O mamão (Carica papaya L.) tem importância destacada na fruticultura e se encontra entre os seis principais produtos que somam mais de 50% da produção nacional desse setor. O mamão tem uma maturação relativamente rápida. Visando aumentar o potencial de comércio e possivelmente diminuir as perdas pós-colheita, a análise de imagens digitais é um recurso tecnológico para avaliar a tonalidade e intensidade da cor da casca dos frutos no período de maturação, que serve de base para estabelecer modelos funcionais para mensurações realizadas num período de tempo. Nesse contexto tem como motivação um estudo longitudinal envolvendo a avaliação da intensidade e tonalidade da cor da casca do mamão da espécie Carica papaya L. no período de maturação. Para a análise dos dados é utilizada a metodologia dos modelos lineares de efeitos mistos e para selecionar os modelos que melhor se ajustavam aos dados, utilizou-se teste da razão de verossimilhanças e teste F, em um método de seleção top-down. Verifica-se que modelo polinomial quadrático com efeito aleatório em todos os parâmetros descreve de maneira satisfatória a variável tonalidade. Para a variável intensidade obteve-se um modelo polinomial cúbico para os efeitos aleatórios e apenas o intercepto como parâmetro de efeito fixo. As análises de diagnóstico confirmaram o ajuste satisfatório dos modelos. / The papaya (Carica papaya L.) has important importance in fruticulture and is among the six main products that add up to more than 50% of the national production of this sector. Papaya has a relatively rapid maturation. In order to increase commercial potential and possibly reduce post-harvest losses, digital image analysis is a technological tool to evaluate the color tone and intensity of fruit peel during the maturation period, which serves as the basis for establishing functional models for measurements performed over a period of time. In this context it has as motivation a longitudinal study involving the evaluation of the intensity and color tone of the shell of the papaya of the species Carica papaya L. in the maturation period. For the analysis of the data the methodology of the linear models of mixed effects is used and to select the models that best fit the data, was used a test of the likelihood ratio and test F, in a method of selection top-down. It can be verified that the quadratic polynomial model with random effect in all the parameters describes in a satisfactory way the variable tonality. For the intensity variable we obtained a cubic polynomial model for the random effects and only the intercept as a fixed effect parameter. Diagnostic analyzes confirmed the satisfactory fit of the models.

COELHO-BARROS, E. A. Analise estatstica para dados de contagem longitudinais na presenca de covariaveis: Aplicações na area medica. Dissertação (mestrado) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto - USP, Ribeirão Preto - SP - Brasil, 2009. Dados de contagem ao longo do tempo na presenca de covariaveis são muito comuns em estudos na area da saude coletiva, por exemplo; numero de doenças que uma pessoa, com alguma caracteristica especifica, adquiriu ao longo de um período de tempo; numero de internações hospitalares em um período de tempo, devido a algum tipo de doença; numero de doadores de orgãos em um período de tempo. Nesse trabalho são apresentados diferentes modelos estatsticos de\\fragilidade\" de Poisson para a analise estatística de dados de contagem longitudinais. Teoricamente, a distribuição de Poisson exige que a media seja igual a variância, quando isto não ocorre tem-se a presenca de uma variabilidade extra-Poisson. Os modelos estatsticos propostos nesta dissertação incorporam a variabilidade extra-Poisson e capturam uma possvel correlação entre as contagens para o mesmo indivduo. Para cada modelo foi feito uma analise Bayesiana Hierarquica considerando os metodos MCMC (Markov Chain Monte Carlo). Utilizando bancos de dados reais, cedidos por pesquisadores auxiliados pelo CEMEQ (Centro de Metodos Quantitativos, USP/FMRP), foram discutidos alguns aspectos de discriminação Bayesiana para a escolha do melhor modelo. Um exemplo de banco de dados reais, discutido na Seção 4 dessa dissertação, que se encaixa na area da saude coletiva, e composto de um estudo prospectivo, aberto e randomizado, realizado em pacientes infectados pelo HIV que procuraram atendimento na Unidade Especial de Terapia de Doencas Infecciosas (UETDI) do Hospital das Clnicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo (HCFMRP-USP). Os esquemas terapêuticos estudados consistiam em zidovudina e lamivudina, associadas ao efavirenz ou lopinavir. Entre setembro de 2004 e maio de 2006 foram avaliados 66 pacientes, sendo 43 deles includos no estudo. Destes, 39 participantes alcançaram a semana 24 de acompanhamento, enquanto 27 atingiram a semana 48. Os grupos de pacientes apresentavam características basais semelhantes, quanto a idade, sexo, mediana de CD4 e carga viral. O interesse desse experimento e estudar a contagem de CD4 considerando os dois esquemas terapêuticos (efavirenz e lopinavir). / COELHO-BARROS, E. A. Analise estatstica para dados de contagem longitudinais na presenca de covariaveis: Aplicac~oes na area medica. Dissertac~ao (mestrado) - Faculdade de Medicina de Ribeir~ao Preto - USP, Ribeir~ao Preto - SP - Brasil, 2009. Longitudinal counting data in the presence of covariates is very common in many applications, especially considering medical data. In this work we present dierent \\frailty\"models to analyze longitudinal Poisson data in the presence of covariates. These models incorporate the extra-Poisson variability and the possible correlation among the repeated counting data for each individual. A hierarchical Bayesian analysis is introduced for each dierent model considering usual MCMC (Markov Chain Monte Carlo) methods. Considering reals biological data set (obtained from CEMEQ, Medical School of Ribeir~ao Preto, University of S~ao Paulo, Brazil), we also discuss some Bayesian discrimination aspects for the choice of the best model. In Section 4 is considering a data set related to an open prospective and randomized study, considering of HIV infected patients, free of treatments, which entered the Infection Diseases Therapy Special Unit (UETDI) of the Clinical Hospital of the Medical School of Ribeir~ao Preto, University of S~ao Paulo (HCFMRP-USP). The therapeutic treatments consisted of the drugs Zidovudine and Lamivudine, associated to Efavirenz and Lopinavir. The data set was related to 66 patients followed from September, 2004 to may, 2006, from which, 43 were included in the study. The patients groups presented similar basal characteristics in terms of sex, age, CD4 counting median and viral load. The main goal of this study was to compare the CD4 cells counting for the two treatments, based on the drugs Efavirenz and Lopinavir, recently adopted as preferencial for the initial treatment of the disease.

INTRODUÇÃO: Com o rápido envelhecimento populacional e o aumento no número absoluto de pessoas com demência, a identificação de fatores protetores que retardem o início do quadro clínico da doença é essencial para o planejamento de medidas preventivas efetivas. Estudos observacionais longitudinais com idosos em países desenvolvidos sugerem que a participação em atividades de lazer preserva a capacidade cognitiva, reduzindo o risco de demência e declínio cognitivo. No Brasil não existem estudos epidemiológicos que investigam a associação entre participação em atividades e cognição. OBJETIVO: Avaliar de forma padronizada a participação em atividades entre idosos; investigar a associação entre participação em atividades e funcionamento cognitivo; investigar a associação entre participação em atividades e incidência de comprometimento cognitivo leve amnésico e demência; e examinar a associação entre participação em diferentes tipos de atividade (social, física, cognitiva e cotidiana) e funcionamento cognitivo, comprometimento cognitivo leve amnésico e demência. MÉTODO: O presente estudo é parte do estudo epidemiológico Sao Paulo Ageing & Health Study (SPAH), uma coorte prospectiva de idosos, com 65 anos e mais, moradores de áreas pobres do Distrito do Butantã, São Paulo. Participantes do presente estudo não tinham demência na inclusão da coorte e foram reavaliados após 24 meses da avaliação inicial. A participação em atividades foi avaliada na inclusão da coorte com um questionário desenvolvido para um estudo transcultural, o Indianapolis-Ibadan Dementia Project. O registro da participação em atividades foi realizado com uma escala de 7 pontos do tipo Likert, com extremos entre 0 (nunca) e 6 (mais de 6 vezes por semana). As atividades foram agrupadas em quatro categorias (social, física, cognitiva e cotidiana). Um escore total de participação em atividades foi obtido por meio da soma das pontuações para cada uma das 42 atividades avaliadas. Um escore parcial também foi obtido para cada categoria de atividade. O funcionamento cognitivo foi avaliado com o Community Screening Instrument for Dementia (CSID). O diagnóstico de comprometimento cognitivo leve amnésico seguiu o critério estabelecido pela Academia Americana de Neurologia para comprometimento objetivo de memória. O diagnóstico de demência seguiu os critérios da quarta edição revisada do Diagnostic and Statistical Manual of Mental Disorders (DSM-IV) e utilizou informações do protocolo padronizado para o diagnóstico de demência, desenvolvido pelo Grupo de Pesquisa em Demência 10/66. Regressão linear múltipla foi utilizada para estimar mudanças no escore do funcionamento cognitivo, com intervalo de 95% de confiança e controle dos possíveis efeitos de confusão para estado cognitivo, características sociodemográficas e estado funcional. Regressão logística foi utilizada para estimar o risco de comprometimento cognitivo leve amnésico e demência, com intervalo de 95% de confiança e controle dos possíveis efeitos de confusão para estado cognitivo, características sociodemográficas e estado funcional. RESULTADOS: 1.520 participantes foram incluídos na coorte e 1.243 foram reavaliados no seguimento. Participação em atividades sociais foi a mais frequente, relatada por 99,0% dos idosos, seguida por participação em atividades cotidianas (95,0%), cognitivas (63,0%) e físicas (49,0%). Foram encontradas associações positivas entre participação em atividades e funcionamento cognitivo (1,0; IC95% 0,4-1,5) e entre participação em atividades cognitivas e funcionamento cognitivo (3,1; IC95% 1,4-4,7). Participação em atividades cotidianas esteve associada com redução do risco de comprometimento cognitivo leve amnésico (OR 0,9; IC95% 0,84-0,99). Participação em atividades esteve associada com redução do risco de demência (OR 0,9; IC95% 0,92-0,99) e participação em atividades cotidianas também se mostrou associada com redução do risco de demência (OR 0,9; IC95% 0,83-0,98). CONCLUSÃO: Participação em atividades possivelmente preserva a capacidade cognitiva e reduz o risco de comprometimento cognitivo leve amnésico e demência em idosos brasileiros. Diferentemente dos países desenvolvidos, na população idosa brasileira as atividades mais frequentes são aquelas que não requerem escolaridade e poder aquisitivo. Apesar disso, foram encontradas associações positivas entre participação em atividades e cognição. Políticas públicas devem enfatizar a participação em atividades como medida preventiva para comprometimento cognitivo e demência / Participation in activities and cognitive functioning: a cohort study with older adults residents in low income area in Sao Paulo functioning, with 95% confidence interval and controlling possible confounding effects of cognitive status, sociodemographic characteristics and functional status. Logistic regression was used to estimate the risk of amnesic mild cognitive impairment and dementia, with 95% confidence interval and controlling possible confounding effects of cognitive status, sociodemographic characteristics and functional status. RESULTS: 1520 participants were included in the cohort and 1243 were reassessed in follow up assessment. Participation in social activities was the most frequent, reported by 99.0% of the elderly, followed by participation in daily activities (95.0%), cognitive activities (63.0%) and physical activities (49.0%). We found positive associations between participation in activities and cognitive functioning ( 1.0; 95% CI 0.4-1.5) and between participation in cognitive activities and cognitive functioning ( 3.1; 95% CI 1.4-4.7). Participation in daily activities was associated with reduced risk of amnesic mild cognitive impairment (OR 0.9; CI 95% 0.84-0.99). Participation in activities was associated with reduced risk of dementia (OR 0.9; 95% CI 0.92-0.99) and participation in daily activities also shown to be associated with reduced risk of dementia (OR 0.9; 95% CI 0.83-0.98). CONCLUSIONS: Participation in activities possibly preserves the cognitive capacity and reduces the risk of amnesic mild cognitive impairment and dementia in Brazilian older adults. Unlike developed countries, Brazilian elderly population the most frequent activities are those that do not require education and purchasing power. Nevertheless, we found positive associations between participation in activities and cognition. We suggest that public policies should emphasize the participation in such activities as a preventive measure for cognitive impairment and dementia .

Ao longo dos anos, desde a concepção do CAPM, o modelo vem passando por um rigoroso escrutínio por parte da comunidade científica e dos agentes de mercado interessados na sua utilização prática. Evidências tanto a favor quanto contra a sua adequação foram surgindo. Várias foram as causas levantadas para o fraco desempenho do CAPM: omissão de variáveis no modelo, variação no tempo da medida de risco (β) ou, ainda, a ausência de outros momentos tais como assimetria e curtose. Esta pesquisa teve como objetivo a investigação empírica da relação entre momentos sistêmicos (covariância, coassimetria e cocurtose) e a taxa de retorno de ativos financeiros negociados no mercado brasileiro. Foi utilizada uma amostra de 179 empresas brasileiras regularmente negociadas na Bovespa entre os anos de 2003 e 2007. Para o teste do modelo de apreçamento, foi utilizado um procedimento em duas etapas. Na primeira, os comomentos de cada ativo foram estimados usando-se dados longitudinais de taxas de retorno. Os coeficientes estimados foram, então, utilizados em uma segunda etapa, na qual uma regressão com dados em painel buscou determinar a relação entre o prêmio pelo risco dos ativos e os comomentos estimados na primeira etapa. Foram estimados modelos com dados agrupados, efeitos aleatórios e efeitos fixos. A determinação do modelo mais adequado foi feita por meio de testes de especificação. Os dados mostraram evidências de que a distribuição de probabilidade das taxas de retorno da maioria das empresas não segue uma distribuição normal, e que tanto a covariância como a cocurtose são fatores de risco relevantes em modelos de apreçamento, mesmo controlados por fatores como: tamanho, alavancagem, liquidez, relação entre preço de mercado e preço contábil e relação entre valor de mercado e valor contábil. / Since the development of the CAPM, the model has been tested with a rigorous scrutiny by academic community and market practitioners who are interested in its practical utilization. Evidence for and against the adequacy of the model has arisen. Various reasons for the failure of the CAPM were raised: omission of variables, time-varying risk factors (β), or the absence of other moments like skewness and kurtosis. This research aimed at empirical investigation of the relationship between systematic moments (covariance, coskewness and cokurtosis) and the rate of return of financial assets traded in the Brazilian market. The sample consisted of 179 stocks regularly traded at Bovespa from 2003 to 2007. The test of the pricing model was run in a two-pass procedure. In the first pass, the comoments for every stock were estimated using a longitudinal series of rates of returns. The estimated coeficients were then used in the second pass, in a panel data regression that intended to establish a relationship between the risk premium and the comoments estimated in the first pass. Panel data models with pooled data, random effects and fixed effects were estimated. The adequacy of each model was tested by specification procedures. Data showed evidence that the rates of return were not normally distributed, and that covariance and cokurtosis were significant risk factors in pricing models, even after controlling for factors like: size, leverage, liquidity, price-earning ratio and

Este trabalho tem como objetivo aplicar a teoria de modelos mistos ao estudo do teor de nitrogênio e carbono no solo, em diversas profundidades. Devido a grande quantidade de matéria orgânica no solo, o teor de nitrogênio e carbono apresentam alta variabilidade nas primeiras profundidades, além de apresentar um comportamento não linear. Assim, fez-se necessário utilizar a abordagem de modelos não lineares mistos a dados longitudinais. A utilização desta abordagem proporciona um modelo que permite modelar dados não lineares, com heterogeneidade de variâncias, fornecendo uma curva para cada amostra. / This paper has as an objective to apply the theory of mixed models to the content of nitrogen and carbon in the soil at various depths. Due to the large amount of organic material in the soil, the content of nitrogen and carbon present high variability in the depths of soil surface, and present a nonlinear behavior. Thus, it was necessary to use the approach of nonlinear mixed models to longitudinal data analysis. The use of this approach provides a model that allows to model nonlinear data with heterogeneity of variances by providing a curve for each sample.

INTRODUÇÃO: Com o rápido envelhecimento populacional e o aumento no número absoluto de pessoas com demência, a identificação de fatores protetores que retardem o início do quadro clínico da doença é essencial para o planejamento de medidas preventivas efetivas. Estudos observacionais longitudinais com idosos em países desenvolvidos sugerem que a participação em atividades de lazer preserva a capacidade cognitiva, reduzindo o risco de demência e declínio cognitivo. No Brasil não existem estudos epidemiológicos que investigam a associação entre participação em atividades e cognição. OBJETIVO: Avaliar de forma padronizada a participação em atividades entre idosos; investigar a associação entre participação em atividades e funcionamento cognitivo; investigar a associação entre participação em atividades e incidência de comprometimento cognitivo leve amnésico e demência; e examinar a associação entre participação em diferentes tipos de atividade (social, física, cognitiva e cotidiana) e funcionamento cognitivo, comprometimento cognitivo leve amnésico e demência. MÉTODO: O presente estudo é parte do estudo epidemiológico Sao Paulo Ageing & Health Study (SPAH), uma coorte prospectiva de idosos, com 65 anos e mais, moradores de áreas pobres do Distrito do Butantã, São Paulo. Participantes do presente estudo não tinham demência na inclusão da coorte e foram reavaliados após 24 meses da avaliação inicial. A participação em atividades foi avaliada na inclusão da coorte com um questionário desenvolvido para um estudo transcultural, o Indianapolis-Ibadan Dementia Project. O registro da participação em atividades foi realizado com uma escala de 7 pontos do tipo Likert, com extremos entre 0 (nunca) e 6 (mais de 6 vezes por semana). As atividades foram agrupadas em quatro categorias (social, física, cognitiva e cotidiana). Um escore total de participação em atividades foi obtido por meio da soma das pontuações para cada uma das 42 atividades avaliadas. Um escore parcial também foi obtido para cada categoria de atividade. O funcionamento cognitivo foi avaliado com o Community Screening Instrument for Dementia (CSID). O diagnóstico de comprometimento cognitivo leve amnésico seguiu o critério estabelecido pela Academia Americana de Neurologia para comprometimento objetivo de memória. O diagnóstico de demência seguiu os critérios da quarta edição revisada do Diagnostic and Statistical Manual of Mental Disorders (DSM-IV) e utilizou informações do protocolo padronizado para o diagnóstico de demência, desenvolvido pelo Grupo de Pesquisa em Demência 10/66. Regressão linear múltipla foi utilizada para estimar mudanças no escore do funcionamento cognitivo, com intervalo de 95% de confiança e controle dos possíveis efeitos de confusão para estado cognitivo, características sociodemográficas e estado funcional. Regressão logística foi utilizada para estimar o risco de comprometimento cognitivo leve amnésico e demência, com intervalo de 95% de confiança e controle dos possíveis efeitos de confusão para estado cognitivo, características sociodemográficas e estado funcional. RESULTADOS: 1.520 participantes foram incluídos na coorte e 1.243 foram reavaliados no seguimento. Participação em atividades sociais foi a mais frequente, relatada por 99,0% dos idosos, seguida por participação em atividades cotidianas (95,0%), cognitivas (63,0%) e físicas (49,0%). Foram encontradas associações positivas entre participação em atividades e funcionamento cognitivo (1,0; IC95% 0,4-1,5) e entre participação em atividades cognitivas e funcionamento cognitivo (3,1; IC95% 1,4-4,7). Participação em atividades cotidianas esteve associada com redução do risco de comprometimento cognitivo leve amnésico (OR 0,9; IC95% 0,84-0,99). Participação em atividades esteve associada com redução do risco de demência (OR 0,9; IC95% 0,92-0,99) e participação em atividades cotidianas também se mostrou associada com redução do risco de demência (OR 0,9; IC95% 0,83-0,98). CONCLUSÃO: Participação em atividades possivelmente preserva a capacidade cognitiva e reduz o risco de comprometimento cognitivo leve amnésico e demência em idosos brasileiros. Diferentemente dos países desenvolvidos, na população idosa brasileira as atividades mais frequentes são aquelas que não requerem escolaridade e poder aquisitivo. Apesar disso, foram encontradas associações positivas entre participação em atividades e cognição. Políticas públicas devem enfatizar a participação em atividades como medida preventiva para comprometimento cognitivo e demência / Participation in activities and cognitive functioning: a cohort study with older adults residents in low income area in Sao Paulo functioning, with 95% confidence interval and controlling possible confounding effects of cognitive status, sociodemographic characteristics and functional status. Logistic regression was used to estimate the risk of amnesic mild cognitive impairment and dementia, with 95% confidence interval and controlling possible confounding effects of cognitive status, sociodemographic characteristics and functional status. RESULTS: 1520 participants were included in the cohort and 1243 were reassessed in follow up assessment. Participation in social activities was the most frequent, reported by 99.0% of the elderly, followed by participation in daily activities (95.0%), cognitive activities (63.0%) and physical activities (49.0%). We found positive associations between participation in activities and cognitive functioning ( 1.0; 95% CI 0.4-1.5) and between participation in cognitive activities and cognitive functioning ( 3.1; 95% CI 1.4-4.7). Participation in daily activities was associated with reduced risk of amnesic mild cognitive impairment (OR 0.9; CI 95% 0.84-0.99). Participation in activities was associated with reduced risk of dementia (OR 0.9; 95% CI 0.92-0.99) and participation in daily activities also shown to be associated with reduced risk of dementia (OR 0.9; 95% CI 0.83-0.98). CONCLUSIONS: Participation in activities possibly preserves the cognitive capacity and reduces the risk of amnesic mild cognitive impairment and dementia in Brazilian older adults. Unlike developed countries, Brazilian elderly population the most frequent activities are those that do not require education and purchasing power. Nevertheless, we found positive associations between participation in activities and cognition. We suggest that public policies should emphasize the participation in such activities as a preventive measure for cognitive impairment and dementia .

Em ensaios clínicos é muito comum a ocorrência de dados longitudinais discretos. Para sua análise é necessário levar em consideração que dados observados na mesma unidade experimental ao longo do tempo possam ser correlacionados. Além dessa correlação inerente aos dados é comum ocorrer o fenômeno de superdispersão (ou sobredispersão), em que, existe uma variabilidade nos dados além daquela captada pelo modelo. Um caso que pode acarretar a superdispersão é o excesso de zeros, podendo também a superdispersão ocorrer em valores não nulos, ou ainda, em ambos os casos. Molenberghs, Verbeke e Demétrio (2007) propuseram uma classe de modelos para acomodar simultaneamente a superdispersão e a correlação em dados de contagens: modelo Poisson, modelo Poisson-gama, modelo Poisson-normal e modelo Poisson-normal-gama (ou modelo combinado). Rizzato (2011) apresentou a abordagem bayesiana para o ajuste desses modelos por meio do Método de Monte Carlo com Cadeias de Markov (MCMC). Este trabalho, para modelar a incerteza relativa aos parâmetros desses modelos, considerou a abordagem bayesiana por meio de um método determinístico para a solução de integrais, INLA (do inglês, Integrated Nested Laplace Approximations). Além dessa classe de modelos, como objetivo, foram propostos outros quatros modelos que também consideram a correlação entre medidas longitudinais e a ocorrência de superdispersão, além da ocorrência de zeros estruturais e não estruturais (amostrais): modelo Poisson inacionado de zeros (ZIP), modelo binomial negativo inacionado de zeros (ZINB), modelo Poisson inacionado de zeros - normal (ZIP-normal) e modelo binomial negativo inacionado de zeros - normal (ZINB-normal). Para ilustrar a metodologia desenvolvida, um conjunto de dados reais referentes à contagens de ataques epilépticos sofridos por pacientes portadores de epilepsia submetidos a dois tratamentos (um placebo e uma nova droga) ao longo de 27 semanas foi considerado. A seleção de modelos foi realizada utilizando-se medidas preditivas baseadas em validação cruzada. Sob essas medidas, o modelo selecionado foi o modelo ZIP-normal, sob o modelo corrente na literatura, modelo combinado. As rotinas computacionais foram implementadas no programa R e são parte deste trabalho. / Discrete and longitudinal structures naturally arise in clinical trial data. Such data are usually correlated, particularly when the observations are made within the same experimental unit over time and, thus, statistical analyses must take this situation into account. Besides this typical correlation, overdispersion is another common phenomenon in discrete data, defined as a greater observed variability than that nominated by the statistical model. The causes of overdispersion are usually related to an excess of observed zeros (zero-ination), or an excess of observed positive specific values or even both. Molenberghs, Verbeke e Demétrio (2007) have developed a class of models that encompasses both overdispersion and correlation in count data: Poisson, Poisson-gama, Poisson-normal, Poissonnormal- gama (combined model) models. A Bayesian approach was presented by Rizzato (2011) to fit these models using the Markov Chain Monte Carlo method (MCMC). In this work, a Bayesian framework was adopted as well and, in order to consider the uncertainty related to the model parameters, the Integrated Nested Laplace Approximations (INLA) method was used. Along with the models considered in Rizzato (2011), another four new models were proposed including longitudinal correlation, overdispersion and zero-ination by structural and random zeros, namely: zero-inated Poisson (ZIP), zero-inated negative binomial (ZINB), zero-inated Poisson-normal (ZIP-normal) and the zero-inated negative binomial-normal (ZINB-normal) models. In order to illustrate the developed methodology, the models were fit to a real dataset, in which the response variable was taken to be the number of epileptic events per week in each individual. These individuals were split into two groups, one taking placebo and the other taking an experimental drug, and they observed up to 27 weeks. The model selection criteria were given by different predictive measures based on cross validation. In this setting, the ZIP-normal model was selected instead the usual model in the literature (combined model). The computational routines were implemented in R language and constitute a part of this work.

Submitted by Fabiano Malheiro (fabianomalheiro22@hotmail.com) on 2017-05-17T14:53:09Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_Fraçoise Helene Van de Sande Leite.pdf: 1988086 bytes, checksum: 89fa1cf85fa8a3b29b2ed64550c20841 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-17T14:53:09Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_Fraçoise Helene Van de Sande Leite.pdf: 1988086 bytes, checksum: 89fa1cf85fa8a3b29b2ed64550c20841 (MD5) Previous issue date: 2012-12-17 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Os materiais mais amplamente utilizados para restaurações diretas em dentes permanentes posteriores são a resina composta (RC) e o amálgama. As RC têm sido cada vez mais utilizadas para estes procedimentos, no entanto esta mudança não é unânime, e difere entre os países. Neste sentido, tem-se procurado estabelecer a longevidade destas restaurações, investigar as causas mais frequentemente atribuídas às falhas, e determinar os fatores relacionados. Em busca de alto nível de evidência, revisões sistemáticas com critérios de inclusão estritos, que incluem apenas estudos clínicos controlados e randomizados, são necessárias para responder estas questões. No entanto, estudos clínicos deste tipo, e com longo período de acompanhamento são escassos, e insuficientes para gerar conclusões. Na presente tese, a longevidade de restaurações diretas em dentes posteriores, as falhas observadas e os fatores potencialmente relacionados foram abordados com uma revisão da literatura e também com um estudo clínico retrospectivo. A revisão sistemática foi realizada com estudos clínicos longitudinais com acompanhamento mínimo de 5 anos, e que investigaram a longevidade de restaurações diretas de amálgama e RC em restaurações em cavidades do tipo classe II. O objetivo foi investigar algumas observações de estudos prévios da literatura, incluindo a investigação do risco de cárie dos pacientes e também acerca da utilização de um material restaurador intermediário para restaurações de RC. Dentre as razões atribuídas às falhas restauradoras, as mais frequentemente relatadas foram cárie secundária e fratura da restauração. Os períodos de observação variaram de 5 até 12 anos. As taxas anuais de falha (TAF) variaram de 0-3,60% para RC, de 2,33-6,45% para RC com técnica de sanduíche, e de 1,5-3,85% para restaurações de amálgama.A análise quantitativa foi realizada com teste-T-independente. O risco de cárie afetou significativamente a TAF para restaurações de RC (p=0,002), enquanto que para amálgama as diferenças não foram estatisticamente significativas. A presença de um material intermediário com técnica de sanduíche em restaurações de resina também afetou significativamente a TAF (p=0,001). Complementando o tema desta tese, foi realizado um estudo retrospectivo em uma clinica odontológica privada. O objetivo foi investigar a sobrevivência, TAF, as razões de falha, e também os fatores que podem afetar a longevidade de restaurações diretas de RC. Trezentas e seis restaurações de RC em dentes posteriores, realizadas de janeiro de 1994 até dezembro de 2002 foram incluídas. A TAF foi de 3,2%, após 10 anos, e de 2,6% após 14 anos de acompanhamento. Nove fatores potencialmente relacionados à longevidade das restaurações foram investigados. A análise estatística foi realizada através de Regressão de Cox, e quatro fatores afetaram significativamente a TAF. Entre as variáveis do paciente, o risco estimado em relação à cárie e ao estresse oclusal mostraram um forte efeito sobre a longevidade das restaurações. Dentre as demais variáveis investigadas, o elemento dentário, a posição no arco, e a vitalidade pulpar foram os fatores que afetam a longevidade das restaurações. A conclusão geral a partir desses estudos é que a avaliação do risco dos indivíduos deve fazer parte dos fatores investigados em avaliações acerca da longevidade de restaurações diretas. / The materials most widely used for direct restorations in posterior teeth are composite and amalgam. Although composites have been increasingly used on posterior teeth, the choice for this material is not unanimous for these restorations, and differs between countries. In this sense, the longevity of direct posterior restorations, the reasons most often attributed to failures, and the determination of the factors related to failures have been investigated. Seeking for the highest level of evidence, systematic reviews with strict inclusion criteria are needed, in which only randomized controlled clinical studies can be used to answer these questions. However, well controlled and randomized clinical studies with long follow-up periods are scarce and insufficient to draw any conclusions. Thus, the inclusion of clinical trials of different designs, with long-term monitoring periods, is needed to perform these investigations. In the present thesis, the longevity of direct posterior restorations, observed failures and potentially related factors were addressed with a literature review and with a retrospective clinical study. The systematic review was conducted with longitudinal studies with follow-up periods of at least 5 years, reporting the longevity of amalgam and composite class II direct restorations. The aim was to investigate some observations from previous studies in the literature. Focus was driven towards the investigation of the caries risk of the patients and also the presence of an intermediate restorative material for composite restorations. From the reasons attributed to failure, the most frequent were secondary caries along with tooth/restoration fracture. Observation periods ranged from 5 up to 12 years. The annual failure rates (AFR) ranged from 0-3.60% for composites, 2.33-6.45% to composites with sandwich-technique, and from 1.5-3.85% for amalgams. A quantitative analysis was performed with Independent-samples-T-test, in which a reduced number of studies could be included. Caries risk significantly affected the AFR for composite restorations (p=0.002), whereas for amalgam the differences were not statistically significant. The sandwich-technique in composite restorations affected significantly the AFR (p=0.001). The way of reporting clinical data hampers the ability to analyze variables with a large number of included studies. Complementing the theme of this thesis, a practice-base retrospective study was conducted. The aim was investigate the survival, AFR, reasons for failure and also look into factors that could affect the longevity of direct composite restorations. Three hundred and six composites restorations placed on posterior teeth from January 1994 up to December 2002 were included. The annual failure rate was 3.2% after 10 years, and 2.6% after 14 years of follow-up. After the analysis of nine factors that could affect survival, four were statistically significant in the Cox-regression analysis. Among patient variables, the estimated patient risk regarding caries and occlusal stress showed a strong effect on survival, whereas among tooth variables, tooth type, arch and pulp vitality were the significant factors affecting the longevity in this retrospective evaluation. The overall conclusion from those studies is that the risk assessment of the individuals should be taken into account when evaluating the longevity of direct restorations.

Submitted by Márcio Ropke (ropke13marcio@gmail.com) on 2017-06-13T14:35:58Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Impacto de sobrepeso e obesidade ao longo da vida na ocorrência de doença.pdf: 9261303 bytes, checksum: 008bc4333ac6715cee1911dc225815b0 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-13T14:35:58Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Impacto de sobrepeso e obesidade ao longo da vida na ocorrência de doença.pdf: 9261303 bytes, checksum: 008bc4333ac6715cee1911dc225815b0 (MD5) Previous issue date: 2015-07-08 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / As doenças periodontais afetam a gengiva e os tecidos dentários de suporte, sendo classificadas em gengivite, inflamação reversível da gengiva marginal, e periodontite, quando há destruição das estruturas que suportam o dente. Estas doenças possuem natureza infecciosa e o grau de destruição observado depende da resposta do sistema imune do hospedeiro. Enquanto algumas condições sistêmicas, como diabetes são indicadas como fatores de risco para o desenvolvimento e para a progressão das doenças periodontais, o papel de outras, como a obesidade, ainda não é totalmente claro. Obesidade caracteriza-se pelo acúmulo excessivo de gordura corporal responsável por causar danos à saúde geral, tendo sido apontada como um fator de risco para outras doenças sistêmicas como diabetes, doença cardiovascular e câncer. Revisões sistemáticas têm demonstrado a associação entre obesidade e doenças periodontais, especialmente em adultos. Os resultados destas revisões, entretanto, são basicamente provenientes de estudos transversais, o que impossibilita o estabelecimento de uma relação causal entre estas condições. Assim, as revisões sistemáticas que compõem esta tese têm como objetivo demonstrar os efeitos da obesidade nas condições periodontais. Na primeira revisão, buscou-se evidenciar o efeito do tratamento periodontal nos indivíduos obesos, e posteriormente, fazer uma comparação com o efeito do tratamento periodontal em indivíduos não-obesos. Os resultados, originados de poucos estudos, sugerem que o tratamento periodontal é efetivo para promover a melhora do quadro periodontal dos indivíduos obesos; ainda, que não há diferença entre o efeito da terapia periodontal entre obesos e não obesos. A segunda revisão sistemática explorou os efeitos do ganho de peso no desenvolvimento de novos casos de periodontite em adultos. Foram incluídos apenas cinco estudos prospectivos longitudinais que evidenciaram a associação entre o ganho de peso e a incidência de periodontite. Os achados demonstraram que os indivíduos que se tornaram obesos tiveram maior risco para desenvolver periodontite, seguido por aqueles com sobrepeso, quando comparados aos indivíduos que permaneceram eutróficos. Três artigos originais fazem parte desta tese: o primeiro, de desenho transversal, explora a associação entre sobrepeso/obesidade e sangramento gengival em escolares da cidade de Pelotas-RS. Os resultados demonstraram que, entre os meninos, o excesso de peso está associado ao aumento do sangramento gengival. Este estudo, embora transversal, demonstra a associação precoce entre sobrepeso/obesidade e condições periodontais. O segundo artigo original objetivou estimar o efeito controlado direto do sobrepeso/obesidade em desfechos periodontais (perda de inserção periodontal; sangramento à sondagem) em uma coorte de adultos da cidade de Florianópolis-SC (EpiFloripa) por meio de métodos de inferência causal (marginal structural model with inverse-probability weighting). Os achados deste estudo evidenciaram o efeito 11 direto do sobrepeso/obesidade, especialmente da forma abdominal, em desfechos periodontais desfavoráveis. Finalmente, o último artigo deste volume pretendeu estimar o risco de periodontite na coorte de nascimentos de Pelotas de 1982. Neste estudo foram realizadas intervenções hipotéticas sobre o efeito do aumento do sobrepeso e da obesidade ao longo da vida, independente e em associação com hábitos não saudáveis, no risco de periodontite nesta população. Para isso, foi empregada a g-formula paramétrica, levando em consideração as variáveis tempodependentes. Os achados deste estudo sugerem que o aumento do sobrepeso e da obesidade aumentam o risco para periodontite. Além disso, quando o excesso de peso é combinado com outros hábitos não saudáveis, como fumo e dieta rica em gordura e carboidratos, o risco torna-se ainda maior. De forma geral, os resultados apresentados pelos artigos componentes desta tese suportam a associação entre excesso de peso e doença periodontal nas diferentes fases da vida. Ainda, os achados sugerem que existe uma relação causal entre sobrepeso/obesidade e doença periodontal em adultos. / Periodontal diseases affect the gingiva and the supporting tissues of the teeth. These diseases can be classified as gingivitis, a reversible inflammation of the marginal gingiva, and periodontitis, a destructive inflammation affecting the supporting structures of the teeth. Periodontal diseases are infectious conditions and depend on the host immune response. While some systemic conditions, such as diabetes are identified as a risk factor for development and progression of periodontal diseases, the role played by other systemic diseases, such as obesity, remains unclear. Obesity can be defined as a systemic disease characterized by excessive body fat accumulation that can lead to adverse impacts on health conditions. Studies have shown that obesity is also an important risk factor for other systemic diseases, such as diabetes, cardiovascular disease and cancer. Systematic reviews have demonstrated the association between obesity and periodontal diseases especially in adults. Results of these reviews, however, are originated from cross-sectional studies, which do not allow the establishment of causal relationship. Thus, the two systematic reviews included in this thesis aimed to estimate the effects of obesity on periodontal conditions. The first review aimed to look at the effects of periodontal therapy amongst obese individuals and to compare the effects of periodontal therapy of obese and non-obese subjects. Results, originated from few studies, suggest that periodontal therapy is effective to improve periodontal condition in obese individuals; also, that there is no difference between the effects of periodontal therapy in obese and in non-obese individuals. The second systematic review aimed to explore the effects of weight gain on the incidence of periodontitis in adults. Five prospective longitudinal studies were included. Pooled results demonstrated that individuals that became obese presented higher risk of periodontitis establishment, followed by those that became overweight comparing with individuals that remained eutrophic. Three original studies are part of this thesis: the first original article, a cross-sectional study, investigated the association between overweight/obesity and gingival bleeding in schoolchildren from Pelotas, Brazil. Results showed that excess of weight is associated with greater prevalence of gingivitis among boys. Even though this study presents a cross-sectional design, it demonstrates the precocious association between overweight/obesity and gingival bleeding. The second original article aimed to estimate the controlled direct effect of overweight/obesity on periodontal outcomes (clinical attachment loss; bleeding on probing) in a cohort of adults from Florianópolis, Brazil. Causal inference methods (marginal structural model with inverse-probability weighting) were applied. Results demonstrated a direct effect of overweight/obesity, especially central obesity, on unfavourable periodontal outcomes. Finally, the last original article of this thesis intended to estimate the risk of periodontitis in the 1982 Pelotas birth cohort. In this study hypothetical interventions on life-course overweight and obesity were set, independently and associated with unhealthy habits, to estimate the risk of periodontitis in this specific population. The parametric g-formula was employed 13 accounting for the time-varying variables. The findings suggest that the increase of overweight and obesity increase the risk of periodontitis. Furthermore, when excess of weight is associated with other unhealthy habits, such as smoking and high consumption of fat and carbohydrates, the risk is even greater. In summary, the results presented by the articles included in this thesis support the association between excess of weight and periodontal disease in different stages of life. Moreover, the findings suggest a causal relationship between overweight/obesity and periodontal disease in adults.

COELHO-BARROS, E. A. Analise estatstica para dados de contagem longitudinais na presenca de covariaveis: Aplicações na area medica. Dissertação (mestrado) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto - USP, Ribeirão Preto - SP - Brasil, 2009. Dados de contagem ao longo do tempo na presenca de covariaveis são muito comuns em estudos na area da saude coletiva, por exemplo; numero de doenças que uma pessoa, com alguma caracteristica especifica, adquiriu ao longo de um período de tempo; numero de internações hospitalares em um período de tempo, devido a algum tipo de doença; numero de doadores de orgãos em um período de tempo. Nesse trabalho são apresentados diferentes modelos estatsticos de\\fragilidade\" de Poisson para a analise estatística de dados de contagem longitudinais. Teoricamente, a distribuição de Poisson exige que a media seja igual a variância, quando isto não ocorre tem-se a presenca de uma variabilidade extra-Poisson. Os modelos estatsticos propostos nesta dissertação incorporam a variabilidade extra-Poisson e capturam uma possvel correlação entre as contagens para o mesmo indivduo. Para cada modelo foi feito uma analise Bayesiana Hierarquica considerando os metodos MCMC (Markov Chain Monte Carlo). Utilizando bancos de dados reais, cedidos por pesquisadores auxiliados pelo CEMEQ (Centro de Metodos Quantitativos, USP/FMRP), foram discutidos alguns aspectos de discriminação Bayesiana para a escolha do melhor modelo. Um exemplo de banco de dados reais, discutido na Seção 4 dessa dissertação, que se encaixa na area da saude coletiva, e composto de um estudo prospectivo, aberto e randomizado, realizado em pacientes infectados pelo HIV que procuraram atendimento na Unidade Especial de Terapia de Doencas Infecciosas (UETDI) do Hospital das Clnicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo (HCFMRP-USP). Os esquemas terapêuticos estudados consistiam em zidovudina e lamivudina, associadas ao efavirenz ou lopinavir. Entre setembro de 2004 e maio de 2006 foram avaliados 66 pacientes, sendo 43 deles includos no estudo. Destes, 39 participantes alcançaram a semana 24 de acompanhamento, enquanto 27 atingiram a semana 48. Os grupos de pacientes apresentavam características basais semelhantes, quanto a idade, sexo, mediana de CD4 e carga viral. O interesse desse experimento e estudar a contagem de CD4 considerando os dois esquemas terapêuticos (efavirenz e lopinavir). / COELHO-BARROS, E. A. Analise estatstica para dados de contagem longitudinais na presenca de covariaveis: Aplicac~oes na area medica. Dissertac~ao (mestrado) - Faculdade de Medicina de Ribeir~ao Preto - USP, Ribeir~ao Preto - SP - Brasil, 2009. Longitudinal counting data in the presence of covariates is very common in many applications, especially considering medical data. In this work we present dierent \\frailty\"models to analyze longitudinal Poisson data in the presence of covariates. These models incorporate the extra-Poisson variability and the possible correlation among the repeated counting data for each individual. A hierarchical Bayesian analysis is introduced for each dierent model considering usual MCMC (Markov Chain Monte Carlo) methods. Considering reals biological data set (obtained from CEMEQ, Medical School of Ribeir~ao Preto, University of S~ao Paulo, Brazil), we also discuss some Bayesian discrimination aspects for the choice of the best model. In Section 4 is considering a data set related to an open prospective and randomized study, considering of HIV infected patients, free of treatments, which entered the Infection Diseases Therapy Special Unit (UETDI) of the Clinical Hospital of the Medical School of Ribeir~ao Preto, University of S~ao Paulo (HCFMRP-USP). The therapeutic treatments consisted of the drugs Zidovudine and Lamivudine, associated to Efavirenz and Lopinavir. The data set was related to 66 patients followed from September, 2004 to may, 2006, from which, 43 were included in the study. The patients groups presented similar basal characteristics in terms of sex, age, CD4 counting median and viral load. The main goal of this study was to compare the CD4 cells counting for the two treatments, based on the drugs Efavirenz and Lopinavir, recently adopted as preferencial for the initial treatment of the disease.