brazil. From January to June/2009, samples were collected monthly from 12 surfaces and fomites of 7-bed of the ICU. There was a total of 504 samples collected from the following sites: alcohol gel and chlorhexidine dispensers, toilet flush button, chair from the accompanying person, ordinary waste bin lid, door handle from outside the bathroom door and the patient’s room, bed control, infusion pump keyboard, TV remote control, desk and telephone. Samples were obtained by rubbing swabs embedded in culture medium (DMEM). Viral nucleic acid extraction was performed by the method of guanidine isothiocyanate / silica, followed by cDNA synthesis using random primer (pdN6). Qualitative and quantitative polymerase chain reaction (PCR) were used for detection and quantification of RV-A by partial amplification of genes coding for the structural protein VP6 and nonstructural protein NSP3, respectively. Of the 504 analyzed samples, 25 (5%) were positive for RV-A by RT-PCR; when nested-PCR was used, the number increased to 73 (14.5%). Of these, 45 (61.6%) were quantified by quantitative PCR with viral load ranging from 3.4 x 100cg/mL to 2.9 x 103cg/mL. Nucleotide sequences of the products obtained by nested-RT-PCR confirmed RV-A contamination. Detection of RV-A in hospital surfaces indicates the need of greater control on cleaning procedures to reduce contamination by viruses and suggests using RV-A as a possible biomarker for contamination of hospital surfaces.

Made available in DSpace on 2012-09-06T01:12:28Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) 892.pdf: 340328 bytes, checksum: 9c6f50b477548805a2017eaf44d2c7be (MD5) Previous issue date: 2007 / A evolução da tecno-ciência, na área de terapia intensiva, vem possibilitando o aumento da sobrevida de pacientes portadores de doenças incuráveis. Esses pacientes, quando se encontram em estágio terminal de doença e são submetidos ao vasto aparato tecnológico, disponível nas UTI, são capazes de permanecer vivos por longos períodos e acabam por apresentar um risco aumentado para infecção hospitalar. O tratamento de todas as complicações infecciosas decorrentes dessa assistência, não é capaz de promover a cura desses pacientes, mas tão somente de postergar a morte, quase sempre à custa de muita dor e muito sofrimento; além disso, favorece a emergência de patógenos cada vez mais resistentes aos antimicrobianos, que, pela possibilidade de transmissão cruzada, passam a representar um risco aos demais pacientes vulnerados e internados na mesma unidade e, ainda, um risco a futuros pacientes, já que o uso indiscriminado de antimicrobianos pode levar a um futuro sem opções terapêuticas. Surge, então, uma série de conflitos de natureza moral, que são abordados no presente estudo e analisados à luz das bioéticas principialista e da proteção. Concluímos que as decisões relacionadas ao fim da vida, em UTI, devem ser fruto de uma ponderação entre todos os princípios da bioética principialista, mas que, num momento em que a resistência aos antimicrobianos representa um sério problema de saúde pública mundial, cabe aos governantes a elaboração de medidas de proteção, no sentido de se evitar o uso fútil de antimicrobianos,nesses pacientes.

Made available in DSpace on 2014-08-26T17:15:16Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) 86.pdf: 4313185 bytes, checksum: 841992629bd3bcc0ae5285c8796f0995 (MD5) Previous issue date: 2009 / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Faculdade de Farmácia, Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / Infecções invasivas são um problema crescente em hospitais terciários no Brasil e no mundo. Dentre os diversos agentes etiológicos encontrados no ambiente hospitalar, o gênero Candida tem sido o terceiro ou quarto patógeno mais isolado. De maneira geral, infecções fúngicas invasivas estão associadas a altas taxas de morbidade e mortalidade, dificuldades de diagnóstico, resistência a antimicrobianos, extensão do tempo de internação e aumento dos custos hospitalares. O presente trabalho objetivou avaliar o desempenho de métodos fenotípicos e moleculares na identificação de espécies de Candida recuperadas de casos de infecção hospitalar e descrever seus perfis de susceptibilidade a drogas antifúngicas através de metodologias de referência e comerciais. Para tanto, 113 isolados clínicos (108 Candida spp., 2 Rhodotorula glutinis e 1Trichosporon sp.) de 100 pacientes hospitalizados no estado do Rio de Janeiro foram submetidos a provas em CHROMagar, do tubo germinativo e do clamidósporo, análises bioquímicas em aparelho VITEK e identificação molecular por multiplex-PCR. A susceptibilidade ao fluconazol, itraconazol e anfotericina B foi avaliada conjuntamente pelos métodos de difusão em ágar (CLSI/M44-A e CECON) e microdiluição em caldo (CLSI/M27-A2 e EUCAST/E.Dis.7.1) conforme os protocolos de referência do CLSI e EUCAST, bem como pelas instruções do fabricante do método comercial CECON. Com relação às características demográficas dos pacientes, 47% eram do sexo masculino e 37% do sexo feminino, a maioria se encontrava na faixa de 0-20 anos (33%) e as leucemias foram os principais processos de base (20%). Candida albicans (41,5%), C. parapsilosis (29,2%), C. guilliermondii (10,6%) e C. tropicalis (9,7%) foram as espécies mais isoladas, considerando a totalidade dos espécimens clínicos. Em cultura de sangue, C. albicans (38,4%) também foi preponderante. A identificação cromogênica mostrou 100% de sensibilidade e especificidade para C. albicans, C. tropicalis e C. krusei. As provas do tubo germinativo e do clamidósporo para identificação de C. albicans apresentaram 89,4% de sensibilidade e 100% de especificidade. Os testes bioquímicos permitiram a detecção correta e completa de 78,8% dos isolados. A multiplex-PCR identificou adequadamente todas as espécies para os quais primers tinham sido desenhados. Alta taxas (≥92,9%) de susceptibilidade aos 3 antifúngicos testados foram observadas em todas as metodologias empregadas. Resistência foi verificada apenas em C. krusei e Rhodotorula glutinis frente ao fluconazol. No entanto, concentrações inibitórias mínimas (CIM) mais elevadas foram, igualmente, encontradas em itraconazol. O cálculo do coeficiente de correlação intraclasse (CCI) demonstrou alta correlação (0,88-0,97) entre todos os métodos utilizados para avaliação das susceptibilidades aos antifúngicos. Os resultados apresentados demonstraram que C. albicans foi a espécie mais prevalente e também que, depois de C. albicans, C. glabrata, C. krusei e C. lambica foram as espécies menos susceptíveis aos antifúngicos azólicos. Além disto, o CHROMagar e a multiplex-PCR foram os mais efetivos na identificação preliminar e na identificação definitiva dos isolados clínicos, respectivamente. As metodologias de difusão em ágar e microdiluição em caldo foram também efetivas tanto na triagem quanto na confirmação das susceptibilidades. / Invasive infections are a increasing problem in tertiary care hospital in the Brazil and in the world. The predominant etiologic agents in the nosocomial environment include the genus Candida that is the third ou fourth most common isolate. In generaly, invasive fungal infections are associated with high morbidity and mortality, difficulties in the diagnosis, acquisition of resistance, prolonged hospital stay, and high hospitalar costs. The aim of the present work was to evaluate the performance of phenotypic and molecular methods in the identification of Candida spp. isolated from nosocomial infection cases as well as to describe their antifungal drug susceptibility profliles by reference and commercial methodologies. For this, 113 clinical isolates (108 Candida spp., 1 Rhodotorula glutinis, 1 Trichosporon sp.) from 100 hospitalized patients in the Rio de Janeiro state were submmited to CHROMagar, germ tube and chlamydospore testing, biochemistry analysis in VITEK equipament, and molecular identification by multiplex-PCR. The susceptibility to fluconazole, itraconazol, and amphotericin B was evaluated by disk-diffusion method (CLSI/M44-A, CECON) and broth microdilution method (CLS/M27-A2, EUCAST/E.Dis.7.1.) according to the CLSI and EUCAST reference protocols and the manufacturer’s instructions, in case of CECON. Relatively of the demographic patient characteristics, 47% were male, 37% were female, the majority was between 0-20 years (33%), and leukemias were the main base diseases (20%). Candida albicans (41,5%), C. parapsilosis (29,2%), C. guilliermondii (10,6%) e C. tropicalis (9,7%) were the most frequently isolated Candida species from all clinical specimens. In hemoculture C. albicans (38,4%) was prevalent. The chromogenic identification showed susceptibility and specificity of 100% to C. albicans, C. tropicalis, and C. krusei. The germ tube and chlamydospore formation to C. albicans identification presented sensibility of 89,4% and specificity of 100%. The biochemistry tests were capable to correct and complete detection of 78% of the isolates. All Candida species could be accuracely identified by using the designed species-specific primers by multiplex-PCR analysis. High rates (≥92,9%) of susceptibility to 3 antifungal drug tested were verified for all methodologies. Resistance was found only in C. krusei and Rhodotorula glutinis to fluconazole. However high minimum inhibitory concentrations (MIC) were found to itraconazole as well. The intraclass correlation coefficient (ICC) showed high correlation (0,88-0,97) between all methods used to antifungal susceptibility evaluation. The results demonstrated that C. albicans was the most predominant specie, and also that after C. albicans, C. glabrata, C. krusei and C. lambica were the less susceptibility to azoles drug. Besides this, CHROMagar and multiplex-PCR were more effective in the preliminar and definitive identification of clinical isolates, respectively. The disk-diffusion and broth microdilution methods were effective to screening and confirm the susceptibilities.

Made available in DSpace on 2014-09-24T12:58:34Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Mestrado-Karine Rangel.pdf: 1004449 bytes, checksum: c343ca975f102dd4b196cf03888ac1f2 (MD5) Previous issue date: 2004 / Pseudomonas aeruginosa é um dos principais patógenos nosocomiais. Atualmente, a emergência de clones multirresistentes causando surtos hospitalares têm sido descritas em diversos países, inclusive no Brasil e consiste num grave problema. A resistência adquirida aos β-lactâmicos, que estão entre as drogas de primeira linha indicadas para o tratamento de infecções causadas por P. aeruginosa, pode ser resultante da produção de β-lactamases. Neste estudo, foram analisadas 214 P. aeruginosa isoladas de pacientes internados em hospitais de São Luís do Maranhão no período de junho de 2001 a junho de 2002. A susceptibilidade aos antimicrobianos foi avaliada pelo método de disco-difusão conforme as recomendações do NCCLS. A presença das seguintes séries de genes codificadores de β-lactamases: CARB, IMP, OXA, PSE, SHV, SPM, TEM e VIM foi determinada através da técnica da PCR em isolados que apresentaram-se positivos em testes de detecção fenotípicos ou que apresentaram perfil de resistência característico para as séries de β-lactamases citadas. Vários isolados apresentaram diferentes séries de β-lactamases, e apenas as séries de metalo-β-lactamases IMP e VIM não foram detectadas nos isolados estudados. A caracterização genotípica dos isolados produtores de β-lactamases foi realizada através de eletroforese em gel de campo pulsado (PFGE), após tratamento do DNA cromossômico com a enzima de restrição Spe I. Foram observados diversos genótipos entre os isolados que apresentaram a mesma série de β-lactamases, mostrando a disseminação destas enzimas nesta espécie nos hospitais de São Luís do Maranhão. Apenas os isolados produtores da enzima SPM-1 apresentaram o genótipo 3 que foi detectado nos últimos 5 meses do estudo, sugerindo o início da introdução desta metalo-β-lactamase no Maranhão. Estudos relacionados à caracterização molecular e resistência a antimicrobianos de isolados hospitalares podem fornecer informações fundamentais para auxiliar as ações dos programas de controle de infecções hospitalares. Nossos resultados mostram a importância da detecção de isolados de P. aeruginosa produtores de β-lactamases, que na maioria dos casos teriam opções terapêuticas limitadas, para prevenir o espalhamento destes e os conseqüentes surtos hospitalares. / Pseudomonas aeruginosa is one of the most common and important nosocomial pathogen. β-lactams antibiotics represent the most commonly prescribed antibacterial agents for treating infections caused by P. aeruginosa. Strains with adquired resistance to β-lactams may be result from the production of β-lactamases. In this study, we analysed 214 isolates of P. aeruginosa obtained from clinical specimens taken from patients hospitalized in Sao Luis do Maranhão from June 2001 to June 2002. Susceptibility tests were determined by the disk diffusion method in accordance with NCCLS guidelines. The presence of genes encoding CARB, IMP, OXA, PSE, SIIV. SPM, TEM and VIM β-lactamases were investigated by PCR in DNA of the isolates that showed particularly resistant phenotypes or in β-lactamase producers detected by phenotypic tests. Several isolates produced different β-lactamases types. None of the isolates gave positive PCR results for sequences encoding IMP or VIM enzyme types. Genetic characterization of isolates β-lactamase producers was performed by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) using the restriction endonuclease Spel. By PFGE twenty-six genotypes were found in P. aeruginosa isolates β-lactamases producers. P. aeruginosa isolates exhibiting one of β-lactamase types (CARB, OXA, PSE, SHV or TEM) revealed several genotypes indicating the nosocomial spread of these β-lactamases. The SPM β-lactamase type was detected only in isolates belonging to genotype 3. The presence of P. aeruginosa carrying the blaspm gene in the last five months studied suggested the introduction of this metalo-β-lactamase. Genetic characterization of nosocomial isolates and antimicrobial resistance studies is important to support and enhance the efforts of the infection control programs. Our results showed that the detection of P. aeruginosa aeruginosa β-lactamase producers that have limited therapeutic options is necessary for protection against spreading nosocomial these isolates.

Made available in DSpace on 2014-09-24T12:58:57Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Tese Liliane Miyuki Seki.pdf: 11573378 bytes, checksum: 779d1d4b49bfc191eafe332410d9730b (MD5) Previous issue date: 2012 / Enterobactérias produtoras de p-Iactamases de espectro estendido (ESBL) e Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC) são reconhecidas mundialmente como importantes problemasde resistência bacteriana nos hospitais. Neste estudo, foi avaliada a prevalência dos genes codificadores de ESBL, bem como a epidemiologia molecular em isolados de hemocultura,em enterobactérias coletadas entre Setembro de 2007 a Setembro de 2008, em cincohospitais localizados no Estado do Rio de Janeiro, Brasil. Das 293 amostras coletadas, 121 foram caracterizadas fenotipicamente como produtores de ESBL sendo a maior prevalência de Klebsiella pneumoniae 63 (52,1%), Enterobacter cloacae 16 (13,2%), Escherichia coli 14 (11,6%), Proteus mtrabtlis 11 (9,1%), Serra tia marcescens 10 (8.3%), Morganella morganii 2 (1.7%), Enterobacter aerogenes 1 (0,8%), Klebsiella oxytoca 1 (0,8%), Providencia stuartii 1 (0,8%), Citrobacter freundii 1 (0,8%), Serratia rubidaea 1 (0,8%). Entre as produtoras de ESBL, 11 amostras de K. pneumoniae e 9 amostras de E cloacae mostraram resistência ou redução de susceptibilidade a pelo menos um dos carbapenemas. A detecção por PCR dos genes de p-Iactamase mostraram que 87,6% produziramblacTX_M, 65,3% blaTEM, 64,5% blaSHVe 9,1% blaxsc- O gene do grupo CTX-M-l foi predominante na maioria das espécies de enterobactérias, exceto para o P. mirabilis, onde 91% das amostras eram do gene do grupo CTX-M-2. Das amostras pertencentes ao grupo CTX-M-l, 88% das K. pneumoniae e 100% das Ecoli foram determinadas como CTX-M-15. A análise do polimorfismo genético, por PFGE, demonstrou a disseminação do gene CTX-M-15 em 10 genótipos para as amostras de K. pneumoniae e de 3 genótipos para Eco/i em diversos hospitais no Rio de Janeiro. (AU)