Contexte: Le cancer du poumon est la deuxième cause de décès par cancer chez les femmes mondialement. Peu d'études ont examiné les facteurs de risque professionnel potentiel de ce cancer chez celles-ci. Objectif: Cette thèse vise à déterminer si certaines expositions professionnelles sont associées au risque de cancer du poumon chez les femmes. L’objectif principal est composé de trois sous-objectifs: 1) Étudier les associations entre les expositions professionnelles prévalentes telles qu'évaluées par des experts et le risque de cancer du poumon chez les femmes dans une étude cas-témoin Montréalaise. 2) Comparer la concordance des attributions d'exposition entre la matrice emploi-exposition canadienne (CANJEM) et l'évaluation d'experts pour les emplois occupés par des femmes. 3) Étudier les associations entre des expositions professionnelles prévalentes et le risque de cancer du poumon chez les femmes dans un ensemble de données internationales combinées de dix études cas-témoins de ce cancer, en utilisant CANJEM pour évaluer les expositions des femmes Méthodes : Pour le sous-objectif 1, nous avons utilisé des modèles de régression logistique multivariée pour examiner les associations entre les expositions professionnelles prévalentes et le risque de cancer du poumon chez les femmes (361 cas et 521 témoins) dans l'étude de Montréal. Pour le sous-objectif 2, nous avons comparé la concordance des expositions entre CANJEM et les experts pour 69 expositions professionnelles en utilisant les données de la même étude montréalaise. Pour le sous-objectif 3, nous avons utilisé une approche méta-analytique pour examiner les associations entre des expositions professionnelles prévalentes et le risque de cancer du poumon chez les femmes (3040 cas et 4187 témoins) à partir de dix études cas-témoins menées en Europe, au Canada et en Nouvelle-Zélande. En l'absence de la disponibilité de données sur les expositions des femmes, nous avons appliqué CANJEM pour estimer les expositions professionnelles. Résultats: Nous n'avons pas observé de risque accru de cancer du poumon chez les femmes exposées professionnellement à 22 agents prévalents évalués dans l'étude de Montréal. Nous avons constaté que la capacité de CANJEM à reproduire l'évaluation des expositions par des experts variait selon l'agent. 2 Compte tenu de ces résultats, nous avons sélectionné 15 agents susceptibles d'être évaluables à l'aide de CANJEM qui étaient également répandus dans l'ensemble de données internationales. Il n'y avait aucune association entre la plupart des agents examinés et le cancer pulmonaire; cependant, les expositions à la poussière métallique, aux composés de fer, à l'isopropanol et aux solvants organiques étaient associées à des risques légèrement élevés. Conclusions: Cette thèse a estimé l'exposition professionnelle des femmes à un large éventail d'agents et a examiné leurs associations avec le cancer du poumon. Dans l'étude de Montréal, aucun des agents évalués par les experts n'était associé à ce cancer. CANJEM s'est avéré capable de reproduire des évaluations d'exposition similaires à celles des experts, bien que sa fiabilité dépende de l'agent. Les expositions professionnelles évaluées par CANJEM ont suggéré des risques plus élevés de cancer du poumon chez les femmes exposées à la poussière métallique, aux composés de fer, à l'isopropanol et aux solvants organiques. / Background: Worldwide, lung cancer is the second leading cause of cancer death among women. Few studies have examined possible occupational risk factors for lung cancer in women. Objective: This thesis aims to investigate whether selected occupational exposures are associated with lung cancer risk among women. The main objective consists of three sub-objectives: 1) To investigate associations between prevalent occupational exposures as assessed by experts and lung cancer risk among women in a Montreal lung cancer case-control study 2) To compare exposure assignment concordance between the Canadian Job-Exposure Matrix (CANJEM) and expert assessment for jobs held by women 3) To investigate associations between prevalent occupational exposures and lung cancer risk among women in a combined international dataset of ten lung cancer case-control studies, with exposure assessed by CANJEM. Methods: For sub-objective 1, we used multivariate logistic regression models to examine the associations between prevalent occupational exposures as assessed by experts and lung cancer risk among women (361 cases and 521 controls) in the Montreal study. For sub-objective 2, we compared exposure assignment concordance between CANJEM and expert assessments for 69 occupational exposures using data from the same Montreal study. For sub-objective 3, we used meta-analysis to examine the associations between prevalent occupational exposures and lung cancer risk among women (3040 cases and 4187 controls) from ten case-control studies conducted in Europe, Canada, and New Zealand. In the absence of available expert-assessed exposures, we applied CANJEM to estimate occupational exposures. Results: We did not observe a clearly increased risk of lung cancer among women occupationally exposed to 22 prevalent agents assessed by experts in the Montreal study. We found that CANJEM’s ability to replicate expert assessment of exposures varied by agent and by specific configurations of CANJEM. Considering these findings, we selected 15 agents suitable to evaluate using CANJEM — which were also prevalent in the international dataset of ten studies — and examined their risks for lung cancer. There was no association between most agents examined in this analysis and lung cancer; however, exposures to metallic dust, iron compounds, isopropanol, and organic solvents were associated with suggestive higher risks. 4 Conclusions: This thesis estimated women's occupational exposure to a wide range of agents and examined their associations with lung cancer. In the Montreal study, none of the expert-assessed prevalent agents was associated with lung cancer. CANJEM was shown to be able to reproduce exposure assessments similar to those of the experts, although its reliability was agent dependent. Occupational exposures assessed by CANJEM in the international dataset of ten studies indicated slightly higher risks of lung cancer among women exposed to metallic dust, iron compounds, isopropanol, and organic solvents.

La bactérie Staphylococcus aureus (S. aureus) est un microorganisme aux multiples facettes. Les isolats résistants à la méticilline (SARM) constituent une cause majeure d'infections nosocomiales, tant en médecine humaine que vétérinaire. Les données épidémiologiques sont importantes pour l’élaboration de programmes de prévention et de contrôle des infections en milieu hospitalier. L’objectif principal de cette étude est d’estimer la prévalence et étudier les facteurs de risque de colonisation par le S. aureus et le SARM des chevaux présentés à l’hôpital équin de la Faculté de médecine vétérinaire de l’Université de Montréal. Les objectifs secondaires sont de déterminer la présence de SARM sur la peau chez les individus colonisés, et évaluer la durée de la colonisation par le SARM. Une étude transversale, menée sur 3 ans, a permis le recrutement de 228 chevaux admis pour des motifs non urgents au Centre Hospitalier Universitaire Vétérinaire (CHUV) de la faculté de médecine vétérinaire de Saint-Hyacinthe. Des prélèvements nasaux et de peau ont été réalisés à l'admission. Les échantillons nasaux ont été soumis au laboratoire de microbiologie pour culture et identification des S. aureus, grâce à la technologie MALDI-TOF. Les isolats résistants à la méticilline ont été identifiés à l’aide de géloses sélectives chromogéniques, et confirmés par un test de concentration minimale inhibitrice à l'oxacilline et une technique de diagnostic moléculaire (PCR mecA et mecC). En cas de SARM détecté sur le prélèvement nasal, l’échantillon de peau était soumis. Les prélèvements nasaux ont été répétés chez les individus colonisés jusqu'à l'obtention de deux cultures négatives. Pour l’exploration des facteurs de risque, les informations concernant la gestion de l'écurie, le type d’activité et les antécédents médicaux des chevaux ont été obtenues auprès des propriétaires via un questionnaire et la consultation des dossiers médicaux. Des régressions logistiques multivariées ont été utilisées pour modéliser les associations entre les facteurs de risque et la colonisation. La prévalence du portage nasal de S. aureus et de SARM dans la population de l’étude est respectivement de 17,5 % (IC à 95 % : 12,4-22,7) et de 6,2 % (IC à 95 % : 2,9-9,4). Les facteurs de risque de colonisation par le S. aureus et le SARM sont une hospitalisation dans les 6 mois précédents (S. aureus : rapport de cotes (RC) 3,5 – intervalle de confiance (IC) à 95 % 1,4-8,7 ; SARM : RC 6,1 - IC à 95 % 1,0-35,7) et l'année d'admission au CHUV (2022 vs. 2020-2021 ; 4 S. aureus: RC 3,3 – IC à 95% 1,5-7,1 ; RC 8,8 - IC à 95 % 1,7-90,9). De plus, être hébergé dans une écurie de plus de 10 chevaux constituait un facteur de risque additionnel d’être colonisé par le SARM (RC 5,9 - IC à 95 % 1,1-63,3). Aucun SARM n’a été détecté sur les prélèvements de peau des chevaux colonisés d’après les échantillons nasaux. Sur les 10 chevaux colonisés par le SARM et pour lesquels un suivi était disponible, un seul a été testé positif jusque 3 mois après l’admission. Un autre testait positif jusqu’à 30 jours suivant l’échantillonnage initial et 8 chevaux étaient négatifs au premier prélèvement de suivi, environ 14 jours après l’admission. La prévalence de colonisation nasale par le SARM dans notre population d’étude est non négligeable ; cependant, le portage semble transitoire. Outre des facteurs de risque d’ordre médical, l'importance des interactions sociales dans la transmission du SARM chez les chevaux est à prendre en considération. / The bacterium Staphylococcus aureus (S. aureus) is a multifaceted microorganism. Methicillin-resistant isolates (MRSA), are a major cause of nosocomial infections in both human and veterinary medicine. Epidemiological data are important for building robust hospital infection prevention and control programs. The main objectives of this study were to estimate the prevalence and investigate the risk factors for S. aureus and MRSA colonization in horses presented to the Veterinary Teaching Hospital (VTH) of the Faculty of Veterinary Medicine (FVM) of the Université de Montréal. Secondary objectives were to determine the presence of MRSA on the skin of colonized individuals and to assess the duration of MRSA colonization. A 3-year cross-sectional study recruited 228 horses admitted for non-emergency reasons to the VTH. Nasal and skin samples were taken on admission. Nasal samples were submitted to the microbiology laboratory for culture and identification of SA, using MALDI-TOF technology. Methicillin resistance was detected using chromogenic agar plates and confirmed by oxacillin minimum inhibitory concentration testing and a molecular diagnostic technique (mecA / mecC PCR). In the case of a nasal MRSA, the skin sample was submitted. Nasal swabs were repeated in colonized horses until two negative cultures were obtained. To investigate risk factors, information on stable management, type of activity, and medical history was obtained from owners through a questionnaire and review of the medical records. Multivariate logistic regressions were used to model associations between risk factors and colonization. The prevalence of nasal carriage of S. aureus and MRSA in the study population were 17.5% (95% CI: 12.4-22.7) and 6.2% (95% CI: 2.9-9.4), respectively. Risk factors for colonization were hospitalization within the previous 6 months (S. aureus: odds ratio (OR) 3.5 - 95% confidence interval (CI) 1.4-8.7; MRSA: OR 6.1 - 95% CI: 1.0-35.7) and year of admission (2022 vs. 2020-2021; S. aureus: OR 3.3 - 95% CI: 1.5-7.1; MRSA: OR 8.8 - 95% CI: 1.7-90.9). Furthermore, being housed in a stable with more than 10 horses was an additional risk factor for MRSA colonization (OR 5.9 - 95% CI: 1.1-63.3). No MRSA was detected on skin samples from colonized horses based on nasal samples. Of the 10 MRSA-colonized horses for which a follow-up was available, only one tested positive after 3 months. Another tested positive up to 30 days after admission, and 8 horses were negative at the first recheck sample, 14 days after admission. The prevalence of nasal MRSA colonization in our study population is not negligible; however, carriage appears to be transient. In addition to the medical risk factors, the importance of social interactions in equine MRSA transmission should be considered.

Chez les aînés autrement en santé, les facteurs de risque vasculaires (FRV), tels que l’hypertension artérielle, le diabète sucré, l’hypercholestérolémie et le tabagisme, sont d’importants facteurs de risque pour les troubles cognitifs, les symptômes psychologiques et comportementaux ainsi que la démence. Néanmoins, il y a actuellement peu de connaissances quant aux conséquences des maladies cérébro-vasculaires et des FRV dans la maladie de Parkinson idiopathique (MP). Les troubles d’ordre neuropsychologique ont un impact considérable sur la qualité de vie des patients et de leurs proches et constituent un aspect important du tableau clinique de la MP. Par conséquent, il est crucial d’identifier les facteurs y prédisposant. Les FRV offrent plusieurs pistes d’interventions intéressantes, puisqu’ils peuvent être modifiés et traités. Ainsi, cette thèse avait pour objectifs principaux d’étudier si les FRV contribuaient aux troubles cognitifs et la démence associés à la MP, et dans l’affirmative, de préciser le profil neuropsychologique des patients MP présentant des FRV. La thèse se divise en six chapitres, chacun adressant un objectif particulier. Le Chapitre 1 introduit les principaux concepts de la problématique et présente les particularités de l’étude des conséquences neurocognitives des FRV dans le contexte spécifique de la MP. Le Chapitre 2 est une recension systématique des écrits qui a permis de faire état des connaissances actuelles sur la question, en plus de soulever les limites des études antérieures afin de guider les travaux subséquents de cette thèse doctorale. Le Chapitre 3 présente une analyse transversale incluant 139 patients MP et montre que la sévérité de l’histoire de tabagisme est associée à un fonctionnement cognitif global inférieur, même chez les patients ayant cessé de fumer, et ce, indépendamment de l’âge et du niveau d’éducation. Le Chapitre 4 présente une étude empirique basée sur la banque de données longitudinale du Parkinson’s Progression Markers Initiative (PPMI), et conclut que le nombre d’années avec un diagnostic d’hypertension artérielle ainsi qu’une pression différentielle élevée ont des effets délétères sur les mesures de mémoire épisodique et de fluidité verbale sémantique. Le Chapitre 5 détaille la dernière étude empirique de la thèse et expose les effets dommageables du fardeau vasculaire total sur les fonctions exécutives et la mémoire épisodique, à la fois dans un groupe de patients MP et un groupe de participants contrôles. Enfin, le Chapitre 6 se veut une synthèse, une mise à jour et une réflexion critique des résultats obtenus dans le cadre des travaux de cette thèse. / Vascular risk factors (VRFs) such as hypertension, diabetes mellitus, hypercholesterolemia and smoking are important risk factors for cognitive impairment, psychiatric disorders and dementia in otherwise healthy older adults. However, there is little knowledge about the influence of cerebrovascular diseases and VRFs on cognition in idiopathic Parkinson's disease (PD). Cognitive impairment and dementia are an important part of the clinical presentation of PD and have a considerable impact on the quality of life of the patients and their caregivers. Therefore, it is crucial to identify potential risk factors for neuropsychological disorders in PD. VRFs offer many possibilities for intervention in clinical settings, since they can be modified and treated. Thus, the main objectives of this dissertation were to study whether VRFs contribute to cognitive impairment and dementia associated with PD, and if so, to specify the neuropsychological profile of MP patients with VRFs. The dissertation is divided into six chapters, each addressing a particular objective. Chapter 1 introduces the main concepts of the problem and presents the specific challenges of the study of the neurocognitive consequences of VRFs in the specific context of PD pathology and treatment. Chapter 2 is a systematic and critical review of the literature that presents the current knowledge on this issue, in addition to identifying and discussing the limits of the previous studies to guide the subsequent work of this dissertation. Chapter 3 presents a cross-sectional analysis including 139 PD patients that shows that the severity of smoking history is associated with lower global cognitive functioning, even in patients who quit smoking, and regardless of age and level of education. Chapter 4 presents an empirical study based on the longitudinal database of the Parkinson's Progression Markers Initiative (PPMI), and concludes that the number of years with a diagnosis of hypertension and high pulse pressure have deleterious effects on measures of episodic memory and semantic fluency. Chapter 5 presents the last empirical study of this dissertation and shows that a higher vascular burden is independently associated with worse performance on executive functions and episodic memory, both in a group of PD patients and a group of otherwise healthy controls. Finally, Chapter 6 presents a summary, an update and a critical discussion of the results obtained over the last five years.

Objectifs : Cette étude transversale effectuée sur les travailleuses du sexe (TS) et leurs clients dans 2 zones géographiques d'intervention du Projet SIDA 3 au Sénégal avait pour objectifs: de déterminer la prévalence et les rapports de prévalence des facteurs associés aux virus de l'immunodéficience acquise (VIH) et des infections sexuellement transmissibles (IST), chez les TS et leurs clients et d'estimer le potentiel de transmission du VIH et des IST à la population générale par le biais des TS et de leurs clients. Méthodologie : Les prélèvements vaginal, urinaire et sanguin ont été respectivement analysés au laboratoire par Polymérase Chain Réaction (PCR) pour la détection de gonocoque ou chlamydia et Enzyme Linked Sorbent Assay (ELISA) pour le VIH, tandis qu'un test Leucocytes Esterase Dipstick (LED) détectait les leucocytes dans l'urine. Les proportions et les données continues ont été respectivement comparées, en utilisant les tests du X2 ou exact bilatéral de Fisher et test t de Student. Par régression binomiale avec GENMOD en analyse univariée ou multivariée, les rapports de prévalence ont été les estimés des forces d'association. Toutes les analyses statistiques ont été réalisées grâce au logiciel SAS 8 ou 9. L'étude a été approuvée par le comité national éthique du Sénégal. Résultats : Chez les TS, les prévalences du VIH et des IST étaient respectivement de 26,9% (65/242) et 09,8% (21/214) tandis que chez leurs clients, elles étaient de 2,1% (6/285) et 1,4% (4/294). En analyse multivariée chez les TS : l'âge, le nombre d'épisodes IST dans la vie et le nombre de partenaires dans la dernière semaine de travail restaient ensemble toutes significativement associées au VIH. On notait 2 fois plus d'IST chez les TS clandestines que chez les TS officielles (p=0,08) alors qu'il y avait 3 fois moins de VIH chez les premières que chez les dernières (p=0,001). Entre le test LED et l'analyse PCR chez les clients, les sensibilité, spécificité, valeurs prédictives positive et négative étaient respectivement de 100%, 91%, 16% et 100%. La fraction du risque chez le client, attribuable au contact infectant avec la TS était de 67% et 5,2% de l'ensemble des femmes del5-49 ans des sites géographiques étudiés ont été indirectement exposées aux IST/VIH par le biais des clients. Conclusion : Afin d'avoir des données fiables permettant d'établir des programmes appropriés de lutte contre les IST/VIH au Sénégal, des enquêtes répétées auprès des TS et de leurs clients s'avèrent nécessaires

Les enjeux de santé mentale sont fréquents chez les adolescents et peuvent avoir des répercussions négatives durables sur leur santé globale. Plusieurs facteurs de risque prédisposant aux symptômes dépressifs dans cette population sont bien connus, tels qu’être une fille ou avoir étévictime d’intimidation. Le sentiment d’appartenance à l’école, quant à lui, apparaît être un facteur protecteur des symptômes dépressifs chez les adolescents. Son impact positif au sein de groupes vulnérables reste toutefois à vérifier. Le présent mémoire a trois objectifs distincts. Le premier est d’évaluer l’influence du sentiment d’appartenance sur les symptômes dépressifs chez les adolescents. Le deuxième est de vérifier si son influence varie chez les groupes plus vulnérables, tels que les filles, les victimes d’intimidation et celles cumulant ces deux vulnérabilités face aux symptômes dépressifs. Le troisième est d’examiner l’impact relatif hypothétique que pourraient atteindre des interventions favorisant le sentiment d’appartenance, l’élimination de l’intimidation ou de l’écart entre les sexes sur les symptômes dépressifs significatifs sur la base des associations trouvées précédemment. Pour répondre à ces questions, les données de la cohorte 2017-2018 de COMPASS-Québec de 17 367 élèves de 37 écoles secondaires de l’Est-du-Québec ont été utilisées (Chapitre 1). Les résultats suggèrent que le sentiment d’appartenance à l’école rapporté par les élèves a une influence positive face à leurs symptômes dépressifs, et que son influence semble d’autant plus importante pour les adolescents cumulant les vulnérabilités, tels que les filles intimidées. Toutefois, même en présence des plus hauts scores d’appartenance, cette influence pourrait être insuffisante chez les groupes les plus à risque de symptômes dépressifs. / Mental health issues are common in adolescents and can have a lasting negative impact ontheir overall health. Several risk factors for depressive symptoms in this population are wellknown, such as being a girl or being bullied. School connectedness appears to be a protective factor in adolescents’ depressive symptoms. However, its positive impact among vulnerable groups remains unknown. This master’s thesis has three distinct objectives. The first one isto assess the influence of school connectedness on depressive symptoms among adolescents.The second is to see if its influence varies among vulnerable groups, such as girls, victims of bullying and those who combine these two vulnerabilities. The third is to examine the hypothetical relative impact whether public health interventions aimed at increasing school connectedness, eliminating bullying or eliminating the gender gap could achieve on significant depressive symptoms based on the associations found above. To answer these questions, datafrom COMPASS-Quebec’s 2017-2018 cohort of 17,367 students from 37 high schools in Eastern Quebec were used ( Chapter 1). The results suggest that the students’ reported school connectedness has a protective influence on their depressive symptoms and its influence appears evengreater among young people cumulating vulnerabilities, such as bullied girls. However, evenwith the highest school connectedness scores, this influence may not be sufficient in the mostat-risk students for depressive symptoms.

La résistance des bactéries à Gram négatif aux céphalosporines de troisième génération (C3G) et aux carbapénèmes constitue une menace de santé publique majeure à l’échelle mondiale. Ces β-lactamines à large spectre d’action sont spécifiquement utilisées dans le traitement des infections résistantes potentiellement mortelles causées par des bactéries multirésistantes. Le principal mécanisme de résistance aux C3G et aux carbapénèmes est l’acquisition de gènes encodant respectivement des β-lactamases à spectre étendu (BLSE) et des carbapénémases. Plusieurs études ont répertorié les principales β-lactamases responsables des épidémies dans de nombreux pays à savoir les types TEM, SHV et CTX-M pour les bactéries productrices de BLSE, et plus récemment les types IMP, KPC, NDM, OXA-48 et VIM pour les bactéries productrices de carbapénémases. L’Organisation mondiale de la Santé a recommandé des mesures contrôle et prévention et de contrôle afin de réduire le risque de transmission des bactéries à Gram négatif productrices de BLSE ou de carbapénémases. Ces stratégies incluent l’identification des bactéries productrices de BLSE et de carbapénémases par des méthodes diagnostiques rapides de même que la mise en place d’une surveillance épidémiologique des principaux gènes de résistance encodant à ces enzymes. Ce mémoire de maîtrise se présente en 2 volets. D’une part, le développement d’un essai PCR en temps réel pour la détection rapide et sensible des gènes encodant les principales carbapénémases. D’autre part, la réalisation d’une étude épidémiologique dans deux hôpitaux de la ville de Québec sur les principaux gènes de BLSE chez des souches cliniques résistantes aux céphalosporines de 3e génération. Ces résultats démontrent que ces approches moléculaires pourraient être utilisées dans les laboratoires de microbiologie clinique afin de faciliter la détection et la surveillance des bactéries productrices de BLSE et de carbapénémases. / The resistance of Gram-negative bacteria against third-generation cephalosporins (3GC) and carbapenems is a major public health threat worldwide. These antibiotics are used specifically in the treatment of life-threatening infections caused by multidrug-resistant bacteria. The acquisition of genes encoding for extended-spectrum β-lactamases (ESBL) and carbapenemases is the main mechanism of resistance to 3GC and carbapenems, respectively. Several studies have identified the main β-lactamases responsible for epidemics in many countries namely TEM, SHV, and CTX-M for ESBL-producing bacteria, and more recently IMP, KPC, NDM, OXA-48-type, and VIM for bacteria producing carbapenemases. The World Health Organization has recommended preventives measures to control and reduce the risk of transmission of Gram-negative bacteria producers of ESBL and carbapenemases. These strategies include the identification of ESBL and carbapenemases with rapid diagnostic methods as well as the establishment of epidemiological surveillance of major resistance genes for these enzymes. This master’s thesis is presented in two parts. On one hand, the development of a real-time PCR assay for rapid and sensitive detection of key genes encoding carbapenemases. On the other hand, an epidemiological study in two hospitals in Quebec City of genes coding for ESBL in clinical strains resistant to third generation cephalosporins. These results demonstrate that these molecular approaches could be used in clinical microbiology laboratories to facilitate the detection and monitoring of ESBL- and carbapenemases-producing bacteria.

Tableau d’honneur de la Faculté des études supérieures et postdoctorales, 2013-2014. / Les graphes sont des objets mathématiques abstraits utilisés pour modéliser les interactions entre les éléments constitutifs des systèmes complexes. Cette utilisation est motivée par le fait qu’il existe un lien fondamental entre la structure de ces interactions et les propriétés macroscopiques de ces systèmes. La théorie de la percolation offre un paradigme de choix pour analyser la structure de ces graphes, et ainsi mieux comprendre les conditions dans lesquelles ces propriétés émergent. Les interactions dans une grande variété de systèmes complexes partagent plusieurs propriétés structurelles universelles, et leur incorporation dans un cadre théorique unique demeure l’un des principaux défis de l’étude des systèmes complexes. Exploitant une approche multitype, une idée toute simple mais étonnamment puissante, nous avons unifié l’ensemble des modèles de percolation sur graphes aléatoires connus en un même cadre théorique, ce qui en fait le plus général et le plus réaliste proposé à ce jour. Bien plus qu’une simple compilation, le formalisme que nous proposons augmente significativement la complexité des structures pouvant être reproduites et, de ce fait, ouvre la voie à plusieurs nouvelles avenues de recherche. Nous illustrons cette assertion notamment en utilisant notre modèle pour valider et formaliser certaines intuitions inspirées de résultats empiriques. Dans un premier temps, nous étudions comment la structure en réseau de certains systèmes complexes (ex. réseau de distribution électrique, réseau social) facilite leur surveillance, et par conséquent leur éventuel contrôle. Dans un second temps, nous explorons la possibilité d’utiliser la décomposition en couches “k-core” en tant que structure effective des graphes extraits des systèmes complexes réels. Enfin, nous utilisons notre modèle pour identifier les conditions pour lesquelles une nouvelle stratégie d’immunisation contre des maladies infectieuses est la stratégie optimale. / Graphs are abstract mathematical objects used to model the interactions between the elements of complex systems. Their use is motivated by the fact that there exists a fundamental relationship between the structure of these interactions and the macroscopic properties of these systems. The structure of these graphs is analyzed within the paradigm of percolation theory whose tools and concepts contribute to a better understanding of the conditions for which these emergent properties appear. The underlying interactions of a wide variety of complex systems share many universal structural properties, and including these properties in a unified theoretical framework is one of the main challenges of the science of complex systems. Capitalizing on a multitype approach, a simple yet powerful idea, we have unified the models of percolation on random graphs published to this day in a single framework, hence yielding the most general and realistic framework to date. More than a mere compilation, this framework significantly increases the structural complexity of the graphs that can now be mathematically handled, and, as such, opens the way to many new research opportunities. We illustrate this assertion by using our framework to validate hypotheses hinted at by empirical results. First, we investigate how the network structure of some complex systems (e.g., power grids, social networks) enhances our ability to monitor them, and ultimately to control them. Second, we test the hypothesis that the “k-core” decomposition can act as an effective structure of graphs extracted from real complex systems. Third, we use our framework to identify the conditions for which a new immunization strategy against infectious diseases is optimal.

La prévalence d'anémie, de déficience en fer et d'anémie ferriprive ainsi que les apports en fer total et absorbable ont été évalués chez un groupe représentatif de femmes inuites non enceintes âgées de 18 à 74 ans résidant au Nunavik. L'anémie, la déficience en fer et l'anémie ferriprive étaient présentes chez 43%, 36% et 21% de ces femmes respectivement (n=466). Une proportion plus importante de femmes âgées entre 18 et 49 ans souffraient d'anémie ferriprive (61 % des cas d'anémie), alors que les femmes de plus de 50 ans souffraient davantage d'anémie de type inflammatoire (42% des anémies). Les apports en fer total ont été estimés à 14 mg/jour et ceux en fer absorbable à 1,5 mg/jour (n=346). En tout, 23 % des femmes avaient des apports insuffisants en fer total et 45 % avaient des apports insuffisants en fer absorbable le jour précédant l'entrevue. La prévalence d'apports inadéquats en fer absorbable a été associée avec la déficience en fer et la déplétion des réserves, alors qu'aucune relation significative n'a été trouvée avec le fer total. Les déficiences en vitamines A, B₉ et B₁₂ sont peu fréquentes et ne semblent pas être des facteurs étiologiques importants de l'anémie chez les femmes du Nunavik. Cependant, une consommation plus faible de céréales et de boissons sucrés, des apports plus élevés de mollusques, l'obésité abdominale, la sécurité alimentaire et l'emploi ont été associés avec un meilleur statut en fer selon les analyses multivariées. L'anémie et la carence en fer sont des problèmes majeurs de santé au Nunavik. Bien que l'OMS recommande une supplémentation en fer universelle lorsque la prévalence d'anémie ferriprive excède 20%, des programmes d'intervention en nutrition sont requis de façon urgente pour améliorer le statut en fer des femmes inuites du Nunavik.

Le virus respiratoire syncytial (VRS) est le plus important pathogène respiratoire du jeune enfant. Dans une étude prospective menée au cours de deux saisons hivernales, parmi les enfants de 0-3 ans hospitalisés pour infections des voies respiratoires (IVR) , au moitis un virus respiratoire a été retrouvé chez 74%. Le VRS était présent chez 55,6% des enfants. Deux sousgroupes (A et B) du VRS et plusieurs génotypes ont été identifiés basé sur la séquence du gène G. Le séquençage de la glycoprotéine G et l'analyse phylogénétique ont été effectués sur les souches détectées. La comparaison des données cliniques des 106 enfants avec le sous-groupe A du VRS (96 génotypes GA2) et 94 enfants avec le sous-groupe B du VRS (62 génotypes GB3) a montré que le sous-groupe A et le génotype GAI étaient associés à une plus grande sévérité de la maladie en comparaison avec les souches du sous-groupe B. Parmi les enfants atteints de VRS qui ont reçu des antibiotiques (AB) de façon empirique à l'admission, la réception d'un résultat d'un test rapide confirmant la présence du VRS n'a pas réduit subséquemment l'utilisation des AB. La proportion des hospitalisations attribuables au VRS et à l'influenza estimée à partir des banques administratives par six méthodes statistiques connues a été comparée aux résultats de l'étude prospective chez les enfants de 6 à 23 mois. Les estimés obtenus variaient de façon considérable selon la saison et la méthode. Les méthodes statistiques usuelles ne semblent pas en mesure d'estimer correctement les hospitalisations attribuables aux virus respiratoires.

Les arboviroses représentent un fardeau sanitaire considérable et croissant à l’échelle mondiale. La complexité des facteurs biotiques et abiotiques qui interviennent dans la transmission de ces arbovirus pose un défi de taille aux scientifiques qui tentent de comprendre, de modéliser ou d’anticiper leur transmission ainsi qu’aux intervenants de santé publique qui ont la responsabilité de surveiller, d’évaluer et gérer le risque que posent les arbovirus pour la santé des populations. Cette étude visait à estimer et caractériser le risque d’exposition à plusieurs arbovirus suspectés d’être actifs et émergents au Québec mais dont la distribution avait peu ou n’avait pas été étudiée au Québec : le virus du Nil occidental (VNO), le virus de l’encéphalite équine de l’est (VEEE) et deux virus du sérogroupe de la Californie (VSGC), le virus de Jamestown Canyon (VJC) et le virus du lièvre d’Amérique (VLA). Basée notamment sur l’hypothèse selon laquelle les animaux d’espèces différentes qui partagent un environnement commun partagent également un risque environnemental commun, cette étude visait également à évaluer si les populations d’animaux de compagnie pouvaient aider à estimer et caractériser le risque d’infection arbovirale chez l’humain. L’échantillonnage sérologique de populations humaines, canines et équines du sud-ouest du Québec a permis d’évaluer et de comparer la séroprévalence aux arbovirus étudiés chez chacune de ces trois espèces. Les estimations de séroprévalence ont révélé un niveau d’activité arbovirale significative pour chacun des arbovirus. Des différences ont été remarquées quant au pourcentage de sujets séropositifs chez chacune des espèces. Les facteurs environnementaux ayant une influence sur le risque d’infection par le VEEE ont été modélisés à partir de données sérologiques et cliniques chez les chevaux. Les milieux humides boisés ont été identifiés comme les principaux environnements à risque pour le VEEE au Québec alors que les zones agricoles ont été identifiées comme des environnements protecteurs. Les facteurs environnementaux ayant un impact sur le risque d’infection par le VNO ont été modélisés à partir des données sérologiques chez le chien et des données cliniques agrégées chez l’humain. Cette modélisation a suggéré un risque singulièrement plus élevé en zone agricole chez le chien et un risque plus faible en zone forestière chez l’humain, des facteurs rarement identifiés dans la littérature Nord-Américaine. Les facteurs environnementaux et individuels ayant un impact sur le risque d’infection par les VSGC chez l’humain et le chien ont par la suite été modélisés à partir des données sérologiques chez ces deux espèces. D’après nos modèles, le risque d’infection par ces virus serait supérieur en zone forestière et le degré d’exposition aux piqures de moustiques serait un facteur déterminant du risque d’infection chez les deux espèces. Cette étude a permis de bonifier de façon substantielle le portrait de l’activité arbovirale au Québec. Elle a permis de caractériser la distribution du risque et a fourni des données probantes pouvant soutenir la recherche ainsi que la planification des interventions en santé publique. La méthodologie utilisée dans le cadre de cette étude supporte la pertinence de l’approche « One Health » pour l’étude des maladies vectorielles émergentes. / Arboviral infections represent a considerable and growing health burden globally. The complexity of biotic and abiotic factors involved in the transmission of these arboviruses pose a challenge to scientists trying to understand, model or anticipate arboviral transmission as well as to public health authorities who have the responsibility to monitor, assess and manage the public health risk posed by arboviruses. This study aimed at estimating and characterizing the risk of exposure to several arboviruses suspected of being active and emerging in Québec but whose distribution had not been studied thoroughly in Québec: West Nile virus (WNV), eastern equine encephalitis virus (EEEV) and two viruses of the California serogroup (CSG), Jamestown Canyon virus (JCV) and Snowshoe hare virus (SHV). Based on the assumption that animals of different species sharing a common environment also share similar environmental risk, this study also aimed to assess whether some populations of domestic animals could help to estimate and characterize the risk of arboviral infection in humans. Serological sampling of human, canine and equine populations from southwestern Québec was used to evaluate and compare the seroprevalence to the selected arboviruses in each of these three species. Seroprevalence estimates showed a significant level of arboviral activity for all arboviruses. Differences were noted in the percentage of seropositive individuals in each species. Environmental factors that influence the risk of infection by EEEV were modeled based on serological and clinical data in horses. Wooded wetlands were identified as the main risk environments for EEEV in Québec while agricultural areas were identified as protective environments. Environmental factors affecting the risk of WNV infection were modeled based on serological data in dogs and aggregated clinical data in humans. These models suggested a higher risk in agricultural areas in dogs and a lower risk in forest areas in humans, two factors rarely identified in the North American literature. Environmental and individual factors affecting the risk of infection by CSGV in humans and dogs have subsequently been modeled based on serological data in these two species. According to our models, the risk of infection with these viruses would be higher in forested areas and the degree of exposure to mosquito bites would be a risk factor for infection in both species. This study substantially enhanced the comprehension of arboviral activity in Québec. It allowed for characterizing the distribution of risk and provided evidence that may support research and planning of public health interventions. The methodology used in this study supports the relevance of the "One Health" approach for the study of emerging vector-borne diseases.