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Comunidade bacteriana de uma área do bioma pampa

Vargas, Rafael da Silveira January 2014 (has links)
As pastagens naturais do Bioma Pampa têm sido tipicamente utilizadas em sistemas extensivos de criação de bovinos de corte, com pouco ou nenhum aporte de insumos externos. Em ambientes naturais ou com pouca intervenção antrópica, como os sistemas pastoris tradicionais do Bioma Pampa, a microbiota do solo assume um papel no funcionamento do ecossistema. A presente pesquisa teve como objetivo avaliar o impacto de diferentes pressões de pastejo sobre a atividade microbiana e a diversidade de bactérias do solo. Foi avaliado um experimento de longa duração, localizado em Eldorado do Sul, Brasil, avaliando-se três níveis de pressão de pastejo: alta pressão de pastejo (HP), com 4% de oferta de forragem (OF); pressão de pastejo moderada (MP), com 12% de OF e baixa pressão de pastejo (LP), com 16% de OF. Foram avaliadas ainda duas áreas de referência, sendo uma área de vegetação nativa nunca pastejada (NG) e outra de vegetação regenerada após dois anos de pastejo (RG). As amostras de solo foram avaliadas quanto à biomassa microbiana, atividades de β-glucosidase, arilsulfatase e urease, adotados como indicadores bioquímicos de qualidade do solo. Avaliou-se ainda a estrutura da comunidade bacteriana e da população de bactérias diazotróficas por meio de RFLP dos genes 16S rRNA e o nifH, respectivamente. A diversidade de bactérias diazotróficas foi avaliada por meio de sequenciamento parcial do gene 16S rRNA. A presença de animais em pastejo favoreceu a comunidade microbiana do solo, de modo que a média geométrica geral dos atributos bioquímicos foi significativamente maior nos tratamentos com maior intensidade de pastejo, MP e HP. As estruturas da comunidade bacteriana e das populações de diazotróficos foram alteradas pelos diferentes manejos da pastagem, observando-se uma maior diversidade de bactérias diazotróficas culturáveis no tratamento LP. Considerando-se o conjunto das características bioquímicas e microbiológicas avaliadas no presente trabalho e o histórico da área, a adoção do tratamento MP parece o mais adequado visando à produção animal e à conservação do Bioma Pampa. / The grasslands of the Pampa biome have been typically used in extensive breeding systems of beef cattle, with little or no contribution of external inputs. In natural environments or with little human intervention, such as traditional grazing systems of the Pampa biome, the soil microbiota plays a role in the ecosystem functioning. This study aimed to evaluate the impact of different grazing pressures on the activity and diversity of soil bacteria. We performed one long-term experiment in Eldorado do Sul, Brazil, which assessed three levels of grazing pressure: high grazing pressure (HP), with 4% herbage allowance (HA); moderate grazing pressure (MP), with 12% HA; and low grazing pressure (LP), with 16% HA. Two reference areas were also assessed, an area of never-grazed native vegetation (NG) and an area of regenerated vegetation after two years of grazing (RG). Soil samples were evaluated for microbial biomass; β-glucosidase, arylsulfatase and urease activities; and biochemical indicators of soil quality. The structure of the bacterial community and the population of diazotrophic bacteria were also evaluated by RFLP of the 16S rRNA and nifH genes, respectively. The diversity of diazotrophic bacteria was assessed by partial sequencing of the 16S rRNA gene. The presence of grazing animals favored the soil microbial community, and consequently, the overall geometric mean of the biochemical characteristics was significantly higher in MP and HP. The structures of the bacterial community and the populations of diazotrophic bacteria were changed by the different grazing managements, with a greater diversity of culturable diazotrophic bacteria observed in the LP treatment. Considering all the biochemical and microbiological characteristics evaluated in this study and the history of the area, adoption of the MP treatment seems the most appropriate for animal production and conservation of the Pampa biome.
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Filogenia e perfil plasmidial de bactérias aeróbias formadoras de endósporos isoladas de solo

Orem, Juliana Capella de 05 April 2014 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Microbiana, 2014. / Submitted by Larissa Stefane Vieira Rodrigues (larissarodrigues@bce.unb.br) on 2014-11-18T14:54:16Z No. of bitstreams: 1 2014_JulianaCapellaDeOrem.pdf: 1268500 bytes, checksum: 6af9f521d386911ca6747d4af1af37d7 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2014-11-25T17:10:39Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_JulianaCapellaDeOrem.pdf: 1268500 bytes, checksum: 6af9f521d386911ca6747d4af1af37d7 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-11-25T17:10:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_JulianaCapellaDeOrem.pdf: 1268500 bytes, checksum: 6af9f521d386911ca6747d4af1af37d7 (MD5) / A endoesporulação constitui uma estratégia bacteriana de sobrevivência extremamente eficiente. Bactérias aeróbias formadoras de endósporo (Bafes) são isoladas dos mais diversos ambientes e acredita-se que essas tenham papel fundamental na ecologia destes sítios. As Bafes estão distribuídas em mais de 25 famílias e 200 gêneros dentro do filo Firmicutes que abriga bactérias em maioria Gram positivas, com baixo conteúdo G+C e parede celular muito rígida. A formação de endósporos é a característica mais marcante do filo, porém nem todas as linhagens possuem habilidade de esporular. As Bafes apresentam grande potencial biotecnológico e sua importância abrange diversas áreas como, por exemplo, médica, agrícola, ecológica e de biodefesa. Apesar da importância, as Bafes, coletivamente, são pouco estudadas. O conhecimento que existe hoje sobre esses microrganismos é extrapolado a partir do estudo de espécies individuais, notadamente o Bacillus subtilis e B. cereus e espécies relacionadas. Neste trabalho, foi avaliada a diversidade de Bafes isoladas de solo do Distrito Federal, por meio de filogenia baseada na comparação de sequências de genes rRNA 16S e do perfil plasmidial. O trabalho foi realizado com 45 linhagens denominadas SDF que fazem parte do acervo da coleção CBafes do Laboratório de Microbiologia/ LaBafes da UnB. Os dados obtidos durante a realização deste trabalho indicam uma grande diversidade entre as linhagens ambientais. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The endosporulation process is an extremely efficient strategy for bacterial survival. Aerobic endospore forming bacteria are isolated from the most diverse environments and it is likely that they play a major role in the ecology of those sites. These bacteria are allocated in more than 25 families and 200 genera within the Phylum Firmicutes. Most of the bacteria allocated in this Phylum stain Gram positive, have low G+C content and a very thick cell wall. The endosporulation is the main feature of the Phylum, but the ability to form spores is not present in all lineages. The aerobic endospore forming bacteria have great biotechnological potential and are of great importance to medical, agricultural, ecological and biodefense fields. Despite of their importance, there is little investigation on aerobic endospore forming bacteria. The present knowledge about them is extrapolated from studies on individual species, like Bacillus subtilis, B. cereus and related species. In this work it was assessed the diversity of aerobic endospore forming bacteria, isolated from Distrito Federal soil, by phylogeny based on comparison of 16S rRNA genes sequences and also by plasmid pattern. This study was performed with 45 lineages called SDF that belong to the collection of the Microbiology Laboratory/LaBafes of UnB. The data obtained in this work indicate a great diversity among the environmental lineages.
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Ultraestrutura e termorresistência de esporos e identificação de proteínas de bactérias aeróbias de solo do Distrito Federal

Cavalcante, Danilo de Andrade 10 April 2014 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Programa de Pós-Graduação em Biologia Microbiana, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, Pós-Graduação em Biologia Microbiana, 2014. / Submitted by Cristiane Mendes (mcristianem@gmail.com) on 2014-11-20T18:58:01Z No. of bitstreams: 1 2014_DaniloDeAndradeCavalcante.pdf: 5572777 bytes, checksum: 480a0fa7c84d6ddba2d4bad240ad23a5 (MD5) / Approved for entry into archive by Patrícia Nunes da Silva(patricia@bce.unb.br) on 2014-11-21T13:59:00Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_DaniloDeAndradeCavalcante.pdf: 5572777 bytes, checksum: 480a0fa7c84d6ddba2d4bad240ad23a5 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-11-21T13:59:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_DaniloDeAndradeCavalcante.pdf: 5572777 bytes, checksum: 480a0fa7c84d6ddba2d4bad240ad23a5 (MD5) / O solo é considerado o maior reservatório de bactérias aeróbias formadoras de endósporos (Bafes). Essas linhagens apresentam importância microbiológica e potencial biotecnológico em diversas áreas como a médica, agrícola, ecológica e de biodefesa. As Bafes estão distribuídas taxonomicamente dentro do filo Firmicutes, que abriga bactérias, em maioria, Gram positivas, com baixo conteúdo G+C e parede celular muito rígida. De um modo geral, o conhecimento atual sobre essas bactérias é limitado as espécies modelo, notadamente, o Bacillus subtilis, em adição aos B. cereus, B. thuringiensis e B. athracis. Estudos clássicos envolvendo esporos bacterianos investigados por microscopia eletrônica de transmissão revelaram a complexa ultraestrutura destas células. Essas características estruturais motivaram investigações para compreender como a estrutura é montada de modo a resultar no dispositivo celular mais resistente conhecido. Esses dados possibilitaram direcionar estudos evolutivos relacionados com as diferenças fenotípicas em um tipo celular supostamente preparado para resistir a estresses ubíquos, tanto de natureza física, quanto química. Durante este trabalho, o número de linhagens ambientais da Coleção de Bafes (CBafes) do Laboratório de Microbiologia/LaBafes da UnB foi ampliada em 125 linhagens e avaliada quanto a diversidade. Os esporos de dezenove linhagens de solo do DF (SDF) e a linhagem de Bacillus spp. FT9, também, parte do acervo, foram caracterizadas quanto à ultraestrutura, por microscopia eletrônica de transmissão e termorresistência, por calor úmido. Biomoléculas, como peptídeos e proteínas, produzidas durante o ciclo celular dessas linhagens também foram identificadas e analisadas quanto ao grau de pureza, por análises espectroscópicas e espectrometria de massa (MALDI-TOF). Os resultados obtidos, embora preliminares, reforçam a diversidade presente nas linhagens da CBafes, não somente dentro de uma visão taxonômica, como também quanto ao potencial de exploração biotecnológica e abertura para várias linhas de pesquisa. / Soil is considered the greatest aerobic endospore-forming bacteria (Aefbs) reservoir. These lineages present microbiological importance and biotechnological potential in diverse fields such as medical, agricultural, ecological and biodefense. Aefbs are widely distributed within the phylum Firmicutes, which houses mainly Gram-positive bacteria, presenting low G+C content, and rigid cell wall. Generally, the current knowledge regarding these species is limited to some model lineages, notably, Bacillus subtilis in addition to B. cereus, B. thuringiensis, and B. anthracis. Classic studies involving bacterial spores investigated by transmission electron microscopy revealed the complex ultrastructure of these cells. These structural characteristics have motivated investigations to understand how this structure is assembled to result in the most resistant living cell ever known. These data impelled evolutionary studies related to phenotypic diversions in a cell type supposed to be prepared to resist to both physical and chemical ubiquitous stresses. During this work the number of environmental lineages within the Aefbs Collection (CBafes) from the Aefbs Laboratory’ (LaBafes UnB) was increased by 125 lineages and assayed for diversity. Spores from nineteen selected DF soil lineages (SDFs) and the Bacillus spp. lineage FT9 were further investigated regarding ultrastructure, by transmission electron microscopy and thermoresistance, by wet-heat. Biomolecules such as peptides and proteins produced during SDFs cell cycles were also identified and inspected concerning the degree of purity, by spectroscopy analysis and mass spectrometry (MALDI-TOF). Though preliminary, these results enhance the knowledge on the diversity presented by the SDF lineages both from a taxonomic view and regarding the biotechnological potential. Taken together these data represent a whole new research line in the spore-forming biology.
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Isolamento e análise de resistência a antimicrobianos de cepas de Campylobacter jejuni em amostras de carne de aves resfriadas comercializadas no Distrito Federal

Moura, Helenira Melo de 23 February 2010 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, 2010. / Submitted by Fernanda Weschenfelder (nandaweschenfelder@gmail.com) on 2010-11-16T17:19:33Z No. of bitstreams: 1 2010_HeleniraMelodeMoura.pdf: 924664 bytes, checksum: f02996cab5cd61a9da1368c299fb07e4 (MD5) / Approved for entry into archive by Daniel Ribeiro(daniel@bce.unb.br) on 2010-11-16T23:42:33Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2010_HeleniraMelodeMoura.pdf: 924664 bytes, checksum: f02996cab5cd61a9da1368c299fb07e4 (MD5) / Made available in DSpace on 2010-11-16T23:42:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2010_HeleniraMelodeMoura.pdf: 924664 bytes, checksum: f02996cab5cd61a9da1368c299fb07e4 (MD5) / A campilobacteriose é uma zoonose que provoca diarréia em humanos, sendo diagnosticado com frequência nos países desenvolvidos e tem como principal agente causal o Campylobacter jejuni. Este microrganismo é comumente veiculado ao homem por alimentos de origem aviária. Várias pesquisas no âmbito internacional tem demonstrado a presença desta bactéria resistente à alguns antimicrobianos, e tendo em vista a escassez de trabalhos na região do Distrito Federal, este trabalho objetivou verificar a ocorrência de C. jejuni em carcaças de aves resfriadas comercializadas no Distrito Federal, bem como avaliar a presença ou não de resistência à antimicrobianos. Das 101 amostras analisadas de carcaças de aves resfriadas, foram isoladas 18 (17,82%) cepas de Campylobacter jejuni, sendo que desse total, as 9 amostras que foram adquiridas em feiras sem inspeção, não apresentaram crescimento de C.jejuni. Um total de 16 cepas de C.jejuni foram submetidas ao teste de susceptibilidade aos antimicrobianos para oito drogas (ácido nalidíxico, estreptomicina, gentamicina, eritromicina, amoxilina, cloranfenicol, ciprofloxacina e tetraciclina). Todas as cepas (100%) foram resistentes para a ciprofloxacina, 93,75% de cepas foram resistentes concomitantemente para as drogas ácido nalidíxico, estreptomicina, tetraciclina e gentamicina, 87,5% de cepas resistentes a amoxilina, 68,75% de cepas resistentes a eritromicina e a menor resistência observada foi de 37,5% para o cloranfenicol. Os resultados observados foram similares à presença de resistência a determinados antimicrobianos, entretanto foram superiores aos observados em trabalhos de outros países no que se refere ao número de cepas resistentes, sendo a presença de 100% à ciprofloxacina, bem como os valores obtidos de 93,75% de cepas resistentes ao ácido nalidíxico. Estes resultados sugerem falhas em algumas fases de processamento deste alimento e um possível problema de saúde pública tendo em vista a alta resistência observada nas cepas isoladas. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The campylobacteriosis is a zoonotic that cause diarrhea in humans, and has been diagnose frequently in developed countries and the causal agent is Campylobacter. This microorganism is transmitted to the man frequently by from chicken meats. Several researches in worldwide have showed the presence of the bacterial resistance to some antibiotics. In Distrito Federal there are few researches about the presence of C. jejuni in foods, for this reason, this work aimed to detect the occurrence of C.jejuni in cooled carcasses of chicken commercialized in Distrito Federal, as well as to detect the presence or not of resistance to antibiotics. The 101 samples analyzed were isolated 18 (17,82%) strains of Campylobacter jejuni. The 9 samples that weren’t acquired in fairs without inspection veterinary services, they weren’t any presence of the strains of C.jejuni. The 16 strains of C.jejuni were submitted to the antimicrobial susceptibility testing (nalidixic acid, streptomycin, gentamicin, erythromycin, amoxicillin, chloramphenicol, ciprofloxacin e tetracycline). All strains (100%) were resistant to the ciprofloxacin, 93,75% of strains were resistant to the drugs nalidixic acid, streptomycin, tetracycline and gentamicin, 87,5% resistant strains to the amoxicillin, 68,75% resistant strains to the erythromycin and 37,5% to the chloramphenicol. The results obtained of 93,75% resistant strains to the nalidixic acid and 37,5% of resistant strains the chloramphenicol. These results suggest that problem in some phases of the processing of this food and is a possible problem of public health because the high resistance observed in the isolated strains.
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Isolamento, identificação e caracterização enzimática de uma bactéria de fonte termal do Cerrado

Rocha, Tiago Benoliel 28 April 2010 (has links)
Dissertação (mestrado)-Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, 2010. / Submitted by Shayane Marques Zica (marquacizh@uol.com.br) on 2011-02-22T17:48:04Z No. of bitstreams: 1 2010_Tiago BenolielRocha.pdf: 1639084 bytes, checksum: b3f6fa5d5ae64ccc7cc41ae94a8b881b (MD5) / Approved for entry into archive by Daniel Ribeiro(daniel@bce.unb.br) on 2011-03-11T01:04:21Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2010_Tiago BenolielRocha.pdf: 1639084 bytes, checksum: b3f6fa5d5ae64ccc7cc41ae94a8b881b (MD5) / Made available in DSpace on 2011-03-11T01:04:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2010_Tiago BenolielRocha.pdf: 1639084 bytes, checksum: b3f6fa5d5ae64ccc7cc41ae94a8b881b (MD5) / Fontes hidrotermais possuem grande diversidade de microrganismos termo resistentes, que são importantes para as indústrias de conversão de biomassa vegetal. A lignocelulose é o componente mais abundante da biomassa, mas é subutilizado pela indisponibilidade de enzimas de baixo custo que realizem a degradação com eficiência. Neste trabalho, treze bactérias foram isoladas da água de duas fontes termais do Parque Nacional de Caldas Novas, GO. Uma foi selecionada para ser identificada e caracterizada enzimaticamente por suportar a maior temperatura de crescimento e deter maior atividade em placa contra carboximetilcelulose (CMC), celulose ultracritalina (UCel) e xilana. Após análises das sequências gênicas do RNA ribossomal 16S e da subunidade β da RNA polimerase, a bactéria selecionada foi classificada no grupo do Bacillus cereus, mas não foi possível a diferenciação entre o B. cereus e o B. thuringinensis, sendo denominada como Bacillus sp. linhagem FT9. Após a classificação, o Bacillus sp. FT9 foi cultivado em CMC, UCel, xilana oat spelts (XOS), xilana birchwood (XBW) e glicose. Para os substratos complexos, a maior taxa de crescimento específico e os mais elevados rendimentos de indução foram encontrados nas culturas induzidas com XOS, sendo observada atividade de xilanase no sobrenadante dessa cultura igual a 0,537 UI/mL a 50 °C e pH 6,0. No sobrenadante da cultura induzida em CMC, foi encontrada atividade de CMCase e FTPase igual a 0,231 UI/mL e 0,111 UI/mL a 70 °C e pH 7,0, respectivamente. Esse é o primeiro relato de atividade xilanolítica e o segundo de atividade celulolítica para linhagens relacionadas filogeneticamente com o grupo do B. cereus. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Microorganisms from hot springs play an important role at the biomass conversion industries. Lignocellulose is the major component of vegetal biomass, however, it is underused because of the unavailability of cost-effective enzymes that perform efficiently its degradation. In this work, thirteen bacteria were isolated from two hot springs located at Caldas Novas National Park, Brazil. One of them was selected for identification and enzymatic description due to the highest grown temperature and the greatest cellulase and xylanase activity that it shown at preliminary assays. When its rDNA 16S and RNA polymerase’s β subunit sequences were analyzed, the chosen strain presented close phylogeny to Bacillus cereus group, although species classification has not been possible through these techniques, it was named Bacillus sp. strain FT9. Then, it was grown on carboxymetylcellulose (CMC), ultracrystalline cellulose (UCel), xylan oat spelts, xylan birchwood and glucose. Considering the complex substrates, the highest rates of specific grown and yields were found at fermentation on XOS, which had 0,537 UI/mL of xylanase activity at 50 °C and pH 6,0. On CMC grown cultures, 0,231 UI/mL of CMCase activity and 0,111 UI/mL of FTPase were detected, both at 70 °C and pH 7,0. That is the first work describing xylanase activity and the second one to describe cellulase activity at Bacillus cereus close related species.
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Avaliação da hematotoxicidade e da genotoxicidade de diferentes esporos-cristais do Bacillus thuringiensis em camundongos Swiss

Mezzomo, Bélin Poletto 29 October 2010 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Medicina, 2010. / Submitted by Matheus Denezine (matheusdenezine@yahoo.com.br) on 2011-06-20T15:39:17Z No. of bitstreams: 1 2010_BelinPolettoMezzomo.pdf: 1043387 bytes, checksum: 342051345079f5037684bd0db915c6b8 (MD5) / Rejected by Daniel Ribeiro(daniel@bce.unb.br), reason: meu caro, ficou faltando o ABSTRACT, favor inserir. Atente-se também para a referência e inserir também o co-orientador. Grato on 2011-06-20T18:57:55Z (GMT) / Submitted by Matheus Denezine (matheusdenezine@yahoo.com.br) on 2011-06-21T13:07:09Z No. of bitstreams: 1 2010_BelinPolettoMezzomo.pdf: 1043387 bytes, checksum: 342051345079f5037684bd0db915c6b8 (MD5) / Approved for entry into archive by Marília Freitas(marilia@bce.unb.br) on 2011-06-21T13:11:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2010_BelinPolettoMezzomo.pdf: 1043387 bytes, checksum: 342051345079f5037684bd0db915c6b8 (MD5) / Made available in DSpace on 2011-06-21T13:11:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2010_BelinPolettoMezzomo.pdf: 1043387 bytes, checksum: 342051345079f5037684bd0db915c6b8 (MD5) / As proteínas inseticidas (ICPs) do Bacillus thuringiensis (Bt) são δ-endotoxinas produzidas sob a forma das inclusões cristalinas geométricas durante a esporulação e designadas como proteínas cristais (Cry). As toxinas Bt conferem a este entomopatógeno propriedades inseticidas, sendo usadas em várias formulações de bioinseticidas rotineiramente empregadas no controle biológico de pragas agrícolas. Inseticidas Bt têm a vantagem de serem muito mais específicos do que os inseticidas químicos sintéticos de amplo espectro, e, portanto, são considerados como agentes de controle de insetos favoráveis ao meio ambiente. Entretanto, com a introdução no ambiente das plantas geneticamente modificadas que expressam as δ-endotoxinas (plantas transgênicas de colheitas), a disponibilidade biológica das proteínas Cry aumentou, e por questões de biossegurança seus efeitos devem ser rigorosamente investigados, sobretudo, para organismos não-alvo. As avaliações de plantas-Bt devem considerar tanto o seu potencial para produzir efeitos perigosos quanto a exposição de organismos sensíveis e não-alvo resultante da disseminação e persistência da toxina. Assim, objetivou-se avaliar, em camundongos albinos Swiss, a hematotoxicidade e genotoxicidade de quatro variedades de Bt esporos-cristais cry1Aa, Cry1Ab, Cry1Ac e Cry2Aa, administrados em uma única dose oral (por gavagem) ou intraperitoneal de 27 mg/Kg (dose mínima), 136 mg/Kg (dose intermediária) ou 270 (dose máxima) mg/Kg, 24 h antes da eutanásia. Para a via oral, os efeitos de cada um dos esporos-cristais também foram testados após uma única administração de 72 h ou 7 dias antes da eutanásia; combinações binárias de Cry foram avaliadas na dose máxima, com uma única administração 24 h antes da eutanásia. Camundongos controle receberam água filtrada (controle negativo) ou ciclofosfamida (CP - controle positivo) a 27 mg/Kg. Para as avaliações de hematotoxicidade, amostras de sangue coletadas por punção cardíaca foram processadas em um analisador hematológico automatizado; para as análises de genotoxicidade, o teste do micronúcleo foi realizado em células da medula óssea dos camundongos. Os efeitos hematotóxicos e/ou genotóxicos variaram com a dose, o esporo-cristal estudado e a via de administração. Cry1Ac 136 mg/kg administrada intraperitonealmente foi a mais tóxica, provocando 100% de mortalidade nos camundongos, enquanto alterações hematológicas e da medula óssea ocorreram em função dos demais tratamentos em ambas as vias. Na via oral, as administrações com Cry provocaram hematototoxicidade seletiva para os 3 tempos de exposição, sendo particularmente tóxicas para a linhagem eritróide; leucocitose também foi observada, bem como redução significativa da proliferação de células da medula óssea, demonstrando efeitos citotóxicos, mas não genotóxicos. Tais efeitos persistiram nos outros tempos de exposição, tornando-se mais evidentes no tempo de 7 dias. Os mesmos tipos de resultados foram observados para as combinações binárias no tempo de exposição de 24 h. Assim, os resultados indicam que (1) as toxinas Cry não foram destruídas no estômago; (2) possivelmente, foram ativadas no intestino, e (3) persistiram no corpo dos animais. Também sugerem a possibilidade da existência de moléculas Cry-receptoras desconhecidas no intestino de vertebrados, ou pelo menos de receptores com alguma afinidade pelas toxinas Cry. A via intraperitoneal foi mais tóxica do que via oral, apresentando alterações leucocitárias mais graves, bem como citotoxicidade para a medula óssea e genotoxicidade. Assim, os resultados demonstraram que as toxinas Cry não são inócuas para vertebrados e que a disseminação e a persistência das toxinas Bt no ambiente em função do aumento das culturas transgênicas pode ter efeitos ecológicos e para a saúde perigosos. Além disso, levando-se em consideração a exposição contínua de humanos e animais (particularmente os domésticos) em níveis consideráveis de Bt através da dieta, os resultados sugerem que são necessários protocolos mais eficientes de avaliação, com exposição mais longa dos mamíferos a estas dietas, e envolvendo observações clínicas antes de concluir que os transgênicos Bt são seguros para a alimentação.
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Isolamento e caracterização de bactérias promotoras de crescimento vegetal de lavouras experimentais de arroz sob diferentes níveis de fertilização

Costa, Pedro Beschoren da January 2012 (has links)
A fertilização química é amplamente utilizada para aumento da produtividade de plantações, mas sua produção e uso levaram a severos danos ambientais. Para reduzir o uso de fertilizantes, pode-se fazer uso de bactérias promotoras de crescimento vegetal (Plant Growth Promoting Rhizobacteria, PGPR), que são bactérias associadas a plantas e que melhoram a sua saúde, tamanho e produtividade através de vários mecanismos. A eficiência das PGPR sabidamente flutua com as condições ambientais; porém, há poucos estudos abordando os efeitos da fertilização química nas características de promoção de crescimento dessas bactérias. Neste trabalho foram analisados os efeitos da fertilização a longo prazo na diversidade de 190 linhagens bacterianas isoladas do solo rizosférico e de raízes de arroz, além da ocorrência e níveis de expressão de algumas características de promoção de crescimento vegetal. Os resultados obtidos demonstraram que a fertilização tem pequeno efeito na diversidade bacteriana, mas um grande efeito nas habilidades de solubilização de fosfato e produção de compostos indólicos. Propõe-se que, em condições de ausência de nutrientes, as plantas selecionam bactérias que apresentem boa capacidade de solubilização de fosfato para uma íntima associação com suas raízes, ao invés de bactérias que sejam boas produtoras de compostos indólicos. Quando em condições de disponibilidade moderada de nutrientes as plantas selecionam bactérias que sejam boas produtoras de compostos indólicos, ao invés de boas solubilizadoras de fosfato. Em condições de abundância de nutrientes essa preferência seletiva parece estar desativada. Após sete linhagens bacterianas terem sido testadas para promoção de crescimento vegetal in vivo de arroz em casa de vegetação, as previsões descritas acima foram avaliadas em um experimento a campo. De fato observou-se que bactérias eficientes em solubilizar fosfato promoveram o crescimento das plantas apenas em condições limitadas de nutrientes e que bactérias produtoras de compostos indólicos promoveram o crescimento vegetal apenas em condições de disponibilidade moderada de nutrientes. Quando a disponibilidade de nutrientes foi abundante, a solubilização de fosfato e a produção de compostos indólicos não foram fatores chave para promover o crescimento vegetal. Essas observações podem ser utilizadas para uma prospecção direcionada de PGPRs e seleção antecipada de candidatas à promoção de crescimento vegetal, de acordo com as necessidades da planta e os interesses dos agricultores. / Chemical fertilization is widely used for increased crop productivity, but its production and use lead to serious environmental damage. To reduce the use of fertilizers, one can make use of plant growth promoting rhizobacteria (PGPR), which are plant-associated bacteria that increase plant health, size and yield through various mechanisms. PGPR effectiveness is known to fluctuate with environmental conditions; however, studies regarding the effect of chemical fertilization on plant growth promoting (PGP) traits of PGPR are scarce. In this work, the effects of long-term fertilization on the diazotrophic diversity, occurrence and expression levels of PGP traits from 190 bacterial strains isolated from rhizospheric soil and roots of rice were analyzed. We found that fertilization had a limited effect on diversity but had a major effect on phosphate solubilization and indolic compounds (IC) production abilities. We propose that plants select bacteria that present good phosphate solubilization ability for intimate root association in lieu of good IC production under nutrient-poor conditions and select good IC producers in lieu of good phosphate solubilizers under nutrient-moderate conditions. In nutrient-rich conditions, this selection preference seems to be deactivated. After testing seven selected isolates for effective in vivo plant growth promotion in greenhouse conditions, our predictions were tested in the field. We found that good phosphate solubilizers only promoted growth at nutrient-poor conditions and that good IC producers only promoted growth at nutrient-moderate conditions. In nutrient-rich conditions, phosphate solubilization and IC production were not key factors to promote plant growth. These findings may be used for directed PGPR prospection and anticipated PGPR candidate selection, according to plant needs and farmer interests.
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Comunidade bacteriana de uma área do bioma pampa

Vargas, Rafael da Silveira January 2014 (has links)
As pastagens naturais do Bioma Pampa têm sido tipicamente utilizadas em sistemas extensivos de criação de bovinos de corte, com pouco ou nenhum aporte de insumos externos. Em ambientes naturais ou com pouca intervenção antrópica, como os sistemas pastoris tradicionais do Bioma Pampa, a microbiota do solo assume um papel no funcionamento do ecossistema. A presente pesquisa teve como objetivo avaliar o impacto de diferentes pressões de pastejo sobre a atividade microbiana e a diversidade de bactérias do solo. Foi avaliado um experimento de longa duração, localizado em Eldorado do Sul, Brasil, avaliando-se três níveis de pressão de pastejo: alta pressão de pastejo (HP), com 4% de oferta de forragem (OF); pressão de pastejo moderada (MP), com 12% de OF e baixa pressão de pastejo (LP), com 16% de OF. Foram avaliadas ainda duas áreas de referência, sendo uma área de vegetação nativa nunca pastejada (NG) e outra de vegetação regenerada após dois anos de pastejo (RG). As amostras de solo foram avaliadas quanto à biomassa microbiana, atividades de β-glucosidase, arilsulfatase e urease, adotados como indicadores bioquímicos de qualidade do solo. Avaliou-se ainda a estrutura da comunidade bacteriana e da população de bactérias diazotróficas por meio de RFLP dos genes 16S rRNA e o nifH, respectivamente. A diversidade de bactérias diazotróficas foi avaliada por meio de sequenciamento parcial do gene 16S rRNA. A presença de animais em pastejo favoreceu a comunidade microbiana do solo, de modo que a média geométrica geral dos atributos bioquímicos foi significativamente maior nos tratamentos com maior intensidade de pastejo, MP e HP. As estruturas da comunidade bacteriana e das populações de diazotróficos foram alteradas pelos diferentes manejos da pastagem, observando-se uma maior diversidade de bactérias diazotróficas culturáveis no tratamento LP. Considerando-se o conjunto das características bioquímicas e microbiológicas avaliadas no presente trabalho e o histórico da área, a adoção do tratamento MP parece o mais adequado visando à produção animal e à conservação do Bioma Pampa. / The grasslands of the Pampa biome have been typically used in extensive breeding systems of beef cattle, with little or no contribution of external inputs. In natural environments or with little human intervention, such as traditional grazing systems of the Pampa biome, the soil microbiota plays a role in the ecosystem functioning. This study aimed to evaluate the impact of different grazing pressures on the activity and diversity of soil bacteria. We performed one long-term experiment in Eldorado do Sul, Brazil, which assessed three levels of grazing pressure: high grazing pressure (HP), with 4% herbage allowance (HA); moderate grazing pressure (MP), with 12% HA; and low grazing pressure (LP), with 16% HA. Two reference areas were also assessed, an area of never-grazed native vegetation (NG) and an area of regenerated vegetation after two years of grazing (RG). Soil samples were evaluated for microbial biomass; β-glucosidase, arylsulfatase and urease activities; and biochemical indicators of soil quality. The structure of the bacterial community and the population of diazotrophic bacteria were also evaluated by RFLP of the 16S rRNA and nifH genes, respectively. The diversity of diazotrophic bacteria was assessed by partial sequencing of the 16S rRNA gene. The presence of grazing animals favored the soil microbial community, and consequently, the overall geometric mean of the biochemical characteristics was significantly higher in MP and HP. The structures of the bacterial community and the populations of diazotrophic bacteria were changed by the different grazing managements, with a greater diversity of culturable diazotrophic bacteria observed in the LP treatment. Considering all the biochemical and microbiological characteristics evaluated in this study and the history of the area, adoption of the MP treatment seems the most appropriate for animal production and conservation of the Pampa biome.
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Produção de Oligossacarídeos por Zymomonas mobilis

Vasconcelos Lobato, Andréa January 2003 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T15:49:13Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4402_1.pdf: 363314 bytes, checksum: 38dd161aa09b0ff55b0867dbe7fb763f (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2003 / Oligossacarídeos são carboidratos de baixo peso molecular produzidos por organismos vivos, com funções relacionadas à defesa imunológica, à replicação viral, ao crescimento e adesão celular e ao armazenamento de energia. Os oligossacarídeos são alimentos funcionais por suas propriedades prebióticas, estimulando a microbiota intestinal e contribuindo para o melhoramento da fisiologia do organismo. Neste trabalho estudou-se a produção de oligossacarídeos por via fermentativa, usando Zymomonas mobilis ZAG-12, além de analisar por CLAE os oligossacarídeos produzidos. Para isso foram realizadas fermentações em meio a base de sacarose, extrato de levedura e sais minerias, conforme estudo realizado previamente para otimização do processo. Foram realizados dois experimentos adicionais às temperaturas de 35 e 40oC, 250 g/L de sacarose inicial e 100 rpm. O pH, a biomassa produzida, a sacarose consumida e a produção de levana e de oligossacarídeos foram analisados. A partir dos resultados obtidos foi realizado estudo cinético da produção de oligossacarídeos em biorreator, a 30oC, 150 g/L de sacarose, a 100 rpm, em processo descontínuo, por 72h. O rendimento em levana foi considerado baixo nas temperaturas de 35 e 40oC, fato atribuído ao favorecimento de outros produtos, inclusive oligossacarídeos. Oligossacarídeos com DP entre 3 e 15 foram encontrados a 35 e 40oC, com predominância dos DP 3, 5, 6, 12, 13 e 15. Na produção a 30oC foi observada a presença de oligossacarídeos com graus de polimerização entre 4 e 15, havendo maior produção dos DP 4, 5, 6, 7, 8 e 15. Os resultados mostram que Zymomonas mobilis ZAG-12 é uma produtora potencial de oligossacarídeos e que as temperaturas de 30, 35 e 40oC são favoráveis à sua produção. Concluiu-se que a temperatura de 40oC é a melhor para produção de oligossacarídeos com baixo DP e que as referidas temperaturas, de uma forma geral, não são favoráveis à produção de oligossacarídeos com elevado DP. Entretanto, em termos de rendimento final em oligossacarídeos, 30 oC apresentou-se como a melhor temperatura de processo
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Atividade bactericida da ß-lapachona, isoniazida, de um derivado 1,2,4-oxadiazol-hidrazida e de suas associações frente ao Mycobacterium fortuitum e Mycobacterium smegmatis

SILVA, Joás Lucas da January 2005 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T15:51:17Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4483_1.pdf: 1126503 bytes, checksum: b1407bf682628eb808f980a32abc7ebb (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2005 / Micobactérias atípicas são organismos saprófitos implicados em um grande número de doenças em pacientes imunocomprometidos. A emergência de cepas multirresistentes e a resistência natural das micobactérias atípicas as drogas antituberculosas clássicas têm encorajado o desenvolvimento de novos quimioterápicos. Este trabalho teve como objetivo determinar a atividade bactericida da 􀈕-lapachona, do derivado 1,2,4-oxadiazol, [3-(􀉪-hidroxi-fenil) 1,2,4-oxadiazol-5-il] acil hidrazida, da isoniazida e suas associações frente ao M. fortuitum e M. smegmatis utilizando como métodos a Concentração Inibitória Mínima (CIM) e a Cinética Bactericida. A CIM permitiu determinar a menor concentração das drogas capaz de inibir o crescimento visível do microrganismo. Através da curva de morte versus tempo (Time Killing Curves), foi possível determinar o decréscimo da população microbiana pela enumeração de células viáveis a cada 24 horas por um período de 144 horas utilizando as drogas em suas concentrações inibitórias mínimas. Este estudo forneceu informações que o efeito da associação 􀈕- lapachona-isoniazida foi melhor quando comparado com as drogas isoladamente. O derivado 1,2,4-oxadiazol apresentou atividade contra ambos os microrganismos, mas sua atividade não foi acentuada quando combinado com isoniazida e 􀈕-lapachona

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