As plantas respondem ao ataque de insetos pela indução e acumulação de um conjunto grande de proteínas de defesa. Nesse trabalho foi feita uma investigação sobre as modificações transcricionais que ocorrem em plantas de cana-de-açúcar, em resposta ao ataque de lagartas de Diatraea saccharalis. A primeira abordagem foi o estudo detalhado da indução de duas isoformas do homólogo de cana-de-açúcar do gene de cevada induzido por dano barwin (barley woundinducible), chamado de sugarwin (sugarcane wound-inducible). A indução de transcritos de sugarwin ocorreu em resposta ao ferimento mecânico, dano provocado por D. saccharalis e tratamento com metil jasmonato. Além disso, sua expressão foi restrita ao local de dano. Sugarwins fazem parte do grupo de genes induzidos tardiamente por dano. A localização subcelular do peptídeo sinal fusionado à gfp (green fluorescent protein) mostra que essas proteínas são secretadas. Embora a função do domínio barwin não esteja completamente elucidada, atividades anti-patogênicas têm sido descritas para um grande número de homólogos. Alinhamentos múltiplos de seqüências do domínio barwin das proteínas de cana-de-açúcar e de outras proteínas de mono e dicotiledôneas revelaram altos índices de similaridade, sugerindo que sua função é conservada entre espécies. Esse é o primeiro relato da indução de uma proteína da família Barwin por herbivoria. A atividade dessas proteínas contra insetos nunca foi estudada. Os resultados apresentados aqui sugerem que as SUGARWINS fazem parte da estratégia de defesa de cana-de-açúcar. A segunda abordagem para estudar a resposta da cana-de-açúcar ao dano por D. saccharalis foi a análise em larga-escala, usando macroarranjos de DNA, de serino proteases e inibidores de serino proteases de cana-de-açúcar diferencialmente expressos em resposta a herbivoria. Enquanto que a função dos inibidores de proteases na defesa de plantas contra insetos e patógenos está bem estabelecida, o envolvimento de proteases na defesa tem sido proposto recentemente. O monitoramento de transcritos de serino proteases de cana-de-açúcar responsivos a herbivoria revelou vários genes cuja função precisa ser investigada. Uma das aplicações desses resultados é a identificação de genes para uso em estratégias biotecnológicas que visam aumentar a resistência de cana-de-açúcar a insetos. / Plants respond to insect damage by induction and accumulation of a large set of defense proteins. An investigation was undertaken to study the sugarcane transcriptional changes following Diatraea saccharalis damage. The first approach was a detailed study about the induction of two isoforms of a sugarcane homologue of a barley wound inducible gene, barwin, named sugarwin (sugarcane wound-inducible). Induction of sugarwin transcripts occurs in response to mechanical wounding, D. saccharalis feeding and methyl jasmonate treatment. Their expression is restricted to the site of damage. Sugarwins are members of the late wound-inducible genes. The subcellular localization of the signal peptide fused to the gfp (green fluorescent protein) shows that these proteins are secreted. Although the exact function of the barwin domain has not been completely elucidated, antipathogenic activities has been described for a number of homologues. Multiple sequence alignment of barwin domain-containing sugarcane proteins and of mono and dicotiledoneous proteins reveals high similarity, suggesting that their function is conserved among species. This is the first report of a barwin-like protein induced by herbivory. The activity of this type of proteins against insects has never been studied. Based on the results presented here, it can be concluded that SUGARWINS are part of the sugarcane defense response strategy. The second approach to study the sugarcane response to D. saccharalis damage was the large-scale analysis, using DNA macroarrays, of serine proteases and serine protease inhibitors differently expressed in response to herbivory. While the protease inhibitors function in defense is well-established, the involvement of proteases in defense has been recently proposed. The transcript monitoring of sugarcane serine proteases in response to herbivory revealed several candidate genes for further functional studies. One of the greatest applications of these results is the identification of genes for use in biotechnological strategies to improve sugarcane insect resistance.

O uso de marcadores moleculares tem contribuído para o estudo da domesticação das espécies de Phaseolus, origem e diversidade das cultivares atuais de feijão-comum (P. vulgaris), e do controle genético da resistência a diversas doenças. Mapas de ligação têm sido estabelecidos em feijão-comum com base em marcas de RFLP, RAPD, SCAR, isoenzimas e locos fenotípicos, sendo que alguns deles foram reunidos em um mapa mais denso e completo do genoma do feijão, chamado mapa núcleo. No entanto, para o uso efetivo de mapas de ligação em programas de melhoramento estes devem ser suficientemente saturados. O presente trabalho se insere neste contexto, visando saturar o mapa núcleo de P. vulgaris a partir do mapeamento de novos marcadores moleculares como AFLP e SSR baseados em EST. Assim, buscou-se desenvolver e caracterizar marcadores SSR oriundos de uma biblioteca de EST, testar a transferibilidade destes para outros cultivares e espécies relacionadas, gerar marcadores AFLP e integrá-los ao mapa consenso da espécie. Também, construir um mapa genético para uma população de interesse no Brasil (Carioca x Flor de Mayo), e promover o seu alinhamento com o mapa consenso, complementando desta forma, a caracterização genômica da espécie. Pares de primers foram desenhados para 156 SSR-EST. Destes, 138 SSR-EST amplificaram locos claros e reprodutíveis e foram caracterizados usando um conjunto de 26 genótipos de feijões cultivados. Dos locos analisados, 85 se mostraram polimórficos entre os genótipos estudados e apresentaram em média 2,96 alelos por loco e um PIC médio de 0,38. Entre todos os SSR-EST analisados, 50 locos segregaram na população de mapeamento Bat 93 x Jalo EEP558, 20 locos segregaram na população Carioca x Flor de Mayo e 12 locos foram polimórficos nas duas populações. Marcadores AFLP foram gerados e genotipados nas duas populações. Os 262 locos microssatélites e AFLP genotipados na população Bat 93 x Jalo EEP558 foram integrados ao mapa núcleo da espécie. Foi obtido um mapa de 1353 cM de comprimento total, contendo 357 marcas, incluindo 9 SSR-genômico, 47 SSR-EST e 190 AFLP. Além disso, outro mapa foi gerado a partir da análise de segregação de 252 marcadores na população Carioca x Flor de Mayo. Este mapa teve 807,5 cM de comprimento, com uma distância média de 5,3 cM entre marcas. Os marcadores microssatélites comuns foram usados como ponte para alinhar e comparar os mapas das duas populações estudadas. / The use of molecular markers has contributed to the studies regarding domestication of Phaseolus species, origin and diversity of current common bean cultivars (P. vulgaris), and the genetic control of resistance to several diseases. Linkage maps have been constructed for common bean by using RFLP, RADP, SCAR, isoenzymes and phenotypic markers, some of which were meeting in a more dense and complete map of bean genome, called core map. However, for the effective use of linkage maps in breeding programs they must be sufficiently saturated. This work fits in this context, aiming to saturate the core map of P. vulgaris from the mapping of new molecular markers as AFLP and SSR EST-based. Thus, it was tried to develop and characterize SSR markers from a EST library, to test the transferability of these markers to other cultivars and related species, to generate AFLP markers and integrate them to the consensus map of the species. Also, build a genetic map for a population of interest in Brazil ( \'Carioca\' x \'Flor de Mayo\'), and promoting its alignment with the consensus map, thus complementing the genomic characterization of the species. Pairs of primers were designed for 156 EST-SSR. Of these, 138 EST-SSR amplified clear and reproducible loci and were characterized using a set of 26 genotypes of cultivated beans. Of the loci tested, 85 were polymorphic between the genotypes studied and showed an average 2.96 alleles per locus and a PIC average of 0.38. Among all examined EST-SSR, 50 loci segregated in \'Bat 93\' x \'Jalo EEP558\' mapping population, 20 loci segregated in \'Carioca\' x \'Flor de Mayo\' population and 12 loci were polymorphic in both two populations. AFLP markers were generated and genotyped in the two populations. The 262 microsatellites and AFLP loci genotyped in \'Bat 93\' x \'Jalo EEP558\' population were integrated onto the core map of the species. A map of 1353 cM total length was obtained, containing 357 markers, including 9 genomic-SSR, 47 EST-SSR and 190 AFLP. Moreover, another map was generated from the analysis of segregation of 252 markers in \'Carioca\' x \'Flor de Mayo population. This map was 807.5 cM long, with an average distance of 5.3 cM between markers. The common microsatellites markers were used as a bridge to align and compare the maps of the two studied populations.

Made available in DSpace on 2017-07-10T17:37:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Hamilton Santana.pdf: 702139 bytes, checksum: d0ac4361cec105b090cd85a79db56ad3 (MD5) Previous issue date: 2007-08-31 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The Cyst Nematode is one of the main soybean crop pathogens in the world levels. In Brazil, such nematode is spread throughout Brazilian regions in which soybean is grown and its damage for soybean crops is dependent on the infestation level on the field. In Paraná State, this species is widely distributed, and it has been reported in 11 counties in the western region. The physiological race determination in such species is fundamentally important for the recommendation of resistant soybean cultivars to H. glycines. This work aimed to study the genetic variability in H. glycines polycystic populations collected from infested areas, through the identification of physiological races in monocystic populations by tests in soybean differential plants. It was also aimed at testing the reaction of soybean commercial cultivars to H. glycines to race 3. Field population and monocystic isolates from H. glycines, collected in Cruz Alta (RS), Porto Mendes (PR) and Novo Horizonte (PR), were developed in CD 202 soybean plants. Soybean differentials and soybean commercial cultivars were seeded in tubes, inoculated in the V1 stage with 5.000 eggs and J2 and kept in a greenhouse under temperature ranging from 28 to 30oC. The greenhouse essays followed a completely randomized design with seven replications. The physiological race identification was carried out with two field populations and nine monocystic isolates whereas the resistance test was developed on 18 commercial cultivars. The evaluation procedure was accomplished at 28 days apart the inoculation and based on the Parasitism Index (PI). The PI was calculated on the number of females and cysts found on the differentials and the cultivars tested in relation to the check cultivar LEE . The tests in differential plants with monocystic isolates revealed the presence of the races 2, 5 and 6 to Porto Mendes, 3 and 6 to Cruz Alta and 5 and 6 to Novo Horizonte. Field populations showed the presence of race 6 in Porto Mendes and race 3 in Cruz Alta. Most of commercial cultivars tested were resistant to H. glycines race 3 while the cv. Liderança and the CD 217 presented susceptibility. The results showed that the race identification from monocystic isolates assists in the identification of genetic variability in field populations of H. glycines, what is not possible according to the race scheme based in polycystic populations extracted from the soybean crop fields / O nematóide de cisto é um dos principais patógenos da cultura da soja a nível mundial. No Brasil, este nematóide encontra-se disseminado em praticamente todas as regiões produtoras de soja, sendo responsável por perdas de produtividade variáveis, dependendo do nível de infestação a campo. No Paraná, esta espécie encontra-se amplamente distribuída, tendo sido relatada em 11 municípios somente da região oeste do estado. A determinação de raças fisiológicas de H. Glycines é de fundamental importância para a recomendação de cultivares de soja resistentes a este patógeno. Objetivou-se com o presente trabalho, estudar a variabilidade genética presente em populações policísticas de H. glycines coletadas a campo, através da identificação de raças fisiológicas de populações monocísticas, a partir de testes em plantas hospedeiro-diferenciadoras. Objetivou-se também testar a reação de cultivares comerciais de soja à raça 3 de H. glycines. Populações de campo e isolados monocísticos de H. glycines, provenientes dos municípios de Cruz Alta (RS), Porto Mendes (PR) e Novo Horizonte (PR), foram multiplicados em plantas de soja CD 202 . Plantas hospedeiro-diferenciadoras e cultivares comerciais de soja foram semeados em tubetes, inoculados no estádio V1 com 5.000 ovos e J2 e mantidos em casa-de-vegetação com temperatura variando de 28 a 30 oC. Os testes em casa-de-vegetação seguiram o delineamento inteiramente casualizados com sete repetições. A identificação de raças fisiológicas foi realizada em duas populações de campo e nove isolados monocísticos e o teste de resistência em 18 cultivares. comerciais. As avaliações foram feitas aos 28 dias após a inoculação com base no Índice de Parasitismo (IP). O IP foi calculado em função do número de fêmeas e cistos encontrados nas diferenciadoras e cultivares testados em relação ao padrão de suscetibilidade e multiplicado por 100. Os testes em plantas diferenciadoras com isolados monocísticos revelou a presença das raças 2, 5 e 6 para Porto Mendes, 3 e 6 para Cruz Alta e 5 e 6 para Novo Horizonte. Populações de campo revelaram a presença da raça 6 para Porto Mendes e da raça 3 para Cruz Alta. A maioria dos cultivares comerciais testados foram resistentes à H. glycines raça 3, enquanto que a cv. Liderança e a CD 217 apresentaram-se suscetíveis. Os resultados mostraram que a identificação de raças a partir de isolados monocísticos de H. glycines auxilia na identificação da variabilidade genética presente em populações de campo, o que não é possível mediante a determinação de raças com base em populações policísticas obtidas a campo

A vassoura-de-bruxa é a doença mais importante da cultura do cacaueiro, nos países onde ela ocorre. Em 1989 foi constatada pela primeira vez a presença do patógeno causador dessa doença na principal região produtora do Brasil. A falta de medidas de controle eficientes resultou, nos últimos anos, em menor produção, mudanças no uso da terra, venda de propriedades, diminuição do nível de emprego e danos ao meio ambiente. Em vista do pouco conhecimento sobre aspectos epidemiológicos da doença nas condições do sudeste da Bahia, elaborou-se o presente trabalho com os seguintes objetivos: estudar o gradiente de infecção da vassoura-de-bruxa em ramos e frutos em cacaueiros enxertados; comparar o efeito de genótipos e três tratamentos (poda fitossanitária semestral, poda fitossanitária mensal e poda fitossanitária aliada a aplicação de fungicida mensais) no controle da doença; estudar o progresso da vassoura-de-bruxa no tempo, quantificado em ramos e frutos doentes. O experimento foi conduzido em Uruçuca, BA, em área contendo 16 genótipos diferentes, adjacente a uma área com cacaueiros abandonados com alta incidência da doença. A área experimental foi dividida em três partes, as quais receberam os seguintes tratamentos: poda fitossanitária semestral, poda fitossanitária mensal e poda fitossanitária aliada a aplicação de fungicida mensal. Pelo menos uma vez por mês foram contados os ramos e frutos com vassoura. Os resultados mostraram a ausência de evidência clara da existência de gradiente de doença. Os níveis de resistência genética à vassoura-de-bruxa de ramos e frutos não foram correlacionados entre si. Houve bom ajuste do progresso da doença ao modelo monomolecular. As menores taxas de crescimento foram obtidas no tratamento com poda e aplicação de fungicida mensal. O tratamento que combinou poda e pulverização com fungicida apresentou diferença significativa na redução do percentual de frutos com vassoura. Os genótipos NO-34, NO-17 e NO-02 foram os que apresentaram menores percentagens de frutos com vassoura, sendo significativamente diferentes dos genótipos NO-24 e NO-13. / Witches' broom is the most important disease of cocoa, in the countries where it occurs. In 1989, it was verified for the first time the presence of the pathogen in the main producing area of Brazil. The lack of efficient control measures resulted, in the last years, in losses in the production, changes in the use of the soil, sale of properties, decrease of the employment level and damages to the environment. In view of the little knowledge on epidemic aspects of the disease in the conditions of the southeast of Bahia, the present work was elaborated with the following objectives: to study the gradient of the witches' broom infection in flushes and pods in grafted cocoa; to compare the effect of genotypes and three treatments (half-yearly phytosanitation, monthly phytosanitation and monthly phytosanitation allied to fungicide application) in the control of the disease; to study the witches' broom temporal progress, quantified in flushes and pods. Trials were carried out in Uruçuca, BA, in area contends 16 different genotypes, adjacent an area with abandoned cocoa with high incidence of the disease. The experimental area was divided in three parts, which received the following treatments: half-yearly phytosanitation, monthly phytosanitation and monthly phytosanitation allied to fungicide application. At least once a month, flushes and pods with broom were counted. Results showed the absence of clear evidence of the existence of disease gradient. The levels of genetic resistance to the witches' broom of flushes and pods were not correlated to each other. There was good adjustment of progress of the disease to the monomolecular model. The smallest growth rates were obtained in the treatment with monthly phytosanitation and fungicide application. The treatment that allied phytosanitation and fungicide application presented significant difference in the reduction of the percentage of witches' broom infected pods. The genotypes NO-34, NO-17 and NO-02 presented smaller percentages of diseased pods, being significantly different from the genotypes NO-24 and NO-13.

A produção brasileira de laranjas destina-se à indústria de suco concentrado, principal produto citrícola, sendo o estado de São Paulo o maior produtor e exportador do país. Devido à diminuição da variabilidade genética causada pela multiplicação de plantas cítricas por enxertia, esta cultura se tornou alvo constante de inúmeras pragas e doenças. Dentre estas doenças que vem causando crescentes prejuízos para a citricultura brasileira destaca-se a pinta preta causada pelo fungo Guignardia citricarpa Kiely. O combate desta doença é feito por inúmeras pulverizações de fungicidas que aumenta significativamente o custo para os produtores. Uma possível alternativa para o combate a este patógeno seria a produção de plantas cítricas resistentes a doença, através de transformação gênica. Mas para isto, é necessário conhecer os mecanismos de respostas de defesa da planta e identificar quais genes podem estar relacionados com a defesa. Na tentativa de elucidar as respostas de defesa deste hospedeiro foram feitas análises anatômicas de frutos de laranja doce (Citrus sinensis Osbeck cv. Pêra) inoculados com o patógeno e análise transcricional de duas bibliotecas de cDNA, uma de albedo de frutos sadios(BAFS) e outra de albedo de frutos inoculados com o patógeno (BAFC). As análises anatômicas mostraram que os danos causados pelo patógeno na planta iniciam-se 24 horas após a inoculação com as lesões das células do epicarpo, e continuam gradativamente até 72 horas apresentando a diminuição na quantidade de amido e acúmulo de compostos fenólicos. Foi obtido 184 ESTs válidas da BAFS e 370 da BAF. A anotação e categorização destas sequencias apresentaram que o perfil transcricional encontrado nas duas bibliotecas foi semelhante, porém, na BAFC, foram encontrados transcritos pertencentes à defesa da planta como a catalase, a glutationa e monooxygenases. Está analise mostrou que a resposta de defesa da planta inicia-se com lesões nas células, que a interação é custo-intensiva (redução da reserva de amido) para o hospedeiro, e que a defesa da planta está relacionada a muitos genes de defesa. / The Brazilian production of oranges is mainly for the industry of concentrated juice, it is the most important citrus product, and the state of São Paulo is the largest producer and exporter of the country. Due to the low genetic variability caused by the multiplication of citrus plants by grafting, this culture became constant target of many pests and diseases. Among all the diseases that lead to elevated damage to the Brazilian citrus plantation, one is very relevant, the Black Spot disease caused by the fungus Guignardia citricarpa Kiely. The control of this disease is done by many sprays of fungicides that significantly increase the production cost to the producers. A possible alternative to control this pathogen is the development of resistant citrus plants to disease through genetic transformation. To that, it is necessary to understand the mechanisms of plant defense response and identify the genes related to the defense. In an attempt to elucidate the responses of this host both,anatomical analysis of sweet orange fruits (Citrus sinensis Osbeck cv. Pêra) inoculated with the pathogen and transcriptional analysis of two cDNA libraries of albedo section were done. One was from health fruits (BAFS) and another from albedo of fruits inoculated with the pathogen (BAFC). The analysis showed that the anatomical damage caused by the pathogen in the plant shall begin 24 hours after inoculation showing lesions on epicarp cells, and continue gradually until 72 hours also showing a decrease in the amount of starch and accumulation of phenolic compounds. It was obtained 184 valid ESTs of the BAFS and 370 from BAFC. The annotation and categorization of these sequences showed that the transcriptional profile in the two libraries were similar, however, in BAFC, were found transcripts belonging to plant defense such as catalase, the glutathione and monooxygenases. These analyses showed that the plant defense response begins with lesions in the cells, being it cost-intensive interaction for the host, (with reduction of starch reserves) and the plant defense to resistance is related to many genes.

Made available in DSpace on 2016-12-08T16:44:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGPV12MA063.pdf: 46944968 bytes, checksum: 6b8d53259f4109a052b1401a704602a0 (MD5) Previous issue date: 2012-02-07 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The macrospora spot, caused by the fungus Stenocarpella macrospora, has become one of the most important maize diseases in Brazil in recent years. The objectives of the study were: a) evaluate the resistance of maize hybrids macrospora spot b) determine the sensitivity of S. macrospora to fungicides by inhibition of mycelial growth and conidial germination c) evaluate the protective and curative control of the disease in young corn plants d) quantify the effect of fungicides on control the expansion macrospora spot. The resistance was evaluated on 52 hybrids and two isolates of the fungus. The inoculation was made at the V2 developmental stage, placing each plant in 0.2 mL of the suspension of 7x104 conidia mL-1. Disease severity was evaluated 14 days after inoculation. The sensitivity of S. macrospora in vitro were evaluated 12 fungicides, six concentrations and two isolates of the fungus. The percentage of inhibition of mycelial growth and conidial germination was calculated in comparison with control, estimation of 50% inhibitory concentration (IC50). The efficiency of fungicides to control protective and curative was determined in a greenhouse, with the isolated SC and the hybrid AS1565. We evaluated 16 fungicides, applied at V2. Preventive control the inoculation was made depositing 0.2 mL of the suspension of 7x104 conidia mL-1 48 hours after application. In the curative control the inoculation was made 48 hours before application. Disease severity was determined 21 days after inoculation. In control the expansion of macrospora spot seven fungicides were evaluated, applied directly to leaves of maize with leaf lesions with hybrid AS 1565. The lesions were measured every three days for a period of 27 days. In each lesion was also quantified the number of pycnidia cm2-1. There was significant difference in severity leaf among the hybrids. There was no significant effect of isolates of the fungus on the severity of the disease. Resistant hybrids were not found. The disease severity ranged from 8.88% for hybrid 30A30HX to 17.76% for the AO 1050. The fungicides tested were effective in inhibiting the growth of the mycelium, and the IC50 was less than 1 ppm for all fungicides. There was no difference between isolates. The strobilurins had higher fungitoxicity in inhibition of germination of the conidia, and the IC50 was between 0.0035 and 0.03 ppm, and the isolated SC showed a higher sensitivity to the fungicides. In preventive aplication, all fungicides differed from the control, reducing the average 85% the severity macrospora spot compared to control. In the curative control all fungicides differed from the control, but mixtures of triazole + strobilurin showed greater efficiency, reducing an average of 75% disease severity, whereas the isolated products as the strobirulins reduced 62%, benzimidazoles 55% and triazoles 38% . The fungicide tebuconazole, and mixtures of triazoles + strobilurins, reduced on average 68% expansion of the macrospora spot, and 58.7% the formation of pycnidia cm2-1. It although no resistant hybrid was found genetic variability exists among the hybrids tested and that the application of fungicides significantly reduced the severity of the macrospora spot / A mancha-de-macrospora, causada pelo fungo Stenocarpella macrospora, tem se tornado uma das doenças mais importantes na cultura do milho nos últimos anos no Brasil. Os objetivos do trabalho foram: a) avaliar a resistência de híbridos de milho a mancha-demacrospora; b) determinar a sensibilidade de S. macrospora a fungicidas pela inibição do crescimento do micélio e germinação de conídios; c) avaliar o controle protetor e curativo da doença em plantas jovens de milho; d) quantificar o efeito de fungicidas na expansão da mancha-de-macrospora. Quanto a resistência foram avaliados 52 híbridos e dois isolados do fungo. A inoculação foi feita no estádio fenológico V2, depositando em cada planta 0,2 mL da suspensão de 7x104 conídios mL-1. A severidade da doença foi avaliada aos 14 dias após a inoculação. Quanto à sensibilidade de S. macrospora in vitro foram avaliados 12 fungicidas, seis concentrações e dois isolados do fungo. A porcentagem de inibição do crescimento micelial e germinação de conídios foi calculada em relação à testemunha, estimando-se valores de concentração inibitória de 50% (CI50). A eficiência de fungicidas no controle protetor e curativo foi determinada em casa-de-vegetação, com o isolado de SC e o híbrido AS1565. Foram avaliados 16 fungicidas, aplicados no estádio V2. No controle preventivo a inoculação de 0,2 mL da suspensão de 7x104 conídios mL-1 foi realizada 48 horas depois da aplicação. No controle curativo a inoculação foi realizada 48 horas antes da aplicação. A severidade da doença foi determinada 21 dias após a inoculação. No controle da expansão da mancha-de-macrospora foram avaliados sete fungicidas aplicados diretamente em folhas de milho AS 1565 com lesões foliares. As lesões foram mensuradas a cada três dias por um período de 27 dias. Em cada lesão também foram quantificados o número de picnídios cm2-1. Houve diferença significativa na severidade entre os híbridos. Não houve efeito significativo dos isolados do fungo sobre a severidade da doença. Não foi encontrado nenhum híbrido resistente. A severidade da doença variou de 8,88% para o híbrido 30A30HX a 17,76% para o AO 1050. Foi constatado que os fungicidas testados foram eficazes na inibição do crescimento do micélio, sendo que a CI50 foi menor que 1 ppm para todos os fungicidas, não havendo diferença entre isolados. Na inibição da germinação de conídios as estrobilurinas apresentaram maior fungitoxicidade, pois a CI50 ficou entre 0,0035 e 0,03 ppm, sendo que o isolado de SC mostrou maior sensibilidade aos fungicidas. Na aplicação preventiva todos os fungicidas diferiram da testemunha, reduzindo em média 85% à severidade da mancha-demacrospora em relação à testemunha. No controle curativo todos os fungicidas diferiram da testemunha, contudo as misturas de triazóis + estrobilurinas mostraram maior eficácia, reduzindo em média 75% a severidade da doença, enquanto que os produtos isolados como as estrobilurinas reduziram 62%, benzimidazóis 55% e triazóis 38%. O fungicida tebuconazole e as misturas de triazóis + estrobilurinas, reduziram em média 68% a expansão da mancha-demacrospora, e 58,7% a formação de picnídio cm2 -1. Foi constatado que apesar de não haver híbridos resistentes existe variabilidade genética entre os híbridos testados e que a aplicação de fungicidas reduz significativamente a severidade da mancha-de-macrospora

Made available in DSpace on 2016-12-08T16:44:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGPV12MA104.pdf: 3071931 bytes, checksum: 12c25e131b1ed773136ed462f974fe61 (MD5) Previous issue date: 2012-07-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The rust (Puccinia hemerocallidis Thuem) is the main disease of daylily. In Brazil, there are no registered fungicides to control this disease and there are no studies indicating the more resistant cultivars. The study aimed to verify, on field conditions, the effectiveness of fungicides mixtures and rock dust on the control of rust and on the agronomic characteristics of five cultivars the daylily, identify the resistance degree of this cultivars to rust, as well to verify, in vitro, the efficacy of seven fungicides and rock dust on the germination inhibition of P. hemerocallidis urediniospore. The experiments were conducted at the Center of Agroveterinaries Sciences, CAV/UDESC in Lages, SC. On field conditions evaluated the cultivars Cora Offer, Daniela Esther Nass, Hariet, Margaret Mee and São Paulo and the products rock dust, pyraclostrobin + epoxiconazole, trifloxystrobin + tebuconazole, picoxystrobin + cyproconazole and azoxystrobin + cyproconazole. The fungicides were applied every thirty days for a total of three applications and the rock dust was applied every seven days for a total of thirteen applications. Weekly were quantified the incidence and severity of rust on leaves and through these data were calculated the Area Under Disease Progress Curve (AUDPC). It was also evaluated number of leaves, of flowers and of tillers. It was observed that all mixtures of fungicides reduced the disease incidence and severity, as well, delayed leaf senescence process. The mixtures pyraclostrobin + epoxiconazole, trifloxystrobin + tebuconazole and picoxystrobin + cyproconazole provided higher number of flowers the plants. The rock dust reduced the severity of the disease, but had lowest control in relation to fungicides mixtures, besides had not increased in none agronomic characteristics. The cultivar Daniela Esther Nass had the lowest incidence and severity of rust and the smallest reduction in number of leaves. The cultivar Daniela Esther Nass was classified as moderately resistant/resistant to rust, the Cora Offer as moderately susceptible/ susceptible, the Hariet and Margaret Mee as susceptible, and São Paulo as very susceptible. In the in vitro assay were evaluated the products azoxystrobin, picoxystrobin, pyraclostrobin, trifloxystrobin, cyproconazole, epoxiconazole, tebuconazole and rock dust at concentrations of 0, 0.01, 0.1, 1, 10 and 100 mg L-1. The products were diluted and mixed in a water-agar media, and stored at 4°C for 24 hours. Was added 0.5 mL of a suspension containing urediniospore of P. hemerocallidis and the incubation was at 22°C, in the dark, for 6 hours. The IC50 values were within the range of 0.01 to 0.1 mg L-1 for fungicides of the strobilurin chemical group; between 0.1 and 1 mg L-1 to tebuconazole; between 1 and 10 mg. L-1 to epoxiconazole, and between 10 and 100 mg. L-1 to cyproconazole and rock dust. The CI100 was observed only in fungicides azoxystrobin and picoxystrobin. It was concluded that all fungicides of the strobilurin chemical group and tebuconazole showed highly toxicity to urediniospores of the P. hemerocallidis, and fungicides epoxiconazole and cyproconazole, such as the rock dust had moderately toxicity this pathogen / A ferrugem (Puccinia hemerocallidis) é a principal doença do hemerocale. No Brasil, não há fungicidas registrados para o controle desta doença e também não há trabalhos indicando quais as cultivares mais resistentes. O trabalho teve como objetivos verificar, a campo, a eficácia de mistura de fungicidas e do pó de rocha no controle da ferrugem e nas características agronômicas de cinco cultivares de hemerocale, identificar o grau de resistência destas cultivares à ferrugem e também verificar, in vitro, a eficácia de sete fungicidas e do pó de rocha na inibição da germinação de uredosporos de P. hemerocallidis. Os experimentos foram conduzidos no Centro de Ciências Agroveterinárias, CAV/UDESC, em Lages, SC. A campo, avaliou-se as cultivares Cora Offer, Daniela Esther Nass, Hariet, Margaret Mee e São Paulo e os produtos pó de rocha, piraclostrobina + epoxiconazol, trifloxistrobina + tebuconazol, picoxistrobina + ciproconazol e azoxistrobina + ciproconazol. Os fungicidas foram aplicados a cada trinta dias, num total de três aplicações e o pó de rocha a cada sete dias, num total de treze aplicações. Semanalmente quantificou-se a incidência e a severidade da ferrugem em folhas e através destas calculou-se a Área Abaixo da Curva de Progresso da Doença (AACPD). Avaliou-se ainda o número de folhas, de flores e de afilhos. Observou-se que todas as misturas de fungicidas reduziram a incidência e a severidade da ferrugem, bem como retardaram o processo de senescência das folhas. As misturas piraclostrobina + epoxiconazol, trifloxistrobina + tebuconazol e picoxistrobina + ciproconazol propiciaram maior número de flores as plantas. O pó de rocha reduziu a severidade da doença, mas apresentou menor controle em relação as misturas de fungicidas, além disso, não apresentou incremento em nenhuma característica agronômica. A cultivar Daniela Esther Nass apresentou a menor incidência e severidade à ferrugem e a menor redução no número de folhas. A cultivar Daniela Esther Nass foi classificada como moderadamente resistente/resistente à ferrugem, a Cora Offer como moderadamente suscetível/suscetível, a Hariet e a Margaret Mee como suscetíveis, e a São Paulo como altamente suscetível. No ensaio in vitro foram avaliados os produtos azoxistrobina, picoxistrobina, piraclostrobina, trifloxistrobina, ciproconazol, epoxiconazol, tebuconazol e pó de rocha nas concentrações de 0; 0,01; 0,1; 1; 10 e 100 mg.L-1. Os produtos foram diluídos e misturados em meio de ágar-água e armazenadas a 4ºC durante 24 horas. Adicionou-se 0,5 mL de uma suspensão contendo uredosporos de P. hemerocallidis e a incubação foi a 22ºC, no escuro, durante 6 horas. As CI50 ficaram num intervalo entre 0,01 e 0,1 mg.L-1 para os fungicidas do grupo químico das estrobilurinas; entre 0,1 e 1 mg.L-1 para o tebuconazol; entre 1 e 10 mg.L-1 para o epoxiconazol; e entre 10 e 100 mg. L-1 para o ciproconazol e o pó de rocha. A CI100 foi observada apenas nos fungicidas azoxistrobina e picoxistrobina. Todos os fungicidas do grupo químico das estrobilurinas e o tebuconazol apresentaram elevada fungitoxicidade a uredosporos de P. hemerocallidis; e os fungicidas ciproconazol e epoxiconazol, bem como o pó de rocha apresentaram ação moderadamente fungitóxica a este patógeno

Made available in DSpace on 2016-12-08T16:44:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGPV13MA115.pdf: 363959 bytes, checksum: 6e95b30ef3170c9a81eb55320f07a3ed (MD5) Previous issue date: 2013-02-21 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The importance of pathogens that infect corn crop is a major obstacle to the continued increase in crop yield. Genetic resistance is a major strategy for disease control, however, in Brazil there is no information maize cultivars resistant to macrospora spot caused by the fungus Stenocarpella macrospora. With the objective to evaluate the resistance of different cultivars to macrospora spot, the impact of their occurrence on yield and quality of grain, get an ideal concentration of conidial S. macrospora to beused for inoculation of corn and investigate whether there are differences in disease severity from isolates of the fungus were developed four experiments. The first experiment tested six xoncentration: 0,60, 120, 180, 240 and 300 000 conidia mL-1 and the second tested isolates drom the regions of Vacaria, Passo Fundo, São Valentim, Campinas do Sul, state of Rio Grande do Sul, and Quilombo e Lages, Santa Catarina state, and Pato Branco, Paraná state. The inoculum concentration data were subjected to regression analysis (P <0.05) while data from different isolates were submitted to Tukey test (P <0.05). the third study was conducted in a greenhouse, in 2011, with 92 cultivars and three isolates of the fungus and mountainous regions west of the State of Santa Catarina (OSC and SSC) and Campos de Cima da Serra of the State of Rio Grande do Sul (CCSRS). It was used a completely randomized designs with five replicates. It was evaluated the severity of the macrospora spot 21 days after inoculation. Data were analyzed by ANOVA and means were compared by the Scott Knott test (P <0.05) and genotype groups responses being analyzed by orthogonal contrast (P <0.05). the fourth experiment was conducted in the field in Lages, SC, 2011/2012 season, with eigth genotypes: CD 393, NBX 920YG, TORK TL, AS 1565, DKB 240YG, SG 6304YG, P30F53YG and SCS 155 CATARINA under inoculating conidia of S. macrospora in different stages (V10, V12 and tasseling) and a control. It was evaluated the incidence of white rot cob, percentage of rot grains, thousand grain weigth and grain yield. Data were analyzed by analysis of variance and then by Tukey test (P <0.005). Dunnett s test was conducted to compare the stages of inoculation with control for each hybrid. The results in these experiments have revealed that there was infection and expression of symptoms in all cultivars, differing in severity. The hybrids showed uo for the three most resistant isolates, indicating that the gratest genetic variability of VPA and HD did not guarantee greater resistance to macrospora spot. It was also verified differneces in aggressiveness among isolates from different regions, being isolated from the Quilombo showed that on average greater disease severity, for this isolated significant difference between transgenic and conventional cultivars. It can be confirmed that was not detected complete resistance to S. macrospora. From the regression analysis it was determined that with 180.000 conidia ml-1 was reached maximum severity. Of the eighjt hybrids tested, five had decreased productivity when inoculated with S. macrospora. For all hybrids increased incidence of white rot cob and rot grains compared stages of inoculation with the witness (check) and as the stadium came from tasseling inoculation increased the percentage of rot cob and rot grain. It was demonstrated in this study that there is genetic variation for resistance to white rot cob caused by S. macrospora with inoculum derived from leaf lesions / A importância dos patógenos que infectam a cultura do milho constitui um dos principais entraves para o contínuo aumento na produtividade da cultura. A resistência genética é uma das principais estratégias de controle de doenças foliares, no entanto, no Brasil não há informações de cultivares de milho resistente à mancha de macrospora causada pelo fungo Stenocarpella macrospora. Com o objetivo de avaliar a resistência de diferentes cultivares comerciais à mancha de macrospora, o impacto da sua ocorrência na produtividade e qualidade de grãos, obter uma concentração ideal de conídios de S. macrospora a ser utilizada na inoculação do milho e investigar se há diferença na severidade da doença a partir de isolados do fungo foram desenvolvidos quatro experimentos. O primeiro experimento testou seis concentrações de conídios: 0, 60, 120, 180, 240 e 300 mil conídios mL-1 e o segundo testou isolados oriundos das regiões de Vacaria, Passo Fundo, São Valentim, Campinas do Sul, Estado do Rio Grande do Sul, Lages e Quilombo, Estado de Santa Catarina, e Pato Branco, Estado do Paraná. Os dados de concentração de inóculo foram submetidos à análise de regressão (P<0,05) enquanto os dados dos diferentes isolados foram submetidos ao teste de Tukey (P<0,05). O terceiro trabalho foi conduzido em casa de vegetação, no ano de 2011, com 92 cultivares e três isolados do fungo das regiões Oeste e Serrana do Estado de Santa Catarina (OSC e SSC) e Campos de Cima da Serra do Estado do Rio Grande do Sul (CCSRS). Utilizou-se delineamento experimental inteiramente casualizado com cinco repetições. Avaliou-se a severidade da mancha de macrospora aos 21 dias após a inoculação. Os dados foram submetidos à ANOVA e as médias comparadas pelo teste de Scott Knott (P<0,05), respostas ente grupos de genótipos analisadas por contraste ortogonal (P<0,05). O quarto experimento foi realizado a campo no município de Lages, SC, safra 2011/2012, com oito genótipos: CD 393, NBX 920YG, TORK TL, AS 1565, DKB 240YG, SG 6304YG, P30F53YG e SCS 155 CATARINA, sob inoculação de conídios de S. macrospora em diferentes estádios de (V10, V12 e Pendoamento) e uma testemunha. Avaliaram-se incidência de podridão branca de espiga, porcentagem de grãos ardidos, massa de mil grãos e rendimento de grãos. Os dados foram analisados por meio de análise de variância e posteriormente por teste de Tukey (P<0,05). Foi realizado teste de Dunnett para comparação dos estádios de inoculação com a testemunha, para cada híbrido. Os resultados obtidos em tais experimentos permitem afirmar que houve infecção e expressão de sintomas em todas cultivares avaliadas, diferindo no nível de severidade. Os híbridos simples demonstraram-se mais resistentes para os três isolados, demonstrando que a maior variabilidade genética da VPA e do HD não garantiu maior resistência à mancha de macrospora. Foi verificado também diferenças de agressividade entre os isolados de regiões diferentes, sendo o isolado de Quilombo o que apresentou na média maior severidade da doença. Para este isolado houve diferença significativa entre cultivares transgênicas e convencionais. Pode-se confirmar que não foi detectada resistência completa à S. macrospora. A partir da análise de regressão determinouse que com 180 mil conídios mL-1 foi alcançada máxima severidade. Dos oito híbridos avaliados, cinco apresentaram queda de produtividade quando foram inoculados com S. macrospora. Para todos os híbridos houve aumento de podridão branca da espiga e grãos ardidos quando comparados os estádios de inoculação com a testemunha e conforme o estádio de inoculação se aproximou do pendoamento aumentou espigas doentes e grãos ardidos. Ficou evidenciado neste estudo que existe variabilidade genética para resistência a podridão da espiga causada por S. macrospora com inóculo oriundo das lesões foliares

Este estudo teve por objetivo analisar e comparar metodologias estatísticas para fins de mapeamento de QTL associados à resistência a ectoparasitas em bovinos. Os animais, submetidos à infestação artificial, foram periodicamente avaliados por contagens, como número de carrapatos. Estes dados se caracterizam como medidas repetidas e, via de regra, não atendem ou atendem parcialmente as exigências usuais da análise, para mapeamento de QTL, dentre elas a de apresentar distribuição normal e independência dos erros. Ainda não está bem definido qual seria a melhor estratégia para analisar dados com o perfil descrito. Algumas alternativas seriam transformações de dados que permitam o uso dos programas já disponíveis, ou o desenvolvimento de programas que utilizem outras distribuições como Poisson ou Poisson inflada de zeros (ZIP). Esta proposta está inserida na parceria entre EMBRAPA - Gado de Leite e a ESALQ/USP, para desenvolvimento do projeto de mapeamento de QTL em bovinos mestiços (Gir x Holandês), para várias características incluindo a resistência a parasitas. Foram utilizados 263 animais F2, genotipados com 5 marcadores moleculares no cromossomo 23, na tentativa de mapear QTL para característica de resistência a carrapatos. Dados coletados naquela população F2 e dados simulados em diferentes cenários, serão a base para a comparação de estratégias de análise e mapeamento de QTL. Os modelos de mapeamento clássico, assim como a utilização de transformações dos dados originais foram comparados a modelos de regressão Poisson e modelo ZIP. Os modelos Poisson e ZIP apresentaram os melhores resultados quando trabalhamos com dados de contagem inflacionados de zeros, porém em outros cenários a transformação dos dados originais se mostrou igualmente eficiente. Dependendo do propósito do mapeamento (seja ele localizar ou estimar o efeito), cada modelo possui suas vantagens e suas limitações. Assim, sempre é recomendável uma prévia análise descritiva dos dados para que o melhor modelo seja utilizado. / This study has as main objective to analyze and compare statistical approaches to QTL mapping for parasites resistance in bovines. The animals, under artificial infestation, were periodically evaluated by counting, as ticks count. These data are characterized as repeated measures and, usually, dont follow or partially follow the usual requirements for the analysis, for QTL mapping, that is to present normal distribution and error independence. It is not clear yet which will be the best strategy to analyze this kind of data. Some alternatives could be data transformation that allows the use of software available on the web, or the development of specific programs that use other types of distribution like Poisson or Zero Inflated Poisson (ZIP).This work is an association between EMBRAPA Gado de Leite and ESALQ/USP, to the development of the QTL mapping project for crossbred bovines (Gyr x Holstein), for different characteristics including the parasite resistance. Were used 263 animals F2, genotyped for 5 molecular markers on the chromosome 23, aiming to map QTL for characteristics of parasite resistance. Data collected on this F2 population and simulated data in different scenarios will be the base for the strategies of the QTL mapping approaches comparison. The classical mapping models and the use of data transformation of the original data were compared to Poisson regression and ZIP models. The Poisson and ZIP models presented the best results when working with zero inflated count data however in some other scenarios the data transformation showed similar efficiency. Depending on the purpose of the mapping (this meaning locate or estimate the QTL effect) each model has its vantages and its limitations. This way, it is always advisable to make a previous descriptive analysis of the data to better choose the model.

A produção brasileira de laranjas destina-se à indústria de suco concentrado, principal produto citrícola, sendo o estado de São Paulo o maior produtor e exportador do país. Devido à diminuição da variabilidade genética causada pela multiplicação de plantas cítricas por enxertia, esta cultura se tornou alvo constante de inúmeras pragas e doenças. Dentre estas doenças que vem causando crescentes prejuízos para a citricultura brasileira destaca-se a pinta preta causada pelo fungo Guignardia citricarpa Kiely. O combate desta doença é feito por inúmeras pulverizações de fungicidas que aumenta significativamente o custo para os produtores. Uma possível alternativa para o combate a este patógeno seria a produção de plantas cítricas resistentes a doença, através de transformação gênica. Mas para isto, é necessário conhecer os mecanismos de respostas de defesa da planta e identificar quais genes podem estar relacionados com a defesa. Na tentativa de elucidar as respostas de defesa deste hospedeiro foram feitas análises anatômicas de frutos de laranja doce (Citrus sinensis Osbeck cv. Pêra) inoculados com o patógeno e análise transcricional de duas bibliotecas de cDNA, uma de albedo de frutos sadios(BAFS) e outra de albedo de frutos inoculados com o patógeno (BAFC). As análises anatômicas mostraram que os danos causados pelo patógeno na planta iniciam-se 24 horas após a inoculação com as lesões das células do epicarpo, e continuam gradativamente até 72 horas apresentando a diminuição na quantidade de amido e acúmulo de compostos fenólicos. Foi obtido 184 ESTs válidas da BAFS e 370 da BAF. A anotação e categorização destas sequencias apresentaram que o perfil transcricional encontrado nas duas bibliotecas foi semelhante, porém, na BAFC, foram encontrados transcritos pertencentes à defesa da planta como a catalase, a glutationa e monooxygenases. Está analise mostrou que a resposta de defesa da planta inicia-se com lesões nas células, que a interação é custo-intensiva (redução da reserva de amido) para o hospedeiro, e que a defesa da planta está relacionada a muitos genes de defesa. / The Brazilian production of oranges is mainly for the industry of concentrated juice, it is the most important citrus product, and the state of São Paulo is the largest producer and exporter of the country. Due to the low genetic variability caused by the multiplication of citrus plants by grafting, this culture became constant target of many pests and diseases. Among all the diseases that lead to elevated damage to the Brazilian citrus plantation, one is very relevant, the Black Spot disease caused by the fungus Guignardia citricarpa Kiely. The control of this disease is done by many sprays of fungicides that significantly increase the production cost to the producers. A possible alternative to control this pathogen is the development of resistant citrus plants to disease through genetic transformation. To that, it is necessary to understand the mechanisms of plant defense response and identify the genes related to the defense. In an attempt to elucidate the responses of this host both,anatomical analysis of sweet orange fruits (Citrus sinensis Osbeck cv. Pêra) inoculated with the pathogen and transcriptional analysis of two cDNA libraries of albedo section were done. One was from health fruits (BAFS) and another from albedo of fruits inoculated with the pathogen (BAFC). The analysis showed that the anatomical damage caused by the pathogen in the plant shall begin 24 hours after inoculation showing lesions on epicarp cells, and continue gradually until 72 hours also showing a decrease in the amount of starch and accumulation of phenolic compounds. It was obtained 184 valid ESTs of the BAFS and 370 from BAFC. The annotation and categorization of these sequences showed that the transcriptional profile in the two libraries were similar, however, in BAFC, were found transcripts belonging to plant defense such as catalase, the glutathione and monooxygenases. These analyses showed that the plant defense response begins with lesions in the cells, being it cost-intensive interaction for the host, (with reduction of starch reserves) and the plant defense to resistance is related to many genes.