Emissões sonoras são comuns em diferentes táxons, principalmente dentro de contextos reprodutivos e territoriais. Nos anuros, as vocalizações são produzidas principalmente pelos machos. Os cantos de anúncio, principal forma de comunicação nesse grupo, têm a função principal de atrair fêmeas e sinalizar a ocupação de um espaço ou território. Em geral, o canto de anúncio, é um atributo único de cada espécie, tendo importância no reconhecimento específico, atuando como barreira pré-zigótica de isolamento reprodutivo, tendo papel importante em eventos de especiação. Assim, o estudo desse tipo de vocalização tem contribuído na determinação da identidade das espécies, sendo usado como caráter diagnóstico em estudos taxonômicos, inclusive no reconhecimento de novas espécies. O gênero Dendropsophus, atualmente abriga 97 espécies distribuídas do sul da Argentina/Uruguai ao sul do México, essas estão divididas essencialmente em nove grupos. O grupo de D. microcephalus que compreende 38 espécies foi tradicionalmente definido em bases morfológicas e, posteriormente, sua monofilia foi corroborada através de dados moleculares. No grupo de D. microcephalus, o subgrupo de Dendropsophus rubicundulus, ainda não teve sua monofilia testada, sendo primeiramente reconhecido como um grupo fenético a partir dos seguintes caracteres: tamanho pequeno, coxas imaculadas, superfícies dorsais esverdeadas em vida e violáceas em espécimes preservados. O presente estudo teve como objetivo analisar e caracterizar os cantos de anúncio de populações e espécies do grupo de Dendropsophus rubicundulus, visando reconhecer novos caracteres acústicos diagnósticos e determinar a posição taxonômica de outras populações. Com as análises dos cantos de anúncio das espécies do grupo de Dendropsophus rubicundulus constatou-se que o canto de D. anataliasiasi é diagnostico de todas as outas oito espécies pela presença de dois tipos de notas compondo o canto de anúncio. A presença de apenas um tipo de nota compondo o canto de anúncio, a grande sobreposição na amplitude de valores para as variáveis temporais, espectrais e as similaridades estruturais não permitem o reconhecimento de caracteres acústicos diagnósticos entre as espécies do complexo de D. tritaeniatus: D. araguaya, D. cerradensis, D. jimi, D. rhea, D. tritaeniatus; e D. cachimbo, D. elianeae, D. rubicundulus e Dendropsophus sp. da Chapada dos Veadeiros e Município de Padre Bernardo (GO). Embora a grande similaridade acústica entre essas espécies não permita diagnoses, a tendência de emitir notas em sequência, a maior duração das notas, maior duração dos pulsos, maior intervalo entre as notas da sequência, frequência dominante mais alta e menor taxa de repetição dos pulsos, permite uma discreta diferenciação entre as espécies que compõem o complexo de D. tritaeniatus e as outras três espécies do grupo de D. rubicundulus (D. cachimbo, D. elianeae, D. rubicundulus) e Dendropsophus sp. da Chapada dos Veadeiros e Município de Padre Bernardo. / Sound emissions are common in different taxa, mainly in reproductive and territorial contexts. In Anura, vocalizations are released mainly by males. The advertisement call, main form of communication in this group, has the function of attracting females and signaling the occupation of a space or territory. In general, the advertisement call is a particular attribute of each species with significance in specific recognition, acting as a pre-zygotic barrier of reproductive isolation, playing an important role in speciation events. Thus, the study of vocalizations have contributed to the determination of species identities as a diagnostic character in taxonomic studies, including the recognition of new species. The genus Dendropsophus, currently comprises 97 species distributed from southern Argentina/Uruguay to southern Mexico. This genus is essentially divided into nine groups. The Dendropsophus microcephalus group comprises 38 species, and was traditionally defined through a morphological approach. Subsequently, its monophyly was corroborated by molecular evidence. In Dendropsophus microcephalus group, the D. rubicundulus sub-group´s monophyly has not been tested yet, recognized as a phenetic group by the following characters: small size, immaculate thighs, dorsum green in life, and violet in preserved specimens. The present study aimed to analyze and characterize the advertisement calls of populations and specimens of the D. rubicundulus group, an effort to recognize further diagnostic acoustics features and to assess the taxonomic status of other populations. From the the advertisement calls analyses among the species of the D. rubicundulus group, we can notice that the call of D. anataliasiasi is diagnostic in relation to the other eight species of the D. rubicundulus group by the presence of two types of notes compounding its advertisement call. The presence of only one type note compounding the call, the wide overlap in the range of values for the temporal traits, as well as spectral and structural similarities, do not allow us to recognize diagnostic acoustic characters among the species of the D. tritaeniatus complex: D. araguaya, D. cerradensis, D. jimi, D. rhea, D. tritaeniatus; and D. cachimbo, D. rubicundulus, D. elianeae, and Dendropsophus sp. from Chapada dos Veadeiros and Municipality of Padre Bernardo (GO). Although the acoustic similarity among these species does not allow us to enhance species diagnoses, the tendency to issue notes in sequences, the longer note duration, longer pulses, longer interval between notes emitted in sequence, higher dominant frequency, and lower pulse repetition rate, shows a slight differentiation between the species of the D. tritaeniatus complex and the three other species of the D. rubicundulus group (D. cachimbo, D. elianeae, and D. rubicundulus), as well as Dendropsophus sp. from the Chapada dos Veadeiros and Municipality of Padre Bernardo.

Os anuros são os anfíbios mais conhecidos no mundo, com aproximadamente 5.067 espécies identificadas. O Brasil abriga a maior riqueza de anuros do planeta. Os sapinhosde- jardim, Rhinella fernandezae, são incluídos na família Bufonidae, para qual tem aumentado anualmente o número de espécies conhecidas. Para o Rio Grande do Sul existem registros de 17 espécies de anuros bufonídeos. Mesmo o Brasil abrigando a maior riqueza de anuros, estudos sobre a helmintofauna destes ainda são escassos. Espécimes de Rhinella fernandezae foram capturados, manualmente, com auxílio de páde- jardim em Imbé, RS. Os sapos foram transportados em recipientes plásticos para o Laboratório de Helmintologia do Departamento de Zoologia, Universidade Federal do Rio Grande do Sul, onde foram mantidos em terrário contendo substrato umidificado do local. Foram mortos com lidocaína e foram necropsiados. Todos foram identificados e depositados na Coleção de Anfíbios do Museu de Ciências e Tecnologia da Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul. Os órgãos internos foram individualizados em placas de petri para exame e coleta dos helmintos. Os helmintos foram processados, corados e/ou diafanizados de acordo com o grupo. Foram encontradas 13 espécies de helmintos: quatro digenéticos (Catadiscus sp., Gorgoderina festoni, Gorgoderina sp. e metacercárias de diplostomídeo), dois cestóides (Cylindrotaenia americana e plerocercóides de Proteocefalidea), dois acantocéfalos (Acanthocephalus lutzi e cistacantos de Centrorhynchus sp.) e cinco nematóides (Cosmocerca parva, Aplecatana meridionalis, Strongyloides carinii, Rhabdias fuelleborni e Oswaldocruzia sp.). Sendo que 10 espécies foram encontradas em forma adulta e três em forma larval (metacercária, plerocercóide e cistacanto). A intensidade média de infecção foi de 26,73 helmintos/hospedeiro. Os nematóides apresentaram maior representatividade, com 80% dos helmintos coletados e com 39% do total de espécies encontradas em R. fernandezae. Os digenéticos representaram 31% do total de espécies encontradas. O maior número de espécies e a alta representatividade de nematóides devem estar associados ao hábito terrestre da espécie hospedeira. A abundância e a prevalência de helmintos não foram afetadas pelo sexo do hospedeiro. A riqueza parasitária não foi influenciada pelo tamanho (comprimento e peso) do hospedeiro. A correlação entre comprimento dos hospedeiros e abundância de helmintos apresentou resultados significativos para duas espécies (Aplectana meridionalis e Centrorhynchus sp.). A correlação entre comprimento dos hospedeiros e a prevalência de helmintos também apresentou resultados significativos para uma espécie (Aplectana meridionalis). A comunidade parasitária do sapinho-dejardim do município de Imbé, RS, apresenta a segunda maior riqueza parasitária para bufonídeos já registrada no mundo e se caracteriza como uma comunidade parasitária do tipo isolacionista.

O registro fossilífero de anuros mesozóicos é raro na maioria das bacias sedimentares do mundo. Na América do Sul, esses registros são ainda mais escassos, principalmente no Brasil. Das ocorrências deste grupo nas bacias sedimentares brasileiras, são conhecidos Arariphrynus placidoi Leal e Brito 2006, do Cretáceo Inferior da Bacia do Araripe, e Baurubatrachus pricei Báez e Peri, 1989, Cretáceo Superior da Bacia Bauru. A Bacia Bauru (sensu Fernandes & Coimbra, 1996) teve o início de sua deposição no Cretáceo Superior (Senoniano) e é composta por dois Grupos: Caiuá e Bauru. O clima durante a deposição destes sedimentos era quente e árido/semi-árido, sendo que na porção oriental, o aporte de canais fluviais e uma maior abundância de água, favorecia a presença de elementos da flora e fauna. Na região do Município de Marília, são encontrados sedimentos da Formação Adamantina, Grupo Bauru, Cretáceo Superior da Bacia Bauru. A descoberta de materiais de anuros fósseis nesta região tem demonstrado um potencial fossilífero muito grande em termos de vertebrados, com uma fauna peculiar, no contexto da Bacia Bauru. Neste trabalho os materiais de anuros encontrados nos arredores do Município de Marília são descritos. Para testar suas relações com os demais grupos de anuros atuais uma análise filogenética seguindo os princípios da metodologia cladística foi aplicada. Uma matriz de 45 táxons pertencentes a gêneros atuais de diferentes famílias de Anura e 86 caracteres osteológicos foi analisada, resultando em uma única árvore mais parcimoniosa de 582 passos, índice de consistência (CI) de 0,239, índice de retenção (RI) de 0,435. Como resultado da análise da matriz de caracteres os táxons atuais, embora bem definidos no cladograma, apresentam incongruências com as filogenias morfológicas e moleculares propostas até o momento. Isso ocorre provavelmente devido à falta de uma amostragem mais representativa dos grupos e de caracteres não osteológicos que sustentam alguns clados. Contudo, os conjuntos de caracteres levantados para cada um dos táxons estudados podem ser utilizados em análises comparativas e de identificação osteológica. No resultado da análise, o anuro fóssil aparece incluso em um clado composto essencialmente por “leptodactilídeos”. Suas relações com os Eleutherodactylinae (Brachycephalidae sensu Frost et al., 2006) também é reforçada devido ao seu posicionamento próximo a representantes deste grupo. Dessa forma, o anuro fóssil de Marília representa hoje o espécime mais bem preservado entre os leptodactilídeos fósseis da América do Sul, sendo o primeiro fóssil de anuro cretáceo formalmente descrito para o estado de São Paulo e o registro mais antigo de anuro da Bacia Bauru (± 83 a 70 m.a.a.). A presença de um registro mais antigo de Leptodactylidae em sedimentos Cretáceos na América do Sul reforça a hipótese da origem deste grupo neste continente. / The fossil record of mesozoic anurans is rare in most sedimentary basins worldwide. In South America, these records are even more scarce, particularly in Brazil. Among the findings of this group in Brazilian basins, there are records of Arariphrynus placidoi (Leal and Brito 2006), from the Lower Cretaceous of the Araripe Basin and Baurubatrachus pricei Báez and Peri, 1989, Upper Cretaceous of the Bauru Basin. The Bauru Basin (sensu Fernandes & Coimbra, 1996) deposit began in the Upper Cretaceous (Senonian) and is composed of two Groups: Caiuá and Bauru. The climate during the deposit of these sediments was hot and arid/semi-arid. Moreover, in the eastern areas, the intrusion of streams and rivers and a greater abundance of water favored the presence of fauna and flora. In the area of the municipality of Marília, are found sediments from the Adamantina Formation, Bauru Group, Upper Cretaceous of the Bauru Basin. The finding of anuran fossil material in this region has demonstrated a great potential for fossils regarding vertebrates, with a peculiar fauna within the Bauru Basin context. In this study, the anuran material found in the nearby areas of the municipality of Marilia is described. To test its relations with the other groups of modern anurans, a phylogenetic analysis according to the principles of the cladistic methodology was applied. A matrix of 45 taxa of modern genus of different families of Anura and 86 osteological characters was analyzed. This resulted in a single, more parsimonious tree with 582 steps, consistency index (CI) 0,239, and a retention index (RI) 0,435. As a result of the analysis of the characters matrix, the modern taxa, although well defined in the cladogram, present inconsistencies with the morphological and molecular phylogenies proposed to date. This most likely occurs due to the lack of a more significant number of samples and of non-osteological characters which support some clades. However, the groups of characters found for each of the taxons studied can be used in comparative analyses and osteological identification. In the result of the analysis, the anuran fossil appears within the clades “leptodactilids”. Its relations with Eleutherodactylinae (Brachycephalidae sensu Frost et al., 2006) are also reinforced due to its position near representatives of this group. Thus, the anuran fossil from Marília currently represents the most well preserved specimen among the leptodactilid fossils from South America. Moreover, it is the first fossil of cretaceous anuran formally described for the State of São Paulo and the oldest anuran from the Bauru Basin (± 83 to 70 m.y.a.). The presence of an older record of Leptodactylidae in Cretaceous sediment in South America reinforces the hypothesis of this groups origin on this continent.

Nesta tese de doutorado foram investigados parâmetros imunológicos de 3 espécies de anuros ao longo de diferentes estágios de história de vida, bem como a relação dos níveis plasmáticos de hormônios esteroides com as variáveis imunológicas (Capítulo 1). O capítulo 2 aborda os ajustes sazonais de reguladores metabólicos em diferentes músculos relacionados a reprodução e locomoção no período reprodutivo e de seca em três espécies de anuros. O capítulo 3 aborda a relação causal entre o aumento dos níveis plasmáticos de hormônios esteroides e a imunomodulação da resposta inflamatória e da resposta mediada por proteínas do sistema complemento na espécie R. jimi. Adicionalmente, foram investigados possíveis ajustes anuais do custo energético da resposta inflamatória, da taxa metabólica padrão, e a relação dessas variáveis com os níveis plasmáticos de hormônios esteroides na espécie R. jimi (Capítulo 4). O conjunto de dados dos capítulos 1 e 4 apontam na direção contrária da hipótese de imunossupressão durante a temporada reprodutiva, altos níveis de hormônios esteroides (testosterona e corticosterona) aumentam os paramêtros imunitários, bem como a resposta imune. Os resultados apresentados no capítulo 3 corroboram os efeitos imunomodulatórios do tratamento agudo de testosterona e corticosterona em anfíbios anuros. Por fim, o capítulo 2 mostra a variação sazonal de expressão de proteínas que agem como reguladores metabólicos. Essas reguladores, mediam a manutenção de células e tecidos durante a seca, fazendo com que os músculos associados a reprodução e locomoção não degradem durante este período. Adicionamente, a espécie estivadora ativa vias que diminuem o consumo de ATP, fazendo que com que haja economia de reservas energéticas durante a estivação / We investigated the correlation between imunological parameters, steroid plasma levels in 3 anuran species during different life history stages (Chapter1). Chapter 2 explore the seasonal adjusments of metabolic regulators for 3 anuran species. In the 3th chapter, we studied the casual relationship between increase of steroid plasma levels and immunomodulation in males of Rhinella jimi. Additionally, w e investigated the metabolic cost of the immune response, standard metabolic rate, and steroid plasma levels of R. jimi (Chapter 4). Our results point to an opposite direction of the immunocompetence handicap hypothesis (Chapter 1 and 4), high steroid plasma levels are associated to higher immune response. The results found in the chapter 3 corroborates the immunomodulatory effects of testosterone and corticosterone. Chapter 2 shows the seasonal variation of metabolic regulators, which guarantee muscle and cellular maintenance during the dry period for all three species. The aestivating species activates pathways that shut down ATP consumption saving energy during the drought

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Orientador: Patricia Pasquali Parise Maltempi / Coorientador: Célio Fernando Baptista Haddad / Banca: Luciana Bolsoni Lourenço / Banca: Mateus Mondin / Banca: Ana Paula Zampieri Silva de Petri / Banca: Carla Santana Cassini / Resumo: O gênero Leptodactylus compreende, atualmente, 74 espécies distribuídas na Região Neotropical, das quais 57 foram relatadas no Brasil. Fatores como a alta similaridade morfológica, bem como a carência de dados diversificados de diferentes populações, refletem no status taxonômico confuso para alguns dos representantes do gênero. Avanços nessa questão foram obtidos através do aumento de estudos, principalmente aqueles envolvendo comparação de dados moleculares mas, muitas vezes, não foram analisados espécimes coletados em localidade tipo, fundamental para a avaliação da real diversidade de espécies, considerada subestimada para os anfíbios anuros em geral. Além da importância da citogenética em diferentes aspectos referentes à organização genômica, bem como na identificação de sistemas de determinação cromossômica do sexo, diferentes dados citogenéticos têm se mostrado uma importante ferramenta para o estudo de anuros, permitindo, pela comparação das variações cromossômicas, a identificação de espécies crípticas, principalmente quando aliados a informações moleculares, zoológicas e ecológicas. Entre os objetivos do presente trabalho destacam-se a busca por variações cariotípicas que auxiliem na elucidação de problemas de taxonomia e sistemática no gênero Leptodactylus, pelo emprego de técnicas de citogenética clássica e molecular, bem como a obtenção de sondas cromossomo-específicas para procedimentos de pintura cromossômica em anfíbios anuros. Entre os resultados obtidos, são destacados: a identificação de um extraordinário sistema cromossômico de determinação do sexo em L. pentadactylus (X1X2X3X4X5X6:Y1Y2Y3Y4Y5Y6), considerado o maior já relatado para vertebrados; a revisão citogenética e molecular de espécimes do grupo de L. melanonotus, o qual apresenta complexo de espécies pendente de resolução. Os dados obtidos indicam a revalidação das espécies L. brevipes e L.... / Abstract: The genus Leptodactylus currently has 74 recognized species in the Neotropical Region, of which 57 were reported in Brazil. Factors such as high morphological similarity, as well as the lack of diverse data from different populations, result in the confusing taxonomic status of some species in the genus. Advances in this matter were obtained by increasing studies involving mainly comparison of molecular data, but often are not examined specimens collected in the type localities, fundamental for assessing the real diversity of species, considered underestimated for amphibians in general. Besides the importance of cytogenetics in describing the genomic organization, such as the presence of chromosomal sex determination systems, different cytogenetic data has been an important tool for studying frogs, allowing comparison of chromosomal variations, inferring / identifying through these the suggestion of taxa, especially when combined with zoological and ecological information. Here we studied cytogenetically species currently in the genus Leptodactylus. Among the results are outstanding: the identification of an extraordinary chromosome system of sex determining in L. pentadactylus (X1X2X3X4X5X6: Y1Y2Y3Y4Y5Y6), considered the highest reported for vertebrates; Cytogenetic and molecular review of specimens in the Leptodactylus melanonotus group, which are in a complex of species pending resolution. With our data, it was possible revalidate the species L. brevipes and L. intermedius as they were in synonymy with L. petersii. Additionally we showed the first construction of DNA probes from whole chromosomes of amphibian, obtained by flow cytometry from Xenopus tropicalis, a model organism for genetic and developmental studies, and the possibility of application in the studies on chromosome evolution of other species of frogs, even those phylogenetically ... / Doutor

Submitted by Gizele Lima (gizele.lima@inpa.gov.br) on 2017-08-11T13:33:19Z No. of bitstreams: 2 Dissertação de Mestrado - Lucas Ferrante.pdf: 1606203 bytes, checksum: 620bbdcdee327fb01bd898acef0659e2 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-11T13:33:19Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação de Mestrado - Lucas Ferrante.pdf: 1606203 bytes, checksum: 620bbdcdee327fb01bd898acef0659e2 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-03-03 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The planet is undergoing an unprecedented loss of biodiversity, so much so that it is considered the sixth mass extinction event. The most drivers of species decline are habitat loss and fragmentation, affecting all natural ecosystems, especially tropical forests. Amphibians are particularly sensitive to fragmentation and habitat loss and many species are strict forest inhabitants. We evaluated 22 fragments of Atlantic Forest in southeastern Brazil, between 5 and 1570 hectares, in order to evaluate the potential of small fragments to be useful for the conservation of anurans and to determine if this group of animals has also vanished from larger areas, implying in the defaunation of forest fragments. For each fragment, we sample the number of individuals, species richness and composition in anuran assemblages in relation to the area, habitat heterogeneity and vegetation quality. The structure of the anurans composition in assemblages and guilds was tested in relation to the gradients of heterogeneity, vegetation quality and size of forest fragments, searching for patterns of species loss (nested) or to species substitutions (turnover). We not observed relation between the variables of the fragments with individuals number or structuring patterns for the species considering all anurans in the assemblages. However, when we analyzed separately in guilds, considering restricted forest species and species with high scatterability in the landscape, the effects on the structure of the assemblages were different. Our data indicate that the individuals number in the assemblages or guilds was not affected by the area, heterogeneity or quality of the habitat, suggesting that in each fragment there are resources to support the same individuals number. The all species in the assemblage and the strictly forest guild showed a decrease in number of species associated only with the habitat quality variable. The species composition in both guilds presented different patterns of structuration. The strictly forested guild presented a nested pattern in relation to vegetation quality, habitat heterogeneity and area of the fragments, while the dispersers guild presented a turnover pattern only in relation to habitat quality. We conclude that restricted forest species depend on a greater set of factors to maintain their populations in forest fragments, such as the fragment area, quality and heterogeneity of habitat. We considered, that the presence of species with wide displacement in the landscape is defined by the fragment quality. In this scenario, many small fragments supported a relatively high number of restricted forest species when compared to larger fragments, but with a greater degree of degradation, demonstrating the importance of these fragments have for the conservation of many species. In addition, some fragments presented total defaunation of strictly forest species and in some cases for all anurans assemblage, becoming empty fragments. / O planeta está passando por uma perda de biodiversidade sem precedentes, tanto que é considerado como o sexto evento de extinção em massa. Os maiores condutores para este declínio de espécies são a perda e a fragmentação de habitat, que vem afetando todos os ecossistemas naturais, especialmente as florestas tropicais. Os anfíbios são particularmente sensíveis à fragmentação e perda de habitat e muitas espécies são restritamente florestais. Nós avaliamos 22 fragmentos de Mata Atlântica no sudeste do Brasil, entre 5 e 1570 hectares, com a finalidade de avaliar o potencial de pequenos fragmentos serem uteis para a conservação de anuros e determinar se este grupo de animais também tem desaparecido de áreas maiores, implicando na defaunação de fragmentos florestais. Para cada fragmento foram amostrados o número de indivíduos, riqueza e composição de espécies nas assembleias de anuros em relação a área, heterogeneidade de habitat e qualidade da vegetação. A estruturação da composição de anuros nas assembleias e guildas foi testada em relação aos gradientes de heterogeneidade, qualidade da vegetação e tamanho dos fragmentos florestais, buscando padrões de perda de espécies (aninhamento) ou substituições de espécies (turnover). Não foram observadas relações entre as variáveis dos fragmentos com o número de indivíduos ou padrões de estruturação para as espécies considerando toda a assembleia de anuros. Entretanto, quando analisamos separadamente em guildas, considerando espécies restritamente florestais e espécies com alta capacidade de dispersão na paisagem, os efeitos sobre a estrutura das assembleias foram distintos. Nossos dados indicam que o número de indivíduos na assembleia ou guildas não foi afetado pela área, heterogeneidade ou qualidade do habitat, sugerindo que em cada fragmento existem recursos para suportar um mesmo número de indivíduos. A assembleia considerando todas as espécies e a guilda restritamente florestal apresentou uma diminuição do número de espécies e essa foi associada apenas a variável qualidade do habitat. A composição de espécies em ambas as guildas, apresentaram padrões de estruturação diferenciados. A guilda restritamente florestal apresentou um padrão de aninhamento em relação qualidade da vegetação, heterogeneidade de habitat e área dos fragmentos, em quanto que a guilda vágil apresentou um padrão de “turnover” apenas em relação a qualidade do habitat. Concluímos que espécies restritamente florestais dependem de um maior conjunto de fatores para manutenção de suas populações em fragmentos florestais, como a área do fragmento, qualidade e heterogeneidade do habitat. Enquanto, a presença de espécies com amplo deslocamento na paisagem é definida pela qualidade do fragmento. Neste cenário, muitos fragmentos pequenos suportaram um número relativamente alto de espécies restritamente florestais quando comparados a fragmentos maiores, mas com maior grau de degradação, demostrando a importância que estes fragmentos têm para a conservação de muitas espécies. Além disso, alguns fragmentos apresentaram defaunação total de espécies restritamente florestais e em alguns casos até mesmo de toda a assembleia de anuros, se tornado fragmentos vazios.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:55Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-14Bitstream added on 2014-06-13T19:40:29Z : No. of bitstreams: 1 gruber_sl_dr_rcla_parcial.pdf: 155184 bytes, checksum: df5017c0c5ab7c0586283ad815f95539 (MD5) Bitstreams deleted on 2015-07-02T12:36:06Z: gruber_sl_dr_rcla_parcial.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2015-07-02T12:37:30Z : No. of bitstreams: 1 000713629_20180214.pdf: 142653 bytes, checksum: 303de0bbf7c0cc98840a1feafcac3291 (MD5) Bitstreams deleted on 2018-02-16T12:28:24Z: 000713629_20180214.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2018-02-16T12:29:08Z : No. of bitstreams: 1 000713629.pdf: 1305461 bytes, checksum: fc93fa24bfaab78fbbbdb8eb677acfba (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A classe Amphibia, especialmente a família Hylidae, passou por extensas modificações na taxonomia e sistemática, realizadas com base, principalmente, em dados moleculares, mas quase nenhuma contribuição das informações citogenéticas. Os hilídeos são os anuros mais abundantes em número de espécies, porém, a maioria delas foi sequer cariotipada e grande parte das informações disponíveis na literatura está restrita apenas ao número e morfologia dos cromossomos. No presente trabalho, foram cariotipadas 28 espécies da subfamília Hylinae, sendo da tribo Cophomantini Aplastodiscus arildae, A. callipygius, A. eugenioi, A. leucopygius, A. perviridis, Hypsiboas aff. polytaenius, Hypsiboas sp. aff. albopunctatus, H. albomarginatus, H. albopunctatus, H. bakeri, H. caingua, H. caipora, H. crepitans, H. faber, H. latistriatus, H. lundii, H. pardalis, H. polytaenius, H. prasinus, H. raniceps e H. semilineatus; da tribo Lophiohylini, as espécies Aparasphenodon bokermanni, Itapotihyla langsdorffii, Phyllodytes edelmoi, P. luteolus, Trachycephalus sp., T. mesophaeus e T. typhonius; e da subfamília Phyllomedusinae, duas espécies, Phyllomedusa distincta e P. tetraploidea, bem como seus híbridos triploides. A maioria das espécies da subfamília Hylinae compartilha cariótipo 2n=24, FN=48, bandas C majoritariamente centroméricas e RON em cromossomos pequenos do par 11 em Cophomantini e do par 10 em Lophiohylini. As exceções são as do gênero Phyllodytes, da tribo Lophyohylini, cujas espécies têm 2n=22, FN=44 e RON no par 2, e as do gênero Aplastodiscus, da tribo Cophomantini, cujas espécies têm diferentes números cromossômicos de 2n=24, 2n=22, 2n=20 e 2n=18, mas compartilham o mesmo padrão de bandamento C e o mesmo par marcador de RON. As bandas de replicação por incorporação de BrdU... / The Amphibia class, especially the family Hylidae, went through extensive changes in taxonomy and systematics, based mainly on molecular data, but with almost no contribution of cytogenetic information. This family is the most speciose among the anurans, however, the great majority of the species was never karyotyped, and most of the cytogenetic information on hylids available in the literature is restricted to the number and morphology of the chromosomes. In the present work we karyotyped 28 representatives of the subfamily Hylinae, belonging to the tribe Cophomantini the species Aplastodiscus arildae, A. callipygius, A. eugenioi, A. leucopygius, A. perviridis, Hypsiboas aff. polytaenius, Hypsiboas sp. aff. albopunctatus, H. albomarginatus, H. albopunctatus, H. bakeri, H. caingua, H. caipora, H. crepitans, H. faber, H. latistriatus, H. lundii, H. pardalis, H. polytaenius, H. prasinus, H. raniceps e H. semilineatus; to the tribe Lophiohylini the species Aparasphenodon bokermanni, Itapotihyla langsdorffii, Phyllodytes edelmoi, P. luteolus, Trachycephalus sp., T. mesophaeus e T. typhonius; and two species of the subfamily Phyllomedusinae, Phyllomedusa distincta and P. tetraploidea, as well as their triploid hybrids. Most species of the subfamily Hylinae share the same karyotype with 2n=24, FN=48, C bands with predominantly centromeric distribution, and NOR located on small chromosomes belonging to the pair 11 in Cophomantini and to the pair 10 in Lophiohylini. The exceptions are the genus Phyllodytes, from the tribe Lophyohylini, whose species have 2n=22, FN=44 and NOR in the pair 2, and the genus Aplastodiscus, from the tribe Cophomantini, whose species have different chromosome numbers of 2n=24, 2n=22, 2n=20, Abstract and 2n=18, but sharing the same C-banding pattern and the same pair of NOR marker... (Complete abstract click electronic access below)

Orientador: Célio Fernando Baptista Haddad / Banca: Cynthia Peralta de Almeida Prado / Banca: José Perez Pombal Junior / Resumo: Este estudo se refere a uma nova espécie de anfíbio anuro do gênero Hypsiboas, pertencente à família Hylidae, que habita as florestas pluviais no alto da Serra de Paranapiacaba, no sul do estado de São Paulo. No primeiro capítulo descrevemos taxanomicamente a espécie. Este capítulo é apresentado em língua inglesa na formatação do periódico Copeia, no qual o manuscrito foi recentemente aceito. Adotamos para a nova espécie o nome provisório KAAPORA (kaa = mato + pora = morador), uma vez que a espécie ainda não está formalmente descrita. Pertencente ao grupo de Hypsiboas pulchellus, a espécie nova compõe um clado com H. semiguttatus, H. joaquini e uma outra nova espécie de Hypsiboas da Argentina e do sul do Brasil, das quais pode ser distinguida principalmente pelo seu canto. O segundo capítulo retrata sua história natural a partir de estudos de campo realizados mensalmente, entre dezembro de 2003 a maio de 2006. A reprodução é contínua (anual). Os machos de Hypsiboas KAAPORA vocalizam a noite e o ano todo, empoleirados na vegetação marginal herbácea-arbustiva, ao longo de riachos no interior da floresta. A razão sexual operacional no riacho é largamente voltada para os machos, o que deve refletir diretamente na aquisição de acasalamentos pelos mesmos. As fêmeas visitam o riacho somente quando estão aptas à reprodução, retornando à mata logo após a oviposição. A desova é depositada no riacho, onde os girinos crescem lentamente. A fase final da metamorfose é sincronizada e ocorre nos meses mais quentes do ano (dezembro e janeiro). O recrutamento de machos adultos no sítio reprodutivo se inicia em fevereiro e perdura o ano todo e as diferenças temporais no recrutamento parecem refletir estratégias reprodutivas distintas. A população de machos adultos pode ser constituída por indivíduos... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: We studied a new species of amphibian anuran of the genus Hypsiboas, family Hylidae, which inhabits the Atlantic Forest from highlands at Serra de Paranapiacaba, São Paulo State, Brazil. In chapter one we describe taxonomically the new species. This chapter was written in English and accepted in the scientific journal Copeia. We used the provisory name KAAPORA (kaa = forest + pora = inhabitant) because the new species is not formally described. Pertaining to the Hypsiboas pulchellus species group, the new species is included in a clade with Hypsiboas semiguttatus, its sister species, Hypsiboas joaquini, and other new species of Hypsiboas from Argentina. Hypsiboas KAAPORA differs from these species mainly by its advertisement call. Chapter two is about the natural history of the new species. It was carried out in a monthly field study, from December 2003 to May 2006. Adult males were registered calling in all months along the year. They call at night from the marginal vegetation of streams inside the forest. Continuous reproduction occurs throughout the year. The operational sexual ratio was largely biased to males in the reproductive site, probably with direct effects on acquisition of females. Females moved to stream only in reproductive events. The egg-mass was deposited in the stream, where the tadpoles develop slowly. The end of the metamorphosis occurs synchronically in the wetter months (December and January). Recruitment of adult males at the reproductive site started in February and continued along the year. Temporal differences in recruitment seem related to distinct reproductive strategies. The population of adult males may include individuals from at least two different generations. Social communication in adults, besides the vocalizations, involves visual signaling in close range interactions, probably to facilitate the localization and... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Submitted by Franciele Moreira (francielemoreyra@gmail.com) on 2018-04-16T17:42:56Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Andrezza Arantes Castro - 2018.pdf: 2625041 bytes, checksum: 5c588cc8e4644fe3bfa34ba8e1dd05a9 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-04-17T10:54:33Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Andrezza Arantes Castro - 2018.pdf: 2625041 bytes, checksum: 5c588cc8e4644fe3bfa34ba8e1dd05a9 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-17T10:54:33Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Andrezza Arantes Castro - 2018.pdf: 2625041 bytes, checksum: 5c588cc8e4644fe3bfa34ba8e1dd05a9 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2018-03-12 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / The ease access to Next Generation Sequence methodologies has improved the development of several projects, once it makes possible the de novo assembly of DNA sequences, creating a great amount of data and giving access to unknown genomes of different organisms. The anuran species Ololygon centralis belong to Hylidae family. It is considered as endemic of Cerrado Biome and little is known about its genomics. The aim of this work was to realize a draft of the genome of O. centralis in order to identify, to characterize, to quantify repetitive elements and to predict possible genes. Also, we aimed to develop microsatellite markers for the species. The genome draft assembled in 13989 scaffolds, which correspond to 4926069 bp with N50 = 336. The repetitive elements found in the O. centralis genome (1795 transposons, 957, microsatellite, one satellite DNA and 25 small nuclear RNAs) comprised 531337 bp. Between the retrotransposons, the LINE element (49,83%) was the most abundant, followed by LTR (48,66%) and SINE (1,56%). It was possible to identify coding genes for the 5S, 18S and 28S subunits of ribosomes. Also, 18 types of coding regions for tRNA and 26 putative genes were found in the O. centralis genome. From the microsatellite regions, it was possible to design 87 pairs of primers for the flanking sites. There were found 47 regions composed of tetranucleotides, 39 dinucleotides and on trinucleotide on the microsatellite sites. From them, 31 pairs of primers were selected for amplification and 18 showed good results. The annealing temperatures varied from 50° e 60° C. Seven markers showed polymorphism. From them, only 5 markers (PCE05, OCE11, PCE20, OCE21, OCE26) were used to characterize the genotype of 30 individuals. The medium number of alleles was 10, the allelic amplitude varied from 148 bp (OCE20) to 318 bp (OCE21). The Expected Heterozygosity was 0,7 and the observed was 0,5. The probability of parentage exclusion (Q) was 0,993 and the probability of combined identity (I) was 1,13x10-6. The global value of the fixation index (FST) was significant and equal to 0,2 (p<0.05). The data obtained from the NGS Illumina platform represent one important step for the knowledge of genomics of this species and of the anuran in general. / A facilidade para o acesso às metodologias de Sequenciamento de Segunda Geração (Next Generation Sequence) tem impulsionado o desenvolvimento de diversos projetos, uma vez que possibilita a montagem de novo de sequências, gerando uma grande quantidade de dados e permitindo o acesso a genomas de diversos organismos ainda pouco conhecidos. A espécie de anuro Ololygon centralis (Pombal e Bastos 1996) pertence à família Hylidae, considerada endêmica do Bioma Cerrado e que ainda não dispõe de nenhuma informação genômica. O objetivo desse trabalho foi realizar uma montagem parcial do genoma de Ololygon centralis a fim de identificar, caracterizar, quantificar elementos repetitivos e predizer genes nas sequências genômicas, além de desenvolver marcadores microssatélites para a espécie. O genoma parcial montado resultou em 13.989 scaffolds, que correspondem a 4.926.069 pb com N50 de 336. Os elementos repetitivos encontrados no genoma de O. centralis (1.795 elementos transponíveis, 957 microssatélites, um DNA satélite e 25 pequenos RNAs nucleares) totalizaram 531.337 pb. Entre os retrotransposons, o elemento LINE (49,83%) foi o mais abundante, seguido do LTR (48,66%) e SINE (1,56%). Foram identificados os genes que codificam as subunidades 5S, 18S e 28S de ribossomos, 18 tipos de tRNAs no genoma e 26 genes. A partir das sequências foi possível desenhar 87 pares de primers flanqueando regiões microssatélites. Dentre elas, 47 foram regiões compostas de tetranucleotídeos, 39 dinucleotídeos, e um trinucleotídeo. Deste total, 31 pares de primers foram selecionados para padronização em gel de poliacrilamida (6%) e 18 deles apresentaram produto de amplificação adequado. Durante a padronização, as temperaturas de anelamento variaram entre 50° e 60° C e sete marcadores apresentaram polimorfismo. Dos sete, apenas cinco marcadores (OCE05, OCE11, OCE20, OCE21, OCE26) foram padronizados e utilizados para caracterização em 30 indivíduos de O. centralis no analisador automático ABI3500. O número médio de alelos foi igual a 10, a amplitude alélica variou entre 148pb (OCE 20) a 318 pb (OCE 21). A Heterozigosidade média esperada foi 0,7 e a observada igual a 0,5. A probabilidade de exclusão de paternidade (Q) foi igual a 0,993 e a probabilidade combinada de identidade (I) igual a 1,13x10-6. O valor global para o índice de fixação (FST) foi significativo e igual a 0,2 (p <0,05). Os dados obtidos a partir do NGS plataforma Illumina representam um importante passo para o conhecimento genômico dessa espécie e dos anfíbios em geral, o desenvolvimento de primers contribuirá para o estudos genéticos-populacionais de Ololygon centralis e espécies correlacionadas por meio da transferibilidade.