Genetically encoded, site-specific incorporation of unnatural amino acids (UAA)into proteins through selective recoding of an amber stop codon provides apowerful route for expressing synthetic proteins in living cells. Recoding of theamber stop codon is achieved by introducing an amber suppressortRNA/synthetase pair orthogonal to the endogenous tRNA complement intocells. Methanosarcina is a methane producing archaea with the unusualcapability of suppressing the stop codon (specifically the amber codon). Bysuppressing the amber codon Methanosarcina facilitate the incorporation of thenon-canonical amino acid pyrrolysine (pyl). The suppressing mechanismoriginates from a evolutionary unique Pyrrolysyl-tRNA synthetase (PylRS) and itsmatching tRNApyl. The PylRS has been further evolved and modified to allowincorporation of a wide range of UAAs. Amber suppression is today used tocontrol and study protein function in living cells. By making a series of wellcontrolledexperiments with HEK293T cells we aimed to develop this techniqueinto a robust and general tool for mammalian cell biology. Specifically we weretesting the incorporation of the unnatural amino acid bicyclononyne (BCN) by aset of known PylRS mutants. Our results suggest the mutant aaRS PylRS “AF” isthe most robust and efficient synthetase for BCN. We have improved ambersuppression by determining which factors leads to a more efficient method andsimultaneously decreasing the cost of the method.

No description available.

Boreal forest is the largest biome in the world and therefore holds much of the global carbon and has a great root system size which makes it relevant to analyze how common grazing animals affect this environment. Roots have many different roles in the ground and for the plants, where fine roots take up nutrients and circulate biomaterials among other things and coarser roots make up most of the biomass and sequestrate most carbon. Herbivores have been shown to affect plant productivity and remove aboveground biomass through their grazing, and this could have both positive, negative, and neutral effects. The purpose of this study was to examine how the root biomass varies depending on reindeer grazing in boreal forests, and this was done by studying how tree distance, ground depth and grazing reindeer affect root biomass. Fine, coarse, and very coarse roots were sampled in ungrazed and grazed areas in northern Finland. This was done with a distance of 1-3 meters from trees and depths in increments of 0-25 cm. No factors were significant for coarse roots and treatment not affecting them could be explained by some plants being able to survive defoliation or simply not being reduced by reindeer. Distance hardly affected root biomass which other studies also found, and also similar to other studies depth affected fine roots. Grazing was shown to reduce fine and very coarse root biomass. Loss of fine roots can affect microbial activity in the soil and loss of coarser roots can possibly affect the area long-term in different ways.

Invasive alien species are the second biggest threat to global biodiversity. Biodiversity loss results in loss of ecosystem functions and resilience. Freshwater ecosystems are more sensitive to invasions; therefore, their biodiversity is decreasing at a much faster rate in comparison to terrestrial ones. This thesis focuses on one of three invasive alien aquatic plants present in Sweden: Nymphoides peltata, a sediment-rooted, floating-leaved plant originating from middle Europe and Asia. Since the early 1980’s N. peltata has been present in Lake Galten, the most western part of Mälaren. The current eradication work is carried out by light depletion through floating frames that shade the N. peltata colony. The aim of this work was to evaluate the efficiency of this method by assessing eventual recolonization of N. peltata in eradicated sites and suggesting possible improvements. Information and data were collected by reviewing existing literature on invasive species eradication as well as conducting interviews with experts followed by field observations in Munkhammar bay of Lake Galten. The choice of floating frames as the main eradication method has been proven valid since it counters N. peltata clonal growth and fragmentation capacity. Despite a reduction by 1.7% of total N. peltata coverage from 2019 to 2020, correlated with the increase in frame coverage, field observations showed that recolonization is happening. Suggested improvements are the use of frames as spreading barrier, to reduce clonal growth and fragmentation of large colonies, together with introducing a free-floating fiber sheet to properly seal the gap between shoreline and frames. A proactive covering of vulnerable shores with fiber sheet is also recommended. However, the lack of a coordinated national action plan and laws’ inadequacy weakens the possibility of a successful eradication. Tempestive adjustments of current legislations are needed since climate change will allow N. peltata to spread further north and produce viable seeds.

No description available.

Som en åtgärd för att försöka hjälpa den minskande populationen av rapphöna att återhämta sig tog HMKs Jaktklubb inspiration från ett lyckat projekt i England utfört av Game & Wildlife Conservation Trust. De sådde blomremsor som en åtgärd för att gynna evertebrater som är kycklingarnas huvudföda. Jaktklubben etablerade dessa blomremsorna 2011 och vill nu undersöka om det gav en effekt på mängden evertebrater. Fönsterfällor och fallfällor placerades ut i och utanför blomremsan och tömdes två gånger i juni, en gång i juli och en gång i augusti. Det insamlade materialet har identifierats till familj med hjälp av litteratur för materialet från augusti, identifierat material från juni fanns redan tillgängligt. För skalbaggar identifierades allt material till art. Resultatet visade en stor diversitet och många olika grupper fanns representerade inom de insamlade materialet. De statistiska analyserna kunde inte med säkerhet visa att blomremsorna gynnade evertebrater. Detta är troligtvis snarare på grund av problematiken med experimentdesignen än att det inte var någon skillnad. Min uppfattning är att blomremsorna har en positiv effekt på biodiversiteten, även om det inte går att visa detta indikerar resultatet på det, vilket även backas upp av litteraturen. Åtgärder som dessa skulle potentiellt kunna vara ett steg i rätt riktning för att kunna lösa den minskade biodiversiteten runt om i världen.

En mängd olika ståndortsfaktorer påverkar trädens tillväxt. Några av dessa kan påverkas genom olika skogsskötselmetoder, t ex näringstillförsel. I ett flertal försök de senaste decennierna har skogsgödsling visat sig kunna öka tillväxten markant. Faktorer som inte är påverkbara, som t ex markens textur och markens jorddjup kan då bli begränsande för tillväxten eftersom en finkornig textur oftast är gynnsam ur tillväxtsynpunkt. Föreliggande undersökning syftar till att se om det finns en texturvariation inom en begränsad yta och dess effekter på tillväxten. Texturen undersöktes genom torrsiktning. Resultaten visar att det förelåg en stor variation av texturen på beståndsnivå och att det kan påverka tillväxten i kombination med andra begränsande faktorer såsom vattentillgång.

No description available.

I den här uppsatsen undersöker jag hur biologilärare på högstadiet försöker få elever nyfikna. Nyfikenhet är ett viktigt ämne att studera eftersom nyfikenhet är det som leder personer till att utforska världen och är det som har lett till den vetenskap vi har idag. Den här studien kan användas av lärare för att lära sig om hur andra lärare försöker inspirera till nyfikenhet. Den öppnar även upp för fler tankar kring nyfikenhet som skulle kunna utforskas mer. För att få reda på hur lärare försöker få elever nyfikna intervjuade jag fem lärare och använde mig av intervjuerna för att titta på mönster som kunde hittas. Några av de saker som kom fram var att flera av lärarna tyckte att det var bra att använda sig av praktiska inslag som laborationer för att få elever nyfikna, att elever främst verkar uttrycka sin nyfikenhet genom att ställa frågor alternativt att de uttrycker det på fler sätt men lärare märker inte det. Framförallt kom det fram att trygghet och bra relationer är viktiga för att eleverna ska våga visa sin nyfikenhet och att lärare ska själva visa sitt intresse för att få elever mer nyfikna.

A greater consumption of pharmaceutical drugs entails an increased concentration of active benzodiazepines in aquatic ecosystems. Consequently, aquatic organisms are experiencing altered behavior that may affect dominance hierarchies since social status (among other variables) is associated with behavioral traits. The aim of this study was to determine whether dominance hierarchies of brown trout (Salmo trutta) were affected by exposure to a benzodiazepine (oxazepam). Hypothetically, aggression (in dominants) and anxiety (in subordinates) will reduce following exposure. The fish should consequently display a significant disparity between treatment groups regarding the frequency of dominance change (i.e., who is dominant versus subordinate). This research included behavioral coding of 150 juvenile brown trout (Salmo trutta) divided into 50 size-matched social groups of 3 individuals. Each group was exposed to one of three oxazepam concentrations (30 µg/L, 1.5 µg/L and 0 µg/L). The results indicate no relationship between an altered aggression and oxazepam exposure. In addition, the level of aggression reduced over time (regardless of social status and concentration) and the initial subordinates remained significantly less aggressive than the initial dominants. The frequency of dominance change did not differ significantly between different treatment groups. Body size did not affect social status. The results in low treatment groups may be due to a low bioconcentration since previous research exhibited similar results. However, the lack of results in high treatment groups could be due to something else. In conclusion, the dominance hierarchy was not disrupted by oxazepam exposure because aggression was unaffected.