Orientador: Mary Anne Heidi Dolder / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-10T17:43:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Leite_RodrigoPaula_M.pdf: 5609286 bytes, checksum: 3ec427e58604a2e57788f27cb168bf44 (MD5) Previous issue date: 2008 / Resumo: O guaraná (Paullinia cupana Mart. var. Sorbilis) é uma planta originária do Brasil encontrada na região da Bacia Amazônica. Estudos prévios vêm demonstrando a propriedade antioxidante do extrato de guaraná e sua capacidade neutralizar radicais livres. Essa planta é tradicionalmente usada com fins terapêuticos diversos e recentemente tem-se investigado sua capacidade de atuar no tratamento de patologias relacionadas ao desequilíbrio da atividade oxidante da célula. O cádmio é um metal pesado com propriedades tóxicas aos organismos e a contaminação por este elemento torna-se preocupante devido ao seu grande efeito cumulativo e meia vida biológica longa. Esse metal tem sido considerado um importante poluente ambiental, sendo as suas principais fontes de exposição o despejo industrial, a poluição atmosférica e o tabaco. Sabe-se que a natureza tóxica do cádmio é, em parte, devida à sua ação oxidante no organismo, estimulando a produção de radicais livres que causam danos celulares. Os testículos são particularmente vulneráveis aos efeitos tóxicos desse metal, sendo que neste órgão a propriedade cumulativa do cádmio parece ser acentuada. Portanto, os testículos atuam como um importante modelo experimental para estudos referentes aos efeitos tóxicos do cádmio e à possíveis alternativas terapêuticas para os efeitos adversos deste metal. Baseando-se nestas informações, o presente estudo avaliou o potencial do guaraná em atenuar os danos causados pelo cádmio no testículo de ratos Wistar adultos. Foram desenvolvidos dois modelos experimentais diferentes: 1o- administração preventiva do guaraná durante 56 dias antes da exposição ao cádmio; 2o- administração do guaraná durante 56 dias após a exposição ao cádmio. Para análises comparativas, também foram montados um grupo tratado somente com cádmio e um grupo tratado somente com guaraná. As amostras de testículo foram coletadas e submetidas a análises histológicas, morfométricas e ultra-estruturais, e os resultados obtidos estão expostos em dois artigos científicos / Abstract: Guaraná (Paullinia cupana Mart. var. Sorbilis) is a Brazilian plant, found in the Amazon basin. Previous studies have demonstrated the antioxidant properties of guaraná and its potential to neutralize free radicals. This plant is traditionally used for several therapeutic purposes and, recently, has been investigated to ascertain the potential of guaraná to counterbalance cellular oxidative disorders. Cadmium is a toxic heavy metal, and the contamination by this element is more harmful due to its long biological half-life, and therefore its accumulation in the organism. This metal is considered important for environmental pollution, in which exposition occurs through industrial wastes, atmospheric pollution and tobacco smoking. Cadmium is known to be toxic partly due to its oxidative effect in the organism, stimulating the production of free radicals that cause cellular damage. The testicles are particularly vulnerable to the toxic effects of this metal and this organ has higher cumulative properties. Therefore the testicles are an important experimental model for studies of the toxic effects of cadmium and the possible therapeutic alternatives for the adverse effects of this metal. Based on this information, the present study evaluated the potential of guaraná to attenuate the harm caused by cadmium in adult rat testicles. Two experimental models were developed: 1) Preventive administration of guaraná during 56 days before exposition to cadmium; 2) Administration of guaraná during 56 days after exposition to cadmium. For comparative analysis, a group was also treated only with cadmium or only with guaraná. Testicle samples were collected and submitted to histological, morphometrical and ultrastructural analysis and the results are presented in the form of two scientific articles. The results show that guaraná is beneficial in both experimental models, contributing to the maintenance of testicular morphology / Mestrado / Biologia Celular / Mestre em Biologia Celular e Estrutural

Orientador: Francisco Eduardo Martinez / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-11T07:02:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Chuffa_LuizGustavodeAlmeida_M.pdf: 17135101 bytes, checksum: 8f33ca2035c16a60e6aeaeb2a8f607d9 (MD5) Previous issue date: 2008 / Resumo: O alcoolismo crônico está inserido no grupo das principais doenças classificadas como oriundas de distúrbios mentais, sendo as mulheres mais atingidas em relação aos homens. Embora, o álcool conduza inicialmente a estímulos emocionais benéficos para o organismo, proporcionando aumento da euforia, do prazer, entre outros, seu uso excessivo e prolongado pode promover efeitos colaterais indesejáveis, inclusive sobre a reprodução. Na literatura existem poucos estudos envolvendo as conseqüências do alcoolismo crônico em fêmeas. O presente trabalho tem como objetivo elucidar as alterações manifestadas no ovário de ratas adultas UChA e UChB (consumidoras voluntárias de etanol a 10%). Após o período de tratamento, 42 ratas subdivididas em três grupos experimentais (UChA, UChB e Wistar) foram eutanasiadas por decapitação, e os ovários coletados e processados para análise em microscopia de luz e eletrônica de transmissão. O material foi corado com Hematoxilina e Eosina, Tricrômico de Masson, Azul de Toluidina, ácido periódico de Schiff, Giemsa, Feulgen e, empregou-se o método enzimológico para atividade da fosfatase ácida e alcalina. Os parâmetros: peso corpóreo e dos genitais, índice de ganho de peso, duração dos ciclos estrais e dosagens hormonais (FSH, LH, _-estradiol e progesterona) foram avaliados. A análise estatística foi realizada com 5% de significância. Não houve diferença significativa entre o peso dos animais no início e final do experimento, embora, ao final do experimento, os animais do grupo UChB apresentaram maior índice de ganho de massa. O peso relativo dos ovários dos animais UChB mostrou-se significativamente menor comparado ao grupo Wistar. As dosagens hormonais não apresentaram diferenças estatísticas entre os grupos. Os animais UChA e UChB revelaram as maiores médias de duração dos ciclos estrais e permanência na fase de estro. Nota-se estágios diferenciados de proliferação celular e atresia folicular avançada nos ovários, variando entre os grupos UChA e UChB. Nas variedades bebedoras, a túnica albugínea apresentou-se fibrosa e o estroma medular predominantemente celular. Estroma fibrocelular e túnica albugínea fibrosa estão presente no grupo controle. O grupo UChA apresentou reações metacromáticas entre as células da granulosa dos folículos em crescimento, enquanto regiões delimitadas na parede dos folículos primários, em desenvolvimento e antrais apresentaram intensa metacromasia nos animais UChB. Os grupos UChA e UChB apresentaram reações PAS-positivo no tecido glandular intersticial, enquanto nos animais controles essas reações ficaram restritas na zona pelúcida de ovócitos e entre as células da granulosa de folículos secundários. Os folículos antrais do grupo UChB apresentaram forte reação à fosfatase ácida (FA), comparados aos grupos UChA e controle. Nos animais UChA, os corpos lúteos hemorrágicos e em regressão, destacaram reação à FA com presença de grumos associados. A fosfatase alcalina (FAL) demarcou ampla vascularização nos corpos lúteos dos animais UCh, enquanto que a teca interna dos folículos secundários do grupo UChB reagiram intensamente com a FAL. A análise ultra-estrutural revelou corpos lúteos com vacúolos autofágicos no citoplasma e início de picnose nuclear nas linhagens UCh. As células da granulosa apresentaram núcleos com marginalização da cromatina e mitocôndrias edemaciadas. Conclui-se que há irregularidades do ciclo estral e, consequentemente, alterações estruturais nos ovários das linhagens UChA e UChB / Abstract: Chronic alcoholism belongs to the group of diseases classified as originated from mental disturbs, being the women more affected than men. Although ethanol intake causes benefic stimulus to the organism, like increase in euphoria and pleasure, excessive and prolonged use can cause side effects, even to the reproduction. On the literature, there were few researches involving chronic alcoholism and female. In regard to the current incidence of early and late alcoholism in women, and its consequences to the reproduction, the aim of this study was to evaluate the UChA and UChB (10% ethanol voluntary intake) adult rat ovary structure. After the experimental period, 42 rats divided into three groups (UChA, UChB and Wistar control) were killed, by decapitation method, and their ovaries collected to the light and electronic microscopy analysis. Ovary slides were stained with HE, Masson¿s tricromic, toluidine blue, Periodic Acid Schiff and tissue was cryofrozen to further acid/alkaline phosphatase histochemical techniques. Final body weight, reproductive organs weight, body weight gain index, estrous cycle duration and hormone dosages (FSH, LH, _-oestradiol and progesterone) were analyzed. The statistical analysis was made using 5% of significance. There was no significative difference between the groups as to initial and final body weights, although the UChB rats showed an increased body mass gain at the final treatment period. The UChB ovaries relative weight was significantly lower comparing to the control. The hormonal levels did not differ among the groups. The UChA and UChB groups presented prolonged estrous cycles and persistent oestrous phases. Different stages of atresia and proliferation on follicle cells were found varying in UChA and UChB ovaries. The tunica albuginea showed fibrous tissue and cellular stromal components in ethanol drinking animals. Fibrocellular stroma and fibrous tunica albuginea were present in the control group. The UChA group showed metachromatic reaction between the growing follicles granulosa cells, whereas, in the UChB rats, intense metachromasia appeared on small, growing and antral follicles. The UCh groups presented PAS-positive reaction in the interstitial glandular tissue, while in control animals these reactions were restricted to the zona pelucida of oocytes and among granulosa cells of secondary follicles. The antral follicles of the UChB rats showed a high intensity reaction to acid phosphatase (AP), when compared to UChA and control groups. In UChA animals, the hemorrhagic and regression corpora lutea had AP reaction with the presence of associated clumps. Alkaline phosphatase (ALP) marked a hypervascularization in corpora lutea of UCh rats. In UChB strain, internal theca layers of growing follicles, reacted strongerly with ALP in contrast to UChA and control groups. The ultrastructural analysis revelated in UCh strain, corpus luteum with autofagic vacuoles and pyknotic nuclei at the initial stage. The UCh granulosa cells resented irregular nucleus with chromatin marginalization and edematous itochondria. In conclusion, there were estral cyclicity irregularities, caused by chronic ethanol intake in the UCh groups, which were consequently reflected as morphologic alterations in the ovaries structure / Mestrado / Biologia Celular / Mestre em Biologia Celular e Estrutural

Submitted by Geandra Rodrigues (geandrar@gmail.com) on 2018-01-26T18:42:50Z No. of bitstreams: 0 / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2018-01-29T11:01:37Z (GMT) No. of bitstreams: 0 / Made available in DSpace on 2018-01-29T11:01:37Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2017-06-09 / - / Bacteria are important components of the food web structure in aquatic ecosystems in which they influence the flow of carbon and energy. Populations of bacteria in these ecosystems comprise a diverse spectrum of individual cells able to respond to many factors such as nutrient supply, temperature and virus infection, which regulate bacterial life and death. Bacterial death is a key cellular event involved in the control and production of bacteria in aquatic ecosystems with functional meaning in the carbon and nutrient cycles. Therefore, the study of bacterial structural features and cellular mechanisms underlying bacterial death is crucial to understand processes affecting the entire population. However, both bacterial structure and cellular events of death in aquatic ecosystems are still poorly understood. In the present work, we used single cell approaches to study the structural organization of bacteria as well as to characterize cellular processes of death in these organisms. First, by using fluorescence and transmission electron microscopy (TEM), we provided a general panorama of how microscopy techniques, especially TEM, are powerful tools to understand bacterial structure and their responses to environmental stresses. We showed that bacteria from aquatic ecosystems have remarkable ultrastrutural diversity with components such as bacterial envelope of individual cells differing in structure within the same population. Second, we sought to identify and characterize mechanisms of bacterial cell death. Because our TEM analyses revealed morphological signs of apoptosis, a type of program cell death (PCD), in aquatic bacteria directly collected from natural ecosystems, we applied different techniques to detect apoptosis in bacteria cultured from natural samples. We used TEM as well as different probes to detect this type of PCD in cultured bacteria exposed to increased temperature and viral infection, which are recognized inducers of bacterial death. TEM showed, in both situations, ultrastructural changes indicative of apoptosis, such as cell retraction and condensation, similar to those reported for eukaryotic cells. Assays for membrane permeability, DNA fragmentation, phosphatidilserine exposition and caspase activation were significantly increased in treated bacteria compared to the control group. Altogether, our data demonstrate, for the first time, that PCD occur in aquatic bacteria, and that this event may be a basic mechanism for regulation of bacterial communities in these ecosystems.

Submitted by Cássia Santos (cassia.bcufg@gmail.com) on 2017-03-28T11:52:44Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Renato Silva Oliveira - 2015.pdf: 8492227 bytes, checksum: 8c75509d39858f351a4962c9a637f670 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-03-28T13:52:13Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Renato Silva Oliveira - 2015.pdf: 8492227 bytes, checksum: 8c75509d39858f351a4962c9a637f670 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-28T13:52:13Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Renato Silva Oliveira - 2015.pdf: 8492227 bytes, checksum: 8c75509d39858f351a4962c9a637f670 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2015-03-04 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / Scenedesmaceae Oltmans are Chlorophyta cenobial fresh water cocoides belonging to the order Sphaeropleales (Luerssen) emend Deason. This family of algae for some decades was classified in Chlorococcales sensu latu based only on cytomorphological criteria. Subsequently, ultrastructural and molecular data confirmed the need to reposition some families and genders. Fifteen genera were considered for the family Scenedesmaceae according to published works until the validity of this work. Scenedesmaceae comprises 3 subfamilies: Scenedesmoidea, Desmodesmoidea and Coelastroidea, the latter not contemplated in this study. The number of papers for Brazil is representative, but in Goiás it is still scarce, a fact that motivated the present study. The objective of this work was to perform an inventory of planktonic Scenedesmaceae morphospecies in the State of Goiás covering the main hydrographic regions of the state. A floristic inventory of Scenedesmaceae from the State of Goiás was carried out between March 2013 and December 2014. This study was carried out with collections from different localities, covering the three hydrographic regions and different environments (lentic and lotic). The samples were fixed in Transeau solution and later deposited in the UFG Herbarium. The study was based on collections of raw water or 25 μm network for phytoplankton material. Scanning electron microscopy and scanning electron microscopy were performed. The classification system adopted was that of Krienitz and Bock published in 2012, with some adaptations of Hegewald and collaborators in the works of 2010 and 2013. A total of 220 samples from 18 municipalities in the State of Goiás were analyzed. The algae obtained from natural populations were described, commented and microphotographed, and when necessary the phenotypic plasticity was reported together with taxonomic considerations. Desmodesmus communis, Desmodesmus maximus and Scenedesmus ellipticus were the common species, 13 taxa were registered with the ultrastructure and eight species were first mentioned for the State. / Scenedesmaceae Oltmans são Chlorophyta cenobiais cocoides dulciaquícolas pertencentes à ordem Sphaeropleales (Luerssen) emend Deason. Esta família de algas durante algumas décadas foi classificada em Chlorococcales sensu latu com base apenas em critérios citomorfológicos. Posteriormente dados ultraestruturais e moleculares confirmaram a necessidade do reposicionamento de algumas famílias e gêneros. Foram considerados 15 gêneros para a família Scenedesmaceae de acordo com trabalhos publicados até a vigência deste trabalho. Scenedesmaceae compreende 3 subfamílias: Scenedesmoidea, Desmodesmoidea e Coelastroidea, esta última não contemplada neste estudo. O número de trabalhos para o Brasil é representativo, no entanto em Goiás ainda é escasso, fato que motivou o presente estudo. O objetivo deste trabalho foi realizar um inventário de morfoespécies de Scenedesmaceae planctônicas no Estado de Goiás abrangendo as principais regiões hidrográficas do estado. Entre março de 2013 e dezembro de 2014 foi realizado um inventário florístico das Scenedesmaceae do Estado de Goiás. Este estudo foi realizado com coletas de diferentes localidades contemplando as três regiões hidrográficas e diferentes ambientes (lênticos e lóticos). As amostras foram fixadas em solução de Transeau e posteriormente depositadas no Herbário UFG. O estudo foi fundamentado em coletas de água bruta ou rede de 25 µm para material fitoplanctônico. Efetuou-se a análise em microscopia óptica e eletrônica de varredura. O sistema de classificação adotado foi o de Krienitz e Bock publicado em 2012, com algumas adaptações de Hegewald e colaboradores nos trabalhos de 2010 e 2013. No total 220 amostras oriundas de 18 municípios do Estado de Goiás foram analisadas. Utilizou-se as algas provenientes de populações naturais sendo estas descritas, comentadas e microfotografadas, e quando necessário relatado a plasticidade fenotípica juntamente com considerações taxonômicas. Foram registrados 33 táxons para o Estado, o gênero Desmodesmus foi o mais representativo com 20 táxons, Desmodesmus communis, Desmodesmus maximus e Scenedesmus ellipticus foram as espécies comuns, 13 táxons foram registrados com a ultraestrutura e oito espécies foram citadas pela primeira vez para o Estado.

A superfície das folhas de árvores (filosfera) oferece uma grande área de habitat para os micro-organismos, mas constitui um ambiente extremo. O desenvolvimento de comunidades microbianas é dependente de fonte de carbono e de certos nutrientes essenciais inorgânicos comumente liberados pela planta para a sua superfície. No entanto, um grupo especial de bactérias, Cyanobacteria, é menos dependente da planta para sua nutrição, pois vários destes organismos são autotróficos para carbono e nitrogênio. Portanto, Cyanobacteria é particularmente interessante para se avaliar neste ambiente. Neste estudo, linhagens de cianobactérias presentes na superfície das folhas secretoras de sal da planta de manguezal Avicennia schaueriana foram isoladas e caracterizadas morfológica, molecular e ultraestruturalmente. O potencial destes isolados para sintetizar moléculas bioativas também foi avaliado. Para isso, folhas de A. schaueriana foram coletadas em um manguezal com histórico de contaminação por petróleo, localizado próximo ao Rio Iriri, em Bertioga-SP. O isolamento das cianobactérias foi realizado usando quatro meios de cultura (BG-11, SWBG-11, BG-11o e SWBG-11o) e dois métodos: a) esfregaço das folhas nos meios sólidos em placas de Petri; e b) submersão das folhas em frascos Erlenmeyer contendo meios líquidos. Após a obtenção de culturas puras, os isolados foram crescidos em meios líquidos, as células foram concentradas e usadas para extração de DNA genômico. O gene de RNAr 16S de cada isolado foi amplificado por PCR usando iniciadores específicos (27F/1494Rc), clonado e sequenciado. As sequências de RNAr 16S foram usadas na construção de árvore filogenética. O potencial dos isolados para sintetizar moléculas bioativas foi acessado pela amplificação de PCR usando iniciadores específicos para sequências gênicas codificadoras de peptídeo sintetase (NRPS), policetídeo sintase (PKS), cianopeptolina, aeruginosina, saxitoxina, anatoxina-a/homoanatoxina-a e microcistina. Como resultado, trinta morfotipos foram isolados em meio líquido e quatro em meio sólido. Estes morfotipos foram identificados como pertencentes a quatro ordens diferentes (12 Nostocales, 9 Pseudanabaenales, 8 Chroococcales e 5 Oscillatoriales). Entre os isolados, alta abundância de linhagens potencialmente fixadoras de N2 foi encontrada, indicando que elas possivelmente são uma importante fonte de nitrogênio neste habitat. As sequências do gene de RNAr 16S de vinte e quatro isolados ficaram distribuídas em onze clados distintos na árvore filogenética e mostraram baixas similaridades com gêneros já descritos. Na análise da ultraestrutura destas linhagens, destacou-se a presença de grânulos de elevado volume em uma cianobactéria unicelular e de um arranjo de tilacoides incomum em uma cianobactéria filamentosa homocitada com morfologia aparentemente simples. Sequências gênicas codificadoras de PKS foram detectadas em dezessete linhagens, de aeruginosina em sete linhagens e de cianopeptolina em dez linhagens. Entretanto, sequências gênicas codificadoras de NRPS e das cianotoxinas microcistina, saxitoxina e anatoxina-a/homoanatoxina-a não foram detectadas. A superfície das folhas de A. schaueriana apresenta elevado número de cianobactérias não descritas, provavelmente um resultado das condições peculiares tanto da filosfera quanto do manguezal estudado. Este é o primeiro relato de isolamento de cianobactérias da superfície de folhas de A. schaueriana / The tree leaf surface (phyllosphere) offer a large habitat area for microorganisms but constitute an extreme environment. The development of microbial communities is dependent of carbon source and certain essential inorganic nutrients commonly released from the plant to its surface. However, a special group of bacteria, Cyanobacteria, is less dependent of the plant for their nutrition since several of these organisms are autotrophic for carbon and nitrogen. Therefore, cyanobacteria are particularly interesting to be evaluated in this environment. In this study, cyanobacterial strains present in the salt-excreting leaf surface of the mangrove Avicennia schaueriana were isolated and morphologically, molecularly and ultrastructurally characterized. The potential of these isolates to synthesize bioactive molecules was also evaluated. To this purpose, A. schaueriana leaves were collected in a mangrove with history of oil contamination located near to the Iriri river in Bertioga-SP. The isolation of cyanobacteria was achieved using four culture media (BG-11, SWBG-11, BG-11o and SWBG-11o) and two methods: a) smearing of leaves into solid media in Petri dishes; and b) submersion of leaves in Erlenmeyer flasks containing liquid media. After obtaining pure cultures, the isolates were grown into liquid media, and the cells were concentrated and used for genomic DNA extraction. The gene of rRNA 16S of each isolate was amplified by PCR using specific primers (27F/1494Rc), cloned and sequenced. The 16S rRNA sequences were used for the construction of a phylogenetic tree. The potential of the isolates to synthesize bioactive molecules was assessed by PCR amplification using primers specific for gene sequences encoding non-ribosomal peptide synthetase (NRPS), polyketide synthase (PKS), cyanopeptolin, aeruginosin, saxitoxin, anatoxin-a/homoanatoxin-a and microcystin. As results, thirty morphotypes were isolated in liquid media and four in solid media. These morphotypes were identified as belonging to four different orders (12 Nostocales, 9 Pseudanabaenales, 8 Chroococcales and 5 Oscillatoriales). Among the isolates, it was found a high abundance of potentially N2-fixing strains, what indicates that they possibly are an important source of nitrogen in this habitat. The 16S rRNA gene sequences of twenty-four isolates were distributed into eleven distinct clades in the phylogenetic tree and showed low similarities with described genera. In the ultrastructural analyses of these strains, the highlight was the presence of granules of high volume in a unicellular cyanobacterium and an unusual thylakoid arrangement in a homocytous filamentous cyanobacterium with apparently simple morphology. Gene sequences encoding for PKS were detected in seventeen strains, for aeruginosine in seven strains and cyanopeptolin in ten strains. Gene sequences encoding for NRPS and for the cyanotoxins microcystin, saxitoxin, and anatoxin-a/homoanatoxin-a were not found. The leaf surface of A. schaueriana presents a high number of undescribed cyanobacteria, probably as a result of the peculiar conditions of the phyllosphere and the studied mangrove. This is the first report of isolation of cyanobacteria from the leaf surface of A. schaueriana

Orientadores: Irani Quagio Grassiotto, Daniela Calcagnotto / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-25T14:34:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Santana_JulioCesardeOliveira_D.pdf: 22975611 bytes, checksum: d02baacf927c5c48bc5cc9f97db90deb (MD5) Previous issue date: 2014 / Resumo: A superfamília Erythrinoidea é uma das oito famílias que compõem a ordem Characiformes e foi proposta como um grupo monofilético para abrigar as famílias neotropicais Ctenoluciidae, Erythrinidae e Lebiasinidae, e a família africana Hepsetidae. Após a proposição da superfamília, estudos filogenéticos recentes com base em caracteres morfológicos, como osteologia e morfologia de partes moles, e caracteres moleculares tem refutado a ideia de monofiletismo do grupo. Além disso, diferentes autores divergem quanto às relações suprafamiliares de Erythrinoidea. Além dos caracteres tradicionais, o emprego dos caracteres oriundos da análise da ultraestrutura da ontogenia dos espermatozoides e sua forma final tem sido uma importante fonte na complementação dos estudos filogenéticos. O estudo apresentado teve como objetivo realizar uma análise filogenética para testar a monofiletismo de Erythrinoidea e verificar os padrões de relacionamento suprafamiliares em Characiformes, e testar o posicionamento filogenético da família Crenuchidae, supostamente relacionada à superfamília. As análises filogenéticas foram realizadas com base em dados moleculares e dados morfológicos independentemente, e de maneira conjunta (evidência total) através do método de Parcimônia. A ultraestrutura da espermiogênese e dos espermatozoides dos gêneros incluídos em Erythrinoidea, mais a família Crenuchidae e outras possivelmente relacionadas, foram descritos e codificados em uma matriz de dados. Nas três análises realizadas a superfamília Erythrinoidea não é recuperada como monofilética. A família Crenuchidae posiciona-se na base da subordem Characoidei e não está estreitamente relacionada à Erythrinoidea. As análises com dados moleculares e de evidência total apresentaram uma topologia muito semelhante ao nível mais inclusivo e os valores de suporte dos principais clados apresentaram-se maiores na evidência total, mostrando a influência positiva da inserção dos caracteres da morfologia das células espermáticas nas análises filogenéticas / Abstract: The superfamily Erythrinoidea is one of eight superfamilies within the order Characiformes and was proposed to include a monophyletic group composed of the Neotropical fish families Ctenoluciidae, Erythrinidae and Lebiasinidae, and African family Hepsetidae. Current phylogenetic studies based on morphological data, such as osteology and morphology of soft structures, and molecular data have refuted the hypothesis of monophyly of this group. In addition, the suprafamilial relationships in Erythrinoidea have diverged among the authors. In combination with more traditional characters, the analyses of the ultrastructure of sperm ontogeny and its final shape have become an interesting source of characters to complement phylogenetic studies. The goal of this study was to perform a phylogenetic analysis to test the monophyly of the Erythrinoidea and to assess the phylogenetic position of the family Crenuchidae, a group supposed to be closely related to the superfamily. The phylogenetic analyses were performed using molecular and morphological data separately, and in a combined approach (total evidence) through the Parsimony method. The ultrastructure of the spermiogenesis and the sperm shape of Erythrinoidea genera, plus the family Crenuchidae and other species possibly related to the superfamily were described and coded in a matrix data. In all three analyses Erythrinoidea was not recovered as monophyletic. The family Crenuchidae was placed in a basal position within the suborder Characoidei in molecular and total evidence analysis, and was not closely related to the Erythrinoidea. The analyses using only molecular data and total evidence showed a very similar topology for the more inclusive relationship levels. The support values were higher for the total evidence tree when compared to the one resulting of only molecular data possibly pointing to a positive influence of the combination of the spermatic cell data in phylogenetic analyses / Doutorado / Biologia Celular / Doutor em Biologia Celular e Estrutural

Orientador: Marcelo Brocchi / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-23T15:34:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Lima_BrunadeAraujo_D.pdf: 3794605 bytes, checksum: 178a4bf447e5292f789a4713d5500b38 (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: A violaceína é um pigmento violeta produzido por algumas espécies bacterianas de origem ambiental, tais como Chromobacterium violaceum e Janthinobacterium lividum. Esta molécula apresenta várias propriedades biológicas incluindo antibacteriana, antifúngica, antiviral, antiprotozoária e antitumoral, apesar de sua função exata na fisiologia dos micro-organismos que a produz, ainda é desconhecido. No presente trabalho, a atividade antimicrobiana da violaceína produzida comercialmente, o extrato semi purificado e nanopartículas de vanadato de prata foram avaliados contra espécies de bacterianas gram-positivas e gram-negativas. A violaceína exibiu efeito antimicrobiano contra Staphylococcus aureus resistente à meticilina (MRSA) e Enterococcus resistente à vancomicina (VRE), que são micro-organismos frequentemente relacionados com infecções adquiridas em hospitais. Os valores de MIC (concentração inibitória mínima) e MBC (concentração bactericida mínima) da violaceína produzida comercialmente foram de 0,625 ?M e 1,25 ?M respectivamente e, análise de curvas de crescimento e tempo-morte revelaram um efeito antibacteriano durante 12 horas contra MRSA. A microscopia eletrônica de transmissão mostrou os efeitos da violaceína com alterações morfológicas e ultra estruturais, incluindo alterações na parede celular e formação de septos de divisão anormais. Nos resultados obtidos das análises de proteômica e transcriptoma a violaceína afetou a expressão de várias classes funcionais de proteínas e genes em MRSA, incluindo processos biológicos em biossíntese da parede celular e divisão celular que corroboram as alterações ultra estruturais visualizadas. Em conclusão, a violaceína produzida comercialmente demonstrou atividade antimicrobiana para S. aureus MRSA e pela primeira vez, os efeitos da violaceína sobre o metabolismo de S. aureus foram descritos, indicando possíveis alvos e vias metabólicas afetadas por esta droga. No seu conjunto, estes dados indicam a violaceína como uma droga potencial para o tratamento de infecções provocadas por MRSA / Abstract: Violacein is a violet pigment produced by some bacterial species of environmental source, such as Chromobacterium violaceum and Janthinobacterium lividum. This molecule has numerous biological properties including antibacterial, antifungal, antiviral, antiprotozoal and antitumor activity, although the exact role in the physiology of producing microorganisms is still unknown. In this study, the antimicrobial activity of violacein produced commercially, semi purified extract and silver vanadate nanoparticles were evaluated against several species of gram-positive and gram-negative bacteria. Violacein exhibited antimicrobial activity against methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and vancomycin-resistant Enterococcus (VRE), microorganisms that are often related to hospital-acquired infections. MIC (minimum inhibitory concentration) and MBC (minimum bactericidal concentration) values of violacein produced commercially were 1.25 ?M mM and 0.625 ?M respectively, and analysis of growth and time-kill curves showed an antibacterial effect against MRSA for 12 hours. The transmission electron microscopy showed the effects of violacein with morphological and ultra-structural changes, including changes in cell wall formation and abnormal division septum. The results obtained from the analysis of proteomic and transcriptomic revealed that violacein affects the expression of several functional classes of proteins and genes in MRSA, including biological processes in cell wall biosynthesis and cell division, supporting ultra-structural changes. In conclusion, violacein produced commercially demonstrated antimicrobial activity against S. aureus MRSA and the effects on the metabolism of S. aureus have been described, indicating possible targets and pathways affected by this drug. These data indicate violacein as a potential drug for the treatment of infections caused by MRSA / Doutorado / Microbiologia / Doutora em Genética e Biologia Molecular

Orientador: Konradin Metze / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-20T00:01:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Valladao_MariaLuizadeCastroRamos_D.pdf: 10270983 bytes, checksum: 4313e15091d949287ba12830e233437d (MD5) Previous issue date: 2012 / Resumo: O tumor venéreo transmissível canino (TVTC) é transmitido por meio da transplantação de células neoplásicas. O sulfato de vincristina é o agente quimioterápico mais utilizado no tratamento do TVTC. O objetivo deste estudo foi comparar as alterações morfológicas antes da quimioterapia e após uma semana da aplicação de uma injeção intravenosa de sulfato de vincristina. Neste estudo prospectivo, 100 massas tumorais do TVTC de ocorrência natural foram inclusos. Lâminas citológicas coradas com HE, cortes parafinados corados com tubulina e PCNA, cortes para microscopia eletrônica foram preparados pré e pós tratamento. Realizou-se a contagem da taxa de mitoses, da porcentagem de linfócitos e da marcação do PCNA. Também foi feita a análise de imagem computacional da textura nuclear e a análise sintática estrutural do tecido tumoral. A morfometria demonstrou que, após a terapia, houve a diminuição da área, do perímetro, do diâmetro, da densidade óptica integrada e da tonalidade dos agrupamentos nucleares; enquanto houve aumento do "goodness of fit" da dimensão fractal nuclear. Na análise sintática estrutural, observou-se o aumento da distância entre os núcleos. A contagem de mitoses e o índice PCNA não mostraram diferença entre a primeira e a segunda biópsia. Os agrupamentos citoplasmáticos grandes que foram corados com tubulina diminuíram de tamanho após o tratamento e essa alteração talvez se deva à ruptura induzida pela vincristina nos microtúbulos. Em resumo, a quimioterapia com vincristina promoveu profundas alterações no núcleo, no citoplasma e na reorganização estrutural sintática do tumor / Abstract: The canine transmissible venereal tumor (CTVT) is transmitted by transplantation of neoplastic cells. Vincristine sulfate is the most widely used chemotherapeutic agent for the treatment of CTVT. The aim of this study was to compare the tumor morphology before chemotherapy and one week after application of a single intravenous injection of vincristine sulphate. In this prospective study 100 animals with spontaneously occuring CTVT were included. HE-stained cytological imprints, paraffin sections stained by tubulin and PCNA and sections for electron microscopy were prepared from the tumor before and after treatment. Mitotic rate, percentage of lymphocytes and PCNA stained tumor cells were counted. Computerized image analysis of the nuclear texture and syntactic structure analysis were applied. After therapy nuclear morphometry showed decreased area, perimeter and diameter values, diminished integrated optical density and cluster shade of nuclear texture, as well as increased values of "goodness of fit" of the fractal dimension. The nuclei were more distant. Mitotic counting and PCNA index did not differ between the first and second biopsy. Cytoplasmic large tubulin clusters diminished their size during treatment. This finding may be due to the vincristine-induced rupture of microtubules. In summary, chemotherapy with vincristine provides profound changes in the nuclear, cytoplasmic and syntactic structural organization of the tumor / Doutorado / Biologia Estrutural, Celular, Molecular e do Desenvolvimento / Doutor em Fisiopatologia Medica

O Callithrix penicillata (sagui-de-tufo-preto) mesmo sendo utilizado em algumas pesquisas e também mantido tanto em zoológicos como animal de estimação, possui ainda diversas lacunas acerca de sua anatomia. Assim, utilizamos 10 animais somente para o estudo da topografia, do padrão de irrigação vascular e de alguns índices biométricos do estômago, e outros cinco animais para estudos microscópicos. Ambos tendo com o objetivo caracterizar a anatomia do estômago e comparar as variações entre os sexos e eventualmente com outras espécies. Para o padrão vascular realizamos injeção de neoprene látex corado na aorta torácica com posterior dissecação dos ramos abdominais e no caso do estudo biométrico o mesmo foi realizado com o uso de um paquímetro digital, fita métrica e transferidor. E procedimentos tanto para a microscopia de luz com colorações de Hematoxilina-Eosina e Tricrômio de Masson quanto para a microscopia eletrônica de varredura foram efetuados. Com base no estudo ora realizado verificamos que o estômago localizava-se medialmente da 9° a 12° costelas e os aspectos biométricos revelam os padrões primários para este órgão, não se registrando diferenças entre machos e fêmeas. A artéria celíaca surge como o primeiro ramo da aorta abdominal, ocorrendo maior prevalência (70%) de trifurcação a partir desta artéria, com a emissão da artéria lienal, artéria gástrica esquerda e artéria hepática. A artéria lienal acompanhou a curvatura maior do estômago dando origem à artéria gastroepiplóica esquerda. A artéria gástrica esquerda no seu trajeto acompanhava a região da cárdia e do esôfago abdominal, cedendo-lhes contribuições. Já a artéria hepática originava a artéria gástrica direita e a artéria gastroduodenal. E esta por sua vez fornecia a artéria gastroepiplóica direita e a artéria pancreático-duodenal. Quanto aos aspectos microscópicos observamos a presença de quatro camadas: mucosa, submucosa, muscular e serosa e a presença de pregas da mucosa. Desta forma nesta oportunidade visamos contribuir para o estudo da anatomia comparativa, o que procuramos por vezes realizar neste trabalho, a fim também de oferecer subsídios indispensáveis em procedimentos clínico-cirúrgicos nesta espécie. / The Callithrix penicillata (black-tufted-ear-marmoset), have being used in some research and also kept both in zoos and pet. There are still many questions to be answered about their anatomy. Then to study the topography, the vascular pattern of irrigation and some biometric indices of the stomach, we used 10 animals and five other animals to microscopic studies. Both group of animals were studied in order to characterize the anatomy of the stomach and compare the variations between the sexes and possibly other species. To perform the vascular standard thoracic aorta was stained with injection of neoprene latex. Subsequently, we performed the dissection of the abdominal branches and in the case of the same biometric study was conducted using a digital caliper, tape measure and protractor. Procedures for both light microscopy with hematoxylin-eosin staining and Massons Trichrome as for scanning electron microscopy were perfomed. Based on our study we verified that the stomach was located medially from 9° to 12° ribs and biometric aspects reveal the primary standards body for this, not registering differences between males and females. The celiac artery arises as the first branch of the abdominal aorta, causing a higher prevalence (70%) from the trifurcation of the artery, originating the lienal artery, left gastric artery and the hepatic artery. Lienal artery accompanied the greater curvature of the stomach giving rise to the left gastroepiploic artery. The left gastric artery in its course follow and irrigate the region of the abdominal esophagus and cardia, originating new branches for that region. In its turn the hepatic artery originated the right gastric artery and gastroduodenal artery which gives rise to the right gastroepiploic artery and pancreatic-duodenal artery. In regards to the microscopic aspects we observed the presence of four layers: mucosa, submucosa, muscle and serosa and the presence of mucosal folds. Thus we aim to contribute to the study of comparative anatomy, in order to offer indispensable subsidies in clinical and surgical procedures in this specie.

Os tendões são tecidos de transição das forças contráteis geradas pelos músculos e as transferindo para os ossos, podendo assim gerar movimento. A região em que o tecido tendíneo se insere ao ósseo é chamada de junção osteotendínea ou entese. Estas junções podem ser classificadas como fibrosas ou fibrocartilaginosas, as fibrosas são aquelas em que os tendões e/ou ligamentos se inserem no eixo (diáfise) dos ossos longos e as fibrocartilaginosas a inserção ocorre nas epífises dos ossos longos ou nos ossos curtos. Este estudo tem como propósito analisar as fibras colágenas e as células presentes na junção osteotendínea, utilizando microscopia de luz com as colorações de Hematoxilina-eosina, Azocarmim, Picro-sírius e Tricromo de Masson e os aspectos ultraestruturais empregando os métodos de microscopia eletrônica de varredura e de transmissão. Foram utilizados 30 ratos Wistar machos, sendo 15 adultos com idade de 4 meses (grupo A) e 15 idosos com idade de 18 meses (grupo B), sendo utilizados 5 ratos de cada grupo para microscopia de luz, 5 para microscopia eletrônica de varredura e 5 para microscopia eletrônica de transmissão. Os membros posteriores dos ratos foram retirados, dissecados e desmineralizados com EDTA a 7% para microscopia de luz e EDTA 0,15M pH 7,4 para microscopia eletrônica de transmissão durante 4 semanas, não foi necessário desmineralizar as amostras para microscopia eletrônica de varredura. Cortes de 6 m foram realizados e montados em lâminas histológicas para análise em microscópio de luz, a técnica de criofratura em nitrogênio líquido foi realizada para análises em microscópio eletrônico de varredura e cortes de 60 nm foram realizados, montados em telas de cobre de 200 mesh (EMS) para análises em microscópio eletrônico de transmissão. O processo de envelhecimento mostrou alterações das fibrilas colágenas, em que o tipo I predomina no grupo adulto e o tipo III no idoso, diminuição na quantidade de células de fibrocartilagem, processos citoplasmáticos destas células curtos e em número reduzido e uma diminuída capacidade de síntese devido a aparelhos de Golgi menores, poucas cisternas de retículo endoplasmático granular e escassas mitocôndrias. / Tendons are transition tissues of contractile forces generated by muscles and transferring to bone, generating this way move. The region where tendon attach to bone is called bone-tendon junction or enthesis. These junctions can be classified as fibrous or fibrocartilaginous, the fibrous are those in which tendons/ligaments are attached in the shaft (diaphysis) of the long bones and fibrocartilaginous attachment occur in the epiphyses of the long bones or short bones. This study aims to analyze collagen fibers and the cells present in the bone-tendon junction, using light microscope with Hematoxylineosin, Azocarmine, Picrosirius red and Masson\'s trichrome staining and ultrastructural aspects using scanning electron microscope, transmission electron microscope methods. Thirty male Wistar rats were using, 15 adults rats at 4 months-old (A group) and 15 old rats at 18 months-old (B group), were used 5 rats of each group to light microscopy, 5 rats to scanning electron microscopy and 5 rats to transmission electron microscopy. The hind limbs of the rats were removed, dissected and demineralized using 7% EDTA solution to light microscopy and 0,15M pH 7,4 EDTA solution to transmission electron microscopy for 4 weeks, was not necessary demineralize the samples to scanning electron microscopy. Cut in slices 6 m thickness were made and mounted on histological slides to analyze in light microscope, freeze-fracture technique with liquid nitrogen was performed to analysis in scanning electron microscope and cuts in slices 60 nm thickness were made, mounted on copper grids (200-mesh - EMS) to analysis in transmission electron microscope. The aging process showed changes of the collagen fibrils, in which type I predominates on adult groups and the type III on the old group, decrease in the amount of the fibrocartilage cells, few and short cytoplasmic processes of this cells and a decreased synthesis capacity due a small Golgi apparatus, a few cisternae of rough endoplasmatic reticulum and few mitochondria.