A taxonomic revision and phylogenetic analysis of the spider genus Glenognatha Simon, 1887 is presented. The analysis is based on a data set including 24 Glenognatha species plus eight outgroup representatives of three additional tetragnathine genera and one metaine, scored for 82 morphological characters. Eight unambiguous synapomorphies support the monophyly of Glenognatha, all free of homoplasy. Some internal clades within the genus are well-supported and its relationships are discussed. The genus Glenognatha has a broad distribution occupying the Neartic, Neotropic, Afrotropic, Indo-Malaya and Oceania ecozones. As revised here, Glenognatha comprises 27 species, four of them only know from males. New morphological data are provided for the description of thirteen previously described species. Eleven species are newly described: G. sp. nov. 1, G. sp. nov. 3, G. sp. nov. 4 and G. sp. nov. 7 from southeast Brazil, G. sp. nov. 6, G. sp. nov. 9 and G. sp. nov. 10 from the Amazonian region, G. sp. nov. 2, G. sp. nov. 5 and G. sp. nov. 8 from northern Andes and G. sp. nov. 11 from central Mexico and Southern United States. Females of G. minuta Banks, 1898, G. gaujoni Simon, 1895 and G. gloriae (Petrunkevitch, 1930) and males of G. globosa (Petrunkevitch, 1925) and G. hirsutissima (Berland, 1935) are described for the first time. Three new combinations are proposed in congruence with the phylogenetic results: G. argyrostilba (O. P.-Cambridge, 1876), G. dentata (Zhu & Wen, 1978) and G. tangi (Zhu, Song & Zhang, 2003), all previously included in Dyschiriognatha. The following taxa are newly synonymized: Dyschiriognatha montana Simon, 1897, Glenognatha mira Bryant, 1945 and Glenognatha maelfaiti Baert, 1987 with Glenognatha argyrostilba (O. P.-Cambridge, 1876) and Glenognatha centralis Chamberlin, 1925 with Glenognatha minuta Banks, 1898. A key to species of Glenognatha and distribution maps are provided. / A revisão taxonômica e análise cladística do gênero Glenognatha Simon, 1887 é apresentada. A análise é baseada em uma matriz que inclui 24 espécies de Glenognatha, oito representantes do grupo externo, incluindo três gêneros da subfamília Tetragnathinae e um de Metainae, e 82 caracteres morfológicos. Oito sinapomorfias não ambíguas sustentam a monofilia de Glenognatha, todas não homoplásticas. Alguns clados internos dentro do gênero são bem suportados e suas relações são discutidas. O gênero Glenognatha apresenta uma ampla distribuição ocupando as regiões Neártica, Neotropical, Afrotropical, Indo-Malaya, Australasia e Oceania. Vinte e sete espécies de Glenognatha são reconhecidas, quatro delas somente conhecidas por machos. Novos dados morfológicos são fornecidos para a descrição de treze espécies previamente conhecidas. Onze espécies novas são descritas: G. sp. nov. 1, G. sp. nov. 3, G. sp. nov. 4 e G. sp. nov. 7 do sudeste do Brasil, G. sp. nov. 6, G. sp. nov. 9 e G. sp. nov. 10 da região Amazônica, G. sp. nov. 2, G. sp. nov. 5 e G. sp. nov. 8 do norte da cordilheira dos Andes e G. sp. nov. 11 da região central do México e sul dos Estados Unidos. As fêmeas de G. minuta Banks, 1898, G. gaujoni Simon, 1895 e G. gloriae (Petrunkevitch, 1930) e os machos de G. globosa (Petrunkevitch, 1925) e G. hirsutissima (Berland, 1935) são descritos por primeira vez. São propostas três novas combinações em congruência com os resultados da análise cladística: Glenognatha argyrostilba (O. P.-Cambridge, 1876), Glenognatha dentata (Zhu & Wen, 1978) e Glenognatha tangi (Zhu, Song & Zhang, 2003), todas previamente incluídas no gênero Dyschiriognatha. Quatro sinonímias são propostas: Dyschiriognatha montana Simon, 1897, Glenognatha mira Bryant, 1945 e Glenognatha maelfaiti Baert, 1987 com Glenognatha argyrostilba (O. P.-Cambridge, 1876) e Glenognatha centralis Chamberlin, 1925 com Glenognatha minuta Banks, 1898. É apresentada uma chave para a identificação e mapas de distribuição para as espécies

A revisão e a análise cladística de Dicrania LePeletier & Audinet-Serville, 1828 (Coleoptera, Scarabaeidae, Melolonthinae), inicialmente com 40 espécies foi realizada. Após esse estudo, o gênero compreende 81 espécies sul americanas. Um sinônimo genérico é proposto entre o gênero monotípico Canestera Saylor, 1938 syn. nov. de Dicrania, e a espécie previamente alocada no primeiro gênero, recebe nova combinação (D. marshalli (Saylor, 1938) comb. nov.). Plectris pellita (Eschscholtz, 1822) comb. nov. é transferida de Dicrania para Plectris LePeletier & Audinet-Serville, 1828. Três espécies são revalidadas: Dicrania badia Burmeister, 1855 reval., anteriormente sinônimo de D. castaneipennis Chevrolat, 1844, D. quadricristata Guérin-Méneville, 1844 reval., anteriormente sinônimo de D. velutina Guérin-Méneville, 1830, e D. nigricans Laporte, 1832 reval., anteriormente sinônimo de D. flavoscutellata Laporte, 1832. Três sinônimos são confirmados: D. lasiopus Burmeister, 1855 sinônimo de D. nigricans Laporte, 1832, D. luridipennis (Laporte, 1832) sinônimo de D. nigra LePeletier & Audinet-Serville, 1828 e D. femorata (Mannerheim, 1829) sinônimo de D. appendiculata (Mannerheim, 1829). Dez sinônimos novos são propostos: D. morio Kraatz, 1895 syn. nov. e D. rugosipennis Blanchard, 1850 syn. nov. de D. velutina, D. plaumanni Frey, 1972 syn. nov. de D. notaticollis Moser, 1921, D. popei Frey, 1972 syn. nov. de D. setosicollis Frey, 1942, D. metzi Kraatz, 1895 syn. nov. e D. unicolor fulvicollis Kraatz, 1895 syn. nov. de D. unicolor Kraatz, 1895, D. piligera Blanchard, 1850 syn. nov.de D. subvestita Guérin-Méneville, 1844, D. flavoscutellata viridescens Moser, 1919 syn. nov. de D. flavoscutellata Laporte, 1832, D. squamulata Moser, 1919 syn. nov. de D. hirtipes Laporte, 1832 (anteriormente sinônimo de D. subvestita), e D. hirsuta Frey, 1972 sinônimo novo de Dasyus collaris LePeletier & Audinet-Serville, 1828. Quarenta e oito espécies novas são descritas: D. abdita sp. nov., O. albisetosa sp. nov., D. armatipennis sp. nov., D. atra sp. nov., D. bellicosa sp. nov., D. bilix sp. nov., D. bilopha sp. nov., D. concolor sp. nov., D. confusa sp. nov., D. crassa sp. nov., D. cruralis sp. nov., D. denticulata sp. nov. , D. dubia sp. nov., D. echinosa espécie nova, D. euryta sp. nov., D. fallax sp. nov., D. flava sp. nov., D. glabra sp. nov., D. gracilis sp. nov., D. hexaphylla sp. nov., D. hirta sp. nov., D. idiota sp. nov., D. imitatrix sp. nov., D. inermis sp. nov., D. inops sp. nov., D. lanosa sp. nov., D. leptonyx sp. nov., D. mendax sp. nov., D. mimosa sp. nov., D. minuta sp. nov., D. neglecta sp. nov., D. nigripennis sp. nov., D. notosia sp. nov., D. nudipes sp. nov., D. perfida sp. nov., D. pinnigera sp. nov., D. punctata sp. nov., D. pusillanimai sp. nov., D. quadricornis sp. nov., D. rugosa sp. nov., D. serrata sp. nov., D. tetraphyllai sp. nov., D. tomentosa sp. nov., D. tridentata sp. nov., D. una sp. nov., D. unguiculata sp. nov., D. villosa sp. nov., D. zephyria sp. nov. Lectótipos para 29 espécies e neótipos para D. hirtipes e D. flavoscutellata são designados. São caracterizadas pela primeira vez a fêmea de D. ebenina Blanchard, 1850, D. laevipennis Moser, 1921, D. marshalli, D. peruana Frey, 1972, D. quadricristata, D. similis Frey, 1972, D. subvestita, e o macho de D. badia. São disponibilizados uma chave de identificação para as espécies, notas biológicas, mapa da distribuição geográfica, novos registros de ocorrência e a primeira hipótese filogenética para o gênero baseada em análise cladística. Além disso, uma nova hipótese filogenética é proposta para Macrodactylini, baseada no estudo das espécies-tipo dos gêneros da tribo. Como resultado da análise filogenética, o gênero Dicrania é monofilético e Macrodactylini é polifilético. Objetivando uma classificação que reflita a organização natural dos táxons e corrigir a sistemática do grupo, são revalidados sinônimos prévios de Macrodactylini; além disso a tribo recebe uma nova definição, Macrodactylini, sensu novum. Cinco tribos são revalidadas: Barybini Gutiérez, 1952, reval., emend.; Ceraspini Burmeister, 1855, reval.; Clavipalpini Lacordaire, 1856, reval.; Dicraniini Burmeister, 1855, reval., emend.; Plectrini Burmeister, 1855, reval. / The taxonomic review and cladistic analysis of Dicrania LePeletier & Audinet-Serville, 1828 (Coleoptera, Scarabaeidae, Melolonthinae), previously with 40 species are presented. After this study, the genus comprises 81 South American species. A generic synonymy is proposed to monotypic Canestera Saylor, 1938 syn. nov. for Dicrania and a new combination to the species previously placed on the former genus, D. marshalli (Saylor, 1938) comb. nov. Plectris pellita (Eschscholtz, 1822) comb. nov. is transferred from Dicrania to Plectris LePeletier & Audinet-Serville, 1828. Three species are revalidated: Dicrania badia Burmeister, 1855 reval., formerly synonymy of D. castaneipennis Chevrolat, 1844, Dicrania quadricristata Guérin-Méneville, 1844 reval., formerly synonymy of D. velutina Guérin-Méneville, 1830, and D. nigricans Laporte, 1832 reval., formerly synonymy of D. flavoscutellata Laporte, 1832. Three synonymies are confirmed: D. femorata (Mannerheim, 1829) for D. appendiculata (Mannerheim, 1829), D. lasiopus Burmeister, 1855 for D. nigricans Laporte, 1832, and D. luridipennis (Laporte, 1832) for D. nigra LePeletier & Audinet-Serville, 1828. Ten new synonymies are proposed: D. morio Kraatz, 1895 syn. nov. and D. rugosipennis Blanchard, 1850 syn. nov. for D. velutina, D. plaumanni Frey, 1972 syn. nov. for D. notaticollis Moser, 1921, D. popei Frey, 1972 syn. nov. for D. setosicollis Frey, 1942, D. metzi Kraatz, 1895 syn. nov. and D. unicolor fulvicollis Kraatz, 1895 syn. nov. for D. unicolor Kraatz, 1895, D. piligera Blanchard, 1850 syn. nov. for D. subvestita Guérin-Méneville, 1844, D. flavoscutellata viridescens Moser, 1919 syn. nov. for D. flavoscutellata Laporte, 1832, D. squamulata Moser, 1919 syn. nov., formerly synonymy of D. subvestita for D. hirtipes Laporte, 1832, and D. hirsuta Frey, 1972 syn. nov. for Dasyus collaris LePeletier & Audinet-Serville, 1828. Forty eigth species are described: D. abdita sp. nov., D. albiserosa sp. nov., D. armatipennis sp. nov., D. atra sp. nov., D. bellicosa sp. nov., D. bilix sp. nov., D. bilopha sp. nov., D. concolor sp. nov., D. confusa sp. nov., D. crassa sp. nov., D. cruralis sp. nov., D. crassa sp. nov., D. denticulata sp. nov., D. dubia sp. nov., D. echinosa sp. nov., D. euryta sp. nov., D. fallax sp. nov., D. flava sp. nov., D. glabra sp. nov., D. gracilis sp. nov., D. hexaphylla sp. nov., D. hirta sp. nov., D. idiota sp. nov., D. imitatrix sp. nov., D. inermis sp. nov., D. inops sp. nov., D. lanosa sp. nov., D. leptonyx sp. nov., D. mendax sp. nov., D. mimosa sp. nov., D. minuta sp. nov., D. neglecta sp. nov., D. nigripennis sp. nov., D. notosia sp. nov., D. nudipes sp. nov., D. perfida sp. nov., D. pinnigera sp. nov., D. punctata sp. nov., D. pusillanima sp. nov., D. quadricornis sp. nov., D. rugosa sp. nov., D. serrata sp. nov., D. tetraphylla sp. nov., D. tomentosa sp. nov., D. tridentata sp. nov., D. una sp. nov., D. unguiculata sp. nov., D. villosa sp. nov., D. zephyria sp. nov. Lectotypes to 29 species and neotype to D. hirtipes and D. flavoscutellata are designed. The previously unknown female of D. ebenina Blanchard, 1850, D. laevipennis Moser, 1921, D. marshalli, D. quadricristata, D. peruana Frey, 1972, D. similis Frey, 1972, D. subvestita, and male of D. badia are first time characterized. Keys to species, biological notes, geographic distribution, new occurrences and the first phylogenetic hypothesis to Dicrania based on cladistics analysis are provided. Furthermore, a new phylogenetic hypothesis to Macrodactylini is presented based on the type species of the genera. As resulting of this analysis, Dicrania is monophyletic and Macrodactylini as polyphyletic. To correct and clarify the group systematic and recover the natural condition of the group, some formerly synonymies of Macrodactylini are revalidated, and the tribe receives a new view, Macrodactylini sensu novum. Five tribes are revalidated: Barybini Gutiérez, 1952, reval., emend.; Ceraspini Burmeister, 1855, reval.; Clavipalpini Lacordaire, 1856, reval.; Dicraniini Burmeister, 1855, reval., emend.; Plectrini Burmeister, 1855, reval.

Abordagens como homologia, construção de táxons e reconstrução da filogenia podem ser contextualizadas e investigadas por meio de uma conexão histórica e atual entre sistemática e filosofia. A presente tese defende essa conexão científico-filosófica, tendo como estudo de caso ambos o complexo Ocotea, que abrange 13 gêneros e 750 espécies predominantemente neotropicais, e o grupo Ocotea indecora, com 20 espécies e centro de diversidade na floresta atlântica do sudeste do Brasil. O capítulo 1 discute a conceitualização de táxons e homologias (táxica e transformativa) como ambos indivíduos e espécies naturais (ou agrupamentos de espécies com propriedade homeostática). Embora essas conceitualizações não sejam mutuamente exclusivas metafisicamente, a perspectiva das espécies naturais é defendida, enquanto a dos indivíduos desafiada, com base em uma motivação por aspectos empírico-pragmáticos e teórico-explicativos em sistemática e evolução. O capítulo 2 foca no renascimento da morfologia na sistemática filogenética, com base em duas teorias da verdade em epistemologia, i.e., coerência e correspondência, chamando para a unificação de ambas a teorias partir de uma teoria funderentista de justificação epistêmica das hipóteses de relação filogenética. O papel e o significado da morfologia também são discutidos no contexto de análises separadas e combinadas, paleontologia, espécies naturais, conceito de caráter, homologia, sinapomorfia, semaforonte, modularidade e taxonomia. O renascimento da morfologia não é apenas dependente de uma perspectiva científico-filosófica mas também depende de uma reforma política, econômica, social e educacional na sistemática contemporânea. O capítulo 3 é uma filogenia do complexo Ocotea com análise combinada de dados morfológicos e da região nuclear ribossômica ITS. São discutidos o papel e o significado das evidências morfológica e molecular, das análises separadas e combinadas, bem como modularidade e homologia. Subclados dentro do complexo Ocotea são inferidos e delimitados por sinapomorfias morfológicas. Uma perspectiva de classificação filogenética dos gêneros do complexo Ocotea também é fornecida. O capítulo 4 trata de mudanças taxonômicas e nomenclaturais no grupo O. indecora, basicamente sinonimizações, lectotopificações e uma nova combinação. O capítulo 5 é uma revisão do grupo O. indecora, com base na análise de ca. 550 coleções. Chave de identificação, descrições, bem como comentários sobre a circunscrição, distribuição, habitat, fenologia e relações taxonômicas das espécies do grupo são fornecidos. / Approaches as homology, construction of taxa, and phylogeny reconstruction can be contextualized and investigated through a historical and current connection between systematics and philosophy. The present thesis defends this scientific-philosophical connection, having as study case both the Ocotea complex, which embraces 13 genera and 750 species predominantly Neotropical, and the Ocotea indecora group, with 20 species and centre of diversity in the Atlantic forest from Southeastern Brazil. The chapter 1 discusses the conceptualization of taxa and homologies (taxic and transformative) as both individuals and natural kinds (or homeostatic property cluster kinds). Although these conceptualizations are not mutually exclusive metaphysically, the perspective of natural kinds is endorsed, whereas that of individuals challenged, based on the motivation for empirical-pragmatic and theoretical-explanatory aspects in systematics and evolution. The chapter 2 focuses on the renaissance of morphology in phylogenetic systematics based on two theories of truth in epistemology, i.e., coherence and correspondence, calling for a unification of both theories from a fundherentist theory of epistemic justification of hypotheses of phylogenetic relationship. The role and meaning of morphology are also discussed in the context of separate and combined analyses, paleontology, natural kinds, character concept, homology, synapomorphy, semaphoront, modularity, and taxonomy. The renaissance of morphology is not only dependent on a scientific-philosophical perspective but it is also dependent on a political, economic, social, and educational reform in contemporary systematics. The chapter 3 is a phylogeny of the Ocotea complex with combined analysis of morphology and ITS nuclear ribosomal region. The role and meaning of morphological and molecular evidence, separate and combined analyses, as well as modularity and homology are discussed. Subclades within the Ocotea complex are inferred and delimited by morphological synapomorphies. A perspective of phylogenetic classification of the genera of the Ocotea complex is provided. The chapter 4 treats of taxonomic and nomenclatural changes in the O. indecora group, basically synonyms, lectotypifications, and a new combination. The chapter 5 is a revision of O. indecora group based on the analysis of ca. 550 collections. Identification key, descriptions, as well as comments on its circumscription, distribution, habitat, phenology, and taxonomic relationships of its species are provided.

As espécies neotropicais de Myrtaceae pertencem à tribo Myrteae e a região neotropical concentra a maior diversidade da tribo. Enquanto os estudos sistemáticos do grupo têm avançado, os estudos biogeográficos na região ainda são escassos. Dentre os sete grupos de Myrteae, encontra-se \"Myrcia group\" (=Myrcia s.l.), de distribuição exclusivamente neotropical. O grupo conta com mais de 700 espécies nos três gêneros reconhecidos - Calyptranthes, Marlierea e Myrcia, porém, a sinonimização dos dois primeiros em Myrcia é necessária. Em estudo filogenético recente, foram definidos nove grupos em Myrcia s.l., um deles o clado 7. Os objetivos deste trabalho foram realizar uma análise filogenética do clado 7, concluir a revisão taxonômica e as atualizações nomenclaturais desse mesmo grupo e estudar os padrões biogeográficos de Myrcia s.l. O estudo filogenético do clado 7 conta com 18 dentre as 22 espécies inferidas, somando 105 amostras; as análises de parcimônia e bayesiana foram baseadas nos marcadores ITS, ndhF, psbA-trnH, trnL e trnQ, e a hipótese filogenética foi contraposta com dados morfológicos. Para a revisão taxonômica e as atualizações nomenclaturais, a coleção de 49 herbários foi analisada e 15 expedições de coleta foram realizadas. Para o estudo biogeográfico de Myrcia s.l., a região Neotropical foi dividida em oito unidades; na análise filogenética de Myrcia s.l., incluindo cinco marcadores de 182 amostras, o fóssil Paleomyrtinaea (56 Ma) foi posicionado no crown node de Myrteae e a diversificação das linhagens foi estimada pelo \"lognormal relaxed clock\"; na análise biogeográfica (\"DEC model\"), os valores de \"dispersal constraints\" foram baseados na distância e nas evidências de ligações florísticas entre as unidades. As análises filogenéticas corroboraram o monofiletismo do clado 7, que foi circunscrito morfologicamente e chamado informalmente de Sympodiomyrcia, nome que faz alusão à ramificação simpodial encontrada nas ramificações vegetativas e, principalmente, nas ramificações basais da inflorescência. As relações internas mostram em geral pouca resolução. Calyptranthes emerge como o grupo-irmão de Sympodiomyrcia e a morfologia corrobora tal relacionamento. Na revisão taxonômica, a caracterização da morfologia de órgãos e estruturas do grupo é fornecida, bem como uma chave de identificação para as espécies. O tratamento taxonômico inclui dados nomenclaturais, morfológicos, geográficos, biológicos e de conservação sobre cada espécie. Até o momento, são reconhecidas 21 espécies em Sympodiomyrcia, seis delas inéditas. Com relação ao estudo biogeográfico de Myrcia s.l., a Mata Atlântica Montana aparece como área ancestral em diversas linhagens. Já a diversificação inicial de Calyptranthes provavelmente se deu do Caribe e, subsequentemente, houve uma expansão para o Sul. O Planalto das Guianas e a Mata Atlântica de Terras Baixas também aparecem como áreas ancestrais de grupos de Myrcia s.l. Os principais eventos de diversificação ocorreram ao longo do Mioceno. Apesar dos resultados, verifica-se que ainda é necessário adensar a amostragem, aumentar o número de marcadores e realizar estudos sobre a morfologia e a biologia de Myrcia s.l., o que será fundamental para melhorar a compreensão da história filogenética e biogeográfica deste grande grupo / The Neotropical species of Myrtaceae belong to the tribe Myrteae, which is most diverse in this region. While the systematics studies of the group have experienced gradual progress, the biogeographic studies are still scanty. \"Myrcia group\" (=Myrcia s.l.), exclusively Neotropical, is one of the seven groups of Myrteae. This group comprises about 700 species in the three recognized genera - Calyptranthes, Marlierea e Myrcia, but the synonymization of the two former in Myrcia is needed. In a recent phylogenetic study, nine groups were proposed in Myrcia s.l., one of them been the clade 7. The aims of this study are to carry out phylogenetic analysis and to conclude the taxonomic revision and nomenclatural updates of the clade 7, and to study the biogeographic patterns of Myrcia s.l. The phylogenetic study of the clade 7 includes 18 of the 22 species inferred for the group, totalizing 105 samples; the parsimony and bayesian analyses were based in the ITS, ndhF, psbA-trnH, trnL and trnQ markers, and the results were compared with the morphology. The collections of 49 herbaria were checked and 15 field expeditions were carried out for the taxonomic revision and nomenclatural updates. In the biogeographic study, the Neotropical region was divided in eight units; in the phylogenetic analysis of Myrcia s.l., which includes five markers and 182 samples, the Paleomyrtinaea fossil (56 Ma) was placed at the crown node of Myrteae and the lineage divergence times were estimated by the lognormal relaxed clock; the DEC model was used for the biogeographic analysis, in which the dispersal constraints were based in the distance and floristic links between the units. The phylogenetic analysis confirm that the clade 7 is monophyletic; the group was morphologically defined and informally named Sympodiomyrcia, which alludes to the sympodial branching found in the vegetative branches and mainly in the basal branching of the inflorescence. The internal relationships show low resolution. Calyptranthes is the sister group of Sympodiomyrcia and the morphology reinforces this relationship. A morphological characterization and an identification key for the species are provided in the taxonomic revision. The taxonomic treatment includes nomenclatural, morphological, geographical, biological and conservational data about each species. Until now, Sympodiomyrcia contains 21 species, which six are undescribed. Concerning the biogeographic study of Myrcia s.l., the Montane Atlantic Forest appears as the ancestral area of several lineages. In contrast, the initial diversification of Calyptranthes probably occurred in the Caribbean region and then the group expanded to the south. The Guiana Shield and the Lowland Atlantic Forest also appear as the ancestral area of Myrcia s.l. lineages. The main diversification events occurred during the Miocene. It is still necessary to expand the sampling, to increase the number of markers and to carry out morphological and biological studies of Myrcia s.l., what will be essential to improve the knowledge of the phylogenetic and biogeographic histories of this big group

O gênero Cercomacra Sclater, 1858 possui 12 espécies, para as quais foram descritos 34 nomes. Ocorre amplamente na Amazônia, mas possui representantes na América Central, oeste dos Andes e na Mata Atlântica brasileira. É tradicionalmente composto por dois grupos distintos, nigricans e tyrannina, segregação baseada nos padrões da plumagem das fêmeas e nas vocalizações dos machos. Estas peculiaridades instigaram a revisão taxonômica deste gênero, após a qual foram propostas hipóteses filogenéticas sob o critério de parcimônia dos terminais com base em caracteres osteológicos, de plumagem e vocais. Foram examinados 52 esqueletos, além de 4.805 espécimes de Cercomacra conservados em via seca e depositados em 36 coleções ornitológicas nacionais e do exterior. Também foi possível analisar 1.097 gravações de Cercomacra disponibilizadas por colaboradores e de arquivos pessoais. Para determinação de caracteres e seus estados, outros 181 esqueletos pertencentes a 55 gêneros (englobando 119 espécies) e outras 85 peles de 14 gêneros (de 15 espécies) foram considerados grupos externos. Na revisão taxonômica foram determinadas 28 espécies filogenéticas inequivocamente diagnosticáveis por ao menos um caráter, seja ele morfológico ou vocal. Seis espécies não possuem nome prévio disponível e serão descritas futuramente. Foram realizadas quatro análises filogenéticas distintas com a utilização de diferentes caracteres: (A) osteológicos, (B) de plumagem, (C) de plumagem, vocais e de história natural e (D) evidência total. Três clados principais foram definidos com suporte máximo do índice de Bremer: Drymophila+Hypocnemis, grupo nigricans e grupo tyrannina. Embora o relacionamento entre eles não tenha sido resolvido, a monofilia de Cercomacra não foi recuperada. Isso ocorreu apenas com a inclusão de caracteres vocais nas matrizes de estados de caracteres (hipóteses C e D). Na ausência de um nome pretérito para o clado tyrannina, ele deve receber um nome recém proposto: Cercomacroides Tello & Raposo in TELLO et. al. (2014). As hipóteses filogenéticas mencionadas são similares àquelas recentemente publicadas e realizadas com dados moleculares, mas a topologia dos grupos internos apresenta variações. Caracteres osteológicos foram considerados pouco informativos para resolução das topologias dos terminais e, embora a monofilia de Cercomacra e Cercomacroides tenham sido recuperadas apenas com a inclusão de caracteres vocais, somente caracteres de plumagem são sinapomorfias de Cercomacra. Como já sugerido anteriormente, este estudo comprova que, de acordo com o conceito de espécie considerado, apenas um caráter vocal pode ser suficiente para a diagnose de uma espécie. São sugeridas futuras direções para a pesquisa com estes gêneros, especialmente com relação à distribuição geográfica de algumas espécies, as quais ainda não a possuem claramente determinada / The genus Cercomacra Sclater, 1858 has 12 species, to which up to 34 names were given. It occurs widely in the Amazon, but some taxa range in Central America, west of the Andes and in the Brazilian Atlantic Forest. It is traditionally composed of two distinct groups, tyrannina and nigricans, a segregation founded on patterns of female plumage and male vocalizations. I was instigated by these peculiarities to conduct the taxonomic revision of this genus. I then proposed phylogenetic hypotheses of all terminals under the criterion of parsimony based on osteological, plumage and vocal characters. I examined some 52 skeletons and 4,805 specimens of Cercomacra deposited in 36 national and foreign ornithological collections. I also analyzed 1,097 Cercomacra recordings available from colleagues and personnal archives. I considered some 181 skeletons of 55 genera (comprising 119 species) and another 85 skins of 14 genera (of 15 species) of out groups to determine character states. My taxonomic revision revealed 28 phylogenetic species unequivocally diagnosed by at least one character, be it morphological or vocal. Six species had no previous available names and will be described elsewhere. I conducted four distinct phylogenetic analyzes using different character sets: (A) osteological, (B) plumage, (C) plumage, vocal and natural history and (D) total evidence. Three major clades were defined with maximum Bremer index support: Drymophila+Hypocnemis, nigricans group and tyrannina group. Although their relationship could not be resolved, the monophyly of Cercomacra was not recovered. This occurred only with the inclusion of vocal characters in the character states matrix (hypotheses C and D). Due to the absence of a previous epithet for the tyrannina clade, it should receive a recently proposed name: Cercomacroides Tello & Raposo in TELLO et al. (2014). The phylogenetic hypotheses aforementioned are similar to those recently published and performed with molecular data, but the topology of the in groups differ. I concluded osteological characters were non informative to resolve terminal topologies and, although the monophyly of Cercomacra and Cercomacroides were recovered only with the inclusion of vocal characters, plumage characters alone were synapomorphies of Cercomacra. As previously suggested, this study proves that, depending on the species concept, only one vocal character may be enough for the diagnosis of a species. I eventually suggest future directions with these genera, especially with regard to the geographical distribution of some species, which have not yet been clearly determined

Resumo: O gênero Erythrolamprus atualmente agrupa 50 espécies que têm sido incluídas tradicionalmente nos gêneros Erythrolamprus, Liophis e Umbrivaga. Embora a recente sinonimização tem sido suportada em todas as análises moleculares, ainda existe debate, devido ao baixo número de espécies incluídas e a falta de sinapomorfías morfológicas. Dentro de Erythrolamprus, podem se reconhecer 13 grupos com base nos arranjos taxonômicos tradicionais, mas a monofilia desses grupos nunca tem sido testada. Utilizando 78 caracteres de osteologia craniana e hemipênis, e seis genes: três mitocondriais (coi, 12s, cytb) e três nucleares (bdnf, cmos, nt3); para 27 espécies, testamos a monofilia do gênero, dos grupos taxonômicos e das espécies, além do relações internas. Realizamos analises de parcimônia, bayesianos e de máxima verossimilhança para os dados moleculares; enquanto que para as matrizes morfológica e combinada (morfologia e molecular) só foi utilizada analise de parcimônia. Os nossos resultados recuperaram monofilético Erythrolamprus como atualmente aceito, nove clados principais dentro do gênero, sendo que para a maioria deles propomos sinapomorfias morfologicas. Só quatro dos grupos taxonômicos tradicionais foram recuperados monofileticos. Erythrolamprus sagittifer foi encontrada aninhada dentro de Lygophis e é realocada neste gênero. Adicionalmente, para o clado conformado por E. almadensis, E. atraventer, E. carajasensis, E. jaegeri, E.maryellenae, E. viridis ressuscitamos o gênero Leimadophis, dado que foi recuperado como irmão de todas as outras espécies do clado Erythrolamprus. / Abstract: The genus Erythrolamprus currently groups 50 species that have traditionally been allocated in the genera Erythrolamprus, Liophis and Umbrivaga. Although synonymization of these three genera with Erythrolamprus finds support in all molecular studies, the systematic value of such nomenclatural act is still under debate, mainly because of the lack of morphological synapomorphies and dense taxonomic sampling for the group. Within Erythrolamprus, 13 taxonomic groups may be recognized based in a traditional taxonomic arrangement, but its monophyly has never been tested. The present study analyzed 78 morphological characters, from cranial osteology and hemipenis, and six genes, three mitochondrial (coi, 12s, cytb) and three nuclear (bdnf, cmos, nt3), in 27 species representing all previously recognized taxonomic groups, in order to test the monophyly of the genus and of its constituent parts. We performed parsimony, bayesian and maximum likelihood analyses for the molecular data, and parsimony analyses for morphological and combined matrices (morphology and molecules). Our results retrieved a monophyletic genus Erythrolamprus as currently accepted, composed by nine main clades that are, for most of them, supported by morphological synapomorphies. On the other hand, only four of the traditional taxonomic groups were retrieved as monophyletic. Erythrolamprus sagittifer was found to be nested within Lygophis and is reallocated in that genus. Additionally, we resurrected the genus Leimadophis for the clade formed by E. almadensis, E. atraventer, E. carajasensis, E. jaegeri, E.maryellenae, and E. viridis, since it was recovered as the sister group of a clade composed by all the other species of the genus Erythtorlamprus.

A Amazônia abriga uma grande parcela da biodiversidade mundial, no entanto, existem grandes incertezas sobre os processos de geração e manutenção dessa enorme diversidade, com várias hipóteses propostas até o momento. Diversas características como tamanho pequeno, baixa capacidade de dispersão e fidelidade ao ambiente estritamente florestal fazem de lagartos do gênero Loxopholis (Squamata: Gymnophthalmidae) candidatos ideais para rastrear a história de modificações da paisagem no norte da América do Sul durante o Neogeno. Nesta tese, revisamos a variação morfológica, taxonomia e a distribuição geográfica das espécies do gênero Loxopholis, assim como estimamos as relações filogenéticas e o tempo de divergência entre as espécies com base em sequências de DNA provenientes do genoma mitocondrial e nuclear. Com essa base de dados, construímos um modelo de como ocorreu a história evolutiva de Loxopholis, discutindo os resultados a partir de reconstruções geológicas provenientes da literatura, e fornecendo uma datação independente para eventos geológicos que potencialmente influenciaram a história evolutiva do gênero. Neste estudo, também revelamos que a atual diversidade descrita para Loxopholis está severamente subestimada. Encontramos que a espécie L. osvaldoi representa um complexo de espécies crípticas, contendo de 8 a 14 potenciais espécies novas, com profundas divergências genéticas tanto nos genomas mitocondrial e nuclear, praticamente dobrando a diversidade conhecida no gênero. No entanto, a morfologia em Loxopholis é extremamente conservada, dificultando a diagnose das espécies novas. Finalmente, descrevemos a primeira população bissexual da espécie partenogenética L. percarinatum, discutindo as implicações deste achado para o entendimento relativo a aparição da partenogênese em Loxopholis / The Amazon rainforest houses a significant portion of the world biodiversity, however, there is still a lot of uncertainty about the processes involved in its generation and maintenance, with several hypotheses proposed so far. Loxopholis lizards (Squamata: Gymnophthalmidae) are small-sized; show low vagility, and high fidelity to the humid forest environment, making them ideal to test hypotheses on the history of landscape modifications in Northern South America, during the Neogene. In this thesis, we revise the morphological variation, the taxonomy, and the geographic distribution of Loxopholis species, as well as estimated a phylogenetic hypothesis and divergence times for these species based on sequences from mitochondrial and nuclear DNA. With this dataset, we build a model for the evolutionary history of Loxopholis and compared the results with geologic reconstructions of the Amazon available in the literature, which provided independent time estimates for geological events that potentially affected the evolutionary history of genus. In this study, we also showed that the actual diversity described for Loxopholis was severely underestimated. We found that L. osvaldoi represents a complex of cryptic species with 8-14 potential new species, and strong divergences in both the mitochondrial and the nuclear genomes, virtually doubling the actual diversity in the genus. Finally, we describe the first bisexual population for the parthenogenetic species L. percarinatum, discussing its implications to the origin of parthenogenesis in the genus

A tribo Chauliognathini, na atual definicão, é composta por ca. 650 espécies em 14 gêneros: Chauliognathus, Daiphron, Microdaiphron, Malthesis, Psilorhynchus, Belotus, Maronius, Paramaronius, Maroniodes, Lobetus, Pseudolobetus, Macromalthinus, Malthoichthyurus e Malthinocantharis - estes dois últimos considerados incertae sedis. Caracteriza-se, principalmente, pela forte assimetria do abdômen e genitália dos machos, presença de sutura epistomal e ausência de esporões tibiais. Tradicionalmente, a classificação da subfamília Chauliognathinae e suas duas tribos era baseada principalmente no comprimento dos élitros: os gêneros de élitros longos eram agrupados em Chauliognathini, enquanto os de élitros curtos eram posicionados em Ichthyurini. Na atual classificação os gêneros foram redistribuídos e as tribos definidas com base na morfologia dos segmentos genitais e genitálias dos machos. Para testar a monofilia de Chauliognathini e verificar as relações entre seus gêneros foi feita uma análise cladística da tribo com 138 caracteres morfológicos envolvendo 45 espécies representantes de todos os gêneros de Chauliognathini e alguns de Ichthyurini, Silinae e Cantharinae. Foram encontradas 48 árvores igualmente mais parcimoniosas, com 341 passos de transformação. Demonstrou-se que Chauliognathini não é monofilética. Dois clados principais foram encontrados, agrupando os gêneros de acordo com a classificação tradicional de Chauliognathinae. O clado que representa a tribo Ichthyurini surge dentre os gêneros de Chauliognathini de élitros curtos. Os gêneros Chauliognathus, Daiphron, Malthesis, Belotus e Lobetus também são parafiléticos. Malthopterus pertence ao grupo formado pelos gêneros de élitros longos, enquanto Malthinocantharis deve ser excluído de Chauliognathini e posicionado em Silinae / The tribe Chauliognathini, in its current definition, is composed of approximately 650 species in 14 genera: Chauliognathus, Daiphron, Microdaiphron, Malthesis, Psilorhynchus, Belotus, Maronius, Paramaronius, Maroniodes, Lobetus, Pseudolobetus, Macromalthinus, Malthoichthyurus e Malthinocantharis - the two latter as incertae sedis. They are characterized by the strong asimmetry of the abdomen and male genitalia, presence of an epistomal suture and absence of tibial spurs. Traditionally, the classification of the subfamily Chauliognathinae and its two tribes were based mainly on elytral length: long-elytra genera were grouped in Chauliognathini, while short-elytra genera were classified in Ichthyurini. On present classification, the genera were redistributed and the tribes were defined based on the morphology of male genital segments and genitalia. To test the monophyly of Chauliognathini and to verify the relationships among its genera, it was conducted a cladistic analysis of the tribe with 138 morphological characters involving 45 species representative of all the genera of Chauliognathini, and some of Ichthyurini, Silinae and Cantharinae. The 48 equally most parsimonious trees (length=341) showed that Chauliognathini is not monophyletic. Two main clades were found, grouping the genera according to the traditional classification of Chauliognathinae. The clade that represents the tribe Ichthyurini is retrieved in a clade composed by the short-elytra genera of Chauliognathini. The genera Chauliognathus, Daiphron, Malthesis, Belotus and Lobetus are also paraphyletic. Malthopterus belongs to the group composed by long-elytra genera, while Malthinocantharis must be excluded from Chauliognathini and positioned in Silinae

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro / principalmente pelo baixo grau de complexidade de especialização, escassez de caracteres distintivos e a elevada plasticidade morfológica. A partir do século XIX emergiram classificações mais robustas. O que conhecemos hoje como Ordem Poecilosclerida só começou a ser delineado pela iniciativa de Zittel (1878) com o reconhecimento de Monaxonida, ou seja, reconhecimento de um padrão de simetria nas categorias de espículas. Ridley e Dendy (1887) apresentaram uma nova classificação para as esponjas do grupo Monaxonida utilizada por Topsent (1894) para criação da Familia Poeciloscleridae, eregida a ordem por este último autor em 1928, enfatizando a presença das quelas como microscleras. Posteriormente, van Soest (1984) e Bergquist e Fromont (1988) empreenderam discussões dessa classificação com base em uma perspectiva filogenética. Uma classificação robusta e de consenso só foi conseguida a partir dos trabalhos de Hajdu e colaboradores (1994a, 1994b) e Hajdu (1994, 1995), com o estabelecimento das Subordens: Mycalina, Myxillina e Microcionina. Apesar disso, as relações internas das famílias da Subordem Mycalina permaneciam com dúvidas, principalmente no tocante à inclusão de Podospongiidae, Isodictyidae, e a relação de Poecilosclerida com a Ordem Haplosclerida. Neste trabalho foi proposto a revisão da classificação da Subordem Mycalina com base em dados morfológicos e moleculares. Foram feitas análises filogenéticas em três níveis taxonômicos, espécie, gênero e família, com base em dados morfológicos. Além disso, foi feita uma análise filogenética molecular utilizando sequências parciais da subunidade maior do RNA ribossomal (LSU do RNAr). As amostras de Mycalina foram amplificadas via PCR e posteriormente sequenciadas. Com base nestes resultados foi concluído que: as Familias Cladorhizidae, Guitarridae, Mycalidae e Hamacanthidae são monofiléticas. Para esta última foi confirmada a série de transformação sigmancistra > cirtancistra > diâncistra > clavidisco. A posição da Familia Podospongiidae dentro de Mycalina está bem corroborada, porém, precisa ser melhor estudada com dados moleculares para determinar, ou não, o seu monofiletismo. A Familia Esperiopsidae precisa ser melhor estudada com base em dados morfológicos e o gênero Amphilectus precisa ser revisado, provavelmente uma parte deste estaria melhor alocado em Haplosclerida junto com Isodictyidae. A Familia Desmacellidae não é monofilética, bem como Biemna e Neofibularia, provavelmente, não são Poecilosclerida e deveriam ser transferidas para uma posição próxima de Tetractinellida. Desmacella provavelmente é uma Mycalina com posição basal na Subordem. Os demais gêneros precisam ser estudados com base em dados moleculares. A Ordem Haplosclerida provavelmente é o grupo irmão de Poecilosclerida e a série de transformação sigmas > quelas foi confirmada com base em dados morfológicos e moleculares. A Subordem Mycalina não é monofilética como definida em Hajdu e van Soest (2002a). Palavras-chave: Sistemática. Porifera. Evolução. / At Phylum Porifera the proposition of classificatory schemes is troublesome, especially by the morphological low level complexity of specialization, paucity of distinctive characters and high plasticity. More robust classifications emerged since the XIXth. century. Poecilosclerida Order only began to be outlined by the initiative of Zittel (1878) with the recognition of "Monaxonida", i.e., a recognition of symmetry pattern in spicules categories. Ridley and Dendy (1887) presented a new classification of the sponges of the group "Monaxonida." Topsent (1894) created the Poeciloscleridae Family, and latter (1928) erected to Order, by emphasizing the presence of chelae as microscleras. Posteriorly, van Soest (1984) and Bergquist and Fromont (1988) undertook a discussion of this classification based on a phylogenetic perspective. A robust classification and consensus was not achieved before from the works of Hajdu et al. (1994a, 1994b) and Hajdu (1994, 1995), with the establishment of the Suborders: Mycalina, Myxillina and Microcionina. Nevertheless, the internal relationship of Mycalina Suborders families remained in doubt, especially regarding the inclusion of Podospongiidae, Isodictyidae, and the relationship between Poecilosclerida and Order Haplosclerida. In this study, we proposed the revision of the classification of Mycalina Suborder based on morphological and molecular data. Phylogenetic analysis was performed in three taxonomic levels, Species, Genus and Family, based on morphological data. The molecular phylogenetic analysis was made using partial sequences of Large Subunit ribosomal RNA (LSU rRNA). Samples of Mycalina were amplified by PCR and sequenced. Based of these, I concluded that: Families Cladorhizidae, Guitarridae, Mycalidae and Hamacanthidae are monophyletic. For this last, the transformation series, sigmancistra>cyrtancistra> diancistra>clavidisc, was confirmed. The position of Family Podospongiidae within Mycalina was well supported, but need to be studied with molecular data to determine monophyletic status. Family Esperiopsidae needs to be further studied based on morphological data; and Amphilectus Genus needs to be revised, probably it is splited and would be transfered to Order Haplosclerida together with Family Isodictyidae. Family Desmacellidae is not monophyletic, Biemna and Neofibularia are probably not Poecilosclerida and should be transferred to a position close to Tetractinellida. Desmacella is probably a true Mycalina with a basal position in the Suborder. The other genera need to be studied with molecular data. Order Haplosclerida is probably the sister group of Poecilosclerida; the series of transformation sigma>chela was established based on morphological and molecular data. Suborder Mycalina is not monophyletic as defined in Hajdu and van Soest (2002a).

Mechanisms for the generation of biodiversity in species-rich biomes such as rain forests remain unclear. Molecular phylogenies using DNA sequence data, calibrated with a temporal dimension offer a means of addressing this question, enabling the testing of different hypotheses on biogeographic histories and causes of diversification. Manilkara is a genus of trees in the Sapotaceae consisting of ~79 species distributed throughout the tropics (30 South and Central American, 35 African and 14 Southeast Asian). This species diversity in all major tropical regions of the globe makes it an ideal candidate for in-depth biogeographic studies. Maximum parsimony and Bayesian analyses of nuclear (ITS) and chloroplast (rpl32-trnL, rps16-trnK and trnS-trnFM) sequences were used to reconstruct a species level phylogeny of Manilkara and related genera in the tribe Mimusopeae. Manilkara, as currently defined, is not monophyletic due to the placement of three Asian taxa (M. fasciculata, M. dissecta and M. udoido), which are more closely related to the Madagascan genera Labourdonnaisia and Faucherea than to Manilkara s.s. and need to be re-circumscribed in a new genus. Letestua is nested in Manilkara and the genera Faucherea and Labourdonnaisia are not monophyletic. Nuclear and chloroplast datasets were mostly congruent, however, three instances of hard incongruence were demonstrated, suggesting chloroplast capture events. Bayesian analyses of ITS sequences using a relaxed molecular clock calibrated with fossils, focused on testing biogeographical hypotheses on the origin of Manilkara’s pantropical disjunct distribution and spatio-temporal diversification patterns on each continent. Mimusopeae, originated during the Eocene ~46-57 Ma and fossil evidence supports its existence in the boreotopical region of the northern hemisphere during this time. This suggests that the tribe may have evolved there and found refuge in Africa when Oligocene climatic cooling made higher latitudes uninhabitable for megathermal taxa. The subtribe Manilkarinae was resolved as ~42-36 Myo. These ages fall on the Eocene-Oligocene boundary and the crown node age coincides with the onset of Oligocene cooling and the closing of the boreotropical route. The genus Manilkara is estimated to have evolved ~36-33 Ma. The current distribution of the genus could not, therefore, have been the result of Gondwanan vicariance or migration through the boreotropics, but results instead support long distance dispersal as an important factor influencing the distribution of the group. Resolution along the backbone of the phylogeny is weak and the area of origin is, therefore, difficult to determine. However, all sister taxa to Manilkara are African and this suggests that the most likely explanation is an African origin for the genus with subsequent inter-continental dispersal during the Miocene. Manilkara spread from Africa to the Neotropics and Asia via at least three separate long distance dispersal events. A single lineage dispersed to the Neotropics ~27-21 Ma and spread across the Isthmus of Panama before its closure. Another lineage dispersed to Southeast Asia ~30-25 Ma from mainland Africa and subsequently diversified throughout the region. A third dispersal from Madagascar to the Sahul Shelf, occurred ~31-16 Ma in the M. fasciculata/dissecta/udoido lineage. In South America, diversification is consistent with both aridification and the rearrangement of drainage patterns in the Amazon basin as a result of Andean orogeny. The Atlantic coastal forest clade and the Amazonian clade of Manilkara split from one another ~14 Ma, at approximately the same time as the dry biomes of the Cerrado and Caatinga were forming between them. In Africa diversification coincides with Tertiary cycles of aridification and uplift of the east African plateaux. In Southeast Asia Wallace’s Line did not affect the dispersal of Manilkara. Instead, the limiting factor was the appearance of land in New Guinea ~10 Ma, which coincides with the dispersal and establishment of new taxa east of Wallace’s Line. Spatio-temporal patterns of diversification in Manilkara were compared to those of 34 other wet tropical genera which have intercontinental disjunctions. Ages of disjunctions ranged from the Eocene to the Pliocene, indicating that compilation of the tropical rain forest biome is a dynamic process which has been occurring throughout the Tertiary. Recent migration via long distance dispersal is a significant phenomenon in biome construction. Geo-climatic events have also been shown to be important drivers of diversification in all continental regions.