• Refine Query
  • Source
  • Publication year
  • to
  • Language
  • 112
  • 109
  • 54
  • 46
  • 12
  • 4
  • 3
  • Tagged with
  • 340
  • 224
  • 56
  • 32
  • 23
  • 20
  • 20
  • 20
  • 20
  • 18
  • 17
  • 17
  • 17
  • 17
  • 16
  • About
  • The Global ETD Search service is a free service for researchers to find electronic theses and dissertations. This service is provided by the Networked Digital Library of Theses and Dissertations.
    Our metadata is collected from universities around the world. If you manage a university/consortium/country archive and want to be added, details can be found on the NDLTD website.
221

Dynamic analyses of hollow core slabs : Experimental and numerical analyses of an existing floor / Dynamiska analyser av håldäcksbjälklag : Experimentell och numerisk analys av ett befintligt golv

Hansell, Markus, Tamtakos, Panagiotis January 2020 (has links)
For intermediate floors in residential and office buildings, as well as in parking garages and malls, there is a wide use of hollow core concrete slabs in Sweden today. Hollow core slabs are precast and prestressed concrete elements with cylindrical-shaped voids extending along the length of the slab. These structural elements have the advantage compared to cast-in-situ concrete slabs that they have a high strength, due to the prestressing, and that the voids allow for a lower self-weight. Additionally, the voids allow for a reduction in the use of concrete material. These characteristics offer possibilities to build long-span floors with slender designs. However, a consequence of the slenderness of the slabs is that such floors have an increased sensitivity to vibrations induced by various dynamic loads. In residential and office buildings vibrations are primarily caused by human activity, and therefore concerns related to the serviceability of such floors are raised. These vibrations are often not related to problems with structural integrity, but rather to different aspects of comfort of the residents or workers. The aim of this thesis is to provide additional information regarding the dynamic behavior of hollow core floors. An experimental modal analysis has been performed on an existing floor in an office building. The dynamic properties in the form of natural frequencies, mode shapes, damping ratios and frequency response functions were derived and analyzed from these measurements. Subsequently, several finite element models were developed, aiming to reproduce the experimental dynamic behavior of the studied floor. The measurements initially showed some unexpected dynamic responses of the floor. For this reason, more advanced methods of signal analyses were applied to the data. The analyses showed that the slab has some closely spaced modes and that the modes of the floor are complex to a certain degree. The finite element models were studied with different configurations. In particular, the effect the model size, boundary conditions, material properties and potential structural discontinuities have on the dynamic response of the slab was studied. Sufficiently good agreement has been achieved between the experimental and numerical results in terms of natural frequencies and mode shapes. The acceleration amplitude responses of the numerical models were generally higher than the ones obtained from the measurements, which leads to difficulties in matching of the frequency response functions. / Håldäck i betong används idag i stor utsträckning som bjälklag i bostads- och kontorsbyggnader, liksom i parkeringsgarage och köpcentra. Håldäcksbjälklag består av prefabricerade och förspända betongelement, med cylindriska hål som sträcker sig i plattans längsriktning. Dessa konstruktionselement har fördelen, jämfört med platsgjutna betongplattor, att de har en hög hållfasthet på grund av förspänningen och att hålen möjliggör en lägre egenvikt. Dessutom gör hålen att en mindre mängd betongmaterial behövs. Dessa egenskaper ger möjligheter att bygga golv med långa spännvidder och slank design. En konsekvens av slankheten är emellertid att sådana golv har en ökad känslighet för vibrationer som orsakas av olika dynamiska belastningar. I bostads- och kontorsbyggnader orsakas vibrationer främst av mänsklig aktivitet, och därför finns det en del oro relaterad till sådana golvs brukbarhet. Dessa vibrationer är oftast inte relaterade till frågor om strukturell integritet, utan snarare till olika aspekter av boendes eller arbetares känsla av komfort. Syftet med detta examensarbete är att bidra till kunskapen om håldäcksbjälklags dynamiska beteende. En experimentell modalanalys har utförts på ett befintligt golv i en kontorsbyggnad. De dynamiska egenskaperna i form av egenfrekvenser, modformer, dämpning och frekvenssvarsfunktioner erhölls och analyserades med hjälp av dessa mätningar. Därefter utvecklades flera finita element modeller för att reproducera det experimentellt uppmätta dynamiska beteendet hos det studerade golvet. Mätningarna visade initialt något oväntade dynamiska responser från golvet. Av denna anledning applicerades mer avancerade signalanalysmetoder på datan. Analyserna visade att plattan har några moder inom ett litet frekvensintervall och att moderna till en viss grad är komplexa. De finita element modellerna studerades med olika konfigurationer. I synnerhet studerades effekten av modellstorleken, randvillkoren, materialegenskaperna och potentiella strukturella diskontinuiteter på golvets dynamiska respons. Tillräckligt bra överensstämmelse har uppnåtts mellan de experimentella och numeriska resultaten i form av egenfrekvenser och modformer. Accelerationsamplituderna för de numeriska modellerna var i allmänhet högre än de som erhölls under mätningarna, vilket leder till svårigheter att matcha frekvenssvarsfunktionerna.
222

Performance Optimization of Signal Processing Algorithms for SIMD Architectures

Yagneswar, Sharan January 2017 (has links)
Digital Signal Processing(DSP) algorithms are widely implemented in real time systems.In fields such as digital music technology, many of these said algorithms areimplemented, often in combination, to achieve the desired functionality. When itcomes to implementation, DSP algorithms are performance critical as they havetight deadlines. In this thesis, performance optimization using Single InstructionMultiple Data(SIMD) vectorization technique is performed on the ARM Cortex-A15 architecture for six commonly used DSP algorithms; Gain, Mix, Gain and Mix,Complex Number Multiplication, Envelope Detection and Cascaded IIR Filter. Toensure optimal performance, the instructions should be scheduled with minimalpipeline stalls. This requires execution time to be measured with fine time granularity.First, a technique of accurately measuring the execution time using thecycle counter of the processor’s Performance Management Unit(PMU) along withsynchronization barriers is developed. It was found that the execution time measuredby using the operating system calls have high variations and very low timegranularity, whereas the cycle counter method was accurate and produced reliableresults. The cost associated with the cycle counter method is 75 clock cycles. Usingthis technique, the contribution by each SIMD instruction towards the executiontime is measured and is used to schedule the instructions. This thesis also presentsa guideline on how to schedule instructions which have data dependencies usingthe cycle counter timing execution time measurement technique, to ensure that thepipeline stalls are minimized. The algorithms are also modified, if needed, to favorvectorization and are implemented using ARM architecture specific SIMD instructions.These implementations are then compared to that which are automaticallyproduced by the compiler’s auto-vectorization feature. The execution times of theSIMD implementations was much lower compared to that produced by the compilerand the speedup ranged from 2.47 to 5.11. Also, the performance increaseis significant when the instructions are scheduled in an optimal way. This thesisconcludes that the auto-vectorized code does poorly for complex algorithms andproduces code with a lot of data dependencies causing pipeline stalls, even with fulloptimizations enabled. Using the guidelines presented in this thesis for schedulingthe instructions, the performance of the DSP algorithms have significant improvementscompared to their auto-vectorized counterparts. / Digitala signalbehandlingsalgoritmer(DSP) implementeras ofta i realtidssystem. Inomfält som exempelvis digital musikteknik används dessa algoritmer, ofta i olika kombinationer,för att ge önskad funktionalitet. Implementationen av DSP-algoritmerär prestandakritisk eftersom systemen ofta har små tidsmarginaler. I det härexamensarbetet genomförs prestandaoptimering med Single Instruction MultipleData(SIMD)-vektorisering på en ARM A15-arkitektur för 6 vanliga DSP-algoritmer;volym, mix, volym och mix, multiplikation av komplexa tal, amplituddetektering,och seriekopplade IIR-filter. Maximal optimering av algoritmerna kräver ocksåatt antalet pipeline stalls i processorn minimeras. För att kunna observera dettakrävs att exekveringstiden kan mätas med hög tidsupplösning. I det här examensarbeteutvecklas först en teknik för att mäta exekveringstiden med hjälp aven klockcykelräknare i processorns Performance Management Unit(PMU) tillsammansmed synkroniseringsbarriärer. Tidsmätning med hjälp av operativsystemsfunktionervisade sig ha sämre noggrannhet och tidsupplösning än metoden medatt räkna klockcykler, som gav tillförlitliga resultat. Den extra exekveringstidenför klockcykelräkning uppmättes till 75 klockcykler. Med den här tekniken är detmöjligt att mäta hur mycket varje SIMD-instruktion bidrar till den totala exekveringstiden.Examensarbete presenterar också en metod att ordna instruktioner somhar databeroenden sinsemellan med hjälp av ovanstående tidsmätningsmetod, såatt antalet pipeline stalls minimeras. I de fall det behövdes, skrevs koden till algoritmernaom för att bättre kunna utnyttja ARM-arkitekturens specifika SIMDinstruktioner.Dessa jämfördes sedan med resultaten från kompilatorns automatgenereradevektoriseringkod. Exekveringstiden för SIMD-implementationerna varsignifikant kortare än för de kompilatorgenererade och visade på en förbättring påmellan 2,47 och 5,11 gånger, mätt i exekveringstid. Resultaten visade också på entydlig förbättring när instruktionerna exekveras i en optimal ordning. Resultatenvisar att automatgenererad vektorisering presterar sämre för komplexa algoritmeroch producerar maskinkod med signifikanta databeroenden som orsakar pipelinestalls, även med optimeringsflaggor påslagna. Med hjälp av metoder presenteradei det här examensarbete kan prestandan i DSP-algoritmer förbättras betydligt ijämförelse med automatgenererad vektorisering.
223

Vom Lernen und Verlernen: Methodenhandbuch zur rassismuskritischen Aufarbeitung des NSU-Komplex

Zimmermann, Hannah, Klaus, Martina 12 April 2023 (has links)
Den NSU als Komplex (#NSU-Komplex) zu begreifen, bedeutet, dessen gesellschaftliche Entstehungsbedingungen zu verstehen und aus den Erkenntnissen Schlüsse für gelingende Präventionsarbeit zu ziehen. Das zentrale Ziel, das wir in diesem Methodenhandbuch für die Bildungsarbeit verfolgen, ist das Kennenlernen und die Sichtbarkeit der Betroffenenperspektiven nach dem Ansatz „Zuhören, Vertiefen, Aktiv werden“ von Ayşe Güleç und Fritz Laszlo Weber.1 In den Fokus gerückt werden die Lebensgeschichten und die Perspektiven der Angehörigen von Enver Şimşek, Abdurrahim Özüdoğru, Süleyman Taşköprü, Habil Kılıç, Mehmet Turgut, İsmail Yaşar, Theodoros Boulgarides, Mehmet Kubaşık, Halit Yozgat und Michèle Kiesewetter. Lehrkräfte und Multiplikator:innen sollen sich mit dem hier zur Verfügung gestellten Material ermutigt fühlen, mit jungen Menschen die Geschichten der Opfer des NSU zu erarbeiten, Migrationsgeschichte und -gegenwart in Deutschland kennenzulernen und sich mit Rassismus und seiner Wirkungsweise anhand des NSU-Komplexes auseinanderzusetzen.
224

Chybná oprava DNA a poruchy v metabolismu RNA spojené s lidským neurologickým onemocněním / Defects in DNA repair and RNA metabolism associated with human neurological disorders

Cihlářová, Zuzana January 2022 (has links)
The human genome is constantly under the attack by various damaging agents, leading to the breakage of one or both strands of DNA that might interfere with RNA processing. Importantly, our cells have evolved diverse mechanisms to rapidly repair various DNA lesions, highlighting the importance of genetic integrity. Defects in DNA repair and/or RNA metabolism can lead to a variety of human hereditary diseases, with pathologies including growth and developmental defects, immunodeficiency, predisposition to cancer, and neurodegeneration. Mutations in the BRAT1 (BRCA1-associated ATM activator-1) protein have been associated with neurological disorders characterized by heterogenous phenotypes with varying levels of clinical severity ranging from microcephaly, hypertonia, epilepsy, seizures, and early death in the first two years of life to mild cerebellar atrophy and ataxia. Previously, BRAT1 protein has been implicated in the cellular response to DNA double-strand breaks and ATM signalling. However, the exact mechanism/s by which mutations in BRAT1 gene trigger neurological disorders are largely unknown. Recently, we have identified a homozygous missense c.185T>A (p.Val62Glu) variant in BRAT1 that markedly reduced the level of BRAT1 protein in patient-derived cell lines. Surprisingly, our data show that...
225

Škola, základ života - Soubor školských staveb v Ostravě na Černé louce / School, the Foundation of Life – a Complex of Educational Buildings in Ostrava, Cerna louka

Linderová, Ivana January 2014 (has links)
Diploma thesis was to design a complex of school buildings near the historic city center of Ostrava, which includes three levels of education, from preschool age to high school students. The main goal is to find a suitable form of functional and operational design of the building in relation to the modern forms of education with regards to the different mental and physical development of these three age groups of children.
226

Machine Learning Methods for Segmentation of Complex Metal Microstructure Features

Fredriksson, Daniel January 2022 (has links)
Machine learning is a growing topic with possibilities that seems endless with growing areas of applications. The field of metallography today is highly dependent on the operators’ knowledge and technical equipment to perform segmentation and analysis of the microstructure. Having expert dependents is both costly and very time-consuming. Some automatic segmentation is possible using SEM but not for all materials and only having to depend on one machine will create a bottleneck. In this thesis, a traditional supervised machine learning model has been built with a Random Forest (RF) classifier. The model performs automatic segmentation of complex microstructure features from images taken using light optical- and scanning electron microscopes. Two types of material, High-Strength-Low-Alloy (HSLA) steel with in-grain carbides and grain boundary carbides, and nitrocarburized steel with different amounts of porosity were analyzed in this work. Using a bank of feature extractors together with labeled ground truth data one model for each material was trained and used for the segmentation of new data. The model trained for the HSLA steel was able to effectively segment and analyze the carbides with a small amount of training. The model could separate the two types of carbides which is not possible with traditional thresholding. However, the model trained on nitrocarburized steel showcased difficulties in detecting the porosity. The result was however improved with a different approach to the labeling. The result implies that further development can be made to improve the model. / Maskininlärning är ett växande område där möjligheterna verkar oändliga med växande applikationsområden. Området för metallografi är idag till stor utsträckning beroende av operatörens kunskap och de tekniska instrumenten som finns tillgängliga för att genomföra segmentering och analys av mikrostrukturen. Viss automatisk segmentering är möjlig genom att använda SEM, men det är inte möjligt för alla material samt att behöva vara beroende av endast en maskin kommer skapa en flaskhals. I denna uppsats har en traditionell övervakad maskininlärnings modell skapats med en Random Forest klassificerare. Modellen genomför automatisk segmentering av komplexa mikrostrukturer på bilder från både ljusoptiskt- och svepelektron-mikroskop. Två olika typer av material, Hög-Styrka-Låg-Legerat (HSLA) stål med karbider och korngräns karbider, samt nitrokarburerat stål med varierande mängd porositet analyserades i detta arbete. Genom användningen av en särdragsextraktions bank tillsammans med annoterad grundsannings data tränades en modell för vartdera materialet och användes för segmentering av ny bild data. Modellen som tränades för HSLA stålet kunde effektivt segmentera och analysera karbiderna med en liten mängd träning. Modellen kunde separera de två typerna av karbider vilket inte varit möjligt med traditionellt tröskelvärde. Den modell som tränades för det nitrokarburerade stålet visade emellertid upp svårigheter i att detektera porositeten. Resultatet kunde dock förbättras genom ett annorlunda tillvägagångssätt för annoteringen. Resultatet vittnar om att vidareutveckling kan göras för att förbättra slutresultatet.
227

Feasibility of Life Cycle Assessment for Complex Medical Devices / Genomförbarhet av livscykelanalys för komplexa medicintekniska produkter

Svensson, Sofia January 2017 (has links)
The interest in environmental issues is increasing and for this reason, assessing the potential environmental impacts of a product or system is of interest. A methodology developed for this particular purpose is the life cycle assessment, also known as LCA. It is not purely of interest these aspects are investigated though, as increasing requirements on organizations also matter. The purpose of this thesis was to investigate the feasibility to implement the methodology of LCA in the aspect of complex medical devices. To do this, the framework for the methodology has been reviewed and a case study performed. The case study comprised of conducting an LCA study on the radiosurgery device Leksell Gamma Knife® IconTM.  The outcome of the investigation showed that conducting an LCA study means a wide range of aspects need to be considered and specified to a high degree. A particular issue was the data requirements, as obtaining data meeting several objectives was challenging. The modeling was also identified as a difficulty. Tools such as software and databases with predefined processes were used, though as complex medical devices can use materials not common in other fields, a lack of appropriate predefined processes hinders the feasibility. The conducted case study was able to attain valuable insights even though the study did not comply with the standards providing the framework, the ISO 14040 series. To conduct a compliant LCA study for complex medical devices, extensive resources would be required as well as the involvement of relevant parties along the supply chain. It is seen improbable to achieve a compliant study the first time a particular type of complex medical device is investigated. However, it is believed the feasibility would increase as studies are repeated, as the data quality is likely to increase. Advancements of the tools, as well as ongoing research on the environmental impacts of more materials, are other factors thought to increase the feasibility of conducting LCA studies on complex medical devices in the future. / Intresset för miljöfrågor ökar och därav finns det ett intresse att undersöka vad den potentiella miljöpåverkan är för en produkt eller ett system. En metodologi utvecklad för detta specifika syfte är livscykelanalys som även kallas LCA. Det är inte enbart utav intresse som aspekterna utreds, de ökande krav som ställs på olika aktörer spelar också roll. Syftet med detta examensarbete var att undersöka genomförbarheten av livscykelanalyser med avseende på komplexa medicintekniska produkter. Detta gjordes genom att granska regelverken för LCA samt genomförandet av en fallstudie, vilken utgjordes av en livscykelanalys på strålkniven Leksell Gamma Knife® IconTM. Resultaten av undersökningen visade att genomförandet av en livscykelanalys innebär att ett stort spann av aspekter måste beaktas och specificeras i hög grad. Ett särskilt problem var kraven på data då det var utmanande att samla in data som skulle möta flera behov. En annan identifierad svårighet var modelleringen. Verktyg användes i form av mjukvara och databaser med fördefinierade processer men då komplexa medicintekniska produkter kan bestå av material som inte är vanliga inom andra områden, var bristen på passande fördefinierade processer ett hinder för genomförbarheten. Den genomförda fallstudien gav värdefulla resultat trots att den inte var utförd helt enligt standarderna i ISO 14040 serien. För att en LCA studie för komplexa medicintekniska produkter skall möta dessa krav krävs omfattande resurser och att flera berörda parter längs försörjningskedjan involveras. Det ses därför som osannolikt att en studie som genomförs för första gången på en viss typ av komplex medicinteknisk produkt kan leva upp till regelverket. Dock så förmodas genomförbarheten öka i takt med att studier upprepas, då kvaliteten på data tros öka. Utveckling av verktygen samt pågående forskning om miljöpåverkan från olika material är andra faktorer som anses öka genomförbarheten av livscykelanalyser på komplexa medicintekniska produkter i framtiden.
228

Utveckling av ny teknik för hjärtpulsdetektion / Development of new heart pulse detection technology

Zaeid, Jabar, Lind, Andreas January 2017 (has links)
In this thesis we suggest a technique for detecting pulses by signal processing of a raw ECG signal registered from 4 electrodes located on the left upper arm. The signal processing is performed in Matlab and consists of normalization, lowpass filtering, highpass filtering, derivation, squaring and a moving average window to reduce interference. The technology is capable of extracting periods between heartbeats after an implemented detection algorithm. The thesis also includes reflections on the types of interferences that may affect an electrical development equipment and also methods of how major parts of the interference can be reduced by different shields. Before the technique is applied in a final product, further tests may need to be performed during the monitoring of a person's pulse. Finally, we believe that our development of pulse detection is the beginning of a new technology that in the future can save lives. / I den här rapporten föreslår vi en teknik för att detektera pulser med hjälp av att signalbehandla en rå EKG-signal registrerad från 4 elektroder placerade på vänster överarm. En signalbehandling utförd i Matlab som bland annat består av normering, lågpassfiltrering, högpassfiltrering, derivering, kvadrering samt ett glidande medelvärdesfönster för att reducera störningar. Tekniken är kapabel till att utvinna tider mellan hjärtslag efter en implementerad detekteringsalgoritm. Rapporten innefattar även reflektioner kring vilka typer av störningar som kan påverka en elektrisk utvecklingsutrustning samt metoder för hur större delar av störningarna kan reduceras med hjälp av olika skärmningar. Innan tekniken appliceras i en slutlig produkt kan ytterligare tester behöva utföras under monitorering av en persons puls. Slutligen anser vi att våran utveckling av pulsdetektion är en början på en ny teknik för att kunna rädda liv.
229

ATT LEVA EFTER DÖDEN : En kvalitativ studie om professionellas erfarenheter av vuxnas sorg efter en närståendes död / LIVING AFTER DEATH : A qualitative study on professionals' experiences of adults' grief after the death of a loved one

Ojanne, Claudia, Wulff, Madeleine, Öz, Patricia January 2024 (has links)
Studiens syfte är att utifrån professionellas erfarenheter undersöka hur vuxnas sorgeprocesser yttrar sig samt hur de professionella bemöter sörjande personer. Undersökningen baseras på professionellas erfarenheter och kunskaper om sorgeprocesser. Sju semistrukturerade intervjuer har genomförts med professionella som alla i sin yrkesroll möter vuxna i sorg. En tematisk analys har använts och fem teman framkom: vuxnas sorgeprocesser, förhållningssätt gentemot sörjande, lyssnande och validerande stöd, stöd i sorgen och verktyg i professionen. För att analysera resultatet användes Kübler-Ross teori om sorgens fem faser och begreppet komplicerad sorg. Kübler-Ross teori fokuserar på sorgeprocessens faser. Den komplicerade sorgen fokuserar på när sorg kvarstår med patologiska symptom. I resultatet framgick att de professionella upplevde sorgeprocessen som dynamisk och kontextbunden. Professionellas främsta förhållningssätt i bemötande har bland annat presenterats vara värderingsfritt och anpassat. Professionella har uttryckt att vuxna människor i sorg behöver ett icke tidsbegränsat, närvarande och anpassat stöd. Dessutom har professionellas utbildning och erfarenhet visat sig utgöra verktyg i professionen och vara nyckeln till ett adekvat och gynnsamt sorgestöd. / The purpose of the study is to examine professional’s experiences of adult’s grieving processes and how they treat bereaved people. Seven semi-structured interviews were conducted with professionals who all in their professional role meet adults in grief. A thematic analysis was used and five themes emerged: adults' grieving processes, attitudes towards grieving, listening and validating support, support in grief and tools in the profession. To analyze the results, Kübler-Ross' theory of the five phases of grief and the concept of complicated grief were used. Kübler-Ross theory focuses on the phases of the grieving process. The complicated grief focuses on when grief persists with pathological symptoms. The results showed that the grieving process of adults was experienced by professionals as dynamic and context-bound. Professionals' main approach towards grieving people has been presented as neutral and context dependant. Professionals have expressed that grieving adults need support that is not time limited and characterized by presence and adapted support. Furthermore, professional´s education and experiences have been shown to be elements in the profession that is key to adequate and beneficial bereavement support.
230

C/EBPα mediated epigenetic complex recruitment and exchange in lymphoid-myeloid transdifferentiation

Sapozhnikova, Valeriia 10 January 2024 (has links)
Das CCAAT/Enhancer-Binding-Protein α (C/EBPα) ist ein Transkriptionsfaktor, der das Zellschicksal des hämatopoetischen Systems bestimmt. C/EBPα reguliert die Selbsterneuerung hämatopoetischer Stammzellen und bestimmt die myelomonozytäre Zelldifferenzierung. C/EBPα besitzt zudem die Eigenschaft lymphoide Zellen in myeloischen Zellen zu transdifferenzieren. Die von C/EBPα induzierte lymphoid-myeloische Transdifferenzierung kann als Modellsystem dienen, um die Vorgänge der Linienfestlegung, der zellulären Plastizität sowie der Funktionen von C/EBPα in der Zelldifferenzierung und Leukämogenese zu untersuchen. C/EBPα ist ein unstrukturiertes Protein, das seine Funktionen durch wechselnde Proteininteraktionen ausübt. Intrinsisch unstrukturierte Proteine, wie C/EBPα, sind prädestiniert an schwachen, multivalenten und hochdynamischen Proteininteraktionen teilzunehmen. Solche Inter-aktionen werden hauptsächlich durch kurze lineare Motive der Protein-Primärstruktur vermittelt. Motiv-basierte Proteininteraktionen sind mit den herkömmlichen Methoden der Interaktom-Analyse schwer zu analysieren. Die Anwendung der neuartigen Biotin-Ligase basierten TurboID Methode mit schneller Enzym-Kinetik ermöglichte nun die Analyse eines dynamischen C/EBPα Interaktoms während der lymphoid-myeloiden Transdifferenzierung. Es wurde festgestellt, dass sich die Proteinexpression der meisten C/EBPα interagierenden Proteine während der Transdifferenzierung kaum änderte, trotz erheblicher Änderungen des C/EBPα Interaktoms, was eine Regulation durch alternative Mechanismen nahelegt. Es wurden mehrere epigenetische Komplexe gefunden, einschließlich Mediator, SWI/SNF und CAF-1, die als mögliche Verbindung zwischen Interaktom, Transkriptom, Chromatinstruktur und Phänotyp in Betracht gezogen werden können. / The CCAAT/enhancer binding protein α (C/EBPα) is a key lineage-instructive transcription factor in the haematopoietic system. C/EBPα regulates the self-renewal of haematopoietic stem cells and is one of the main determinants of myeloid commitment. C/EBPα induces transdifferentiation of B cells into myeloid cells. C/EBPα-induced lymphoid-myeloid transdifferentiation may serve as a model system to study lineage commitment and cellular plasticity as well as address open questions related to functions of C/EBPα in differentiation and leukaemogenesis. C/EBPα is an intrinsically disordered protein that exerts its functions through protein interactions. Intrinsically disordered proteins (IDPs) engage in highly dynamic, weak, and multivalent protein interactions, which are mediated by short linear motifs (SLiMs). SLiMs-based protein interactions are difficult to analyse by conventional methods of interactome analysis. However, to understand the connection between the C/EBPα interactome and its functions, analysis in the cellular context is required. The application of the novel biotin ligase TurboID with faster kinetics enabled the analysis of the dynamic interactome of C/EBPα in the process of lymphoid-myeloid transdifferentiation. For most of the interacting proteins, the protein level did not change, yet variable interactions were found, indicating regulated interactions. TurboID identified changes in the composition of the SWI/SNF complex during transdifferentiation, including the exchange of subunits specific for BAF and PBAF subcomplexes, Brg1 and Brm ATPases, and cell type-specific subunits. The analysis also identified the interaction pattern of the histone demethylase Kdm6b and functional assays confirmed its role in transdifferentiation. TurboID enabled the comparative analysis of the interactomes of C/EBPα isoforms and mutants, that alter the balance between differentiation and proliferation and its oncogenic functions.

Page generated in 0.0273 seconds