Aeglidae Dana (1852) are anomuran crabs which occur exclusively in freshwater. The genus Aegla consists of 63 species and subspecies restricted to the southern South America. Highly sensitive molecular markers can help to elucidate some evolutionary features of the genus. Microsatellite markers are excellent molecular markers because they can reveal fine details of the genetic structure of a population. However, microsatellite isolation employs a laborious and expensive methodology. An alternative approach to the isolation procedure is the utilization of microsatellite markers previously developed for close species. The closer the phylogenetic relationship between two species, the more probable is the conservation of the loci and the successful cross-amplification. The present study aimed to test the crossamplification of microsatellite loci developed for two species of the family Aeglidae in other decapod crustaceans and to verify their potential for application in further studies on population genetics. Primers developed for microsatellite loci previously isolated from Aegla longirostri (AlCA135 and AlCA138) and Aegla uruguayana (Au05) were tested in seven species of the family Aeglidae, Aegla camargoi, Aegla leptodactyla, Aegla plana, Aegla platensis, Aegla spinipalma, Aegla violacea and Aegla sp.n., besides in Emerita brasiliensis (Anomura: Hippidae), Pachycheles laevidactylus (Anomura: Porcellanidae) and Trichodactylus panoplus (Brachyura: Trichodactylidae). DNA was extracted using traditional procedures. DNA samples were submitted to the Polymerase Chain Reaction (PCR) using the primers cited. The PCR products were electrophoresed in 6% polyacrylamide gels, at 100V for 24 hours. The gels were silver-stained and the band patterns were analyzed. The microsatellite markers could be transferred only within the genus Aegla, and the locus AlCA135 presented the greatest rate of success in cross-species transfer. Cross-amplification between families within the infra-order Anomura, as well as between the infra-order Anomura and Brachyura was not possible, indicating that these microsatellite loci are not conserved in distantly related species. Notwithstanding, the evaluated loci present potential for utilization within the family Aeglidae and new tests, using optimized PCR conditions, should improve the success rate in cross-amplification. / Aeglidae Dana (1852) são caranguejos que pertencem a Infraordem Anomura e são exclusivos de água doce. O gênero Aegla é constituído por aproximadamente 63 espécies, sendo restrito ao sul da América do Sul. O emprego de marcadores moleculares altamente sensíveis pode auxiliar no entendimento de aspectos evolutivos e da diversidade do gênero. Os microssatélites são excelentes marcadores moleculares que podem revelar detalhes da estrutura genética de uma população. Entretanto, o isolamento de microssatélites é uma técnica cara e trabalhosa. A utilização de locos de microssatélites previamente desenvolvidos para espécies próximas é uma alternativa ao isolamento. Quanto mais próxima a relação filogenética entre duas espécies, maior a probabilidade de conservação das seqüências e de amplificação cruzada utilizando primers heterólogos. O objetivo deste estudo foi testar a amplificação cruzada de locos de microssatélites desenvolvidos para duas espécies de Aeglidae em outros crustáceos e verificar o seu potencial para aplicação em estudos de genética de populações. Primers desenvolvidos para locos de microssatélite previamente isolados de Aegla longirostri (AlCA 135 e AlCA 138) e Aegla uruguayana (Au05) foram testados em outras sete espécies da família Aeglidae, Aegla camargoi, Aegla leptodactyla, Aegla plana, Aegla platensis, Aegla spinipalma, Aegla violacea, Aegla sp.n. e também em Emerita brasiliensis (Anomura: Hippidae), Pachycheles laevidactylus (Anomura: Porcellanidae) e Trichodactylus panoplus (Brachyura: Trichodactylidae). O DNA foi extraído utilizando o método tradicional de fenol-clorofórmio. As amostras de DNA foram submetidas a uma Reação em Cadeia de Polimerase (PCR) com os primers citados. Os produtos da PCR foram submetidos à eletroforese em gel de poliacrilamida 6% a 100V por 24 horas. Os géis foram corados com nitrato de prata e os padrões de banda foram analisados. Observou-se transferência dos marcadores microssatélites somente dentro do gênero Aegla, e o loco AlCA135 foi o que apresentou maior índice de sucesso na amplificação cruzada. Não foi observada amplificação cruzada entre famílias dentro da infraordem Anomura e nem entre as infraordens Anomura e Brachyura, indicando que esses locos de microssatélites não se encontram conservados em espécies distantemente relacionadas. Entretanto, os locos avaliados apresentam potencial de utilização dentro da família Aeglidae e novos testes, otimizando as condições de PCR, poderão melhorar os índices de sucesso de amplificação cruzada.

Submitted by Ligia Roma Stephan null (ligia.roma@terra.com.br) on 2017-12-03T17:29:12Z No. of bitstreams: 1 Tese Doutorado Ligia R. Stephan.pdf: 1678102 bytes, checksum: 963311d73c5a4e54a01169c577b6df61 (MD5) / Approved for entry into archive by Elza Mitiko Sato null (elzasato@ibilce.unesp.br) on 2017-12-04T14:10:00Z (GMT) No. of bitstreams: 1 stephan_lr_dr_sjrp.pdf: 1678102 bytes, checksum: 963311d73c5a4e54a01169c577b6df61 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-12-04T14:10:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 stephan_lr_dr_sjrp.pdf: 1678102 bytes, checksum: 963311d73c5a4e54a01169c577b6df61 (MD5) Previous issue date: 2017-10-20 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Neste estudo foi avaliada a importância das características limnológicas locais e da predação por peixes na estrutura das comunidades zooplanctônicas, sendo os objetivos e resultados apresentados em dois capítulos distintos: Capítulo 1. Tem por objetivo avaliar a influência dos pulsos de inundação na estrutura funcional e taxonômica das comunidades de microcrustáceos em lagoas marginais. Para atingir o objetivo proposto, foram determinadas a estrutura funcional e taxonômica das assembleias de microcrustáceos coletadas em lagoas marginais ao Rio Turvo em três estações distintas: seca, intermediária e chuvosa. Os resultados encontrados foram comparados entre lagoas e entre estações; também foram comparadas a estrutura das asssembléias das lagoas marginais com amostras de microcrustáceos provenientes de ambientes lênticos com diferentes regimes hidrológicos. Neste estudo também foi avaliado se um período longo de estiagem pode influenciar as dinâmicas sazonais dos microcrustáceos. A estrutura das assembleias dos microcrustáceos com base na classificação funcional e taxonômica apresentaram variações entre lagoas e estações, assim como ambientes aquáticos que não sofrem influência dos pulsos de inundação apresentam uma maior uniformidade funcional. A dinâmica sazonal das assembleias foi afetada pelo período prolongado de estiagem, onde as variações na estrutura das comunidades que existem entre estações foram menos intensas no período de estiagem quando comparado ao ano chuvoso. Os resultados mostram que as características limnológicas das lagoas são influenciadas pelos pulsos de inundação e pelo regime hidrológico, bem como um período prolongado de estiagem é capaz de influenciar a dinâmica sazonal das assembléias de microcrustáceos em lagoas marginais. O estudo também mostra que há uma grande heterogeneidade funcional entre as lagoas, sugerindo que o padrão encontrado para a comunidade zooplanctônica revela mais a importância das características locais associadas ao pulso de inundação do que os efeitos deste sobre a comunidade de toda a planície. Capítulo 2. O segundo capítulo tem por objetivo avaliar se a predação por 6 peixes pode influenciar a estrutura funcional das assembleias de microcrustáceos. A influência da predação sobre a comunidade de microcrustáceos foi avaliada por meio de um experimento de mesocosmo e pela avaliação do conteúdo estomacal dos peixes provenientes das lagoas marginais ao Rio Turvo. A abundância e a estrutura funcional dos microcrustáceos foram influenciadas pela presença dos peixes e das macrófitas aquáticas no experimento, entretanto, para as análises realizadas nas lagoas marginais os resultados mostram que a predação não possui um efeito capaz de influenciar a estrutura das assembleias. Como conclusão, podemos inferir que a presença dos peixes pode ser um fator estruturador das comunidades, mas que em ambientes dinâmicos tais como as lagoas marginais, a influência exercida por alterações nas características locais pode ser um fator mais intenso na estruturação das assembleias de microcrustáceos do que a predação por peixes. / In this study, the importance of local characteristics and predation by fish in the zooplankton community structure was evaluated. The objectives and results were separated in two distinct chapters: Chapter 1. Its objective is to evaluate the influence of flood pulses on the functional and taxonomic structure of microcrustacean communities in oxbow lakes. For the proposed objective, the functional and taxonomic structure of the microcrustacean assemblages from oxbow lakes to the Rio Turvo was determined in three seasons: dry, intermediate and rainy. The results were compared between oxbow lakes and between seasons, as well as between samples from environments with different hydrological regimes. In this study, it was also evaluated if a long period of drought can influence the seasonal dynamics of microcrustaceans. The structure of the microcrustacean assemblages based on the functional and taxonomic classification showed variations between oxbow lakes and seasons; a greater functional uniformity was found on the aquatic environments not influenced by the flood pulses. The seasonal dynamics of the assemblages was affected by the prolonged period of drought, where the variations in the structure of communities between seasons were less intense in the drought year when compared to the rainy year. Our results show the influence of flood pulses on limnological characteristics and on the functional and taxonomic assemblages of microcrustaceans in the oxbow lakes; we also observed that a prolonged period of drought is able to influence the seasonal dynamics of microcrustacean assemblages in oxbow lakes. Chapter 2. The second chapter aims to assess the influence of fish predation on the functional structure of microcrustacean assemblages. The influence of fish predation was evaluated through an mesocosm experiment, and through an evaluation of fish stomach contents sampled in the marginal lakes from Turvo River. In the experiment, the abundance and functional structure of the microcrustaceans were influenced by the presence of fish and aquatic macrophytes, however, results from the oxbow lakes show that predation does not have an effect capable to incluence the structure of the microcrustaceans assemblages. As conclusion, fish predation should have a role in the 8 structure of the communities, although in dynamic environments such as oxbow lakes, the influence of the local characteristics may be a more important factor in the structuring of the microcrustacean assemblages then the fish predation.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Os moluscos pateliformes de água doce da região Neotropical são comumente atribuídos a família Ancylidae sensu latum, abrangendo sete gêneros com pelo menos 13 espécies válidas e sete com identificação duvidosa. Os ancilídeos possuem pequenas dimensões, alcançam no máximo 15 mm de comprimento. Sua concha é frágil, composta por duas regiões, a protoconcha e a teleoconcha, as quais apresentam caracteres relevantes para a sistemática. Na parte mole as impressões musculares, a pigmentação do manto, o sistema reprodutor e a rádula são importantes para o estudo da família. Apesar de existirem vários registros de ocorrência para ancílideos no Estado do Rio de Janeiro (ERJ), existem poucos dados morfológicos. O principal objetivo deste estudo foi fornecer e ampliar as informações sobre a morfologia e distribuição geográfica das espécies de Ancylidae encontradas no ERJ. Os materiais utilizados foram procedentes de coletas próprias, material depositado em Coleções Científicas e dados de revisão bibliográfica. O estudo da morfologia comparada das conchas foi realizado com o auxílio de imagens de microscópio óptico e de varredura. Para a comparação das partes moles, os espécimes foram corados e dissecados sob lupa. Através da conquiliometria analisamos as diferenças inter e intrapopulacionais. Com este trabalho, a riqueza conhecida para Ancylidae no ERJ, aumentou de cinco para sete espécies: Burnupia sp., Ferrissia sp., Gundlachia radiata (Guilding, 1828),G. ticaga (Marcus & Marcus, 1962), Gundlachia sp., Hebetancylus moricandi (d`Orbigny, 1837) e Uncancylus concentricus (d`Orbigny, 1837). Gundlachia radiata e U. concentricus constituem novos registros para o ERJ, e G. radiata para a Região Sudeste. As três espécies com o maior número de registros de ocorrência no ERJ foram: G. ticaga (66%), Ferrissia sp. (37%) e Gundlachia sp. (18%). A ampla distribuição de G. ticaga pode ser devido à capacidade de suportar ambientes impactados. Em relação à morfologia, Burnupia sp. difere de Burnupia ingae Lanzer, 1991, única espécie deste gênero descrita para o Brasil, por apresentar diferenças na microescultura da concha e também na forma das impressões musculares. Ferrissia sp. difere de F. gentilis Lanzer, 1991, devido a diferenças na microescultura apical e número de cúspides no dente central da rádula. Gundlachia sp. é diferente de G. ticaga e G. radiata, por apresentar a abertura da concha mais arredondada, ápice mais recurvado, ultrapassando a borda da concha, pontuações irregulares em toda a protoconcha e forma dos músculos adutores anterior direito e posterior mais elíptica. A morfologia interna também mostra diferenças entre Gundlachia sp. e G. ticaga, como o apêndice terminal do útero e o número de folículos do ovoteste. Através das análises conquiliométricas, constatamos para os gêneros Burnupia, Ferrrissia e Gundlachia, que os índices morfométricos se mostraram melhores que as medidas lineares para a discriminação das espécies, provavelmente porque esses índices diminuem o efeito da amplitude de tamanho das conchas, que são fortemente influenciadas pelas variações ecofenotípicas. Contudo, os caracteres diagnósticos das conchas e das partes moles (impressões musculares) são indispensáveis para a identificação dos gêneros e espécies de Ancylidae. Palavras-chave: Mollusca. Moluscos de água doce. Morfologia. Distribuição geográfica. Estado do Rio de Janeiro.uscos. / The pateliform freshwater molluscs of the Neotropical region are commonly attributed to Ancylidae sensu latum, comprising seven genera with at least 13 valid species and seven with dubious identification. Ancylids are small, reaching up to 15 mm length. The shell is fragile, composed of two regions: protoconch and teleoconch, which microsculpture, which is relevant to systematic. In the soft part mantle scars, pigmentation of mantle, radula and reproductive system are important for the study of the family. There are several records of occurrence of ancylids in the State of Rio de Janeiro (SRJ) but few morphological data. The main objective of this study was to provide and expand morphological and geographical information about Ancylidae species found in the SRJ. The materials were come from own collections, material deposited in scientific collections and data for review. A comparative study of shell morphology was carried out by light and scanning microscope images. To compare the soft parts, specimens were stained and dissected under a research stereomicroscope. Interpopulation and intrapopulation variation were studied by shell morphometric analysis. The richness of Ancylidae in SRJ were increased from five to seven species: Burnupia sp., Ferrissia sp., Gundlachia radiata (Guilding, 1828), Gundlachia ticaga (Marcus & Marcus, 1962), Gundlachia sp., Hebetancylus moricandi (d`Orbigny, 1837) e Uncancylus concentricus (d`Orbigny, 1837). Gundlachia radiata and U. concentricus are new records for SRJ, and G. radiata to Southeast Brazil. The most frequent three species in SRJ were: G. ticaga (66%), Ferrissia sp. (37%) and Gundlachia sp. (18%). The wide distribution of G. ticaga may be due to the ability to survive in impacted environments. With respect to morphology, the single Burnupia species described from Brazil, Burnupia ingae Lanzer, 1991, differs from Burnupia sp. in shell microsculpture and also in the shape of muscle scars. Ferrissia sp. differs from F. gentilis Lanzer, 1991, due to differences in apical microsculpture and number of cusps on radula central tooth. Gundlachia sp. is different from G. ticaga and G. radiata, by presenting the shell opening rounder, more curved apex surpassing the edge of the shell, irregular punctuations across whole protoconch and the more elliptic right anterior and posterior adductor muscle scars. The morphology also shows differences between Gundlachia sp. and G. ticaga, as the terminal appendix of the uterus and the number of follicles of ovotestis. Shell morphometric analysis found that the indices provided better discrimination of species than the linear measurements to Burnupia, Ferrrissia and Gundlachia, probably because these indices decrease the effect of the shells size range that are strongly influenced by ecophenotipics variations. However, the diagnostic characters of the shells (microesculpture apical) and soft tissue (muscle scars and mantle pigmentation) are essential to identify genera and species of Ancylidae. Keywords: Mollusca. Freshwater snails. Morphology. Geographic distribution. Rio de Janeiro State. LISTAe pateliform.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Este trabalho objetiva analisar diversos aspectos do Direito Internacional Público em matéria de recursos hídricos de água doce superficiais e subterrâneos. Geração de energia, abastecimento, pesca, navegação, lazer, agricultura e indústria, são múltiplos os usos que os seres humanos fazem da água doce, mas antes disso a água é essencial para manutenção de todo e qualquer tipo de vida na Terra. São complexas e passíveis de várias análises as relações entre os Estados e as relações que se concretizam no interior dos Estados com objetivo de utilizar, controlar e preservar as fontes de água doce, a que se pretende fazer é uma análise jurídica, inserida no contexto político de expansão do capitalismo liberal. Pretende-se identificar e analisar normas jurídicas produzidas no âmbito internacional multilateral, considerando a sua forma, conteúdo e possíveis efeitos: na resolução de conflitos entre os Estados pelo controle e utilização da água doce, no estabelecimento de parâmetros para solução da crise ambiental e na superação dos problemas de acesso à água. Na primeira parte do trabalho, são identificadas as normas de Direito Internacional Público atinentes à matéria, descrevendo-se, primeiramente, a evolução histórica do Direito Internacional Fluvial até os estudos da doutrina de Direito Internacional e a Convenção de Nova York de 1997. O capítulo segundo objetiva apresentar o tema da água doce no contexto de surgimento do Direito Internacional do Meio Ambiente, de realização de conferências e criação de fóruns internacionais para a questão da água e do desenvolvimento de um direito humano à água. O capítulo terceiro propõe-se a ingressar na incipiente questão da regulamentação dos usos das águas subterrâneas, analisando os trabalhos da Comissão de Direito Internacional da Organização das Nações Unidas que culminaram com a adoção de uma Resolução sobre o Direito dos Aquíferos Transfronteiriços por parte da Assembleia Geral daquela organização. A segunda parte do trabalho objetiva analisar a aplicação das regras e princípios ensaiados nos textos de Direito Internacional aos casos concretos, confrontando-as com as soluções propostas em casos paradigmáticos de conflitos pela água, como o caso Gabcikovo-Nagymaros e o caso das Papeleras, envolvendo Argentina e Uruguai, ambos julgados pela Corte Internacional de Justiça. Na segunda parte do trabalho, também é analisado o caso do aquífero Guarani, um sistema de aquíferos interligados que se estende sob os subsolos de Argentina, Brasil, Paraguai e Uruguai, que em agosto de 2010 foi objeto de um tratado internacional assinado no âmbito do Mercosul. Por fim, a pesquisa objetiva desenvolver ideias e explicações para a existência (ou não) e a efetividade (ou a falta dela) das normas de Direito Internacional sobre recursos hídricos, considerando o conceito de soberania estatal que ora é o bode expiatório para a falta de assinaturas nos tratados ou de votos em declarações, ora é o próprio fundamento para a adoção de compromissos por parte dos Estados. Conclui-se tentando responder as seguintes questões: Existe Direito Internacional da água doce? São as normas de Direito Internacional efetivas? Para que servem essas normas de Direito Internacional, além da afirmação de sua própria existência como metas a serem atingidas? / This thesis examines different aspects of Public International Law related to ground freshwater and surface freshwater resources. There is a variety of freshwater utilization: water power, water supply, fishing, navigation, leisure, agriculture, industry. However we should remember that water is essential to keep all beings of nature alive. Relationships between countries and inside each country related to the use, regulation and preservation of freshwater are complex and multifaceted. This work intends to discuss the juridical aspects of these questions in a political context of liberal capitalist expansion. This work intends to identify and analyze juridical rules created in a multilateral international sphere, considering their content and possible effects (a) in the conflict resolution between countries for the control and utilization of freshwater, (b) in the establishment of parameters to deal with the environmental crisis and (c) in the resolution of water access problem. First, the work identifies the rules of Public International Law related to this subject, describing the history of the Fluvial International Law, the studies about International Law doctrine and the Convention on the Law of the Non-Navigational Uses of International Watercourses (1997). The second chapter presents the discussion of freshwater in the context of the creation of the International Law of the Enviroment, the realization of conferences and the creation of international forums to discuss water and the development of a human right to water. The third chapter introduces the incipient discussion of the regulation of groundwater utilization. This chapter analyses the works of the UN International Law Comission wich resulted in the UN General Assembly Resolution on the Law of Transboundary Aquifers. The second part of the thesis analyses the application of rules and principles described in the International Law texts in the real cases, confronting them with the solutions proposed in paradigmal water conflict cases, as for instance Gabcikovo-Nagymaros and Papeleras, occurred in Argentina and Uruguay. Both cases have been judged by the International Court of Justice. The case of the Guarani Aquifer a system of aquifers interconnected, located beneath the surface of Argentina, Brazil, Paraguay and Uruguay is also examined. This aquifer was the object of an international treaty signed for Mercosul countries in August of 2010. Finally, the thesis tries to develop ideas and explanations about the existence (or not) and the effectiveness (or its lack) of the rules of International Law of water resources, considering the concept of state sovereignty, which sometimes is a scapegoat for the lack of signatures in the treaties and votes in declarations. Other times it allows nation states to embrace responsibilities. The conclusion ventures a response about the following questions: Is there an International Law about freshwater? Are the rules of International Law effective? Why do we need International Law rules beyond the simple assertion of their existence as objectives to be attained?

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:13Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-03-07Bitstream added on 2014-06-13T19:39:34Z : No. of bitstreams: 1 oliveira_pcr_me_botib.pdf: 1401244 bytes, checksum: d0a5231ce70e9cbfd5be0c6439c81f73 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Os rios de pequeno e médio porte são os ecossistemas aquáticos altamente representativos no estado de São Paulo que, tendo a maior produção econômica e maior densidade demográfica do país, sofre com a intensa degradação ambiental. A análise integrada das características da água, do sedimento e da comunidade de macroinvertebrados bentônicos e fundamental para a determinação da qualidade dos ambientes lóticos. 0 presente trabalho buscou avaliar características limnológicas gerais da água e sedimento, bem como a fauna de macroinvertebrados bentônicos dos principais rios do município de Botucatu e região (Capivara, Lavapés, Araquá e Pardo). Os estudos foram feitos em dois períodos do ano: chuvoso (março/2007) e seco (setembro/2007). A largura, profundidade, vazão e temperatura da água aumentaram no sentido jusante; a velocidade, transparência da água e oxigênio dissolvido foram maiores nos trechos à montante; a luminosidade foi total na maioria das estações de amostragem e o pH foi ácido em todos os rios estudados. As estações que sofrem maior impacto de fontes de poluição (rio Lavapés e Araquá) apresentaram os maiores valores de condutividade elétrica, material em suspensão (orgânico e inorgânico), nitrogênio total, nitrato, nitrito, amônia fósforo total, fosfato total dissolvido (orgânico e inorgânico), DBO e coliformes termotolerantes. A maior concentração de silicato foi encontrada no rio Capivara e está relacionada com os intensos processos erosivos na bacia. No período chuvoso a condutividade elétrica, turbidez, material em suspensão foram maiores, enquanto que a clorofila- a foi maior no período seco. Foram encontrados 151 táxons e abundância máxima de 116.481 ind/m2 . Chironomidae apresentou a maior riqueza, seguido... / Rivers and streams of low and medium orders are among the most important aquatic ecosystem of Sao Paulo. This State has the highest economical production and demographic density of the country. Thus, these environments are under severe degradation. Integrated analyses of water, sediment and benthic macroinvertebrates are essential in the assessment of freshwater quality. This study aimed to assess the environmental quality and structure of benthic macroinvertebrates of the main rivers and streams of Botucatu (SP) (Capivara, Lavapes, Araqua and Pardo) and adjacent region. The fieldwork was carried out in rainy (March/207) and dry (September/2007) seasons. Channel width, depth, water velocity and temperature increased towards the rivers mouth. Velocity, water transparency and dissolved oxygen were higher in the upstream sampling stations, light penetration was total in most sampling stations and pH was acid in all studied streams. The most impacted sampling stations, basically by pollution sources (Lavapés and Araquá Rivers), exhibited the highest values of electric conductivity, suspended matter (organic and inorganic), total nitrogen, nitrate, nitrite, ammonium, total dissolved phosphorus (organic and inorganic), BOD and thermotolerant coliforms. Higher silicate concentrations were observed in Capivara stream and were related erosive processes in the basin. Electric conductivity, turbidity and suspended matter were higher in the rainy season and chlorophyll in the dry season. A total of 151 taxa, and a maximum abundance of 116,481 indom-2 , were observed. Chironomidae had the highest richness of taxa, followed by Trichoptera, Oligochaeta and Ephemeroptera. Chironomidae was also the most abundant group, followed by Oligochaeta and Ephemeroptera. Ephemeroptera, Plecoptera Trichoptera and Chironomus gr. decorus were the best (bio) indicators of the environmental conditions... (Complete abstract click electronic access below)

As indústrias têxteis da região de Americana geram grande quantidade de efluentes e resíduos sólidos com grande carga de corantes que são naturalmente de difícil degradação. Assim o objetivo do presente trabalho foi avaliar a possibilidade de biodegradação dos corantes têxteis RBBR, índigo e preto enxofre, e dos resíduos resultantes da Estação de Tratamento de Esgoto da cidade de Americana, SP, (DAE Americana), a qual trata 400 l s-1 de esgoto municipal junto com efluentes de 43 indústrias têxteis. Foram testados quanto à capacidade de degradação a bactéria Acinetobacter johnsonii, os fungos basidiomicetos Pleurotus sajor-caju e Pleurotus ostreatus, várias espécies de cianobactérias e também material da planta raiz-forte contendo alto teor de enzimas peroxidases. A eficiência da degradação foi avaliada em termos de descoloração através de espectrofotômetria para as amostras líquidas e refletância para as amostras sólidas, e toxicidade utilizando como bioindicadores Hydra attenuata, a alga Selenastrum capricornutum, raízes de cebola (Allium cepa) e sementes de alface (Lactuca sativa). A atividade das enzimas ligninolíticas produzidas pelos fungos basidiomicetos foi determinada e alterações celulares durante a degradação foram estudadas através de microscopia eletrônica. Foi também padronizado um teste novo para uso com amostras sólidas, atualmente utilizado para amostras líquidas, chamado Luminotox. Este teste utiliza enzimas extraídas do sistema fotossintético de plantas para estimar a toxicidade das amostras, utilizando como parâmetro a redução na fluorescência emitida por estas enzimas. Vários procedimentos foram testados para exposição das enzimas às amostras e os resultados comparados com o teste Microtox. Os organismos testados foram capazes de degradar os corantes técnicos índigo e RBBR e foram eficientes na descoloração e diminuição da toxicidade do efluente da ETE. A cianobactéria Phormidium foi capaz de degradar o corante índigo completamente e foi então testada com sucesso em Bioreator de 6 l. Os fungos Basidiomicetos e a planta raiz-forte mostraram serem capazes de descolorir o lodo da ETE, entretanto a toxicidade foi aumentada após o tratamento. / The degradation of three textile dyes (RBBR, Indigo and Sulfur Black) and also the wastewater from the Municipal Treatment Station, Americana, SP, Brazil, which treats 400 l s-1 of effluent from domestic and textiles mill, were studied. The decolorization was tested for several organisms including bacterium, white-rot fungi, cyanobacterium and horseradish roots. Detoxification was appraised with three bioassays comprising the cnidarian Hydra attenuata, the alga Selenastrum capricornutum and lettuce seeds. The ligninolytic enzyme activity of the whiterot fungi strains was evaluated and cellular alterations were also studied by electron microscopy. The organisms decolorized the dyes indigo, RBBR and the effluent studied, with color removal and toxicity reduction. The cyanobacterium Phormidium was able to degrade completely the indigo dye in a Bioreactor with 6 l of capacity without increase in the toxicity. The sludge was decolorized by white rot fungi and horseradish, but the toxicity increased after the treatment. However, since the organisms showed the ability to decolorize these residues, it can be used as pre-treatment resulting in a less complex composition of sludge. After that, a study for developing a protocol for analyzing sediment samples was made based in a recent toxicity test for liquid samples. This test uses enzymes extracted from tylacoids membranes of plant photosynthetic system for evaluate the toxicity, using as parameter the fluorescence emitted by the enzymes. Several procedures were tested for exposition of the enzymes to sediment and the results were compared with the Microtox test.

Resumo não disponível.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The first part of this work we assess the relationship between the taxonomic and functional alfa- and beta-diversity (TβD and FβD) in primary ray-finned fishes (Actinopterygii) from Brazil, at three different spatial scales. We assess the contribution of the components of β-div – turnover (replacement of species) and nestedness (species loss) – to the observed pattern, and whether they are driven by stochastic or deterministic processes. While TβD was ruled by high rates of turnover (from 93 to 98%), FβD had a greater contribution of nestedness (70 to 80%). Observed TβD was higher than by chance. In addition, environmental filtering and biotic interactions play a greater role for the formation and maintenance of primary ray-finned fish diversity patterns in the Neotropics. In the second part of this work we assessed how the patterns of beta diversity are affected by human actions. Taking the ‘Bento Rodrigues dam disaster’ at the Doce Basin as a case model, we evaluate the possible consequences of different levels of local species extinctions to the regional taxonomic β-div and functional richness across six neighbour river basins. A higher contribution of nestedness (13-19%), leaded to an increase in the pattern of beta diversity: 0.75 to 0.81 (Sørensen dissimilarity index). The functional richness from Doce Basin also decreased from 69-36%. Owing to the regional pattern of species sharing among basins, the likely consequences of fish extinctions include a decreasing trend of turnover contribution (87-81%). The disaster caused substantial changes on regional patterns of β-div and functional richness, owing to a process known as subtractive heterogenization. These findings might be relevant for both, local conservation purposes and the overview of how disturbance affect biodiversity. / Na primeira parte deste trabalho foi avaliada a relação entre as diversidades taxonômica e funcional, alfa e beta (TβD and FβD), dos peixes de nadadeira raiada (Actinopterygii) de água doce do Brasil, em três escalas diferentes. Avaliou-se a contribuição dos componentes da β-div – ‘turnover’ (substituição de espécies entre comunidades) e ‘nestedness’, ou aninhamento, (perda de espécies) – para os padrões observados, e se eles são influenciados por processos estocásticos ou determinísticos. Enquanto TβD teve altas taxas de ‘turnover’ (de 93 para 98%), FβD possuiu uma maior contribuição do aninhamento (70 - 80%). Os padrões de TβD foi maior do que o esperado ao acaso. Além disso, filtros ambientais e interações bióticas desempenham um papel maior para a formação e manutenção dos padrões de diversidade dos peixes de nadadeiras raiadas primários nos Neotrópicos. Na segunda parte deste trabalho avaliou-se como os padrões de beta diversidade são influenciados por ações humanas. Utilizando o ‘desastre da barragem de Bento Rodrigues’, na Bacia do Rio Doce como um modelo de caso, nós avaliamos as possíveis consequências de diferentes níveis de extinções locais de espécies para a β-div regional e riqueza funcional entre seis bacias vizinhas. Uma maior contribuição do nestedness (13-19%), levou a um aumento nos padrões de diversidade beta: de 0,75 para 081 (índice de dissimilaridade de Sørensen). A riqueza functional da Bacia do Doce também diminui de 69-36%. Graças ao padrão regional de compartilhamento de espécies entre bacias, as possíveis consequências das extinções de peixes incluem a diminuição na contribuição do turnover (87-81%). O desastre causou mudanças substanciais nos padrões regionais de β-div e riqueza funcional, devido a um processo conhecido como heterogeinização subtrativa. Estes resultados podem ser relevantes para ambos, a conservação local e visão geral de como distúrbios afetam a biodiversidade.

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There was analyzed microbiological variables as counting of mesophilic and psychrophilic counts, total NPM and and NPM 45ºC, Salmonella spp and Staphylococcus coagulase positive, and physico-chemical variables (pH, N-BVT, TBA and peroxide index). It was observed that the initial psychophilic bactéria count was 2,25 log CFU/g and the final count was 2,87 log CFU/g for the control group and 2,44 log CFU/g for rhe ozone treated group. For the mesophilic bactéria counts the initial values were 2,5 log CFU/g and final count 2,56 log CFU/g for the control group and 2,12 log CFU/g for the ozone group. Regarding total and faecal NMP in both treatments the samples were negative, as well as, for Salmonella spp and coagulase posite Staphylococcus. For de pH variable the initial values were 6,32 and the final ones were 6,31 for the control group and 6,18 for the ozone treated group. In relation to N-BVT, the initial results in both treatments were 5,82 mg/N/100g and the final results were 10,90 mg/N/100g for the control group and 7,74 mg/N/100g for the ozone group. The initial values for TBA in both treatments were 0,64 mgMA/Kg, increasing gradually until reaching a maximum of 3,37 mgMA/Kg for the control group and 2,03 mgMA/Kg in the musculature of tambaquis treated with ozone. For the peroxide index the initial values in both treatments were similar 0,047 meq/Kg and the final values were 3,15 meq/Kg for the control group and 0,94 meq/Kg in the ozone treated group. It was concluded that whole tambaquis treated in atmospheres with ozone modified atmosfere (1,5 ppm) in cold room (± 2oC temperature and 75-80% relative humidity, for 30 days presented better quality tham the untreated fish, evidencing that the Ozone provides na increase in product quality. / O tambaqui (Colossoma macropomum Cuvier-1818) é um peixe de água doce extremamente importante para o estado do Amazonas, em especial para a piscicultura comercial. Eventos bioquímicos decorrentes dos processos de captura, manipulação, transporte e comercialização resultam na deterioração do pescado fresco e podem ser utilizados para a avaliação físico-química do grau de frescor através de procedimentos analíticos. Devido a necessidade de alternativas para a conservação do pescado regional, o presente estudo teve como objetivo armazenar o tambaqui inteiro sob refrigeração (±2°C de temperatura e 75-80% de umidade relativa), com atmosfera modificada pelo gás ozônio (1,5 ppm) durante 30 dias onde as variáveis respostas foram analisadas em intervalos de 10 dias entre coletas (00, 10, 20 e 30 dias). As variáveis analisadas foram as microbiológicas (Contagem de mesófilas e psicrófilas, NMP total e NMP 45ºC, Salmonella spp e Staphylococcus coagulase positiva) e físico-químicas (pH, N-BVT, TBA e o Índice de Peróxidos). Os resultados do experimento para as contagens iniciais de bactérias psicrófilas, em ambos os tratamentos foram de 2,25 log. UFC/g e as finais 2,87 log. UFC/g para o grupo controle e 2,44 log. UFC/g para o grupo tratado com ozônio. Já para as contagens das bactérias mesófilas os valores iniciais foram de 2,5 log UFC/g e os finais 2,56 log UFC/g para o grupo controle e 2,12 log UFC/g para o grupo tratado com ozônio. Em relação ao NMP total e fecal em ambos os tratamentos as amostras foram negativas, bem como, paraSalmonella sp. e Staphylococcus coagulase positiva. Para a variável pH os valores iniciais foram 6,32 e os finais 6,31 para o grupo controle e 6,18 para o grupo tratado com ozônio. Em relação ao N-BVT os resultados iniciais em ambos os tratamentos de 5,82 mgN/100g e os finais de 10,90 mgN/100g para o grupo controle e de 7,74 mgN/100g para os exemplares do grupo tratado com ozônio. Os valores iniciais para TBA em ambos os tratamentos foram de 0,64 mgMA/Kg, aumentando gradativamente até atingir máximo de 3,37 mgMA/Kg para o grupo controle e de 2,03 mgMA/Kg na musculatura de tambaquis tratados com ozônio. O Índice de Peróxidos os valores inicias em ambos os tratamentos foram semelhantes 0,047 meq/Kg e os valores finais 3,15 meq/Kg para o grupo controle e de 0,94 meq/Kg no grupo tratado com ozônio. Conclui-se que tambaquis inteiros tratados em ambientes com atmosfera modificada com ozônio (1,5ppm) em câmara frigorífica (± 2oC e 75-80% de UR), por 30 dias apresentaram melhor qualidade em relação aos peixes não tratados, evidenciando que o ozônio fornece um incremento de qualidade para o produto

Made available in DSpace on 2015-04-11T13:54:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 juliana luiza.pdf: 3875282 bytes, checksum: e88fed331ab492bec9b53ea5c76c15f5 (MD5) Previous issue date: 2013-05-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Accidents caused by freshwater stingrays are characterized by intense pain and pathological changes at the lesion site, which include edema, erythema and, in most cases, necrosis. In this study, mucus and tissue extracts from the dorsal region and sting of freshwater stingrays Potamotrygon motoro and Plesiotrygon iwamae were analyzed by electrophoresis on SDS-PAGE and zymography. The myotoxic activity (local and systemic) induced by extracts in murine model was evaluated by morphometric analysis and enzimatic activity of the phospholipase A2 (indirect hemolysis) in agarose gel. P. motorosting extract showed a diffuse band with 10 kDa, several between 58 and 27 kDa, and proteolytic components above 58 kDa, while the dorsal region extract showed a strong and diffuse band around 41 kDa and a proteolytic component with 6 kDa. P. iwamae showed, in all samples, a diffuse and intense band with 15 kDa and proteolytic components around 6 and 40 kDa. Doses of 140 μg of P. iwamae protein extracts (sting and dorsal region) induced indirect hemolysis after 24 and 48 hours, but the halo diameter was below 10 mm (minimum value set for the technical), showing a weak phospholipase A2activity. Coagulative necrosis of the muscle tissue, muscle fiber regeneration and inflammatory infiltrates, including neutrophils, macrophages and a reduced number of eosinophils and lymphocytes were observed 24 hours after injection of 400 μg of P. motoro and P. iwamae mucus extracts in mice gastrocnemius muscle. These results were also observed, in a lower proportion, in the gastrocnemius muscles of the contralateral legs, showing that extracts of both species were able to induce a systemic rhabdomyolysis when tested in BALB/c mice. / Acidentes por arraias de água doce são caracterizados por dor intensa e alterações patológicas no local da lesão, que incluem edema, eritema e, na maioria dos casos, necrose. Nesta pesquisa, os extratos de muco e tecido do dorso e do ferrão das arraias Plesiotrygon iwamae e Potamotrygon motoro foram analisados por eletroforese em SDS-PAGE e por zimografia. A atividade miotóxica (local e sistêmica) induzida pelos extratos, em modelo murino, foi avaliada por histopatologia e a atividade da enzima fosfolipase A2 (hemólise indireta), em gel de agarose. O extrato do ferrão de P. motoro apresentou uma banda difusa de 10 kDa, várias entre 58 e 27 kDa e componentes proteolíticos acima de 58 kDa, enquanto que o extrato do dorso apresentou uma banda forte difusa com cerca de 41 kDa e um componente proteolítico de 6 kDa. Em P. iwamae, todas as amostras apresentaram uma banda intensa e difusa de 15 kDa e componentes proteolíticos de 6 e 40 kDa. As doses de 140 μg de proteína dos extratos de P. iwamae induziram hemólise indireta nos intervalos de tempo de 24 e 48 horas, porém, não formaram o halo de 10 mm de diâmetro (valor mínimo definido para a técnica), demonstrando uma fraca atividade de fosfolipase A2. Necrose coagulativa do tecido muscular, regeneração das fibras musculares e presença de infiltrados inflamatórios, incluindo neutrófilos, macrófagos, e um número reduzido de eosinófilos e linfócitos foram observados 24 horas após a injeção da dose de 400 μg dos extratos de muco do dorso e do ferrão das arraias P. motoro e P. iwamae no músculo gastrocnêmio dos camundongos. Tais resultados também foram observados, em menor volume, nos músculos gastrocnêmios das patas contralaterais, demonstrando que os extratos das duas espécies foram capazes de induzir a uma rabdomiólise sistêmica quando testados em camundongos BALB/c.