Resumo: Considerando-se que portadores de anemia falciforme apresentam relatado aumento da suscetibilidade às infecções e que reservatórios bucais de microrganismos patogênicos podem representar uma porta de entrada para doenças, a avaliação da microbiota bucal potencialmente patogênica ganha relevância. O objetivo deste estudo foi avaliar a presença de leveduras do gênero Candida, estafilococos, enterobactérias e Pseudomonas spp. na cavidade bucal de pacientes com anemia falciforme em tratamento com hidroxiuréia, comparando os resultados com indivíduos controle. Foram incluídos no estudo 69 pacientes, com idades entre 15 a 60 anos, portadores de anemia falciforme, confirmados por exames clínicos e laboratoriais. Estes foram divididos em dois grupos: em tratamento com hidroxiuréia (HU) por no mínimo 90 dias (n=30); sem tratamento com HU (n=39). Foram também incluídos dois grupos controle pareados (controle I e II, respectivamente), sendo indivíduos saudáveis com perfil semelhante (quanto à idade, sexo e condições bucais) aos dos grupos em estudo. Não foram incluídos pacientes diabéticos, portadores de próteses bucais totais, outras doenças sistêmicas e que estivessem sob terapia com medicamentos que podem interferir com as condições bucais. Foram realizados exame clínico, anamnese e coleta de enxágüe bucal de cada paciente. Este foi semeado em meios de cultura específicos para cada microrganismo e, após incubação, foram obtidos valores de UFC/mL. Os isolados foram identificados pelo sistema API. A prevalência das espécies de microrganismos isolados foi comparada entre os grupos anemia falciforme com HU (AnF/HU+), sem HU (AnF/HU-) com seus respectivos controles. Foram realizados testes de suscetibilidade aos antimicrobianos segundo metodologia CLSI. Não foram observadas diferenças estatisticamente significativas entre as contagens de estafilococos... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Considering that sickle cell anemia patients have reported increased susceptibility to infections and oral reservoirs of pathogens may represent a gateway for disease, evaluation of potentially pathogenic oral flora becomes relevant. The aim of this study was to evaluate the presence of Candida species, staphylococci, Enterobacteriaceae and Pseudomonas spp. in the oral cavity of patients with sickle cell disease under treatment with hidroxyurea (HU), comparing the results with control subjects. The study included 69 patients aged 15-60 years, with sickle cell disease, confirmed by clinical and laboratory examinations. These were divided into two groups:under treatment with HU for at least 90 days (n=30), and without HU (n=39). Two matched controls (control I and II, respectively), composed of healthy individuals with similar profile (age, gender and oral conditions) to the study groups were included. Diabetic patients, patients with dentures, and other systemic diseases and those under treatment with medications that can interfere with oral conditions were not included. Clinical examination and anamnese were performed and mouthrinse sample was collected from each patient. The sample was plated into specific culture media for each microorganism and, after incubation values of cfu/ml were obtained. Isolates were identified by API system. The prevalence of the species were compared between groups with sickle cell anemia HU (AnF/HU+) and without HU (AnF/HU-) and the respective control groups. Antimicrobial susceptibility testings were performed according to the CLSI methodology. There were no statistically significant differences counts of staphylococci and Enterobacteriaceae/Pseudomonas between the groups AnF/HU+ and AnF/HU- and the respective control groups. Significant differences in the counts of yeasts were observed between AnF/HU- group and the respective control, however... (Complete abstract click electronic access below) / Orientador: Cristiane Yumi Koga Ito / Coorientador: Maria Stella Figueiredo / Banca: Fernanda Lourenção Brigheti / Banca: Karen Regina Carim da Costa / Mestre

Resumo: A espondilite anquilosante (EA) é uma doença inflamatória crônica de etiologia desconhecida, caracterizada pelo acometimento predominante do esqueleto axial. A terapia convencional inclui o uso de antiinflamatórios não hormonais e drogas anti-reumáticas modificadoras da evolução da doença (DMARDs). O uso de agentes imunobiológicos, como o anti-TNF, tem sido considerada uma excelente opção terapêutica em casos mais graves e refratários, porém estudos prévios demonstraram maior risco de infecções após o tratamento. Reservatórios bucais de microrganismos oportunistas podem causar infecções sistêmicas, uma vez que a cavidade bucal representa uma porta de entrada para patógenos, especialmente em pacientes imunocomprometidos. O objetivo do presente estudo foi avaliar a presença e a sensibilidade aos antimicrobianos de Candida spp., Staphylococcus spp., Enterobacteriaceae e Pseudomonas spp. na cavidade bucal de pacientes com EA em uso de anti-TNF comparando-os com indivíduos controle. Foram incluídos no estudo: grupo anti-TNF (35 indivíduos, diagnosticados portadores de EA com idade entre 17 a 63 anos e sob terapia anti-TNF); grupo Convencional (35 pacientes portadores de EA, com idade entre 21 e 74 anos sob tratamento convencional não imunobiológico; e respectivos grupos controle composto por indivíduos saudáveis pareados na idade, gênero e condições bucais aos grupos com EA. Foram realizados exame clínico, anamnese, bem como coleta de enxágüe bucal de cada indivíduo a qual foi semeada em meios de cultura específicos para cada microrganismo e posterior obtenção do número de unidades formadoras de colônia por militros (UFC/mL). Os isolados foram identificados pelo Sistema API, bem como fora realizados testes de sensibilidade aos antifúngicos dos isolados de leveduras, e, antibióticos dos isolados bacterianos... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The Ankylosing Spondylitis (AS) is a chronic inflammatory disease of unknown etiology, particularly characterized by a compromise of the axial skeleton. The conventional therapy includes the use of non-hormonal anti-inflammatory and Disease-modifying antirheumatic drugs (DMARDs). The use of immunobiological agents, such as anti-TNF, has been considered an excellent therapeutical option in more serious and refractory cases. However, previous studies demonstrated an increased risk of infections after the treatment is completed. Oral reservoirs of opportunist microorganisms can cause systemic infections, once that the oral cavity represents a door of entrance for pathogens, especially in immunocompromised patients. The aim of the present study was to evaluate the presence and antimicrobial susceptibility of Candida spp., Staphylococcus spp., Enterobacteriaceae and Pseudomonas spp. in the oral cavity of patients with AS treated with anti-TNF in comparison to healthy individuals. The following groups were included in the study: anti-TNF group (35 AS patients, aged between 17 and 63 years and under anti-TNF therapy); Conventional group (35 AS patients aged between 21 and 74 years under non-immunobiological conventional treatment); and respective Control groups (composed by healthy individuals paired in age, gender and oral conditions with AS groups). After clinical examination and anamnesis, oral rinses of each individual was collected. The rinses were plated in specific culture media for each microorganism. The number of colony-forming units per milliters (CFU/mL) was obtained. Isolates were identified by API system. Next, sensitivity tests to antifungicals agents were done for yeasts isolates and antibiotics for bacterial isolates. For Staphylococcus spp., the CFU counts for the anti-TNF group and Conventional group was statistically higher than the respective control groups... (Complete abstract click electronic access below) / Orientador: Cristiane Yumi Koga Ito / Coorientador: Marcelo de Medeiros Pinheiro / Banca: Fernanda Lourenção Brighenti / Banca: Emilia Inoue Sato / Mestre

Orientador: Maria da Lourdes Ribeiro de Souza da Cunha / Coorientador: / Banca: Carlos Magno C. B. Fortaleza / Banca: Lígia Maria Suppo de Souza Rugolo / Resumo: Infecções da Corrente Sanguínea Relacionadas a Cateter (ICSRC) têm se tornado a principal causa de infecção sanguínea associada à assistência a saúde e são associadas com substancial morbidade, mortalidade e excesso de custos ao hospital. Essas infecções incluem colonização do dispositivo pelos microrganismos, infecção no local de saída e uma infecção da corrente sanguínea microbiologicamente confirmada relacionada ao dispositivo. A cultura semiquantitativa é baseada no rolamento de segmento da ponta de cateter em placa contendo ágar-sangue, determinando a presença de bactérias na superfície externa do cateter e crescimento igual ou superior a 15 UFC é um indicativo de infecção. No método quantitativo descrito passa-se 1 mL de água destilada estéril pelo lúmen do cateter, agita-se e semeia-se em ágar sangue por 5 dias, considera-se significativo o crescimento maior ou igual que 103 UFC/mL, recuperando micro-organismos da superfície interna e externa do cateter. Nesse estudo, foram analisadas 584 pontas de cateter de 399 pacientes de Novembro de 2005 a Junho de 2012. As sensibilidades das técnicas semiquantitativa e quantitativa foram 72,7% e 59,3%, respectivamente, com especificidades de 95,7% e 94,4%, respectivamente. O diagnóstico de ICSRC a partir da similaridade dos isolados das pontas de cateteres e da hemocultura pela técnica genotípica PFGE revelou sensibilidade de 82,6% e especificidade de 100%. Os ECN foram os micro-organismos mais isolados. Sendo a espécie S. epidermidis a prevalente (61,0%), seguida por S. haemolyticus (13,0%), leveduras (8,7%), K. pneumoniae (8,7%), S. aureus (4,3%) e E. coli (4,3%). A resistência à Oxacilina foi encontrada em 90,9% dos ECN isolados dos casos de ICSRC, o SCCmec tipo III foi encontrado em 55,0%, o operon icaABCD em 59,0%. A CIM dos ECN para Oxacilina foi ≥0,5μg/mL para todos os isolados com exceção de um e para Vancomicina ≤4μg/mL para ... / Abstract: Catheter-related bloodstream infections (CR-BSIs) have become the most common cause of healthcare-associated bloodstream infection and are associated with substantial morbidity and mortality and excess hospital costs. These infections include device colonization by microorganisms, exit site infection, and microbiologically confirmed device-related bloodstream infection. Semi-quantitative culture is used to determine the presence of microorganisms on the outer surface of the catheter, whereas quantitative culture also isolates microorganisms present inside the catheter. The objectives of this study were to compare the semi-quantitative and quantitative techniques for the diagnosis of CR-BSIs in newborns hospitalized in the neonatal ICU of HC-FMB, and to determine the incidence density and risk factors for these infections. In this study, 584 catheter tips from 399 patients seen between November 2005 and June 2012 were analyzed. The incidence density of CR-BSI varied according to newborn weight, with an incidence of 3.44/1000 catheter days in newborns <1,000 g and of 2.83/1000 catheter days in newborns >2,501 g. The sensitivity of the semi-quantitative and quantitative techniques was 72.7% and 59.3%, respectively, and specificity was 95.7% and 94.4%. The diagnosis of CR-BSI based on PFGE analysis of similarity between strains isolated from catheter tips and blood cultures showed 82.6% sensitivity and 100% specificity. Coagulase-negative staphylococci (CoNS) were the most frequently isolated microorganisms (75.9%), including S. epidermidis as the most prevalent species (65.5%), followed by S. haemolyticus (10.3%), yeasts (10.3%), K. pneumoniae (6.9%), S. aureus (3.4%), and E. coli (3.4%). Oxacillin resistance was observed in 90.9% of the CoNS isolated from cases of CR-BSI. SCCmec type III was detected in 55% of the isolates and the icaABCD operon in 59%. The oxacillin MIC was ≥0.5 μg/mL for most strains and the vancomycin MIC was ... / Mestre

Orientador: Maria de Lourdes Ribeiro de Souza da Cunha / Banca: Alessandro Lia Mondelli / Banca: Brasilina Campos Salles Cerqueira / Resumo: A infecção do trato urinário (ITU) é uma das infecções mais comuns na prática clínica, sendo S. saprophyticus o segundo agente mais frequente na comunidade. Esse estudo objetivou comparar três métodos fenotípicos de identificação e avaliar o perfil de sensibilidade aos antimicrobianos em Staphylococcus spp. isolados de pacientes com ITU. As 101 amostras de estafilococos isoladas foram identificadas pelo disco de novobiocina, Vitek I e método simplificado de provas bioquímicas, utilizando como referência o método genotípico ITS-PCR. A prova da DNAse teve uma boa correlação com a coagulase em tubo, apresentando 100,0% sensibilidade e 97,6% de especificidade. No teste de concordância entre os métodos de identificação, o método simplificado de provas bioquímicas obteve taxas de concordância de 98,0% em relação ao ITS-PCR, enquanto que com o Vitek I foi de 81,2%, e com o disco de novobiocina de 89,1%. O maior percentual de resistência encontrado foi à oxacilina (78,0%) seguido da penicilina (73,0%), sendo todas as amostras sensíveis à vancomicina, linezolida e nitrofurantoina. Os 17 isolados de S. aureus encontrados foram identificados corretamente por todos os métodos e os que carreavam o SCCmec do tipo III foram os que apresentaram maior resistência aos antimicrobianos. Das 18 amostras de estafilococos mecA positivos encontradas neste estudo, 15 (83,3%) foram resistentes aos discos de cefoxitina e oxacilina concomitantemente, além disso foram resistentes também à oxacilina pelo E-test® e pelo Vitek I. Dos 57 S. saprophyticus, 7 (12,3%) foram resistentes ao disco de cefoxitina e nenhum apresentou o gene mecA, enquanto 56 (98,2%) demonstraram resistência ao disco de oxacilina, sendo que todos foram resistentes pelo E-teste® e pelo Vitek I e somente dois apresentaram o gene mecA e carreavam o SCCmec do tipo IV. Em relação aos métodos de detecção... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Urinary tract infection (UTI) is one of the most common infections in clinical practice, and S. saprophyticus is the second most frequent agent in the community. This study aimed at comparing three phenotypic methods to identify and evaluate the sensitivity profile to antimicrobials in Staphylococcus spp. isolated from patients with UTI. The 101 samples of staphylococcus isolated were identified by novobiocin disks, Vitek I and the simplified method of biochemical tests, using the ITS-PCR genotypic method as reference. The DNAse test showed good correlation with tube coagulase, exhibiting 100.0% sensitivity and 97.6% specificity. In the agreement test between the identification methods, the simplified method of biochemical tests showed agreement rates of 98.0% in relation to ITS-PCR, whilst with Vitek I, it was of 81.2%, and with the novobiocin disk, it was of 89.1%. The highest resistance percentage found was to oxacillin (78.0%), followed by penicillin (73.0%), and all samples were sensitive to vancomycin, linezolid and nitrofurantoin. The 17 isolates of S. aureus found were correctly identified by all methods, and those carrying type-III SCCmec showed the greatest resistance to antimicrobials. Of the 18 mecA-positive staphylococcus samples found in this study, 15 (83.3%) were concomitantly resistant to cefoxitin and oxacillin disks. Additionally, they were also resistant to oxacillin by the E-test® and by Vitek I. Of the 57 S. saprophyticus, 7 (12.3%) were resistant to the cefoxitin disk, and none showed the mecA gene, while 56 (98.2%) showed resistance to the oxacillin disk, all of them were resistant by the E-test® and by Vitek I, and only two showed the mecA gene and carried the type-IV SCCmec. As regards the detection methods for oxacillin resistance, the diffusion technique with oxacillin disks, E-test® and Vitek I showed greater sensitivity (94.4%) and lower specificity... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Lígia Maria S. S. Rugolo / Banca: Cleide Enoir Petean Trindade / Banca: José Carlos Peraçoli / Banca: Maria Fernanda Branco de Almeida / Banca: Lilian dos Santos Rodrigues Sadeck / Resumo: A rotura prematura de membranas pré-termo (RPM-PT) é uma das principais causas de morbimortalidade perinatal e fator de risco para infecção neonatal precoce. As citocinas pró-inflamatórias TNF-α, IL-8 e a antiiflamatória IL-10 são importantes mediadores da resposta imune, e na situação de risco infeccioso podem ser adjuvantes úteis no diagnóstico de infecção neonatal. Investigar se os níveis de TNF-α, IL-8 e IL-10 em sangue de cordão umbilical são marcadores de infecção precoce em prematuros advindos de gestações com RPM-PT. Estudo clínico, prospectivo e do tipo teste diagnóstico, realizado no Serviço de Obstetrícia e Neonatologia da Faculdade de Medicina de Botucatu, envolvendo prematuros de gestantes com rotura de membranas ≥ 12 horas. As citocinas TNF-α, IL-8 e IL-10 foram dosadas em sangue de cordão umbilical pelo método ELISA. Conforme a evolução clínica e laboratorial dos recém-nascidos foram constituídos dois grupos: Infectado e Não infectado, os quais foram comparados quanto às variáveis perinatais e neonatais por análise estatística univariada; com significância em 5%. A acurácia do teste diagnóstico foi obtida pela curva ROC, sendo calculados: sensibilidade, especificidade, valor preditivo positivo (VPP) e negativo (VPN). Foram estudados 55 prematuros: 27 infectados e 28 não infectados. O tempo de rotura não diferiu entre os grupos (54 x 29 hs; p=0,102) mas, no grupo infectado corioamnionite clínica e histológica foi mais frequente; a idade gestacional (31 x 33 semanas; p<0,001) e o peso de nascimento (1707 x 2109g; p=0,003) foram menores; a morbidade foi maior desde o nascimento com necessidade de assistência mais intensiva e o óbito ocorreu somente nesse grupo. As medianas de TNF-α (3.67 vs 1.76 pg/ml; p =0.084) e IL-10 (0 vs 4.10 pg/ml; p=0.291)... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Preterm premature rupture of membranes (PPROM) is one of the major causes of perinatal morbidity and mortality, and an important risk factor for early-onset neonatal infection. The pro-inflammatory cytokines TNF-α, IL-8 and anti-inflammatory cytokine IL-10 are mediators of immune response and may be helpful as early indicator of neonatal infection in the presence of perinatal risk factor. To evaluate umbilical cord blood levels of TNF-α, IL-8 and IL-10 as markers for early-onset infections in premature infants from pregnancies complicated by PPROM. Clinical, prospective and diagnostic test study performed at Obstetrician and Neonatal Unit of Botucatu School of Medicine, enrolling premature infants from pregnant women with ≥ 12 hours of premature rupture of membranes. TNF-α, IL-8 and IL-10 cytokines were measured in umbilical cord blood by ELISA. According to clinical and laboratorial evaluation patients were classified into two groups: infected and noninfected. Perinatal and neonatal variables were studied. Comparisons between groups were performed by univariate statistical analysis; significance at p <0.05. The diagnostic test accuracy was obtained by ROC curve. Sensibility, specificity, positive predictive value (PPV) and negative predictive value (NPV) were calculated by comparing infected with noninfected group. 55 premature infants were studied: 27 infected and 28 noninfected. There was no difference between the groups in the latency period (54 x 29 hours; p=0,102). In the infected group, clinical and histological chorioamnionitis were more frequent, gestational age (31 x 33 weeks; p<0,001) and birth weight(1707 x 2109g; p=0,003) were lower. Morbidity, mortality and resource use were higher among infected premature infants. The median levels of TNF-α (3.67 vs 1.76 pg/ml; p=0.084)... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Resumo: As leishmanioses são zoonoses causadas por protozoários do gênero Leishmania, transmitidos aos vertebrados por meio da picada de flebotomíneos. A doença consiste em um espectro de manifestações clínicas incluindo as formas tegumentar (LT) e visceral (LV), a segunda de maior importância para a saúde pública devido a sua alta taxa de letalidade. No Brasil a leishmaniose visceral ocorre em ambientes modificados pelo homem, com crescente avanço no âmbito urbano, tendo já sido relatada nas cinco regiões do país. Lutzomyia longipalpis é o principal veiculador da leishmaniose visceral no Novo Mundo, com grande importância no Brasil e no Estado de São Paulo, devido a sua abundância e fácil adaptação. No ciclo biológico do protozoário observa-se o desenvolvimento de formas promastigotas no vetor que se diferenciam em amastigotas no hospedeiro ao serem fagocitadas por macrófagos. Visando diminuir a crescente incidência de casos humanos e caninos, medidas preventivas e de controle voltadas ao homem, cão e vetor têm sido aplicadas no Brasil. O objetivo deste trabalho foi avaliar a abundância e a taxa de infecção de Lu. longipalpis em área urbana endêmica para leishmaniose visceral com o intuito de contribuir com parâmetros importantes para estudos que avaliem o impacto de medidas aplicadas para o controle da LV neste novo cenário / Abstract: - Leishmaniasis are zoonotic diseases caused by protozoa of the genus Leishmania transmitted to vertebrates thru the bite of sandflies. The disease consists of a spectrum of clinical manifestations including the tegumentary (TL) and the visceral leishmaniasis (VL) forms, the latter more important for public health because of its higher lethality. Visceral leishmaniasis occurs in Brazil in environments modified by man, with an increase in the urban area where it has been reported in the five regions of country. Lutzomyia longipalpis is the main vector for visceral leishmaniasis in the New World, with great importance in Brazil and in the state of São Paulo due to its abundance and easy adaptation. In the biological cycle of the parasite observed development of the promastigote forms in the vector and the turning for amastigote in the host when phagocytosed by macrophages. Aiming at reducing the increasing incidence of VL in human and canine preventive and control measures targeting man, dogs and the vector have been used in Brazil. The aim of this study was to evaluate the abundance and the infection rate of Lu. Longipalpis by Leishmania spp. in an urban area endemic for visceral leishmaniasis in order to contribute to studies that assess the impact of measures applied to control LV in this new scenario / Orientador: Cáris Maroni Nunes / Banca: Cláudio Casanova / Banca: Luzia Helena Queiroz / Mestre

Orientador: Maria de Lourdes Ribeiro de Souza da Cunha / Banca: Carlos Magno Castelo Branco Fortaleza / Banca: Maria Clara Padoveze / Resumo: O gênero Staphylococcus está envolvido em infecções adquiridas tanto na comunidade como em hospitais, sobressaindo-se atualmente como um dos maiores problemas clínicos e epidemiológicos em infecções nosocomiais. Diante da importância do S.aureus como um dos microrganismos mais freqüentemente isolados de infecções de pele e tecidos moles e a crescente disseminação dos S. aureus resistentes a oxacilina (MRSA), este estudo objetiva identificar a presença de MRSA em feridas de pacientes atendidos em unidades básicas de saúde da cidade de Botucatu, caracterizar o cassete cromossômico mec e identificar fatores de risco para aquisição de S aureus e MRSA. Foram incluídas no estudo 126 amostras isoladas de 107 pacientes atendidos no período de março de 2010 à fevereiro de 2011. As amostras foram submetidas à identificação e detecção de resistência a oxacilina pelo método de difusão com disco de oxacilina e cefoxitina, penicilina, levofloxacina, clindamicina, eritromicina, gentamicina, sulfametazol/Trimetropim, tigeciclina, ácido fusídico, quinupristina/dalfopristina, linezolida e vancomicina. Foi realizada a caracterização do SCCmec por PCR multiplex nas amostras de S. aureus com gene mecA. Foi investigada a presença dos genes codificadores da Leucocidina Panton-Valentine (PVL). As amostras de Staphylococcus spp. também foram submetidas detecção de produção de -lactamase. Das 126 amostras estudadas, 73(58%) foram identificadas como genero Staphylococcus spp., sendo 49/73(67,1%) isolados S. aureus e 24/73(32,9%) estafilococos coagulase-negativa (ECN). A produção de -lactamase foi positiva em 65/73(89%) das amostras de Staphylococcus spp. Foi encontrado 7/49(14,2%) isolados de S. aureus e 13/24(54,1%) isolados de ECN com presença do gene mec A... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The genus Staphylococcus is involved in both community and hospital-acquired infections, currently standing out as major clinical and epidemiological problems in nosocomial infections. Given the importance of S. aureus as one of the most frequently microorganism isolated from skin and soft tissue infections and the increasing spread of methicillin-resistant S. aureus (MRSA), the aims of this study were to identify the presence of MRSA in wounds of patients treated at basic health units in Botucatu, characterize the cassette chromosome mec (SCCmec) and identify risk factors for acquisition of S aureus and MRSA. The study included 126 isolates from 107 patients treated from March 2010 to February 2011. The samples were identified and the disk diffusion method with cefoxitin and oxacillin disks was carried out in order to detect the resistance to oxacillin. The disk diffusion method was also carried out to set the susceptibility profile for the following antibiotics: penicillin, levofloxacin, clindamycin, erythromycin, gentamicin, sulfamethoxazole/trimethoprim, tigecycline, fusidic acid, quinupristin/dalfopristin, linezolid and vancomycin. mecA positive samples were submitted to SCCmec characterization using multiplex PCR. We also investigated the presence of genes encoding Panton-Valentine Leukocidin (PVL) as far as the - lactamase production. From the 126 samples studied, 73 (58%) were identified as genus Staphylococcus spp., and 49/73 (67.1%) isolates were identified as S.aureus and 24/73 (32.9%) as coagulase-negative Staphylococcus (CoNS). The -lactamase production was positive in 65/73 (89%) samples of Staphylococcus spp. The mecA gene was detected in 7/49 (14.2%) isolates of S. aureus and 13/24 (54.1%) isolates of CoNS. Among MRSA, 4/7 (57.2%) isolates were SCCmec type... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Clarice Queico Fujimura Leite / Coorientador: Luiz Pedro Sorio de Carvalho / Coorientador: Cleslei Fernando Zanelli / Banca: Pedro Eduardo Almeida da Silva / Banca: Cristiano Gallina Moreira / Banca: Patrícia Bento da Silva / Banca: Leonardo Neves de Andrade / Resumo: Tuberculose (TB), com principal agente etiológico o bacilo Mycobacterium tuberculosis, é uma doença infecciosa passível de cura. Entretanto, é detentora de uma estatística mundial preocupante, e em 2014 apresentou 9,5 milhões de novos casos e 1,5 milhão de mortes. Além dos altos índices estatísticos, a TB aparece ainda associada a dois fatores agravantes: a co-infecção com HIV ("Human Immunodeficiency Virus") e a crescente emergência de linhagens resistentes aos quimioterápicos como "multi-drug resistant" (MDR) e "extensively drug resistant" (XDR), que dificultam sobremaneira o tratamento, indicando premência na pesquisa de novos fármacos. A resistência do bacilo manifesta-se a partir de eventos adquiridos (como aquisição de mutações cromossomais em genes específicos relacionados ao metabolismo de fármacos) ou intrínsecos, como uma parede celular altamente hidrofóbica (devido à grande quantidade de ácidos micólicos). Estes mecanismos de resistência são discutidos amplamente na literatura. Por outro lado, pouco se sabe a respeito da resistência devido as alterações na expressão dos genes das bombas de efluxo, responsáveis pela exclusão de fármacos, bem como dos mecanismos de resistência relacionados a halotolerância bacteriana. Neste sentido, três assuntos de relevância no combate à tuberculose foram abordados nesta tese. Como primeira frente, avaliou-se inicialmente a expressão de 5 genes codificadores de bombas de efluxo pela técnica de RT-qPCR em 12 isolados clínicos frente ao tratamento com rifampicina, principal fármaco do regime terapêutico da TB. Resultados indicaram que essas proteínas auxiliam na emergência da resistência, sendo indicados pela superexpressão dos genes frente ao tratamento. Como segunda frente avaliou-se a atividade de 15 compostos inéditos de furoxânicos e benzofuroxânicos... / Abstract: Tuberculosis (TB) is an infectious disease caused mainly by Mycobacterium tuberculosis bacillus, presenting 9.5 million of new cases and 1.5 million of deaths in 2014. Two aggravating factors are associated with these high statistical indexes: a co-infection with HIV ("Human Immunodeficiency Virus") and the increasing emergence of resistant strains represented by MDR ("multi-drug resistant") and XDR ("extreme drug resistant") strains. The bacillus resistance manifests from acquired events (such as acquisition of chromosomal mutations in specific genes related to drug metabolism) or intrinsic, as a highly hydrophobic cell wall (due to the large amount of mycolic acids) and the action of efflux pumps (responsible for drug extrusion). Thus, the thesis project evaluated the expression of five genes encoding efflux pumps by RT-qPCR technique in 12 clinical isolates against rifampicin, the main anti-TB drug used in the standard treatment. Results indicated that these proteins contribute to the emergence of resistance, indicated by overexpression of these genes after treatment. The second part of the study evaluated the activity of 15 furoxan and benzofuroxan derivative compounds for inhibitory capacity against the M. tuberculosis, cytotoxicity in VERO cells, as well as ethidium bromide accumulation and efflux assays. Aiming evaluate their mechanism of action, microarray and assays of nitric oxide release were also done, as they are supposed nitric oxide donors and may present an action by oxidative stress and/or the activity efflux pumps inhibition. Results indicated that the class of compounds is promising for the treatment, with good inhibitory activity against bacillus and substantial degree of selectivity. Mechanism of action assays indicated activity independent of efflux inhibition, of isoniazid subunit' or nitric oxide release. Microarray pointed to changes ... / Doutor

Made available in DSpace on 2013-08-07T19:06:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000448527-Texto+Completo-0.pdf: 415770 bytes, checksum: 09e12a0bd7a9b1c0393a3bdb829d942c (MD5) Previous issue date: 2013 / Acute wheezing is a leading cause of hospitalization in infants. Previous studies have described a difference in the severity of the disease depends on the virus identified in a sample of air, but some studies show conflicting results. This study is therefore to evaluate the relationship between the causative pathogen of lower respiratory tract infection (LRTI) and length of stay in a sample of infants from Porto Alegre. The nasopharyngeal specimens for testing of respiratory viruses by immunofluorescence and polymerase chain reaction were collected between 09/2009 and 09/2011. We recruited patients at the Hospital São Lucas diagnosed with LRTI. We analyzed 122 samples from patients with LTRI, and of these, 65 (51. 2%) were positive for respiratory syncytial virus infection (RSV). Besides these samples, 15 were positive for influenza, 5 to rhinovirus, parainfluenza to 10, 3 to metapneumovírus and 3 for adenovirus. When we used length of stay as a marker of severity, patients with RSV were, on average, 6. 74 ± 4. 39 days hospitalized, while patients infected with other viruses were only 4. 97 ± 2. 64 days hospitalized, on average; this difference was statistically significant. However, when we used other risk factor as family history of asthma, number of siblings and sex, there was no significant difference. The study demonstrated high overall positive tests for virus, with the predominance of RSV. The study suggests that RSV may be considered as a risk factor for ITRI severity. / As crises de sibilância desencadeadas por vírus estão entre as principais causas de internação hospitalar em lactentes. Estudos prévios descreveram uma diferença na severidade da doença dependente do vírus identificado em amostra de via aérea, porém alguns trabalhos apresentam resultados conflitantes. Este estudo tem, portanto, o objetivo de avaliar a relação entre o patógeno causador da infecção e tempo de internação, em uma amostra de lactentes de Porto Alegre. As amostras de secreção nasofaríngea para pesquisa de vírus respiratórios por imunofluorescência direta (IFD) e polymerase chain reaction (PCR) foram coletadas no período 09/2009 e 09/2011. Foram recrutados pacientes internados no Hospital São Lucas da PUCRS com diagnóstico de infecção do trato respiratório inferior (ITRI). Foram analisadas 122 amostras de pacientes com ITRI, e destas, 65 (51,2%) foram positivas para infecção por vírus sincicial respiratório (VSR). Além destas amostras, 15 foram positivas para influenza, 5 para rinovírus, 10 para parainfluenza, 3 para metapneumovírus e 3 para adenovírus. Quando utilizamos o tempo de internação como um marcador de gravidade, pacientes com VSR ficaram, em média, 6,74 ± 4,39 dias internados, enquanto pacientes sem VSR ficaram apenas 4,97 ± 2,64 dias internados, em média, sendo esta diferença estatisticamente significativa. Porém quando avaliados outros fatores de risco como história familiar de asma da mãe, número de irmãos e sexo não houve uma diferença significativa. O estudo demonstrou uma positividade geral elevada para vírus, com a predominância do VSR. Este estudo indica a possibilidade de que a infecção por VSR possa influenciar marcadores gravidade em lactentes com ITRI.

Made available in DSpace on 2013-08-07T19:06:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000384827-Texto+Completo-0.pdf: 455005 bytes, checksum: 666c2b62d544e697f84370a42c66c1f6 (MD5) Previous issue date: 2006 / Background: Invasive Group B Streptococcal disease emerged in the 1970s as a leading cause of neonatal morbidity and mortality in the United States, and in the last 20 years has remained as the main cause of early-onset disease, meningitis and pneumonia among neonates. Since 1992, the American Academy of Pediatrics, the American College of Obstetricians and Gynecologists, and the Center for Disease Control and Prevention issued revised guidelines recommending universal screening of pregnant women for rectovaginal Group B Streptococcal colonization at 35-37 weeks’ gestation and administering intrapartum antimicrobial prophylaxis to carriers at delivery. Methods: It was a cross sectional study. Vaginal and rectal material was collected by sterile swab. Stuart broth media was used and samples were analyzed by PCR within 72 hours in the Centro de Biologia Genômica e Molecular – PUCRS and Centro de Pesquisas, Serviço de Patologia Clínica do HCPA – UFRGS. The sample was cultured in Brain Heart Infusion plus 8 bg/ml of gentamicin and 15 bg/ml of nalidixic acid medium. After that DNA was extracted and PCR was done. Prevalence ratio was used as risk measure. Data were expressed as proportion and respective 95% confidence interval. Quisquare as well as exact Fisher test was used to evaluate the strength of association among variables. Results: 121 women were analyzed and 28 of them had positive PCR for group B streptococci (23,1% IC95% 16,0 – 31,7). There were no associations between the dependent variable, positive group B streptococci, and the other independent variables tested. The association with previous abortion showed a p=0. 05. Conclusions: The study detected a high rate of prevalence of colonization by EGB in this population, similar to the prevalence described by the international literature. This new method has the potential to be utilized in screening prenatal programs. / Introdução: a doença invasiva pelo estreptococo do grupo B (EGB) emergiu como a principal causa de mortalidade e morbidade no período neonatal nos Estados Unidos da América do Norte em 1970, e durante os últimos 20 anos tem-se mantido como a principal causa de sepsis de início precoce, meningite e pneumonia entre recém-nascidos. Em 1992, a Academia Americana de Pediatria, o Colégio Americano de Obstetrícia e Ginecologia e o Centro de Controle e Prevenção de Doenças nos Estados Unidos da América recomendaram a adoção de medidas baseadas na pesquisa ativa para identificação das gestantes colonizadas pelo estreptococo do grupo B, e correspondente quimioprofilaxia no momento do parto. Objetivos: Relatar a prevalência da colonização materna pelo estreptococo do grupo B nas gestantes atendidas no Serviço de Saúde da Mulher em Uruguaiana (RS), medir a freqüência de exposições e relatar a estimativa de risco através da razão de prevalência. Métodos: O trabalho teve um delineamento transversal contemporâneo. A coleta do material foi realizada através de swab combinado vaginal e anal. O material coletado foi mantido em meio de Stuart e encaminhado para análise por PCR no Centro de Biologia Genômica e Molecular da PUCRS e no Centro de Pesquisas, Serviço de Patologia Clínica do HCPA da UFRGS em até 72 horas. Eram então inoculadas em meio seletivo Brain Heart Infusion, suplementado com 8 µg/ml de gentamicina e 15 µg/ml de ácido nalidíxico. Posteriormente era extraído o DNA das culturas e estes submetidos a PCR. A razão de prevalência foi utilizada como medida de risco. Os dados foram expressos como percentual e respectivos intervalos de confiança no nível de 95% (∞=0,05). A força de associação entre as variáveis foi submetida a análise utilizando-se o teste do X² e teste exato de Fischer, quando apropriado. Resultados: 121 pacientes foram incluídos no estudo, sendo que 28 destes apresentaram PCR positiva para o estreptococo do grupo B (23,1% - IC95% 16,0 – 31,7). Não foram detectadas associações entre a variável dependente, EGB positiva, e as variáveis independentes testadas. A associação com aborto prévio apresentou um p=0,05. Conclusões: o estudo detectou uma prevalência alta de colonização das gestantes por EGB nesta população, similar à descrita na literatura internacional. Este novo método tem o potencial de utilização em programas de triagem pré-natal.