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Análise in silico da Expressão Diferencial de Transcritos SuperSAGE de Proteínas Quinases em Cana-de-Açúcar em Resposta ao Déficit Hídrico

Correia, Carolina Neves 31 January 2013 (has links)
Submitted by Andre Moraes Queiroz (andre.moraesqueiroz@ufpe.br) on 2015-04-14T14:30:37Z No. of bitstreams: 2 Dissertaçao Carolina Neves Correia.pdf: 5310409 bytes, checksum: 06fd884bd1cc5beab0d792b693d0b03f (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-04-14T14:30:37Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertaçao Carolina Neves Correia.pdf: 5310409 bytes, checksum: 06fd884bd1cc5beab0d792b693d0b03f (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2013 / FINEP / Estudos de expressão gênica diferencial associados a perfis metabólicos de plantas submetidas a um estresse alvo são abordagens valiosas na compreensão da tolerância vegetal. Por sua vez, proteínas quinases são importantes componentes da sinalização celular, catalisando a transferência do grupo fosfato de uma molécula de ATP para um substrato, em processo chamado fosforilação, com participação ativa na aclimatação às mudanças ambientais. O presente trabalho teve como objetivo comparar in silico perfis de transcrição, de unitags SuperSAGE diferencialmente expressas e anotadas como prováveis quinases, de genótipos de cana-de-açúcar tolerantes e sensíveis ao déficit hídrico (24 h de supressão de rega). Para tanto, sequências expressas (EST) de gramíneas, de diversos bancos de dados públicos, similares às unitags (análises BLASTn), foram caracterizadas em termos de Ontologia Gênica, que conjuntamente com as anotações das EST permitiram identificar e classificar as quinases em famílias. Através dos respectivos números de Classificação Enzimática (EC), mapas metabólicos foram gerados, permitindo comparar os grupos de genótipos contrastantes (tolerantes e sensíveis ao estresse). Foram observadas 539 prováveis quinases, que distribuídas em 41 famílias e em 18 vias metabólicas, quando associadas às unitags, permitiram discuti-las com base em oito classes hierárquicas funcionais. Importantes diferenças na expressão desses transcritos mapeados como quinases, entre os grupos de genótipos tolerantes e sensíveis, após 24 h de supressão de rega, foram observadas neste trabalho, contribuindo para um melhor entendimento da percepção do estresse aplicado, podendo ser útil ao melhoramento genético da cana-de-açúcar.
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Cancelador de eco para modem de dados

Márcio Abud Marcelino 01 May 1989 (has links)
Este trabalho apresenta um Estudo da Conformação de Sinais para MODEM a 4800 bps FULL-DUPLEX (FDX) a Dois Fios, utilizando a rede telefônica comutada. Como hoje o maior problema desse tipo de MODEM é a implementação de um sistema eficiente de separação de canais na comunicação FDX a dois fios, é apresentada uma técnica de cancelamento de eco usando filtro transversal juntamente com o respectivo algorítmo de minimização de erro. É apresentada também uma proposta de implementação da estrutura para o Cancelador de Eco, utilizando um "Digital Signal Processor", o NEC uPD 77230. Esse trabalho relata resultados relevantes obtidos através de simulação computacional, da estrutura proposta de cancelamento de eco. A principal conclusão obtida com esse trabalho foi que na estrutura apresentada, o eco residual depende exclusivamente do número de coeficientes do filtro transversal, do passo de convergência do algorítmo de adaptação e do sinal não cancelável, e que fatores como interferência entre símbolos, tempo de atraso e fase da portadora, e relação sinal/ruído não interferem na propriedade de convergência do eco residual. Também ficou comprovado que o eco residual independe do tipo do canal do eco, desde que o mesmo seja linear.
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Influência de Timol e Carvacrol sobre o crescimento,características metabólicas e potencial enterotoxigênico de cepas de Staphylococcus aureusisoladas de alimentos

OLIVEIRA, Carlos Eduardo Vasconcelos de 23 February 2010 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T22:58:10Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo3075_1.pdf: 1945647 bytes, checksum: 99ed6719bdfcff0e1240d8e5ce5d5958 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2010 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A indústria alimentícia visa a produção de alimentos que apresentem vida-de-prateleira longa e inocuidade com relação à presença de microrganismos patógenos e suas toxinas. A nova tendência do consumidor e da legislação de alimentos têm tornado essa busca cada vez mais premente e necessária. A maioria das Doenças Transmitidas por Alimentos (DTAs) de origem microbiana possui sua etiologia bem estabelecida, de modo que a bactéria S. aureus é reconhecida como um dos agentes patogênicos mais comuns, sendo responsável por surtos associados à ingestão de alimentos in natura e processados em todo o mundo, justifica-se a execução de um estudo com ênfase na avaliação dos compostos fenólicos timol e carvacrol, os quais são reconhecidos como componentes majoritários do óleo essencial de O. vulgare. Desta forma, este estudo avaliou a inibição dos possíveis mecanismos de ação e a interferência de timol e carvacrol sobre o crescimento, potencial enterotoxigênico e alguns parâmetros metabólicos de cepas de S. aureus isoladas de alimentos. Aplicou-se de forma combinada o timol e carvacrol com ácido láctico e acético contra Staphylococcus aureus com a determinação da Concentração Inibitória fracionária (FIC) e índice de tempo de morte em ensaio com caldo de carne e um modelo alimentar (carne). A Concentração Inibitória Mínima (CIM) do carvacrol e timol foram 1,25 e 0,6 μL/mL, respectivamente. Índices de FIC da aplicação combinada dos constituintes fenólicos e ácidos orgânicos foram 0,5, sugerindo uma interação sinérgica. Não houve diferença significativa (p> 0,05) encontrada entre as contagens bacterianas para o caldo de carne acrescentado dos fenóis isoladamente ou em combinação com o ácido láctico em concentrações sub-inibitórias. Contrariamente, a contagem bacteriana encontrada para o caldo de carne acrescentado dos fenóis somente foram significativamente menores (p> 0,05) às contagens obtidas para o caldo acrescentado da combinação de compostos fenólicos e ácido acético. Não houve diferença significativa (p> 0,05) entre as contagens bacterianas para o modelo de carne adicionado de fitoquímicos isolados e em combinação com os ácidos orgânicos. Os antimicrobianos testados isoladamente ou em mistura proporcionaram menores efeitos a influência dos compostos fenólicos carvacrol e timol sobre algumas características fisiológicas e modulação da secreção de fatores de virulência estafilocócicas, coagulase e enterotoxina. Foram também estudados possíveis mecanismos para o estabelecimento de atividade anti-estafilocócica por estes compostos. Concentrações subnibitórias (0,3 e 0,15 μL/mL) do carvacrol e timol inibiram fortemente a atividade das enzimas coagulase e lipase, além de causar uma perda significativa de tolerância à salinidade. A supressão da produção de enterotoxinas ocorreu totalmente com ambos compostos fenólicos em concentrações subnibitórias. A perda de material absorvente 260-nm e íons potássio ocorreu imediatamente após a adição de carvacrol e timol nas concentrações de 0,6 e 1,2 μL/mL. A microscopia eletrônica de células tratadas com o carvacrol e timol revelou a formação de defeitos na superfície das células e perda de material citoplasmático. Esses resultados sugerem uma abordagem interessante para a melhoria da preservação de alimentos que utilizam procedimentos mais naturais, considerando a demanda atual de consumo e qualidade sensorial de alimentos
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Filtros de Kalman no tempo e freqüência discretos combinados com subtração espectral / Kalman filters of time and frequency discrete combined with spectral subtraction

Silva, Leandro Aureliano da 20 July 2007 (has links)
Este trabalho tem a finalidade de apresentar e comparar técnicas de redução de ruído utilizando como critérios de avaliação a mínima distorção espectral e a redução de ruído, na reconstrução dos sinais de voz degradados por ruído. Para tanto, utilizou-se os filtros de Kalman de tempo discreto e de freqüência discreta em conjunto com a técnica de subtração espectral de potência. Os sinais utilizados foram contaminados por ruídos branco e colorido, e a avaliação do desempenho dos algoritmos foi realizada tendo-se como parâmetros a relação sinal/ruído segmentada (SNRseg) e a distância de Itakura-Saito (d(a,b)). Após o processamento, verificou-se que a técnica, proposta neste trabalho, de filtragem de Kalman no tempo em conjunto com a subtração espectral de potência, apresentou resultados um pouco melhores em relação à filtragem de Kalman na freqüência em conjunto com a subtração espectral de potência. / This work has as main objective to present and to compare techniques of noise reduction using as evaluation criterion the low spectral distortion and the noise reduction in the reconstruction of corrupted speech signals. For so much, it was used the Kalman\'s filters in the time and frequency domain together with the technique of power spectral subtraction. The used signals were corrupted by white and colored noises and the evaluation of effectiveness of the algorithms was accomplished using the segmental signal-to-noise ratio (SNRseg) and the Itakura-Saito distance (d(a,b)). After the processing, it was noticed that the Kalman filtering in the time together with power spectral subtraction presented better results than the Kalman filtering in the frequency together with power spectral subtraction.
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O fenômeno da tolerância oral e a regulação de células patogênicas Th17 no modelo de encefalomielite experimental auto-imune. / The oral tolerance phenomenon and the regulation of pathogenic Th17 cells during the EAE model.

Peron, Jean Pierre Schatzmann 16 May 2008 (has links)
Recentemente demonstrou-se o papel de células T produtoras de IL-17 na patogênese da esclerosa múltipla e de seu modelo, a EAE. Através da produção desta e de outras citocinas, a população chamada Th17 promove o rompimento da barreira hematoencefálica e a conseqüente infiltração de células patogênicas para dentro do SNC. Nesse contexto, em nosso trabalho utilizamos o fenômeno da tolerância oral para avaliar a capacidade deste em suprimir a resposta imune durante o modelo de EAE, mais especificamente as células Th17. Nossos dados demonstram uma diminuição de IL-17 tanto na periferia como no SNC dos animais tolerados. Além disso, detectamos menos CCL2 e IL-6 em células extraídas do CNS dia 10 pós-imunização. Não observarmos diferença na produção de IL-4,5,10, 13, IL-12p70, TNF-<font face=\"symbol\">a, e IFN-<font face=\"symbol\">g entre os grupos. Em suma, nossos resultados mostram que o fenômeno da tolerância oral é capaz de suprimir parâmetros de EAE devido a uma menor capacidade linfoproliferativa associada a uma supressão de células patogênicas Th17 tanto na periferia como no SNC. / It has recently been shown the role of IL-17 secreting cells on the pathogenesis of multiple sclerosis and also in its model, EAE. Due to the secretion of this and other cytokines, the population so called Th17, promotes the disruption of the blood-brain barrier and the following infiltration of pathogenic cells into the CNS. In this context, in our work we used the oral tolerance phenomenon to evaluate its supressive capacity, more specifically over the Th17 cells. We showed that oral tolerated mice has a diminished production of IL-17 both in the periphery and in the CNS. Futhermore, we detected lower levels of CCL2 and IL-6 also from brain and spinal cord extracted mononucear cells at day 10th post-immunization. We were not able to detect differences on IL-4,5,10, 13, IL-12p70, TNF-<font face=\"symbol\">a, e IFN-<font face=\"symbol\">g between the groups. Thus, our results show that the oral tolerance phenomenon suppresses EAE findings, mainly due to a lower lymphoprolipherative response associated to a supression over the expansion of Th17 pathogenic T cells both in the periphery and inside the CNS.
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Obtenção e caracterização de linhagem transgênica de Aedes aegypti machos geneticamente estéreis. / Obtention and characterization of transgenic lines of Aedes aegypti for males genetically sterile.

Carvalho, Danilo de Oliveira 08 August 2016 (has links)
Com o aumento progressivo do número de casos de infecção por diferentes arbovírus, por exemplo, dengue, zica e chikungunya, faz-se necessário o desenvolvimento de novas técnicas para o combate a esses arbovírus. A manipulação genética possibilitou a obtenção de mosquitos geneticamente modificados que sejam capazes de suprimir a população selvagem ou impedir a transmissão de agentes etiológicos gerando doenças. O estudo teve como objetivo o estabelecimento de linhagens para supressão populacional de Aedes aegypti. Esta construção apresenta esterilidade condicionada à presença ou ausência de antibiótico no meio em que esses mosquitos se desenvolvem durante a fase larval. Dessa forma, sem a necessidade de se utilizar radiação para obter insetos estéreis, é possível melhorar a qualidade dos machos adultos liberados e aumentar a competitividade dos mesmos em competir por fêmeas selvagens e adicionalmente gerar o desejado quadro de supressão populacional. / The increasing number of infection cases by arboviruses, for instance Dengue, Zika and Chikungunya, it is necessary to develop new techniques to fight against these arboviruses. Genetic manipulation allowed the production of genetically modified mosquitoes that are capable of suppressing the wild population or prevent pathogens transmission and avoid disease development. The project proposes to establish lines for population suppression of Aedes aegypti, one of the main vectors of those diseases. This construction presents the conditional sterility due to the presence or absence of antibiotics in the environment where these mosquitoes are developed during the larval stage. Thus, without the need to use radiation for sterile insects, it is possible to improve the quality of the released adult males and enhance the competitiveness thereof in competing with wild females and additionally generate population suppression.
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Supressão condicionada sobre linhas de base de variabilidade e repetição operantes / Conditioned suppression in operant variability and repetition

Bisaccioni, Paola 23 June 2010 (has links)
A supressão condicionada é definida como a redução na taxa de resposta operante diante de um estímulo que foi previamente pareado com um evento aversivo inevitável e independente do comportamento do sujeito. A linha de base na qual se sobrepõe os pareamentos tem sido apontada como uma das variáveis críticas na determinação do efeito supressivo. Portanto, o objetivo desse trabalho foi verificar se esquemas de reforçamento contingentes à variabilidade ou à repetição do comportamento seriam igualmente sensíveis ao procedimento de supressão condicionada. Ratos foram divididos em dois grupos (n=6), denominados Variabilidade (VAR) e Repetição (REP), que diferiram apenas quanto ao esquema de reforçamento da linha de base. Os sujeitos do grupo VAR foram submetidos a uma contingência que exigia que eles emitissem diferentes seqüências de quatro respostas de pressão a duas barras (esquema RDF). Já os sujeitos do grupo REP foram reforçados por emitir uma única seqüência (seqüência EEEE). Depois de 25 sessões sob esses esquemas, foram introduzidos os pareamentos aversivos, que consistiram na apresentação de duas luzes de 12 V, por 20 s, localizadas em cima de cada barra, que foram regularmente seguidas por choques de 0,8 mA por 0,5 s. Os resultados indicaram que os dois grupos foram sensíveis aos pareamentos CS-US, mostrando queda na taxa de resposta operante frente ao estímulo condicionado. Embora todos os sujeitos tenham apresentado forte efeito supressivo, a supressão foi mais acentuada no Grupo REP. No entanto, as diferenças obtidas nas razões de supressão dos dois grupos foram pequenas considerando a magnitude das diferenças entre as contingências de reforçamento utilizadas, que selecionavam padrões opostos em relação à variabilidade do comportamento. Discutiu-se que alguns parâmetros utilizados poderiam explicar a pequena diferença obtida aqui em comparação com os estudos da literatura. Os resultados apontaram ainda que os padrões de variar e repetir não foram afetados pela exposição ao US aversivo, mantendo-se no final do experimento os mesmos níveis da linha de base. Portanto, os dados sugerem que a variabilidade operante pode coexistir com contingências aversivas, ampliando o potencial de análise da variação do comportamento, que usualmente é investigada apenas com reforço positivo / Conditioned suppression is defined as a decrease in the rate of a positively reinforced response during a stimulus which precedes an unavoidable shock. The reinforcement schedule used to maintain the baseline performance is an important variable in determining the degree of suppression. Therefore, the purpose of the present study was to compare the effects of different reinforcement schedules that selected behavioral variation or repetition in the conditioned suppression procedure. Rats were divided into two groups (n=6), named Variability (VAR) and Repetition (REP), that differed from each other in relation to the reinforcement schedules used to maintain the baseline. In VAR Group, rats were rewarded for variable response sequences. In REP Group, rats were rewarded for repeating a single LLLL sequence. After 25 sessions in these schedules, periods of light (20 sec.) were terminated with a brief, unavoidable shock (0.8 mA/ 0.5 sec.) for the two groups. The results indicated that the rate of operant response of all subjects decrease during the CS. Therefore all subjects showed strong suppression, the effect was more severe in REP Group. However, the difference obtained was small considering the differences in the reinforcement schedules that selected opposite performances related to behavioral variation. It was discussed that some parameters of this experiment could explain the small difference obtained here in contrast with previous studies. The results also showed that variation and repetition sequences are not affected by the aversive US. Thus, the data suggest that operant variability could be maintained in aversive contingencies
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Análise imunoistoquímica das proteínas maspin, p63 e bcl2 em tumor odontogênico queratocístico, cisto dentígero e ameloblastoma / Maspin, p63 e bcl2 in odontogenic keratocyst tumor, dentigerous cyst and ameloblastoma

Costa, Alexandra Fontes da 11 June 2007 (has links)
Os cistos e tumores odontogênicos sempre tiveram grande importância dentro da Odontologia, seja pela grande prevalência clínica seja pelo grande acometimento do indivíduo afetado pela lesão. A nova classificação da Organização Mundial de Saúde trouxe a mudança de categoria do queratocisto, que recebe agora a nômina de tumor odontogênico queratocístico, e que figura não mais na categoria de cisto odontogênico de desenvolvimento, mas sim de tumor odontogênico. Certa precipitação nessa mudança levou alguns autores a sugerirem a necessidade de estudos que esclareçam as características clínicas e histopatológicas dessa lesão para que se tenha uma classificação realmente precisa. O grande paradigma dessa lesão é: ao mesmo tempo em que apresenta características histológicas de um cisto, possui um comportamento clínico agressivo mais comumente observado nos tumores. O que realmente difere esta lesão das outras lesões que se inseriam no mesmo grupo é o padrão de crescimento diferenciado do tumor odontogênico queratocístico em relação às outras lesões císticas. Sendo assim, poderia se suspeitar que essa lesão possua um potencial proliferativo maior do que as outras que anteriormente pertenciam ao mesmo grupo, denotando uma regulação diferenciada do mecanismo proliferação-apoptose. Este estudo teve como objetivo comparar o tumor odontogênico queratocístico com uma lesão cística - o cisto dentígero - e com uma lesão tumoral - o ameloblastoma ? por meio de marcadores imunoistoquímicos para supressão tumoral e anti-apoptose. Os resultados demostraram que a maior diferença entre essas lesões está principalmente na atividade apoptótica, já que somente o resultado de bcl2 foi estatisticamente significante entre essas lesões. / Odontogenic cysts and tumors have always had a great importance in Dentistry, for its high clinical prevail and for its noticeable invasive behavior. The new classification released by WHO rearranged keratocyst, that is named now odontogenic keratocystic tumor, classifying it no longer as a development cyst, but now as odontogenic tumor. Certain haste in this change brought some authors to suggest the necessity of more studies to clarify the feautures of such lesions to determine a more accurate classification. The greatest paradigm of this lesion is that it shows cyst-like histological characteristics and simultaneuosly it has an aggressive clinical behavior, which is more commonly observed in tumors. The main difference between this lesion and the others cystic lesions is the growth pattern, which suggests that the odontogenic keratocystic tumor has higher proliferative potential than other cystic lesions. The aim of this research was to compare odontogenic keratocystic tumor with a cystic lesion ? dentigerous cyst ? and with a tumoral lesion ? ameloblastoma ? using tumor suppressor and anti-apoptosis immunohistochemical expression. Results show that the more important difference among the analysed lesions is apoptosis activity, since only bcl2 staining was significantly different among them.
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Análise de concentração de agentes extintores e gases tóxicos em cabines de pequenas aeronaves.

Cássio Karassawa Zanoni 07 July 2008 (has links)
O objetivo deste trabalho foi o de desenvolver uma metodologia e uma ferramenta utilizando o programa MatLab para analisar a concentração volumétrica de gases tóxicos ao longo do tempo em cabines de pequenas aeronaves durante um evento de fogo. Estes gases podem ser os gerados pela combustão ou pelos agentes extintores utilizados para apagar o fogo. Um modelo matemático foi descrito utilizando a abordagem de uma mistura de gás perfeito com o método dos parâmetros concentrados, já que esta foi demonstrada por testes fornecer dados similares a uma simulação real, bem como ser esta a metodologia sugerida e aceita pelas autoridades atualmente. As entradas do problema são as vazões mássicas do agente extintor e de outros gases tóxicos provenientes da combustão, a variação da altitude de cabine e a taxa de entrada de ar na cabine. As saídas são as concentrações volumétricas de todos estes gases na cabine ao longo do tempo. A contribuição desta ferramenta é na definição preliminar dos extintores de incêndio na cabine e a na visualização dos efeitos de possíveis variações na altitude de cabine e entrada de ar em um evento de fogo. Esta ferramenta também é útil no estudo da substituição de agentes extintores existentes por outros menos tóxicos bem como na reavaliação de instalações existentes de extintores de incêndio com as possíveis mudanças nos valores de nível de toxicidade recomendado pelas autoridades. Os resultados obtidos pela ferramenta apesar de conservadores, demonstraram-se coerentes para casos de simulação em regime permanente, para casos de disparo de mais de um gás na simulação de uma aeronave em cruzeiro e altitude constante, e com variação na altitude de cabine.
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Cancelamento de eco e equalização adaptativa para a transmissão digital banda básica "Full Duplex" em um par de fios

Paulo Eduardo Martins Vieira 01 April 1990 (has links)
Uma vez escolhida a técnica da híbrida para a transmissão digital banda básica &quot;full duplex&quot; em um par de fios, este trabalho consiste em obter as respostas impulsivas do sistema (canal e eco), fazer o cancelamento de eco e a equalização do canal (usando DFE-&quot;Decision Feedback Equalizer&quot;) através de filtragem adaptativa e obter o desempenho do sistema completo através do cálculo da probabilidade de erro. Simulamos em computador digital os filtros adaptativos (cancelador de eco e equalizador) que usam o algoritmo LMS (&quot;Least Mean Square&quot;) nas estruturas transversal e &quot;lookup table&quot;. Através da observação da f.d.p. (função densidade de probabilidade) do sinal entrante no elemento de decisão dos pulsos recebidos, após convergências dos filtros adaptativos, foi obtida um método analítico de cálculo da probabilidade de erro Pe.

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