O herpesvírus bovino tipo 4 (BoHV-4) é um herpesvírus membro da subfamília Gammaherpesvirinae, gênero Rhadinovirus que tem sido detectado em bovinos sadios e com diferentes sinais clínicos em todos os continentes. Sugere-se que este vírus está relacionado com diversas doenças do trato reprodutivo de bovinos. Dessa forma, faz-se necessária a pesquisa desse vírus em amostras biológicas com potencial utilização em biotécnicas de reprodução de bovinos, com o objetivo de reduzir sua transmissão e possíveis prejuízos econômicos advindos de sua infecção. Cento e dezenove amostras de líquido folicular de fêmeas abatidas em frigorífico e 164 amostras de sêmen de centros de inseminação artificial foram submetidas a uma reação de nested PCR para detecção do genoma do BoHV-4. Foi detectado o DNA de BoHV-4 em 2 amostras (1,68%) de liquido folicular e em 14 amostras (8,54%) de sêmen. Sete produtos foram submetidos ao sequenciamento, que revelou a semelhança dessas amostras com amostras europeias. É o primeiro relato de detecção do DNA de BoHV-4 em amostras de líquido folicular de bovinos, o que pode sugerir uma nova via de transmissão desse agente. Dessa forma, as alíquotas de sêmen destinadas à inseminação artificial e os ovários destinados a produção de embriões in vitro necessitam de um controle maior para evitar a disseminação do BoHV-4 entre os rebanhos bovinos e possíveis prejuízos econômicos associados ao vírus. / Bovine herpesvirus type 4 (BoHV-4), a member of the Gammaherpesvirinae subfamily, genus Rhadinovirus has been detected in healthy as well as diseased cattle in all continents. It is suggested that this virus is associated to several disorders of the reproductive tract of bovines, and the virus or its genome has been found in clinical and biological samples like fetuses, semen and cells of the granulosa. Given the lack of evidences on the circulation of BoHV-4 in bovines of Brazil, specifically from samples from the reproductive tract, this study aimed the detection of BoHV-4 DNA from semen and follicular fluids of bovines. One hundred and nineteen follicular fluid samples obtained from a slaughterhouse and 164 semen samples obtained in artificial insemination centers were subjected to a nested PCR for the detection of BoHV-4 DNA. BoHV-4 DNA was detected in 2 samples (1.68%) from follicular fluid and 14 (8.54%) of semen samples. Seven products were subjected to sequencing, which confirmed the identity of the PCR products and revealed the similarity of these viruses with European virus isolates. It is the first report on the detection of BoHV-4 DNA in bovine follicular fluid samples and semen in Brazil, which may suggest that the virus may be disseminating in Brazilian cattle through reproductive practices. In addition, the results found here point to the a requirement for the testing of such samples, in search for BoHV-4 DNA, in order to prevent the spread of BoHV-4 between the cattle herds and the potential economic losses associated.

As principais causas de morbidade e mortalidade em cirurgia biliar relacionam-se a complicações sépticas. Estas associam-se à presença de bife colonizada por bactérias. Pacientes portadores de patologias biliares apresentam colonização bacteriana da bile em uma prevalência que varia de 11 a 1 00°/o. A maior parte dos estudos identifica uma prevalência de colonização da bile em torno de 1/3 dos casos. As espécies bacterianas mais freqüentemente isoladas são as da flora entérica, destacando-se a Escherichia co/i, Klebsiella sp e Streptococcus faeca/is. As bactérias anaeróbicas são encontradas em zero a 40°/o dos pacientes, sendo as mais prevalentes dos gêneros Bacteroides e Clostridium. No presente estudo, foram coletadas biópsias hepáticas intra-operatórlas com agulha de Vinn Silvermann e material denominado de aspirado hepático, constituído do sangue aspirado pela agulha após a retirada do fragmento da biópsia. O estudo visa identificar a acurácia da cultura bacteriana destes materiais no diagnóstico da colonização bacteriana da bile. A cultura da bile do colédoco, coletada por cateterização transcística da via biliar, foi escolhida como padrão-ouro. Alem destas, foram realizadas culturas de bile da vesícula biliar e sangue periférico. Foram, também, coletados dados de idade, sexo, diagnóstico pré-operatório, fatores de risco para colonização biliar e uso de antibióticos profiláticos. A população amestrada foi de pacientes submetidos a cirurgia biliar no Hospital de Clínicas de Porto Alegre. Foram excluídos pacientes em uso de antibióticos em regime terapêutico, uso de corticóides ou imunossupressores, presença de patologias parenquimatosas hepáticas e patologias infecciosas abdominais fora das vias biliares. As culturas aeróbicas foram feitas usando meio de agar-tripnase .. soja enriquecido com sangue humano desfibrinado e agar-MacConkey, incubados por 24 horas. As cultura anaeróbicas foram semeadas em caldo de tioglicolato enriquecido com vitamina K-hemina 1 o/o, agar-Brucella e agar-fenil-etanol enriquecidos com sangue de carneiro desfibrinado e vitamina K-hemina. o tempo de incubação foi de 48 horas. Entraram no estudo 57 pacientes, sete foram excluídos, permanecendo 50. A média de idade foi de 45,1 anos (:!:_15,3). Quarenta e oito pacientes tinham o diagnóstico pré-operatório de colecistite crônica, sendo 13 deles associada à coledocolitíase. Havia um caso de colecistite aguda e um de estenose pós-cirúrgica de via biliar. O fator de risco para colonização da bile de maior prevalência foi a coledocolitíase, com 13 pacientes. Vinte e nove pacientes não apresentavam nenhum fator de risco. Foram isoladas bactérias na bile do colédoco de nove pacientes. As espécies encontradas foram: Klebsiella pneumoniae, Escherichia co/i, Streptococcus faecalis, Enterobacter c/oacae, Klebsiella oxytoca, Streptococcus a-haemolitico. Na bile da vesícula biliar, foram isoladas bactérias em 7 pacientes: Klebsiella pneumoniae, Escherichia co/i, Streptococcus faeca/is, Enterobacter cloacae. Houve concordância entre os resultados da bile do colédoco e da vesícula biliar em 97,7% dos casos. A cultura da biópsia hepática foi positiva em dois casos. Em um, foi isolado Staphilococcus epidermidis, onde provavelmente houve contaminação externa. No outro, foi isolada Klebsiella pneumoniae que também havia sido encontrada na bile do colédoco do mesmo paciente. Neste paciente foi isolada Klebsiella no aspirado hepático. Foi o único caso de cultura positiva no aspirado hepático. Foi o único caso de cultura positiva no aspirado hepático. A cultura da biópsia hepática teve uma sensibilidade de 0,11, especificidade de 0,98, valor preditivo positivo de 0,50 e valor preditivo negativo de 0,83. A cultura do aspirado hepático apresentou uma sensibilidade de O, 11, especificidade de 1 ,O , valor preditivo positivo de 1 ,O e valor preditivo negativo de 0,84. Conclui-se que a cultura da biópsia e aspirado hepáticos com a técnica bacteriólogica empregada no estudo demonstrou uma acurácia diagnóstica baixa. A sua utilidade clínica na identificação de pacientes portadores de bactérias na bile é limitada. / The main causes of morbidity and mortality in biliary tract surgery are related to septic complications. Those relate to the presence of bile colonized by bacteria. Patients with biliary pathology show bacteria colonization of bile in a prevalence which varies from 11 to 100°/o. The majority of the studies identify a prevalence of colonization of bile about 1/3 of the cases. lhe bacterial species most frequently isolated are those of enteric flora, distinguishing the Escherichia co/i, Klebsiella sp and Streptococcus faecallis. The anaerobic bacteria are found in zero to 40o/o of the cases, being the most prevailing of the species Bactoides and Clostridium. In the present study there were collected hepatic intra-surgical biopsies with a needle of Vinn Silvermann and material named hepatical aspirated, made of aspirated blood through the needle after the removal of the pieces of the biopsy. lhe study aims to identify the accuracy of the bacterial culture from those substances in the diagnostic of the bacterial colonization of the bile. The culture of the bife from the common duct, collected by cystic duct probing, was chosen as the gold-standard. Besides those, there were made cultures o f bile o f the gallbladder and peripheral blood. lt was also collected data of age, sex, prcoperativo diagnosis, risk factors to biliary tract colonization and the use of prophylactic antibiotics. The sampled population was of patients undergoing on biliary tact surgery at the "Hospital de Clínicas de Porto Alegre". Patients in therapeutical use of antibiotics, using corticoesteroids or immunossupressive drugs, with hepato-cellular pathologies and abdominal infectious pathologies out · of the biliary tract were excluded. The aerobic cultures were made by the use of agar-tripnase-soy improved by desfibrinated human blood and agar-McConkey, incubated for 24 hours. The anaerobic cultures were sowed in a broth of tioglicolatus improved by vitamins K-hemine 1o/o, agar-Brucella and agar-fenil-ethanol improved with desfibrinated sheep blood and vitamin K-hemine. The time of incubation was of 48 hours. From 57 patients that begun the study, 7 were excluded, remaining 50. The age average was of 45,7 years old (± 15,3). Forty-eight patients had the preoperative diagnosis of chronic cholecystitis, 13 of them being related to choledocholithiasis. There was a case of acute cholecystitis and one of postoperative biliary tract stenosis. The risk factor to bile colonization of major prevalence was the choledocholithiasis (13 patients). Twenty-nine patients did not show any risk factor. They were isolated bacteria in the common duct bile of nine patients. The species found were Klebsiella penumoniae, Eschericha coli, Streptococcus faecalis, Enterobacter cloacae, Klebsiella oxytoca, Streptococcus a-haemolitico. In the gallbladder bile bacteria were isolated in 7 patients: Klebsie/la pneumoniae, Escherichia co/i, Streptococcus faecalis, Enterobacter cloacae. There was agreement between the results of the common duct and gallbladder bile in 97,7% o f the cases. The culture o f the hepatic biopsy was positiva in two cases. In one, it was isolated Staphi/ococcus epidermidis , were probably there was externai contamination. In the other one, it was isolated Klebsiella penumoniae, which had also been found in the common duct bile of the same patient. In that patient it was isolated Klebsiella in the hepatic aspirated. lt was the only case of positive culture in the hepatic aspirated. The hepatic biopsy culture had a sensibility of O, 11, a specificity of 0,98, a predictive positiva value of 0,50 and a predictive negative value of 0,83. The hepatic aspirated culture showed a sensibility of O, 11, a specificity of 1 ,O, a predictive positive value of 1 ,O and a predictive negative value of 0,84. We concluded that the culture of the biopsy and hepatic aspirated, with the bacteriological technique used in the study, showed a low diagnostic accuracy. lt has a low clinicai use in the identification of patients with biliary tract colonization.

Resumo não disponível.

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Submitted by Amanda Silva (amanda.osilva2@ufpe.br) on 2015-03-11T13:27:51Z No. of bitstreams: 2 DISSERTAÇÃO Keilla Maria Silva.pdf: 4228154 bytes, checksum: ea3da547f9bdeacfacd07ad7ced6d809 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-11T13:27:51Z (GMT). No. of bitstreams: 2 DISSERTAÇÃO Keilla Maria Silva.pdf: 4228154 bytes, checksum: ea3da547f9bdeacfacd07ad7ced6d809 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2014-02-25 / CNPq / O Papilomavírus Humano (HPV) é um agente sexualmente transmissível que se destaca por infectar o trato anogenital, e devido à sua associação etiológica com uma grande variedade de carcinomas, encontra-se entre as mais importantes infecções sexualmente transmissíveis (IST) da atualidade. Acredita-se que a presença do vírus da imunodeficiência humana (HIV) e da Chlamydia trachomatis parecem favorecer a infectividade viral, proporcionando o surgimento de lesões que podem levar ao câncer. Desta forma, o presente trabalho teve por objetivo avaliar os genótipos do HPV presentes em amostras cervicais e anais, correlacionando com a infecção por Chlamydia trachomatis. Realizou-se um estudo incluindo 73 mulheres com idade entre 17 e 65 anos, atendidas no Hospital das Clínicas de Pernambuco (HC/UFPE) entre novembro de 2010 e fevereiro de 2013. As amostras foram obtidas e a extração do DNA foi realizada através de kits específicos. Posteriormente, os genótipos do HPV foram determinados pelo PapilloCheck® (GreinerBio-One) e a identificação da Chlamydia trachomatis por PCR em Tempo-Real. A prevalência do HPV no canal anal foi de 83,6%, estando associado com história de intercurso anal (p=0.0295) e infecção por HIV (p=0.0104). Infecção múltipla por HPV foi observada em 50,8% das pacientes, sendo o HPV44 o mais comum. Nos grupos HIV-positivo e HIV-negativo, o genótipo de alto risco mais frequente foi o HPV16, enquanto que HPV44 e o HPV43 foram os genótipos de baixo risco mais encontrados, respectivamente. A taxa de concordância entre os genótipos de HPV cervical e anal chegou a 52%. Apenas um paciente apresentou infecção por Chlamydia trachomatis em canal anal. Os resultados sugerem que o canal anal pode ter participação na infecção cervical funcionando como reservatório do vírus. Desta forma, o rastreamento dessas pacientes no serviço público de saúde pode favorecer um diagnóstico precoce, auxiliando os médicos no acompanhamento e prevenindo a evolução da infecção, principalmente em pacientes HIV-positivas.

Este estudo avaliou a ocorrência de leveduras do gênero Candida sp além dos principais microrganismos periodontopatogênicos e enterobactérias na saliva, em mucosa e no biofilme aderido à prótese total, correlacionando com aspectos clínicos e condição de higiene bucal de 90 indivíduos edêntulos e portadores de prótese total, por meio de métodos moleculares (PCR). Espécimes clínicos intrabucais foram coletados desses indivíduos após avaliação das condições sócio-econômicas e comportamentais. A microbiota bucal dos pacientes foi caracterizada por meio da obtenção de amostras de biofilme aderido às próteses totais, mucosa e saliva, as quais foram processadas, por meio de PCR. As inter-relações entre os diferentes microrganismos foram determinadas por meio dos testes de Qui-quadrado e Mann-Whitney. Verificaram-se diferenças na ocorrência de Prevotella intermedia e Enterobacteriaceae na saliva dos pacientes edêntulos, o mesmo ocorrendo com Enterobacteriaceae, Camphylobacter rectus e gênero Pseudomonas no biofilme aderido às próteses totais. As condições de higiene bucal e estado de conservação da prótese total precários favoreceram a ocorrência de leveduras do tipo Candida sp, em especial Candida albicans, em níveis estatisticamente significante nas amostras de mucosa e biofilme aderido à prótese total, tornando este dispositivo protético um potencial reservatório de leveduras e bactérias entéricas que podem ser de relevância na patogênese das infecções oportunistas. _________________________________________________________________________________________ ABSTRACT: The aim of this study was to evaluate the occurrence of major periodontopathogenic microorganisms and Enterobacteriaceae and biofilm adhered to the denture, mucosa and saliva in 90 edentulous subjects with complete dentures, using molecular methods (PCR). Clinical specimens were collected from these individuals after assessing the socio-economic circumstances and behavioral. The oral microbiota of patients was characterized by obtaining samples of the biofilm adhered to the dental prothesis and saliva, for detection of major pathogens using PCR. The possibility of inter-relationships between different microorganisms was determined using the chi-square test and Mann-Whitney test. There were differences in the occurrence of Prevotella intermedia and Enterobacteriaceae in the saliva of edentulous patients, likewise, Enterobacteriaceae, Pseudomonas, Camphylobacter rectus and the biofilm attached to denture patients. The conditions for oral hygiene and stat of preservation of prosthesis total precarious favored the occurrence of yeasts of the Candida sp, particularly Candida albicans, statistically significant levels in samples of mucosa and biofilm acceded to total prosthesis, prothetic device, making it a potential reservoir of enteric bacteria and yeasts that may be of relevance in the pathogenesis of opportunistic infections.

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:03:00Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo1599_1.pdf: 10160665 bytes, checksum: 18093a04cd5f95193e064e8b75b921af (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2010 / Universidade Federal de Pernambuco / O resultado de óbitos mal-definidos torna indispensável à necropsia para que seja elucidada a causa morte. Dessa forma, este estudo visou verificar infecções fúngicas isoladas ou em associação com outras doenças relacionadas ao óbito, bem como dados epidemiológicos que possam ter contribuído. Durante a necropsia, foram realizados exames micológicos e histopatológicos. Os órgãos acometidos por fungos foram pulmões, cérebro, rim, meninges, fígado e coração, sendo diagnosticadas post mortem aspergilose, candidíase, fusariose e trichosporonose. Os indivíduos eram de ambos os sexos, com idade variando de 29 a 91 anos e desempenhavam variadas ocupações. Diabetes mellitus, tuberculose, esquistossomose, cardiopatia, hipertensão intracraniana, neoplasia cerebral, insuficiência renal foram doenças de base associadas às infecções fúngicas. Os dados refletem a dificuldade diagnóstica e terapêutica dessas infecções e confirmam a importância da necropsia

Orientador: Oslei Paes de Almeida / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba / Made available in DSpace on 2018-07-23T14:13:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Vargas_PabloAgustin_M.pdf: 6507911 bytes, checksum: 90dfb46fb14f48379fefb67aeec0d821 (MD5) Previous issue date: 1998 / Resumo: O objetivo deste estudo foi avaliar as alterações anatomopatológicas das glândulas salivares maiores de 32 pacientes aidéticos autopsiados e de 13 que morreram por outras causas. As autópsias foram realizadas no SVOC (Serviço de Verificação de Óbitos da Capital) -FMUSP(Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo) em 1996 e 1997, seguindo os preceitos éticos e técnicos do local. As glândulas salivares maiores foram dissecadas, cortadas em seis fragmentos e os cortes histológicos corados em H/E, Grocott e ZiehlNielsen. No grupo HIV negativo observou-se em três casos sialadenite discreta crônica na parótida. Nas parótidas do grupo aidético observou-se seis casos de tuberculose, um de criptococose e um de citomegalovirose. Sialadenite esteve presente em 18 casos na parótida, 17 na submandibular e 15 na sublingual. Não foram encontradas lesões císticas ou neoplásicas. Os linfonodos intraparotídeos do grupo aidético apresentaram: depleção de linfócitos em 07 casos; granulomas com bacilos de Koch em 06 e inclusão de tecido glandular nos linfonodos em 07casos. Em 92% dos casos o nível de linfócitos CD4 no sangue dos indivíduos aidéticos esteve abaixo de 200 cels/ 'mu'l. A etiologia da sialadenite crônica em pacientes aidéticos ainda precisa ser melhor determinada. Tuberculose, criptococose e citomegalovirose, ocorreram apenas na parótida. Estas doenças não estavam localizadas na parótida exclusivamente, envolvendo também outros órgãos. Um maior número de casos está sendo avaliado, para melhor determinar a incidência de doenças nas glândulas salivares de pacientes aidéticos / Abstract: This study describes the alterations found in the major salivary glands of 32 patients who died of AIDS and of 13 who died for other reasons. Sialadenitis occurred in the parotid of 23% cases of the control group, and in 54%, 51 % and 45% cases of the parotid, submandibular and sublingual glands respectively, of the patients with human immunodeficiency virus infection. Six cases of tuberculosis, one of cryptococosis, one citomegalovirus infection were found in the parotid of the HIV positive patients. Intraparotid lymph nodes showed depletion of lymphocytes in 7 and inclusion of glandular tissue in 7 cases of immunodeficient patients. Tuberculosis in the salivary glands is well documented in the literature, but in HIV positive it is rarely described. It is also important to consider that the alterations of the major salivary glands here described had not been diagnosed clinically / Mestrado / Biologia e Patologia Buco-Dental / Mestre em Odontologia

Orientador: Maria Luiza Moretti-Branchini / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-07-27T12:40:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Trabasso_Plinio_D.pdf: 33454772 bytes, checksum: 929d6b15891369e193a83b4f0a4d2cc1 (MD5) Previous issue date: 2001 / Resumo: Receptores de transplante de medula óssea constituem uma população de alto risco para ocorrência de infecções fúngicas invasivas (IFI). O conhecimento das características epidemiológicas locais é fundamental para a defInição das estratégias de prevenção. Foi feito um estudo retrospectivo que envolveu 115 pacientes, 91 receptores de enxerto alogênico e 24 receptores de enxerto autólogo, nos quais foram detectadas 15 (13,0%) IFI, 8 (53,3%) delas com identificação microbiológica do patógeno. As fungemias (n=8; 53,3%) e as sinusites (n=4; 26,7%) foram as localizações mais freqüentes. Cinco (62,5%) infecções foram causadas por espécies de Candida e 2 (25,0%) foram causadas por Fusarium sp. Dentre as espécies de Candida, 60,0% eram não-albicans. Cinqüenta e dois (45,2%) pacientes apresentaram colonização fúngica; receptores de enxerto alogênico apresentaram maior proporção (52,7%) de colonização do que receptores de enxerto autólogo (16,7%) (p=O,003). O fator de risco independente para ocorrência de IFI nos receptores de enxerto alogênico, identificado por regressão logística multivariada, foi neutropenia prolongada (p<0,001; OR=I,17 [IC95%=1,04-1,24]), enquanto que a não realização de irradiação corporal total no condicionamento agiu como fator independente de proteção ao desenvolvimento de IFI (P=O,021; OR=0,16 [IC95%=0,03-0,76). Através de análise de regressão logística multivariada, encontramos que mucosite prolongada foi fator de risco independente para ocorrência de colonização fúngica entre os receptores de enxerto alogênico (P=O,014; OR=I,l1 [IC95%=1,02-1,21]). A mortalidade atribuível à IFI foi 20,0%. Não houve diferença na sobrevida entre pacientes com ou sem IFI (P=0,173) / Abstract: Bone marrow transplant (BMT) recipients are at high risk for developing invasive fungal infections. Deep and prolonged immunosupression have been associated conditions to increase the number of invasive fungal infections in this population. The study of the local and specific epidemiology of these immunosuppressive patients has been an important issue for the treatment and application of preventive measures to reduce the risk of infections. The aim of this study was to evaluate the epidemiology of fungal infections in patients hospitalized in the BMT unit of the Hospital das Clínicas-UNICAMP. Diagnose of invasive fungal infections were made according to the EORTCINIAID criteria. One hundred and fifteen BMT patients, 91 allogenic and 24 autologous recipients were evaluated. Fifteen invasive fungal infections were detected and 8 (53.3%) had microbiological identification of the pathogens. Fungemia (n=8) and sinusitis (n=4) were the most prevalent funga! infections in our study. Five (62.5%) invasive fungal infections were caused by Candida spp. (C. parapsilosis=3) and two (25.0%) by Fusarium sp. Fifty-two (45.2%) patients had fungal colonization. Fungal colonization was more frequent in allogeneic BMT recipients (52.7%) than in autologous recipients (16.7%) (p=O.003). Independent risk factors for invasive fungal infections in allogeneic recipients, identified by multivariate analysis, were prolonged neutropenia (p<0.001) and total body irradiation in the conditioning regimen (P=O.021).The attributable mortality due to fungal infection was 20.0%. There was no difference in survival between patients with or without deep fungal infections (P=O.173) / Doutorado / Clinica Medica / Doutor em Clínica Médica

Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-03-14T11:15:18Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Vanda S. Q. Dini.pdf: 3327102 bytes, checksum: 159dd47f2d164189acf76615ebf5f409 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-03-14T11:15:34Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Vanda S. Q. Dini.pdf: 3327102 bytes, checksum: 159dd47f2d164189acf76615ebf5f409 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-03-14T11:15:51Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Vanda S. Q. Dini.pdf: 3327102 bytes, checksum: 159dd47f2d164189acf76615ebf5f409 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-14T11:15:51Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Vanda S. Q. Dini.pdf: 3327102 bytes, checksum: 159dd47f2d164189acf76615ebf5f409 (MD5) Previous issue date: 2016-10-04 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / Introduction: Pseudomonas aeruginosa resistant to multiple antibiotics (MDR , multi-drugresistance and PDR , pan-drug-resistance ) is a frequent etiologic agent of nosocomial infections, mainly affecting immunocompromised patients, such as those admitted to the Intensive Care Unit (ICU). Objectives: (1) Detect P. aeruginosa resistant to multiple antimicrobials in patients, professionals and hospital environment; (2) Identify genetic factors that confer antibiotic resistance such as integrons, gene cassettes and genes encoding enzymes β-lactamases; and (3) Detect clonal groups among isolates MDR/PDR. Methods: Samples were collected samples from patients, professionals and structures in ICUs of Hospitals 28 de Agosto (HPS28), Francisca Mendes (HUFM) e João Lúcio Pereira Machado (HPSJL), which were isolated and identified strains of P. aeruginosa by classical and molecular microbiological methods (amplification and sequencing of the 16S rRNA gene); The antimicrobial resistance profile was determined by disk diffusion technique; The research groups was determined by clonal genetic similarity among isolates MDR/PDR by PFGE; The detection of genes that encode resistance (integrons, gene cassettes and β-lactamases enzymes) was performed by PCR and confirmed by RFLP and/or genetic sequencing. Results: The phenotypes MDR and PDR were detected, respectively, 13.3 % and 1.2 % of the isolates. In 32 (38.5%) were detected class integrons 1. Of these, three (3.6%) were also positive for integrons class intengrons 2. The presence of the isolates showed statistical correlation (P<0.05) with significant phenotypic resistance to the tested drugs. A high frequency of integrons contained no genetic cassette or carried only genes that encode resistance to aminoglycosides streptomycin and spectinomycin and trimethoprim. The β- lactamase showed the production of enzyme KPC -2 study (66,7%), VIM (8.3%) and OXA - 50 (100%) P. aeruginosa isolates MDR/PDR. Two clonal groups were detected among MDR/PDR isolates, indicating clonal intra and inter-hospital. Conclusion: The isolation of P. aeruginosa from hospitals studied shows that these pathogens, which can cause severe nosocomial infections, in particular MDR and PDR strains are spreading in a hospital environment. Moreover, it appears that the presence of genetic elements such as integrons, gene cassettes and genes encoding β-lactamases are correlated to the resistance fenótops these isolates and therefore potential genetic mechanisms that confer antimicrobial resistance. Nevertheless, further studies are needed to assess the contribution of other molecular mechanisms and the selective pressure exerted by antimicrobial agents that contribute to the development of these phenotypes. / Introdução: Pseudomonas aeruginosa resistente a múltiplos antimicrobianos (MDR, multidrug- resistance e PDR, pan-drug-resistance) é um agente etiológico frequente em infecções hospitalares, acometendo principalmente pacientes imunossuprimidos, tal como os internados em Unidade de Tratamento Intensivo (UTI). Objetivos: (1) Detectar P. aeruginosa resistente a múltiplos antimicrobianos em pacientes, profissionais e estruturas hospitalares; (2) identificar fatores genéticos que conferem resistência antimicrobiana, tais como integrons, cassetes gênicos e genes codificadores de enzimas β-lactamases; e (3) Detectar grupos clonais entre os isolados MDR/PDR. Metodologia: Foram realizadas coletas de amostras de pacientes, profissionais e estruturas de UTIs dos Hospitais 28 de Agosto (HPS28), Francisca Mendes (HUFM) e João Lúcio Pereira Machado (HPSJL), dos quais foram isoladas e identificadas cepas de P. aeruginosa por metodologia microbiológica clássica e molecular (amplificação e sequenciamento do gene 16s rRNA); O perfil de resistência aos antimicrobianos foi determinado pela técnica de disco-difusão; A pesquisa de grupos clonais foi determinada por similaridade genética entre os isolados MDR/PDR por PFGE; A detecção de genes que codificam resistência (integrons, cassetes gênicos e enzimas β-lactamases) foi realizada por PCR e confirmadas por RFLP e/ou sequenciamento genético. Resultados: Os fenótipos MDRs e PDR foram detectados em, respectivamente, 13,3% e 1,2% dos isolados estudados. Em 32 (38,5%) foram detectados integrons de classe 1. Destes, três (3,6%) também foram positivos para integrons de classe 2. A presença de intengrons nos isolados estudados demonstra correlação estatística (P<0,05) significativas com os fenótipos de resistência aos fármacos testados. Uma alta frequência de integrons não continha cassete gênico ou apenas carregava genes que codificavam resistência aos aminoglicosídeos estreptomicina e espectinomicina e ao trimetropin. A pesquisa de β-lactamases revelou a produção de enzimas KPC-2 (66,7%), VIM (8,3%) e OXA-50 (100%) por isolados de P. aeruginosa MDR/PDR. Dois grupos clonais foram detectados entre os isolados MDR/PDR estudados, indicando disseminação clonal inter e intrahospitalares. Conclusão: O isolamento de P. aeruginosa a partir dos hospitais estudados evidencia que esses patógenos, capazes de causar graves infecções nosocomiais, em especial, cepas MDR e PDR, estão se disseminando em ambiente hospitalar. Além disso, constata-se que a presença de elementos genéticos como integrons, cassetes gênicos e genes codificadores de β-lactamases estão correlacionadas aos fenótops de resistência nesses isolados, sendo, portanto, mecanismos genéticos potenciais capazes de conferir resistência antimicrobiana. Apesar disso, estudos futuros são necessários para avaliar a contribuição de outros mecanismos moleculares e a pressão seletiva exercida pelos antimicrobianos que contribuem para o desenvolvimento destes fenótipos.