Orientador: Eliana Regina Forni Martins / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-24T09:37:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Nasario_JoaoPauloSardin_M.pdf: 1858989 bytes, checksum: 1fd7e7dcb1a5473c4ff7fb12d1cd1a15 (MD5) Previous issue date: 2014 / Resumo: Tradicionalmente incluso na extinta família Bombacaceae, Pseudobombax Dugand pertence à subfamília Bombacoideae, Malvaceae sensu lato. Abrange cerca de 29 espécies, das quais 16 ocorrem em território brasileiro e nove são endêmicas. No Brasil, a maioria das espécies é encontrada no sudeste, planalto central e nordeste. As espécies possuem considerável valor comercial, por serem utilizadas no mundo todo, principalmente na ornamentação e arborização urbana. Estudos sobre o sistema reprodutivo e citogenéticos são raros para o gênero. Com este trabalho, objetivou-se o estudo da biologia floral e reprodutiva, assim como a análise cariotípica de três espécies de Pseudobombax da região sudeste do Brasil. As espécies de Pseudobombax são importantes fontes de pólen e néctar para seus visitantes florais, especialmente por florescerem na estação seca. Algumas diferenças foram observadas entre os períodos de floração e frutificação durante os dois anos de estudo, as quais podem estar relacionadas a diferentes quantidades de chuva antes do início da floração. As flores apresentam antese crepuscular/noturna, com características que se encaixam na síndrome da quiropterofilia. As flores de P. tomentosum são significativamente diferentes das demais espécies (maior comprimento da flor, das pétalas, do ovário e do cálice), porém a forma e o indumento dos frutos é a principal característica que podemos utilizar para separar taxonomicamente as três espécies. Os estudos reprodutivos das três espécies evidenciaram alta porcentagem de fecundação cruzada, indicando alogamia. A eficácia reprodutiva manteve-se alta, confirmando a necessidade de polinização cruzada e, consequentemente, de seus polinizadores. As análises citogenéticas mostraram contagens inéditas, com 2n=88 para Pseudobombax sp. (nova) e P. tomentosum e 2n=84 para P. grandiflorum. O número básico sugerido para as espécies de Pseudobombax é x=44. Foi confirmado mais de um número cromossômico no gênero, o que sugere a derivação por disploidia, decorrente de possíveis rearranjos cromossômicos. Pseudobombax sp. (nova) e P. grandiflorum, espécies muitas vezes confundidas entre si, possuem números cromossômicos diferentes (2n=88 e 2n=84, respectivamente) sendo este um caráter adicional importante na separação taxonômica das duas espécies. O bandamento CMA/DAPI evidenciou um padrão conservado dentro do gênero, com seis bandas CMA+ nas três espécies. Os valores métricos dos cromossomos das espécies em estudo indicaram um comprimento do complemento cromossômico pequeno, nas quais o menor tamanho cromossômico foi de 0,3 µm em P. grandiflorum e o maior foi de 3,5 µm em P. tomentosum. O diferente número cromossômico, bem como algumas características morfológicas florais e do fruto podem ser utilizadas na separação taxonômica das três espécies de Pseudobombax em estudo, evidenciando assim a existência de uma nova espécie para o gênero / Abstract: Traditionally included in the extinct family Bombacaceae, Pseudobombax Dugand belongs to the Bombacoideae subfamily, Malvaceae sensu lato. Composed by about 29 species, of which 16 occur in Brazilian territory and nine are endemic. In Brazil, most species are found in the southeast, northeastern and central plains. Species have considerable commercial value, for being used worldwide, especially in ornamentation and urban forestry. Studies on the reproductive system and cytogenetics are rare for the genus. This work aimed to study the floral and reproductive biology, as well as analysis of karyotype of three species of Pseudobombax from southeastern Brazil. The Pseudobombax species are important sources of pollen and nectar for their floral visitors, especially by flourishing in the dry season. Some differences were observed between the periods of flowering and fruiting during the two years of study, which may be related to different amounts of rainfall before flowering. The flowers have crepuscular/nocturnal anthesis, with features that fit in the chiropterophily syndrome. The flowers of P. tomentosum are significantly different from the other species (greater length of the flower petals, the ovary and the cup), but the shape and indumentum of the fruit is the main feature that we can use to separate the three species taxonomically. Reproductive studies of the three species showed a high percentage of outcrossing, indicating outcrossing. The reproductive efficiency remained high, confirming the necessity of cross-pollination and, therefore, their pollinators. Cytogenetic analysis showed unprecedented chromosome counts, with 2n=88 to Pseudobombax sp. (new) and P. tomentosum and 2n=84 for P. grandiflorum. The basic chromosome number suggested to Pseudobombax is x=44. We confirmed more than one chromosome number in the genus, which suggests derivation by disploidy, due to possible chromosomal rearrangements. Pseudobombax sp. (new) and P. grandiflorum, species often confused with each other, presented different chromosome numbers (2n=88 or 2n=84 , respectively) which is an important taxonomic character for the separation of the two species. The CMA/DAPI banding showed a conserved pattern within the genus, with six CMA+ bands in all species. The metric values of the chromosomes of the species under study indicated a small chromosomal complement length, wherein the smallest chromosome size was 0.3 µm in P. grandiflorum and the largest was 3.5 µm in P. tomentosum. The different chromosome numbers, as well as some floral and fruit morphological characteristics can be used for taxonomic separation of the three Pseudobombax species under study Pseudobombax, thus revealing the existence of a new species for the genus / Mestrado / Biologia Vegetal / Mestre em Biologia Vegetal

The objective of this work was to evaluate the frequency effects of Megathyrsus maximus cv. The treatments were characterized by harvest frequencies, being: fixed periods of 28 days, whenever the canopy intercepted 90%, or 95% of the incident light, following a completely randomized design with four replicates. It was observed at pre-cut height that the 28-day treatment had a higher mean (104.61 cm), with lower values (P <0.0001) and 90% IL treatment (80.46 cm). At the post-cut period, the treatment of 28 days of rest also presented the highest mean value (63.19 cm), with frequencies of 90 and 95% IL, not differing from each other. The light intercept, in the pre-cut condition, presented differences between the treatments (P <0.0001), with a higher mean value being observed in the treatment of 28 days (95.81%) and lower in 90% IL (90, 83%). For light interception, the treatment of 28 days had a higher value 81.63% of IL (P <0.0001), treatment 95% had a value of 67.74%, and treatment 90%, 74.48% of IL. Regarding the leaf angle, the treatments showed no differences, both in the pre-cut and post-cut conditions (P = 0.435). The leaf area index, in the pre-cut condition, presented a difference (P> 0.0001) between the treatments, in which the 28 days presented the highest value (4.13), the 95% IL presented an intermediate value ( 3.79) and the treatment of 90% IL presented the lowest value (3.37). The highest post-cut leaf area index was observed in the 28-day treatment (2.03), and the treatments were treated by similar IL (1.46 and 1.66 for 90 and 95% IL, respectively), not differing from each other . Regarding the rate of tiller emergence, the treatment of 90% IL presented the highest mean value (P = 0.05) (0.58), with the lowest value being observed in the treatment of 28 days (0.4), in that of 95% IL was similar to the others (0.47). Regarding the rate of tillering treatments did not differ statistically between them (P = 0.11). Regarding the tiller survival rate, the treatment of 90% IL showed a lower rate, the treatment of 95% IL did not differ statistically from the others for tiller survival rate, being the highest value observed in the treatment 28 days. Regarding the population density of tillers the results obtained in this study did not present statistical differences between them. With an average value of 452.7 tiller.m-2. Regarding the number of cycles, 90% IL presented the highest number, with 11, the treatment of 95% IL presented a number of intermediary cycles (10 cycles). The treatment was managed with 28 days, which presented the fewest cycles, (9 cycles). It was observed a high degree of correlation between light interception with canopy height (r = 0.72), between light interception and leaf area index (r = 0.78) and between leaf area index and canopy height (r = 0.81). The treatment handled with 90% IL presented the best results, as it presented a higher number of harvest cycles, a shorter rest period and a greater renewal of tillers in this system. In addition, pastures managed with 90% IL can be harvested when they reach 80.46 cm and lowered with 48.37 cm in height. / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Objetivou-se com esse trabalho avaliar os efeitos freqüência de colheita de pastos de Megathyrsus maximus cv. sempre-verde na estrutura, dinâmica do perfilhamento, período de descanso e ciclos de colheita.Foram avaliados três tratamentos, caracterizados por freqüências de colheita, sendo elas: a de períodos fixos de 28 dias, sempre que dossel interceptasse 90%, ou 95% da luz incidente, seguindo delineamento inteiramente casualizado com quatro repetições. Foi observado na altura de pré-corte que o tratamento de 28 dias apresentou maior média (104,61 cm), com menores valores (P<0,0001) sendo observados no tratamento de 90% de IL (80,46 cm). Na altura pós-corte, o tratamento de 28 dias de descanso também apresentou o maior valor médio (63,19 cm), com as freqüências de 90 e 95% de IL não diferindo entre si. A interceptação luminosa, na condição de pré-corte, apresentou diferenças entre os tratamentos (P<0,0001), com maior valor médio sendo observado no tratamento de 28 dias (95,81%) e menor em 90% IL (90,83%). Para interceptação luminosa, o tratamento de 28 dias apresentou maior valor 81,63 % de IL (P<0,0001), o tratamento 95% apresentou um valor de 67,74%, e o tratamento 90%, 74,48% de IL. Com relação ao ângulo foliar os tratamentos não apresentaram diferenças, tanto na condição de pré-corte como na de póscorte(P=0,435). O índice de área foliar, na condição de pré-corte, apresentou diferença (P>0,0001) entre os tratamentos, em que o de 28 dias apresentou maior valor (4,13), o de 95% IL apresentou valor intermediário (3,79) e o tratamento de 90%IL apresentou o menor valor (3,37). O maior índice de área foliar pós-corte foi observado no tratamento de 28 dias (2,03), sendo os tratamentos manejados por IL semelhantes (1,46 e 1,66 para 90 e 95% IL, respectivamente) não diferindo entre si. Com relação à taxa de aparecimento de perfilhos o tratamento de 90%IL apresentou o maior valor médio (P=0,05) (0,58), com o menor valor sendo observado no tratamento de 28 dias (0,4), em que o de 95% IL foi semelhante aos demais (0,47). Com relação à taxa de mortalidade de perfilhosos tratamentos não diferiram estatisticamente entre si(P=0,11). Com relação à taxa de sobrevivência de perfilhos o tratamento de 90% IL apresentou menor taxa, o tratamento de 95%IL não diferiu estatisticamente dos demais para taxa de sobrevivência de perfilhos sendo o maior valor observado no tratamento 28 dias. Com relação à densidade populacional de perfilhos os resultados obtidos este estudo não apresentaram diferenças estatísticas entre si. Apresentando valor médio de 452,7 perfilhos.m2. Com relação ao número de ciclos o tratamento de 90% IL apresentou o maior número, com 11, o tratamento de 95% IL apresentou quantidade de ciclos intermediaria (10 ciclos), sendo o tratamento manejado com 28 dias o que apresentou a menor quantidade ciclos, (9 ciclos). Pôde-se observar um alto grau de correlação entre a interceptação luminosa com altura do dossel(r=0,72), entre a interceptação luminosa e índice de área foliar (r= 0,78) e entre o índice de área foliar e a altura do dossel(r= 0,81). O tratamento manejado com 90% IL apresentou os melhores resultados, pois apresentou maior número de ciclos de colheita, menor período de descanso e maior renovação de perfilhos neste sistema. Ademais, pastos manejados com 90% de IL podem ser colhidos quando atingirem 80,46 cm e rebaixados com 48,37 cm de altura.

A demonstração feita por Erdos da existência de grafos com cintura e número cromático grandes é uma das primeiras aplicações do método probabilístico. Essa demonstração fornece um limite para o número de vértices de um grafo desse tipo, que é exponencial na cintura quando o número cromático é fixado. O foco deste texto, no entanto, são as construções determinísticas de grafos com cintura e número cromático grandes e os números de vértices dos grafos obtidos. As construções elementares conhecidas fornecem apenas grafos com um número Ackermanniano de vértices. O texto começa com uma breve repetição das demonstrações probabilísticas da existência de grafos e hipergrafos com cintura e número cromático grandes. Depois, a busca por construções determinísticas é motivada apresentando-se algumas construções para o caso particular de grafos livres de triângulo e com número cromático grande. São construídos os grafos de Tutte, Zykov, Mycielski e Kneser, os grafos de shift e os de planos projetivos finitos. Os números de vértices dessas construções são computados e comparados. De fato, a construção a partir de planos projetivos finitos tem um número polinomial de vértices. A parte principal do texto são as construções de grafos e hipergrafos com cintura e número cromático grandes. A primeira construção apresentada foi feita por Kriz. Ela foi a primeira construção para grafos com cintura e número cromático grandes que não envolvia hipergrafos. A segunda construção apresentada foi feita por Nesetril e Rödl. Essa construção antecede a de Kriz. Ela utiliza a amalgamação entre grafos e hipergrafos para obter um hipergrafo uniforme com cintura e número cromático grandes. A terceira e última construção apresentada foi encontrada por Alon, Kostochka, Reiniger, West e Zhu. Essa construção consegue obter hipergrafos uniformes com cintura e número cromático grandes diretamente a partir de um grafo, que é uma certa árvore aumentada. Em particular, essa construção obtém grafos com cintura e número cromático grandes sem envolver hipergrafos. Os números de vértices dos hipergrafos obtidos por essas construções são computados e comparados. / The proof by Erdos of the existence of graphs with high girth and high chromatic number is one of the first applications of the probabilistic method. This proof gives a bound on the number of vertices of such graphs, which is exponential on the girth if the chromatic number is fixed. The focus of this text is however on the deterministic construction of graphs with high girth and high chromatic number and on the number of vertices of the obtained graphs. The elementary known constructions can only give us graphs with an Ackermannian number of vertices. We begin by briefly repeating the probabilistic proofs of the existence of graphs and hypergraphs with high girth and high chromatic number. Then we motivate the search for deterministic constructions of such graphs by showing some constructions for the special case of triangle-free graphs with high chromatic number. We construct Tutte, Zykov, Mycielski and Kneser graphs, the shift graphs and graphs built from finite projective planes. We count and compare the number of vertices of the graphs obtained by each of these constructions. In fact, the construction based on finite projective planes gives us graphs with a polynomial number of vertices. The main part of the text consists of constructions of graphs and hypergraphs with high girth and high chromatic number. The first construction we present is due to Kriz. This was the first construction to give graphs with high girth and high chromatic number without using hypergraphs. The second construction we present is due to Nesetril and Rödl. This construction precedes the one by Kriz. It uses amalgamations between graphs and hypergraphs to obtain uniform hypergraphs with high girth and high chromatic number. The third and last construction we show was found by Alon, Kostochka, Reiniger, West and Zhu. This construction manages to build uniform hypergraphs with high girth and high chromatic number directly from a single graph, which is an augmented-tree. In particular, it constructs graphs with high girth and high chromatic number without using hypergraphs. We count and compare the number of vertices of the hypergraphs obtained by these constructions.

O número de contato do Rn (em inglês, kissing number) é o maior número de esferas de raio unitário e interiores dois-a-dois disjuntos que podem tocar simultaneamente uma esfera de raio unitário central. Nesta dissertação estudamos métodos que limitam o tamanho de tais configurações através de técnicas de otimização, como dualidade e programação semidefinida. O principal resultado obtido foi o cálculo de melhores limitantes para o número de contato nas dimensões 9 a 23; o que foi possível graças à exploração de simetrias dos polinômios presentes no limitante proposto por Bachoc e Vallentin (2008), levando à consideração de programas semidefinidos menores. Por fim, o limitante estudado é estendido para uma classe mais geral de problemas. / The kissing number of Rn is the maximum number of pairwise-nonoverlapping unit spheres that can simultaneously touch a central unit sphere. In this thesis we study methods to bound from above the size of such configurations using optimization techniques, like duality and semidefinite programming. The main result achieved is the computation of better bounds for the kissing number in dimensions 9 to 23; a result possible due to the exploitation of symmetries in the polynomials present in the bound proposed by Bachoc and Vallentin (2008), leading to the consideration of smaller semidefinite programs. Finally, the studied bound is extended to a bigger class of problems.

Panicum coloratum es una especie C4 perenne originaria del Sur de África, que fue introducida a nuestro país en la década del 90´a partir de pocos eventos no debidamente registrados. A pesar de sus buenos atributos como forrajera ha sido escasamente difundida en los sistemas ganaderos. Sin embargo, existe hoy una tendencia a aumentar su uso debido a su potencial y a su adaptación a condiciones marginales que es donde se sitúa predominantemente la actividad ganadera en la actualidad. En los últimos años se han dado a conocer varios trabajos que estudian diversos aspectos del crecimiento y de la adaptación de la especie a estreses abióticos, a la vez que se han instituido planes de mejoramiento con el fin de obtener nuevos cultivares para afrontar la creciente demanda de esta especie. P. coloratum está constituida principalmente por dos variedades botánicas, var. makarikariense y var. coloratum. En esta tesis en particular se describe detalladamente las características morfo-fisiológicas de la var. makarikariense de una colección del INTA EEA Rafaela, y se la compara con una accesión de la var. coloratum de la misma colección. Esta información sumada a la caracterización de la variación molecular presente en la colección son de suma importancia para la conservación de los recursos genéticos presentes en la colección a la vez que resultan muy informativos para el planteo de estrategias a seguir en el programa de mejoramiento que se está siguiendo en INTA. En el desarrollo de esta tesis se trabajó con cinco accesiones, 15 materiales clonales y un material comercial de la var. makarikariense y una accesión de la var. coloratum que se estudiaron utilizando descriptores fenotípicos asociados a producción de forraje y semillas y marcadores moleculares ISSR y SSR. Se identificaron accesiones superiores en cuanto a su potencial forrajero y de producción de semillas, con rendimientos en algunos casos por encima del material comercializado en el país. La variabilidad genética encontrada por medio del uso de marcadores ISSR y SSR tanto dentro como entre accesiones, se visualizó a través de bandas y alelos únicos por accesión. Con respecto al material actualmente comercializado en el país, la variabilidad genética existente, nos indicaría que se trata de una población estabilizada que no ha sido objeto de procesos de selección definidos. La accesión de la var. coloratum fue diferenciada morfológica y genéticamente de la var. makarikariense, detectándose loci y alelos que diferencian ambas variedades. La baja correlación entre la distancia morfológica y molecular indicaría que cada set de datos provee información diferente y complementaria para la caracterización y evaluación de los materiales. Dentro de la var. makarikariense, se encontraron accesiones que difieren entre sí y en sus niveles de diversidad, pudiéndose tratar de materiales que han sufrido algún proceso de diferenciación. La evaluación del número cromosómico y modo reproductivo de los materiales, mostró que se trataría de accesiones tetraploides. Por otra parte, la diferenciación en cuanto a la producción de mayor número de semillas llenas con respecto a vanas y la supervivencia diferencial de las plántulas cuando las semillas se obtienen bajo polinización libre en comparación a la autofecundación, asegura que se trata de una especie cuyo modo reproductivo preferencial es la alogamia. El análisis de test de progenie con marcadores SSR mostró que el 100% de la progenie presenta recombinación genética y el 83% presenta alelos paternos, lo que refuerza las evidencias sobre la naturaleza principalmente alógama de la especie. Las estimaciones de los componentes de varianza sobre familias de medias hermanas mostraron que más del 80% de la variación reside dentro de familias mientras que sólo una baja proporción de la variación estaría entre familias. Asimismo fue posible diferenciar entre familias de medias hermanas para varios de los caracteres evaluados. Se lograron hacer estimaciones de heredabilidad, aunque las mismas resultaron en general con valores moderados a bajos. Estas estimaciones se utilizaron para predecir ganancias genéticas a obtenerse después de un ciclo de selección con una presión del 15% en caracteres morfo-fisiológicos asociados a producción de forraje y semillas. Los métodos utilizados para estimar heredabilidad mostraron similar tendencia entre variables y una concordancia entre ellos, lo que nos indicaría que cualquiera de ellos sería un método apropiado para la estimación de estos parámetros. Se estudiaron relaciones entre caracteres, coheredabilidades y ganancias por selección indirecta entre rasgos relacionados que pudieran ser útiles en programas de selección. Estos resultados adicionan nuevos conocimientos sobre la diversidad genética, biología reproductiva y niveles de ploidía en materiales disponibles de P. coloratum, brindan información pertinente a la vez que abren nuevas perspectivas para el programa de mejoramiento de la especie lo que permitirá la planificación y desarrollo de metodologías de cruzamientos y de utilización de los materiales para ser manipulados de forma práctica y eficiente.

El género Zea comprende varias especies de gramíneas de origen americano, de las cuales la única que tiene valor económico es Zea mays ssp mays, conocida como maíz, un cereal de alto valor energético cultivado para el consumo humano y animal. Las especies silvestres, conocidas colectivamente como Teosintes, difieren significativamente en su aspecto fenotípico con respecto al maíz, aunque en algunos casos, han desarrollado un aspecto similar, como respuesta a la erradicación selectiva realizada por los granjeros que la consideran una maleza del cultivo de maíz. Con el fin de dilucidar las relaciones fitogenéticas, el nivel de ploidía y la diferenciación evolutiuva de los genomios homeólogos del género Zea, se analizaron especies e híbridos de Zea a nivel fenotípico, genotípico y citogenético, induciéndose con solución diluida de colchicina el apareamiento intergenómico críptico de los genomios homeólogos. Los resultados obtenidos en este proyecto de investigación han proporcionado datos valiosos sobre las relaciones filogenéticas y evolutivas de las especies de este género. Asimismo, sobre la base de los resultados, se plantea una hipótesis en torno al origen evolutivo de la especie cultivada. / Molina Belver, MDC. (2011). Estudios citogenéticos evolutivos del género Zea [Tesis doctoral]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/9912

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Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo a Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro / A Deficiência Intelectual (DI) é uma condição complexa, que acomete 2-3% da população mundial, constituindo um importante problema de saúde pública. No entanto, uma parcela significativa dos casos de DI permanece sem um diagnóstico definitivo, o que demonstra que muitos fatores etiológicos associados a esta condição ainda precisam ser elucidados. Há um consenso de que o número de homens com DI supera em 30% o número de mulheres, um achado atribuído à presença de mutações em genes localizados no cromossomo X. Dentre os genes presentes neste cromossomo que são expressos no cérebro, o Jumonji AT-rich interactive domain 1C (JARID1C) foi identificado como um potencial candidato a estar relacionado à DI ligada ao X (DILX). O gene JARID1C codifica uma desmetilase da lisina 4 da histona H3 (H3K4), imprescindível para a regulação epigenética. Tão importante quanto o estudo do gene JARID1C em pacientes com DI é a busca por variações no número de cópias gênicas (VNCs) em regiões cromossômicas subteloméricas. Genes relacionados ao desenvolvimento cerebral são enriquecidos em VNCs e as regiões subteloméricas são mais susceptíveis à formação destes rearranjos. Diante do exposto, neste estudo, investigamos mutações no gene JARID1C (exons 3, 4, 5, 8, 10, 14 e 23) em 148 homens portadores de DI pertencentes a famílias com padrão de segregação sugestivo de DILX. Paralelamente, analisamos VNCs subteloméricas em 174 homens com DI familiar de etiologia idiopática, independente do padrão de segregação. Para todos os indivíduos selecionados, amostras de DNA genômico foram extraídas a partir de sangue periférico e alterações genéticas frequentemente relacionadas à DI foram previamente excluídas (expansões trinucleotídicas nos loci FRAXA e FRAXE e mutações nos genes MECP2 e ARX). A análise do gene JARID1C foi realizada pela técnica de PCR, seguida da análise dos produtos amplificados por sequenciamento. Foram identificadas quatro variantes silenciosas (c.564G>A, c.633G>C, c.1884G>A, c.1902C>A). Através da análise in silico de sequências exônicas acentuadoras de splicing (ESEs) localizadas nas posições das variantes encontradas, foi possível classificar a variante c.1884G>A como neutra e as três variantes restantes como possíveis criadoras de ESEs. Já para a investigação das VNCs subteloméricas, foi utilizada a metodologia de Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification (MLPA), capaz de identificar microdeleções e microduplicações nas 46 regiões subteloméricas. Para este fim, inicialmente, os indivíduos foram investigados pelo kit de MLPA P036, enquanto que para aqueles que exibiram alterações também foi utilizado o kit P070. A validação das VNCs encontradas foi realizada por PCR quantitativo em Tempo Real. A análise por MLPA revelou um indivíduo apresentando duas deleções (9p e 13q), um indivíduo apresentando duas amplificações (1p e 2p), dois indivíduos apresentando uma deleção e uma amplificação (18p e 18q; 4p e 8p), quatro indivíduos portadores de uma deleção cada (10p, 20p, 3q e 22q) e dois indivíduos com uma amplificação cada (7q e 20p). Algumas das alterações subteloméricas encontradas (2,87%) representam VNCs de relevância clínica para o estudo da DI, reforçando a importância do rastreamento de rotina de VNCs subteloméricas na DI familiar. Consideramos que a elucidação de novos genes ou mecanismos moleculares diretamente relacionados à DI é um caminho promissor e urgente para o estabelecimento de novas estratégias terapêuticas possíveis. / Intellectual Disability (ID) is a complex condition, which affects 2-3% of general population, constituting a major public health problem. Nevertheless, a significant number of ID cases remain to have a definitive diagnosis, showing that many etiologic factors associated with this condition need to be elucidated. There is a consensus that the number of ID males exceeds by 30% the number of females, a finding that is attributed to the presence of mutations in genes located on chromosome X. Among the X-linked brain-expressed genes, the Jumonji AT-rich interactive domain 1C (JARID1C) was identified as a potential candidate to be related to X-Linked ID (XLID). The JARID1C gene encodes a histone demethylase specific for histone 3 lysine 4 (H3K4), which is indispensable for the epigenetic regulation. As important as the study of JARID1C gene in ID patients is the search for subtelomeric copy number variations (CNVs). Genes related to brain development are enriched in CNVs and subtelomeric regions are particularly susceptible to these rearrangements. In view of this evidence, in this study we investigated JARID1C mutations (exons 3, 4, 5, 8, 10, 14 and 23) among 148 males with ID from families with a segregation pattern suggestive of XLID. In parallel, we analyzed subtelomeric CNVs among 174 males with idiopathic familial ID, regardless of the segregation pattern. For all selected individuals, genomic DNA was extracted from peripheral blood and other frequent genetic causes related to ID were previously excluded (trinucleotide expansions at FRAXA and FRAXE loci and mutations in MECP2 and ARX genes). The JARID1C gene analysis was performed by PCR followed by sequencing analysis of the amplified products. We identified four silent mutations (c.564G>A, c.633G>C, c.1884G>A and c.1902C>A). In silico analysis of exonic splicing enhancers (ESEs) located in the variants positions made possible to classify the variant c.1884G>A as neutral and the remaining variants as potential creators of new ESEs. For the investigation of subtelomeric CNVs, Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification (MLPA) methodology was applied to identify microdeletions and microduplications in the 46 subtelomeric regions. For this purpose, individuals were initially investigated by P036 MLPA kit, whereas for those who exhibited abnormalities, the P070 kit was also used. The CNVs validation was performed by quantitative Real Time PCR. The MLPA analysis revealed an individual with two deletions (9p and 13q), an individual with two amplifications (1p and 2p), two individuals with a deletion and amplification (18q and 18p; 4p and 8p), four individuals with a deletion (10p, 20p, 3q and 22q) and two individuals with an amplification (7q and 20p). Some of the changes found (2,87%) represent subtelomeric CNVs of clinical relevance for the study of ID, reinforcing the importance of routine screening of subtelomeric CVNs in cases of familial ID. We believe that the elucidation of novel genes or molecular mechanisms directly related to ID is a promising and urgent way for establishing new possible therapeutic strategies.

Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo a Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro / A Deficiência Intelectual (DI) é uma condição complexa, que acomete 2-3% da população mundial, constituindo um importante problema de saúde pública. No entanto, uma parcela significativa dos casos de DI permanece sem um diagnóstico definitivo, o que demonstra que muitos fatores etiológicos associados a esta condição ainda precisam ser elucidados. Há um consenso de que o número de homens com DI supera em 30% o número de mulheres, um achado atribuído à presença de mutações em genes localizados no cromossomo X. Dentre os genes presentes neste cromossomo que são expressos no cérebro, o Jumonji AT-rich interactive domain 1C (JARID1C) foi identificado como um potencial candidato a estar relacionado à DI ligada ao X (DILX). O gene JARID1C codifica uma desmetilase da lisina 4 da histona H3 (H3K4), imprescindível para a regulação epigenética. Tão importante quanto o estudo do gene JARID1C em pacientes com DI é a busca por variações no número de cópias gênicas (VNCs) em regiões cromossômicas subteloméricas. Genes relacionados ao desenvolvimento cerebral são enriquecidos em VNCs e as regiões subteloméricas são mais susceptíveis à formação destes rearranjos. Diante do exposto, neste estudo, investigamos mutações no gene JARID1C (exons 3, 4, 5, 8, 10, 14 e 23) em 148 homens portadores de DI pertencentes a famílias com padrão de segregação sugestivo de DILX. Paralelamente, analisamos VNCs subteloméricas em 174 homens com DI familiar de etiologia idiopática, independente do padrão de segregação. Para todos os indivíduos selecionados, amostras de DNA genômico foram extraídas a partir de sangue periférico e alterações genéticas frequentemente relacionadas à DI foram previamente excluídas (expansões trinucleotídicas nos loci FRAXA e FRAXE e mutações nos genes MECP2 e ARX). A análise do gene JARID1C foi realizada pela técnica de PCR, seguida da análise dos produtos amplificados por sequenciamento. Foram identificadas quatro variantes silenciosas (c.564G>A, c.633G>C, c.1884G>A, c.1902C>A). Através da análise in silico de sequências exônicas acentuadoras de splicing (ESEs) localizadas nas posições das variantes encontradas, foi possível classificar a variante c.1884G>A como neutra e as três variantes restantes como possíveis criadoras de ESEs. Já para a investigação das VNCs subteloméricas, foi utilizada a metodologia de Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification (MLPA), capaz de identificar microdeleções e microduplicações nas 46 regiões subteloméricas. Para este fim, inicialmente, os indivíduos foram investigados pelo kit de MLPA P036, enquanto que para aqueles que exibiram alterações também foi utilizado o kit P070. A validação das VNCs encontradas foi realizada por PCR quantitativo em Tempo Real. A análise por MLPA revelou um indivíduo apresentando duas deleções (9p e 13q), um indivíduo apresentando duas amplificações (1p e 2p), dois indivíduos apresentando uma deleção e uma amplificação (18p e 18q; 4p e 8p), quatro indivíduos portadores de uma deleção cada (10p, 20p, 3q e 22q) e dois indivíduos com uma amplificação cada (7q e 20p). Algumas das alterações subteloméricas encontradas (2,87%) representam VNCs de relevância clínica para o estudo da DI, reforçando a importância do rastreamento de rotina de VNCs subteloméricas na DI familiar. Consideramos que a elucidação de novos genes ou mecanismos moleculares diretamente relacionados à DI é um caminho promissor e urgente para o estabelecimento de novas estratégias terapêuticas possíveis. / Intellectual Disability (ID) is a complex condition, which affects 2-3% of general population, constituting a major public health problem. Nevertheless, a significant number of ID cases remain to have a definitive diagnosis, showing that many etiologic factors associated with this condition need to be elucidated. There is a consensus that the number of ID males exceeds by 30% the number of females, a finding that is attributed to the presence of mutations in genes located on chromosome X. Among the X-linked brain-expressed genes, the Jumonji AT-rich interactive domain 1C (JARID1C) was identified as a potential candidate to be related to X-Linked ID (XLID). The JARID1C gene encodes a histone demethylase specific for histone 3 lysine 4 (H3K4), which is indispensable for the epigenetic regulation. As important as the study of JARID1C gene in ID patients is the search for subtelomeric copy number variations (CNVs). Genes related to brain development are enriched in CNVs and subtelomeric regions are particularly susceptible to these rearrangements. In view of this evidence, in this study we investigated JARID1C mutations (exons 3, 4, 5, 8, 10, 14 and 23) among 148 males with ID from families with a segregation pattern suggestive of XLID. In parallel, we analyzed subtelomeric CNVs among 174 males with idiopathic familial ID, regardless of the segregation pattern. For all selected individuals, genomic DNA was extracted from peripheral blood and other frequent genetic causes related to ID were previously excluded (trinucleotide expansions at FRAXA and FRAXE loci and mutations in MECP2 and ARX genes). The JARID1C gene analysis was performed by PCR followed by sequencing analysis of the amplified products. We identified four silent mutations (c.564G>A, c.633G>C, c.1884G>A and c.1902C>A). In silico analysis of exonic splicing enhancers (ESEs) located in the variants positions made possible to classify the variant c.1884G>A as neutral and the remaining variants as potential creators of new ESEs. For the investigation of subtelomeric CNVs, Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification (MLPA) methodology was applied to identify microdeletions and microduplications in the 46 subtelomeric regions. For this purpose, individuals were initially investigated by P036 MLPA kit, whereas for those who exhibited abnormalities, the P070 kit was also used. The CNVs validation was performed by quantitative Real Time PCR. The MLPA analysis revealed an individual with two deletions (9p and 13q), an individual with two amplifications (1p and 2p), two individuals with a deletion and amplification (18q and 18p; 4p and 8p), four individuals with a deletion (10p, 20p, 3q and 22q) and two individuals with an amplification (7q and 20p). Some of the changes found (2,87%) represent subtelomeric CNVs of clinical relevance for the study of ID, reinforcing the importance of routine screening of subtelomeric CVNs in cases of familial ID. We believe that the elucidation of novel genes or molecular mechanisms directly related to ID is a promising and urgent way for establishing new possible therapeutic strategies.

Submitted by Nadir Basilio (nadirsb@uninove.br) on 2017-04-04T16:01:12Z No. of bitstreams: 1 Eunice Ramos de Carvalho Fernandes.pdf: 3905291 bytes, checksum: 8eee9065955d5de911be06694aba1ddd (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-04T16:01:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Eunice Ramos de Carvalho Fernandes.pdf: 3905291 bytes, checksum: 8eee9065955d5de911be06694aba1ddd (MD5) Previous issue date: 2017-02-02 / The present research aims to analyze if the mathematical activities contained in Buriti Mirim's collection of textbooks of Editora Moderna, directed to Early Childhood Education, provide the construction of the number for young children. As specific objectives, we highlight the following: the book has classification, serialization and ordering activities since they are fundamental for number construction, observing how the class teacher uses this instrument and observing what strategies the children use to carry out the activities. The research was conducted in the last cycle of a private school of Early Childhood Education located in the city of São Paulo which adopts the material in question and the subjects were seven children aged five years and a teacher. We used a qualitative methodological approach and, as an instrument of data collection, we made use of participant observation. The analysis of the data was based on the proposal of content analysis of Bardin. As a theoretical reference, we will betake the following authors: Piaget (2013), Kamii (2012), Ramos (2009) to substantiate the number construction category; Barbosa (2009), Campos (2005), Campos et al. 2011), Oliveira (2010) to support the category early childhood education; Gomes and Magalhães (2012), D'Ambrosio (2005, 2012), Zorzan (2007) Skovsmose (2013) to base the category mathematics. We also analyzed some documents that rules Early Childhood Education. As a result, we find out that the book has concerns about working with children and not just records of activities. It contributes to the teaching of the National Curricular Reference Framework for Early Childhood Education (RCNEI), although many activities starts with the teacher and not with the child as the protagonist. Some activities have an end in itself. The playful is part of the universe of children and, in general, helps the development of logical-mathematical reasoning, favoring the construction of numbers. The book's activities works only as a resource for the teacher and not as an indispensable tool. / Esta investigación tiene como objetivo analizar si las actividades de matemáticas contenidas en la colección de libros de texto Buriti Mirim de Editora Moderna dirigidas a proporcionar el construcción de número de Educación Infantil por niños pequeños. Los objetivos específicos se indican las siguientes: El libro tiene la serialización, la clasificación y la ordenación, ya que son fundamentales para la construcción de número, observan cómo el maestro de la clase utilizando este instrumento y tenga en cuenta que los niños estrategias utilizadas para llevar a cabo las actividades. La encuesta se llevó a cabo en el último ciclo de una escuela privada de la Educación Infantil en la ciudad de Sao Paulo se adopta el material en cuestión y los sujetos eran siete niños de 5 años y un maestro. Utilizamos enfoque metodológico de carácter cualitativo y, como un instrumento de recolección de datos hace uso de la observación participante. El análisis de los datos se basó en el análisis de contenido de Bardin propuesto. Como marco teórico, utilizaremos los siguientes autores: Piaget (2013); Kamii (2012), Ramos (2009) para apoyar el número de categoría de la construcción; Barbosa (2009), Campos (2005, et al (2011) Oliveira (2010) para apoyar a la categoría de Educación Infantil; .. Gomes y Magalhães (2012) D'Ambrosio (2005, 2012) Zorzan (2007) Skovsmose (2013) de apoyar la educación de la categoría matemáticas. también se analizaron algunos de los documentos que rigen la educación en la primera infancia. como resultado, nos encontramos con que el libro plantea preocupaciones acerca de las actividades prácticas de trabajo con los niños y no sólo como registros de actividad. contribuye ayudando al maestro en los supuestos del Plan de Estudios Nacional de Referencia para la Educación Preescolar (RCNEI) aunque muchas actividades comienzan desde el maestro y no el niño como protagonista. Algunas actividades son fines en sí mismos. la parte lúdica del universo de los niños y en general ayudar en el desarrollo del razonamiento lógico matemático, favoreciendo número del edificio. las actividades del libro funciona sólo como un recurso para el profesor y no en una herramienta indispensable. / A presente pesquisa tem por objetivo analisar se as atividades de matemática contidas na coleção de livros didáticos Buriti Mirim da Editora Moderna, direcionados à educação infantil, proporcionam a construção do número pelas crianças pequenas. Como objetivos específicos, elencamos os seguintes: O livro possui atividades de seriação, classificação e ordenação, uma vez que são fundamentais para a construção do número; observar como a professora da classe se utiliza desse instrumento e observar que estratégias as crianças utilizam para realizar as atividades. A pesquisa foi realizada no último ciclo de uma escola privada de educação infantil localizada na cidade de São Paulo que adota o material em questão e os sujeitos foram sete crianças de 5 anos de idade e uma professora. Utilizamos abordagem metodológica de cunho qualitativo e, como instrumento de coleta de dados fizemos uso da observação participante. As análises dos dados foram pautadas na proposta de análise de conteúdo de Bardin. Como referencial teórico, recorreremos aos seguintes autores: Piaget (2013); Kamii (2012), Ramos (2009), para fundamentar a categoria construção do número; Barbosa (2009), Campos (2005), Campos et al. (2011), Oliveira (2010), para fundamentar a categoria educação infantil; Gomes e Magalhães (2012), D’Ambrosio (2005, 2012), Zorzan (2007), Skovsmose (2013), para fundamentar a categoria ensino da matemática. Também analisamos alguns documentos que regem a educação infantil. Como resultados, constatamos que o livro traz preocupações em trabalhar atividades práticas com as crianças e não somente como registros de atividades. Contribui auxiliando a professora nos pressupostos do Referencial Curricular Nacional para a Educação Infantil (RCNEI), embora muitas atividades partem do professor e não da criança como protagonista. Algumas atividades têm fim em si mesmas. O lúdico faz parte do universo das crianças e, de maneira geral, auxiliam no desenvolvimento do raciocínio lógico matemático, favorecendo a construção do número. As atividades do livro funcionam apenas como um recurso para o professor e não um instrumento indispensável.