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Estrutura de solos altamente intemperizados cultivados sob sistema de plantio direto / Structure of highly weathered soils cultivated under no-tillage systemMárcio Renato Nunes 09 March 2018 (has links)
O desenvolvimento econômico brasileiro depende da crescente produção agropecuária, aliada ao conservacionismo. O sistema de plantio direto é o manejo de solo que reúne o mais amplo conjunto de preceitos da agricultura conservacionista. As áreas agrícolas cultivadas sob plantio direto, entretanto, têm apresentado duas camadas de solo distintas: uma entre, aproximadamente, 0 e 7 cm de profundidade, com condições físicas e químicas favoráveis ao desenvolvimento radicular; e uma entre, aproximadamente, 7 e 20 cm de profundidade, com menor permeabilidade do solo ao ar e a água, elevada resistência à penetração e baixa fertilidade química do solo. Estas condições promovem a concentração do sistema radicular das plantas agrícolas cultivadas na camada mais superficial do solo (0 a 7 cm), motivando perdas de produtividade por estresse hídrico. A magnitude desse problema se estende a mais de 30 milhões de hectares de lavoura cultivada sob plantio direto no Brasil, colocando em risco as projeções de exuberância da agricultura no país. Assim, o desenvolvimento desta tese teve o objetivo de estudar fatores que, além do processo de compactação mecânica do solo, possam estar promovendo a estratificação física e química de solos altamente intemperizados cultivados sob sistema de plantio direto. Dentre os possíveis fatores causadores deste tipo de degradação, foram avaliados: i) a aplicação excessiva de calcário, exclusivamente em superfície, ocasionando, na camada de 0 a 7 cm, a elevação do pH do solo para além do ponto de carga zero do solo, elevando o potencial eletronegativo do solo e por consequência, promovendo a dispersão de argila; ii) a migração da argila dispersa no perfil do solo, pela água de percolação, como um fator promotor de degradação física em subsuperfície; iii) o aporte de fitomassa ao solo em quantidade e qualidade para manter a estabilidade estrutural dos solos cultivados. Os resultados obtidos mostraram que o movimento de calcário no perfil dos solos estudados é muito lento, limitando o efeito deste produto a poucos centímetros abaixo do local onde ele é depositado ou incorporado (2,5 cm em 130 semanas), independentemente da dose aplicada (até 33,2 Mg ha-1). Assim, a calagem superficial promove e intensifica a estratificação dos atributos químicos no perfil do solo, aumentando, demasiadamente, o pH próximo à superfície e sendo ineficiente em mitigar a acidez na subsuperficie destes solos. A concentração de calcário na camada mais superficial dos solos altamente intemperizados aumenta a eletronegatividade do solo, resultando na dispersão de argila. A migração dos argilominerais dispersos no perfil do solo, pela água de percolação, promove uma série de alterações estruturais, incluindo a diminuição da porosidade total e da continuidade dos poros e o aumento da densidade e da resistência do solo à penetração na camada subsuperficial. A diminuição da estabilidade estrutural dos Latossolos sob cultivo também está ligada ao aporte de material orgânico ao solo em quantidade e qualidade inferiores à que ocorre no solo sob sistema nativo. Os Latossolos cauliníticos são mais propensos a diminuição da estabilidade estrutural quando submetidos ao cultivo. Portanto, a recomendação de calagem em solos altamente intemperizados cultivados sob plantio direto, precisa considerar a mineralogia do solo e a possível degradação estrutural promovida pela calagem em excesso. / The economic development of Brazil depends upon the increasing agricultural production associated with conservation practices. The no-tillage system is the soil management practice that brings together the broadest set of principles for conservation agriculture. Areas under no-till system, however, generally have two completely different soils layers: a surface layer, around 0 to 7 cm, with physical and chemical conditions favorable for root development; and a sub-surface layer, around 7 to 20 cm, with lower permeability to air and water, high soil penetration resistance, and low soil fertility. The existence of these stratified layers dramatically restricts the development of the root system into the sub-surface soil layer, which may result in reducing plant productivity by water deficit. This problem exists on more than 30 million hectares cultivated under no-tillage system in Brazil, and can compromise the optimistic projections of agricultural growth in the country. Therefore, more research is necessary to explore challenges that come with no-tillage. The aim of this thesis was to study the factors that can promote the physical and chemical stratification of highly weathered soils cultivated under no-till system. Among the factors that could cause this degradation, the following were studied: i) the application of excessive lime only on surface soil, or into the uppermost soil layer, which can increase its pH to levels beyond of the zero point of charge of soil, raising its electronegative potential and promoting, as a consequence, the clay dispersion; ii) the dispersed clay migration thtough the soil profile, by the percolation water, as a factor of physical degradation of sub-surface of soil cultiveted under no-tillage; and iii) the aplication of phytomass to the soil in insufficient amount and quality to maintain the soil structural stability of the soil. The results of this study showed that lime movement into the deeper soil profile, is very slow, as its impacts are limited to just a few centimeters below of where it is applied or incorporated (2.5 cm after 130 weeks), independent of the applied amount of lime. Thus, the surface lime application intensifies the chemical stratification of the clayey soils under no-tillage, increasing to much the soil pH of the uppermost soil layer, and being inefficient to decrease the soil acidity in the subsurface soil layer. The concentration of lime into the uppermost soil layer can significantly increase the electronegativity of the soil system and result in clay dispersion in the topsoil layer (0 to 5 cm). The resulting clay migration into the soil profile led to a series of structural alterations in subsurface layers, including: decrease of both soil porosity and pore continuity; and increase of both soil bulk density and soil penetration resistance in the sub-superficial layer. The structural stability decreasing of Oxisols under no-till system also is linked with the low addition of organic matter to the cultivated soil, in relation to the non-cultivated soils. The kaolinitic Oxisols are more susceptible to degradation than the gibbsitic Oxisols. Thus, it could be conclude that liming practices (rate and application methods of lime), mainly under no-till systems, need to consider both type and mineralogy of soil, as well as considering soil structure degradation promoted by over-liming in the uppermost soil layer.
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ESTUDO DO COMPORTAMENTO DE RESINAS BULK FILL EM RESTAURAÇÕES CLASSE I POR MEIO DE MICROTOMOGRAFIA COMPUTADORIZADA E MICROTRAÇÃO / STUDY OF BULK FILL RESIN BEHAVIOR IN CLASS I RESTRICTIONS BY COMPUTERIZED MICROTOMOGRAPHY AND MICROTRATIONALMEIDA JUNIOR, Lauber Jose dos Santos 12 June 2017 (has links)
Submitted by Daniella Santos (daniella.santos@ufma.br) on 2017-06-20T14:13:09Z
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Previous issue date: 2017-06-12 / FAPEMA / The polymerization shrinkage (PS) and the detrimental effects have been the focus of studies with the aim of improving the performance of composite resins. The simplicity of technique due to the possibility of single fill in large quantities have allowed bulk fill composite resins (BFC) to be indicated to minimize this shrinkage. This thesis, divided in two chapters, aimed to evaluate the behavior of bulk fill composite resins in class I restorations by mans computerized microtomography (μCT) and microtensile bond strength (μTBS). Chapter I evaluated the PS and μTBS in BFC and conventional class I restorations composite resins, and the correlation between these factors. Class I cavities (4 x 5 x 4 mm), (factor-C = 4.2), were created in human third molars that were free of caries, which were randomized and divided into 4 groups (n = 6): Z350 XT(+): incremental insertion (II) and manual fill (MF); Z350 XT(-): single insertion (SI) and MF; TBF (Tetric N-Ceram Bulk Fill: SI and MF); and SFU [SonicFill: SI and ultrasonic fill (UF) ]. The teeth were scanned and analyzed in μCT at two times: T0- after the filling of the cavity with composite resins and T1- after the polymerization for PS. After 1 week, the teeth were sectioned crosswise in the buccolingual and mesiodistal directions to obtain specimens with approximately 1 mm² thickness and fixed to universal test machine device to perform μTBS. The data showed a statistically significant difference for PS between the groups Z350 XT(+) e Z350 XT(-), and between SF e Z350 XT(-) (Kruskal-Wallis and Dunn, p<0.05). he μTBS was higher for Z350 XT (+) than the other groups (p <0.05) and there was no correlation between PS and μTBS (p> 0.05). It was concluded that the BFC type present a PS similar to that of the conventional nanoparticulate composite resin inserted using the incremental technique. The bond strength was higher for the composite resin incrementally inserted, which presented a lower number of pre-test failures when compared to bulk fill composites. No correlation was observed between the PS and bond strength when bulk fill and conventional composites were used. Chapter II evaluated the volume of polymerization shrinkage (VS), gap (VG) and void (VV) using μCT in BFC and conventional class I restorations, and their correlations. Class I cavities (4 x 5 x 4 mm), factor-C = 4.2, were created in human third molars that were free of caries, which were randomized and divided into 5 groups (n = 6): Z350 XT(+) (II/MF); Z350 XT(-) (SI/MF); TBF (SI/MF); SFM [ (SonicFill: SI and MF) ] and SFU (SI/UF). The teeth were scanned and analyzed in μCT at two times: T0- after the filling of the cavity with composite resins and T1- after the polymerization for VG and VV, and for VS (T1-T0). After 1 week, the teeth were sectioned crosswise in the buccolingual and mesiodistal directions to obtain specimens with approximately 1 mm² thickness and fixed in a universal testing machine to perform μTBS. Kruskal-Wallis and Dunn tests showed statistically significant difference in VS for groups Z350 XT(+) and Z350 XT (-), and between SFU and Z350 XT(-), and difference between VV for Z350 XT(+) and BFC (p <0.05). There was no difference in VG between the conventional and BFC (p>0.05). There is a positive correlation between VS versus VG and between VS versus VV (Spearman, p <0.05). It was concluded that BFCs of both sonic and manual insertion showed polymerization shrinkage and gap formation similar to the incrementally inserted nanoparticulate conventional resin. There is a positive correlation between polymerization shrinkage and final gap formation, as well as between polymerization shrinkage and void in composite resins. The final gap was formed mainly by the initial gap generated during the insertion/filling of the composite in the cavity and not to the polymerization shrinkage. / A contração de polimerização (CP) e seus efeitos prejudiciais vêm sendo o foco de estudos com o intuito de melhorar o desempenho das resinas compostas. A simplicidade da técnica devido a possibilidade de preenchimento único em grande quantidade tem permitido que resinas bulk fill (RBF) sejam indicadas para minimizar essa contração. Esta tese, dividida em dois capítulos, teve por objetivo avaliar o comportamento de resinas bulk fill em restaurações classe I por meio de microtomografia computadorizada (μCT) e resistência de união por microtração (μTBS). O capítulo I avaliou a CP por μCT e a μTBS em restaurações classe I de RBF e convencional, e a correlação entre esses fatores. Cavidades classe I (4x5x4 mm), (fator-C=4,2) foram realizadas em terceiros molares livres de cárie, que foram randomizados e divididos em 4 grupos (n=6): Z350 XT(+): inserção incremental(II) e preenchimento manual (PM); Z350 XT(-): inserção única (IU) e PM; TBF (Tetric N Ceram Bulk Fill: IU e PM); e SFU [SonicFill: IU e preenchimento ultrassônico (PU) ]. Os dentes foram escaneados e analisados em μCT em dois tempos: T0- após o preenchimento da cavidade com resinas compostas e T1- depois da polimerização para CP. Após 1 semana os dentes foram seccionados transversalmente no sentido vestíbulo-lingual e mesio-distal para obtenção de espécimes com aproximadamente 1mm² de espessura, e fixados em dispositivo para máquina de ensaio universal para realizar μTBS. Os dados demonstraram diferença estatisticamente significante para a CP entre os grupos Z350 XT(+) e Z350 XT(-) e entre SFU e Z350 XT(-) (Kruskal-Wallis e Dunn, p<0.05). A μTBS foi maior para Z350 XT(+) em relação aos demais grupos (p<0.05) e não houve correlação entre CP e a μTBS (p>0.05). Concluiu-se que RBF apresentaram CP semelhante à resina convencional nanoparticulada inserida de forma incremental. A resistência de união foi maior para a resina convencional inserida pela técnica incremental que apresentou menor falhas pré-teste, quando comparada às RBF. Não foi observada correlação entre a CP e a resistência de união quando utilizadas RBF e convencionais. O capítulo II avaliou o volume de contração de polimerização (VC), gap (VG) e poro (VP) usando μCT em restaurações classe I de RBF e convencional, e suas correlações. Cavidades classe I (4x5x4 mm), fator-C=4,2, foram realizadas em terceiros molares humanos livres de cárie que foram randomizados e divididos em 5 grupos (n=6): Z350 XT(+) (II/PM); Z350 XT (-) (IU/PM); TBF (IU/PM); SFM [ (SonicFill (IU/PM) ] e SFU (IU/PU). Os dentes foram escaneados e analisados em μCT em dois tempos: T0- após o preenchimento da cavidade com resinas compostas e T1- depois da polimerização para VG e VP, e VC (T1-T0). Após 1 semana os dentes foram seccionados transversalmente no sentido vestíbulo-lingual e mesio-distal para obtenção de espécimes com aproximadamente 1mm² de espessura, e fixados em máquina de ensaio universal para realizar μTBS. Os testes de Kruskal-Wallis e Dunn, demonstraram diferença estatisticamente significante no VC em μCT para os grupos Z350 XT(+) e Z350 XT (-) e entre SFU e Z350 XT(-), e diferença entre o VP para Z350 XT(+) e as RBF (p<0.05). Não houve diferença para o VG entre as RBF e convencional (p>0.05). Houve correlação positiva entre a VC versus VG e entre VC versus VP (Spearman, p<0.05). Concluiu-se que as RBF tanto de inserção sônica quanto manual mostraram contração de polimerização e formação de gap semelhante à resina convencional nanoparticulada inserida de forma incremental. Há uma correlação positiva entre a contração de polimerização e a formação de gap final, assim como entre a contração de polimerização e poro nas resinas compostas. O gap final foi formado principalmente pelo gap inicial gerado durante a inserção/preenchimento da resina na cavidade e não à contração de polimerização.
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Avaliação Citogenética de Técnicos em Radiologia Expostos Ocupacionalmente à Radiação IonizanteMotta, Andreya Gonçalves Costa 08 March 2018 (has links)
Submitted by admin tede (tede@pucgoias.edu.br) on 2018-06-20T19:01:11Z
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Previous issue date: 2018-03-08 / The understanding of the biological effects radioinducites in the organism can help the
cytogenetic dosimetry in monitoring the health of professionals occupationally exposed to
radiation, so radiology technicians must pay attention to all necessary and obligatory
measures of protection because they are responsible for the procedures that refer to the
diagnoses involving exposure to ionizing radiation. The objective of this research was to
perform a cytogenetic analysis of 20 professional radiology technicians exposed
occupationally to ionizing radiation through the collection of heparinized peripheral blood and
culture of T lymphocytes to verify the frequencies of chromosomal aberrations and
micronuclei. All subjects had to have more than 3 years of service time, regardless of age,
sex, smoking habits or alcohol. The control group had the same age and sex as the exposed
group. Micronucleus analysis occurred faster and more accurately than the analysis of
chromosomal aberrations, suggesting that it is used as the first choice in radiological
screening. Metaphase analysis and the cytokinesis blockade test allowed the quantification of
a high frequency of unstable chromosomal aberrations and micronuclei in subjects with a
workday from 6 hours to 12 hours daily. The results of the frequency of unstable
chromosomal aberrations in the exposed group were 0.031 ± 0.030 and in the control group
0.002 ± 0.004. In the micronuclei frequencies of the exposed group the obtained result was
0.0035 ± 0.003 and in the control group 0,0004 ± 0.001 confirming the methodology of
cytogenetic analysis as quality control in the biodosimetric investigation for the identification
and prevention of possible genomic damages. Subsequent studies are needed to find out if
factors such as smoking and alcoholism can influence changes in the health of these
professionals. / A compreensão dos efeitos biológicos radioinduzidos no organismo pode auxiliar a
dosimetria citogenética no monitoramento da saúde dos profissionais ocupacionalmente
expostos a radiação, assim, os técnicos em radiologia devem se atentar a todas as medidas
necessárias e obrigatórias de proteção por serem responsáveis pelos procedimentos que
referentes aos diagnósticos clínicos que envolvam a exposição à radiação ionizante. O
objetivo desta pesquisa foi realizar análise citogenética de 20 profissionais técnicos em
radiologia expostos ocupacionalmente a radiação ionizante, através da coleta de sangue
periférico heparinizado e cultura de linfócitos T para verificar as frequências de aberrações
cromossômicas e de micronúcleos. Todos os indivíduos tinham que ter mais de 3 anos de
tempo de serviço, independente da idade, sexo, hábitos tabagista ou etilista. O grupo controle
teve a idade e sexo equiparados com o grupo exposto. A análise de micronúcleos ocorreu de
forma mais rápida e precisa do que a análise de aberrações cromossômicas, sugerindo que ela
seja utilizada como primeira escolha em triagem radiológica. A análise de metáfases e o teste
de bloqueio de citocinese permitiu a quantificação de uma alta frequência de aberrações
cromossômicas instáveis e de micronúcleos nos indivíduos com a jornada de trabalho entre 6
horas a 12 horas diárias. Os resultados encontrados da frequência de aberrações
cromossômicas instáveis no grupo exposto foi 0,031±0,030 e no grupo controle 0,002±0,004.
Nas frequências de micronúcleos do grupo exposto o resultado obtido foi 0,0035±0,003 e no
grupo controle 0,0004±0,001 confirmando a metodologia de análise citogenética como
controle de qualidade na investigação biodosimétrica para a identificação e prevenção de
possíveis danos genômicos. Estudos subsequentes são necessários para averiguar se fatores
como o fumo e o etilismo podem influenciar as alterações na saúde destes profissionais.
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Difração de raios X em minerais de bauxita e análise através de refinamento pelo método de RietveldERDÓCIA, Félix Anderson Barros January 2011 (has links)
Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-04-16T17:12:01Z
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Previous issue date: 2011 / O alumínio metálico é obtido a partir da bauxita, minério de grande importância industrial, composta por um ou mais tipos de hidróxidos de alumínio, acrescido de
uma mistura de compostos contendo sílica, óxido de ferro, titânia e aluminossilicatos. Em
virtude da variação na concentração relativa desses componentes, em amostras diferentes de
bauxita, a determinação qualitativa e quantitativa da composição mineralógica desse minério, tem
importância relevante no que se refere à sua aplicação tecnológica, já que esta está diretamente
relacionada com o teor desses componentes. Neste trabalho, aplicou-se em oito amostras de
bauxita extraídas de uma mina em Paragominas, o processo de refinamento de espectros de
difração de raios X pelo método de Rietveld, onde foram identificadas e quantificadas as fases
cristalinas: gibbsita, caulinita, goehtita, anatásio, quartzo e hematita. Realizados os refinamentos
das amostras, constatou-se que todas apresentavam alto teor de Gibbsita e baixo teor de Goethita
o que confere um excelente tipo de bauxita para ser utilizada em processo de extração de alumina. / The aluminum metal is obtained from bauxite ore, great industrial importance,
consisting of one or more types of aluminum hydroxide plus a mixture of compounds
containing silica, iron oxide, titania and aluminosilicates. Because of the variation in the relative
concentration of these components in different samples of bauxite, the qualitative and quantitative
mineralogy of the ore, has great importance with regard to its technological application,
since this is directly related to the content of these components. This work was applied in eight
samples of bauxite, extracted from a mine in Paragominas, the process of refining the spectra of
X-ray diffraction using the Rietveld method, which were identified and quantified the crystalline
phases: gibbsite, kaolinite, goehtita, anatase, quartz and hematite. Carried the refinements of the
samples, we found that all had high levels of Gibbsite and Goethite low which gives an excellent
type of bauxite to be used in extraction of alumina.
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Crescimento e caracterização dos cristais de sulfato de níquel hexahidratado dopados com íons [MnH<sub>2</sub>O]<sup>2+</sup> e com sulfato de magnésio heptahidratadoFERREIRA JÚNIOR, Messias de Nazaré Guimarães January 2011 (has links)
Submitted by Cleide Dantas (cleidedantas@ufpa.br) on 2014-04-16T15:47:22Z
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Previous issue date: 2011 / Neste trabalho, cristais de sulfato níquel dopados com íons de manganês (NSH: Mn) e cristais
de sulfato níquel dopados com de íon de magnésio (NMgSH) foram crescidos e
posteriormente caracterizados pelas técnicas de difração de raios X e de espectroscopia
Raman. Os resultados obtidos mostraram que os cristais dopados possuem estrutura muito
semelhante a do cristal de sulfato de níquel puro (NSH), com uma deformação anisotrópica
nas dimensões da célula unitária em relação ao cristal puro. O objetivo do presente estudo foi
crescer dois novos monocristais de boa qualidade óptica para serem usados como filtros
ópticos de banda passante. Os cristais de sulfato de níquel hexa-hidratado (NHS) são
conhecidos por possuírem espectros de transmissão óptica, que tem atraído muita atenção,
pois apresentam duas regiões com alta eficiência de transmissão, aproximadamente 80%,
sendo a primeira região entre 200 e 350 nm e a segunda entre 400 e 600 nm, e uma alta
eficiência de absorção em outras regiões do espectro UV-VIS. Um espectro de transmissão de
luz com estas características é semelhante a um filtro óptico. Analises Termogravimetric
(TGA) foram realizadas para cristais puros e dopados. A temperatura de decomposição obtida
para o NSH foi de 73 ° C, enquanto que os cristais de NSH:Mn e NMgSH apresentam valores
de 82 ° C e 86 º C, respectivamente. Como pode ser facilmente percebido, a estabilidade
térmica de cristais com o íons de Mn ou Mg em suas estruturas é significativamente maior. A
banda de transmissão entre 200 e 350 nm no espectro óptico de NSH foi observada com
redução significativa em sua largura nos espectros de transmissão dos cristais dopados
restringindo assim a região do espectro conhecida como UVA. / In this work, manganese ions doped nickel sulphate crystals (NSH:Mn) and
magnesium ion doped nickel sulphate crystals (NMgSH) were grown and later characterized
by X-ray diffraction and Raman spectroscopy techniques. The results obtained showed that
the doped crystals possess a structure very similar to that of the pure nickel sulphate crystal
(NSH), with an anisotropic deformation in the unit cell dimensions compared to the pure
crystal, undergoing expansion in unit. The aim of the present study was to grow two new
single crystals of good optical quality to be used as optical bandpass filters. Nickel sulfate
hexahydrate (NHS) crystals are known to possess an optical transmission spectrum which has
attracted much attention because it presents two regions with high transmission efficiency of
approximately 80%, the first region being between 200 and 350 nm and the second between
400 and 600 nm, and a high absorption efficiency in other regions of the UV-VIS spectrum. A
light transmission spectrum with these characteristics is similar to an optical filter.
Termogravimetric (TGA) analyses were carried out for pure and doped crystals. The obtained
decomposition temperature of NSH was found to be 73 °C while that NSH: Mn and NMgSH
crystals present values of 82 ° C and 86 C respectively. As can be easily perceived, the
thermal stability of crystals with Mn or Mg ions in their structures is significantly higher. The
transmission band between 200 and 350 nm in the optical spectrum of NSH was found to be
narrower in the transmission spectrum of the doped crystal thus restricting the region of the
spectrum known as UVA.
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Estudos cristalográficos da enzima diidroorotato desidrogenase de \'Trypanosoma Cruzi\' / Crystallographic studies of dihydroorotate dehydrogenase from \'Trypanosoma cruzi\'Pinheiro, Matheus Pinto 29 February 2008 (has links)
\'Trypanosoma cruzi\' é o agente etiológico da doença de Chagas, esta considerada um problema de saúde pública na América Latina. Cerca de 10 a 14 milhões de pessoas estão infectadas com o \'Trypanosoma cruzi\' e 40120 milhões de pessoas correm o risco de contrair a doença. Diidroorotato desidrogenase (DHODH) é uma flavoenzima que catalisa a oxidação de L-diidroorotato em orotato, a quarta e única reação redox na biossíntese de novo de nucleotídeos de pirimidinas. Atualmente, existe um grande interesse em inibidores da DHODH como agentes terapêuticos para o tratamento de câncer, artrite reumatóide e doenças parasitarias. Em particular, estudos genéticos têm mostrado que DHODH é essencial para a sobrevivência do \'T. cruzi\', validando a idéia de que DHODH pode ser considerada um alvo atraente para o desenvolvimento de drogas antichagásicas. Neste trabalho, reportamos a estrutura cristalográfica da enzima DHODH de \'Trypanosoma cruzi\' cepa Y (TcDHODH), uma cepa parcialmente resistente a drogas e altamente virulenta. O gene de TcDHODH que codifica um polipeptídeo consistindo de 314 aminoácidos foi clonado em pET-28a entre os sítios de restrição BamHI e NotI. A enzima TcDHODH foi expressa como uma proteína solúvel em E. coli BL21 (DE3) através da indução com 1 mM IPTG por 5 h a 25 °C e purificada utilizando cromatografia por afinidade em resina Ni-NTA. A cristalização de TcDHODH foi realizada utilizando o método de difusão de vapor em gotas suspensa e pendurada contra o reservatório contendo 1,5 M sulfato de amônio, 5% 2-propanol em 0,1 M acetato de sódio pH 5 adicionado de 2 mM ditiotreitol (DTT). A coleta de dados foi realizada na linha de luz D03B-MX1 do Laboratório Nacional de Luz Síncrotron (LNLS) com radiação a 1,427 Å. Cristais de TcDHODH difratam à resolução de 2.2 Å e crescem no grupo espacial P212121 com parâmetros de cela a = 82.39, b = 123.92 e c = 128.89 Å. A estrutura foi resolvida por técnicas de substituição molecular e refinada a 2.2 Å de resolução. Uma análise detalhada da enzima TcDHODH cepa Y tem nos permitido identificar características estruturais que podem ser melhor exploradas para o desenho de inibidores altamente específicos através da tecnologia de desenho de drogas baseado em estrutura, como uma importante ferramenta no combate a doença de Chagas. / \'Trypanosoma cruzi\' is the etiological agent of Chagasdisease, considered a public health problem in Latin America. Ten to 14 million people are infected by \'Trypanosoma cruzi\' and 40120 million people are at risk of infection. Dihydroorotate dehydrogenase (DHODH) is a flavin mononucleotide containing enzyme, which catalyses the oxidation of L-dihydroorotate to orotate, the fourth step and only redox reaction in the de novo biosynthesis of pyrimidine nucleotides. At present, there is a great interest in inhibitors of DHODH as therapeutic agents for the treatment of cancer, rheumatoid arthrits and parasitic diasease. In particular, genetic studies have shown that DHODH is essential for \'T. cruzi\' survival, validating the idea that DHODH can be considered an attractive target for the development of antichagasic drugs. Here, we report the crystal structure of \'Trypanosoma cruzi\' DHODH from Y strain (TcDHODH), a partially drug-resistant and highly virulent strain. The TcDHODH gene that encodes a polypeptide consisting of 314 amino acid residues was cloned into BamHI and NotI restriction sites of pET-28a. The TcDHODH was functionally expressed as a soluble protein in E. coli BL21 (DE3), through induction with 1 mM IPTG for 5 h at a temperature of 25 °C and purified to homogeneity using affinity chromatography on Ni-NTA resin. The crystallization of TcDHODH was performed using vapor diffusion method in sitting and hanging drops against a reservoir solution containing 1.5 M ammonium sulfate, 5% 2-propanol in 0.1 M sodium acetate pH 5 plus the addition of 2 mM dithiothreitol (DTT). Data collection was performed at the D03B-MX1 beam line of the Brazilian Synchrotron Light Laboratory (LNLS) using 1.427 Å radiation. TcDHODH crystals diffract up to 2.2 Å resolution and belong to space group P212121 with unit cell dimensions a = 82.39, b = 123.92 and c = 128.89 Å. The structure has been solved by molecular replacement techniques and refined up to 2.2 Å resolution. A detailed analysis of TcDHODH strain Y has allowed us to identify structural characteristics that can be further exploited for design of highly specific inhibitors through the technology of structure-based drug design as an important tool to fight against Chagasdisease.
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Determinação de estruturas moleculares cristalinas por difração de raios X e desenvolvimento de um sistema computacional para a comparação de fragmentos moleculares de configuração similar / Crystal molecular structure determination by X-ray diffraction and the development of a computational system of superposition of similar molecular fragmentsAraujo, Alexandre Suman de 18 March 2002 (has links)
O presente trabalho tem como dupla finalidade a determinação de algumas estruturas moleculares inéditas e o desenvolvimento de dois sistemas computacionais de uso em cristalografia. Primeiramente, determinamos quatro estruturas moleculares de complexos de ácido piridinacarboxílico ligados a íons metálicos (Co, Ni, Cu e Zn), os quais apresentam interesse farmacológico e se enquadram em uma das linhas de pesquisa do grupo de Cristalografia de São Carlos. Nesta Dissertação, a ênfase dada a esta parte do trabalho é a aprendizagem das técnicas relativamente complexas para a resolução e refinamento de estruturas moleculares obtidas através de difração de raios X, como uma motivação preliminar para o subseqüente trabalho computacional. Com relação ao desenvolvimento de sistemas computacionais, são apresentados dois programas que representam importantes ferramentas cristalográficas. O Xandrix realiza todos os cálculos matriciais necessários em transformações cristalográficas, tanto no espaço real como no recíproco, envolvendo tensores de até segunda ordem. O WinKabsch é uma implementação do algoritmo de Kabsch que melhor sobrepõe, utilizando mínimos quadrados, dois conjuntos de vetores e é usado para comparar moléculas inteiras ou fragmentos. Ambos foram desenvolvidos para ambiente Windows, oferecendo uma interface visual poderosa e amigável. O WinKabsch permite que o usuário gire, visualmente, duas moléculas dadas de maneira que elas se posicionem em orientações similares, para então selecionar, com o mouse, alguns átomos homólogos a partir dos quais é obtida uma primeira matriz de transformação. A seguir, o programa reconhece todos os outros pares de átomos homólogos para os cálculos finais. A transformação pode ser forçada a ser uma rotação própria quando as moléculas comparadas são suspeitas de possuir a mesma quiralidade. / This work has the two-fold purpose of determining a few novel crystal structures and to develop two computational systems for crystallographic use. First, we determined four molecular structures of complexes of a derivative of the pyridinacarboxilic acid with a metal ion (Co, Ni, Cu and Zn), which are of pharmacological interest and belong to one of the research lines of the group. In the present contribution the emphasis of these studies is in mastering the somewhat involved techniques for solving and refining molecular structures by X-ray diffraction, as a preliminary motivation for the subsequent computational work. Second, two programs which turn out to be useful tools for crystallographic work were developed. Xandrix, permits all matrix calculations necessary in crystallography transformations, both in real and reciprocal space, involving tensors up to the second rank. WinKabsch is an implementation of the Kabsch algorithm for the best least squares superposition of two sets of vectors and is used to compare molecules or molecular fragments. Both programs were developed to run in a Windows environment with a powerful and friendly visual interface. WinKabsch allows the user to visually rotate two given molecules to achieve similar orientations to perform later a mouse selection of a few homologous atoms from which a first orthogonal transformation matrix is obtained, after which the program recognizes all other pairs of homologous atoms for the final calculation. The transformation may be forced to be a proper rotation when the compared molecules are known to be of the same chirality.
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Efeitos de regimes de sobreclareamento associados a produtos clareadores caseiros sobre o conteúdo mineral e a rugosidade do esmalte dentário humano / Overbleaching effects on mineral content and roughness of human enamelMarianna Sorozini Ferreira de Miranda 09 December 2013 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O clareamento dental se tornou um dos tratamentos estéticos mais realizados nos consultórios odontológicos, devido à simplicidade técnica e popularização através da mídia. Consiste na utilização de géis à base de peróxido de carbamida, peróxido de hidrogénio e, em uma menor escala, de perborato de sódio, com intuito de oxidar moléculas responsáveis pela pigmentação da estrutura dentária. Apesar da grande quantidade de estudos sobre o tema, não se sabe os efeitos do uso excessivo desses agentes sobre a estrutura dentária. O objetivo deste estudo foi avaliar os efeitos sobre a rugosidade superficial e conteúdo mineral do esmalte dental humano submetido a regimes de sobreclareamento associados ao uso de géis clareadores caseiros: peróxido de carbamida 10% (Opalescence PF Regular 10%, Ultradent do Brasil Produtos Odontológicos Ltda., Indaiatuba, São Paulo), peróxido de hidrogênio 9,5% (DayWhite 9,5%, Discus, LLC Culver City, EUA), bem como tiras clareadoras (Oral-B WhiteStrips, Anderson Packaging, Rockford, Estados Unidos). Quatro fragmentos de esmalte obtidos a partir de cinco dentes foram submetidos a um diferente tratamento: Grupo I - armazenamento em saliva artificial por oito semanas; Grupo 2 oito semanas de tratamento com gel de peróxido de carbamida 10% por 6 horas diárias; Grupo 3 oito semanas de tratamento com gel de peróxido de hidrogênio 9,5% com duas aplicações diárias de 30 minutos; Grupo 4 oito semanas de tratamento com tiras clareadoras duas aplicações diárias de 30 minutos. A alteração no conteúdo mineral foi avaliada semanalmente em seis pontos de cada fragmento devidamente identificados através de um sistema de coordenadas (X, Y e Z) utilizando-se a técnica de fluorescência de raios X (Artax 200). Alterações na rugosidade superficial das amostras também foram avaliadas através de um rugosímetro 3D (FormTalysurf 60, Taylor Leicester, Reino Unido). Apenas o grupo 3 apresentou diferenças estatísticas significativas com relação aos níveis de rugosidade (p<0,05), porém não consideradas como clinicamente significativos. Para os demais tratamentos e intervalos propostos, não foram encontradas diferenças estatisticamente significativas (p>0,05). Desse modo, não houve alterações compatíveis com um processo de desmineralização ou aumento real da rugosidade da superfície. Nas condições desse estudo in vitro os géis clareadores caseiros foram considerados seguros. São necessários novos estudos in situ e in vitro que analisem os efeitos de regimes de sobreclareamento quando em condições de somatório de desafios intra-orais. / Tooth bleaching has become one of the most performed cosmetic treatments in dental offices because of the technical simplicity and popularization through media. It is based in the use of gels containing carbamide peroxide, hydrogen peroxide, and sodium perborate to oxidize molecules responsible for pigmentation of the tooth structure. Despite the large amount of studies of the topic, the effects of overuse of these agents on tooth structure are not established. The aim of this study was to evaluate the effects on the surface roughness and mineral content of the enamel submitted to overbleaching protocols associated with the use of home bleaching gels: 10 % carbamide peroxide (Opalescence PF 10 % Regular, Ultradent Dental Products of Brazil Ltd., Indaiatuba, São Paulo), hydrogen peroxide 9.5% (DayWhite 9.5%, Discus, LLC Culver City, EUA), as well as bleaching strips (Oral- B Whitestrips, Anderson Packaging, Rockford, USA). Four enamel fragments obtained from five teeth were subjected to different treatments: Group I - storage in artificial saliva for eight weeks; Group 2 eight-week exposure to 10% carbamide peroxide gel for 6 hours daily; Group 3 eight-week exposure to 9,5% hydrogen peroxide gel - two 30-minute application, Group 4 eight-week exposure to bleaching strips - twice daily for 30 minutes. The change in mineral content was assessed weekly with the analysis of six points in each fragment properly identified by a coordinate system (X, Y and Z) using the technique of X-ray fluorescence (Artax 200). Changes in surface roughness of the samples were also evaluated using a 3D perfilometer (FormTalysurf 60, Taylor Leicester, UK). Only group 3 showed statistically significant differences for roughness (p <0.05), but this is not considered as clinically important. For other proposed treatments and intervals, there were no statistically significant differences for any of the treatments tested in any of the proposed ranges (p > 0,05). There was no sign of demineralization process. Under these in vitro conditions, home bleaching gels were considered safe. Further in situ and in vivo studies are necessary to examine the effects of overbleaching protocols with all other intra-oral challenges.
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Avaliação da técnica de impedância bioelétrica na identificação das alterações da composição corporal em mulheres no período pós-parto / Assessment of body composition changes in women in the postpartum period by bioelectrical impedanceAna Cristina Teixeira Santos 20 December 2013 (has links)
Este trabalho teve como objetivo verificar se a técnica de impedância bioelétrica (IB) identifica as modificações da composição corporal em mulheres no período pós-parto. Participaram do estudo 47 mulheres (≥ 18 anos), nas quais foram avaliadas massa livre de gordura (MLG), massa gorda (MG) e percentual de gordura corporal (%GC) pelos equipamentos IB_Tanita BC 533; IB_RJL 101 e por absorciometria de raio X de dupla energia (DXA). Todas as avaliações foram feitas no mesmo dia. Posteriormente, as mulheres foram categorizadas em dois grupos: com perda ponderal (n= 24) e com ganho ponderal (n= 22). Os valores médios das alterações da composição corporal (CC), foram comparados intra-métodos e em relação ao método padrão-ouro (DXA) através de teste T-pareado. A concordância entre as diferenças das alterações da CC obtidas pelas IB e DXA foi avaliada pelo método de Bland & Altman e pelo coeficiente de correlação intraclasse (CCI). A média  desvio padrão de idade foi de 26,7  5,2 anos e o tempo médio da captação no pós-parto para a primeira avaliação foi de 2,6  2,0 meses e 8,0  2,7 meses para a segunda avaliação. A média de massa corporal (MC) foi de 74,6  11,4 kg na primeira avaliação e 75,1  12,6 kg na segunda avaliação, correspondendo a um valor de índice de massa corporal (IMC) de 28,8  4,0 kg/m2 e 29,0  4,6 kg/m2, respectivamente. O %GC medido pela DXA foi de 40,1  4,9 % para a primeira avaliação e de 41,0  5,2 %, para a segunda avaliação, representando uma MG de 30,2  6,6 kg e de 30,9  8,0 kg, respectivamente. Ambas as IB subestimaram a alteração do % GC (-0,7 % para IB_Tanita e -1,1% para IB_RJL) e MG (-0,6 kg para IB_Tanita e -1,0 kg IB_RJL) em relação ao DXA. Por sua vez, as alterações de MLG foram superestimadas 0,8 kg pela IB_Tanita e 1,0 kg IB_RJL. Houve boa concordância (CCI ≥ 0,75) entre as alterações identificadas para MG pela IB_Tanita e por DXA e satisfatória pela IB_RJL. Dessa forma o presente estudo verificou um desempenho satisfatório da técnica de IB em identificar as alterações da MG gorda e que a IB_Tanita mostrou-se melhor que a IB_RJL na estimativa da alteração desse componente corporal nesse grupo de mulheres pós-parto. / The aim of the present study is to assure that the measurement of the bioelectrical impedance (IB) identifies the changes in the body composition of postpartum women. Forty-seven women (≥ 18 years of age) were enrolled in the study. Body composition (BC) - fat free mass (FFM), fat mass (FM) and percentage body fat (%BF) - was obtained by two IB devices (Tanita BC 533 and RJL 101) and DXA. All measurements were performed at the same day in two different postpartum moments. The women were categorized in two groups: with weight loss (WWL, n= 24) and with weight gain (WWG, n= 22). Pair T-test was used to compare mean difference values within methods and DXA. Bland & Altman plots and intraclass correlation coefficients (ICC) were used to evaluate the agreement between body composition changes obtained by both IB and DXA. The first and second visits for BC measurements occurred 2,6  2,0 months e 8,0  2,7 months after delivery, respectively. Mean ( SD) age was 26.7  5.2 years and body mass was 74.6  11.4 kg at the first visit and 75.1  12.6 kg at the second visit. Women were overweight in both visits (BMI= 28.8  4,0kg/m2 e 29.0  4.6 kg/m2). % BF measured by DXA at the first visit was 40.1  4.9% and at the second visit was 41.0  5.2% yielding on average a FM of 30.2  6,6 kg and 30,9  8,0 kg, respectively.. IB_Tantia yelded lower mean values for FFM and FM compare to DXA mean values, except for %BF. Both IB underestimated %BF (-0.7% for Tanita and -1.1% for RJL) and FM changes (-0.6 kg for Tanita and -1.0 for RJL) compared to DXA changes. On the other hand FFM changes were overestimated by Tanita (0,8 kg) and RJL (1,0 kg). There was a good agreement (CCI ≥ 0.75) between FM changes measured by IB_Tanita and DXA and a fair agreement for IB_RJL. Therefore the IB technique was able to identified FM changes, and IB_Tanita showed a better performance than IB_RJL on the estimation of FM changes in these postpartum women.
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Biomateriais multifuncionais aplicados em reparo ósseo na odontologia /Barud, Hélida Gomes de Oliveira. January 2017 (has links)
Orientador: Osmir Batista de Oliveira Junior / Abstract: A regeneração óssea caracteriza-se por ser um processo fisiológico complexo que envolve a participação coordenada entre angiogênese e osteogênese. Envolve um processo de múltiplas etapas que inclui migração, proliferação e diferenciação de vários tipos de células, como células endoteliais, fibroblastos, osteoblastos e osteoclastos. Sabe-se que os biomateriais sintéticos têm demonstrado ser uma excelente alternativa ao reparo ósseo. Assim, o objetivo deste estudo foi avaliar o efeito do Biosilicato de sódio (BS) e dos compósitos 3D de 30% de hidroxiapatita e ácido poliláctico (3D 30% HA / PLA) e 30% hidroxiapatita e ácido poli (ácido láctico-co-glicólico) (30% HA / PLGA), e em defeitos críticos na calvária de ratos. Cento e vinte ratos machos de 90 dias com 350g de massa corporal em média foram aleatoriamente divididos em grupos de acordo com materiais de enxerto e tempo de análise, apresentando 6 animais em cada um. Os defeitos de tamanho crítico foram criados empregando-se uma trefina de 8 mm de diâmetro interno e preenchidos com os materiais mencionados ou apenas o coágulo sanguíneo como controle. Após 14 (T1), 30 (T2), 60 (T3), 90 (T4) e 120 dias (T5) dias do procedimento cirúrgico, a regeneração óssea foi avaliada por radiografia, microtomografia computadorizada (μ-CT) e histologia. A avaliação macroscópica mostrou biocompatibilidade em torno da área de interesse entre os biomateriais e ossos adjacentes. As imagens de μ-CT e de raios-x revelaram uma considerável formação ... (Complete abstract click electronic access below) / Resumo: The process of bone regeneration requires a coordinated coupling between osteogenesis and angiogenesis involveing a multistep process that includes migration, proliferation, and differentiation of several types of cells such as endothelial, fibroblasts, osteoblasts and osteoclasts. It is known that synthetic biomaterials have been proven to be an excellent alternative to bone repair. Thus, the aim of this study is to evaluate the effect of calcium and sodium Biosilicate (BS), a 3D scaffold of hydroxyapatite and polylactic acid (30% HA / PLA) and a hydroxyapatite and poly (lactic-co-glycolic acid) (30% HA / PLGA) composites in critical-sized calvarial defects. One hundred and twenty 90 days old male rats with 350g of body mass on average were randomly divided into groups (n = 6) according to graft materials and analysis time. Critical-size defects were created by means of a 8 mm inner diameter trephine bur and were filled with a 3D 30% HA/PLGA scaffold, 30% HA/PLA, BS or blood clot as control. After 15 (T1), 30 (T2), 60 (T3), 90 (T4) and 120 (T5) days of the cirurgical procedure, bone regeneration was evaluated by histology, x-ray and micro-computed tomography (µ-CT). Macroscopic evaluation showed no significant inflamation around the interest area. µ-CT results indicates that 30% HA/PLA and 3D 30% HA/PLGA composites were not fully degraded and images revealed considerable bone formation in 90 days and 120 days in relation to these materials. On the other hand, BS presented a ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Doutor
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