Made available in DSpace on 2014-06-11T19:31:05Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-03-16Bitstream added on 2014-06-13T20:21:50Z : No. of bitstreams: 1 smaniotto_ei_dr_mar.pdf: 710146 bytes, checksum: 068a0f1aaf3bce2c3777543efde2b9f0 (MD5) / Este trabalho tem por objetivo contribuir para as pesquisas referentes ao movimento científico e social conhecido como eugenia, a partir da análise de obras brasileiras de ficção científica publicadas na primeira metade do século XX, particularmente entre os anos de 1922 a 1949. A partir de algumas obras representativas, segundo a crítica especializada da época, buscamos verificar a forma com que o pensamento eugênico foi incorporado às narrativas de ficção científica, dando forma à representação ficcional de mundos utópicos eugenistas. Mapearemos e estudaremos a apropriação da ciência e do pensamento social desses intelectuais eugenistas pelos escritores brasileiros de ficção científica, no período de 1922 a 1949, possibilitando compreender as formas com as quais o discurso eugênico foi incorporado à literatura brasileira e, posteriormente, difundido por ela. Para tanto, buscamos entender os limites da eugenia como ciência, as diferentes formas do gênero ficção científica e as formas de interação entre literatura de ficção científica e eugenia no Brasil e nos Estados Unidos. Dessa forma, teremos um amplo aspecto das interações entre o pensamento social eugenista e o campo literário no Brasil. Sendo assim, os textos literários, a serem abordados no decorrer de nossa pesquisa, possibilitarão identificarmos a transposição do discurso científico eugenista para a literatura de ficção científica, na primeira metade do século XX / This work aims to contribute to research concerning the scientific and social movement known as eugenics, from the analysis of Brazilian science fiction works that were published in the first half of the twentieth century, particularly at the years 1922 to 1949. From some representative works, according to specialized critics of the age, we seek to verify the way the eugenic thinking was incorporated into the science-fiction stories, forming the fictional representation of utopian eugenicist worlds. We shal map and study the appropriation of science and social thought of these intellectual eugenicists by Brazilian writers of science fiction at the period 1922 to 1949, making possible to understand the ways which eugenic discourse was incorporated into Brazilian literature and posteriorly spread by it. Therefore we seek to understand the limits of eugenics as a science, the different forms of the science fiction genre and the forms of interaction between science fiction literature and eugenics in Brazil and the United States. Thus we will have an ample aspect of interactions between the eugenicist social thought and literary field in Brazil. In such case, the literary texts, which will be discussed during our research, will enable identifying the transposition of eugenicist scientific discourse to the science fiction literature in the first half of the twentieth century

Made available in DSpace on 2013-08-07T18:41:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000426061-Texto+Completo-0.pdf: 815660 bytes, checksum: a63907607c66f42025ef148afc7c6471 (MD5) Previous issue date: 2010 / The neurotrophic factor known as BDNF has attracted considerable attention in the scientific literature, due to its involvment in critical processes related to the development and regulation of the nervous system. However, many aspects of this molecule are still unknown, while others have only been investigated in humans and model organisms. In this context, bioinformatic tools can be very useful to perform comparative analyses focusing on evolutionary, structural and functional aspects of this protein. This study aimed to characterize the patterns of conservation and variability in this molecule through the comparison of coding sequences in different mammalian lineages, as well as to investigate structural aspects by constructing a novel 3D model of a BDNF homodimer that is consistent with experimentally validated data. Our results revealed very interesting patterns of conservation and variability in different lineages, including strong evidence for the occurrence of negative natural selection (indicating constraints to evolutionary change implying functional relevance) in both the mature and the pro domains. In addition, we observed evidence of positive selection (induction of changes that are likely adaptive) in different lineages, in every case directly affecting the pro domain. These results indicate that the pro domain presents great functional relevance, and highlight the importance of focusing research efforts on this portion of BDNF. / O fator neurotrófico conhecido como BDNF tem atraído considerável atenção na literatura científica, pelo seu envolvimento em processos cruciais de desenvolvimento e regulação do sistema nervoso. Entretanto, muitos aspectos desta molécula são ainda desconhecidos, enquanto outros foram investigados apenas em humanos e organismos-modelo. Neste contexto, ferramentas de bioinformática podem ser muito úteis para realizar análises comparativas enfocando aspectos evolutivos, estruturais e funcionais. Este projeto objetivou uma caracterização de padrões de conservação e variação desta molécula através da comparação das seqüências codificantes deste gene em diferentes linhagens de mamíferos, assim como uma investigação de aspectos estruturais através da construção de um modelo 3D do BDNF consistente com dados experimentais. Os resultados revelam padrões bastante interessantes de conservação e variação de sequência em diferentes linhagens, incluindo fortes evidências da ocorrência de seleção natural negativa (indicando restrição à mudança devido à relevância funcional) tanto no domínio maduro como no domínio pro. Além disso, observou-se evidência de seleção positiva (indução de mudanças possivelmente adaptativas) em diferentes linhagens, em todos os casos afetando diretamente o domínio pro. Estes resultados indicam que o domínio pro apresenta grande relevância funcional, e salientam a importância de focar esforços de investigação experimental nesta porção do BDNF.

Orientador: Ana Maria de Andrade Caldeira / Banca: Fernanda Aparecida Meglhioratti / Banca: João José Caluzi / Resumo: A aprendizagem de evolução biológica é permeada por dificuldades referentes aos conceitos evolutivas que são frequentemente entendidos de forma equivocada, sendo que tais dificuldades são comumente tratadas por pesquisas que apontam concepções alternativas como obstáculos para o entendimento da teoria evolutiva. O pensamento teleológico é uma das dificuldades, cuja importância no ensino de evolução biológica será explorada nesse trabalho por meio de um estudo teórico e de uma investigação empírica, que possibilitaram explorar tanto as possibilidades de emprego da teleologia na interpretação da biologia quanto os empregos equivocados no discurso de estudantes da graduação de Ciências Biológicas. A obtenção de dados foi viabilizada pela gravação de áudios e aplicação de questionário escrito durante os encontros do Grupo de Pesquisa em Epistemologia da Biologia, cujos participantes eram graduandos de licenciatura em Ciências Biológicas. A análise dos dados foi realizada por meio da metodologia de análise de conteúdo e as concepções dos alunos foram classificadas cronologicamente em zonas de um perfil conceitual. As discussões convergem para a aceitação da teleologia no entendimento das causas próximas da biologia e para a rejeição nas causas últimas (evolução). A análise dos dados permitiu a identificação da presença de concepções teleológicas nas formulações dos graduandos e a análise da evolução conceitual (durante os encontros do grupo de discussão) aponta para uma tendência... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The learning of biological evolution is permeated by difficulties concerning evolutionary concepts which are often misunderstood, and such difficulties are commonly covered by research which points to alternative conceptions as obstacles to the understanding of evolutionary theory. The teleological thought is one of the difficulties, whose importance on the teaching of biological evolution will be explored in this paperwork through a theoretical study and an empirical investigation, which made it possible to explore both the possibilities of teleology in the interpretation of biology and the mistaken use in the Speech of undergraduate students of Biological Sciences. The data collection was made possible by the recording of audios and the application of a written questionnaire during the meetings of the Research Group on Epistemology of Biology, whose participants were undergraduate students in Biological Sciences. Data analysis was performed using content analysis methodology and students' conceptions were chronologically classified in zones of a conceptual profile. The discussions converge towards the acceptance of teleology on the understanding of the proximate causes of biology and for rejection in ultimate causes (evolution). Data analysis allowed the identification of the presence of teleological conceptions in the formulations of the undergraduate students and the analysis of the conceptual evolution (during the meetings of the discussion group) points to a tendency of... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:21:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 3272.pdf: 1459537 bytes, checksum: 78eeb30fb7d9022c1a6c97b55c565d47 (MD5) Previous issue date: 2010-08-02 / Financiadora de Estudos e Projetos / The genus Anastrepha is the largest in the family Tephritidae (Trypetinae, Toxotrypanini). The construction of cDNA libraries is important for identifying new genes and establishing genetic markers on non-models organisms such as the genus Anastrepha. Among the proteins involved in reproduction, we can cite those belonging cascade sexual and those responsible for forming the eggshell. The purpose of this study was to build a cDNA library from a pool of female reproductive tissues Anastrepha obliqua to breed ESTs, to search for genes with a high evolutionary rate, focusing on chorionic and vitelline proteins. We were sequenced 2304 clones obtained from the reproductive tissues of female flies Anastrepha obliqua. In total, 310 contigs and 506 singlets were generated wich were classified into different proteins classes. The chorionic proteins and Sxl revealed to be under selection positive as well as the vitelline Vm 26Aa ', which was possibly generated by a gene duplication of Vm 26aa, while Tra2 seems under purifying selection. The inference of the secondary structure of proteins studied revealed that the sites under positive selection were present on outside membrane. The population analysis of genes chorionic, vitelline, Sxl and Tra2 revealed no separation between the 3 species, although in some situations have occurred separation between some of the haplotypes for a single specie. With these results, it was possible to identify new genes, make the full sequencing for some vitelline and chorionic genes on pools of other species of Anastrepha, and we also identified that some of these genes are under positive selection pressure. / O gênero Anastrepha é o maior dentro da família Tephritidae (Trypetinae, Toxotrypanini). A construção de bibliotecas de cDNA é importante para a identificação de novos genes e no estabelecimento de marcadores genéticos em organismos não-modelos como do gênero Anastrepha. Dentre as proteínas envolvidas na reprodução podemos citar as pertencentes da cascata sexual e as que são responsáveis por formar a parede do ovo. Assim, este trabalho teve como objetivo construir uma biblioteca de cDNA a partir de um pool de tecidos reprodutivos femininos de Anastrepha obliqua para gerar ESTs, afim de buscar genes com alta taxa evolutiva, focando em proteínas coriônicas e vitelínicas. No Total foram seqüenciados 2304 clones obtidos a partir dos órgãos reprodutivos de fêmeas de moscas de Anastrepha obliqua. Ao todo foram gerados 310 contigs e 506 singlets que foram classificados em diferentes classes de proteínas. As proteínas coriônicas e o Sxl revelaram estar sob seleção positiva, assim como a vitelínica Vm 26Aa´ que possivelmente foi gerada por uma duplicação gênica do Vm 26Aa, enquanto que o Tra2 parece estar sob seleção purificadora. A inferência da estrutura secundária das proteínas estudadas revelou que os sítios sob seleção positiva estavam presentes do lado externo da membrana. As análises populacionais dos genes coriônicos, vitelínicos, Sxl e Tra2 não revelaram uma separação entre as 3 espécies, apesar de em algumas situações ter ocorrido uma separação entre alguns dos haplótipos para uma determinada espécie. Com resultados obtidos, foi possível identificar novos genes, fazer o seqüenciamento completo para alguns genes coriônicos e vitelínicos em pools de outras espécies de Anastrepha, e também foi possível identificar que alguns destes genes estão sob pressão de seleção positiva.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, 2017. / Submitted by Raiane Silva (raianesilva@bce.unb.br) on 2017-07-19T20:02:21Z No. of bitstreams: 1 2017_LeonardoBragaCastilho.pdf: 670210 bytes, checksum: 11cb21f594fb223c5497115770d3833c (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2017-09-11T14:56:42Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2017_LeonardoBragaCastilho.pdf: 670210 bytes, checksum: 11cb21f594fb223c5497115770d3833c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-09-11T14:56:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2017_LeonardoBragaCastilho.pdf: 670210 bytes, checksum: 11cb21f594fb223c5497115770d3833c (MD5) Previous issue date: 2017-09-11 / A seleção sexual é uma vertente da seleção natural que explica o surgimento de características morfológicas e comportamentais especializadas para o comportamento reprodutivo. Muitas dessas características são tidas como importantes no processo de escolha de parceiros em várias espécies animais. Nesta tese, o comportamento reprodutivo da aranha papa-moscas Hasariusadansoni (Araneae: Salticidae) foi descrita em detalhes pela primeira vez. Em seguida, o processo de seleção sexual foi estudado, em especial averiguando-se a presença de preferências por fenótipos específicos de parceiros nos níveis populacional e individual. Uma das mais importantes hipóteses da teoria de seleção sexual, a hipótese da desvantagem, foi também testada explicitamente. A espécie estudada apresenta comportamento reprodutivo semelhante àquele já descrito para outras espécies da mesma família, incluindo ornamentos coloridos (i.e.: manchas brancas nos pedipalpos dos machos) mostrados para as fêmeas durante a corte, e vibração abdominal por parte de ambos os sexos durante o cortejo. Não foi detectada qualquer preferência de machos por fenótipos específicos de fêmeas, nem preferências de fêmeas por fenótipos específicos de machos.No entanto, as fêmeas apresentaram fortes tendências individuais para escolha de parceiros. Os machos da espécie não seguem o modelo da desvantagem. Este é um primeiro passo no estudo do comportamento reprodutivo de H. adansoni e estudos futuros buscarão focar em dados colorimétricos e vibracionais como características candidatas para serem alvo de escolha das fêmeas, já que tais características não puderam ser abordadas com mais detalhes neste estudo. / Sexual selection is a branch of natural selection that explains the origin of specialized morphological and behavioral characters important during reproductive behavior. Many of those characters are thought to be important in the process of mate choice in many animal species. In this theses, the sexual behavior of the jumping spider Hasariusadansoni (Araneae: Salticidae) was described in detail for the first time. Then, the process of sexual selection was assessed, in particular, we assessed the presence of preference for specific phenotypes in sexual partners in the population and individual levels. One of the most important hypothesis in the sexual selection theory, the handicap hypothesis, was also explicit tested. The study species shows sexual behavior similar to those already described for other species in the same family, including colored ornaments (i.e.: white patches in males’ palps) show to females during courtship, and abdominal vibrations by both sexes during courtship. We were unable to detect any male preference for specific females phenotypes, or female preferences for specific males genotypes. However, females presented strong individual tendencies for mate choice. Males do not follow the handicap hypothesis.This is a first step in the study of the sexual behavior of H. adansoni and future studies will assess colorimetric and vibrational data, since these characters could not be studied in this thesis.

Orientador: Christina de Rezende Rubim / Banca: Andréas Hofbauer / Banca: Aluisio Almeida Schumacher / Banca: Carlos Alberto Machado / Banca: Edgar Silveira Franco / Resumo: Este trabalho tem por objetivo contribuir para as pesquisas referentes ao movimento científico e social conhecido como eugenia, a partir da análise de obras brasileiras de ficção científica publicadas na primeira metade do século XX, particularmente entre os anos de 1922 a 1949. A partir de algumas obras representativas, segundo a crítica especializada da época, buscamos verificar a forma com que o pensamento eugênico foi incorporado às narrativas de ficção científica, dando forma à representação ficcional de mundos utópicos eugenistas. Mapearemos e estudaremos a apropriação da ciência e do pensamento social desses intelectuais eugenistas pelos escritores brasileiros de ficção científica, no período de 1922 a 1949, possibilitando compreender as formas com as quais o discurso eugênico foi incorporado à literatura brasileira e, posteriormente, difundido por ela. Para tanto, buscamos entender os limites da eugenia como ciência, as diferentes formas do gênero ficção científica e as formas de interação entre literatura de ficção científica e eugenia no Brasil e nos Estados Unidos. Dessa forma, teremos um amplo aspecto das interações entre o pensamento social eugenista e o campo literário no Brasil. Sendo assim, os textos literários, a serem abordados no decorrer de nossa pesquisa, possibilitarão identificarmos a transposição do discurso científico eugenista para a literatura de ficção científica, na primeira metade do século XX / Abstract: This work aims to contribute to research concerning the scientific and social movement known as eugenics, from the analysis of Brazilian science fiction works that were published in the first half of the twentieth century, particularly at the years 1922 to 1949. From some representative works, according to specialized critics of the age, we seek to verify the way the eugenic thinking was incorporated into the science-fiction stories, forming the fictional representation of utopian eugenicist worlds. We shal map and study the appropriation of science and social thought of these intellectual eugenicists by Brazilian writers of science fiction at the period 1922 to 1949, making possible to understand the ways which eugenic discourse was incorporated into Brazilian literature and posteriorly spread by it. Therefore we seek to understand the limits of eugenics as a science, the different forms of the science fiction genre and the forms of interaction between science fiction literature and eugenics in Brazil and the United States. Thus we will have an ample aspect of interactions between the eugenicist social thought and literary field in Brazil. In such case, the literary texts, which will be discussed during our research, will enable identifying the transposition of eugenicist scientific discourse to the science fiction literature in the first half of the twentieth century / Doutor

Made available in DSpace on 2014-04-25T02:02:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000457273-Texto+Completo-0.pdf: 12530353 bytes, checksum: d0fcb9d7b4ba6c715cb7c60244fd80bb (MD5) Previous issue date: 2014 / Variation in animal coloration is a theme that has intrigued evolutionary biologists for a long time. Among the commonly observed pigmentation polymorphisms, melanism (darkening of the surface coloration) has been reported quite frequently in multiple groups of organisms. Several biological factors may be influenced by melanism, including thermoregulation, susceptibility or response to disease, camouflage, aposematism, sexual selection and reproductive success. Melanism is common in the Felidae, having been documented in 13 of its 38 species, in some cases reaching high frequencies in natural populations. Classical hypothesis have suggested that such coat color variants can present adaptive advantages under certain ecological conditions, but these ideas have never been rigorously tested for any wild cat species. In jaguars (Panthera onca), jaguarundis (Puma yagouaroundi) and leopards (Panthera pardus) melanism is caused by different mutations in the MC1R and ASIP genes, which present dominant, semi-dominant and recessive inheritance patterns, respectively. In this study we have focused on melanism in these three cat species, and considered two competing hypotheses: (I) melanism is a neutral polymorphism that is randomly distributed throughout the range of each of these species, bearing no association with particular habitats or environmental variables; and (II) melanism has a non-random distribution, and presents significantly different frequencies among distinct landscape conformations. We constructed databases of records obtained from scientific collections, camera trap studies, individual captures and fecal DNA samples that collectively covered most of the ranges of the focal species. We obtained 794 records of jaguars, 463 jaguarundis and 623 leopards, including individually ascertained information on coat color. We performed modeling and statistical analyses using the software packages Maxent (maximum entropy algorithm), ArcGis 9. 3 and SPSS 17, based on environmental variables obtained from the Worldclim, Climond, SRTM and GlobCover databases. The results allowed for the first time the construction of maps depicting the geographic distribution of melanism in wild cat species, as well as estimates of its frequency in the three target species. The frequency of melanism was ca. 9% in jaguars, 80% in jaguarundis, and 10% in leopards, and all three species showed a non-random distribution pattern of this coloration variant. In jaguars, melanism was totally absent from ecoregions containing open and periodically flooded landscapes, such as the Pantanal (Brazil) and Llanos (Colombia/Venezuela), which was striking given the large number of samples surveyed in these regions; in contrast, forested areas displayed a melanism frequency that was similar to that expectation based on the species as a whole. In jaguarundis, the dark phenotype (which is evolutionarily derived) proved to be much more common in nature than the ancestral reddish form, with the former being distributed across all areas in which the species occurs, and the latter being highly associated with open and dry landscapes. In leopards, melanism was present in five of the nine currently recognized subspecies, and was strongly associated with tropical and subtropical moist forests, especially in Southeast Asia. Analyses of environmental parameters that seem to be most influential on the melanism occurrence in these three species suggest a relevant role for factors such as altitude, temperature, solar radiation and moisture in different landscape conformations. These observations support the hypothesis that melanism in felids is not a neutral polymorphism, and undergoes the influence of natural selection related to environmental variables and landscape conformations, leading to a non-random geographic distribution of this coloration phenotype. / A variação na coloração animal é um tema que intriga pesquisadores da área de biologia evolutiva há bastante tempo. Dentre as variações observadas, o melanismo é um polimorfismo de coloração comum em diversos grupos de organismos, definido pela predominância de uma cor escura na superfície do corpo. Diversos fatores biológicos, como termorregulação, suscetibilidade ou resposta a doenças, camuflagem, aposematismo, seleção sexual e sucesso reprodutivo podem ser influenciados pelo melanismo, o que torna o seu estudo bastante relevante, inclusive como um sistema modelo para investigações evolutivas de polimorfismos fenotípicos em geral. Sua ocorrência é comum na família Felidae, tendo sido documentada em 13 das 38 espécies do grupo e, em alguns casos, podendo atingir altas frequências em certas populações. Hipóteses clássicas sugerem que essas variantes de pelagem podem apresentar vantagens adaptativas em certas circunstâncias ecológicas, o que até o momento não foi testado de forma rigorosa para qualquer das espécies do grupo. O presente estudo teve como foco o melanismo em três espécies de felídeos: onças-pintadas (Panthera onca), jaguarundis (Puma yagouaroundi) e leopardos (Panthera pardus), nas quais esta variante é causada por diferentes mutações nos genes MC1R e ASIP, de herança dominante, semi-dominante e recessiva, respectivamente. No presente estudo, para cada uma destas espécies, foram consideradas duas hipóteses concorrentes: (I) o melanismo constitui um polimorfismo neutro, presente em toda a área de distribuição e de forma aleatória entre ambientes distintos, com ausência de associação com variáveis ambientais; e (II) o melanismo está distribuído espacialmente de forma estruturada e não-randômica, e associada a parâmetros ambientais e condicionantes biogeográficos específicos. A partir de registros provenientes de coleções científicas, armadilhas fotográficas, capturas e DNA fecal cobrindo a maior parte da distribuição geográfica das espécies focais, foram obtidas 794 amostras de onças-pintadas, 463 de jaguarundis e 623 de leopardos, com aferição da coloração em nível individual. As modelagens e análises estatísticas foram realizadas com os programas Maxent (algoritmo de máxima entropia), ArcGis 9. 3 e SPSS 17, utilizando variáveis ambientais obtidas a partir das bases de dados WorldClim, Climond, SRTM e GlobCover. Os resultados apresentam pela primeira vez um mapa de distribuição geográfica do melanismo em felinos, bem como estimativas da frequência dessa característica nestas três espécies.A frequência observada de melanismo foi de 9% em onças-pintadas, 80% em jaguarundis e 10% em leopardos, sendo que em todas as espécies o padrão de distribuição geográfica foi significativamente não-aleatório. Nas onças-pintadas, em ecoregiões de paisagens abertas periodicamente inundadas como o Pantanal (Brasil) e os Llanos (Colômbia/Venezuela), o melanismo foi totalmente ausente, apesar do grande número de amostras provenientes destas regiões, ao contrário de áreas florestais, onde a frequência do melanismo se manteve semelhante ao esperado para a espécie como um todo. Em jaguarundis, o padrão fenotípico escuro (que é evolutivamente derivado) mostrou-se muito mais comum na natureza do que a coloração ancestral (avermelhada), estando o primeiro distribuído em todas as áreas de ocorrência da espécie, e a segunda associada fortemente a paisagens mais secas e abertas. Em leopardos, o melanismo está presente em cinco das nove subespécies atualmente reconhecidas, e fortemente associado a florestas tropicais e subtropicais úmidas, especialmente na região do sudeste asiático. Análises dos parâmetros ambientais que parecem influenciar de forma mais relevante a ocorrência do melanismo nestas três espécies sugerem um papel importante de fatores como altitude, temperatura, radiação solar e umidade em diferentes conformações de paisagem. Essas observações apoiam a hipótese de que o melanismo em felinos não constitui um polimorfismo neutro, sofrendo a ação de seleção natural relacionada a variáveis ambientais e conformações de paisagem, o que induz uma distribuição geográfica não-aleatória deste fenótipo de coloração.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, Programa de Pós-graduação em Biologia Molecular, 2015. / Submitted by Aline Girardi (alinegirardiunb@gmail.com) on 2015-04-01T19:26:55Z No. of bitstreams: 1 2015_LuízaCescaPiva.pdf: 2317519 bytes, checksum: 29251421288ca0cf8f14fde7573ec0cb (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2015-04-01T19:50:02Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_LuízaCescaPiva.pdf: 2317519 bytes, checksum: 29251421288ca0cf8f14fde7573ec0cb (MD5) / Made available in DSpace on 2015-04-01T19:50:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_LuízaCescaPiva.pdf: 2317519 bytes, checksum: 29251421288ca0cf8f14fde7573ec0cb (MD5) / A levedura Pichia pastoris tem sido bastante explorada na produção de proteínas heterólogas, graças a algumas vantagens apresentadas por esse sistema, tais como: técnicas de manipulação genética disponíveis, crescimento em altas densidades celulares, realização de modificações pós-traducionais e secreção eficiente de proteínas. Contudo, esse sistema ainda possui algumas limitações no que se refere às ferramentas de genética molecular. Por exemplo, para que diversas modificações sejam introduzidas na mesma linhagem, faz-se necessário o uso de múltiplas marcas de seleção ou de estratégias que permitam a sua reutilização. Em Pichia, o uso de marcas recicláveis ainda é limitado. Nesse contexto, destaca-se o gene amdS (acetamidase) de Aspergillus nidulans, que permite a seleção de fungos em meio de cultura contendo acetamida como única fonte de nitrogênio e a contrasseleção em meio contendo a droga fluoroacetamida. Em conjunto com a contrasseleção do gene amdS, o sistema Cre-loxP de recombinação sítio-específica pode ser utilizado para facilitar a excisão da marca de seleção. Neste trabalho, o uso da marca amdS foi testado em P. pastoris e, como prova de conceito, foi feita a deleção do gene ADE2, uma carboxilase envolvida na síntese “de novo” de purinas. Primeiramente, uma ORF endógena que codifica para uma amidase putativa foi deletada. Em seguida, foi construído um vetor contendo um cassete com o gene amdS flanqueado por sítios loxP além do gene repórter EGFP para testar a eficiência da marca em P. pastoris. A construção amdS-loxP foi também utilizada em cassetes de deleção para os genes ADE2 e URA5. Após a deleção do gene ADE2, um plasmídeo replicativo contendo o gene da recombinase CreA (pYRCre2) foi utilizado para a excisão da marca, para permitir a reutilização do gene amdS em outros eventos de deleção. A integração do vetor contendo o gene amdS mostrou que esta nova marca de seleção é aplicável em P. pastoris com a vantagem de permitir a contrasseleção de transformantes após o uso do sistema de recombinação Cre-loxP. Esta nova ferramenta traz alternativas na manipulação genética da levedura reduzindo problemas como a necessidade de expressão de diversas marcas dominantes. / The yeast Pichia pastoris has been widely explored for the production of heterologous proteins due to certain advantages presented by this system, such as: molecular genetic techniques available, growth at high cell densities, post-translational modifications and efficient protein secretion. However, this system still has some limitations related to the tools used for genetic modifications. For example, in order for many genetic modifications to be done in the same strain, one needs to use multiple selection marks or strategies that allow marker reusing. In Pichia, the use of recyclable markers is still limited. The amdS gene from Aspergillus nidulans stands out in this context because it allows the selection of fungi in medium that contains acetamide as sole nitrogen source, as well as the counterselection in medium that contains the drug fluoroacetamide. Along with the counterselection property of the amdS gene, the Cre-loxP site-specific recombination system can be used to help in selection marker excision. In this work, the amdS selection mark was tested in P. pastoris and, as proof of concept, the ADE2 gene coding for a carboxylase involved in purine synthesis was deleted. Firstly, an endogenous ORF coding for a putative amidase was deleted. Subsequently, a vector containing a cassette with the amdS gene flanked by loxP sites and a EGFP gene was constructed in order to test the selection marker in P. pastoris. The amdS-loxP construction was also used in deletion cassettes for ADE2 and URA5 genes. After the ADE2 gene deletion, a replicative plasmid containing the CreA recombinase gene (pYRCre2) was used for marker excision, allowing the use of the amdS gene in further gene deletion events. Integration of the vector containing the amdS gene showed that this new selection marker is applicable in P. pastoris with the advantage of allowing counterselection after using the Cre-loxP recombination system. This new tool brings an alternative for P. pastoris genetic manipulation, reducing problems such as the expression of many dominant selection markers simultaneously.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Departamento de Filosofia, Programa de Pós-Gradução em Filosofia, 2012. / Submitted by Elna Araújo (elna@bce.unb.br) on 2012-07-11T21:49:17Z No. of bitstreams: 1 2012_EdsonClaudioMesquitaPinto.pdf: 2225550 bytes, checksum: 9ee3bd8a60450b055b6b7815e311fac4 (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Ferreira de Souza(jaquefs.braz@gmail.com) on 2012-07-18T12:48:08Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_EdsonClaudioMesquitaPinto.pdf: 2225550 bytes, checksum: 9ee3bd8a60450b055b6b7815e311fac4 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-07-18T12:48:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_EdsonClaudioMesquitaPinto.pdf: 2225550 bytes, checksum: 9ee3bd8a60450b055b6b7815e311fac4 (MD5) / Esta dissertação está voltada para as discussões em torno do poder explicativo do programa adaptacionista, que têm seu principal fundamento no processo de seleção natural. O seu título indica que a estratégia adotada é a de uma análise metodológica. Cada tema é discutido com o intuito de compor um arcabouço conceitual a partir do qual um programa adaptacionista possa ser delineado e situado dentro do amplo debate acerca da evolução. Não apenas situado, mas reconhecido como um programa de pesquisas em biologia evolutiva que oferece boas explicações científicas. Isso não implica em sustentar a tese de que as explicações adaptacionistas são mais eficazes e têm maior credibilidade do que as alternativas existentes, o que não nos parece plausível. Diferentemente, esse estudo tenta mostrar que as explicações adaptacionistas são mais bem avaliadas, com base nos valores cognitivos destacados usualmente pelos filósofos da ciência, quando vinculadas às explicações que pressupõem mecanismos evolutivos diferentes da seleção natural, bem como em conhecimentos bem estabelecidos. Mostramos que, desse modo, o poder heurístico das explicações adaptacionistas se expande, permitindo que muitos problemas sejam mais bem formulados e abrindo caminho para soluções que efetivamente aumentem nosso entendimento da evolução biológica. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / This work focuses on discussions concerning the explanatory power of adaptationist explanations, which are chiefly based on the process of natural selection. The title of this thesis indicates that the strategy here adopted is that of a methodological analysis. Each topic is discussed in order to set up a conceptual framework for the outline of an adaptationist program and for locating it within the broader debate about evolution. This program is not just located, but recognized for its contributions to evolutionary biology, in providing good scientific explanations. This doesn't mean, however, that this work supports the idea that adaptationist explanations are the most effective and most trustful, among the extant alternatives, what seems to us not plausible at all. Instead, we attempt to show that adaptationist explanations are better valued, taking for granted those cognitive values usually pointed out by philosophers of science, when they are associated with explanations that presuppose evolutionary mechanisms other than natural selection, besides well-established knowledge. As a result, the heuristic power of adaptationist explanations expands itself, making possible a better formulation of several problems and providing solutions that increase effectively our understanding of biological evolution.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Biologia, Departamento de Ecologia, 2010. / Submitted by Jaqueline Ferreira de Souza (jaquefs.braz@gmail.com) on 2011-02-25T14:34:37Z No. of bitstreams: 1 2010_DeboraGoedert.pdf: 2526291 bytes, checksum: 3d96b61b3b5716b3f574941cf0891656 (MD5) / Approved for entry into archive by Luanna Maia(luanna@bce.unb.br) on 2011-02-28T13:52:14Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2010_DeboraGoedert.pdf: 2526291 bytes, checksum: 3d96b61b3b5716b3f574941cf0891656 (MD5) / Made available in DSpace on 2011-02-28T13:52:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2010_DeboraGoedert.pdf: 2526291 bytes, checksum: 3d96b61b3b5716b3f574941cf0891656 (MD5) / Sinais sonoros são essenciais para a comunicação em aves, permitindo a identificação de espécies. Muitas vezes, ainda, estão relacionados ao contexto social ou ecológico do indivíduo emissor, e podem afetar significativamente a aptidão dos indivíduos que participam da interação, especialmente em espécies com alto grau de socialidade. Assim, buscou-se descrever e caracterizar os sinais sonoros em uma população de pica-pau-do-campo (Colaptes campestris campestris) do Brasil Central, bem como investigar se esses sinais podem ser relacionados a contextos sociais e ecológicos específicos. Durante o período de agosto de 2007 a dezembro de 2009, um total de 26 grupos sociais foram monitorados e tiveram suas vocalizações gravadas. Não houve registro de tamborilado, indicando que a comunicação acústica nessa espécie se dá apenas por sinais vocais. As cinco vocalizações mais comuns dentre as oito encontradas apresentam 12 tipos de elementos diferentes. Para cada uma das cinco vocalizações foram calculadas as estatísticas descritivas do número de elementos; intervalo entre elementos; duração dos elementos; freqüência de maior amplitude; freqüência máxima, mínima e central do primeiro tom; e banda de freqüência do primeiro tom. São descritas também a combinação de elementos que compõe cada vocalização e os contextos identificados. Muitos contextos puderam ser identificados para cada vocalização, sendo que, para determinados contextos, foram utilizadas mais de uma vocalização. Foi observado, ainda, o uso de sinais visuais associados a algumas vocalizações. A variedade de contextos observada, o uso combinado de diferentes vocalizações e de sinais multimodais permite uma grande variedade de interações via comunicação acústica, apesar da ausência de tamborilado, condizente com a complexidade social da espécie. Esse trabalho é o primeiro a classificar as vocalizações do pica-pau-do-campo com base em sua estrutura acústica, o que permite a realização futura de estudos mais detalhados da comunicação dessa espécie. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT / Sonorous signals are crucial for communication in birds, providing clues for the species identification. These signals can also be related to the social or ecological contexts of the sender, and thus significantly affect the fitness of all individuals participating in the interaction, particularly individuals of highly social species. Therefore, the aims of this study was to describe and characterize the acoustic repertoire of the campo flicker (Colaptes campestris campestris) in a population of Central Brazil, and investigate whether these signals are related to particular social or ecological situations. A total of 26 social groups were monitored from August 2007 to December 2009 and had their acoustic signals recorded. There were no records of drumming, suggesting this species relies solely on vocal calls for communication. The five most common vocalizations out of eight calls found are composed by 12 different elements. Descriptive statistics are presented for each of these five calls on the number of elements; the interval between elements; the duration of elements; peak frequency; maximum, minimum and central frequencies of the first tone; and the bandwidth of the first tone. The elements composing each call and the situations associated with the calls are also described. There was a variety of situations associated with each call, and for some situations, more than one call was used. Visual signals were also displayed in association with some of the calls. The variety of contexts and both the use of different calls in combination and the use of multimodal signals result in a great diversity of possible interactions through acoustic communication, even in the absence of drumming, which is consistent with the social complexity of this species. This is the first study to classify the vocal call of the campo flicker based on the acoustic structure of the signals, therefore laying ground for future studies on the communication of this species.