Made available in DSpace on 2014-06-11T19:33:31Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-02-24Bitstream added on 2014-06-13T18:45:19Z : No. of bitstreams: 1 oliveira_ea_dr_jabo.pdf: 1159929 bytes, checksum: 57312724924758d48f60ea911e40e1de (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Objetivou-se com este estudo avaliar as características qualitativas da carne, a composição química e de ácidos graxos dos cortes do contrafilé (Longissimus thoracis) e a composição química e de ácidos graxos da picanha (Biceps femoris) de 35 tourinhos da raça Nelore abatidos com peso de 532,17 ± 30,2 kg e 24 meses de idade. Estes animais foram confinados por 96 dias e receberam dietas contendo cana-de-açúcar (var. IAC86-2480) e concentrado com diferentes fontes de óleos protegidos ou não da degradação ruminal; todas as dietas possuíam a relação volumoso:concentrado de 40:60 na matéria seca. Após o período de engorda os animais foram enviados a um frigorífico comercial, abatidos e depois do resfriamento das carcaças, foi retirada uma seção que compreendia da 9a à 13a costelas do músculo Longissimus thoracis e uma peça padronizada, de acordo com o estabelecimento, do músculo Biceps femoris e trazidas ao laboratório para posteriores análises. O delineamento utilizado foi em blocos casualizados com 5 tratamentos e 7 repetições, sendo as médias comparadas por contrastes ortogonais. As análises da qualidade da carne não mostraram diferenças significativas para força de cisalhamento, pH, cor da carne, da gordura e perdas no cozimento. A capacidade de retenção de água evidenciou diferenças, sendo que, o óleo de linhaça protegido foi o tratamento que apresentou os maiores valores em relação aos demais (73,67 vs. 70,89%, respectivamente). A avaliação sensorial feita por painel de degustação treinado, analisadas estatisticamente pelo teste não paramétrico de Kruskal-Wallis evidenciou diferenças para as variáveis: aparência, maciez e suculência sendo que as menores notas foram atribuídas à carne dos animais alimentados com o óleo de linhaça protegido e maiores notas foram obtidas para... / The objective of this study was assess the meat quality, chemical and fatty acids composition of the loin (Longissimus thoracis) and chemical and fatty acids composition of the rump (Biceps femoris) from 35 Nellore young bulls, slaughtered weighing 532.2 ± 30.2 kg and 24 months of age. These animals were confined for 96 days and were fed with diets containing sugar cane (var. IAC86- 2480) and concentrate with different sources of oil, protected or not from ruminal degradation, all diets possessed the roughage:concentrate ratio of 40:60 in dry matter. After the fedlot period the animals were sent to a commercial abattoir, stunned and slaughtered, and soon after the carcass cooling, a section which included the 9th to 13th rib from Longissimus thoracis muscle and a standardized cut of Biceps femoris were removed, according to the establishment. The design was randomized blocks with five treatments and seven replicates and the averages were compared by orthogonal contrasts. The analysis of meat quality showed no significant differences in shear force (SF), pH, meat and fat color and cooking losses. The water holding capacity (WHC) showed differences and the linseed protected oil treatment showed higher values compared to the others (73.67% vs. 70.89%, respectively). The sensory evaluation done by trained tasting panel, statistically analyzed by nonparametric Kruskal-Wallis test, showed differences for the variables: appearance, tenderness and juiciness and the lowest scores were assigned to the meat of animals fed with linseed protected oil. The highest score was obtained from animals fed with soybean oil. No differences were found for loin cholesterol, and the values of this variable was lower for meat from animals fed soybean oil compared to other oils. We observed lower values for soybean protected oil... (Complete abstract click electronic access below)

Submitted by Automação e Estatística (sst@bczm.ufrn.br) on 2018-07-03T11:30:10Z No. of bitstreams: 1 NataliaRochaSilva_DISSERT.pdf: 767991 bytes, checksum: 0bd1cbab454c6d9c2f4765971c6e1adb (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2018-07-09T14:37:00Z (GMT) No. of bitstreams: 1 NataliaRochaSilva_DISSERT.pdf: 767991 bytes, checksum: 0bd1cbab454c6d9c2f4765971c6e1adb (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-09T14:37:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 NataliaRochaSilva_DISSERT.pdf: 767991 bytes, checksum: 0bd1cbab454c6d9c2f4765971c6e1adb (MD5) Previous issue date: 2018-03-08 / As investigações científicas demonstram que os maiores problemas associados ao aumento da incidência dos problemas cardiovasculares em seres humanos estão associados ao estresse, a pressão arterial, ao sedentarismo e ao desequilíbrio que ocorre na composição dos ácidos graxos nas carnes que são consumidas, pois existem ácidos graxos insaturados que são benéficos a saúde humana, mas há outros que são maléficos, sendo necessário a procura pelo equilíbrio para obtenção de resultados promissores. Os lipídios são consumidos e absorvidos pelos animais monogástricos sem sofrer alterações, desta forma, a manipulação da composição dos óleos oferecidos nas dietas pode levar a modificação da composição dos tecidos. Neste contexto, objetivouse avaliar diferentes Blends de óleos vegetais em rações para suínos em terminação sobre os parâmetros sanguíneos, perfil de ácidos graxos e índices trombogênicos e aterogênicos. Foram utilizados 24 suínos machos castrados, com peso inicial de 72,0 ± 3,4 Kg/PV em delineamento de blocos casualizados, contendo 4 tratamentos e 6 repetições. Os tratamentos foram compostos por uma ração basal (RB) formulada com milho, farelo de soja, trigo, núcleo comercial e 2% de uma mistura (Blends) de óleos vegetais, sendo: T1 - RB + óleo de soja (100%); T2 - RB + 50% óleo de soja, 25% óleo de linhaça, 12,5% óleo de oliva e 12,5% óleo de canola (Blend 1); T3 - RB + 25% de óleo de soja, 50% de óleo de linhaça, 12,5% oliva e 12,5 % canola (Blend2); e T4 - RB + 25% de óleo de soja, 12,5% óleo de linhaça, 12,5% óleo de oliva e 50% óleo de canola (Blend3). Foram avaliados os parâmetros sanguíneos, o perfil de ácidos graxos e os índices de trombogenicidade e aterogenicidade nos cortes: lombo, toucinho, pernil, paleta, copa e barriga. A utilização do Blend 3 proporcionou melhores níveis de HDL e menores de LDL. Os Blends 2 e 3 proporcionaram menores teores de ácidos graxos saturados e maiores concentrações dos ácidos graxos insaturados, bem como menores índices de aterogenicidade e trombogenicidade. Recomenda-se a utilização do Blend 3 por promover aumento no HDL e redução no LDL, além de enriquecer a carne com ácidos graxos insaturados e promover menor risco ao surgimento de trombo e ateromas. / Scientific studies have shown that the major problems associated with the increased incidence of cardiovascular problems in humans are associated with stress, blood pressure, sedentary lifestyle and the imbalance that occurs in the composition of fatty acids in the meats that are consumed, since there are fatty acids unsaturates that are beneficial to human health, but there are others that are harmful, so the search for balance can bring promising results. Lipids are consumed and absorbed by the monogastric animals without modification, so manipulation of the composition of the oils offered in the diets can lead to the modification of the composition of the tissues. In this context, the objective was to evaluate different vegetable oil blends in feed for finishing pigs on blood parameters, fatty acid profile and thrombogenic and atherogenic indexes. Twenty - four castrated male pigs, with initial weight of 72.0 ± 3.4 kg / PV were used in a randomized block design, containing 4 treatments and 6 replicates. The treatments were composed by a basal diet (RB) formulated with corn, soybean meal, wheat, commercial nucleus and 2% of a blend of vegetable oils, being: T1 - RB + soybean oil (100%); T2 - RB + 50% soybean oil, 25% flaxseed oil, 12.5% olive oil and 12.5% canola oil (Blend 1); T3 - RB + 25% soybean oil, 50% linseed oil, 12.5% olive oil and 12.5% canola oil (Blend2); and T4 - RB + 25% soybean oil, 12.5% flaxseed oil, 12.5% olive oil and 50% canola oil (Blend3). Blood parameters, fatty acid profile and thrombogenicity and atherogenicity indexes were evaluated in the following sections: loin, backfat, shank, palette, crown and belly. The use of Blend 3 provided better levels of HDL and lower levels of LDL. Blends 2 and 3 provided lower levels of saturated fatty acids and higher concentrations of unsaturated fatty acids, as well as lower rates of atherogenicity and thrombogenicity. It is recommended to use Blend 3 for promoting increase in HDL and reduction in LDL, besides enriching the meat with unsaturated fatty acids and to promote lower risk to the appearance of thrombus and atheromas.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:15Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-07-30Bitstream added on 2014-06-13T20:16:18Z : No. of bitstreams: 1 araujo_ap_me_botfmvz.pdf: 420836 bytes, checksum: 8fa5df7898f8420a8565026491e76692 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / O objetivo do presente trabalho foi realizar um levantamento em quatro frigoríficos comerciais da Região Sul do Brasil, com a finalidade de fornecer um panorama das condições do manejo pré-abate visando o bem-estar animal. A avaliação das condições do manejo pré-abate foi realizada mediante um questionário fornecido aos motoristas responsáveis pelo transporte dos suínos até o frigorífico. Neste questionário foram obtidas informações referentes às condições do acesso à propriedade, do embarcadouro e das estradas, número de manejadores, número de suínos transportados e duração do embarque, do transporte, do desembarque e do jejum pré-abate. Diante desse levantamento verificou-se que 42,52% das estradas onde trafegam os caminhões que transportam os suínos apresentam bom estado de conservação, com cerca de 60% de acessos às propriedades em boas condições. No embarque, foram observados problemas nos modelos de embarcadouros utilizados e na forma de condução dos suínos e a execução desta atividade foi em média, 40 minutos. A distância das granjas até o frigorífico não ultrapassou 120 km e o tempo médio para chegar ao frigorífico foi de 2 horas. Com relação à prática de jejum, 62% dos suínos foram submetidos a adequados períodos de restrição alimentar. / The aim of this study was to carry out a survey in four commercial abattoirs from the south region of Brazil to obtain an overview of pre-slaughter management conditions for animal welfare. The evaluation was done by giving a questionnaire to the drivers responsible for transporting pigs to the abattoirs. The questionnaire included information on the conditions of property access, loading ramp and road, the number of handlers and transported pigs, and the duration of loading, transportation, delivery, and pre-slaughter fasting. The survey indicated that 42.52% roads where trucks transport pigs are wellpreserved and have around 60% well-conserved access to the farms. During loading, problems were detected in the used ramp models and in the pig transportation procedure, which took 40 minutes on average. The distance from pig farms to slaughterhouses was not greater than 120 km and the mean time to arrive at the abattoir was 2h. As regards fasting, 62% pigs were subjected to adequate food restriction periods.

Submitted by Claudia Rocha (claudia.rocha@udesc.br) on 2018-03-15T16:44:00Z No. of bitstreams: 1 PGCA17MA212.pdf: 755428 bytes, checksum: 72b64e835e22e9356f3dea7f2684090f (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-15T16:44:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGCA17MA212.pdf: 755428 bytes, checksum: 72b64e835e22e9356f3dea7f2684090f (MD5) Previous issue date: 2016-12-15 / Studies aiming at the characterization of the carcass and meat of cattle fed on grazing and feedlot systems used in the Santa Catarina State Region contribute to the characterization of the production and to the comparison of carcasses and meat from finished and grazing animals. The objective of this study was to evaluate the effect of bovine termination systems on pasture in comparison to feedlot, on animal performance and carcass and meat quality of castrated Angus males on Planalto Catarinense. The work was carried out in the period from 12/10/2015 to 04/26/2016. One group of animals was finished under confinement for a period of 82 days, and the other group was finished in summer pasture consisting of millet (Pennisetum glaucum) for a period of 138 days. Twenty male Aberdeen Angus bulls were weaned and castrated at approximately seven months of age, divided into two uniform batches, based on paternal origin and live weight (mean ± 331 kg), distributed in a completely randomized experimental design . The animals of the experiment were weighed on a digital scale every 28 days to control weight gain. For weighing the animals were kept in water fasting and solids for an average of 12 hours, and measurements were performed early in the morning. At the beginning of treatments and before slaughter, the thickness of the subcutaneous fat between the 12 th and 13 th ribs (EGS) and the subcutaneous fat thickness in the picanha (EGP) were measured by means of ultrasonography in live animals. The groups were slaughtered when they reached minimum weight of 420kg and minimum EGS of 3mm. The time required for the animals to reach the goal of live weight and EGS for slaughter was 56 days higher in the pasture termination system when compared to the feedlot termination system. The animals in feedlot obtained a mean of 4.4 mm of subcutaneous fat and 6.3 mm of fat in the rumpcap in 82 days of feedlot, while the animals in pasture required 138 days of pasture finishing to obtain 3 and 4,3 mm Of subcutaneous fat and on picanha, respectively. The warm carcass weight (PCQ) and hot carcass pH (pHCQ) were similar between pasture and feedlot treatments, with averages of 232 kg and 6.72, respectively. The subcutaneous fat thickness in the carcass (EGSC) (+ 0.71 mm) and the depth of the muscle (PM) longissimus dorsis, (+ 0.85 cm) were higher in the animals finishing in feedlot when compared to the animals finished in grass, But the length area of the muscle (CM) longissimus dorsis (+ 1.5 cm) was higher in the pasture-terminated animals when compared to the other group. In relation to the softness, the confined animals had inferior values in comparison to the animals finished to grass (4,5 and 6,3 kgF / cm² respectively). Both groups reached similar weights but in different periods. Greater attention should be given to animals finishing the pasture to obtain an adequate carcass finish. Termination with annual summer pasture allows final live weight and carcass yields similar to animals finished in feedlot / Trabalhos que visam a caracterização da carcaça e da carne de bovinos terminados em sistemas a pasto quanto em confinamento utilizados na Região Serrana Catarinense, contribuem para caracterização da produção e para a comparação das carcaças e carne de animais terminados a pasto e em confinamento. Objetivou-se avaliar o efeito de sistemas de terminação bovina a pasto em comparação ao confinamento, sobre o desempenho animal e a qualidade de carcaça e carne de machos castrados da raça Angus no Planalto Catarinense. O trabalho foi realizado no período de 10/12/2015 a 26/04/2016. Um grupo de animais foi terminado sob regime de confinamento por um período de 82 dias, e o outro grupo foi terminado em pastagem de verão constituída por milheto (Pennisetum glaucum) por um período de 138 dias. Foram utilizados 20 bovinos, machos, da raça Aberdeen Angus, desmamados e castrados com aproximadamente sete meses de idade, divididos em dois lotes uniformes, em função da origem paterna e do peso vivo (média ± 331 kg), distribuídos num delineamento experimental inteiramente casualizado. Os animais do experimento foram pesados em balança digital a cada 28 dias para controle do ganho de peso. Para as pesagens os animais eram mantidos em jejum hídrico e de sólidos por, em média, 12 horas, e as medidas eram realizadas no início da manhã. No início dos tratamentos e antes do abate, foram medidas a espessura de gordura subcutânea entre a 12ª e 13ª costela de (EGS) e a espessura de gordura subcutânea na picanha (EGP) realizadas por meio de ultrassonografia, nos animais vivos. Os grupos foram abatidos quando atingiram peso mínimo de 420kg e EGS mínima de 3mm. O período necessário para os animais atingirem a meta de peso vivo e EGS para o abate foi 56 dias superior no sistema de terminação a pasto quando comparado ao sistema de terminação em confinamento. Os animais em confinamento obtiveram em média 4,4 mm de gordura subcutânea e 6,3 mm de gordura na picanha em 82 dias de confinamento, enquanto os animais em pasto precisaram de 138 dias de terminação a pasto para obterem 3 e 4,3 mm de gordura subcutânea e na picanha, respectivamente. O peso de carcaça quente (PCQ) e o pH da carcaça quente (pHCQ) foram similares entre os tratamentos a pasto e confinamento, com médias de 232 kg e 6,72, respectivamente. A espessura de gordura subcutânea na carcaça (EGSC) (+ 0,71 mm) e a profundidade do músculo (PM) longissimus dorsis, (+ 0,85 cm) foram superiores nos animais terminados em confinamento quando comparados aos animais terminados em pasto, mas o comprimento área do músculo (CM) longissimus dorsis (+ 1,5 cm) foi superior nos animais terminados a pasto quando comparados ao outro grupo. Em relação à maciez, os animais confinados apresentaram valores inferiores em comparação aos animais terminados a pasto (4,5 e 6,3 kgF/cm² respectivamente). Ambos os grupos atingiram pesos semelhantes mas em diferentes períodos. Maior atenção deve ser dada a animais terminados a pasto para que obtenham adequado acabamento de carcaça. A terminação com pastagem anual de verão permite peso vivo final e rendimentos de carcaça semelhantes aos animais terminados em confinamento

Submitted by uly.carneiro@hotmail.com (uly.carneiro@hotmail.com) on 2016-09-01T17:39:41Z No. of bitstreams: 1 Dissertação completa Uly.pdf: 1094703 bytes, checksum: 9819132b5cb7e4c7ce37c5b263f2c03d (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Paula Grisoto (grisotoana@reitoria.unesp.br) on 2016-09-02T19:23:18Z (GMT) No. of bitstreams: 1 bragiato_uc_me_jabo.pdf: 1094703 bytes, checksum: 9819132b5cb7e4c7ce37c5b263f2c03d (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-02T19:23:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 bragiato_uc_me_jabo.pdf: 1094703 bytes, checksum: 9819132b5cb7e4c7ce37c5b263f2c03d (MD5) Previous issue date: 2016-07-05 / Objetivou-se avaliar o consumo, desempenho e as características físico-químicas e nutricionais do músculo Longissimus lumborum de cordeiros alimentados com silagem tratada com inoculante bacteriano associada a duas relações volumoso:concentrado. Foram utilizados 40 cordeiros machos mestiços (Texel x Dorper) não castrados, em sistema de confinamento. O experimento foi conduzido em blocos ao acaso em esquema fatorial 2 (silagem de milho inoculada ou não com Lactobacillus plantarum e Bacillus subtilis) x 2 (duas relações volumoso:concentrado: 60:40 e 40:60), com 10 repetições. Os animais foram alocados em baias individuais e permaneceram em adaptação por 15 dias. O consumo de FDN foi superior nos animais que receberam maior proporção de volumoso na dieta (60% de silagem). O ganho de peso diário (GDP) foi maior nos animais tratados com silagem inoculada (controle = 218g/dia; Inoculada = 234g / dia), e relação volumoso:concentrado 60:40 (40: 60 = 212g/dia; 60:40 = 233g/dia). A menor proporção de silagem (40%) na dieta implicou em maior (P<0,05) de rendimento de carcaça quente. Os animais que receberam maior proporção de silagem (60%) na dieta apresentaram teores de colesterol mais elevados (40% silagem= 107mg; 60% de silagem= 116mg). Com relação aos ácidos graxos, os animais que receberam silagem inoculada apresentaram maior concentração de ácidos graxos saturados (controle= 45,51; inoculada= 47,68), e os que receberam silagem sem tratamento apresentaram maior concentração de ácidos graxos insaturados (controle= 54,49; inoculada= 52,32) e monoinsaturados (controle= 46,89; inoculada= 45,16). A Atividade das enzimas elongase foi superior (P<0,05) nos animais que receberam silagem controle (60%), sendo os valores de Δ9dessaturase18 e o índice de aterogenicidade, superiores (P<0,05) nos tratamentos com silagem inoculada na relação 40:60 de volumoso:concentrado. A inoculação da silagem promoveu maior desempenho, porém elevou a proporção de ácidos graxos saturados na carne de cordeiros. / This study evaluated the intake, performance, physico-chemical and nutrional properties of the longissimus lumborum of lambs fed with silage. The silage was treated with inoculant bacteria associated with two forage-toconcentrate ratio. The investigation used forty crossbred male lambs (Texel x Dorper). The lambs were not neutered and were raised in a containment system. The experiment was randomly conducted in blocks in factorial system 2 (silage treated or not treated with Lactobacillus plantarum corn and Bacillus subtilis) x 2 (two ratio forrage-to-concentrate ratio: 60:40 and 40:60) and repeated ten times. The animals were placed in individual pens, where they remained in adaptation for fifteen days. The study found that the comsumption of FDN was higher in animals that had received a greater proportion of silage in their diet (60% silage). The average daily weight gain (ADG) was higher in animals fed with treated silage (control = 218g / day; treated = 234g / day) and with forage-to-concentrate ratio 60:40 (40: 60 = 212g / day; 60:40 = 233g / day). The lowest rate of silage (40%) in the animals’ diet caused a higher hot carcass weight (P <0.05). The animals that received a higher rate of silage diet (60%) presented higher cholesterol levels (40% silage = 107mg, 60% silage = 116mg). Regarding fatty acids, animals that were fed wth treated silage presented a higher concentration of saturated fatty acids (control = 45.51; inoculated = 47.68). Those that did not receive treated silage showed a higher concentration of unsaturated (control = 54.49; treated = 52.32) and monounsaturated (control = 46.89; treated = 45.16) fatty acids. The activity of the elongase enzyme was greater (P <0.05) in animals that received control silage (60%) causing the Δ9 dessaturase18 values and atherogenicity index to be higher (P <0.05) in control silage treated at 40:60 forage-to-concentrate ratio. In conclusion, the use of lactobacillus plantarum and bacillus subtilis in silage caused higher performance but increased the proportion of saturated fatty acids in lamb meat.

Submitted by MARIANA PIATTO BERTON null (mapberton@gmail.com) on 2017-08-30T18:09:32Z No. of bitstreams: 1 merged (1).pdf: 1918881 bytes, checksum: 61d779cd34fb3b01057ec32e78aa948d (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-08-30T18:32:14Z (GMT) No. of bitstreams: 1 berton_mp_dr_jabo.pdf: 1918881 bytes, checksum: 61d779cd34fb3b01057ec32e78aa948d (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-30T18:32:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 berton_mp_dr_jabo.pdf: 1918881 bytes, checksum: 61d779cd34fb3b01057ec32e78aa948d (MD5) Previous issue date: 2017-08-02 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Este estudo propôs avaliar uma outra forma de detecção de variações estruturais no genoma bovino, as variações no número de cópias CNVs, e sua associação com características de qualidade de carne. O capitulo 1 aborda considerações gerais e revisão de literatura das características de qualidade da carne e de sua inclusão em estudos genômicos, bem como a utilização das variações do número de cópias em estudos de associação com características de interesse econômico para a agropecuária brasileira. O capítulo 2 teve como objetivo explorar diferentes softwares para avaliar diferenças na detecção de CNVs em uma população de bovinos da raça Nelore. A diferença metodológica entre os softwares pode ser a causa da diferença de CNVR detectados em ambos os métodos. Os grupos funcionais enriquecidos significativos foram relacionados a funções de ligações de ATP, bem como estruturas das membranas celulares e resposta do sistema imunológico. A presença de genes do tipo LOC também é bastante interessante, pois estes são genes os quais ainda não foram confirmadas sua função biológica, necessitando de mais estudos para a determinação da mesma. O estudo de diferentes algoritmos na detecção de CNVRs pode divergir dependendo das plataformas e metodologias aplicadas em cada software, como foi observado no presente estudo. A sobreposição dos mesmos nos fornece maior confiabilidade na detecção de regiões de CNVs. O capítulo 3 propôs identificar regiões no genoma de bovinos da raça Nelore que apresentam variações no número de cópias (CNV: Copy Number Variation) e estudar a associação genética entre os CNVs com características quantitativas e qualitativas da carne. O enriquecimento de genes das regiões de CNV revelaram processos biológicos que podem estar envolvidos na qualidade de carne. Várias regiões genômicas foram associadas à QTL relacionadas à deposição de gordura (FABP7) e contração muscular (SLC34A3, TRDN), matriz extracelulares (INS e COL10A1), bem como genes transportadores de creatina (SLC6A18 e SLC6A19) foram identificadas, além das respectivas vias metabólicas. Estas devem contribuir para consolidar características que quando agregadas às informações genômicas, poderão auxiliar a seleção de Nelore (Bos indicus) em relação à qualidade da carne. Além disso, as CNVRs podem ser usadas como ferramenta auxiliar em futuros estudos de GWAS, cuja principal função é procurar mutações causadoras informativas, que vão auxiliar o melhor entendimento dos mecanismos de ação e a fisiologia de características importantes. A sobreposição de CNVs com SNPs aumenta as chances de encontrar regiões mais confiáveis para a detecção de QTLs relacionados com características de interesse. Uma vez detectadas as CNVRs podem ser inseridos em chips personalizados de baixa densidade permitem avaliação genética rentável e acessível para os criadores. / The aim of this study was to evaluate another way to detect structural variations in bovine genome, the variations in CNVs number of copies and its association with meat quality traits. Chapter 1 addresses general considerations and literature review of meat quality traits and their inclusion in genomic studies, as well as the use of variations in the number of copies in association studies with characteristics of economic interest for Brazilian agribusiness. Chapter 2 aimed to explore different softwares to evaluate differences in the detection of CNVs in a population of Nellore cattle. The difference in methodologies between the softwares can be the cause of the difference in CNVR detected in both methods. Significant enriched functional groups were related to ATP binding functions, as well as cell membrane structures and immune system response. The presence of genes of the LOC type is also very interesting, since the biological function of these genes have not been confirmed yet, requiring further studies to determine the same. The study of different algorithms in CNVRs detection can differ depending on the applied platforms and methodologies in each software, as it was observed in this study. The overlaps can provide more reliability in the detection of CNVs regions. Chapter 3 proposed to identify genome regions of Nellore cattle that presented variations in the number of copies (CNV: copy number variation) and to study the genetic association of CNVs with quantitative and qualitative traits in meat. The enrichment of CNV regions genes revealed biological processes which can be involved in meat quality. Several genomic regions were associated with QTL related to fat deposition (FABP7) and muscle contraction (SLC34A3, TRDN), extracellular matrix (INS and COL10A1), as well as creatine transporter genes (SLC6A18 and SLC6A19) were identified, in addition to their respective metabolic pathways. These regions should contribute to consolidate characteristics that when added to genomic information may help the selection of Nellore animals (Bos indicus) for meat quality. Furthermore, CNVRs can be used as an auxiliary tool in further GWAS studies, which will help to better understand the mechanisms of action and the physiology of important traits. The overlap of CNVs with SNPs increases the chances of finding more reliable regions to the detection of QTLs related to traits of interest. Once detected, the CNVRs can be inserted in low-density customized chips allowing cost-effect and affordable genetic evaluation for farmers.

Orientador: Rosemeire da Silva Filardi / Resumo: O estudo foi realizado em um frigorífico de suínos localizado no interior do estado de São Paulo. O objetivo foi avaliar a interferência da distância do transporte e do manejo pré-abate no frigorífico sobre as injúrias na carcaça e qualidade da carne suína. No primeiro experimento foram observadas as incidências de injúrias corporais (marcas de mordidas, feridas e hematomas) e escore de lesão na carcaça de 3.900 suínos provenientes de granjas comercias localizadas à distância de 150, 600 e 950 km do frigorífico de abate, perfazendo portanto 2, 8 e 14 horas de transporte. Para cada tempo de transporte foram considerados cinco lotes de cerca de 260 animais cada. O fato do tempo de transporte variar entre 2, 8 ou 14 horas de duração pouco interferiu na incidência de injúrias corporais ou lesões na carcaça dos suínos. O tempo de transporte só influenciou na ocorrência de feridas na região do dorso dos animais, com o maior percentual (P<0,05) desta injúria ocorrendo no transporte por 8 horas. Independentemente do tempo de transporte, os animais apresentaram diferentes injúrias distribuídas por todo o corpo e carcaças predominantemente com poucas lesões e com lesões leves, entretanto há indícios de que o maior tempo de transporte possa estar relacionado ao maior percentual de carcaças com lesões severas. No segundo experimento foram utilizados 960 animais provenientes de duas granjas comerciais, distribuídos em um delineamento inteiramente casualizado em esquema fatorial 2 x 3, dua... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The study was conducted in a pig slaughterhouse located in the state of São Paulo. The aim was to evaluate the effect of distance transport and slaughterhouse's preslaughter management on injuries in the carcass and pork quality. In the first experiment were observed the incidences of bodily injuries (bite marks, wounds and bruises) and lesion score in the carcass of 3,900 pigs from commercial farms located at a distance of 150, 600 and 950 km of the slaughterhouse, representing 2, 8 and 14 hours of transportation. For each transport time it was considered five lots of approximately 260 animals each. The fact that the transport time range from 2, 8 or 14 hours little interfered in the incidence of bodily injuries or injuries in swine carcass. The transport time only influenced the occurrence of wounds on the animals back region, with the highest percentage (P<0.05) of this injury occurring in the 8 hours transport. Regardless of the time of transport, the animals showed different injuries distributed throughout the body and carcasses, predominantly few injuries and minor injuries, however there was evidence that the higher transport time can be related to the higher percentage of carcasses with severe injuries. In the second experiment were used 960 animals from two commercial farms, distributed in a completely randomized design in a factorial 2 x 3, two distances (185 and 958 km) and three leading forms in the slaughterhouse (management with electric baton, management with r... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Resumo: O objetivo do presente trabalho foi realizar um levantamento em quatro frigoríficos comerciais da Região Sul do Brasil, com a finalidade de fornecer um panorama das condições do manejo pré-abate visando o bem-estar animal. A avaliação das condições do manejo pré-abate foi realizada mediante um questionário fornecido aos motoristas responsáveis pelo transporte dos suínos até o frigorífico. Neste questionário foram obtidas informações referentes às condições do acesso à propriedade, do embarcadouro e das estradas, número de manejadores, número de suínos transportados e duração do embarque, do transporte, do desembarque e do jejum pré-abate. Diante desse levantamento verificou-se que 42,52% das estradas onde trafegam os caminhões que transportam os suínos apresentam bom estado de conservação, com cerca de 60% de acessos às propriedades em boas condições. No embarque, foram observados problemas nos modelos de embarcadouros utilizados e na forma de condução dos suínos e a execução desta atividade foi em média, 40 minutos. A distância das granjas até o frigorífico não ultrapassou 120 km e o tempo médio para chegar ao frigorífico foi de 2 horas. Com relação à prática de jejum, 62% dos suínos foram submetidos a adequados períodos de restrição alimentar. / Abstract: The aim of this study was to carry out a survey in four commercial abattoirs from the south region of Brazil to obtain an overview of pre-slaughter management conditions for animal welfare. The evaluation was done by giving a questionnaire to the drivers responsible for transporting pigs to the abattoirs. The questionnaire included information on the conditions of property access, loading ramp and road, the number of handlers and transported pigs, and the duration of loading, transportation, delivery, and pre-slaughter fasting. The survey indicated that 42.52% roads where trucks transport pigs are wellpreserved and have around 60% well-conserved access to the farms. During loading, problems were detected in the used ramp models and in the pig transportation procedure, which took 40 minutes on average. The distance from pig farms to slaughterhouses was not greater than 120 km and the mean time to arrive at the abattoir was 2h. As regards fasting, 62% pigs were subjected to adequate food restriction periods. / Orientador: Roberto de Oliveira Roça / Coorientador: Osmar Antonio Dalla Costa / Banca: Germano Francisco Biondi / Banca: Jacinta Diva Ferrugem Gomes / Mestre

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2016-06-23T21:59:34Z No. of bitstreams: 1 ApaulianaDanielaLimaDaSilva_DISSERT.pdf: 1651970 bytes, checksum: 4f932d7448918fbb58c861b68118bb5d (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2016-06-28T22:16:00Z (GMT) No. of bitstreams: 1 ApaulianaDanielaLimaDaSilva_DISSERT.pdf: 1651970 bytes, checksum: 4f932d7448918fbb58c861b68118bb5d (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-28T22:16:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ApaulianaDanielaLimaDaSilva_DISSERT.pdf: 1651970 bytes, checksum: 4f932d7448918fbb58c861b68118bb5d (MD5) Previous issue date: 2015-03-26 / Objetivou-se com este estudo avaliar os efeitos do farelo do baga?o de caju (FBC) como ingrediente de ra??es em programas de restri??o alimentar sobre as caracter?sticas da carca?a, qualidade da carne, peso dos ?rg?os e morfometria intestinal de su?nos machos castrados e f?meas. Foram utilizados vinte e quatro su?nos mesti?os (machos castrados e f?meas) com peso m?dio inicial de 57,93 ? 3,67 kg/PV. O delineamento experimental foi o de blocos casualizados em um esquema fatorial 3x2, sendo tr?s n?veis (0%, 15% e 30% de FBC), dois sexos e quatro repeti??es. Totalizando 24 parcelas. Os tratamentos foram compostos por uma dieta basal (DB), contendo milho, farelo de soja e n?cleo comercial para su?nos em termina??o, sendo suplementada com diferentes n?veis de FBC. No final do per?odo experimental os animais foram abatidos para a avalia??o da carca?a, qualidade da carne, Peso Absoluto (PA) e Peso Relativo (PR) dos ?rg?os e estudo morfom?trico de fragmento do intestino delgado. A inclus?o de FBC nas dietas n?o afetou a qualidade das carca?as das f?meas, mas interferiu positivamente nas carca?as dos machos castrados, aumentando o rendimento de carne na carca?a resfriada e reduzindo a espessura de toucinho, sem afetar o perfil dos ?cidos graxos. Observou-se aumento do peso dos ?rg?os e volume parcial da mucosa absortiva (Vv) das f?meas. Quando se comparou os resultados entre sexo, os machos apresentaram maior peso do f?gado e densidade de superf?cie da mucosa absortiva (Sv). Neste contexto, o FBC apresentou-se como um ingrediente a ser utilizado em programas de restri??o alimentar qualitativa para su?nos na fase de termina??o. / The objective of this study was to evaluate the effects of the use of cashew bagasse bran (CBB) as food ingredient in qualitative feed restriction programs on the carcass traits, meat quality, organs weight and intestinal morphometry of barrows and gilts. Twenty ? four crossbred pigs were used (12 barrows and 12 gilts) with an average initial body weight of 57.93 ? 3.67 kg/LW. The experimental designs was in randomized blocks 3x2 factorial arrangement with three level (0%, 15% e 30% CBB), two genders (barrows and gilts) and four repetition. A total of twenty-four instalments. The treatments were composed of basal diet (BD) formulated with corn, soybean meal and commercial base mix for finishing pigs, being containing different levels of CBB. At the end of the trial period the animals were slaughtered for the evaluation of the meat quality, traits carcass, Absolute Weight (AW) and Relative Weight (RW) of the organs and morphometric study of small intestine fragment. The inclusion of (CBB) in the diets did not affect the traits carcass of gilts, but interfered in the traits carcass of the barrow positively, increasing the yield of meat into cold carcass and reducing the thickness of subcutaneous fat, without affecting the fatty acid profile. However, we observed increased weight of organs and partial volume of absortiva mucosa of gilts. In the comparison between sex was observed a greater liver weight (AW) and (RW), and surface density of absortiva mucosa of barrow. The use of CBB was considered as ingredient to be used in programs of qualitative feed restriction for finishing pigs.

Objetivou-se por meio deste trabalho caracterizar a influência do sistema de criação convencional de frangos de corte nas perdas produtivas desde a criação até a obtenção do produto final. Foram acompanhados 4 ciclos de produção até o produto final. A caracterização climática (temperatura, umidade relativa e entalpia específica do ar) ocorreu nas etapas de criação, transporte e espera das aves. A qualidade de cama do aviário (porcentagem de umidade) foi avaliada no início e final do ciclo de criação. No dia da apanha e carregamento das aves, uma amostragem de 80 aves foi selecionada aleatoriamente e identificada por anilhas para análise de lesão I (limpeza de plumagem). Durante o transporte ocorreu a caracterização da viagem (duração, distância percorrida e infraestrutura da rodovia), condições climáticas ambientais e mensuração dos níveis de vibração do caminhão. No frigorífico, a espera das aves foi caracterizada pela duração, tipologia do galpão e condições climáticas do ambiente. Na descarga, ocorreu a análise de lesões II (pododermatite, lesão de joelho, arranhão antigo e recente, fratura de asa e perna antiga e recente) e quantificação da mortalidade das aves. E selecionadas aleatoriamente 10 aves por linhagem (HUBB, ROSS/COBB e COBB), totalizando 30 aves. Após 24 horas do abate, os peitos de frango foram analisados com relação a cor (L*- luminância, a*- vermelho e b*- amarelo), pH, perda de peso por gotejamento e cocção, e força de cisalhamento. Realizou-se uma classificação em carne DFD-like (escura, dura e seca), normal e PSE-like (pálida, mole e exsudativa). Verificou-se uma heterogeneidade estrutural nos galpões, nas variáveis bioclimáticas e no conforto térmico das aves, proporcionando condições de estresse térmico pelo frio nas primeiras semanas de vida e pelo calor na fase adulta. A mortalidade de chegada ao frigorífico (DOA) mostrou-se relacionada com maior mortalidade durante a criação (DOF) e características do transporte (maior duração e distância de viagem). A alta umidade de cama mostrou uma relação com maior sujidade de plumagem e dermatites de contato. A lesão de joelho, pododermatite e arranhão da criação foram influenciados pela densidade de alojamento na criação. O arranhão gerado durante o período pré-abate foi relacionado com maior tempo de espera e estresse térmico. A fase de criação foi responsável pelos maiores níveis de ocorrência e severidade de lesões. A incidência de carne PSE-like foi 15% e possuiu relação com desconforto térmico das aves durante o transporte (altos valores de entalpia específica do ar e duração). Assim o sistema de criação convencional de frangos de corte influenciou nas perdas produtivas desde a criação até a obtenção do produto final. / The aim of this study was to characterize the influence of the conventional broiler rearing system on the productive losses from the rearing to the final product. Four production cycles were studying until the final product. Climatic characterization (air temperature, relative humidity, and specific enthalpy of air) occurred during the rearing, transport, and lairage. The litter quality of the aviary (percentage of moisture) was performed at the beginning and end of the rearing cycle. On the day of catching and loading of the birds, a sample of 80 birds was randomly selected and identified for analysis of lesion I (Plumage cleanliness). During transportation, the characterization of the travel (duration, distance traveled and highway infrastructure), environmental climatic conditions and measurement of vibration levels of the truck occurred. At the slaughterhouse, lairage was characterized by the length, typology of the barn and climatic conditions of the environment. In the discharge, the analysis of lesions II (pododermatitis, hock burn, old and recent scratch, old and recent wing and leg fracture) and quantification of the mortality of the birds occurred. And 10 bird of each breed (HUBB, ROSS/COBB e COBB) were randomly selected (totaling 30 birds). After 24 hours of slaughter, the chicken breasts were analyzed for color (L*- luminance, a*- red and b*- yellow), pH, drip loss, cooking loss and shear force. And classified in DFD-like (dark, firm, and dry), normal and PSE-like (pale, soft, and exudative) meat. There was a structural heterogeneity in the barns, in the bioclimatic variables and in the thermal comfort of the birds, providing conditions of thermal stress by the cold in the first weeks of life and by the heat in the adult phase. The dead on arrival (DOA) was related to higher dead on the farm (DOF) and transport characteristics (longer duration and distance of travel). The high litter moisture showed a relation with greater dirt plumage and dermatitis. The hock burn, pododermatitis, and scratch of the rearing were influenced by the stocking density in the rearing. The scratching generated during the pre-slaughter period was related to longer lairage time and thermal stress. The rearing phase was responsible for the higher levels of occurrence and severity of lesions. The incidence of PSE-like meat was 15% and had relation with the thermal discomfort of the birds during transport (high values of specific enthalpy of air and duration). Thus, the conventional broiler rearing system influenced the productivity losses from the rearing until the final product was obtained.