Submitted by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-04-13T19:59:37Z No. of bitstreams: 1 TESE Phelipe Manoel Oller Costa.pdf: 1999949 bytes, checksum: 49abf0731b768bcf9bffb00d8885126f (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-13T19:59:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TESE Phelipe Manoel Oller Costa.pdf: 1999949 bytes, checksum: 49abf0731b768bcf9bffb00d8885126f (MD5) Previous issue date: 2015-02-26 / CNPQ / Sistemas agroflorestais se apresentam como alternativa à monocultura agrícola, por serem mais sustentáveis. Dentre suas vantagens, destaca-se o grande aporte de serapilheira sobre o solo que contribui para adição de matéria orgânica, contribuindo com aumento da diversidade e a atividade de microrganismos no solo, fertilidade e produtividade. Os fungos são importantes componentes da microbiota do solo e são fundamentais para a manutenção e o funcionamento de solos por participarem da ciclagem da matéria orgânica. Assim, o objetivo desse trabalho foi estudar a dinâmica da serapilheira em sistema agroflorestal e seu efeito sobre a estrutura e função da comunidade de fungos filamentosos no solo desse sistema de cultivo. Foram coletados mensalmente dados de serapilheira total produzida e trimestralmente de serapilheira total acumulada no solo, durante três anos de pesquisa. Foi estimada a taxa de decomposição, pela relação entre o material produzido e acumulado, e a velocidade de decomposição foi determinada com o uso de litterbags. Foram também realizadas oito coletas de solo a cada três meses. As amostras de solo foram submetidas à análise química, isolamento de fungos pela técnica da diluição seriada, análise molecular da comunidade de fungos filamentosos pela técnica de eletroforese em gel com gradiente desnaturante (DGGE) e análise da evolução do CO2. Por meio dos dados obtidos no isolamento foi determinada a densidade, diversidade, riqueza, equitabilidade, dominância e aplicados modelos hipotéticos de distribuição de abundância das espécies. A produção média anual de serapilheira foi de 8.383 kg.ha-1 e a média anual de serapilheira acumulada foi 6.320 kg.ha-1. A taxa média anual de decomposição da serapilheira foi estimada em 1,41. A respiração microbiana não apresentou diferença estatística entre os períodos avaliados. Foi constatado que o processo de decomposição da serapilheira é lento, apresentando perdas mais significativas nos três primeiros meses. Foram identificadas 110 espécies de fungos, sendo a maioria sapróbios e algumas espécies que também são potenciais antagonistas de organismos fitopatógenos. O modelo serie logarítmica foi o que melhor representou a comunidade. A diversidade e a riqueza foram altas, permanecendo sem grandes variações durante o período avaliado, porém a estrutura da comunidade sofre mudanças durante o processo de decomposição da serapilheira. O sistema agroflorestal apresenta dinâmica de serapilheira dentro da faixa esperada para florestas tropicais, particularmente semelhante à de Mata Atlântica, influenciada pela precipitação pluviométrica, sendo maior nas estações de estiagem. / Agroforestry systems are an alternative to monoculture crops as they are recognized as models of sustainable soils using. They have greater input of litter on the soil which contributes to addition of organic matter, to increased diversity and microbial activity in the soil, fertility and productivity. Fungi are major components of soil microbial communities and are fundamental to the maintenance and functioning of land for participating in the cycling organic matter. The objective of this work was to study the litter dynamics in agroforestry system and its effect on the structure and function of soil fungi community. During three years of research, were sampled monthly litter fall and quarterly accumulation litter. Annual decomposition were also estimated by the ratio produced:accumulation litter. The rate of decomposition was determined using litterbags. Quarterly soil collections were carried out, totaling from eight samples. Soil samples were submitted to chemical analysis, isolation of fungi by the technique of serial dilutions, molecular analysis of filamentous fungi community by gel electrophoresis in denaturing gradient (DGGE) and analysis of the evolution of CO2. Using data obtained in the isolation was determined the density, diversity, richness, evenness, dominance and applied hypothetical models of distribution of species abundance. The average annual litter fall was 8,383 kg ha-1 and the average annual accumulation litter was 6,320 kg ha-1. The average annual rate of decomposition of litter was estimated at 1.41. Microbial respiration rates was not significant between the periods. Has been found that litter decomposition process is slow, with more significant loss in the first three months. 110 species of fungi have been identified, most saprobes, and some species that are also potential antagonists of plant pathogens organisms. The log-series model was the better fitted the community. The diversity and the richness were high, remaining without major changes during the study period, but the community structure undergoes changes during the process of decomposition of litter. This study showed that the agroforestry system presents litterfall and litter accumulation in the expected range for tropical forests, and particularly similar to the Atlantic Forest, which is influenced by rainfall.

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:06:38Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo535_1.pdf: 3371000 bytes, checksum: febaed24d114c7c2a823b525626f77e7 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2011 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Os fungos gasteróides são caracterizados principalmente pelo basidioma angiocárpico e liberação passiva dos basidiosporos. Até o momento, 232 espécies de fungos gasteróides estão registradas para o Brasil, sendo que o conhecimento do grupo vem aumentando desde o início do século XXI. Com o objetivo de conhecer melhor estes organismos no Brasil, a diversidade e aspectos ecológicos de fungos gasteróides foram investigados em quatro remanescentes de Mata Atlântica no estado de Pernambuco. Um transecto de 20 × 500 m foi delimitado em cada área de estudo e estes foram percorridos em cada saída de campo, totalizando 36 visitas. Foram coletados 229 espécimes de fungos gasteróides, correspondendo à 16 espécies distribuídas em cinco gêneros e cinco famílias. Dentre as espécies identificadas, Cyathus setosus representa novo registro para o Brasil, enquanto quatro espécies são novos registros para o Nordeste e três para Pernambuco. Geastraceae foi a família com maior número de espécies (9). A RPPN Carnijó apresentou maior número de espécies (12), e somente duas espécies foram comuns às quatro áreas de estudo. A composição de espécies do Brejo dos Cavalos foi estatisticamente distinta de Dois Irmãos e Carnijó, e não houve diferença significativa na diversidade de espécies entre as épocas de coleta (meses secos e meses chuvosos) nas quatro localidades

Submitted by Amanda Silva (amanda.osilva2@ufpe.br) on 2015-03-11T14:35:46Z No. of bitstreams: 2 TESE Thaís Emanuelle Lima.pdf: 2722576 bytes, checksum: e426fab41a74285cee3e9127d0500ab0 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-11T14:35:46Z (GMT). No. of bitstreams: 2 TESE Thaís Emanuelle Lima.pdf: 2722576 bytes, checksum: e426fab41a74285cee3e9127d0500ab0 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2014-02-26 / Este trabalho objetivou (1) determinar a micobiota da rizosfera, do rizoplano e endófita de raízes de Vitis labrusca cv. Isabel; (2) avaliar a patogenicidade e a capacidade de recolonização de algumas espécies endófitas selecionadas em folhas e raízes; (3) determinar a frequência de ocorrência dos fungos isolados e a similaridade entre a micobiota endófita das raízes, do rizoplano e da rizosfera; (4) determinar o padrão de recolonização e a patogenicidade (capacidade de ser um patógeno latente) de espécies endófitas selecionadas através da inoculação em mudas de V. labrusca, e, (5) confirmar, através de técnicas moleculares (ISSR), a identificação das espécies inoculadas e re-isoladas. De janeiro a dezembro de 2011 foram efetuadas seis coletas da rizosfera e raízes de V. labrusca cv. Isabel em São Vicente Férrer, Pernambuco. Fragmentos de raízes (324) foram desinfestados em álcool 70% (1min), hipoclorito de sódio a 3% (2 min), álcool 70% (30s), e em seguida lavados com água destilada esterilizada (ADE) e incubados em meio Batata-Dextrose-Ágar (BDA) + cloranfenicol (50mg/L-1). As amostras de rizosfera foram submetidas à técnica de diluição sucessiva, onde 25g de solo foram suspensos em 225ml de ADE. Desta diluição, 10ml foi adicionado a 990ml de ADE da qual 1ml foi semeada em meio Ágar Sabouraud com Rosa de bengala (SAB+Rb). Amostras do rizoplano (2mg) foram inoculadas em meio SAB+Rb. As placas foram incubadas em temperatura ambiente e observadas quanto ao crescimento fúngico. As colônias, após purificadas, foram identificadas com base nas características macro e microestruturais. Para a avaliação da capacidade de colonização, Nigrospora oryzae e Fusarium merismoides, fungos endófitos isolados de indivíduos adultos de videiras, foram inoculados pulverizando 1,5x106 esporos/mL-1 com 10 ml, a cada 15 dias, durante 8 semanas, no solo e nas folhas de mudas de videiras com 40 dias de cultivo, e avaliados após 30, 60 e 90 dias por meio do re-isolamento desses fungos das raízes e folhas. Para a avaliação da patogenicidade às raízes, Fusarium oxysporum e Lasiodiplodia theobromae foram inoculados em mudas com 90 dias, por meio de pulverizações de 1,5x106 esporos/mL-1 com e sem escarificação das raízes. Nas folhas, Guignardia mangiferae e Colletotrichum gloeosporioides foram inoculados com ferimento, por meio da fixação de discos de micélio à superfície abaxial das folhas, e sem ferimento, por meio de pulverizações da suspensão de inóculos dos fungos. As mudas foram cobertas com sacos plásticos umedecidos com ADE e mantidas em câmara úmida por 48h. O aparecimento de sintomas foi avaliado durante 30 dias, e realizado o re-isolamento dos fungos testados em meio BDA. Fusarium oxysporum, F. merismoides e Cylindrocladiella camelliae foram as espécies mais isoladas como endófitas de raízes. Na rizosfera as espécies mais representativas foram: F. oysporum e F. merismoides e para o rizoplano: Aspergillus carbonarius, A. japonicus e Trichoderma koningii e T. virens. Dentre os endófitos inoculados somente N. oryzae foi isolada de folhas (oito re-isolamentos) após 30 e 60 dias da inoculação, havendo similaridade genética entre seis isolados pelos primers (GACA)4 e (GTG)5. Nenhum dos fungos isolados endófitos inoculados causou sintomas nas mudas de videiras.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-04-20T18:12:57Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1130155 bytes, checksum: 0950afcb6db136da799b0f7aae36c9f8 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-20T18:12:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1130155 bytes, checksum: 0950afcb6db136da799b0f7aae36c9f8 (MD5) Previous issue date: 2003-07-24 / Schinus terebinthifolius é uma planta originária do Brasil, Paraguai e Argentina. Foi introduzida em outros países como ornamental, tornando-se posteriormente uma planta invasora. Visando subsidiar futuros programas de controle biológico de S. terebinthifolius, utilizando-se fungos fitopatogênicos em locais onde esta tenha se tornado invasora, buscou-se ampliar o conhecimento sobre a micobiota associada a esta planta. Para isso, foi realizado entre o segundo semestre de 2001 e início de 2003, um levantamento desta micobiota, na região sudeste do Brasil. Foram identificados os fungos Hainesia lythri, Pilidium concavum, Meliola sp., Irenopsis sp., Septoria sp., Phyllosticta sp., Stenella sp., Pseudocercospora sp. e Pseuderythrogloeum schini gen. nov.. A patogenicidade de Hainesia lythri, Pilidium concavum e Septoria sp., foram comprovadas através da realização do postulado de Kock. Inoculações de Pseudocercospora sp. e Pseuderythrogloeum schini em S. terebinthifolius provocaram sintomas, mas estes não foram reisolados. Inoculações feitas com Stenella sp. não resultaram em sintomas. Foi realizado teste simplificado de especificidade para o fungo Septoria sp., utilizando-se outras plantas da família Anacardiaceae. Tais plantas não foram infectadas por Septoria sp.. A severidade da doença provocada por Septoria sp. em Schinus terebinthifolius, tanto em condições de campo, quanto em condições controladas, bem como a sua especificidade, fazem deste fungo um possível candidato a agente de controle biológico de Schinus terebinthifolius. Entretanto, o potencial deste fungo deve ser mais estudado. / Schinus terebinthifolius is a plant belonging to the Anacardiaceae native from Brazil, Paraguay and Argentina. It was introduced as an ornamental in many countries often becoming invasive in natural habitats. A search for pathogenic fungi associated to S. terebinthifolius was conducted in part of its native range of distribution in Brazil aimed at the discovery of potential candidates to be used as biocontrol agents against this plant. Several survey trips were carried out from 2001 to 2003 in Southeastern Brazil. Specimens available from previous ad hoc collections were also included. The following fungi were found during the surveys: Meliola sp., Irenopsis sp., Hainesia lythri, Pilidium concavum, Septoria sp., Phyllosticta sp., Pseudoerythrogloeum (gen. nov.), Stenella sp., Pseudocercospora sp., Corticium sp., Phomopsis sp. and Oidium sp. Some of them had their taxonomy studied in more detail: Meliola sp., Irenopsis sp., , Septoria sp., Phyllosticta sp., Stenella sp., Pseudocercospora sp., Hainesia lythri, Pilidium concavum. The first five clearly represent new species to science and will be published soon. Pseudocercospora sp. is presently inadequately placed in Cercospora and requires a recombination. Additionally a coelomycete that was found couldn’t be placed in any known genus and the new genus Pseuderythrogloeum will be proposed based on specimens of this fungus. The pathogenicity of Hainesia lythri, Pilidium concavum and Septoria sp. were demonstrated. Inoculations of Pseudocercospora sp. and Pseuderythrogloeum schini in S. terebinthifolius also produced symptoms, but results were dubious as the fungus couldn’t be recovered from seemingly diseased tissues, after inoculation. Although field observations suggest that Stenella sp. is also a pathogen inoculations didn’t produce any symptoms. A simplified host-specificity test was performed for Septoria sp. involving only a limited number of plants belonging to the Anacardiaceae (Table 1). Only S. terebinthifolius was infected by Septoria sp.. The significant defoliation that Septoria sp. caused both in field as well as under controlled conditions together with the indications that this fungus is host-specific suggested by the results from the preliminary essay indicates that this species is a potential biological control agent for Schinus terebinthifolius. It is nevertheless acknowledged here that additional work is necessary in order to confirm that. / Dissertação importada do Alexandria

Submitted by Daniella Sodre (daniella.sodre@ufpe.br) on 2015-03-17T14:19:53Z No. of bitstreams: 2 Tese Allyne Silva.pdf: 4941442 bytes, checksum: 50b2e8bcec71a4c3d568843d1a90f396 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-17T14:19:53Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese Allyne Silva.pdf: 4941442 bytes, checksum: 50b2e8bcec71a4c3d568843d1a90f396 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2013-02-22 / CNPq e CAPES / Os fungos poróides são popularmente chamados de “orelhas-de-pau” devido ao hábito do basidioma, onde produzem holobasídios clavados, em himênio geralmente tubular bem definido. A maioria das espécies desse grupo de fungos apresenta um papel particularmente importante devido à capacidade de degradação de madeira nos diferentes ecossistemas. Para ampliar o conhecimento sobre a diversidade e aspectos ecológicos de fungos poróides na Amazônia brasileira, foram realizadas revisão de exsicatas de fungos poróides coletados na Amazônia e depositados em herbários e coletas em duas áreas de terra firme no município de Porto Velho, Rondônia: Parque Natural Municipal (PNM) e Estação Ecológica de Cuniã (ESEC), em julho de 2009 (período seco), fevereiro (chuvoso) e julho de 2010 (seco) e fevereiro de 2011 (chuvoso), totalizando oito visitas. Foram coletados 398 espécimes de fungos poróides, representantes de seis famílias, 32 gêneros e 77 espécies, das quais nove são novas para a ciência. Todas as famílias estiveram presentes nas duas áreas de estudo. Vinte espécies foram comuns para ambas as áreas; o PNM apresentou o maior número de espécies exclusivas (37, 19 para a ESEC). A riqueza de espécies não diferiu significativamente entre as áreas de coleta, mas maior abundância foi encontrada no PNM. Maior riqueza e abundância foram encontradas no período chuvoso. Cento e oitenta e oito espécimes foram coletados em áreas adicionais localizadas em Porto Velho e representaram 52 espécies, das quais quatro são novas para a ciência e 20 exclusivas a essas áreas. Desse modo, foram identificadas, ao todo, 97 espécies provenientes de coletas. A partir da revisão de 5.933 exsicatas de fungos poróides coletados na Amazônia e depositados nos Herbários INPA, SP, UFACPZ e URM foram encontradas 212 espécies, distribuídas nos diferentes Estados da Amazônia brasileira, das quais quatro espécies novas para a ciência e 137 encontradas exclusivamente nesses herbários. No total, 238 espécies são registradas para a Amazônia brasileira. Dezessete espécies são novas para a ciência, enquanto 17 são novos registros para o Brasil e 40 para Amazônia brasileira. Onze famílias foram registradas, sendo Polyporaceae com maior número de gêneros e espécies (27 e 104, respectivamente), seguida por Hymenochaetaceae (nove e 46) e Ganodermataceae (quatro e 42). Baseado em análises morfológicas e/ou moleculares da região ITS rDNA, 27 espécies de Amauroderma, muitas morfologicamente semelhantes, foram delimitadas, das quais nove (A. albostipitatum, A. floriforme, A. laccatostiptatum, A. lemoniforme, A minimum, A. ovisporum, A. paraelegantissimum, A. subsessile e A. sessile) são propostas como novas para a ciência.

Submitted by Leonardo Freitas (leonardo.hfreitas@ufpe.br) on 2015-04-08T18:40:04Z No. of bitstreams: 2 Tese Allyne Silva.pdf: 4941442 bytes, checksum: 50b2e8bcec71a4c3d568843d1a90f396 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-04-08T18:40:04Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese Allyne Silva.pdf: 4941442 bytes, checksum: 50b2e8bcec71a4c3d568843d1a90f396 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2013-02-22 / CNPq; CAPES / Os fungos poróides são popularmente chamados de “orelhas-de-pau” devido ao hábito do basidioma, onde produzem holobasídios clavados, em himênio geralmente tubular bem definido. A maioria das espécies desse grupo de fungos apresenta um papel particularmente importante devido à capacidade de degradação de madeira nos diferentes ecossistemas. Para ampliar o conhecimento sobre a diversidade e aspectos ecológicos de fungos poróides na Amazônia brasileira, foram realizadas revisão de exsicatas de fungos poróides coletados na Amazônia e depositados em herbários e coletas em duas áreas de terra firme no município de Porto Velho, Rondônia: Parque Natural Municipal (PNM) e Estação Ecológica de Cuniã (ESEC), em julho de 2009 (período seco), fevereiro (chuvoso) e julho de 2010 (seco) e fevereiro de 2011 (chuvoso), totalizando oito visitas. Foram coletados 398 espécimes de fungos poróides, representantes de seis famílias, 32 gêneros e 77 espécies, das quais nove são novas para a ciência. Todas as famílias estiveram presentes nas duas áreas de estudo. Vinte espécies foram comuns para ambas as áreas; o PNM apresentou o maior número de espécies exclusivas (37, 19 para a ESEC). A riqueza de espécies não diferiu significativamente entre as áreas de coleta, mas maior abundância foi encontrada no PNM. Maior riqueza e abundância foram encontradas no período chuvoso. Cento e oitenta e oito espécimes foram coletados em áreas adicionais localizadas em Porto Velho e representaram 52 espécies, das quais quatro são novas para a ciência e 20 exclusivas a essas áreas. Desse modo, foram identificadas, ao todo, 97 espécies provenientes de coletas. A partir da revisão de 5.933 exsicatas de fungos poróides coletados na Amazônia e depositados nos Herbários INPA, SP, UFACPZ e URM foram encontradas 212 espécies, distribuídas nos diferentes Estados da Amazônia brasileira, das quais quatro espécies novas para a ciência e 137 encontradas exclusivamente nesses herbários. No total, 238 espécies são registradas para a Amazônia brasileira. Dezessete espécies são novas para a ciência, enquanto 17 são novos registros para o Brasil e 40 para Amazônia brasileira. Onze famílias foram registradas, sendo Polyporaceae com maior número de gêneros e espécies (27 e 104, respectivamente), seguida por Hymenochaetaceae (nove e 46) e Ganodermataceae (quatro e 42). Baseado em análises morfológicas e/ou moleculares da região ITS rDNA, 27 espécies de Amauroderma, muitas morfologicamente semelhantes, foram delimitadas, das quais nove (A. albostipitatum, A. floriforme, A. laccatostiptatum, A. lemoniforme, A minimum, A. ovisporum, A. paraelegantissimum, A. subsessile e A. sessile) são propostas como novas para a ciência.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2016-03-10T22:12:31Z No. of bitstreams: 1 JuliethDeOliveiraSousa_DISSERT.pdf: 11081242 bytes, checksum: f2202b2fd5e889749c93749db00087da (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2016-03-17T23:38:23Z (GMT) No. of bitstreams: 1 JuliethDeOliveiraSousa_DISSERT.pdf: 11081242 bytes, checksum: f2202b2fd5e889749c93749db00087da (MD5) / Made available in DSpace on 2016-03-17T23:38:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 JuliethDeOliveiraSousa_DISSERT.pdf: 11081242 bytes, checksum: f2202b2fd5e889749c93749db00087da (MD5) Previous issue date: 2015-03-13 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / Geastraceae ? uma fam?lia monofil?tica pertencente ao clado ?gomphoid-phalloid?, composta apenas por dois g?neros Geastrum e Myriostoma, que s?o muito pr?ximos tanto na morfologia quanto na filogenia, ambos apresentam basidiomas angioc?rpicos, poro apical, basidiosporos liberados passivamente atrav?s do mecanismo de fole e exoper?dio deiscente em raios, sendo diferenciados pelo n?mero de ost?olos e pedicelos. Devido ? deisc?ncia do exoper?dio, s?o conhecidos popularmente como ?estrelas-daterra?. Ocorrem geralmente degradando liteira ou madeira, sendo, portanto, saprof?ticos, com raras exce??es de esp?cies ectomicorr?zicas. Geastrum ? um dos g?neros gasteroides mais diversos no Brasil, com 51 registros. Contudo, existem lacunas de conhecimento quanto ? distribui??o geogr?fica e sistem?tica deste g?nero no pa?s. Especialmente, devido ?s caracter?sticas encontradas em territ?rio brasileiro (megavidersidade, ?hotspots? e tamanho continetal), as quais o tornam ?rea priorit?ria para invent?rio de esp?cies. Desta forma, o presente trabalho objetivou realizar inventariar esp?cies Geastrum ocorrentes em ?reas da Caatinga e Mata Atl?ntica do Nordeste. Foram realizadas pelo menos duas expedi??es de campo, com dura??o aproximada de quatro dias, durante per?odos de chuva dos anos 2013 e 2014 para as ?reas: Reserva Biol?gica de Guaribas, localizada no dom?nio Mata Atl?ntica da Para?ba e Reserva Ecol?gica Estadual Mata do Pau Ferro, localizada nos ?Brejos Paraibanos?. Al?m disso, foram analisados esp?cimes depositados no Herb?rio UFRN-Fungos, os quais foram coletados no Parque Nacional Vale do Catimbau, Caatinga de Pernambuco. Os esp?cimes foram identificados de acordo com a an?lise de macro e micromorfologia, seguindo literatura espec?fica. Foram analisados cerca de 400 basidiomas, distribu?dos em 73 exsicatas. Foram identificadas 21 esp?cies, 19 em n?vel de esp?cie, sendo duas destas propostas como novas esp?cies (Geastrum magnosporum sp. nov. e G. pusillupilosum sp. nov.) e duas em n?vel de g?nero (sp. e aff.). Destaca-se um novo registro para o Brasil, 12 novos registros para o estado da Para?ba, quatro novos registros para a regi?o Semi?rida do Brasil e seis novos registros para a vegeta??o de ?Brejos de Altitude?. Desta forma, os resultados representam um aumento de 200% no conhecimento do g?nero Geastrum na Para?ba, 24 % no Semi?rido e 55% no ?Brejo de Altitude?, demostrando que o Nordeste brasileiro apresenta uma alta riqueza de esp?cies. / Geastraceae is a monophyletic family included in the gomphoid-phalloid clade, it is composed only by two genus: Geastrum and Myriostoma. These genus are closely related in their morphology and phylogeny, both showing angiocarpic basidiomata, apical stoma, basidiospores passively released by the bellows mechanism and exoperidium dehiscent in rays, these genus are distinct by the number of stomas and pedicels. Because of dehiscense of exoperidium they are popularly known as ?earthstars?. Usually they occur on decomposing leaf-litter and decaying wood. They are, thus, saprophytic, with rare exceptions of ectomycorrhizal species. Geastrum is the most diverse gasteroid genus in Brazil, with an estimated 51 records. However, there are large gaps in the geographic distribution and systematics studies about the Geastrum in this country, especially because of the characteristics found in the Brazilian territory (megadiverse, hotspots and continental size), which makes it a priority area for species inventory. Thus, this work was aimed at realizing inventory of species of Geastrum, which occur in Caatinga and Northeastern Atlantic Rainforest. At least two field expeditions were realized, during about four days on rainy season of 2013 and 2014 in the areas: Reserva Biol?gica de Guaribas, located in Atlantic Rainforest domain, Para?ba State and Reserva Ecol?gica Estadual Mata do Pau Ferro, located on ?Brejos Paraibanos?, Para?ba State. Furthermore, specimens deposited in the Herbarium of the Universidade Federal do Rio Grande do Norte, which were collected in Parque Nacional Vale do Catimbau, Caatinga of Pernambuco State, were analyzed. The specimens were identified according to analysis of macro and micro morphology based on specific literature. Approximately 400 basidiomata, distributed in 73 exsiccates were analyzed. 21 species were identified, 19 are in specie level, which two are proposed to new species. (Geastrum magnosporum sp. nov. e G. pusillupilosum sp. nov.) and two in genera level (sp. e aff.). We emphasize one new record for Brazil, 12 new records for Para?ba State, four new records for semiarid region in Brazil and six new records to Atlantic Rainforest relicts ?Brejo de Altitude?. So, the results improved the knowledge about Geastrum in Para?ba State by 200%, 24 % in Brazilian semiarid region and 55% in Atlantic Rainforest relicts ?Brejo de Altitude?, evincing that Northeastern Brazil has high species richness.

Orientador: Jose Luiz Pereira / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-08-13T15:09:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Copetti_MarinaVenturini_D.pdf: 6048122 bytes, checksum: 93c1ab6938ae661500c36bb19ce26312 (MD5) Previous issue date: 2009 / Resumo: O Brasil se encontra entre os maiores produtores mundiais de cacau. Parte da sua produção é destinada à exportação, principalmente após passar por algum processamento industrial, e o restante se destina ao consumo interno. A qualidade obtida ao final do processamento do cacau depende de uma ampla variedade de fatores, dentre os quais os microrganismos desempenham um papel fundamental. A presença de fungos é observada em várias fases do processamento, o que além do aspecto deteriorativo representa um perigo toxicológico devido a possibilidade de síntese de micotoxinas. Na presente tese são apresentados os resultados sobre a presença de fungos, ocratoxina A e aflatoxinas em um total de 494 amostras de cacau analisadas em diferentes fases do processamento. A maior quantidade e diversidade de fungos foi encontrada em amostras coletadas durante o processamento na fazenda, especialmente durante a secagem e estocagem das amêndoas. Foram isolados 1132 espécies potencialmente toxigênicas do gênero Aspergillus: A. flavus, A. parasiticus, A. niger, A. carbonarius e grupo dos A. ochraceus. Com relação à presença de micotoxinas, as amostras da secagem e estocagem foram as que apresentaram maiores níveis de ocratoxina A e aflatoxinas na fazenda, enquanto que nas amostras coletadas em indústrias processadoras de cacau os maiores níveis de ocratoxina A foram detectados na casca, torta e cacau em pó e os de aflatoxina, nos nibs e liquor. Nas amostras de chocolate observou-se uma relação direta entre a quantidade de cacau no produto e os níveis de aflatoxinas e ocratoxina A, sendo estes maiores em chocolate em pó e chocolate meio amargo. Também foram conduzidos experimentos para avaliar as condições que afetam a produção de ocratoxina A no cacau por A. carbonarius. Foi observado que, diante da presença de inóculo, a produção de ocratoxina A já ocorre durante a fermentação. Os níveis de ocratoxina A foram menores quando sementes de cacau com polpa integral foram fermentadas durante 6 dias em caixas, se comparados aos obtidos com sementes parcialmente despolpadas e conduzidas à secagem sem prévia fermentação. Os resultados em geral mostraram a existência de uma grande diversidade de fungos, muitos dos quais toxigênicos, durante o processamento do cacau e a inter-relação de fatores intrínsecos, ambientais e de processamento pareceram determinar a ocorrência ou não de micotoxinas / Abstract: Brazil is one of the biggest cocoa producing countries. Part of its production is exported, mainly after undergoing some industrial processing, and the other supplies the internal market. The quality of the final cocoa product depends on several factors, and microorganisms play an important role on this. Investigations have demonstrated the presence of filamentous fungi in many processing stages. Besides the spoilage potential, those are a cause for concern from the toxicological aspect, since mycotoxins may be produced. This thesis presents the results concerning the presence of fungi, ochratoxin A and aflatoxins in a total of 494 cocoa samples collected at different processing stages, from farm to market. The greatest occurrence and the major diversity of fungi were found in samples collected during the drying and storage of the beans on the farm. A total of 1132 potentially toxigenic fungi were isolated, belonging to the species A. flavus, A. parasiticus A. niger, A. ochraceus group and A. carbonarius. Regarding the presence of mycotoxins, samples collected during drying and storage presented the highest ochratoxin A and aflatoxin levels amongst samples collected at farm. During industrialization, the most contaminated products were the cocoa shell, cocoa cake and cocoa cake with respect to ochratoxin A. The aflatoxin levels were higher in the nibs and liquor. A direct correlation between the amount of cocoa in the product and the ochratoxin A level in the chocolate was observed. Dark chocolate and powdered commercial cocoa were the most contaminated samples. An additional experiment was carried out to evaluate the conditions affecting ochratoxin A production by A. carbonarius in cocoa on the farm. It was observed that ochratoxin A production could start during fermentation if toxigenic fungi were present, and lower ochratoxin levels were found when the integral beans were fermented during 6 days in box if compared to those with pulp partially removed and submitted to drying fermentation. In general, during cocoa processing, a wide variety of fungi was found, some of these toxigenic. Intrinsic, environmental and processing factors acting together seemed to determine the production of mycotoxins in cocoa / Doutorado / Doutor em Ciência de Alimentos

Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2018-05-17T15:27:41Z No. of bitstreams: 0 / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2018-05-22T11:42:00Z (GMT) No. of bitstreams: 0 / Made available in DSpace on 2018-05-22T11:42:00Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2018-05-03 / Os fungos têm um papel complexo no trato intestinal, influenciando diretamente na saúde e na doença e sua disbiose pode contribuir para a obesidade. O objetivo deste estudo foi avaliar a diversidade de fungos da microbiota intestinal humana entre indivíduos eutróficos, com sobrepeso e obesos. Foram coletados espécimes fecais de 72 indivíduos adultos e análises dependentes e independentes de cultivo foram realizadas para avaliar os fungos presentes. As leveduras foram identificadas pela técnica de ionização e dessorção a laser assistida por matriz acoplada a analisador do tipo espectro de massa por tempo de vôo (MALDI-TOF MS) e os fungos filamentosos por microcultivo. A contagem média de fungos filamentosos e leveduras cultiváveis foi de 1,58 Log10 UFC/g de fezes. Diferenças significativas no nível populacional dos fungos filamentosos foi observado entre os grupos dos indivíduos eutróficos e obesos. Trinta e quatro gêneros de fungos foram identificados. O filo predominante foi Ascomycota com 29 gêneros e/ou espécies diferentes, seguido por Zigomycota e Basidiomycota. O fungo mais isolado nos indivíduos eutróficos foi Paecylomyces sp. e nos indivíduos obesos Penicillium sp. Os indivíduos eutróficos apresentam uma diversidade ligeiramente maior de fungos filamentosos do que os indivíduos obesos. Os indivíduos do sexo feminino tiveram um maior número de fungos diferentes quando comparados aos do sexo masculino. A análise de eletroforese em gel de gradiente desnaturante (DGGE) mostrou agrupamento dos indivíduos eutróficos e com sobrepeso em um cluster e dos indivíduos obesos em outro cluster distinto, embora a riqueza tenha sido baixa nos três grupos. A análise de hibridização in situ florescente (FISH) demonstrou maior densidade relativa de C. albicans no grupo obeso quando comparado ao eutrófico e pela análise de reação da polimerase em cadeia quantitativa (qPCR) um número maior de cópias de DNA de fungos e do filo Ascomycota nos indivíduos obesos quando comparado aos indivíduos com sobrepeso e obesos. Foi verificada correlação positiva entre os fungos e os parâmetros antropométricos colesterol total, LDL, triglicerídeos, hemoglobina, HOMA-IR, HOMA-β, insulina, glicose sérica, creatinina e porcentagem de fibras e carboidratos da dieta. Outros estudos são necessários para melhor compreender a interrelação entre a micobiota do intestino e a obesidade. Futuramente, este conhecimento poderá ser utilizado na modulação da micobiota intestinal e no tratamento da obesidade. / Fungi have a complex role in the intestinal tract, directly influencing health and disease and potential dysbiosis could contribute to obesity. The aim of this study was to investigate the fungal diversity of human gut microbiota among eutrophic, overweight, and obese individuals and to understand the gut microbial ecology shifts between healthy and obese individuals. Stool samples of 72 adult individuals were collected and dependent and independent cultive approach were performed to evaluate the fungi. The yeasts were identified by matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) and the filamentous fungi were identified by microculture. The mean count of filamentous fungi and yeast was 1.58 log10 CFU/g of feces. Significant differences in the population level of the filamentous fungi was observed within eutrophic and obese groups. Overall, 34 genera were identified. The predominant phylum was Ascomycota with 20 different genera, followed by Basidiomycota and Zygomycota. The most prevalent specie was Paecylomyces sp. in euthrophic individuals and Penicillium sp. in obese individuals. The results of the eutrophic individuals suggest a slightly higher diversity of fungi within these individuals. Female individuals had a greater diversity of fungal types compared to males. The denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) analysis showed the grouping of eutrophic and overweight individuals in one cluster and of obese individuals in another cluster, although richness was low in all three groups. The fluorescence in situ hybridization (FISH) analysis showed a higher relative density of C. albicans in the obese group when compared to eutrophic and by the quantitative real time PCR (qPCR) a larger number of DNA copies of fungi and the phylum Ascomycota in obese individuals when compared to overweight and obese individuals. There was a positive correlation between fungi and the anthropometric parameters, total cholesterol, LDL, triglycerides, hemoglobin, HOMA-IR, HOMA-β, insulin, serum glucose, creatinine and percentage of dietary fibers and carbohydrates. Other studies are needed to better understand the causal relationship between gut mycobiota and obesity. This knowledge could be used in modulating the gut mycobiota and identifying future obesity treatments.

Submitted by Ricardo Cedraz Duque Moliterno (ricardo.moliterno@uefs.br) on 2016-01-21T00:37:49Z No. of bitstreams: 1 TESE_Loise Araujo Costa.pdf: 3490024 bytes, checksum: d67e88fa9cf7de3c8ca53e0ee35cc012 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-21T00:37:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TESE_Loise Araujo Costa.pdf: 3490024 bytes, checksum: d67e88fa9cf7de3c8ca53e0ee35cc012 (MD5) Previous issue date: 2014-08-29 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / The Atlantic Forest has the highest biodiversity among tropical forests is one of the 34 priority areas for global conservation. Currently remains about 11% of its original area, which is composed of fragmented and geographically distant remnants. Among the microorganisms that compose forest ecosystems, fungi are important components because ensure the cycling of carbon and nutrients, however are poorly studied. The present study aimed to assess the diversity and distribution of fungi associated to leaf litter from three Atlantic Forest remnants in the semiarid region of Brazil: Brejo Paraibano-PB, Serra da Ibiapaba-CE and Serra da Jib?ia-BA; and the effects of methodological aspects on mycobiota. Two expeditions were conducted in each area, during the wet season and the other in the dry season, between June/2011 and January/2013. Twenty-three samples of leaf litter, five Clusia nemorosa G. Mey and eighteen Vismia guianensis (Aubl) Choisy, were collected and submitted to the technique of particle filtration. The total volume of 9.3 mL of particle suspension was plated on two different culture media: dichloran rose bengal chloramphenicol agar (DRBC) and malt yeast extract agar (MYE). The analysis of this material yielded 6.460 colonies identified 168 taxa for which data were divided into three chapters. The first chapter evaluates the effects of time (fresh material, 07, 14, 21 and 28 d) and storage temperature (room temperature and 4?C) of the leaves of C. nemorosa plus the use of two culture media on mycobiota. Analysis of covariance indicated that the richness and the number of isolates decreased with storage, however in relation to the culture medium there was no significant difference. The storage temperature had no significant influence on the community according to the t-test. The second chapter compared the communities of fungi of C. nemorosa and V. guianensis during the wet and dry seasons. Clusia nemorosa showed higher species richness and diversity of fungi compared to V. guianensis. Similarity analysis indicated that variations in the community between plants and seasons were significant while the cluster analysis and multivariate NMDS showed seasonality factor as more decisive for the distribution of fungi. The third chapter investigated the spatial and temporal distribution of fungi associated with leaf litter community of V. guianensis present in the three remaining. Multivariate analysis NMDS revealed differences in community composition of fungi in each area and climate season and the similarity analysis indicated that the differences were statistically significant. The results of this study presented a great diversity associated with the leaf litter present in remnants of Atlantic Forest and indicate that the distribution of fungi in the environment is not random. Knowledge of the effects of biotic and abiotic factors on the distribution of saprobic fungi is fundamental to understanding the role that they play in forest ecosystems. / A Mata Atl?ntica apresenta uma das maiores biodiversidade dentre as florestas tropicais sendo uma das 34 ?reas priorit?rias para a conserva??o mundial. Atualmente resta cerca de 11% da sua ?rea original, que ? composto por remanescentes fragmentados e distantes geograficamente. Dentre os micro-organismos que comp?em os ecossistemas florestais, os fungos s?o componentes importantes, pois promovem a ciclagem de carbono e nutrientes, no entanto, s?o pouco estudados. O presente estudo teve como objetivo avaliar a diversidade e distribui??o de fungos associados ao folhedo de tr?s remanescentes de Mata Atl?ntica na regi?o semi?rida do Brasil: Brejo Paraibano-PB, Serra da Ibiapaba-CE e Serra da Jib?ia-BA; bem como os efeitos de aspectos metodol?gicos sobre a micobiota. Duas expedi??es foram realizadas em cada ?rea, uma durante a esta??o chuvosa e a outra na esta??o seca, entre junho/2011 e janeiro/2013. Vinte e tr?s amostras de folhas da serapilheira, cinco de Clusia nemorosa G. Mey e dezoito de Vismia guianensis (Aubl) Choisy, foram coletadas e submetidas ? t?cnica de filtra??o de part?culas. O volume total de 9.3 mL de suspens?o de part?culas foi plaqueado em dois meios de cultivo: ?gar dicloran rosa bengala cloranfenicol (DRBC) e ?gar extrato de malte e levedura (MYE). A partir da an?lise desse material, 6.460 col?nias foram isoladas e identificadas em 168 t?xons cujos dados foram distribu?dos em tr?s cap?tulos. O primeiro cap?tulo avaliou os efeitos do tempo (material fresco, 07, 14, 21 e 28 dias) e temperatura (ambiente e 4?C) no acondicionamento das folhas de C. nemorosa al?m do uso dos dois meios de cultura sobre a micobiota. A an?lise de covari?ncia indicou que a riqueza e o n?mero de isolados diminu?ram com o tempo de acondicionamento, entretanto em rela??o ao meio de cultura n?o houve diferen?a significativa. A temperatura de acondicionamento n?o apresentou influ?ncia significativa sobre a comunidade, segundo o teste-t. O segundo cap?tulo comparou as comunidades de fungos de C. nemorosa e V. guianensis durante as esta??es chuvosa e seca. Clusia nemorosa apresentou maior riqueza de esp?cies e diversidade de fungos comparada a V. guianensis. A an?lise de similaridade indicou que as varia??es na comunidade entre as plantas e esta??es foram significativas, enquanto que a an?lise de agrupamento e a multivariada NMDS apresentaram a sazonalidade como fator determinante para a distribui??o dos fungos. O terceiro cap?tulo investigou a distribui??o espacial e temporal da comunidade de fungos associada ao folhedo de V. guianensis presentes nos tr?s remanescentes. A an?lise multivariada NMDS revelou diferen?as na composi??o das comunidades de fungos em cada ?rea e esta??o clim?tica e a an?lise de similaridade indicou que as diferen?as encontradas foram estatisticamente significativas. Os resultados deste estudo apresentam uma grande diversidade de fungos associada ao folhedo presente nos remanescentes de Mata Atl?ntica e indicam que a distribui??o dos fungos no ambiente n?o ? aleat?ria. O conhecimento dos efeitos dos fatores bi?ticos e abi?ticos sobre a distribui??o dos fungos sapr?bios ? fundamental para entender o papel que desempenham nos ecossistemas florestais.