Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 294516 bytes, checksum: 2ec13b3c525f57f69aa1f3dad7a90997 (MD5) Previous issue date: 2008-07-28 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / QTL are statistical associations of a genomic region and the phenotypic variation between segregating populations. The variation in a quantitative trait of interest can be related with the genotype of a molecular marker if this marker is close and linked to quantitative trait loci (QTL). To identify these associations, the mapping of chromosomes 9 and 10 was conducted in a F2 population composed of 714 animals derived from Piau X Commercial (Large White Landrace X Pietrain) crosses. The population was evaluated by performance, carcass, internal organs, viscera, carcass cuts and meat quality traits. Six microsatellites loci on chromosome 9 and three microsatellites loci on chromosome 10 were studied. The loci were analyzed for genic frequency, observed heterogosity, expected heterozigosity and polymorphic information content. Linkages maps were also constructed through the CRIMAP 2.4 program for the informative markers. The orders of all microsatellite loci were in accordance with the published USDA-MARC map. However, sex average maps of chromosomes 9 and 10 were, respectively, 27.75% and 124.60% longer than the published USDA-MARC. Association analyses were performed using interval mapping by regression for QTL detection. Three significant QTL to chromosomal levels were detected on chromosome 9 for total (bone-in) loin weight (P<0.01), boneless loin weight (P<0.05) and small intestine length (P<0.05), responding, respectively, by 6.7%, 4.0% and 4.9% of phenotypic variance. Two significant QTL to chromosomal levels have been detected on chromosome 10 for higher backfat thickness on the shoulder region (P<0.05) and redness (P<0.05), both responding by 2.4% of phenotypic variance and one significant QTL to genomic level for liver weight (P<0.01) responding by 6.9% of phenotypic variance. The generated information of significant QTL will be useful for future studies dealing with fine mapping and identification of genes that could provide a better understanding of physiology and production traits of pigs. / QTL são associações estatísticas entre dados relativos a uma região genômica e a variabilidade fenotípica existente entre populações segregantes. Para identificação e avaliação dos efeitos de tais associações, foi feito o mapeamento dos cromossomos 9 e 10 de suínos pertencentes a uma população F2, oriunda do cruzamento entre as raças Piau e Comercial (Landrace X Large White X Pietrain), composta por 714 animais. A população foi avaliada em relação a características de desempenho, carcaça, órgãos e vísceras, cortes de carcaça e qualidade da carne. Foram estudados um total de 9 locos microssatélites distribuídos nos cromossomos, sendo seis localizados no cromossomo 9 e três no cromossomo 10. Os locos foram avaliados em relação à freqüência alélica, heterozigosidade observada, heterozigosidade esperada e conteúdo de informação polimórfica, sendo que aqueles considerados informativos foram utilizados na construção dos mapas de ligação, a partir do programa CRIMAP versão 2.4. A ordem dos marcadores no presente mapa foi semelhante àquela apresentada pelo mapa do USDA-MARC. No entanto, os mapas médios entre sexos dos cromossomos 9 e 10 obtidos no presente estudo possuem comprimentos superiores, respectivamente, 27,75% e 124,60% em relação aos mapas do USDA-MARC. As análises de associação foram feitas utilizando mapeamento de intervalo por regressão para detecção de QTL, com o auxílio do programa QTL EXPRESS. Foram detectados três QTL significativos ao nível cromossômico no cromossomo 9 para peso total do carré (P<0,01), peso do lombo (P<0,05) e comprimento total do intestino delgado (P<0,05), respondendo, respectivamente, por 6,7%, 4,0% e 4,9% da variação fenotípica. No cromossomo 10, foram detectados dois QTL significativos ao nível cromossômico para maior espessura de toucinho na região da copa, na linha dorso-lombar (P<0,05) e índice de vermelho (P<0,05), ambos respondendo por 2,4% da variação fenotípica, e um QTL significativo ao nível genômico para peso de fígado (P<0,01), respondendo por 6,9% da variação fenotípica. As informações dos QTL significativos encontrados servem para estudos futuros como o mapeamento fino e a identificação de genes que ajudem no melhor entendimento da fisiologia e das características de produção de suínos.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 806136 bytes, checksum: 6eec761511b691ec5f75116a9561965a (MD5) Previous issue date: 2010-07-27 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Knowledge of genetic diversity (GD) and relationships among maize inbred lines may allow characterization of the germplasm sort the genotypes into distinct heterotic groups, and this information is important in the choice of parents to obtain hybrids with high heterosis and increased grain yield. Our objectives in this study were (1) investigate the genetic diversity among tropical maize inbred lines from the germplasm collection of Maize Program® UFV,(2)estimate the potential informativeness of the SSR loci studied in maize inbred lines and (3) investigate the presence of alleles present in groups of strains belonging to different companies for improvement. The genetic similarity between all pairs of strains (ii ') were calculated by the weighted index, and for calculating the dissimilarity measure (Dii') we used the arithmetic complement (Dii'= 1 - S ii'). In total, 471 SSR alleles were identified, with an average of 5.81 alleles per locus. The average polymorphism information content (PIC) was 0. 5733. The genetic dissimilarity between strains ranged from 0.19 to 0.67, with an average of 0.49. Cluster analysis by the Tocher and UPGMA method was efficient in grouping inbred lines, suggesting a total of eighteen groups. Most of the inbred lines were consistent with its origins, although with some discrepancies. The pattern of groupings of the inbred lines revealed that there is ample genetic base among the majotity of inbred lines. The plausible ample genetic base among the majotity of inbred lines. The plausible explanation is that these were derived from different heterotic groups. The variability detected in the groups formed by SSR loci may contribute to the efficient use of inbred lines for exploitation of heterosis and broadening the genetic base of the program. The variability detected in the small number of groups formed by SSR loci may contribute to the effective use of inbred lines for the exploitation of heterosis and broadening the genetic base of the program. / O conhecimento da diversidade genética (GD) e as relações entre linhagens de milho podem permitir caracterizar o germoplasma e classificar os genótipos em grupos heteróticos distintos, sendo essas informações importantes na escolha de genitores para a obtenção de híbridos com maior heterose e alta produtividade de grãos. Os objetivos deste estudo foram (1) investigar o nível de diversidade genética existente entre as linhagens de milho tropical do Banco de Germoplasma do Programa Milho, (2) estimar o potencial de informatividade dos locos SSRs nas linhagens de milho estudadas e (3) averiguar a presença de alelos exclusivos presentes em grupos de linhagens pertencentes a diferentes empresas de melhoramento. A similaridade genética entre todos os pares de linhagens (ii ) foi calculada pelo índice ponderado, e para o cálculo da medida de dissimilaridade (Dii ) utilizou-se o complemento aritmético (Dii = 1 S ii ). No total, 471 alelos SSR foram identificados, com uma média de 5,81 alelos por loco. O conteúdo informativo de polimorfismo (PIC) foi de 0,5733. A dissimilaridade genética entre as linhagens variou 0,19-0,67, com uma média de 0,49. A análise de agrupamento pelo método de Tocher e UPGMA foi eficiente no agrupamento das linhagens, sugerindo um total de dezoito grupos. A maioria das linhagens esteve condizente com suas origens, embora com algumas discrepâncias. O padrão de agrupamento das linhagens revelou haver uma base genética ampla entre a maioria das linhagens. Uma explicação plausível é que estas foram originadas de grupos heteróticos diferentes. A variabilidade detectada nos grupos formados por meio de locos SSR pode contribuir para a utilização eficaz das linhagens para a exploração da heterose e ampliação da base genética do programa.

Submitted by Yani Cristina Aranguren Díaz null (acaena1@gmail.com) on 2016-07-06T15:09:40Z No. of bitstreams: 1 Tese_Yani_Aranguren.pdf: 3856258 bytes, checksum: 1d74b9265bdfb98769a471cdd8bfe46d (MD5) / Rejected by Ana Paula Grisoto (grisotoana@reitoria.unesp.br), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo a orientação abaixo: O arquivo submetido não contém o certificado de aprovação. A versão submetida por você é considerada a versão final da dissertação/tese, portanto não poderá ocorrer qualquer alteração em seu conteúdo após a aprovação. Corrija esta informação e realize uma nova submissão contendo o arquivo correto. Agradecemos a compreensão. on 2016-07-07T20:22:53Z (GMT) / Submitted by Yani Cristina Aranguren Díaz null (acaena1@gmail.com) on 2016-07-07T20:38:22Z No. of bitstreams: 3 Tese_Yani_Aranguren.pdf: 3856258 bytes, checksum: 1d74b9265bdfb98769a471cdd8bfe46d (MD5) defesa057.jpg: 816752 bytes, checksum: 20ea84b37022f41e6951e61741700daa (MD5) Ata defesa055.jpg: 3802257 bytes, checksum: 6f9de980950f3042f050f8799fc63197 (MD5) / Rejected by Ana Paula Grisoto (grisotoana@reitoria.unesp.br), reason: Solicitamos que realize uma nova submissão seguindo as orientações abaixo: Apenas 1 arquivo deve ser submetido. O arquivo PDF não deve estar protegido e a dissertação/tese deve estar em um único arquivo, inclusive a folha de aprovação, os apêndices e anexos, se houver. Corrija estas informações e realize uma nova submissão contendo o arquivo correto. Agradecemos a compreensão. on 2016-07-11T19:03:19Z (GMT) / Submitted by Yani Cristina Aranguren Díaz null (acaena1@gmail.com) on 2016-07-12T01:33:08Z No. of bitstreams: 1 Tese_Yani_ArangurenD.pdf: 4149138 bytes, checksum: b98484c58a1e802317b4ddb19d9dfd9a (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Paula Grisoto (grisotoana@reitoria.unesp.br) on 2016-07-12T14:35:16Z (GMT) No. of bitstreams: 1 arangurendíaz_yc_dr_jabo.pdf: 4149138 bytes, checksum: b98484c58a1e802317b4ddb19d9dfd9a (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-12T14:35:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 arangurendíaz_yc_dr_jabo.pdf: 4149138 bytes, checksum: b98484c58a1e802317b4ddb19d9dfd9a (MD5) Previous issue date: 2016-06-17 / O gênero Genlisea forma parte da maior família de plantas carnívoras, as Lentibulariaceae. Das aproximadamente 30 espécies conhecidas do gênero, 17 encontram-se no Brasil e delas 10 são endêmicas. O gênero tem sido pouco estudado, sendo ainda escassos os estudos sobre aspectos genéticos e praticamente se desconhecem seu estado de conservação ou a fragilidade das populações naturais. Genlisea violacea A.St.-Hil. e G. aurea A.St.-Hil. são endêmicas e estão distribuídas nas formações de Cerrado e de Mata Atlântica, que são biomas muito frágeis. Neste trabalho foram estudadas a biologia reprodutiva e a polinização de G. violacea em duas populações naturais. Além disso, foram analisadas a estrutura genética e a dinâmica de populações de G. violacea e G. aurea. Para isso se desenvolveram microssatélites a partir de dados genômicos de G. aurea, transferíveis nas espécies congenéricas, incluindo G. violacea. Adicionalmente foi estudada a estrutura genética de algumas populações de G. violacea e G. aurea. Segundo as observações e análises realizadas, G. violacea é espécie alógama e autocompatível que oferece néctar aos visitantes, facilitando a autopolinização durante a antese e polinização cruzada durante todo o tempo de vida da flor, por meio de pelo menos duas espécies de abelhas. Mesmo assim, existem diferencias fenotípicas entre populações e incluso apresenta vario morfotipos dentro da mesma população. Ademais, foram desenvolvidos 12 marcadores microssatélites em G. aurea, que são transferíveis a espécies congenéricas. Nas populações das espécies estudadas observou-se variabilidade baixa e média, respectivamente para G. violacea e G. aurea, com maior variação dentro que entre populações, que refletem o sistema reprodutivo misto e uma polinização entomofílica. No caso de G. aurea, na estruturação genética se observou uma separação entre as populações da Bahia e do sul e centro oeste do país. As diversidades genéticas baixas destas duas espécies sugerem que devem ser vigiadas e protegidas para sua conservação. / The Genlisea genus is part of the larger family of carnivorous plants, Lentibulariaceae. They are approximately 30 known species of the genus, 17 in Brazil and 10 of them are endemic. The genus has been understudied, yet there are few studies on genetic aspects and practically its conservation status and the fragility of the natural populations are unknown. Genlisea violacea A.St.Hil. and G. aurea A.St.Hil. are endemic and are distributed in the formations of the Cerrado and Atlantic Forest, which are very fragile biomes. In this study we analyzed the reproductive biology and pollination of G. violacea in two natural populations. In addition, we also analyzed the genetic structure and dynamics of G. violacea and G. aurea populations. For this we developed microsatellite from genomic data of G. aurea, and did cross-amplification in congeneric species including G. violacea. According to the observations and analyses, G. violacea is self-compatible and allogamous that offers nectar to visitors, facilitating self-pollination during anthesis and cross-pollination throughout the flower lifetime through at least two species of bees. Also, there are differences between populations and phenotypic features included morphotypes within the same population. In addition, 12 microsatellite markers were developed in G. aurea, which are transferable to congeneric species. The populations of both species have low variability and average, respectively for G. violacea and G. aurea, with high variation within than among populations, reflecting the mixed reproductive system and pollination by insects. In G. aurea was observed in genetic structure a separation between the populations from Bahia and the South and Center-West of the country. The low diversity of these two species is indicative of the importance of monitoring and protecting the natural populations.

Submitted by Franciele Moreira (francielemoreyra@gmail.com) on 2018-05-07T20:08:46Z No. of bitstreams: 2 Tese - Andreia Juliana Leite Rodrigues - 2009.pdf: 4133776 bytes, checksum: 2dcea8498672423efda1a3650814faad (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-05-08T11:29:36Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Andreia Juliana Leite Rodrigues - 2009.pdf: 4133776 bytes, checksum: 2dcea8498672423efda1a3650814faad (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-08T11:29:36Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Andreia Juliana Leite Rodrigues - 2009.pdf: 4133776 bytes, checksum: 2dcea8498672423efda1a3650814faad (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2009-04-29 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The objective of this work was to construct primers from the development of libraries enriched with microsatellite loci and to evaluate the magnitude and spatial distribution of genetic variability in natural populations of H. speciosa do Cerrado. Locals containing microsatellite regions were isolated and sequenced, which resulted in the design of 74 primer pairs. Of these, 35 were selected for synthesis and optimization of PCR amplification. All the synthesized primers amplified, with annealing temperature ranging from 48° C to 64° C. The primers were tested on 35 genotypes of mangabeira originating from different geographic areas. The 35 individuals were also grouped into four populations according to the botanical variety they belong to (H. s. Var. Speciosa, H. s.var. cuyabensis, H. s.var. gardneri, H. s.var. pubescens). Six pairs of primers were selected for analysis of 162 progenies belonging to the EA / UFG germplasm collection. The developed markers were considered highly informative, with high index of polymorphism and represent a suitable tool to be used in genetic structure studies of natural populations. A high number of alleles per locus were observed. The progenies evaluated had a high polymorphism index. The value obtained for ‘He’ was high, which is indicative of high genetic diversity. The value obtained for the fixation index (f) was positive and high and suggests a relatively high rate of inbreeding in the studied populations. The estimated value of FST, considering each geographical area as a subpopulation, was 0.19. This parameter is indicative of the genetic divergence among the subpopulations, which suggests a high level of differentiation and corroborates the hypothesis of restriction to the gene flow. The NST parameter, similar to the FST, but considering the size of the alleles, provided a considerably higher value, which reinforces the great diversity among the subpopulations of the Cerrado mangrove. Nei was also observed to group the populations in a random manner, regardless of the geographic distance, which indicates that there is no structuring in the geographic space of the genetic variability among the populations. An absence of correlation between genetic distances and geographic distances was observed, which confirms the random distribution of genotypes for this study, reinforcing the hypothesis of restriction to gene flow, even at short distances. When considering the botanical varieties as different populations, an estimate of 0.0583 was observed for the FST statistic and the estimated NST was 0.11738, which again indicates the greater sensitivity of this parameter to detect divergence between populations. A genetic structure analysis was carried out in pairs between the botanical varieties and from the genetic distances obtained, measured by the parameter NST, it was possible to observe a greater similarity between H. s. var. gardneri and H. s. var. pubescens which was expected to be sympatric in its occurrence. The H. s. var. cuyabensis was the most divergent in relation to the others. The fact that the population of Japonvar-MG did not cluster with H. s. var. speciosa, corroborates the hypothesis that this belongs to another botanical variety, which should be further investigated. / O objetivo deste trabalho foi construir iniciadores a partir do desenvolvimento de bibliotecas enriquecidas com locos microssatélites e avaliar a magnitude e a distribuição espacial da variabilidade genética em populações naturais de H. speciosa do Cerrado. Foram isolados e sequenciados locos que continham regiões microssatélites, o que resultou no desenho de 74 pares de iniciadores. Destes, 35 foram selecionados para síntese e otimização da amplificação via PCR. Todos os iniciadores sintetizados amplificaram, com temperatura de anelamento que variou de 48 ̊C a 64 ̊C. Os iniciadores foram testados em 35 genótipos de mangabeira originários de diferentes áreas geográficas. Os 35 indivíduos também foram agrupados em quatro populações de acordo com a variedade botânica que pertencem (H. s. var. speciosa, H. s. var. cuyabensis, H. s. var. gardneri, H. s. var. pubescens). Foram selecionados seis pares de iniciadores para análise de 162 progênies pertencentes à coleção de germoplasma da EA/UFG. Os marcadores desenvolvidos foram considerados altamente informativos, com alto índice de polimorfismo e representam uma ferramenta adequada para ser utilizada em estudos de estrutura genética de populações naturais. Foi observado um elevado número de alelos por loco. As progênies avaliadas apresentaram alto índice de polimorfismo. O valor obtido para He foi alto, o que é um indicativo de diversidade genética elevada. O valor obtido para o índice de fixação (f) foi positivo e elevado e sugere uma taxa relativamente alta de endogamia nas populações estudadas. O valor estimado de FST, considerando-se cada área geográfica como uma subpopulação, foi de 0,19. Este parâmetro é um indicativo da divergência genética entre as subpopulações, o que sugere um alto nível de diferenciação e corrobora a hipótese de restrição ao fluxo gênico. A estimativa do parâmetro NST, análogo ao FST, porém considerando o tamanho dos alelos, forneceu um valor consideravelmente maior, o que reforça a grande diversidade existente entre as subpopulações de mangabeira do Cerrado. Foi observado também o Nei o agrupamento das populações de maneira aleatória, independente da distância geográfica, o que indica que não há estruturação no espaço geográfico da variabilidade genética entre as populações. Foi observada uma ausência de correlação entre as distâncias genéticas e as distâncias geográficas o que confirma, para esse estudo, a distribuição aleatória dos genótipos, reforçando a hipótese de restrição ao fluxo gênico, mesmo a curtas distâncias. Ao considerar as variedades botânicas como diferentes populações, observou-se uma estimativa de 0,0583 para a estatística FST e o valor estimado de NST foi de 0,1738 o que mais uma vez indica, a maior sensibilidade deste parâmetro para detectar divergência entre populações. Foi realizada uma análise de estrutura genética par a par entre as variedades botânicas e a partir das distâncias genéticas obtidas, medidas pelo parâmetro NST, foi possível observar uma maior semelhança entre H. s. var. gardneri e H. s. var. pubescens o que era esperado pelo fato de apresentarem uma simpatria em sua ocorrência. A variedade H. s. var. cuyabensis mostrou-se a mais divergente em relação às demais. O fato de a população de Japonvar-MG não ter se agrupado com H. s. var. speciosa, corrobora a hipótese de esta pertencer a outra variedade botânica, o que deve ser melhor investigado.

Submitted by Liliane Ferreira (ljuvencia30@gmail.com) on 2018-11-28T12:01:20Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Marcos Vinícius Pereira Pinto - 2017.pdf: 1766318 bytes, checksum: 434666d4b4d8dea79ee04fb075107a9b (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-11-28T13:49:22Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Marcos Vinícius Pereira Pinto - 2017.pdf: 1766318 bytes, checksum: 434666d4b4d8dea79ee04fb075107a9b (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-11-28T13:49:22Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Marcos Vinícius Pereira Pinto - 2017.pdf: 1766318 bytes, checksum: 434666d4b4d8dea79ee04fb075107a9b (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-09-22 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / Genetic diversity is a fundamental component for the survival of any species over evolutionary time, because it is the repertoire of possible responses to environmental pressures, which are dynamic and constant. Knowledge of the magnitude and structuring patterns of this diversity allows to understand how environmental and microevolutionary factors have interacted over time and shaped the populations. Microsatellite markers have been the most used molecular tool in recent decades for mapping studies of diversity and genetic structure due to its high degree of polymorphism, genomic abundance and codominant nature. For native species these markers rarely are available, however, the regions flanking the microsatellites are usually conserved among evolutionarily close species, which allows the transfer of these markers. Pterodon emarginatus Vogel, popularly known as Sucupira branca, is a tree plant belonging to the legume family. This species is widely used for medicinal purposes because of the broad properties of its secondary compounds. In addition, it provides rigid wood of interest for construction and is also used as an ornamental species. Despite the substantial number of studies directed to the medicinal potential, little is known about the genetic diversity present in this species. Therefore, the objectives of the work were to transfer to P. emarginatus microsatellite markers developed for Dipteryx alata and to access the diversity and genetic structure in natural populations of P. emarginatus. For this, the cross-amplification of 25 primers were tested and 12 natural populations were genotyped for 6 loci. Of the 25 primers tested, 2 (8%) showed good amplification and polymorphism pattern. The set of markers used revealed a total of 45 alleles for the 12 populations evaluated, with a mean of 7.667 per locus. This value ranged from 4 (DaE12) to 22 (PVESTBR067). Populations showed intermediate levels of genetic diversity (He = 0.555) and greater variability within populations than among populations. Small but significant levels of inbreeding were detected due to both the mating system and the population subdivision (f = 0.07; Fst = 0.073). These results support that the species presents a mixed mating system, being preferentially allogama. The pattern of divergence among populations was moderately structured in space (Mantel = 0.440, p <0.002) indicating a profile of large continuous populations with significant levels of gene flow over distances up to approximately 400 km. / A diversidade genética é componente fundamental para a sobrevivência de qualquer espécie ao longo do tempo evolutivo, isto porque configura-se como o repertório de possíveis respostas ás pressões ambientais, que são dinâmicas e constantes. O conhecimento da magnitude e dos padrões de estruturação dessa diversidade permite entender como fatores ambientais e microevolutivos tem interagido ao longo do tempo e moldado as populações, possibilitando melhor uso e conservação. Marcadores microssatélites tem sido a ferramenta molecular mais utilizada nas últimas décadas para estudos de mapeamento de diversidade e estrutura genética, devido ao seu alto grau de polimorfismo, abundância genômica e natureza codominante. Para espécies nativas raramente esses marcadores estão disponíveis, no entanto, as regiões que flanqueiam os microssatélites costumam ser conservadas entre espécies evolutivamente próximas, o que possibilita a transferência desses marcadores. Pterodon emarginatus Vogel, popularmente conhecida como Sucupira Branca, é uma planta arbórea pertencente à família das leguminosas. Esta espécie é amplamente utilizada com propósitos medicinais devido ao vasto potencial terapêutico de seus compostos secundários. Além disso, fornece madeira rígida de interesse para construção civil e também é utilizada como espécie ornamental. Apesar da grande quantidade de estudos direcionados para o potencial medicinal, pouco se sabe sobre a diversidade genética presente nessa espécie. Diante disso, os objetivos do trabalho foram transferir para P. emarginatus marcadores microssatélites desenvolvidos para Dipteryx alata e acessar a diversidade e estrutura genética em populações naturais de P. emarginatus. Para isso, foi testada à amplificação cruzada de 25 iniciadores e 12 populações naturais foram genotipadas para 6 locos microssatelites. Dos 25 iniciadores testados, 2 (8%) apresentaram bom padrão de amplificação e polimorfismo. O conjunto de marcadores utilizados revelou um total de quarenta e cinco alelos, com uma média de 7,667 por loco. Esse valor variou de 4 (DaE12) a 22 (PVESTBR067). As populações apresentaram nível intermediário de diversidade genética (He=0,555) e maior variabilidade dentro de populações do que entre populações. Foram detectados pequenos, porém significativos, níveis de endogamia devido tanto ao sistema de acasalamento quanto a subdivisão populacional (f= 0,07; Fst= 0,073). Esses resultados suportam que a espécie apresenta sistema misto de acasalamento. O padrão de divergência entre as populacionais demonstrou-se moderadamente estruturado no espaço (Mantel= 0,440; p<0,002) indicando um perfil de grandes populações continuas, com níveis significativos de fluxo gênico em distancias até aproximadamente 400 km.

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:05:47Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4602_1.pdf: 941507 bytes, checksum: c0ae7f823963e2cbd711e367c4dd1d23 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2006 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Foram analisadas as linhagens Metahizium anisopliae var. acridum e Metarhizium anisopliae var. anisopliae quanto à patogênicidade sobre Zaprinus indianus, utilizando as concentrações 104, 105, 106, 107, 108 conídios/mL considerando o percentual de emergência de adultos. De acordo com a metodologia empregada verificou-se que as duas linhagens apresentaram ação contra Z. indianus. Os marcadores moleculares ITS (Internal Trancride Spacer) do rDNA, Intron Splice Site Primer e Microssatélite (SSR- Simple Sequence Repeats), foram utilizados para avaliar a diversidade genética entre as linhagens antes e após a passagem pela mosca. A análise de agrupamento usando o método de UPGMA baseada nas distâncias genéticas dos marcadores moleculares confirmou a diversidade genética reconhecida no gênero Metarhizium. O microssatélite (GTG)5 e o intron do grupo mRNA nuclear tiveram a mesma sensibilidade em detectar a variabilidade genética entre as linhagens de Metarhizium . Os produtos de amplificação dos loci ITS1-5.8-ITS2 do rDNA com os iniciadores ITS4 e ITS5 foram eficientes em demonstrar que as linhagens estudadas pertence à espécie Metarhizium anisopliae, apesar da diversidade genética demonstrada pelos marcadores (GTG)5 e EI1. Os perfis de amplificações da região microssatélite, intron e ITS após a passagem por Z. indianus comprovaram que as linhagens reisoladas foram às mesmas que foram utilizadas para infectar

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-10-26T13:40:10Z No. of bitstreams: 1 Raquel Ventura Lima.pdf: 907594 bytes, checksum: b1c95adf4722d8417b5de6105e98b747 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-26T13:40:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Raquel Ventura Lima.pdf: 907594 bytes, checksum: b1c95adf4722d8417b5de6105e98b747 (MD5) Previous issue date: 2015-02-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The pacamã (Lophiosilurus alexandri) is a species of endemic catfish São Francisco river belonging to the order Siluriformes. It is a species very appreciated in the regions of the São Francisco River by the absence of intramuscular bones and quality of their steak, also highlighting the great potential for aquaculture. The pacamã among the most endangered species and restocking programs in the various regions of this basin have been developed. The aim of this study was to develop novel microsatellite markers for pacamã that can be used for genetic studies of this species and their populations. Tissue samples were collected from adult fish caught by artisanal fishing between the reservoirs of Sobradinho and Itaparica-BA-PE. First, a genomic DNA library was performed and a set of microsatellite was obtained. After genotyping, the number of alleles ranged from two to nine, and the average heterozygosity were 0659 (He) and 0.603 (Ho), respectively. Only one marker showed deviation from HWE and presence of null alleles. The overall coefficient of inbreeding (FIS) was 0.091, suggesting the presence of homozygous, which may be due to species characteristics. Polymorphic information content is, in most cases, greater than 0.5, confirming the efficiency of these markers for genetic studies / O pacamã (Lophiosilurus alexandri) é uma espécie de bagre endêmico do rio São Francisco pertencente a ordem dos Siluriformes. Trata-se de uma espécie muito apreciada nas regiões do rio São Francisco pela ausência de espinhos intramusculares e qualidade de seu filé, se destacando também pelo grande potencial para a aquicultura. O pacamã figura entre as espécies mais ameaçadas e programas de repovoamento nas diversas regiões desta bacia vêm sendo desenvolvidos. O objetivo deste trabalho foi desenvolver marcadores microssatélites inéditos para o pacamã que possam servir para estudos genéticos sobre essa espécie e suas populações. Amostras de tecido foram coletadas de peixes adultos capturados pela pesca artesanal entre os reservatórios de Sobradinho-BA e Itaparica-PE. Inicialmente, uma biblioteca genômica de DNA foi realizada e um conjunto de microssatélites foi obtido. Após a genotipagem, o número de alelos variou de dois a nove e as heterozigosidades médias foram de 0,659 (He) e de 0,603 (Ho), respectivamente. Apenas um marcador apresentou desvio do EHW e presença de alelos nulos. O coeficiente de endocruzamento total (FIS) foi de 0.091, sugerindo a presença de homozigotos, que pode ser em decorrência de características da espécie. O conteúdo de informação polimórfica foi, na maioria dos casos, superior a 0,5, atestando a eficiência desses marcadores para estudos genéticos futuros.

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:03:44Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4555_1.pdf: 1910369 bytes, checksum: 5a0109c9538c737e8440a1c2af5b2757 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2005 / Foram analisadas 15 linhagens de Metarhizium isoladas de diferentes regiões e hospedeiros quanto às características genéticas e 7 linhagens quanto a patogenicidade sobre Diatraea saccharalis. Os marcadores moleculares ITS (Internal Transcrided Spacer) do rDNA, Intron splice site primer, RAPD e Microssatélites (SSR-Simple Sequence Repeats) foram utilizados para avaliar a diversidade genética entre as linhagens. A análise de agrupamento usando o método UPGMA baseada nas distâncias genéticas dos quatro marcadores moleculares confirmou a diversidade genética reconhecida no gênero Metarhizium. As enzimas de restrição, HaeIII e MspI, evidenciaram a diversidade genética entre as linhagens ao digerirem os produtos de amplificação do locus ITS1-5.8S-ITS2 do rDNA com os iniciadores ITS4 e ITS5, a enzima DraI não apresentou sítios de restrição. Os introns do grupo mRNA nuclear discriminaram as linhagens de Metarhizium apenas com a utilização do iniciador EI1. As técnicas de RAPD e regiões de Microssatélite foram eficientes em demonstrar a diversidade entre as linhagens. Porém o microssatélite (GACA)4 foi mais sensível em detectar a variabilidade intra e interespecífica entre as diferentes linhagens de Metarhizium. Não houve correlação entre grupos e regiões geográficas. As linhagens 4415, 4400 e 4897 causaram maior percentual de mortalidade das larvas de Diatraea saccharalis. Também não houve correlação entre os agrupamentos gerados pelas técnicas moleculares e percentual de mortalidade de larvas de D. saccharalis

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:04:27Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4592_1.pdf: 1899674 bytes, checksum: 8f9acd45748f10771b8fa5759959958a (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2006 / Foram analisadas sete linhagens de Beauveria bassiana quanto à patogenicidade sobre os insetos adultos de Callosobruchus maculatus utilizando as concentrações 108, 107, 106, 105 e 104 conídios.mL-1, sendo a virulência determinada pelo percentual de mortalidade durante o período de nove dias. Todas as linhagens mostraram-se altamente patogênicas, provocando mortalidade superior a 50% da população de insetos já no terceiro dia após a inoculação. As linhagens URM2921, URM2923 e URM4544 comportaram-se como as mais agressivas ao inseto-alvo, sugerindo sua utilização em programas de controle biológico do caruncho do caupi. Quanto à analise genética, utilizou-se marcadores moleculares com base em PCR, sendo empregado o ISSR (Inter Simple Sequence Repeats) - iniciadores (GACA)4 e (GTG)5 para investigar a diversidade genética de sete linhagens de Beauveria bassiana. Esses primers são usualmente utilizados para amplificação de inter-regiões repetidas. A análise genética revelou que os primers foram eficientes em demonstrar a variabilidade intraespecífica entre as linhagens de B. bassiana. Analizando o efeito fungitóxico , in vitro, de produtos fitossanitários utilizados em culturas de feijão sobre o crescimento vegetativo e conidiogênese das linhagens de B. bassiana, observou-se que independente do inseticida utilizado, as linhagens URM2923, URM2926 e URM4552 apresentaram as maiores médias de crescimento micelial, enquanto a linhagem URM4544 apresentou o menor diâmetro. A compatibilidade das linhagens de B. bassiana variou amplamente dentro de cada linhagem e entre os inseticidas estudados, sendo Quimióleo (óleo vegetal) o produto que apresentou o maior efeito fungitóxico e URM2921 a linhagem mais sensível ao efeito dos defensivos agrícolas. As demais linhagens, dependendo do inseticida, podem ser recomendadas para programas de Manejo Integrado de Pragas do feijoeiro

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:04:33Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4458_1.pdf: 786506 bytes, checksum: 30ccb6ed2c83e0fa52dedbb745159fb1 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2004 / Foram analisadas 20 linhagens de C. gloeosporioides quanto às características genéticas e citomorfológicas. Os marcadores moleculares, RAPD, microssatélites, Intron Spice Site Primer e região ITS do DNA ribossomal, foram utilizados para avaliar a diversidade genética entre as linhagens. A análise de agrupamento através do método UPGMA confirmou a diversidade genética intraespecífica reconhecida em C. gloeosporioides. Com a técnica de RAPD foi detectada uma maior similaridade genética entre as linhagens. As regiões de microssatélites investigadas, demonstraram alto polimorfismo genético e os introns discriminaram todos as linhagens apenas com o primer (EI-1), e revelaram maior diversidade genética em relação aos outros marcadores moleculares utilizados. As três enzimas de restrição testadas, HaeIII, DraI e MspI evidenciaram a diversidade genética entre as linhagens nos produtos de amplificação dos loci ITS1-5.8S-ITS2 do rDNA com os primers ITS1 e ITS4. Todos os marcadores empregados, foram eficientes em demonstrar o alto grau de polimorfismo genético, constatado pela formação de grupos altamente diversificados, sem apresentar correlação entre os hospedeiros. Os aspectos macroscópicos exibiram uma variação na coloração, textura e segregação de setores nas colônias, e as observações microscópicas demonstraram a formação de estruturas vegetativas e reprodutivas peculiares da espécie. A condição nuclear investigada através da técnica de HCl-Giemsa, evidenciou conídios 100% uninucleados