Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-07-05T20:01:47Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 613081 bytes, checksum: 51a4d7528d9d2e7c73d3049bdf77a998 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-05T20:01:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 613081 bytes, checksum: 51a4d7528d9d2e7c73d3049bdf77a998 (MD5) Previous issue date: 2001-01-25 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Isolinhas de feijoeiro-comum obtidas por cruzamentos em que o cultivar Rudá foi o genitor recorrente foram inoculadas com diferentes patótipos de ferrugem, antracnose e mancha-angular, analisadas com marcadores moleculares de DNA e avaliadas por meio de características quantitativas. As inoculações feitas em isolinhas RC n F 2:3 indicaram que as proporções entre as famílias heterozigotas e homozigotas para a resistência foram 2:1 em todos os cruzamentos. Para resistência à ferrugem e antracnose simultaneamente, foram selecionadas 13 isolinhas do retrocruzamento Rudá x Ouro Negro. Para resistência à antracnose, foram selecionadas, ainda, outras 16 isolinhas, sendo 10 isolinhas provenientes do retrocruzamento Rudá x TO e seis do retrocruzamento Rudá x AB 136. Cinco isolinhas homozigotas do retrocruzamento Rudá x AND 277 foram selecionadas para resistência à mancha-angular. De todas as isolinhas homozigotas, foram selecionadas aquelas geneticamente mais próximas do genitor recorrente, pela utilização de marcadores RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA). Essas isolinhas foram utilizadas para avaliar a reação de resistência a ferrugem, antracnose e mancha-angular causadas pelos patótipos Uromyces appendiculatus, Colletotrichum lindemuthianum e Phaeoisariopsis griseola , respectivamente. A s isolinhas ON-25-99 e ON-48-99 se comportavam como resistentes a todos os patótipos de ferrugem inoculados. As isolinhas TO-41-5-6-24 e AB-74-1-13 foram resistentes a todos os patótipos de antracnose testados. A isolinha AN-7-2-9-4-6 foi resistente aos seis isolados de mancha-angular testados. As isolinhas mais próximas geneticamente do recorrente foram caracterizadas com marcadores moleculares fortemente ligados aos genes de resistência dos genitores doadores. Treze marcadores foram testados, e oito deles (OPAZ20 940 , OPB03 1800 , OPH13 490 , ScarBA08 560 , ScarF10 1050 , OPX11 630 , OPY20 830 e Satt174) podem ser potencialmente utilizados para dar continuidade ao processo de piramidização dos genes de resistência no cultivar Rudá. Os outros cinco marcadores sofreram recombinação no processo de retrocruzamento. As isolinhas foram, ainda, testadas para características quantitativas, em que foram estimados diferentes parâmetros genéticos, correlações fenotípicas, genotípicas e ambientais e efeitos diretos e indiretos de cada característica sobre a produção, mediante o uso da análise de trilha conduzido em dois ambientes diferentes. Os caracteres “número de vagens por planta” e “número de sementes por vagem” apresentaram maiores correlações genotípicas com a produção por planta. A média das características e a precisão experimental foram semelhantes nos dois ensaios. Os resultados encontrados neste trabalho são importantes para dar continuidade ao processo de piramidização de genes visando à resistência a ferrugem, antracnose e mancha- angular no cultivar Rudá atualmente sendo conduzido pelo BIOAGRO/UFV. / Common bean isolines obtained from crosses in which cultivar Rudá was the recurrent parent were inoculated with different rust, anthracnose, and angular leaf spot pathotypes, and also characterized with DNA molecular markers and evaluated for quantitative traits. The inoculations done in BC n F 2:3 isolines showed that the proportion between heterozygous and homozygous resistant plants was 2:1 for all crosses. Thirteen homozygous isolines resistant to rust and anthracnose simultaneously were selected from the cross Rudá x Ouro Negro. Sixteen isolines resistant to anthracnose were selected, 10 from the cross Rudá x TO, and six isolines from the cross Rudá x AB 136. Six homozygous isolines resistant to angular leaf spot were selected from the cross Rudá x AND 277. The isolines genetically closer to the recurrent parent were identified with the use of the random amplified DNA (RAPD) technique. These lines were tested against different pathotypes of the causing agents of rust, anthracnose and angular leaf spot, Uromyces appendiculatus, Colletotrichum lindemuthianum and Phaeoisariopsis griseola , respectively. Isolines ON-25-99 and ON-48-99 were resistant to all rust pathotypes tested. Isolines TO-41-5-6-24 and AB-74-1-13 were resistant to all anthracnose pathotypes tested. Isoline AN-7-2-9-4-6 was resistant to six angular spot pathotypes tested. The isolines which were genetically closer to the recurrent parent were characterized with molecular markers previously shown to be tightly linked to disease resistance genes in the donor parents. Thirteen markers were tested and eight of them (OPAZ20 940 , OPB03 1800 , OPH13 490 , ScarBA08 560 , ScarF10 1050 , OPX11 630 , OPY20 830 and Satt174) proved to be potentially useful in a breeding program to pyramid the resistance genes in the same cultivar. The other five markers separated from the resistance loci due to recombinations during the backcrossing process. The isolines were also tested for quantitative traits and different genetic parameters, phenotypic, genotypic and environmental correlations, and the direct effect of each characteristic on productivity by using path analysis in two different environments. The characters ‘number of pods per plant’ and ‘number of seeds per pod’ presented the highest correlations with productivity per plant. The mean values for the traits and the experimental precision were similar for both assays. Our results will be important to continue the pyramidation process of resistance genes for rust, anthracnose, and angular leaf spot in the cultivar Rudá presently being conducted at BIOAGRO/UFV.

Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-10-16T16:36:01Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 29196319 bytes, checksum: 6884bb9f5a2472d3848b481521f34322 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-16T16:36:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 29196319 bytes, checksum: 6884bb9f5a2472d3848b481521f34322 (MD5) Previous issue date: 1999-03-01 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cientifico e Tecnologico / Foram desenvolvidos três sistemas de genotipagem multilocos (sistemas Multiplex) semi-automatizados, baseados na amplificação e análise simultânea de locos microssatélites via florescência, para análise genética de espécies do gênero Eucalyptus. Tabelas de frequências alélicas e estimativas do conteúdo de informação genética foram geradas para seis espécies comercialmente importantes do gênero Eucalyptus (subgênero Symphyomyrtus). Inicialmente, microssatélites desenvolvidos a partir de genótipos de E. grandis e E. urophylla foram avaliados quanto à especificidade de amplificação. Dentre os locos que apresentaram boa qualidade de amplificação, 11 foram selecionados para o desenvolvimento de sistemas Multiplex. Três sistemas Multiplex, comportando cada um a análise simultânea de três locos, foram selecionados. Foi estudado o tamanho mínimo de amostra necessário para se obterem estimativas acuradas da heterozigosidade de cada loco. Para isso, foram genotipados 192 indivíduos de E. grandis provenientes de uma população de melhoramento. Com essa informação, avaliou-se o comportamento de estimadores para heterozigosidade esperada com vários tamanhos de amostra, analisando-se a sua variância por meio da sua fórmula exata e por reamostragem numérica. Concluiu-se que uma amostra de 64 indivíduos dessa população seria satisfatória para estimar a heterozigosidade esperada com boa precisão. Os três sistemas Multiplex foram utilizados para genotipar indivíduos provenientes de cinco procedências de E. grandis. Com os dados genotípicos, foram construídas tabelas de frequências alélicas para cada loco e procedência, além de serem registrados 0 número de alelos/loco e a amplitude alélica e estimados os parâmetros heterozigosidade esperada, conteúdo de informação de polimorfismo, probabilidade de identidade e poder de exclusão, os quais indicaram que os locos utilizados possuía alto conteúdo de informação genética. Foram ainda estimadas as distâncias genéticas de Nei entre as procedências; uma AMOVA realizada entre as procedências indicou variação significativa entre elas, embora a maior porção da variabilidade fosse encontrada dentro de procedências. Em seguida, os sistemas Multiplex foram otimizados e caracterizados para outras cinco espécies do gênero Eucalyptus: E. camaldulensis, E. dunnii, E. globulus, E. saligna e E. urophylla. As estimativas dos parâmetros de informação genética da maioria dos locos indicaram que eles são apropriados para genotipagem de indivíduos dessas espécies. Finalmente, os sistemas Multiplex foram utilizados na avaliação de uma população de melhoramento de E. urophylla e de uma coleção de clones-elite, em que foi possível a detecção de erros de identificação do material genético, além de uma avaliação da diversidade genética e da similaridade entre clones. / Three semi-automated multilocus genotyping systems, based on microsatellites, were developed for the analysis of Eucalyptus species. Allele frequency tables and estimates of the genetic information content of these loci were generated for six economically important species of Eucalyptus (subgenus Symphyomyrtus). A set of microsatellites, developed from E. grandis and E. urophylla genotypes. was evaluated based on their PCR amplilication quality and transferability across species. Eleven microsatellites and tifteen combinations of three Ioci were tested. Among these, three triplex systems were chosen. The minimum number of individuals necessary to obtain accurate estimates of He was evaluated. A population of 192 individuals of E. Grandis was typed with six microsatellites and the behavior of the estimate of He with increased sample sizes was analyzed using the gene diversity variance formula and numeric resampling. Congruent results using both approaches showed that a sample size of 64 individuals would be appropriate to estimate He with good accuracy. The multiplex systems were used to type individuals from live Eucalyptus provenances. Allele frequency tables were generated for every locus, and estimates of parameters of genetic information content were obtained (He, PIC, I and Q). AII loci showed to be highly informative with average values of He (0,85), PIC (0,84), combined Q (99,99%) and combined I (10-14). Nei's genetic distances estimated among provenances. An AMOVA showed that there is significant genetic variation among provenances. Although the majority of the variation was found within provenances. The multiplex systems were then optimized and evaluated for other tive species of Eucalyptus: E. camaldulensis, E. dunnii, E. globulus, E. saligna and E. urophylla. The estimates of genetic information content parameters showed once more that these Ioci are highly appropriate for genotyping Eucalyptus species. As a final step to evaluate the usefulness of these genotyping systems, a breeding population of E. urophylla and a collection of elite clones were analyzed. Several clonal identification errors were detected within this population. Based on the multilocus genotypes, an evaluation of the genetic variability and similarity among clones was also performed.

Submitted by Amauri Alves (amauri.alves@ufv.br) on 2015-12-08T16:54:37Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 978738 bytes, checksum: e276249e195666bea77a1d9e97cb4580 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-12-08T16:54:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 978738 bytes, checksum: e276249e195666bea77a1d9e97cb4580 (MD5) Previous issue date: 2015-07-02 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / A produtividade da soja depende da fotossíntese gerada pelas folhas, de modo que qualquer fator que interfira em sua área foliar poderá afetar a produção. A soja é uma planta que suporta determinado nível de redução de área foliar sem que haja decréscimo significativo do rendimento de grãos. No entanto, essa perda depende do estádio em que a desfolha ocorre. Dentre os agentes que causam desfolhamento na cultura da soja estão os insetos desfolhadores, os quais podem causar danos durante praticamente todo o ciclo de vida da cultura; e doenças, sendo a principal a ferrugem asiática que provoca desfolhamento no sentido da base para o ápice. Uma das vantagens frente a esses estresses bióticos é a variabilidade existente entre as cultivares, pois algumas características podem ser vantajosas e influenciar na reação da planta a perda de área foliar. Todos esses fatores vão influenciar os componentes de rendimento que formam a produtividade da planta. Assim, o estudo do efeito ambiental, torna-se fundamental. Nesse sentido, o objetivo desses estudos foram: I - avaliar o efeito de níveis de desfolha contínua, nos estádios vegetativo e reprodutivo, em cultivares de soja com diferentes características agronômicas; II - simular o progresso da ferrugem asiática em cultivares de soja por meio da retirada de trifólios e % de desfolha no sentido da base para o ápice em três estádios reprodutivos; III - avaliar a divergência genética de cultivares de soja no verão e inverno com base em caracteres agromorfológicos e marcadores moleculares e IV - analisar a influência da coleta de vagens com 1, 2 e 3 grãos para formação da geração seguinte e seu respectivo efeito nas frequências do número de grãos por vagem, bem como a associação dos componentes de rendimento pela análise de trilha. Pelos resultados do primeiro experimento observou se que a desfolha teve efeito negativo em todos os componentes de rendimento das cultivares, com maior decréscimo quando ocorre no estádio reprodutivo. A desfolha contínua, a partir de 16,7%, tanto no estádio vegetativo como no reprodutivo diminuiu significativamente a produtividade da soja. Independentemente das características agronômicas, como tipo de crescimento, grupo de maturidade e forma do folíolo, o efeito do estresse por desfolhamento em cultivares vii de soja é semelhante no verão, no inverno, porém as cultivares com maior grupo de maturidade menor redução na produção. Em relação a desfolha simulando a ferrugem asiática, conforme elevou-se a intensidade de desfolha no sentido da base para o ápice nos estádios reprodutivos estudados (R3, R5, R6) há decréscimo linear na produtividade da planta. A simulação de danos por ferrugem asiática por meio dos níveis desfolha das cultivares, independentemente da metodologia estudada, evidenciou a severidade na redução da área foliar e seu consequente reflexo negativo na produtividade. A dissimilaridade genética entre as cultivares a partir de caracteres agromorfológicos varia de acordo com a época de cultivo. Por meio dos marcadores moleculares foi demonstrada variabilidade genética entre os genótipos estudados, com resultados diferentes dos agrupamentos formados a partir dos caracteres agronômicos. Dessa forma, tanto os dados fenotípicos, quanto os moleculares, mostraram-se ferramentas informativas na caracterização da divergência existente entre as cultivares de soja. Independentemente do número de grãos (1, 2 ou 3) das vagens selecionadas em F4, a frequência do número de grãos nas vagens das plantas da geração seguinte não é modificada. Nos dois ambientes estudados (Casa de vegetação e campo) as vagens com 2 e 3 grãos tiveram efeito direto e positivo na produtividade. / Soybean yield depends on mainly the photosynthesis generated by the leaves, so that any factor that interferes in their leaf area can affect production. The soybean is a plant that supports determined reduction of leaf area level without significant decrease of yield. However, this loss depends on the stage at which defoliation occurs. Among the agents that cause defoliation of soybean are the defoliating insects, which can cause damage during the entire crop cycle; and diseases, being the main the soybean rust that causes defoliation from the bottom to the top, when environmental conditions are favorable. One of the advantages in relation this biotic stress is the variability among the cultivars because some traits may be advantageous and influence on plant response to loss of leaf area. All these factors will influence the yield components that make up the plant yield. Thus, the study of the environmental effect is essential. In this sense, the objective of the studies were: I - Evaluate the effect of continuous defoliation levels in vegetative and reproductive stages in soybean cultivars with different agronomic traits; II - Simulate the progress of Asian rust in soybean cultivars by removal of trefoliolate leaves and of defoliation percentage towards the bottom to the top in three reproductive stages; III - To assess the genetic diversity of soybean cultivars in summer and winter through agromorphological traits and molecular markers and IV - to analyze the influence of the pods collection with 1, 2 and 3 seeds to training the next generation and their respective effects on frequencies the number of seeds per pod, as well the association of yield components by path analysis. Through of results of the first experiment was observed that the defoliation has a negative effect on all yield components of cultivars with greater decrease when occurs on the reproductive stage. It was noted also that the continuous defoliation, from 16.7% in both the vegetative as well as on the reproductive stage significantly decreased soybean yield. Regardless of the agronomic traits, such as growth type, maturity group and leaf shape, the effect of stress by defoliation on soybean cultivars is similar in summer, but in winter, the cultivars with greater maturity group have higher performance. Regarding defoliation simulating the Asian rust, according increased the defoliation intensity from the bottom to the top during the reproductive stages studied (R3, R5, R6) there is a linear ix decrease in plant yield. The damage simulation of Asian rust through defoliation levels on the cultivars, independent of the study methodology, showed the severity in reducing the leaf area and its consequent negative impact on yield. The genetic dissimilarity between cultivars from agromorphological traits varies according on the growing season. Through of molecular markers was demonstrated genetic variability between genotypes, with results different of the clusters formed from the agronomic traits. Thus, both the phenotypic and molecular data, proved to be informative tools to characterize the existing diversity between the soybean cultivars. And finally, regardless of the number of seeds (1, 2 or 3) per pods selected in F4, the frequency of the number of seeds in the pods of the next generation plants is not modified. In both study environment (greenhouse and field) the pods with 2 and 3 seeds had a direct and positive effect on yield.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2016-06-20T09:33:18Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1242987 bytes, checksum: 40686c6cb351db885dae39bee568b193 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-20T09:33:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1242987 bytes, checksum: 40686c6cb351db885dae39bee568b193 (MD5) Previous issue date: 2016-02-16 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O estudo da diversidade genética é fundamental, pois permite a identificação de genitores apropriados que podem ser usados para obtenção de uma população com maior variabilidade genética e consequentemente, com melhores possibilidades de combinações alélicas. Neste sentido, objetivou-se com este trabalho avaliar a variabilidade fenotípica e a diversidade genética de 160 linhagens elites de sorgo granífero, visando à utilização destas linhagens no desenvolvimento de futuros híbridos e populações melhoradas. Conduziu-se um experimento de campo para avaliar 23 descritores morfoagronômicos, em delineamento com blocos incompletos, com duas repetições. Adicionalmente, realizou-se a extração de DNA e as linhagens foram genotipadas com 29.649 marcadores SNPs, por meio da técnica de GBS (Genotyping by sequencing). Os dados morfoagronômicos foram analisados com base em modelos mistos. As análises de diversidade foram realizadas para os dados morfoagronômicos e moleculares, a partir de uma matriz de distâncias, formando- se agrupamentos das linhagens através do método de Neighbor-Joining. Foram realizadas análises de desequilíbrio de ligação, de estrutura populacional e de componentes principais para os dados moleculares. Paralelamente, avaliou-se 55 híbridos, para estimativas de correlações entre as distâncias genéticas dos parentais e rendimento de grãos de seus híbridos. Os resultados indicaram que: os caracteres morfoagronômicos foram menos informativos do que os moleculares. Considerando r 2 ~ 0,2, foi estimada a distância variando 100 a 800 kb entre pares de marcadores, sendo considerado um decaimento lento. A análise populacional indicou a existência provável de duas subpopulações nas linhagens. O agrupamento das linhagens com os dados genotípicos apresentaram-se mais coerentes de acordo com as características dos progenitores; e apesar da baixa variabilidade genética, houve divergência genética entre os grupos de linhagens mantenedoras e restauradoras. Conclui-se que os materiais avaliados possuem base genética próxima, o que sugere a necessidade de ampliar a diversidade genética do programa de melhoramento de sorgo granífero para aumentar a probabilidade de obtenção de híbridos superiores. / The study of genetic diversity is essential because it enables the identification of appropriate genitors for obtaining a population with greater genetic variability and more possibility of combinations. This study aimed to evaluate the phenotypic variability and genetic diversity of 160 grain sorghum elite inbred lines, seeking to use these for development of future hybrid and improved plant populations. An experiment was carried out in order to evaluate the 23 morpho-agronomic descriptors in a design of incomplete blocks with two replications. Additionally, DNA extraction was performed and genotyped with 29,649 SNPs markers by GBS technique (Genotyping by sequencing).The diversity analyses were performed based on morph-agronomic and molecular markers data, obtaining a distance matrix and forming clusters of inbred lines through the Neighbor- Joining method. Analyses of population structure and main components for the molecular data were performed. In parallel, 55 hybrids were evaluated to estimate the correlations between genetic distances of genitors and the performance of their hybrids regarding grain yield. The results indicated that: the morpho-agronomic traits were less informative than the molecular ones. Considering r2 ~ 0.2, was estimated the distance 100-800 kb between markers pairs, what is considered a slow decay. The population analysis indicated the probable existence of two subpopulations in the lines. The grouping of lines with the genotypic data was more consistent according to the characteristics of the progenitors; despite the low genetic variability, there was genetic divergence between groups of maintainers and restorers lines. It was concluded that the evaluated materials have similar genetic basis, which suggests the need to increase the genetic diversity of sorghum breeding program to increase the likelihood of obtaining superior hybrids.

ARAÚJO, Linda Brenna Ribeiro. Potencial genético de variedades tradicionais de feijão-caupi e avaliação para resistência à murcha-de-Fusarium. 2017. 80 f. Dissertação (Mestrado em Agronomia/Fitotecnia) - Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2017. / Submitted by Deocleciano Xavier (dixavier.ufc@gmail.com) on 2017-08-21T18:35:50Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Linda Brenna R Araújo_FINAL.pdf: 1356498 bytes, checksum: b4e907dfc4ac85e53f13d1e09c6d0d55 (MD5) / Approved for entry into archive by Jairo Viana (jairo@ufc.br) on 2017-08-29T20:36:01Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação Linda Brenna R Araújo_FINAL.pdf: 1356498 bytes, checksum: b4e907dfc4ac85e53f13d1e09c6d0d55 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-29T20:36:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação Linda Brenna R Araújo_FINAL.pdf: 1356498 bytes, checksum: b4e907dfc4ac85e53f13d1e09c6d0d55 (MD5) Previous issue date: 2017 / Traditional varieties are an important source of germplasm for several crops, and may present alleles that have long been lost, such as those that confer resistance to biotic and abiotic stresses. In the state of Ceará, the cultivation of the cowpea is highlighted because it is mainly carried out by family farmers who make use of these varieties, and their great adaptation to the region of cultivation and to the management adopted by the farmers can be used in the development of cultivars that better meet their demands. Thus, this work was carried out to evaluate the genetic potential of traditional varieties of cowpea collected from family farmers in the state of Ceará. In order to achieve this objective, laboratory analyzes, field and greenhouse tests were carried out. The laboratory analyzes consisted of the evaluation of the genetic diversity of the varieties through ISSR markers. The field experiments consisted of tests for the evaluation of morphological and agronomic descriptors in two environments: Fortaleza and Madalena, in the state of Ceará. The experiment in greenhouse was conducted to evaluate the existence of sources of resistance to Fusarium wilt by the root-dipping inoculation method. The ISSR markers selected for the study were efficient in identifying the genetic variability of the species, presenting high values of polymorphism and polymorphism information content (PIC). Even so, the genetic distance found between the studied varieties ranged from 0,05 to 0,31, values considered low and that suggest a narrow genetic base of the species. Some traditional varieties evaluated showed higher grain yield than commercial cultivars for the evaluated environments (3286.66 tons/ha), indicating a high agronomic potential and a great environmental adaptation. They presented greater genetic variability for the morphological characters evaluated, when compared to the molecular data. Regarding the severity of the disease, the varieties formed three distinct groups. The group with the lowest severity of the disease (25,00 to 32,50 %) consisted of thirty-seven varieties, the second group with intermediate values of severity (33,75 to 37,50 %) consisted of eight varieties and in the third Group were the five varieties that presented the highest values of severity (41,25 to 51,25 %). The varieties with the best results for agronomic traits, resistance to Fusarium wilt and greater genetic distance are promising for use in breeding programs. / As variedades tradicionais constituem importante fonte de germoplasma para diversas culturas, podendo apresentar alelos há muito perdidos, como os que conferem resistência a estresses bióticos e abióticos. No estado do Ceará, o cultivo do feijão-caupi tem destaque por ser realizado principalmente por agricultores familiares que fazem uso dessas variedades, e a grande adaptação delas à região de cultivo e ao manejo adotado pelos agricultores pode ser utilizada no desenvolvimento de cultivares que atendam melhor às suas demandas. Assim, objetivou-se com esse trabalho avaliar o potencial genético e a resistência à murcha-de-Fusarium de variedades tradicionais de feijão-caupi coletadas junto a agricultores familiares no estado do Ceará. Para se alcançar tal objetivo foram realizadas análises em laboratório, ensaios em campo e em casa de vegetação. As análises em laboratório constaram da avaliação da diversidade genética das variedades através de marcadores ISSR. Os experimentos de campo constaram de ensaios para a avaliação de descritores morfológicos e agronômicos em dois ambientes: Fortaleza e Madalena, no estado do Ceará. O ensaio em casa de vegetação foi realizado para avaliar a existência de fontes de resistência à murcha-de-Fusarium através do método de dipping. Os marcadores ISSR selecionados para o estudo foram eficientes na identificação da variabilidade genética dos genótipos, apresentando altos valores de polimorfismo e conteúdo de informação polimórfica (PIC). Ainda assim, a distância genética encontrada entre as variedades estudadas variou de 0,05 a 0,31, valores considerados baixos e que sugerem uma estreita base genética dos genótipos avaliados. Algumas variedades tradicionais avaliadas apresentaram produtividade de grãos superior às cultivares comerciais para os ambientes avaliados (3286,66 ton/ha), o que indica um alto potencial agronômico e uma grande adaptação ambiental. Elas apresentaram maior variabilidade genética para os caracteres morfológicos avaliados, quando comparados aos dados moleculares. Com relação à severidade da doença, as variedades formaram três grupos distintos. O grupo com a menor severidade da doença (25,00 a 32,50 %) foi constituído por trinta e sete variedades, o segundo grupo com valores intermediários de severidade (33,75 a 37,50 %) foi constituído por oito variedades e no terceiro grupo ficaram as cinco variedades que apresentaram os maiores valores de severidade (41,25 a 51,25 %). As variedades com melhores resultados para os caracteres agronômicos, de resistência à murcha-de-Fusarium e maior distância genética são promissoras para uso em programas de melhoramento genético.

Made available in DSpace on 2016-08-29T15:37:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_8344_Dissertação Final Larissa Vianna.pdf: 1816030 bytes, checksum: db630057efda6e596abefc0d380531fa (MD5) Previous issue date: 2015-02-26 / CAPES / Vochysia bifalcata é conhecida popularmente como Guaricica, é uma espécie arbórea neotropical cuja sobrevivência encontra-se ameaçada devido aos processos de degradação de seus ambientes naturais e exploração antrópica, considerado o estado de ameaça em que se encontram, faz-se necessário obter informações mais detalhadas sobre a diversidade genética de populações naturais desta espécie, o que é possível a partir de estudos com marcadores microssatélites. Neste contexto, o objetvo do presente estudo foi avaliar a diversidade genética da espécie Vochysia bifalcata em duas populações nativas estabelecidas no Parque Nacional do Caparaó, ES, bem como, caracterizar a fertilidade do solo. Para tanto, foram coletadas amostras foliares de 28 individuos adultos em ambas populações, os testes de transferifilidades foram realizados utilizando 8 primers microssatélites desenvolvidos para Qualea grandiflora e 10 desenvolvidos para Vochysia ferrugínea no genoma dos indivíduos de Vochysia bifalcata. Os marcadores que geraram amplificações satisfatórias foram utilizados para os estudos de diversidade e estrutura genética em todos os 28 indivíduos amostrados. Para a caracterização dos atributos químicos do solo, foram selecionados aleatoriamente seis pontos de amostragem de solos em cada população, nas camadas de 0 – 5; 5 – 10 e 10 – 20 cm. Os resultados de amplificação heteróloga de Vochysia ferruginea para V. bifalcata foram satisfatórios, sendo utilizados para as análises estatísticas e de Qualea grandiflora para V. bifalcata foram satisfatórios, entretanto se mostraram monomórficos. Para os iniciadores de V. ferruginea os resultados mostraram a ocorrência média de 4,85 alelos/loco. Dois dos sete locos analisados evidenciaram a presença de alelos nulos, com frequência significativa. Os valores de riqueza alélica foram similares entre as duas populações. O valor médio de heterozigosidade observada para a população I foi 0,434 e para população II foi 0,355, ambos distintos do esperado para o equilíbrio de Hardy-Weinberg. O índice de fixação médio para a população I foi de 0,390 e para a população II de 0,328, indicando presença de endogamia nas populações. O valor médio do Conteúdo de Informação Polimórfica (PIC) foi de 0,608 para a população I e 0,566 para a população II, sendo considerados altamente informativos. O par de genótipos (9 e 11) e (5 e 9) foram identificados como os menos dissimilares na população I e população II, respectivamente. O valor de GST (0,079), indicou uma diferenciação genética moderada entre as populações. Para AMOVA, 10 92,86% da variação foram dentro de populações e 7,13% entre populações. Com a análise bayesiana foi possível definir a divisão dos genótipos em dois grupos. O fluxo gênico médio obtido foi de 2,88 sendo considerado alto o suficiente para contrapor os efeitos da deriva genética. Os parâmetros genéticos obtidos geraram informações sobre a variabilidade genética existente, comprovando a importância do Parque Nacional do Caparaó para fins conservacionistas. As amostras de solos analisadas evidenciaram que a fertilidade de ambas populações apresenta-se baixas e com uma acidez elevada / Vochysia bifalcata is popularly known as Guaricica, is a tree neotropical species whose survival is threatened due to degradation processes of the natural environment and man operation, considered the threat of state they are in, it is necessary to obtain more detailed information the genetic diversity of natural populations of this species, which is possible from studies with microsatellite markers. In this context, the present study was to evaluate objetvo the genetic diversity of Vochysia bifalcata species and characterize soil fertility in two native populations established in Caparaó National Park, ES. Therefore, leaf samples from 28 adult individuals were collected from two native populations of V. bifalta. For transferability test were tested 8 microsatellite primers developed for Qualea grandiflora and 10 designed to Vochysia ferruginea in the genome of individuals to V. bifalcata. Total genomic DNA was isolated using the Doyle & Doyle protocol (1990) modified. The amplified fragments were separated by electrophoresis on gel polyacrylamide 10% with 1X TBE buffer. Electrophoresis was performed at constant voltage of 100 W for 5 hours. The markers that generate satisfactory amplifications were then used for the studies and genetic diversity of structure in all 28 individuals sampled. We randomly selected six soil sampling points in each population at depths 0-5; 5-10 e 10-20 cm and chemical analyzes were performed using the methodology proposed by EMBRAPA (1997). The heterologous amplification results for V. ferruginea to V. bifalcata were satisfactory, and then used for statistical analysis and Q. grandiflora for V. bifalcata were satisfactory, however proved to be monomorphic. For starters, V. ferruginea the results showed the average occurrence of 4.85 alleles/locus. In both two populations of seven loci analyzed suggested the presence of null alleles, with significant frequency. The allelic richness were similar between the two populations. The average observed heterozygosity for the population I was 0.434 and population II was 0.355, both distinct from the expected to the Hardy-Weinberg equilibrium. The average fixation index for the population I was 0.390 and the population II was 0.328, indicating the presence of inbreeding within populations. The average value of Polymorphic Information Content (PIC) was 0.608 for the population I and 0.566 for the population II and are considered highly informative. The pair of genotypes (9 and 11) and (5 and 9) were identified as the least dissimilar opulations the population I and II, respectively. The amount of GST (0.079) indicated a moderate genetic differentiation among populations. To AMOVA, 92.86% of the variation was within 12 populations and among populations 7.13%. After analyzing the program, STRUCTURE was possible to define the division into two groups of genotypes. The obtained average gene flow was 2.88 being considered high enough to counteract the effects of genetic drift. These data generate important information about the genetic variability, proving the importance of Caparaó National Park for the species conservation. Soil samples analyzed demonstrated that the fertility of both populations are present and a low acidity, the homogeneity of the soil fertility can be explained by the soil and climatic characteristics similar between the two study populations.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:07Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-09-24Bitstream added on 2014-06-13T18:54:05Z : No. of bitstreams: 1 vechetini_me_me_jabo.pdf: 579041 bytes, checksum: 90bdfc2c0590f6beb86275f97fa9a321 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / Este estudo foi conduzido com 125 novilhas da raça Nelore de três rebanhos: Nelore Seleção (NeS), Nelore Tradicional (NeT), ambos selecionados para peso ao sobreano, e Nelore Controle (NeC), selecionado para a média deste peso, com o objetivo de avaliar polimorfismos do tipo PCR-RFLP's nos genes OGA T1 e LEPTlNA. Os rebanhos analisados pertencem ao Programa de Melhoramento Genético das Raças Zebuínas, da Estação Experimental de Zootecnia de Sertãozinho - SP - Brasil. O DNA genômico foi extraído de leucócitos pelo método salino. Para a amplificação dos fragmentos de gene foram utilizados oligonucleotídeos iniciadores previamente descritos na literatura. Os produtos de PCR foram digeridos com enzimas de restrição para a detecção dos polimorfismos OGAT1 - Eael e LEPTlNA - BsaAI, e submetidos a eletroforese em gel de agarose. O OGAT1K (Iisina) foi o alelo que apresentou maior freqüência n nos rebanhos. As maiores freqüências do genótipo OGA T1KK foram encontradas nos rebanhos selecionados NeS e NeT, respectivamente, seguido pelo heterozigoto OGAT1KA. Nenhum animal apresentou o genótipo OGAT1AA (alanina). As freqüências alélicas e genotípicas do OGA T1 não diferiram entre NeS e NeT, mas foram estatisticamente diferentes (p<0,05) entre esses e o rebanho controle NeC. Em relação ao hormônio Leptina, as freqüências dos alelos foram LEP A = LEP G = 0,50 em toda a população. O heterozigoto LEP AG foi o genótipo que apresentou maior freqüência para os três rebanhos A maior freqüência do genótipo LEP GG foi observada no rebanho controle (NeC), mas as freqüências alélicas e genotípicas entre os rebanhos não foram estatisticamente diferentes. / This study was conducted with 125 Nelore heifers from three different herds: selection (NeS), traditional (NeT), both selected for yearling weight, and contrai (NeC), selected for mean yearling weight, and had the objective of looking for PCR-RFLP's polymorphisms in DGA T1 and LEPTlN genes. The herds analysed belong to the Zebu Breeding Pragram, of the Animal B:-8eding Experiment Station of Sertãozinho - SP - Brazil. The DNA was extracted fram leukocytes by the saline protocol, and to amplify the gene fragments primers previously described were used. The PCR products were digested by restriction enzymes to detect the DGA T1 - Eael e LEPTlNA - BsaAI polymorphisms, and were submitted to electraphoresis. The DGAT1K allele (Iisine) presented the larger frequency in the population. The highest frequencies of the DGA T1KK were found in the NeS e NeT herds, respectively, followed by the DGA T1KA. Neither animal presented the DGA T1AA genotype (alanine). Selected herds (NeS and NeT) allelic and genotypic frequencies for this locus were not significanttly different. Howerver, significant differences (p<0.05) were detected between the selected (NeS and NeT) and the control herds (NeC). In respect of the Leptin hormone, the allele frequencies were LEP A = LEP G = 0,50 in all the population. The LEP AG was the most frequent genotype in all the three herds. The control group (NeC) presented the LEP GG largest frequency, however, no significant differences were observed among the three herds for this locus.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:08Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-03-05Bitstream added on 2014-06-13T19:33:26Z : No. of bitstreams: 1 mancini_mc_me_jabo.pdf: 661667 bytes, checksum: 93a47f0775d75ffee87421531e42770c (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O objetivo deste trabalho foi construir um mapa de ligação e identificar marcadores associados aos componentes de produção (diâmetro, peso, altura, número de perfilhos e TCH) e parâmetros de qualidade (Fibra, Brix e Pol%Cana), em uma progênie derivada cruzamento entre o clone IACSP95-3018 e a cultivar IACSP93-3046, desenvolvidas pelo Programa de Melhoramento Cana IAC. Para tanto, foram utilizados marcadores moleculares do tipo AFLP e microssatélites genômicos e derivados de ESTs. A progênie mostrou grande variabilidade genética tanto para os componentes de produção quanto aos parâmetros de qualidade. O mapa de ligação foi composto por 231 marcadores segregando em dose única, distribuídos em 72 grupos de ligação (GL) que deram origem a dez grupos de homologia, com cobertura de 2436 centiMorgans (cM) e distância média entre marcadores de 10,55 cM, com distribuição irregular ao longo do cromossomo. O comprimento dos GLs variou de 1 a 96 cM. Os marcadores em dose única foram utilizados na análise de marcas simples para a identificação de prováveis QTLs associados às características fenotípicas obtidas em cana planta e cana soca. Um total de 155 associações marcador/característica foi encontrado a p<0,05 para as oito características avaliadas e 84 foram mapeadas em 34 GLs, sendo que apenas 16 foram observadas nos dois anos da cultura para a mesma característica / The objective of this study was to construct a linkage map and identify markers associated with yield components (diameter, weight, height, stalk number and productivity) and quality parameters (Brix, Fiber and Pol%Cana), in a progeny derived from a cross of the elite clone IACSP95-3018 and the variety IACSP93-3046, both developed from the IAC Sugarcane Breeding Program. We used molecular markers AFLP and genomic and derived from ESTs microsatellites. The progeny showed high genetic variability for both yield components and quality parameters. The genetic map was composed by 231 single markers dose, distributed onto 72 linkage groups (LG) which resulted in ten homology groups, with coverage 2436 centiMorgans (cM) and average distance between markers of 10.55, with irregular distribution along the chromosome. The length of the LG raging from 1 to 96 cM. Single marker trait association analysis was performed with the single dose markers to identify putative QTLs associated with the phenotypic measures obtained at cane plant and ratoon cane. A total of 155 marker/trait association was detected at p<0.05 for the eight traits evaluated and 84 were mapped in 34LGs, and only 16 were observed in both cycles for the same trait

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:33:40Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-02-27Bitstream added on 2014-06-13T19:23:54Z : No. of bitstreams: 1 luz_fjf_dr_jabo.pdf: 696825 bytes, checksum: e6fae364aaea139b88622f336be9f094 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA) / Com o objetivo de ampliar o conhecimento sobre uma coleção de pimentas da Embrapa Roraima, foram realizadas caracterizações morfológica com descritores do IPGRI e molecular com marcadores fAFLP, de 58 acessos de Capsicum chinense. Os resultados da avaliação morfológica detectaram que, 39% dos acessos não se agruparam e entre os mesmos observou-se uma dissimilaridade de até 70%, com 50% de média. A caracterização molecular revelou uma dissimilaridade média de 22,3% entre os acessos levando à conclusão de que há uma pequena variabilidade genética entre os acessos, considerando o genoma como um todo. Os resultados demonstraram que as diferenças morfológicas estariam baseadas apenas em uma parte do genoma das pimentas, focada em características visíveis e mensuráveis pelo ser humano. Por outro lado, a variação observada a partir do DNA genômico por meio do marcador molecular utilizado não foi suficiente para ratificar as diferenças morfológicas observadas. Ambas as formas de caracterizar os acessos foram úteis e necessárias para o conhecimento dos mesmos, revelando informações valiosas para estratégias de conservação e uso das pimentas da Amazônia. / In order to raise the knowledge about a pepper collection from Embrapa Roraima, IPGRI morphological descriptors and fAFLP molecular marker were used to characterize 58 acessions of Capsicum chinense, contributing with information about the diversity of those plants. The results of morphological evaluation showed that 39% of the accessions did not group together and it also detected a great dissimilarity among the accessions, reaching values above 70%, with a 50% medium. The molecular characterization showed an average dissimilarity of 22,3%, indicating little genetic variability on the collection evaluated, considering the total genome of the plants. These results demonstrate that variation detected by morphological descriptors would be related to only a small part of pepper genome, focusing on human visible and measurable traits. The variation observed directly on the genome by the molecular marker used was not sufficient to confirm the morphological differences observed among the accessions. Both ways of characterizing the accessions were useful and necessary to their knowledge, revealing valuable information for conservation strategies and the use of amazon peppers.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 696310 bytes, checksum: 885479e14190b04344238aca73a62d1d (MD5) Previous issue date: 2007-02-28 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The Zabrotes subfasciatus Boheman (Coleoptera: Bruchidae) is a species probably originated from Central America. It became an agricultural pest since it was established and continually began to reproduce in stored seeds and later diffused throughout tropical and subtropical regions. In stores, those insects cause damages to the grains, by boring them and giving them an unpleasant flavor, therefore depreciating their commercial value. In seeds, the pest consumes the reserves of the cotyledons, therefore endangering germination. This study was conducted to estimate the genetic diversity in Z. subfasciatus populations, by using the molecular markers ISSR (Inter Simple Sequence Repeat). Twelve populations of Z. subfasciatus amostradas were sampled in eight Brazilian states as totaling 269 individuals, then they were evaluate. Five primers ISSR (UBC 807, UBC 808, UBC 809, UBC 811, UBC 891) were used, whereas a total of 51 polymorphic bands averaging 10 bands by each primer were amplified. The percent polymorphism within each population ranged from 74.51 to 92.16, with an average percentage of 83.82. The expected heterozygozite corrected by Nei in 1978 ranged from 0.2253 to 0.;3281 with some 0.2885 average, whereas the genetic diversity index by Shannon and Weaver (HE) ranged from 0.2908 to 0.4805, as averaging 0.4167. At species level, those two indexes showed the values 0.3636 and 0.5393 respectively. The FST values between the population pairs obtained by molecular variance analysis (AMOVA) ranged from 0.06804 to 0.6165. The genetic distance by Nei used in estimation of the genetic divergence among populations ranged from 0.0563 to 0.3250. The AMOVA allowed for the partition of the genetic variation into two levels: either inside and among populations. Higher genetic variation was observed inside population, with 66% of the total variation. Only 34% genetic variation were observed among populations. The Mantel` test showed low correlation between geographical distance and FST, genetic identity and FST, and between the Nei´genetic distance and FST. According to the results, the following conclusions were drawn: the genetic variability of the species is still considered as low in Brazil, probably due to the recent introduction of the pest; and those Zabrotes subfasciatus populations showed to be not geographically structured in Brazil. / Zabrotes subfasciatus Boheman (Coleoptera: Bruchidae), espécie originária provavelmente na América Central, se tornou uma praga agrícola quando se estabeleceu e passou a se reproduzir continuamente em sementes armazenadas, difundindo-se posteriormente pelas regiões tropicais e subtropicais. Em armazéns, esses insetos causam danos aos grãos, perfurando-os e conferindo-lhes sabor desagradável, depreciando o seu valor comercial. Nas sementes, a praga consome as reservas dos cotilédones, comprometendo a germinação. O objetivo deste trabalho foi estimar a diversidade genética de populações de Z. subfasciatus por meio de marcadores moleculares ISSR (Inter Simple Sequence Repeat). Foram avaliadas 12 populações de Z. subfasciatus, amostradas em oito estados brasileiros, totalizando 269 indivíduos. Cinco primers ISSR foram utilizados (UBC 807, UBC 808, UBC 809, UBC 811, UBC 891), sendo amplificadas um total de 51 bandas polimórficas com média de 10 bandas por primer. A porcentagem de polimorfismo dentro de cada população variou de 74,51 a 92,16, com porcentagem média de 83,82. A heterozigosidade esperada corrigida de Nei (HE), variou de 0,2253 a 0,3281, com média de 0,2885 e o índice de diversidade genética de de Shannon e Weaver (I) variou de 0,2908 a 0,4805, com média de 0,4167. Em nível de espécie, estes dois índices apresentaram valores de 0,3636 e 0,5393 respectivamente. Os valores de FST entre pares de populações obtidos pela análise de variância molecular (AMOVA) variaram de 0,06804 a 0,6165. A distância genética de Nei (1978), usada para estimar a divergência genética entre populações, variou de 0,0563 a 0,3250. A AMOVA permitiu uma partição da variação genética em dois níveis: dentro de populações e entre populações. Foi observada maior variação genética dentro da população, com 66% da variação total. Apenas 34% da variação genética foi observada entre populações. O teste de Mantel revelou baixa correlação entre distância geográfica e FST, identidade genética e FST e entre distância genética de Nei e FST. Pode-se concluir que a variabilidade genética da espécie ainda é considerada baixa no Brasil, provavelmente devido à introdução recente da praga. As populações de Zabrotes subfasciatus avaliadas não se apresentam geograficamente estruturadas no Brasil.